chem/KPP/kpp/kpp-2.1/util/sparsity_plots.m

   1 % Plots the sparsity patterns of the  Jacobian and the Hessian
   2
   3 %%%%% JACOBIAN
   4 figure(1);
   5
   6 J = zeros(NVAR,NVAR);
   7 for k=1:LU_NONZERO
   8   J( LU_IROW(k), LU_ICOL(k) ) = 1;
   9 end
  10 spy(J);
  11 TK = floor( linspace(1,NVAR,5) );
  12 set(gca,'XTick',TK,'YTick',TK,'FontSize',14,'LineWidth',2);
  13
  14 %%%%% HESSIAN
  15 figure(2);
  16
  17 H = zeros(NVAR,NVAR,NVAR);
  18 for k=1:NHESS
  19   H( IHESS_I(k), IHESS_J(k), IHESS_K(k) ) = 1;
  20   H( IHESS_I(k), IHESS_K(k), IHESS_J(k) ) = 1;
  21 end
  22
  23 M = ceil( sqrt(NVAR) );
  24
  25 for i=1:M
  26   for j=1:M
  27     k = M*(i-1)+j;
  28     if ( k <= NVAR )
  29       subplot(M,M,k);
  30       hold on
  31       G = reshape( H(k,1:NVAR,1:NVAR), NVAR, NVAR );
  32       % spy(G); figure;hold on
  33       for iH=1:NVAR; for jH=1:NVAR
  34          if( G(iH, jH) )
  35             plot(iH,NVAR+1-jH,'.');
  36          end;
  37       end; end
  38       text(NVAR/6,NVAR*0.6,int2str(k))
  39       set(gca,'XLim',[1,NVAR],'YLim',[1,NVAR]);
  40       set(gca,'XTick',[],'YTick',[]);
  41       axis('square');
  42       box on
  43       hold off;
  44     end
  45   end
  46 end