t/data/geneid_1.0.out

   1 ## source-version: GeneId v 3.0 EvoI -- geneid@imim.es
   2 ## date Tue Jun 13 10:17:01 2000
   3 # Optimal Gene Structure. 3 genes. Score = 140.109665
   4 # Gene 1(Forward). 2 exons. 155 aa. Score = 36.870944
   5    First     6090     6155       1.40   + 0 0    2.15    3.63   12.34    0.00   AA   0: 22 gene_1
   6 Terminal     6881     7276      35.47   + 0 0    3.33    2.30   97.73    0.00   AA  23:155 gene_1
   7
   8 >10|GeneId_predicted_protein_1|156_AA
   9 MVVKAVCVINGDAKGTVFFEQESSGTPVKVSGEVCGLAKGLHGFHVHEFGDNTNGCMSSG
  10 PHFNPYGKEHGAPVDENRHLGDLGNIEATGDCPTKVNITDSKITLFGADSIIGRTVVVHA
  11 DADDLGQGGHELSKSTGNAGARIGCGVIGIAKV*
  12
  13 # Gene 2(Reverse). 5 exons. 401 aa. Score = 70.179051
  14 Terminal     9100     9217       5.49   - 1 0    0.09    6.09   21.94    0.00   AA 362:401 gene_2
  15 Internal     9294     9387       0.61   - 2 2    0.89    4.23   11.34    0.00   AA 331:362 gene_2
  16 Internal     9479    10085      46.13   - 0 1    3.97    5.00   119.37   0.00   AA 128:331 gene_2
  17 Internal    10140    10273       6.48   - 2 0    3.37    2.05   25.56    0.00   AA  83:127 gene_2
  18    First    10334    10580      11.47   - 0 1    5.04   -1.96   41.57    0.00   AA   0: 83 gene_2
  19
  20 >10|GeneId_predicted_protein_2|402_AA
  21 MQETGEHQHVLSRNANRSSVLRFNSNPYRNDHDDSAVPLTTEVGKIYGEYLMLDKLLDAQ
  22 CMLSEEDKRPVHDEHLFIITHQAYELWFKQIIFEFDSIRDMLDAEVIDETKTLEIVKRLN
  23 RVVLILKLLVDQVPILETMTPLDFMDFRKYLAPASGFQSLQFRLIENKLGVLTEQRVRYN
  24 QKYSDVFSDEEARNSIRNSEKDPSLLELVQRWLERTPGLEESGFNFWAKFQESVDRFLEA
  25 QVQSAMEEPVEKAKNYRLMDIEKRREVYRSIFDPAVHDALVRRGDRRFSHRALQGAIMIT
  26 FYRDEPRFSQPHQLLTLLMDIDSLITKWRYNHVIMVQRMIGSQQLGTGGSSGYQYLRSTL
  27 SDRYKVFLDLFNLSTFLIPREAIPPLDETIRKKLINKSV*
  28
  29 # Gene 3(Reverse). 1 exons. 187 aa. Score = 33.059670
  30   Single    20955    21515      33.06   - 0 0    0.48   -2.76   103.58   0.00   AA   0:187 gene_3
  31
  32 >10|GeneId_predicted_protein_3|188_AA
  33 MVPSTVEKIVEVDKHIGCATSGLMADARTLIERARVECQNHWFVYNERMSIESCAQAVST
  34 LAIQFGDSGDSDGAAAMSRPFGVAILFAGIEAGQPQLWHMDPSGTFVGHGAKAIGSGSEG
  35 AQQNLQDLFRPDLTLDEAIDISLNTLKQVMEEKLNSTNVEVMTMTKEREFYMFTKEEVEQ
  36 HIKNIA*
  37