bp_process_wormbase: move program to new Bio-DB-Ace distribution
[bioperl-live.git] / t / data / psiblastreport.out
blobe276af4f09c0b6d036cb1dc7b594a8c120881274
1 BLASTP 2.0.14 [Jun-29-2000]
4 Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
5 Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
6 "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
7 programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
9 Query= CYS1_DICDI
10          (343 letters)
12 Database: /home/peter/blast/data/swissprot.pr
13            88,780 sequences; 31,984,247 total letters
15 Searching..................................................done
18 Results from round 1
21                                                                    Score     E
22 Sequences producing significant alignments:                        (bits)  Value
24 sp|P04988|CYS1_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR                  721  0.0
25 sp|P43295|A494_ARATH PROBABLE CYSTEINE PROTEINASE A494 PRECURSOR      281  1e-75
26 sp|P25804|CYSP_PEA CYSTEINE PROTEINASE 15A PRECURSOR (TURGOR-RES...   278  1e-74
27 sp|P43296|RD19_ARATH CYSTEINE PROTEINASE RD19A PRECURSOR              275  1e-73
28 sp|Q10716|CYS1_MAIZE CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR                  262  7e-70
29 sp|P04989|CYS2_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR (PRESTALK C...   262  7e-70
30 sp|P54640|CYS5_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 5 PRECURSOR                  249  7e-66
31 sp|Q26534|CATL_SCHMA CATHEPSIN L PRECURSOR (SMCL1)                    244  2e-64
32 sp|P14658|CYSP_TRYBB CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR                    243  4e-64
33 sp|P35591|CYS1_LEIPI CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR (AMASTIGOTE...   236  5e-62
34 sp|P25775|LCPA_LEIME CYSTEINE PROTEINASE A PRECURSOR                  235  9e-62
35 sp|P25779|CYSP_TRYCR CRUZIPAIN PRECURSOR (MAJOR CYSTEINE PROTEIN...   232  1e-60
36 sp|P13277|CYS1_HOMAM DIGESTIVE CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR        225  1e-58
37 sp|P25782|CYS2_HOMAM DIGESTIVE CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR        224  2e-58
38 sp|P07154|CATL_RAT CATHEPSIN L PRECURSOR (MAJOR EXCRETED PROTEIN...   224  3e-58
39 sp|P06797|CATL_MOUSE CATHEPSIN L PRECURSOR (MAJOR EXCRETED PROTE...   223  5e-58
40 sp|P25784|CYS3_HOMAM DIGESTIVE CYSTEINE PROTEINASE 3 PRECURSOR        221  1e-57
41 sp|P41721|CATV_NPVBM VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)                         221  2e-57
42 sp|P41715|CATV_NPVCF VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)                         220  4e-57
43 sp|P25975|CATL_BOVIN CATHEPSIN L PRECURSOR                            218  1e-56
44 sp|P36400|LCPB_LEIME CYSTEINE PROTEINASE B PRECURSOR                  218  2e-56
45 sp|Q05094|CYS2_LEIPI CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR (AMASTIGOTE...   218  2e-56
46 sp|P12412|CYSP_VIGMU VIGNAIN PRECURSOR (BEAN ENDOPEPTIDASE) (CYS...   217  3e-56
47 sp|P07711|CATL_HUMAN CATHEPSIN L PRECURSOR (MAJOR EXCRETED PROTE...   215  8e-56
48 sp|Q28944|CATL_PIG CATHEPSIN L PRECURSOR                              214  2e-55
49 sp|P25783|CATV_NPVAC VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)                         213  3e-55
50 sp|Q40143|CYS3_LYCES CYSTEINE PROTEINASE 3 PRECURSOR                  212  7e-55
51 sp|O60911|CATM_HUMAN CATHEPSIN L2 PRECURSOR (CATHEPSIN V)             210  5e-54
52 sp|P54639|CYS4_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 4 PRECURSOR                  209  6e-54
53 sp|Q10991|CATL_SHEEP CATHEPSIN L                                      209  6e-54
54 sp|P25803|CYSP_PHAVU VIGNAIN PRECURSOR (BEAN ENDOPEPTIDASE) (CYS...   208  2e-53
55 sp|P00785|ACTN_ACTCH ACTINIDAIN PRECURSOR (ACTINIDIN)                 206  4e-53
56 sp|P43156|CYSP_HEMSP THIOL PROTEASE SEN102 PRECURSOR                  203  6e-52
57 sp|P25777|ORYB_ORYSA ORYZAIN BETA CHAIN PRECURSOR                     203  6e-52
58 sp|Q10717|CYS2_MAIZE CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR                  201  2e-51
59 sp|P00786|CATH_RAT CATHEPSIN H PRECURSOR (CATHEPSIN B3) (CATHEPS...   200  3e-51
60 sp|O10364|CATV_NPVOP VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)                         199  9e-51
61 sp|P43297|RD21_ARATH CYSTEINE PROTEINASE RD21A PRECURSOR              198  2e-50
62 sp|P15242|TES1_RAT TESTIN 1/2 PRECURSOR (CMB-22/CMB-23)               198  2e-50
63 sp|P25776|ORYA_ORYSA ORYZAIN ALPHA CHAIN PRECURSOR                    198  2e-50
64 sp|P14080|PAP2_CARPA CHYMOPAPAIN PRECURSOR (PAPAYA PROTEINASE II...   194  2e-49
65 sp|P43235|CATK_HUMAN CATHEPSIN K PRECURSOR (CATHEPSIN O) (CATHEP...   194  2e-49
66 sp|P25778|ORYC_ORYSA ORYZAIN GAMMA CHAIN PRECURSOR                    194  3e-49
67 sp|P25251|CYS4_BRANA CYSTEINE PROTEINASE COT44 PRECURSOR              194  3e-49
68 sp|P09668|CATH_HUMAN CATHEPSIN H PRECURSOR                            192  1e-48
69 sp|O46427|CATH_PIG CATHEPSIN H PRECURSOR                              191  2e-48
70 sp|P05167|ALEU_HORVU THIOL PROTEASE ALEURAIN PRECURSOR                191  2e-48
71 sp|P43236|CATK_RABIT CATHEPSIN K PRECURSOR (OC-2 PROTEIN)             191  2e-48
72 sp|P10056|PAP3_CARPA CARICAIN PRECURSOR (PAPAYA PROTEINASE OMEGA...   190  3e-48
73 sp|P49935|CATH_MOUSE CATHEPSIN H PRECURSOR (CATHEPSIN B3) (CATHE...   189  6e-48
74 sp|P55097|CATK_MOUSE CATHEPSIN K PRECURSOR                            188  1e-47
75 sp|P56203|CATW_MOUSE CATHEPSIN W PRECURSOR (LYMPHOPAIN)               185  9e-47
76 sp|P25250|CYS2_HORVU CYSTEINE PROTEINASE EP-B 2 PRECURSOR             184  2e-46
77 sp|P25249|CYS1_HORVU CYSTEINE PROTEINASE EP-B 1 PRECURSOR             184  3e-46
78 sp|P05994|PAP4_CARPA PAPAYA PROTEINASE IV PRECURSOR (PPIV) (PAPA...   183  3e-46
79 sp|P22895|P34_SOYBN P34 PROBABLE THIOL PROTEASE PRECURSOR             183  3e-46
80 sp|P43234|CATO_HUMAN CATHEPSIN O PRECURSOR                            182  8e-46
81 sp|P56202|CATW_HUMAN CATHEPSIN W PRECURSOR (LYMPHOPAIN)               182  1e-45
82 sp|P25774|CATS_HUMAN CATHEPSIN S PRECURSOR                            177  3e-44
83 sp|P00784|PAPA_CARPA PAPAIN PRECURSOR (PAPAYA PROTEINASE I) (PPI)     176  6e-44
84 sp||CATL_CHICK_1 [Segment 1 of 2] CATHEPSIN L                         175  1e-43
85 sp|P25326|CATS_BOVIN CATHEPSIN S                                      173  5e-43
86 sp|P80884|ANAN_ANACO ANANAIN                                          167  3e-41
87 sp|Q02765|CATS_RAT CATHEPSIN S PRECURSOR                              167  4e-41
88 sp|P20721|CYSL_LYCES LOW-TEMPERATURE-INDUCED CYSTEINE PROTEINASE...   164  3e-40
89 sp|P36184|ACP1_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE ACP1 PRECURSOR               162  7e-40
90 sp|O17473|CATL_BRUPA CATHEPSIN L-LIKE PRECURSOR                       159  8e-39
91 sp|Q01957|CPP1_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR                  156  5e-38
92 sp|Q06964|CPP3_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE 3 PRECURSOR (CYSTEINE P...   153  4e-37
93 sp|Q01958|CPP2_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR                  153  5e-37
94 sp|P46102|CYSP_PLAVN CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR                    153  6e-37
95 sp|P36185|ACP2_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE ACP2 PRECURSOR               150  5e-36
96 sp|P25781|CYSP_THEAN CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR                    146  5e-35
97 sp|P14518|BROM_ANACO BROMELAIN, STEM                                  146  6e-35
98 sp|P22497|CYSP_THEPA CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR                    145  1e-34
99 sp|P16311|MMAL_DERFA MAJOR MITE FECAL ALLERGEN DER F 1 PRECURSOR...   144  3e-34
100 sp|P25805|CYSP_PLAFA THROPHOZOITE CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR ...   144  3e-34
101 sp|P42666|CYSP_PLAVI CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR                    132  1e-30
102 sp|P08176|MMAL_DERPT MAJOR MITE FECAL ALLERGEN DER P 1 PRECURSOR...   123  7e-28
103 sp|P80067|CATC_RAT DIPEPTIDYL-PEPTIDASE I PRECURSOR (DPP-I) (DPP...   117  3e-26
104 sp|P97821|CATC_MOUSE DIPEPTIDYL-PEPTIDASE I PRECURSOR (DPP-I) (D...   116  8e-26
105 sp|P53634|CATC_HUMAN DIPEPTIDYL-PEPTIDASE I PRECURSOR (DPP-I) (D...   113  4e-25
106 sp|Q26563|CATC_SCHMA CATHEPSIN C PRECURSOR                            113  7e-25
107 sp|P25773|CATL_FELCA CATHEPSIN L (PROGESTERONE-DEPENDENT PROTEIN...   113  7e-25
108 sp|P25780|EUM1_EURMA MITE GROUP I ALLERGEN EUR M 1 (EUR M I)          105  1e-22
109 sp|Q23894|CYS3_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 3 (CYSTEINE PROTEINASE II)    96  1e-19
110 sp|P43508|CPR4_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 4 PREC...    94  3e-19
111 sp|P05993|PAP5_CARPA CYSTEINE PROTEINASE (CLONE PLBPC13)               90  5e-18
112 sp|P25807|CYS1_CAEEL GUT-SPECIFIC CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR        90  5e-18
113 sp|P43509|CPR5_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 5 PREC...    89  1e-17
114 sp|P00787|CATB_RAT CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1) (RSG-2)        88  3e-17
115 sp|P07688|CATB_BOVIN CATHEPSIN B PRECURSOR                             87  5e-17
116 sp|P07858|CATB_HUMAN CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1) (APP S...    86  1e-16
117 sp|P43157|CYSP_SCHJA CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE PRECUR...    85  3e-16
118 sp|P25792|CYSP_SCHMA CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE PRECUR...    85  3e-16
119 sp|P10605|CATB_MOUSE CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1)              84  5e-16
120 sp|P43510|CPR6_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 6 PREC...    83  6e-16
121 sp|P43233|CATB_CHICK CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1)              83  6e-16
122 sp|P25802|CYS1_OSTOS CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 1 PREC...    76  1e-13
123 sp|P25793|CYS2_HAECO CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 2 PREC...    75  2e-13
124 sp|P19092|CYS1_HAECO CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 1 PREC...    75  3e-13
125 sp|P43507|CPR3_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 3 PREC...    73  7e-13
126 sp|P13823|SERA_PLAFG SERINE-REPEAT ANTIGEN PROTEIN PRECURSOR (P1...    71  4e-12
127 sp|P32956|CC3_CARCN CYSTEINE PROTEINASE III (CC-III)                   63  8e-10
128 sp|P32957|CC4_CARCN CYSTEINE PROTEINASE IV (CC-IV)                     62  2e-09
129 sp|Q06544|CYS3_OSTOS CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 3            59  1e-08
130 sp|P32954|CC1_CARCN CYSTEINE PROTEINASE I (CC-I)                       59  2e-08
131 sp|P32955|CC2_CARCN CYSTEINE PROTEINASE II (CC-II)                     58  3e-08
132 sp||CATL_CHICK_2 [Segment 2 of 2] CATHEPSIN L                          52  2e-06
133 sp|P12399|CT2A_MOUSE CTLA-2-ALPHA PROTEIN PRECURSOR                    42  0.002
134 sp|P21381|THPA_THADA THAUMATOPAIN                                      41  0.005
135 sp|P05689|CATX_BOVIN CATHEPSIN                                         40  0.006
136 sp|P12400|CT2B_MOUSE CTLA-2-BETA PROTEIN PRECURSOR                     39  0.018
137 sp|P20736|BM86_BOOMI GLYCOPROTEIN ANTIGEN BM86 PRECURSOR (PROTEC...    35  0.21
138 sp|Q11121|PLB1_TORDE LYSOPHOSPHOLIPASE PRECURSOR (PHOSPHOLIPASE B)     35  0.27
139 sp|P46992|YJR1_YEAST HYPOTHETICAL 43.0 KD PROTEIN IN CPS1-FPP1 I...    34  0.61
140 sp|P28493|PR5_ARATH PATHOGENESIS-RELATED PROTEIN 5 PRECURSOR (PR-5)    32  1.8
141 sp|P41901|SPR3_YEAST SPORULATION-SPECIFIC SEPTIN                       32  2.4
142 sp|P54634|POLN_LORDV NON-STRUCTURAL POLYPROTEIN [CONTAINS: RNA-D...    31  3.1
143 sp|P21173|DNAA_MICLU CHROMOSOMAL REPLICATION INITIATOR PROTEIN DNAA    31  3.1
144 sp|P89263|Y022_GVXN HYPOTHETICAL ORF22 HOMOLOG                         31  5.3
145 sp|P24896|NU5M_CAEEL NADH-UBIQUINONE OXIDOREDUCTASE CHAIN 5            31  5.3
146 sp|P25648|SRB8_YEAST SUPPRESSOR OF RNA POLYMERASE B SRB8               30  7.0
147 sp|Q04723|PEPC_LACLC AMINOPEPTIDASE C                                  30  7.0
148 sp|Q13867|BLMH_HUMAN BLEOMYCIN HYDROLASE (BLM HYDROLASE) (BMH)         30  9.1
149 sp|P87362|BLMH_CHICK BLEOMYCIN HYDROLASE (BLM HYDROLASE) (BMH) (...    30  9.1
150 sp|P70645|BLMH_RAT BLEOMYCIN HYDROLASE (BLM HYDROLASE) (BMH)           30  9.1
152 >sp|P04988|CYS1_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR
153           Length = 343
155  Score =  721 bits (1841), Expect = 0.0
156  Identities = 343/343 (100%), Positives = 343/343 (100%)
158 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIE 60
159            MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIE
160 Sbjct: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIE 60
162 Query: 61  ELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPT 120
163            ELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPT
164 Sbjct: 61  ELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPT 120
166 Query: 121 AFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEY 180
167            AFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEY
168 Sbjct: 121 AFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEY 180
170 Query: 181 EGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTM 240
171            EGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTM
172 Sbjct: 181 EGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTM 240
174 Query: 241 IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIF 300
175            IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIF
176 Sbjct: 241 IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIF 300
178 Query: 301 RKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
179            RKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII
180 Sbjct: 301 RKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
183 >sp|P43295|A494_ARATH PROBABLE CYSTEINE PROTEINASE A494 PRECURSOR
184           Length = 313
186  Score =  281 bits (712), Expect = 1e-75
187  Identities = 147/316 (46%), Positives = 193/316 (60%), Gaps = 18/316 (5%)
189 Query: 32  FQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKA---DTKFGVNKFADLSSDE 87
190            F+ KF K Y S EE+  RF +FK+NL       L A+ H+      + GV +F+DL+  E
191 Sbjct: 3   FKKKFGKVYGSIEEHYYRFSVFKANL-------LRAMRHQKMDPSARHGVTQFSDLTRSE 55
193 Query: 88  FKNYYLNNKEAI-FTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFS 146
194            F+  +L  K       D   A  L  +   ++P  FDWR RGAVTPVKNQG CGSCWSFS
195 Sbjct: 56  FRRKHLGVKGGFKLPKDANQAPILPTQ---NLPEEFDWRDRGAVTPVKNQGSCGSCWSFS 112
197 Query: 147 TTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNG 206
198            TTG +EG HF++  KLVSLSEQ LVDCDHEC + E E +CD GCNGGL  +A+ Y +K G
199 Sbjct: 113 TTGALEGAHFLATGKLVSLSEQQLVDCDHEC-DPEEEGSCDSGCNGGLMNSAFEYTLKTG 171
201 Query: 207 GIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVE 266
202            G+  E  YPYT   G  C  + + I A +SNF+++  NE  +A  ++  GPLA+A +A  
203 Sbjct: 172 GLMREKDYPYTGTDGGSCKLDRSKIVASVSNFSVVSINEDQIAANLIKNGPLAVAINAAY 231
205 Query: 267 WQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAK--NTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIY 324
206             Q YIGGV         L+HG+L+VGY +   +    K  PYWI+KNSWG  WGE G+  
207 Sbjct: 232 MQTYIGGVSCPYICSRRLNHGVLLVGYGSAGFSQARLKEKPYWIIKNSWGESWGENGFYK 291
209 Query: 325 LRRGKNTCGVSNFVST 340
210            + +G+N CGV + VST
211 Sbjct: 292 ICKGRNICGVDSLVST 307
214 >sp|P25804|CYSP_PEA CYSTEINE PROTEINASE 15A PRECURSOR (TURGOR-RESPONSIVE PROTEIN 15A)
215           Length = 363
217  Score =  278 bits (703), Expect = 1e-74
218  Identities = 144/320 (45%), Positives = 201/320 (62%), Gaps = 14/320 (4%)
220 Query: 26  QSQFLEFQDKFNKKYS-HEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLS 84
221            +  F  F+ KF+K Y+  EE+  RF +FKSNL K +    +  N     + G+ KF+DL+
222 Sbjct: 45  EHHFTSFKSKFSKSYATKEEHDYRFGVFKSNLIKAK----LHQNRDPTAEHGITKFSDLT 100
224 Query: 85  SDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPV-ADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCW 143
225            + EF+  +L  K+ +    LP  A         ++P  FDWR +GAVTPVK+QG CGSCW
226 Sbjct: 101 ASEFRRQFLGLKKRL---RLPAHAQKAPILPTTNLPEDFDWREKGAVTPVKDQGSCGSCW 157
228 Query: 144 SFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYII 203
229            +FSTTG +EG H+++  KLVSLSEQ LVDCDH C + E   +CD GCNGGL  NA+ Y++
230 Sbjct: 158 AFSTTGALEGAHYLATGKLVSLSEQQLVDCDHVC-DPEQAGSCDSGCNGGLMNNAFEYLL 216
232 Query: 204 KNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAAD 263
233            ++GG+  E  Y YT   G+ C F+ + + A +SNF+++  +E  +A  +V  GPLA+A +
234 Sbjct: 217 ESGGVVQEKDYAYTGRDGS-CKFDKSKVVASVSNFSVVTLDEDQIAANLVKNGPLAVAIN 275
236 Query: 264 AVEWQFYIGGV-FDIPCNPNSLDHGILIVGY--SAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQ 320
237            A   Q Y+ GV     C  + LDHG+L+VG+   A   I  K  PYWI+KNSWG +WGEQ
238 Sbjct: 276 AAWMQTYMSGVSCPYVCAKSRLDHGVLLVGFGKGAYAPIRLKEKPYWIIKNSWGQNWGEQ 335
240 Query: 321 GYIYLRRGKNTCGVSNFVST 340
241            GY  + RG+N CGV + VST
242 Sbjct: 336 GYYKICRGRNVCGVDSMVST 355
245 >sp|P43296|RD19_ARATH CYSTEINE PROTEINASE RD19A PRECURSOR
246           Length = 368
248  Score =  275 bits (695), Expect = 1e-73
249  Identities = 155/359 (43%), Positives = 205/359 (56%), Gaps = 34/359 (9%)
251 Query: 6   LFVLAVFTVFVSSR---------------GIPPE---EQSQFLEFQDKFNKKY-SHEEYL 46
252            +FVL+ F V VSS                G  P+    +  F  F+ KF K Y S+EE+ 
253 Sbjct: 10  VFVLSFFIVSVSSSDVNDGDDLVIRQVVGGAEPQVLTSEDHFSLFKRKFGKVYASNEEHD 69
255 Query: 47  ERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTK--FGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAI-FTDD 103
256             RF +FK+NL +         + K D     GV +F+DL+  EF+  +L  +       D
257 Sbjct: 70  YRFSVFKANLRRARR------HQKLDPSATHGVTQFSDLTRSEFRKKHLGVRSGFKLPKD 123
259 Query: 104 LPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLV 163
260               A  L  E   ++P  FDWR  GAVTPVKNQG CGSCWSFS TG +EG +F++  KLV
261 Sbjct: 124 ANKAPILPTE---NLPEDFDWRDHGAVTPVKNQGSCGSCWSFSATGALEGANFLATGKLV 180
263 Query: 164 SLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQ 223
264            SLSEQ LVDCDHEC + E  ++CD GCNGGL  +A+ Y +K GG+  E  YPYT + G  
265 Sbjct: 181 SLSEQQLVDCDHEC-DPEEADSCDSGCNGGLMNSAFEYTLKTGGLMKEEDYPYTGKDGKT 239
267 Query: 224 CNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNS 283
268            C  + + I A +SNF++I  +E  +A  +V  GPLA+A +A   Q YIGGV         
269 Sbjct: 240 CKLDKSKIVASVSNFSVISIDEEQIAANLVKNGPLAVAINAGYMQTYIGGVSCPYICTRR 299
271 Query: 284 LDHGILIVGYSAKN--TIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVST 340
272            L+HG+L+VGY A        K  PYWI+KNSWG  WGE G+  + +G+N CGV + VST
273 Sbjct: 300 LNHGVLLVGYGAAGYAPARFKEKPYWIIKNSWGETWGENGFYKICKGRNICGVDSMVST 358
276 >sp|Q10716|CYS1_MAIZE CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR
277           Length = 371
279  Score =  262 bits (663), Expect = 7e-70
280  Identities = 138/324 (42%), Positives = 189/324 (57%), Gaps = 15/324 (4%)
282 Query: 26  QSQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLS 84
283            +S FL F  +F K Y   +E+  R  +FK NL +     L+        + GV KF+DL+
284 Sbjct: 45  ESHFLSFVQRFGKSYKDADEHAYRLSVFKDNLRRARRHQLL----DPSAEHGVTKFSDLT 100
286 Query: 85  SDEFKNYYLN---NKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGS 141
287              EF+  YL    ++ A+  +    A        + +P  FDWR  GAV PVKNQG CGS
288 Sbjct: 101 PAEFRRTYLGLRKSRRALLRELGESAHEAPVLPTDGLPDDFDWRDHGAVGPVKNQGSCGS 160
290 Query: 142 CWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNY 201
291            CWSFS +G +EG H+++  KL  LSEQ  VDCDHEC   E  ++CD GCNGGL   A++Y
292 Sbjct: 161 CWSFSASGALEGAHYLATGKLEVLSEQQFVDCDHECDSSE-PDSCDSGCNGGLMTTAFSY 219
294 Query: 202 IIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIA 261
295            + K GG+++E  YPYT   G +C F+ + I A + NF+++  +E  ++  ++  GPLAI 
296 Sbjct: 220 LQKAGGLESEKDYPYTGSDG-KCKFDKSKIVASVQNFSVVSVDEAQISANLIKHGPLAIG 278
298 Query: 262 ADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKN--TIFRKNMPYWIVKNSWGADWGE 319
299             +A   Q YIGGV         LDHG+L+VGY A     I  K+ PYWI+KNSWG +WGE
300 Sbjct: 279 INAAYMQTYIGGVSCPYICGRHLDHGVLLVGYGASGFAPIRLKDKPYWIIKNSWGENWGE 338
302 Query: 320 QGYIYLRRG---KNTCGVSNFVST 340
303             GY  + RG   +N CGV + VST
304 Sbjct: 339 NGYYKICRGSNVRNKCGVDSMVST 362
307 >sp|P04989|CYS2_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR (PRESTALK CATHEPSIN)
308           Length = 376
310  Score =  262 bits (663), Expect = 7e-70
311  Identities = 147/383 (38%), Positives = 213/383 (55%), Gaps = 55/383 (14%)
313 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIP-------PEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFK 53
314            M++++  +L +F  F  +   P        + ++ F E+  KFN++YS  E+  R+ IFK
315 Sbjct: 1   MRLLVFLILLIFVNFSFANVRPNGRRFSESQYRTAFTEWTLKFNRQYSSSEFSNRYSIFK 60
317 Query: 54  SNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNK-EAIFTDDLPVADYLDD 112
318            SN+  ++  N       + T  G+N FAD++++E++  YL  +  A   +     + L+ 
319 Sbjct: 61  SNMDYVDNWNS---KGDSQTVLGLNNFADITNEEYRKTYLGTRVNAHSYNGYDGREVLNV 117
321 Query: 113 EFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVD 172
322            E + + P + DWRT+ AVTP+K+QGQCGSCWSFSTTG+ EG H +   KLVSLSEQNLVD
323 Sbjct: 118 EDLQTNPKSIDWRTKNAVTPIKDQGQCGSCWSFSTTGSTEGAHALKTKKLVSLSEQNLVD 177
325 Query: 173 CDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIG 232
326            C        G E  + GC+GGL  NA++YIIKN GI TESSYPYTAETG+ C FN ++IG
327 Sbjct: 178 C-------SGPEE-NFGCDGGLMNNAFDYIIKNKGIDTESSYPYTAETGSTCLFNKSDIG 229
329 Query: 233 AKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGIL 289
330            A I  +  I     +        GP+++A DA    +Q Y  G++  P C+P  LDHG+L
331 Sbjct: 230 ATIKGYVNITAGSEISLENGAQHGPVSVAIDASHNSFQLYTSGIYYEPKCSPTELDHGVL 289
333 Query: 290 IVGY--------------------------------SAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADW 317
334            +VGY                                 + +++  K   YWIVKNSWG  W
335 Sbjct: 290 VVGYGVQGKDDEGPVLNRKQTIVIHKNEDNKVESSDDSSDSVRPKANNYWIVKNSWGTSW 349
337 Query: 318 GEQGYIYLRRG-KNTCGVSNFVS 339
338            G +GYI + +  KN CG+++  S
339 Sbjct: 350 GIKGYILMSKDRKNNCGIASVSS 372
342 >sp|P54640|CYS5_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 5 PRECURSOR
343           Length = 344
345  Score =  249 bits (629), Expect = 7e-66
346  Identities = 139/362 (38%), Positives = 201/362 (55%), Gaps = 37/362 (10%)
348 Query: 1   MKVI-LLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKI 59
349            MKV+  L VL V       +    + ++ F ++     K Y+ EE+  R+ IF +N+  +
350 Sbjct: 1   MKVLSFLCVLLVSVATAKQQFSELQYRNAFTDWMITHQKSYTSEEFGARYNIFTANMDYV 60
352 Query: 60  EELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP 119
353            ++ N    +  ++T  G+N FAD++++E++N YL  K   F     +    +    NS  
354 Sbjct: 61  QQWN----SKGSETVLGLNNFADITNEEYRNTYLGTK---FDASSLIGTQEEKVHTNSSA 113
356 Query: 120 TAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECME 179
357             + DWR+ GAVTPVKNQGQCG CWSFSTTG+ EG HF S+ +LVSLSEQNL+DC  E   
358 Sbjct: 114 ASKDWRSEGAVTPVKNQGQCGGCWSFSTTGSTEGAHFQSKGELVSLSEQNLIDCSTE--- 170
360 Query: 180 YEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFT 239
361                   + GC+GGL   A+ YII N GI TESSYPY AE G +C + S N GA +S++ 
362 Sbjct: 171 -------NSGCDGGLMTYAFEYIINNNGIDTESSYPYKAENG-KCEYKSENSGATLSSYK 222
364 Query: 240 MIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGY--- 293
365             +           V+  P+++A DA    +Q Y  G++  P C+  +LDHG+L VGY   
366 Sbjct: 223 TVTAGSESSLESAVNVNPVSVAIDASHQSFQLYTSGIYYEPECSSENLDHGVLAVGYGSG 282
368 Query: 294 -----------SAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTS 341
369                       S+ N     +  YWIVKNSWG  WG +GYI + R + N CG+++  S  
370 Sbjct: 283 SGSSSGQSSGQSSGNLSASSSNEYWIVKNSWGTSWGIEGYILMSRNRDNNCGIASSASFP 342
372 Query: 342 II 343
373            ++
374 Sbjct: 343 VV 344
377 >sp|Q26534|CATL_SCHMA CATHEPSIN L PRECURSOR (SMCL1)
378           Length = 319
380  Score =  244 bits (617), Expect = 2e-64
381  Identities = 128/326 (39%), Positives = 190/326 (58%), Gaps = 22/326 (6%)
383 Query: 21  IPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKF 80
384            +P     ++++F+ K+ K+Y   E   RF IFKSN+ K +   L  +  +    +GV  +
385 Sbjct: 12  LPGNVDEKYVQFKLKYRKQYHETEDEIRFNIFKSNILKAQ---LYQVFVRGSAIYGVTPY 68
387 Query: 81  ADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCG 140
388            +DL++DEF   +L     + +        L  E +N+IP  FDWR +GAVT VKNQG CG
389 Sbjct: 69  SDLTTDEFARTHLTASWVVPSSRSNTPTSLGKE-VNNIPKNFDWREKGAVTEVKNQGMCG 127
391 Query: 141 SCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYN 200
392            SCW+FSTTGNVE Q F    KL+SLSEQ LVDCD            D+GCNGGL  NAY 
393 Sbjct: 128 SCWAFSTTGNVESQWFRKTGKLLSLSEQQLVDCD----------GLDDGCNGGLPSNAYE 177
395 Query: 201 YIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAI 260
396             IIK GG+  E +YPY A+   +C+  +  +   I++   + ++ET +A ++     +++
397 Sbjct: 178 SIIKMGGLMLEDNYPYDAK-NEKCHLKTDGVAVYINSSVNLTQDETELAAWLYHNSTISV 236
399 Query: 261 AADAVEWQFYIGGV---FDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADW 317
400              +A+  QFY  G+   + I C+   LDH +L+VGY     +  KN P+WIVKNSWG +W
401 Sbjct: 237 GMNALLLQFYQHGISHPWWIFCSKYLLDHAVLLVGYG----VSEKNEPFWIVKNSWGVEW 292
403 Query: 318 GEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
404            GE GY  + RG  +CG++   ++++I
405 Sbjct: 293 GENGYFRMYRGDGSCGINTVATSAMI 318
408 >sp|P14658|CYSP_TRYBB CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR
409           Length = 450
411  Score =  243 bits (614), Expect = 4e-64
412  Identities = 136/346 (39%), Positives = 193/346 (55%), Gaps = 26/346 (7%)
414 Query: 3   VILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEE 61
415            V+L     + +V + S  +    + +F  F+ K+ K Y   +E   RF  F+ N+   E+
416 Sbjct: 15  VLLAMAACLASVALGSLHVEESLEMRFAAFKKKYGKVYKDAKEEAFRFRAFEENM---EQ 71
418 Query: 62  LNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTA 121
419              + A  +   T FGV  F+D++ +EF+  Y N           +   ++       P A
420 Sbjct: 72  AKIQAAANPYAT-FGVTPFSDMTREEFRARYRNGASYFAAAQKRLRKTVNVT-TGRAPAA 129
422 Query: 122 FDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYE 181
423             DWR +GAVTPVK QGQCGSCW+FST GN+EGQ  ++ N LVSLSEQ LV CD       
424 Sbjct: 130 VDWREKGAVTPVKVQGQCGSCWAFSTIGNIEGQWQVAGNPLVSLSEQMLVSCD------- 182
426 Query: 182 GEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKN--GGIQTESSYPYTAETG--TQCNFNSANIGAKISN 237
427                 D GCNGGL  NA+N+I+ +  G + TE+SYPY +  G   QC  N   IGA I++
428 Sbjct: 183 ---TIDSGCNGGLMDNAFNWIVNSNGGNVFTEASYPYVSGNGEQPQCQMNGHEIGAAITD 239
430 Query: 238 FTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKN 297
431               +P++E  +A Y+   GPLAIA DA  +  Y GG+    C    LDHG+L+VGY+  +
432 Sbjct: 240 HVDLPQDEDAIAAYLAENGPLAIAVDAESFMDYNGGIL-TSCTSKQLDHGVLLVGYNDNS 298
434 Query: 298 TIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
435                 N PYWI+KNSW   WGE GYI + +G N C ++  VS++++
436 Sbjct: 299 -----NPPYWIIKNSWSNMWGEDGYIRIEKGTNQCLMNQAVSSAVV 339
439 >sp|P35591|CYS1_LEIPI CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR (AMASTIGOTE CYSTEINE PROTEINASE
440            A-1)
441           Length = 354
443  Score =  236 bits (596), Expect = 5e-62
444  Identities = 146/350 (41%), Positives = 196/350 (55%), Gaps = 38/350 (10%)
446 Query: 5   LLFVLAVFTVFVSSRGI-------PPEEQ----SQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIF 52
447            LLF + V  +FV   G        PP +     + +  F+ +  K +  + E   RF  F
448 Sbjct: 7   LLFAIVVTILFVVCYGSALIAQTPPPVDNFVASAHYGSFKKRHGKAFGGDAEEGHRFNAF 66
450 Query: 53  KSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLN-NKEAIFTDDLPVADYLD 111
451            K N+     LN    +   D      KFADL+  EF   YLN +  A    D     ++D
452 Sbjct: 67  KQNMQTAYFLNTQNPHAHYDVS---GKFADLTPQEFAKLYLNPDYYARHLKDHKEDVHVD 123
454 Query: 112 DEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLV 171
455            D   + + +  DWR +GAVTPVKNQG CGSCW+FS  GN+EGQ   S + LVSLSEQ LV
456 Sbjct: 124 DSAPSGVMSV-DWRDKGAVTPVKNQGLCGSCWAFSAIGNIEGQWAASGHSLVSLSEQMLV 182
458 Query: 172 DCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK--NGGIQTESSYPYTAETGTQ--CNFN 227
459             CD+           DEGCNGGL   A N+I++  NG + TE+SYPYT+  GT+  C+ +
460 Sbjct: 183 SCDN----------IDEGCNGGLMDQAMNWIMQSHNGSVFTEASYPYTSGGGTRPPCH-D 231
462 Query: 228 SANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHG 287
463               +GAKI+ F  +P +E  +A ++   GP+A+A DA  WQ Y GGV  + C   SL+HG
464 Sbjct: 232 EGEVGAKITGFLSLPHDEERIAEWVEKRGPVAVAVDATTWQLYFGGVVSL-CLAWSLNHG 290
466 Query: 288 ILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNF 337
467            +LIVG++ KN       PYWIVKNSWG+ WGE+GYI L  G N C + N+
468 Sbjct: 291 VLIVGFN-KNA----KPPYWIVKNSWGSSWGEKGYIRLAMGSNQCMLKNY 335
471 >sp|P25775|LCPA_LEIME CYSTEINE PROTEINASE A PRECURSOR
472           Length = 354
474  Score =  235 bits (594), Expect = 9e-62
475  Identities = 146/359 (40%), Positives = 195/359 (53%), Gaps = 56/359 (15%)
477 Query: 5   LLFVLAVFTVFVSSRGI-------PPEEQ----SQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIF 52
478            LLF + V  +FV   G        PP +     + +  F+ +  K +  + E   RF  F
479 Sbjct: 7   LLFAIVVTILFVVCYGSALIAQTPPPVDNFVASAHYGSFKKRHGKAFGGDAEEGHRFNAF 66
481 Query: 53  KSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLN----------NKEAIFTD 102
482            K N+     LN    +   D      KFADL+  EF   YLN          +KE +  D
483 Sbjct: 67  KQNMQTAYFLNTQNPHAHYDVS---GKFADLTPQEFAKLYLNPDYYARHLKNHKEDVHVD 123
485 Query: 103 DLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKL 162
486            D   +  +          + DWR +GAVTPVKNQG CGSCW+FS  GN+EGQ   S + L
487 Sbjct: 124 DSAPSGVM----------SVDWRDKGAVTPVKNQGLCGSCWAFSAIGNIEGQWAASGHSL 173
489 Query: 163 VSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK--NGGIQTESSYPYTAET 220
490            VSLSEQ LV CD+           DEGCNGGL   A N+I++  NG + TE+SYPYT+  
491 Sbjct: 174 VSLSEQMLVSCDN----------IDEGCNGGLMDQAMNWIMQSHNGSVFTEASYPYTSGG 223
493 Query: 221 GTQ--CNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIP 278
494            GT+  C+ +   +GAKI+ F  +P +E  +A ++   GP+A+A DA  WQ Y GGV  + 
495 Sbjct: 224 GTRPPCH-DEGEVGAKITGFLSLPHDEERIAEWVEKRGPVAVAVDATTWQLYFGGVVSL- 281
497 Query: 279 CNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNF 337
498            C   SL+HG+LIVG++ KN       PYWIVKNSWG+ WGE+GYI L  G N C + N+
499 Sbjct: 282 CLAWSLNHGVLIVGFN-KNA----KPPYWIVKNSWGSSWGEKGYIRLAMGSNQCMLKNY 335
502 >sp|P25779|CYSP_TRYCR CRUZIPAIN PRECURSOR (MAJOR CYSTEINE PROTEINASE) (CRUZAINE)
503           Length = 467
505  Score =  232 bits (585), Expect = 1e-60
506  Identities = 137/350 (39%), Positives = 191/350 (54%), Gaps = 30/350 (8%)
508 Query: 3   VILLFVLAVFTVFV--SSRGIPPEEQ--SQFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLG 57
509            ++L  VL V    V  ++  +  EE   SQF EF+ K  + Y S  E   R  +F+ NL 
510 Sbjct: 8   LLLAAVLVVMACLVPAATASLHAEETLTSQFAEFKQKHGRVYESAAEEAFRLSVFRENLF 67
512 Query: 58  KIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINS 117
513             +  L+  A  H     FGV  F+DL+ +EF++ Y +N  A F      A       +  
514 Sbjct: 68  -LARLHAAANPHAT---FGVTPFSDLTREEFRSRY-HNGAAHFAAAQERARVPVKVEVVG 122
516 Query: 118 IPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHEC 177
517             P A DWR RGAVT VK+QGQCGSCW+FS  GNVE Q F++ + L +LSEQ LV CD   
518 Sbjct: 123 APAAVDWRARGAVTAVKDQGQCGSCWAFSAIGNVECQWFLAGHPLTNLSEQMLVSCD--- 179
520 Query: 178 MEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK--NGGIQTESSYPYTAETGTQ--CNFNSANIGA 233
521                     D GC+GGL  NA+ +I++  NG + TE SYPY +  G    C  +   +GA
522 Sbjct: 180 -------KTDSGCSGGLMNNAFEWIVQENNGAVYTEDSYPYASGEGISPPCTTSGHTVGA 232
524 Query: 234 KISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGY 293
525             I+    +P++E  +A ++   GP+A+A DA  W  Y GGV    C    LDHG+L+VGY
526 Sbjct: 233 TITGHVELPQDEAQIAAWLAVNGPVAVAVDASSWMTYTGGVM-TSCVSEQLDHGVLLVGY 291
528 Query: 294 SAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
529            +    +     PYWI+KNSW   WGE+GYI + +G N C V    S++++
530 Sbjct: 292 NDSAAV-----PYWIIKNSWTTQWGEEGYIRIAKGSNQCLVKEEASSAVV 336
533 >sp|P13277|CYS1_HOMAM DIGESTIVE CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR
534           Length = 322
536  Score =  225 bits (567), Expect = 1e-58
537  Identities = 130/341 (38%), Positives = 182/341 (53%), Gaps = 33/341 (9%)
539 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKI 59
540            MKV+ LF+  +     +           + EF+ KF +KY   EE   R  +F  NL  I
541 Sbjct: 1   MKVVALFLFGLALAAANP---------SWEEFKGKFGRKYVDLEEERYRLNVFLDNLQYI 51
543 Query: 60  EELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP 119
544            EE N      +      +N+F+D+++++F       K+       P A +   +      
545 Sbjct: 52  EEFNKKYERGEVTYNLAINQFSDMTNEKFNAVMKGYKKG----PRPAAVFTSTDAAPE-S 106
547 Query: 120 TAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECME 179
548            T  DWRT+GAVTPVK+QGQCGSCW+FSTTG +EGQHF+   +LVSLSEQ LVDC      
549 Sbjct: 107 TEVDWRTKGAVTPVKDQGQCGSCWAFSTTGGIEGQHFLKTGRLVSLSEQQLVDC------ 160
551 Query: 180 YEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFT 239
552              G    ++GCNGG    A  Y+  NGG+ TESSYPY A   T C FNS  IGA  + + 
553 Sbjct: 161 -AGGSYYNQGCNGGWVERAIMYVRDNGGVDTESSYPYEARDNT-CRFNSNTIGATCTGYV 218
555 Query: 240 MIPK-NETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQF---YIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSA 295
556             I + +E+ +       GP+++A DA    F   Y G  ++  C+ + LDH +L VGY +
557 Sbjct: 219 GIAQGSESALKTATRDIGPISVAIDASHRSFQSYYTGVYYEPSCSSSQLDHAVLAVGYGS 278
559 Query: 296 KNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVS 335
560            +         +W+VKNSW   WGE GYI + R + N CG++
561 Sbjct: 279 EG-----GQDFWLVKNSWATSWGESGYIKMARNRNNNCGIA 314
564 >sp|P25782|CYS2_HOMAM DIGESTIVE CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR
565           Length = 323
567  Score =  224 bits (566), Expect = 2e-58
568  Identities = 132/349 (37%), Positives = 188/349 (53%), Gaps = 32/349 (9%)
570 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKI 59
571            MKV +LF+  V     S           +  F+ K+ ++Y   EE   R  IF+ N   I
572 Sbjct: 1   MKVAVLFLCGVALAAASP---------SWEHFKGKYGRQYVDAEEDSYRRVIFEQNQKYI 51
574 Query: 60  EELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP 119
575            EE N    N +      +NKF D++ +EF      N   I     PV+ +   +      
576 Sbjct: 52  EEFNKKYENGEVTFNLAMNKFGDMTLEEFNAVMKGN---IPRRSAPVSVFYPKKETGPQA 108
578 Query: 120 TAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECME 179
579            T  DWRT+GAVTPVK+QGQCGSCW+FSTTG++EGQHF+    L+SL+EQ LVDC      
580 Sbjct: 109 TEVDWRTKGAVTPVKDQGQCGSCWAFSTTGSLEGQHFLKTGSLISLAEQQLVDC------ 162
582 Query: 180 YEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFT 239
583                    +GCNGG   +A++YI  N GI TE++YPY A  G+ C F+S ++ A  S  T
584 Sbjct: 163 --SRPYGPQGCNGGWMNDAFDYIKANNGIDTEAAYPYEARDGS-CRFDSNSVAATCSGHT 219
586 Query: 240 MIPK-NETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGYSA 295
587             I   +ET +   +   GP+++  DA    +QFY  GV+  P C+P+ LDH +L VGY +
588 Sbjct: 220 NIASGSETGLQQAVRDIGPISVTIDAAHSSFQFYSSGVYYEPSCSPSYLDHAVLAVGYGS 279
590 Query: 296 KNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTSII 343
591            +         +W+VKNSW   WG+ GYI + R + N CG++   S  ++
592 Sbjct: 280 EG-----GQDFWLVKNSWATSWGDAGYIKMSRNRNNNCGIATVASYPLV 323
595 >sp|P07154|CATL_RAT CATHEPSIN L PRECURSOR (MAJOR EXCRETED PROTEIN) (MEP) (CYCLIC
596            PROTEIN-2) (CP-2)
597           Length = 334
599  Score =  224 bits (564), Expect = 3e-58
600  Identities = 127/351 (36%), Positives = 195/351 (55%), Gaps = 31/351 (8%)
602 Query: 3   VILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEEL 62
603            ++LL VL + T   + +       +Q+ +++    + Y   E   R  +++ N+  I+  
604 Sbjct: 4   LLLLAVLCLGTALATPK-FDQTFNAQWHQWKSTHRRLYGTNEEEWRRAVWEKNMRMIQLH 62
606 Query: 63  NLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKN------YYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFIN 116
607            N    N K      +N F D++++EF+       +  + K  +F + L +          
608 Sbjct: 63  NGEYSNGKHGFTMEMNAFGDMTNEEFRQIVNGYRHQKHKKGRLFQEPLML---------- 112
610 Query: 117 SIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHE 176
611             IP   DWR +G VTPVKNQGQCGSCW+FS +G +EGQ F+   KL+SLSEQNLVDC H+
612 Sbjct: 113 QIPKTVDWREKGCVTPVKNQGQCGSCWAFSASGCLEGQMFLKTGKLISLSEQNLVDCSHD 172
614 Query: 177 CMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKIS 236
615                +G    ++GCNGGL   A+ YI +NGG+ +E SYPY A+ G+ C + +    A  +
616 Sbjct: 173 ----QG----NQGCNGGLMDFAFQYIKENGGLDSEESYPYEAKDGS-CKYRAEYAVANDT 223
618 Query: 237 NFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGY 293
619             F  IP+ E  +   + + GP+++A DA     QFY  G++  P C+   LDHG+L+VGY
620 Sbjct: 224 GFVDIPQQEKALMKAVATVGPISVAMDASHPSLQFYSSGIYYEPNCSSKDLDHGVLVVGY 283
622 Query: 294 SAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNT-CGVSNFVSTSII 343
623              + T   K+  YW+VKNSWG +WG  GYI + + +N  CG++   S  I+
624 Sbjct: 284 GYEGTDSNKD-KYWLVKNSWGKEWGMDGYIKIAKDRNNHCGLATAASYPIV 333
627 >sp|P06797|CATL_MOUSE CATHEPSIN L PRECURSOR (MAJOR EXCRETED PROTEIN) (MEP)
628           Length = 334
630  Score =  223 bits (562), Expect = 5e-58
631  Identities = 126/351 (35%), Positives = 198/351 (55%), Gaps = 31/351 (8%)
633 Query: 3   VILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEEL 62
634            ++LL VL + T   + +       +++ +++    + Y   E   R  I++ N+  I+  
635 Sbjct: 4   LLLLAVLCLGTALATPK-FDQTFSAEWHQWKSTHRRLYGTNEEEWRRAIWEKNMRMIQLH 62
637 Query: 63  NLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKN------YYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFIN 116
638            N    N +      +N F D++++EF+       +  + K  +F + L +          
639 Sbjct: 63  NGEYSNGQHGFSMEMNAFGDMTNEEFRQVVNGYRHQKHKKGRLFQEPLML---------- 112
641 Query: 117 SIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHE 176
642             IP + DWR +G VTPVKNQGQCGSCW+FS +G +EGQ F+   KL+SLSEQNLVDC H 
643 Sbjct: 113 KIPKSVDWREKGCVTPVKNQGQCGSCWAFSASGCLEGQMFLKTGKLISLSEQNLVDCSHA 172
645 Query: 177 CMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKIS 236
646                +G    ++GCNGGL   A+ YI +NGG+ +E SYPY A+ G+ C + +    A  +
647 Sbjct: 173 ----QG----NQGCNGGLMDFAFQYIKENGGLDSEESYPYEAKDGS-CKYRAEFAVANDT 223
649 Query: 237 NFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGY 293
650             F  IP+ E  +   + + GP+++A DA     QFY  G++  P C+  +LDHG+L+VGY
651 Sbjct: 224 GFVDIPQQEKALMKAVATVGPISVAMDASHPSLQFYSSGIYYEPNCSSKNLDHGVLLVGY 283
653 Query: 294 SAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTSII 343
654              + T   KN  YW+VKNSWG++WG +GYI + + + N CG++   S  ++
655 Sbjct: 284 GYEGTDSNKN-KYWLVKNSWGSEWGMEGYIKIAKDRDNHCGLATAASYPVV 333
658 >sp|P25784|CYS3_HOMAM DIGESTIVE CYSTEINE PROTEINASE 3 PRECURSOR
659           Length = 321
661  Score =  221 bits (558), Expect = 1e-57
662  Identities = 123/317 (38%), Positives = 182/317 (56%), Gaps = 37/317 (11%)
664 Query: 32  FQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEF-- 88
665            F+ ++ +KY   +E L R  +F+ N   IE+ N    N +   K  +N+F D++++EF  
666 Sbjct: 23  FKTQYGRKYGDAKEELYRQRVFQQNEQLIEDFNKKFENGEVTFKVAMNQFGDMTNEEFNA 82
668 Query: 89  --KNYYLNNK---EAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCW 143
669              K Y   ++   +A+FT +              +    DWRT+  VTPVK+Q QCGSCW
670 Sbjct: 83  VMKGYKKGSRGEPKAVFTAEA-----------GPMAADVDWRTKALVTPVKDQEQCGSCW 131
672 Query: 144 SFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYII 203
673            +FS TG +EGQHF+  ++LVSLSEQ LVDC          +  ++GC GG   +A++YI 
674 Sbjct: 132 AFSATGALEGQHFLKNDELVSLSEQQLVDC--------STDYGNDGCGGGWMTSAFDYIK 183
676 Query: 204 KNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAAD 263
677             NGGI TESSYPY AE    C F++ +IGA  +    +   E  +   +   GP+++A D
678 Sbjct: 184 DNGGIDTESSYPYEAE-DRSCRFDANSIGAICTGSVEVQHTEEALQEAVSGVGPISVAID 242
680 Query: 264 A--VEWQFYIGGV-FDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQ 320
681            A    +QFY  GV ++  C+P  LDHG+L VGY  ++T       YW+VKNSWG+ WG+ 
682 Sbjct: 243 ASHFSFQFYSSGVYYEQNCSPTFLDHGVLAVGYGTEST-----KDYWLVKNSWGSSWGDA 297
684 Query: 321 GYIYLRRGK-NTCGVSN 336
685            GYI + R + N CG+++
686 Sbjct: 298 GYIKMSRNRDNNCGIAS 314
689 >sp|P41721|CATV_NPVBM VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)
690           Length = 323
692  Score =  221 bits (557), Expect = 2e-57
693  Identities = 131/342 (38%), Positives = 181/342 (52%), Gaps = 26/342 (7%)
695 Query: 5   LLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKIEELN 63
696            +LF L V+ V  S+   P +  + F EF  +FNK YS E E L RF+IF+ NL +I    
697 Sbjct: 4   ILFYLFVYAVVKSAAYDPLKAPNYFEEFVHRFNKNYSSEVEKLRRFKIFQHNLNEI---- 59
699 Query: 64  LIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD 123
700             I  N     K+ +NKF+DLS DE    Y        T +      LD       P  FD
701 Sbjct: 60  -INKNQNDSAKYEINKFSDLSKDETIAKYTGLSLPTQTQNFCKVILLDQP-PGKGPLEFD 117
703 Query: 124 WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGE 183
704            WR    VT VKNQG CG+CW+F+T G++E Q  I  N+L++LSEQ ++DCD         
705 Sbjct: 118 WRRLNKVTSVKNQGMCGACWAFATLGSLESQFAIKHNELINLSEQQMIDCDF-------- 169
707 Query: 184 EACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISN-FTMIP 242
708               D GCNGGL   A+  IIK GG+Q ES YPY A+    C  NS     ++ + +  I 
709 Sbjct: 170 --VDAGCNGGLLHTAFEAIIKMGGVQLESDYPYEAD-NNNCRMNSNKFLVQVKDCYRYII 226
711 Query: 243 KNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRK 302
712              E  +   +   GP+ +A DA +   Y  G+    C  + L+H +L+VGY  +N     
713 Sbjct: 227 VYEEKLKDLLPLVGPIPMAIDAADIVNYKQGIIKY-CFDSGLNHAVLLVGYGVEN----- 280
715 Query: 303 NMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSN-FVSTSII 343
716            N+PYW  KN+WG DWGE G+  +++  N CG+ N   ST++I
717 Sbjct: 281 NIPYWTFKNTWGTDWGEDGFFRVQQNINACGMRNELASTAVI 322
720 >sp|P41715|CATV_NPVCF VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)
721           Length = 324
723  Score =  220 bits (554), Expect = 4e-57
724  Identities = 131/344 (38%), Positives = 188/344 (54%), Gaps = 27/344 (7%)
726 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKI 59
727            M  I+L++L    V  ++  +  +  + F +F  KFNK YS E E L RF+IF+ NL +I
728 Sbjct: 1   MNKIVLYLLVYGAVQCAAYDVL-KAPNYFEDFLHKFNKSYSSESEKLRRFQIFRHNLEEI 59
730 Query: 60  EELNLIAINHKADT-KFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSI 118
731                 I  NH   T ++ +NKFADLS DE  + Y      + T +      LD    +  
732 Sbjct: 60  -----INKNHNDSTAQYEINKFADLSKDETISKYTGLSLPLQTQNFCEVVVLDRP-PDKG 113
734 Query: 119 PTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECM 178
735            P  FDWR    VT VKNQG CG+CW+F+T G++E Q  I  N+ ++LSEQ L+DCD    
736 Sbjct: 114 PLEFDWRRLNKVTSVKNQGMCGACWAFATLGSLESQFAIKHNQFINLSEQQLIDCDF--- 170
738 Query: 179 EYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISN- 237
739                    D GC+GGL   A+  ++  GGIQ ES YPY A  G  C  N+A    K+   
740 Sbjct: 171 -------VDAGCDGGLLHTAFEAVMNMGGIQAESDYPYEANNG-DCRANAAKFVVKVKKC 222
742 Query: 238 FTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKN 297
743            +  I   E  +   + S GP+ +A DA +   Y  G+    C  + L+H +L+VGY+ +N
744 Sbjct: 223 YRYITVFEEKLKDLLRSVGPIPVAIDASDIVNYKRGIMKY-CANHGLNHAVLLVGYAVEN 281
746 Query: 298 TIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTS 341
747                  +P+WI+KN+WGADWGEQGY  +++  N CG+ N + +S
748 Sbjct: 282 -----GVPFWILKNTWGADWGEQGYFRVQQNINACGIQNELPSS 320
751 >sp|P25975|CATL_BOVIN CATHEPSIN L PRECURSOR
752           Length = 334
754  Score =  218 bits (550), Expect = 1e-56
755  Identities = 124/342 (36%), Positives = 182/342 (52%), Gaps = 25/342 (7%)
757 Query: 7   FVLAVFTVFVSSRG--IPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNL 64
758            F L V  + V+S    + P   + + +++    + Y   E   R  +++ N   I+  N 
759 Sbjct: 5   FFLTVLCLGVASAAPKLDPNLDAHWHQWKATHRRLYGMNEEEWRRAVWEKNKKIIDLHNQ 64
761 Query: 65  IAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFK---NYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTA 121
762                 K   +  +N F D++++EF+   N + N K               +  +  +P +
763 Sbjct: 65  EYSEGKHAFRMAMNAFGDMTNEEFRQVMNGFQNQKHK-------KGKLFHEPLLVDVPKS 117
765 Query: 122 FDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYE 181
766             DW  +G VTPVKNQGQCGSCW+FS TG +EGQ F    KLVSLSEQNLVDC       +
767 Sbjct: 118 VDWTKKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSATGALEGQMFRKTGKLVSLSEQNLVDCSRA----Q 173
769 Query: 182 GEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMI 241
770            G    ++GCNGGL  NA+ YI  NGG+ +E SYPY A     CN+      A  + F  I
771 Sbjct: 174 G----NQGCNGGLMDNAFQYIKDNGGLDSEESYPYLATDTNSCNYKPECSAANDTGFVDI 229
773 Query: 242 PKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGV-FDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNT 298
774            P+ E  +   + + GP+++A DA    +QFY  G+ +D  C+   LDHG+L+VGY  + T
775 Sbjct: 230 PQREKALMKAVATVGPISVAIDAGHTSFQFYKSGIYYDPDCSCKDLDHGVLVVGYGFEGT 289
777 Query: 299 IFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNT-CGVSNFVS 339
778                N  +WIVKNSWG +WG  GY+ + + +N  CG++   S
779 Sbjct: 290 DSNNN-KFWIVKNSWGPEWGWNGYVKMAKDQNNHCGIATAAS 330
782 >sp|P36400|LCPB_LEIME CYSTEINE PROTEINASE B PRECURSOR
783           Length = 443
785  Score =  218 bits (549), Expect = 2e-56
786  Identities = 123/320 (38%), Positives = 177/320 (54%), Gaps = 34/320 (10%)
788 Query: 29  FLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKA---DTKFGVNKFADLS 84
789            F EF+  + + Y    E  +R   F+ NL  + E       H+A     +FG+ KF DLS
790 Sbjct: 38  FEEFKRTYGRAYETLAEEQQRLANFERNLELMRE-------HQARNPHAQFGITKFFDLS 90
792 Query: 85  SDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEF--INSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSC 142
793              EF   YLN            A +       ++++P A DWR +GAVTPVK+QG CGSC
794 Sbjct: 91  EAEFAARYLNGAAYFAAAKRHAAQHYRKARADLSAVPDAVDWREKGAVTPVKDQGACGSC 150
796 Query: 143 WSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYI 202
797            W+FS  GN+EGQ +++ ++LVSLSEQ LV CD            ++GC+GGL   A++++
798 Sbjct: 151 WAFSAVGNIEGQWYLAGHELVSLSEQQLVSCDD----------MNDGCDGGLMLQAFDWL 200
800 Query: 203 IK--NGGIQTESSYPYTAETG--TQC-NFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGP 257
801            ++  NG + TE SYPY +  G   +C N +   +GA+I    +I  +E  MA ++   GP
802 Sbjct: 201 LQNTNGHLHTEDSYPYVSGNGYVPECSNSSELVVGAQIDGHVLIGSSEKAMAAWLAKNGP 260
804 Query: 258 LAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADW 317
805            +AIA DA  +  Y  GV    C    L+HG+L+VGY     +     PYW++KNSWG DW
806 Sbjct: 261 IAIALDASSFMSYKSGVL-TACIGKQLNHGVLLVGYDMTGEV-----PYWVIKNSWGGDW 314
808 Query: 318 GEQGYIYLRRGKNTCGVSNF 337
809            GEQGY+ +  G N C +S +
810 Sbjct: 315 GEQGYVRVVMGVNACLLSEY 334
813 >sp|Q05094|CYS2_LEIPI CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR (AMASTIGOTE CYSTEINE PROTEINASE
814            A-2)
815           Length = 444
817  Score =  218 bits (549), Expect = 2e-56
818  Identities = 123/321 (38%), Positives = 178/321 (55%), Gaps = 35/321 (10%)
820 Query: 29  FLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKA---DTKFGVNKFADLS 84
821            F EF+  + + Y    E  +R   F+ NL  + E       H+A     +FG+ KF DLS
822 Sbjct: 38  FEEFKRTYGRAYETLAEEQQRLANFERNLELMRE-------HQARNPHAQFGITKFFDLS 90
824 Query: 85  SDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEF--INSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSC 142
825              EF   YLN            A +       ++++P A DWR +GAVTPVK+QG CGSC
826 Sbjct: 91  EAEFAARYLNGAAYFAAAKRHAAQHYRKARADLSAVPDAVDWREKGAVTPVKDQGACGSC 150
828 Query: 143 WSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYI 202
829            W+FS  GN+EGQ +++ ++LVSLSEQ LV CD            ++GC+GGL   A++++
830 Sbjct: 151 WAFSAVGNIEGQWYLAGHELVSLSEQQLVSCDD----------MNDGCDGGLMLQAFDWL 200
832 Query: 203 IK--NGGIQTESSYPYTAETG--TQCNFNSAN--IGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTG 256
833            ++  NG + TE SYPY +  G   +C+ +S    +GA+I    +I  +E  MA ++   G
834 Sbjct: 201 LQNTNGHLHTEDSYPYVSGNGYVPECSNSSEELVVGAQIDGHVLIGSSEKAMAAWLAKNG 260
836 Query: 257 PLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGAD 316
837            P+AIA DA  +  Y  GV    C    L+HG+L+VGY     +     PYW++KNSWG D
838 Sbjct: 261 PIAIALDASSFMSYKSGVL-TACIGKQLNHGVLLVGYDMTGEV-----PYWVIKNSWGGD 314
840 Query: 317 WGEQGYIYLRRGKNTCGVSNF 337
841            WGEQGY+ +  G N C +S +
842 Sbjct: 315 WGEQGYVRVVMGVNACLLSEY 335
845 >sp|P12412|CYSP_VIGMU VIGNAIN PRECURSOR (BEAN ENDOPEPTIDASE) (CYSTEINE PROTEINASE)
846            (SULFHYDRYL-ENDOPEPTIDASE) (SH-EP)
847           Length = 362
849  Score =  217 bits (547), Expect = 3e-56
850  Identities = 127/306 (41%), Positives = 179/306 (57%), Gaps = 29/306 (9%)
852 Query: 47  ERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNK---EAIFTDD 103
853            +RF +FK+N+  +   N +   +K      +NKFAD+++ EF++ Y  +K     +F   
854 Sbjct: 58  KRFNVFKANVMHVHNTNKMDKPYKLK----LNKFADMTNHEFRSTYAGSKVNHHKMFRGS 113
856 Query: 104 LPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLV 163
857               +     E + S+P + DWR +GAVT VK+QGQCGSCW+FST   VEG + I  NKLV
858 Sbjct: 114 QHGSGTFMYEKVGSVPASVDWRKKGAVTDVKDQGQCGSCWAFSTIVAVEGINQIKTNKLV 173
860 Query: 164 SLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQ 223
861            SLSEQ LVDCD E          ++GCNGGL  +A+ +I + GGI TES+YPYTA+ GT 
862 Sbjct: 174 SLSEQELVDCDKE---------ENQGCNGGLMESAFEFIKQKGGITTESNYPYTAQEGT- 223
864 Query: 224 CNFNSAN-IGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCN 280
865            C+ +  N +   I     +P N+       V+  P+++A DA   ++QFY  GVF   CN
866 Sbjct: 224 CDESKVNDLAVSIDGHENVPVNDENALLKAVANQPVSVAIDAGGSDFQFYSEGVFTGDCN 283
868 Query: 281 PNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG----KNTCGVSN 336
869               L+HG+ IVGY    T+   N  YWIV+NSWG +WGEQGYI ++R     +  CG++ 
870 Sbjct: 284 -TDLNHGVAIVGYG--TTVDGTN--YWIVRNSWGPEWGEQGYIRMQRNISKKEGLCGIAM 338
872 Query: 337 FVSTSI 342
873              S  I
874 Sbjct: 339 MASYPI 344
877 >sp|P07711|CATL_HUMAN CATHEPSIN L PRECURSOR (MAJOR EXCRETED PROTEIN) (MEP)
878           Length = 333
880  Score =  215 bits (543), Expect = 8e-56
881  Identities = 124/341 (36%), Positives = 186/341 (54%), Gaps = 26/341 (7%)
883 Query: 8   VLAVFTVFVSSRGIPPEE--QSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLI 65
884            +LA F + ++S  +  +   ++Q+ +++   N+ Y   E   R  +++ N+  IE  N  
885 Sbjct: 6   ILAAFCLGIASATLTFDHSLEAQWTKWKAMHNRLYGMNEEGWRRAVWEKNMKMIELHNQE 65
887 Query: 66  AINHKADTKFGVNKFADLSSDEFK---NYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAF 122
888                K      +N F D++S+EF+   N + N K               +      P + 
889 Sbjct: 66  YREGKHSFTMAMNAFGDMTSEEFRQVMNGFQNRKPR-------KGKVFQEPLFYEAPRSV 118
891 Query: 123 DWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEG 182
892            DWR +G VTPVKNQGQCGSCW+FS TG +EGQ F    +L+SLSEQNLVDC        G
893 Sbjct: 119 DWREKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSATGALEGQMFRKTGRLISLSEQNLVDC-------SG 171
895 Query: 183 EEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIP 242
896             +  +EGCNGGL   A+ Y+  NGG+ +E SYPY A T   C +N     A  + F  IP
897 Sbjct: 172 PQG-NEGCNGGLMDYAFQYVQDNGGLDSEESYPYEA-TEESCKYNPKYSVANDTGFVDIP 229
899 Query: 243 KNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGV-FDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTI 299
900            K E  +   + + GP+++A DA    + FY  G+ F+  C+   +DHG+L+VGY  ++T 
901 Sbjct: 230 KQEKALMKAVATVGPISVAIDAGHESFLFYKEGIYFEPDCSSEDMDHGVLVVGYGFEST- 288
903 Query: 300 FRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG-KNTCGVSNFVS 339
904               N  YW+VKNSWG +WG  GY+ + +  +N CG+++  S
905 Sbjct: 289 ESDNNKYWLVKNSWGEEWGMGGYVKMAKDRRNHCGIASAAS 329
908 >sp|Q28944|CATL_PIG CATHEPSIN L PRECURSOR
909           Length = 334
911  Score =  214 bits (540), Expect = 2e-55
912  Identities = 117/307 (38%), Positives = 165/307 (53%), Gaps = 23/307 (7%)
914 Query: 40  YSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFK---NYYLNNK 96
915            Y   E   R  +++ N+  IE  N      K      +N F D++++EF+   N + N K
916 Sbjct: 40  YGMNEEGWRRAVWEKNMKMIELHNQEYSQGKHGFSMAMNAFGDMTNEEFRQVMNGFQNQK 99
918 Query: 97  EAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHF 156
919                           +  +  +P + DWR +G VT VKNQGQCGSCW+FS TG +EGQ F
920 Sbjct: 100 HK-------KGKVFHESLVLEVPKSVDWREKGYVTAVKNQGQCGSCWAFSATGALEGQMF 152
922 Query: 157 ISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPY 216
923                KLVSLSEQNLVDC       +G    ++GCNGGL  NA+ Y+  NGG+ TE SYPY
924 Sbjct: 153 RKTGKLVSLSEQNLVDCSRP----QG----NQGCNGGLMDNAFQYVKDNGGLDTEESYPY 204
926 Query: 217 TAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGV 274
927                   C +      A  + F  IP+ E  +   + + GP+++A DA    +QFY  G+
928 Sbjct: 205 LGRETNSCTYKPECSAANDTGFVDIPQREKALMKAVATVGPISVAIDAGHSSFQFYKSGI 264
930 Query: 275 -FDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNT-C 332
931             +D  C+   LDHG+L+VGY  + T    +  +WIVKNSWG +WG  GY+ + + +N  C
932 Sbjct: 265 YYDPDCSSKDLDHGVLVVGYGFEGT-DSNSSKFWIVKNSWGPEWGWNGYVKMAKDQNNHC 323
934 Query: 333 GVSNFVS 339
935            G+S   S
936 Sbjct: 324 GISTAAS 330
939 >sp|P25783|CATV_NPVAC VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)
940           Length = 323
942  Score =  213 bits (538), Expect = 3e-55
943  Identities = 129/342 (37%), Positives = 179/342 (51%), Gaps = 26/342 (7%)
945 Query: 5   LLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKIEELN 63
946            +LF L V+ V  S+     +  + F EF  +FNK Y  E E L RF+IF+ NL +I    
947 Sbjct: 4   ILFYLFVYGVVNSAAYDLLKAPNYFEEFVHRFNKDYGSEVEKLRRFKIFQHNLNEI---- 59
949 Query: 64  LIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD 123
950             I  N     K+ +NKF+DLS DE    Y      I T +      LD       P  FD
951 Sbjct: 60  -INKNQNDSAKYEINKFSDLSKDETIAKYTGLSLPIQTQNFCKVIVLDQP-PGKGPLEFD 117
953 Query: 124 WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGE 183
954            WR    VT VKNQG CG+CW+F+T  ++E Q  I  N+L++LSEQ ++DCD         
955 Sbjct: 118 WRRLNKVTSVKNQGMCGACWAFATLASLESQFAIKHNQLINLSEQQMIDCDF-------- 169
957 Query: 184 EACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISN-FTMIP 242
958               D GCNGGL   A+  IIK GG+Q ES YPY A+    C  NS     ++ + +  I 
959 Sbjct: 170 --VDAGCNGGLLHTAFEAIIKMGGVQLESDYPYEAD-NNNCRMNSNKFLVQVKDCYRYIT 226
961 Query: 243 KNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRK 302
962              E  +   +   GP+ +A DA +   Y  G+    C  + L+H +L+VGY  +N     
963 Sbjct: 227 VYEEKLKDLLRLVGPIPMAIDAADIVNYKQGIIKY-CFNSGLNHAVLLVGYGVEN----- 280
965 Query: 303 NMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSN-FVSTSII 343
966            N+PYW  KN+WG DWGE G+  +++  N CG+ N   ST++I
967 Sbjct: 281 NIPYWTFKNTWGTDWGEDGFFRVQQNINACGMRNELASTAVI 322
970 >sp|Q40143|CYS3_LYCES CYSTEINE PROTEINASE 3 PRECURSOR
971           Length = 356
973  Score =  212 bits (535), Expect = 7e-55
974  Identities = 126/324 (38%), Positives = 176/324 (53%), Gaps = 34/324 (10%)
976 Query: 29  FLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDE 87
977            F  F  +  K+Y S EE  +RFEIF  NL  I   N   +++K     G+N+F DL+ DE
978 Sbjct: 57  FARFAIRHRKRYDSVEEIKQRFEIFLDNLKMIRSHNRKGLSYK----LGINEFTDLTWDE 112
980 Query: 88  FKNYYLN---NKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWS 144
981            F+ + L    N  A    +L + + +       +P   DWR  G V+PVK QG+CGSCW+
982 Sbjct: 113 FRKHKLGASQNCSATTKGNLKLTNVV-------LPETKDWRKDGIVSPVKAQGKCGSCWT 165
984 Query: 145 FSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK 204
985            FSTTG +E  +  +  K +SLSEQ LVDC      +        GCNGGL   A+ YI  
986 Sbjct: 166 FSTTGALEAAYAQAFGKGISLSEQQLVDCAGAFNNF--------GCNGGLPSQAFEYIKF 217
988 Query: 205 NGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVS-TGPLAIAAD 263
989            NGG+ TE +YPYT + G  C F+ ANIG K+ +   I         Y V+   P+++A +
990 Sbjct: 218 NGGLDTEEAYPYTGKNGI-CKFSQANIGVKVISSVNITLGAEYELKYAVALVRPVSVAFE 276
992 Query: 264 AVE-WQFYIGGVF---DIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGE 319
993             V+ ++ Y  GV+   +    P  ++H +L VGY  +N       PYW++KNSWGADWGE
994 Sbjct: 277 VVKGFKQYKSGVYASTECGDTPMDVNHAVLAVGYGVEN-----GTPYWLIKNSWGADWGE 331
996 Query: 320 QGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
997             GY  +  GKN CGV+   S  I+
998 Sbjct: 332 DGYFKMEMGKNMCGVATCASYPIV 355
1001 >sp|O60911|CATM_HUMAN CATHEPSIN L2 PRECURSOR (CATHEPSIN V)
1002           Length = 334
1004  Score =  210 bits (528), Expect = 5e-54
1005  Identities = 127/349 (36%), Positives = 191/349 (54%), Gaps = 35/349 (10%)
1007 Query: 5   LLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQS---QFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEE 61
1008            L  VLA F + ++S  +P  +Q+   ++ +++    + Y   E   R  +++ N+  IE 
1009 Sbjct: 3   LSLVLAAFCLGIAS-AVPKFDQNLDTKWYQWKATHRRLYGANEEGWRRAVWEKNMKMIEL 61
1011 Query: 62  LNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNY---YLNNK---EAIFTDDLPVADYLDDEFI 115
1012             N      K      +N F D++++EF+     + N K     +F + L    +LD    
1013 Sbjct: 62  HNGEYSQGKHGFTMAMNAFPDMTNEEFRQMMGCFRNQKFRKGKVFREPL----FLD---- 113
1015 Query: 116 NSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDH 175
1016              +P + DWR +G VTPVKNQ QCGSCW+FS TG +EGQ F    KLVSLSEQNLVDC  
1017 Sbjct: 114 --LPKSVDWRKKGYVTPVKNQKQCGSCWAFSATGALEGQMFRKTGKLVSLSEQNLVDCSR 171
1019 Query: 176 ECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKI 235
1020                 +G    ++GCNGG    A+ Y+ +NGG+ +E SYPY A     C +   N  A  
1021 Sbjct: 172 P----QG----NQGCNGGFMARAFQYVKENGGLDSEESYPYVA-VDEICKYRPENSVAND 222
1023 Query: 236 SNFTMI-PKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGV-FDIPCNPNSLDHGILIV 291
1024            + FT++ P  E  +   + + GP+++A DA    +QFY  G+ F+  C+  +LDHG+L+V
1025 Sbjct: 223 TGFTVVAPGKEKALMKAVATVGPISVAMDAGHSSFQFYKSGIYFEPDCSSKNLDHGVLVV 282
1027 Query: 292 GYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNT-CGVSNFVS 339
1028            GY  +      N  YW+VKNSWG +WG  GY+ + + KN  CG++   S
1029 Sbjct: 283 GYGFEGA-NSNNSKYWLVKNSWGPEWGSNGYVKIAKDKNNHCGIATAAS 330
1032 >sp|P54639|CYS4_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 4 PRECURSOR
1033           Length = 442
1035  Score =  209 bits (527), Expect = 6e-54
1036  Identities = 116/300 (38%), Positives = 167/300 (55%), Gaps = 24/300 (8%)
1038 Query: 4   ILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQ--SQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEE 61
1039            +L F+  +   + S++    E Q  + F  +     + YS EE+  R++IFKSN+  + +
1040 Sbjct: 3   VLSFLCLLLVSYASAKQQFSELQYRNAFTNWMQAHQRTYSSEEFNARYQIFKSNMDYVHQ 62
1042 Query: 62  LNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTA 121
1043             N    +   +T  G+N FAD+++ E++  YL      F     +    +  F    PT 
1044 Sbjct: 63  WN----SKGGETVLGLNVFADITNQEYRTTYLGTP---FDGSALIGTEEEKIFSTPAPTV 115
1046 Query: 122 FDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFIS---QNKLVSLSEQNLVDCDHECM 178
1047             DWR +GAVTP+KNQGQCG CWSFSTTG+ EG HFI+   +  LVSLSEQNL+DC     
1048 Sbjct: 116 -DWRAQGAVTPIKNQGQCGGCWSFSTTGSTEGAHFIASGTKKDLVSLSEQNLIDCS---- 170
1050 Query: 179 EYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNF 238
1051                +   + GC GGL    + YII N GI TESSYPYTAE G +C F ++NIGA+I ++
1052 Sbjct: 171 ----KSYGNNGCEGGLMTLGFEYIINNKGIDTESSYPYTAEDGKECKFKTSNIGAQIVSY 226
1054 Query: 239 TMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGYSA 295
1055              +            +  P+++A DA    +Q Y  G++  P C P  LDHG+L+VGY +
1056 Sbjct: 227 QNVTSGSEASLQSASNNAPVSVAIDASNESFQLYESGIYYEPACTPTQLDHGVLVVGYGS 286
1059  Score = 48.8 bits (114), Expect = 2e-05
1060  Identities = 18/35 (51%), Positives = 24/35 (68%), Gaps = 1/35 (2%)
1062 Query: 306 YWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVS 339
1063            YWIVKNSWG  WG  GYI++ + + N CG++   S
1064 Sbjct: 401 YWIVKNSWGTSWGMDGYIFMSKDRNNNCGIATMAS 435
1067 >sp|Q10991|CATL_SHEEP CATHEPSIN L
1068           Length = 217
1070  Score =  209 bits (527), Expect = 6e-54
1071  Identities = 104/226 (46%), Positives = 140/226 (61%), Gaps = 17/226 (7%)
1073 Query: 118 IPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHEC 177
1074            +P + DW  +G VTPVKNQGQCGSCW+FS TG +EGQ F    KLVSLSEQNLVD     
1075 Sbjct: 1   VPKSVDWTKKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSATGALEGQMFRKTGKLVSLSEQNLVD----- 55
1077 Query: 178 MEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISN 237
1078                     ++GCNGGL  NA+ YI +NGG+ +E SYPY A T T CN+      AK + 
1079 Sbjct: 56  ---SSRPQGNQGCNGGLMDNAFQYIKENGGLDSEESYPYEA-TDTSCNYKPEYSAAKDTG 111
1081 Query: 238 FTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGV-FDIPCNPNSLDHGILIVGYS 294
1082            F  IP+ E  +   + + GP+++A DA    +QFY  G+ +D  C+   LDHG+L+VGY 
1083 Sbjct: 112 FVDIPQREKALMKAVATVGPISVAIDAGHSSFQFYKSGIYYDPDCSSKDLDHGVLVVGYG 171
1085 Query: 295 AKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNT-CGVSNFVS 339
1086             + T    N  +WIVKNSWG +WG +GY+ + + +N  CG++   S
1087 Sbjct: 172 FEGT----NNKFWIVKNSWGPEWGNKGYVKMAKDQNNHCGIATAAS 213
1090 >sp|P25803|CYSP_PHAVU VIGNAIN PRECURSOR (BEAN ENDOPEPTIDASE) (CYSTEINE PROTEINASE EP-C1)
1091           Length = 362
1093  Score =  208 bits (523), Expect = 2e-53
1094  Identities = 124/306 (40%), Positives = 176/306 (56%), Gaps = 29/306 (9%)
1096 Query: 47  ERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNK---EAIFTDD 103
1097            +RF +FK+NL  +   N +   +K      +NKFAD+++ EF++ Y  +K     +F   
1098 Sbjct: 58  KRFNVFKANLMHVHNTNKMDKPYKLK----LNKFADMTNHEFRSTYAGSKVNHPRMFRGT 113
1100 Query: 104 LPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLV 163
1101                     E + S+P + DWR +GAVT VK+QGQCGSCW+FST   VEG + I  NKLV
1102 Sbjct: 114 PHENGAFMYEKVVSVPPSVDWRKKGAVTDVKDQGQCGSCWAFSTVVAVEGINQIKTNKLV 173
1104 Query: 164 SLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQ 223
1105            +LSEQ LVDCD E          ++GCNGGL  +A+ +I + GGI TES+YPY A+ GT 
1106 Sbjct: 174 ALSEQELVDCDKE---------ENQGCNGGLMESAFEFIKQKGGITTESNYPYKAQEGT- 223
1108 Query: 224 CNFNSAN-IGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCN 280
1109            C+ +  N +   I     +P N+       V+  P+++A DA   ++QFY  GVF   C+
1110 Sbjct: 224 CDASKVNDLAVSIDGHENVPANDEDALLKAVANQPVSVAIDAGGSDFQFYSEGVFTGDCS 283
1112 Query: 281 PNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG----KNTCGVSN 336
1113               L+HG+ IVGY    T+   N  YWIV+NSWG +WGE GYI ++R     +  CG++ 
1114 Sbjct: 284 -TDLNHGVAIVGYG--TTVDGTN--YWIVRNSWGPEWGEHGYIRMQRNISKKEGLCGIAM 338
1116 Query: 337 FVSTSI 342
1117              S  I
1118 Sbjct: 339 LPSYPI 344
1121 >sp|P00785|ACTN_ACTCH ACTINIDAIN PRECURSOR (ACTINIDIN)
1122           Length = 380
1124  Score =  206 bits (520), Expect = 4e-53
1125  Identities = 123/327 (37%), Positives = 176/327 (53%), Gaps = 35/327 (10%)
1127 Query: 24  EEQSQFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADT----KFGVN 78
1128            E ++ +  +  K+ K Y S  E+  RFEIFK  L  I+E       H ADT    K G+N
1129 Sbjct: 37  EVKAMYESWLIKYGKSYNSLGEWERRFEIFKETLRFIDE-------HNADTNRSYKVGLN 89
1131 Query: 79  KFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQ 138
1132            +FADL+ +EF++ YL       ++   V++  +  F   +P+  DWR+ GAV  +K+QG+
1133 Sbjct: 90  QFADLTDEEFRSTYLGFTSG--SNKTKVSNRYEPRFGQVLPSYVDWRSAGAVVDIKSQGE 147
1135 Query: 139 CGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNA 198
1136            CG CW+FS    VEG + I    L+SLSEQ L+DC        G      GCNGG   + 
1137 Sbjct: 148 CGGCWAFSAIATVEGINKIVTGVLISLSEQELIDC--------GRTQNTRGCNGGYITDG 199
1139 Query: 199 YNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIG-AKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGP 257
1140            + +II NGGI TE +YPYTA+ G +CN +  N     I  +  +P N        V+  P
1141 Sbjct: 200 FQFIINNGGINTEENYPYTAQDG-ECNLDLQNEKYVTIDTYENVPYNNEWALQTAVTYQP 258
1143 Query: 258 LAIAADAV--EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGA 315
1144            +++A DA    ++ Y  G+F  PC   ++DH + IVGY  +  I      YWIVKNSW  
1145 Sbjct: 259 VSVALDAAGDAFKHYSSGIFTGPCG-TAIDHAVTIVGYGTEGGI-----DYWIVKNSWDT 312
1147 Query: 316 DWGEQGYIYLRR---GKNTCGVSNFVS 339
1148             WGE+GY+ + R   G  TCG++   S
1149 Sbjct: 313 TWGEEGYMRILRNVGGAGTCGIATMPS 339
1152 >sp|P43156|CYSP_HEMSP THIOL PROTEASE SEN102 PRECURSOR
1153           Length = 360
1155  Score =  203 bits (510), Expect = 6e-52
1156  Identities = 125/304 (41%), Positives = 164/304 (53%), Gaps = 30/304 (9%)
1158 Query: 43  EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTD 102
1159            +E   RF +FK N+  I E N       A  K  +NKF D+++ EF++ Y  +K      
1160 Sbjct: 54  DEKNRRFNVFKENVKFIHEFNQ---KKDAPYKLALNKFGDMTNQEFRSKYAGSKIQHHRS 110
1162 Query: 103 DLPVADYLDD---EFINSIPTA-FDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFIS 158
1163               +         E + S+P A  DWR +GAVT VK+QGQCGSCW+FST  +VEG + I 
1164 Sbjct: 111 QRGIQKNTGSFMYENVGSLPAASIDWRAKGAVTGVKDQGQCGSCWAFSTIASVEGINQIK 170
1166 Query: 159 QNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTA 218
1167              +LVSLSEQ LVDCD          + +EGCNGGL   A+ +I KN GI TE SYPY  
1168 Sbjct: 171 TGELVSLSEQELVDCD---------TSYNEGCNGGLMDYAFEFIQKN-GITTEDSYPYAE 220
1170 Query: 219 ETGTQCNFNSANIG-AKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVF 275
1171            + GT C  N  N     I     +P N        V+  P++++ +A    +QFY  GVF
1172 Sbjct: 221 QDGT-CASNLLNSPVVSIDGHQDVPANNENALMQAVANQPISVSIEASGYGFQFYSEGVF 279
1174 Query: 276 DIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG----KNT 331
1175               C    LDHG+ IVGY A     R    YWIVKNSWG +WGE GYI ++RG    +  
1176 Sbjct: 280 TGRCG-TELDHGVAIVGYGAT----RDGTKYWIVKNSWGEEWGESGYIRMQRGISDKRGK 334
1178 Query: 332 CGVS 335
1179            CG++
1180 Sbjct: 335 CGIA 338
1183 >sp|P25777|ORYB_ORYSA ORYZAIN BETA CHAIN PRECURSOR
1184           Length = 471
1186  Score =  203 bits (510), Expect = 6e-52
1187  Identities = 115/303 (37%), Positives = 165/303 (53%), Gaps = 25/303 (8%)
1189 Query: 44  EYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDD 103
1190            E+  RF +F  NL  ++  N  A +     + G+N+FADL+++EF+  +L  K A     
1191 Sbjct: 69  EHERRFLVFWDNLKFVDAHNARA-DEGGGFRLGMNRFADLTNEEFRATFLGAKVA--ERS 125
1193 Query: 104 LPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLV 163
1194                +    + +  +P + DWR +GAV PVKNQGQCGSCW+FS    VE  + +   +++
1195 Sbjct: 126 RAAGERYRHDGVEELPESVDWREKGAVAPVKNQGQCGSCWAFSAVSTVESINQLVTGEMI 185
1197 Query: 164 SLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQ 223
1198            +LSEQ LV+C             + GCNGGL  +A+++IIKNGGI TE  YPY A  G +
1199 Sbjct: 186 TLSEQELVEC--------STNGQNSGCNGGLMADAFDFIIKNGGIDTEDDYPYKAVDG-K 236
1201 Query: 224 CNFNSANIG-AKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCN 280
1202            C+ N  N     I  F  +P+N+       V+  P+++A +A   E+Q Y  GVF   C 
1203 Sbjct: 237 CDINRENAKVVSIDGFEDVPQNDEKSLQKAVAHQPVSVAIEAGGREFQLYHSGVFSGRCG 296
1205 Query: 281 PNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNT----CGVSN 336
1206              SLDHG++ VGY   N        YWIV+NSWG  WGE GY+ + R  N     CG++ 
1207 Sbjct: 297 -TSLDHGVVAVGYGTDN-----GKDYWIVRNSWGPKWGESGYVRMERNINVTTGKCGIAM 350
1209 Query: 337 FVS 339
1210              S
1211 Sbjct: 351 MAS 353
1214 >sp|Q10717|CYS2_MAIZE CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR
1215           Length = 360
1217  Score =  201 bits (505), Expect = 2e-51
1218  Identities = 119/327 (36%), Positives = 175/327 (53%), Gaps = 36/327 (11%)
1220 Query: 28  QFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSD 86
1221            +F  F  ++ K Y S  E  +RF IF  +L  +   N   ++++     G+N+FAD+S +
1222 Sbjct: 58  RFARFAVRYGKSYESAAEVHKRFRIFSESLQLVRSTNRKGLSYR----LGINRFADMSWE 113
1224 Query: 87  EFKNYYLN---NKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCW 143
1225            EF+   L    N  A  T      ++       ++P   DWR  G V+PVKNQG CGSCW
1226 Sbjct: 114 EFRATRLGAAQNCSATLT-----GNHRMRAAAVALPETKDWREDGIVSPVKNQGHCGSCW 168
1228 Query: 144 SFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYII 203
1229            +FSTTG +E  +  +  K +SLSEQ LVDC      +        GCNGGL   A+ YI 
1230 Sbjct: 169 TFSTTGALEAAYTQATGKPISLSEQQLVDCGFAFNNF--------GCNGGLPSQAFEYIK 220
1232 Query: 204 KNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKI---SNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAI 260
1233             NGG+ TE SYPY    G  C F + N+G K+    N T+  ++E   A  +V   P+++
1234 Sbjct: 221 YNGGLDTEESYPYQGVNGI-CKFKNENVGVKVLDSVNITLGAEDELKDAVGLVR--PVSV 277
1236 Query: 261 AADAVE-WQFYIGGVF---DIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGAD 316
1237            A + +  ++ Y  GV+        P  ++H +L VGY  ++      +PYW++KNSWGAD
1238 Sbjct: 278 AFEVITGFRLYKSGVYTSDHCGTTPMDVNHAVLAVGYGVED-----GVPYWLIKNSWGAD 332
1240 Query: 317 WGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
1241            WG++GY  +  GKN CGV+   S  I+
1242 Sbjct: 333 WGDEGYFKMEMGKNMCGVATCASYPIV 359
1245 >sp|P00786|CATH_RAT CATHEPSIN H PRECURSOR (CATHEPSIN B3) (CATHEPSIN BA)
1246           Length = 333
1248  Score =  200 bits (504), Expect = 3e-51
1249  Identities = 121/324 (37%), Positives = 172/324 (52%), Gaps = 28/324 (8%)
1251 Query: 25  EQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLS 84
1252            E+  F  +  +  K YS  EY  R ++F +N  KI+  N    NH    K G+N+F+D+S
1253 Sbjct: 29  EKFHFTSWMKQHQKTYSSREYSHRLQVFANNWRKIQAHN--QRNHTF--KMGLNQFSDMS 84
1255 Query: 85  SDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRG-AVTPVKNQGQCGSCW 143
1256              E K+ YL ++          ++YL        P++ DWR +G  V+PVKNQG CGSCW
1257 Sbjct: 85  FAEIKHKYLWSEPQ--NCSATKSNYLRGT--GPYPSSMDWRKKGNVVSPVKNQGACGSCW 140
1259 Query: 144 SFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYII 203
1260            +FSTTG +E    I+  K+++L+EQ LVDC         +   + GC GGL   A+ YI+
1261 Sbjct: 141 TFSTTGALESAVAIASGKMMTLAEQQLVDC--------AQNFNNHGCQGGLPSQAFEYIL 192
1263 Query: 204 KNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKN-ETVMAGYIVSTGPLAIAA 262
1264             N GI  E SYPY  + G QC FN     A + N   I  N E  M   +    P++ A 
1265 Sbjct: 193 YNKGIMGEDSYPYIGKNG-QCKFNPEKAVAFVKNVVNITLNDEAAMVEAVALYNPVSFAF 251
1267 Query: 263 DAVE-WQFYIGGVFDI-PCN--PNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWG 318
1268            +  E +  Y  GV+    C+  P+ ++H +L VGY  +N +      YWIVKNSWG++WG
1269 Sbjct: 252 EVTEDFMMYKSGVYSSNSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEQNGLL-----YWIVKNSWGSNWG 306
1271 Query: 319 EQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
1272              GY  + RGKN CG++   S  I
1273 Sbjct: 307 NNGYFLIERGKNMCGLAACASYPI 330
1276 >sp|O10364|CATV_NPVOP VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)
1277           Length = 324
1279  Score =  199 bits (500), Expect = 9e-51
1280  Identities = 118/316 (37%), Positives = 170/316 (53%), Gaps = 26/316 (8%)
1282 Query: 29  FLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDE 87
1283            F +F  KFNK YS E E L RF+IF+ NL +I   N     + +  ++ +NKF+DLS +E
1284 Sbjct: 28  FEDFLHKFNKNYSSESEKLHRFKIFQHNLEEIINKN----QNDSTAQYEINKFSDLSKEE 83
1286 Query: 88  FKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFST 147
1287              + Y        T +      LD       P  FDWR    VT VKNQG CG+CW+F+T
1288 Sbjct: 84  AISKYTGLSLPHQTQNFCEVVILDRPPDRG-PLEFDWRQFNKVTSVKNQGVCGACWAFAT 142
1290 Query: 148 TGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGG 207
1291             G++E Q  I  N+L++LSEQ  +DCD            + GC+GGL   A+   ++ GG
1292 Sbjct: 143 LGSLESQFAIKYNRLINLSEQQFIDCDR----------VNAGCDGGLLHTAFESAMEMGG 192
1294 Query: 208 IQTESSYPYTAETGTQCNFNSAN--IGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV 265
1295            +Q ES YPY    G QC  N     +G + S    I   E  +   + + GP+ +A DA 
1296 Sbjct: 193 VQMESDYPYETANG-QCRINPNRFVVGVR-SCRRYIVMFEEKLKDLLRAVGPIPVAIDAS 250
1298 Query: 266 EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYL 325
1299            +   Y  G+    C  + L+H +L+VGY+ +N     N+PYWI+KN+WG DWGE GY  +
1300 Sbjct: 251 DIVNYRRGIMR-QCANHGLNHAVLLVGYAVEN-----NIPYWILKNTWGTDWGEDGYFRV 304
1302 Query: 326 RRGKNTCGVSNFVSTS 341
1303            ++  N CG+ N + +S
1304 Sbjct: 305 QQNINACGIRNELVSS 320
1307 >sp|P43297|RD21_ARATH CYSTEINE PROTEINASE RD21A PRECURSOR
1308           Length = 462
1310  Score =  198 bits (498), Expect = 2e-50
1311  Identities = 119/313 (38%), Positives = 165/313 (52%), Gaps = 35/313 (11%)
1313 Query: 35  KFNKKYSHEEYLE---RFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNY 91
1314            K  K  S    +E   RFEIFK NL  ++E N   ++++     G+ +FADL++DE+++ 
1315 Sbjct: 56  KHGKAQSQNSLVEKDRRFEIFKDNLRFVDEHNEKNLSYR----LGLTRFADLTNDEYRSK 111
1317 Query: 92  YLN---NKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTT 148
1318            YL     K+      L     + DE    +P + DWR +GAV  VK+QG CGSCW+FST 
1319 Sbjct: 112 YLGAKMEKKGERRTSLRYEARVGDE----LPESIDWRKKGAVAEVKDQGGCGSCWAFSTI 167
1321 Query: 149 GNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGI 208
1322            G VEG + I    L++LSEQ LVDCD          + +EGCNGGL   A+ +IIKNGGI
1323 Sbjct: 168 GAVEGINQIVTGDLITLSEQELVDCD---------TSYNEGCNGGLMDYAFEFIIKNGGI 218
1325 Query: 209 QTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VE 266
1326             T+  YPY    GT            I ++  +P          V+  P++IA +A    
1327 Sbjct: 219 DTDKDYPYKGVDGTCDQIRKNAKVVTIDSYEDVPTYSEESLKKAVAHQPISIAIEAGGRA 278
1329 Query: 267 WQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLR 326
1330            +Q Y  G+FD  C    LDHG++ VGY  +N        YWIV+NSWG  WGE GY+ + 
1331 Sbjct: 279 FQLYDSGIFDGSCG-TQLDHGVVAVGYGTEN-----GKDYWIVRNSWGKSWGESGYLRMA 332
1333 Query: 327 R----GKNTCGVS 335
1334            R        CG++
1335 Sbjct: 333 RNIASSSGKCGIA 345
1338 >sp|P15242|TES1_RAT TESTIN 1/2 PRECURSOR (CMB-22/CMB-23)
1339           Length = 333
1341  Score =  198 bits (497), Expect = 2e-50
1342  Identities = 115/348 (33%), Positives = 184/348 (52%), Gaps = 22/348 (6%)
1344 Query: 3   VILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQS--QFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIE 60
1345            +I +  LA+  + V S    P+     ++ E++ K  K Y+  E   +  +++ N   IE
1346 Sbjct: 1   MIAVLFLAILCLEVDSTAPTPDPSLDVEWNEWRTKHGKTYNMNEERLKRAVWEKNFKMIE 60
1348 Query: 61  ELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLN-NKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP 119
1349              N   +  + D    +N F DL++ EF        ++ I    +    + D +F+  +P
1350 Sbjct: 61  LHNWEYLEGRHDFTMAMNAFGDLTNIEFVKMMTGFQRQKIKKTHI----FQDHQFLY-VP 115
1352 Query: 120 TAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECME 179
1353               DWR  G VTPVKNQG C S W+FS TG++EGQ F    +L+ LSEQNL+DC    + 
1354 Sbjct: 116 KRVDWRQLGYVTPVKNQGHCASSWAFSATGSLEGQMFRKTERLIPLSEQNLLDCMGSNVT 175
1356 Query: 180 YEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFT 239
1357            +        GC+GG    A+ Y+  NGG+ TE SYPY  + G +C +++ N  A + +F 
1358 Sbjct: 176 H--------GCSGGFMQYAFQYVKDNGGLATEESYPYRGQ-GRECRYHAENSAANVRDFV 226
1360 Query: 240 MIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGYSAK 296
1361             IP +E  +   +   GP+++A DA    +QFY  G++  P C    L+H +L+VGY  +
1362 Sbjct: 227 QIPGSEEALMKAVAKVGPISVAVDASHGSFQFYGSGIYYEPQCKRVHLNHAVLVVGYGFE 286
1364 Query: 297 NTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG-KNTCGVSNFVSTSII 343
1365                  N  +W+VKNSWG +WG +GY+ L +   N CG++ + +  I+
1366 Sbjct: 287 GEESDGN-SFWLVKNSWGEEWGMKGYMKLAKDWSNHCGIATYSTYPIV 333
1369 >sp|P25776|ORYA_ORYSA ORYZAIN ALPHA CHAIN PRECURSOR
1370           Length = 458
1372  Score =  198 bits (497), Expect = 2e-50
1373  Identities = 122/348 (35%), Positives = 182/348 (52%), Gaps = 37/348 (10%)
1375 Query: 3   VILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQ--FLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKI 59
1376            ++LL  LA   + + S G   EE+++  + E++ +  K Y+   E   R+  F+ NL  I
1377 Sbjct: 12  LLLLLSLAAADMSIVSYGERSEEEARRLYAEWKAEHGKSYNAVGEEERRYAAFRDNLRYI 71
1379 Query: 60  EELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLN-----NKEAIFTDDLPVADYLDDEF 114
1380            +E N  A       + G+N+FADL+++E+++ YL       +E   +D    AD      
1381 Sbjct: 72  DEHNAAADAGVHSFRLGLNRFADLTNEEYRDTYLGLRNKPRRERKVSDRYLAADN----- 126
1383 Query: 115 INSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCD 174
1384              ++P + DWRT+GAV  +K+QG CGSCW+FS    VE  + I    L+SLSEQ LVDCD
1385 Sbjct: 127 -EALPESVDWRTKGAVAEIKDQGGCGSCWAFSAIAAVEDINQIVTGDLISLSEQELVDCD 185
1387 Query: 175 HECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIG-A 233
1388                      + +EGCNGGL   A+++II NGGI TE  YPY  +   +C+ N  N    
1389 Sbjct: 186 ---------TSYNEGCNGGLMDYAFDFIINNGGIDTEDDYPYKGK-DERCDVNRKNAKVV 235
1391 Query: 234 KISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIV 291
1392             I ++  +  N        V   P+++A +A    +Q Y  G+F   C   +LDHG+  V
1393 Sbjct: 236 TIDSYEDVTPNSETSLQKAVRNQPVSVAIEAGGRAFQLYSSGIFTGKCG-TALDHGVAAV 294
1395 Query: 292 GYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRR----GKNTCGVS 335
1396            GY  +N        YWIV+NSWG  WGE GY+ + R        CG++
1397 Sbjct: 295 GYGTEN-----GKDYWIVRNSWGKSWGESGYVRMERNIKASSGKCGIA 337
1400 >sp|P14080|PAP2_CARPA CHYMOPAPAIN PRECURSOR (PAPAYA PROTEINASE II) (PPII)
1401           Length = 352
1403  Score =  194 bits (488), Expect = 2e-49
1404  Identities = 125/315 (39%), Positives = 167/315 (52%), Gaps = 43/315 (13%)
1406 Query: 35  KFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKF--GVNKFADLSSDEFKNY 91
1407            K NK Y S +E + RFEIF+ NL  I+E N      K +  +  G+N FADLS+DEFK  
1408 Sbjct: 54  KHNKIYESIDEKIYRFEIFRDNLMYIDETN------KKNNSYWLGLNGFADLSNDEFKKK 107
1410 Query: 92  YLNNKEAIFTDDLPVADYLDDE-----FINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFS 146
1411            Y+        +D    ++ D+E      + + P + DWR +GAVTPVKNQG CGSCW+FS
1412 Sbjct: 108 YVG----FVAEDFTGLEHFDNEDFTYKHVTNYPQSIDWRAKGAVTPVKNQGACGSCWAFS 163
1414 Query: 147 TTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNG 206
1415            T   VEG + I    L+ LSEQ LVDCD              GC GG Q  +  Y + N 
1416 Sbjct: 164 TIATVEGINKIVTGNLLELSEQELVDCDKH----------SYGCKGGYQTTSLQY-VANN 212
1418 Query: 207 GIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKN-ETVMAGYIVSTGPLAIAADA- 264
1419            G+ T   YPY A+       +      KI+ +  +P N ET   G + +  PL++  +A 
1420 Sbjct: 213 GVHTSKVYPYQAKQYKCRATDKPGPKVKITGYKRVPSNCETSFLGALANQ-PLSVLVEAG 271
1422 Query: 265 -VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYI 323
1423               +Q Y  GVFD PC    LDH +  VGY   +    KN  Y I+KNSWG +WGE+GY+
1424 Sbjct: 272 GKPFQLYKSGVFDGPCG-TKLDHAVTAVGYGTSD---GKN--YIIIKNSWGPNWGEKGYM 325
1426 Query: 324 YLRR----GKNTCGV 334
1427             L+R     + TCGV
1428 Sbjct: 326 RLKRQSGNSQGTCGV 340
1431 >sp|P43235|CATK_HUMAN CATHEPSIN K PRECURSOR (CATHEPSIN O) (CATHEPSIN X) (CATHEPSIN O2)
1432           Length = 329
1434  Score =  194 bits (488), Expect = 2e-49
1435  Identities = 121/339 (35%), Positives = 180/339 (52%), Gaps = 25/339 (7%)
1437 Query: 9   LAVFTVFVSSRGIPPEE--QSQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKIEELNLI 65
1438            L V  + V S  + PEE   + +  ++    K+Y+++ + + R  I++ NL  I   NL 
1439 Sbjct: 4   LKVLLLPVVSFALYPEEILDTHWELWKKTHRKQYNNKVDEISRRLIWEKNLKYISIHNLE 63
1441 Query: 66  AINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWR 125
1442            A       +  +N   D++S+E        K  +         Y+  E+    P + D+R
1443 Sbjct: 64  ASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLKVPLSHSRSNDTLYIP-EWEGRAPDSVDYR 122
1445 Query: 126 TRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEA 185
1446             +G VTPVKNQGQCGSCW+FS+ G +EGQ      KL++LS QNLVDC  E         
1447 Sbjct: 123 KKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSE--------- 173
1449 Query: 186 CDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPK-N 244
1450             ++GC GG   NA+ Y+ KN GI +E +YPY  +    C +N     AK   +  IP+ N
1451 Sbjct: 174 -NDGCGGGYMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQE-ESCMYNPTGKAAKCRGYREIPEGN 231
1453 Query: 245 ETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGV-FDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFR 301
1454            E  +   +   GP+++A DA    +QFY  GV +D  CN ++L+H +L VGY       +
1455 Sbjct: 232 EKALKRAVARVGPVSVAIDASLTSFQFYSKGVYYDESCNSDNLNHAVLAVGYG-----IQ 286
1457 Query: 302 KNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVS 339
1458            K   +WI+KNSWG +WG +GYI + R K N CG++N  S
1459 Sbjct: 287 KGNKHWIIKNSWGENWGNKGYILMARNKNNACGIANLAS 325
1462 >sp|P25778|ORYC_ORYSA ORYZAIN GAMMA CHAIN PRECURSOR
1463           Length = 362
1465  Score =  194 bits (487), Expect = 3e-49
1466  Identities = 114/327 (34%), Positives = 171/327 (51%), Gaps = 37/327 (11%)
1468 Query: 28  QFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSD 86
1469            +F  F  +  K+Y    E   RF IF  +L  +   N   + ++     G+N+FAD+S +
1470 Sbjct: 61  RFARFAVRHGKRYGDAAEVQRRFRIFSESLELVRSTNRRGLPYR----LGINRFADMSWE 116
1472 Query: 87  EFKNYYLN---NKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCW 143
1473            EF+   L    N  A    +  + D        ++P   DWR  G V+PVK+QG CGSCW
1474 Sbjct: 117 EFQASRLGAAQNCSATLAGNHRMRD------APALPETKDWREDGIVSPVKDQGHCGSCW 170
1476 Query: 144 SFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYII 203
1477             FSTTG++E ++  +    VSLSEQ L DC      +        GC+GGL   A+ YI 
1478 Sbjct: 171 PFSTTGSLEARYTQATGPPVSLSEQQLADCATRYNNF--------GCSGGLPSQAFEYIK 222
1480 Query: 204 KNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKI---SNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAI 260
1481             NGG+ TE +YPYT   G  C++   N G K+    N T++ ++E   A  +V   P+++
1482 Sbjct: 223 YNGGLDTEEAYPYTGVNGI-CHYKPENAGVKVLDSVNITLVAEDELKNAVGLVR--PVSV 279
1484 Query: 261 AADAVE-WQFYIGGVF---DIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGAD 316
1485            A   +  ++ Y  GV+       +P  ++H +L VGY  +N      +PYW++KNSWGAD
1486 Sbjct: 280 AFQVINGFRMYKSGVYTSDHCGTSPMDVNHAVLAVGYGVEN-----GVPYWLIKNSWGAD 334
1488 Query: 317 WGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
1489            WG+ GY  +  GKN CG++   S  I+
1490 Sbjct: 335 WGDNGYFTMEMGKNMCGIATCASYPIV 361
1493 >sp|P25251|CYS4_BRANA CYSTEINE PROTEINASE COT44 PRECURSOR
1494           Length = 328
1496  Score =  194 bits (487), Expect = 3e-49
1497  Identities = 115/300 (38%), Positives = 160/300 (53%), Gaps = 29/300 (9%)
1499 Query: 47  ERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNK----EAIFTD 102
1500            ERF IFK NL  I+  N    N  A  K G+  FA+L++DE+++ YL  +      I   
1501 Sbjct: 27  ERFNIFKDNLRFIDLHN--ENNKNATYKLGLTIFANLTNDEYRSLYLGARTEPVRRITKA 84
1503 Query: 103 DLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKL 162
1504                  Y     ++ +P   DWR +GAV  +K+QG CGSCW+FST   VEG + I   +L
1505 Sbjct: 85  KNVNMKYSAAVNVDEVPVTVDWRQKGAVNAIKDQGTCGSCWAFSTAAAVEGINKIVTGEL 144
1507 Query: 163 VSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGT 222
1508            VSLSEQ LVDCD         ++ ++GCNGGL   A+ +I+KNGG+ TE  YPY    G 
1509 Sbjct: 145 VSLSEQELVDCD---------KSYNQGCNGGLMDYAFQFIMKNGGLNTEKDYPYHGTNG- 194
1511 Query: 223 QCNFNSANIG-AKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPC 279
1512            +CN    N     I  +  +P  +       VS  P+++A DA    +Q Y  G+F   C
1513 Sbjct: 195 KCNSLLKNSRVVTIDGYEDVPSKDETALKRAVSYQPVSVAIDAGGRAFQHYQSGIFTGKC 254
1515 Query: 280 NPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG----KNTCGVS 335
1516              N +DH ++ VGY ++N      + YWIV+NSWG  WGE GYI + R        CG++
1517 Sbjct: 255 GTN-MDHAVVAVGYGSEN-----GVDYWIVRNSWGTRWGEDGYIRMERNVASKSGKCGIA 308
1520 >sp|P09668|CATH_HUMAN CATHEPSIN H PRECURSOR
1521           Length = 335
1523  Score =  192 bits (482), Expect = 1e-48
1524  Identities = 122/326 (37%), Positives = 168/326 (51%), Gaps = 32/326 (9%)
1526 Query: 25  EQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLS 84
1527            E+  F  +  K  K YS EEY  R + F SN  KI   N    N     K  +N+F+D+S
1528 Sbjct: 31  EKFHFKSWMSKHRKTYSTEEYHHRLQTFASNWRKINAHN----NGNHTFKMALNQFSDMS 86
1530 Query: 85  SDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGA-VTPVKNQGQCGSCW 143
1531              E K+ YL ++          ++YL        P + DWR +G  V+PVKNQG CGSCW
1532 Sbjct: 87  FAEIKHKYLWSEPQ--NCSATKSNYLRGT--GPYPPSVDWRKKGNFVSPVKNQGACGSCW 142
1534 Query: 144 SFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYII 203
1535            +FSTTG +E    I+  K++SL+EQ LVDC  +   Y        GC GGL   A+ YI+
1536 Sbjct: 143 TFSTTGALESAIAIATGKMLSLAEQQLVDCAQDFNNY--------GCQGGLPSQAFEYIL 194
1538 Query: 204 KNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSAN-IG--AKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAI 260
1539             N GI  E +YPY  + G  C F     IG    ++N T+   +E  M   +    P++ 
1540 Sbjct: 195 YNKGIMGEDTYPYQGKDG-YCKFQPGKAIGFVKDVANITIY--DEEAMVEAVALYNPVSF 251
1542 Query: 261 AADAV-EWQFYIGGVF-DIPCN--PNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGAD 316
1543            A +   ++  Y  G++    C+  P+ ++H +L VGY  KN I     PYWIVKNSWG  
1544 Sbjct: 252 AFEVTQDFMMYRTGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEKNGI-----PYWIVKNSWGPQ 306
1546 Query: 317 WGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
1547            WG  GY  + RGKN CG++   S  I
1548 Sbjct: 307 WGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPI 332
1551 >sp|O46427|CATH_PIG CATHEPSIN H PRECURSOR
1552           Length = 335
1554  Score =  191 bits (481), Expect = 2e-48
1555  Identities = 122/332 (36%), Positives = 171/332 (50%), Gaps = 28/332 (8%)
1557 Query: 17  SSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFG 76
1558            S+  +   E+  F  +  +  KKYS EEY  R ++F SN  KI   N  A NH    K G
1559 Sbjct: 23  SNLAVSSFEKLHFKSWMVQHQKKYSLEEYHHRLQVFVSNWRKINAHN--AGNHTF--KLG 78
1561 Query: 77  VNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGA-VTPVKN 135
1562            +N+F+D+S DE ++ YL ++           +YL        P + DWR +G  V+PVKN
1563 Sbjct: 79  LNQFSDMSFDEIRHKYLWSEPQ--NCSATKGNYLRGT--GPYPPSMDWRKKGNFVSPVKN 134
1565 Query: 136 QGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQ 195
1566            QG CGSCW+FSTTG +E    I+  K++SL+EQ LVDC         +   + GC GGL 
1567 Sbjct: 135 QGSCGSCWTFSTTGALESAVAIATGKMLSLAEQQLVDC--------AQNFNNHGCQGGLP 186
1569 Query: 196 PNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKN-ETVMAGYIVS 254
1570              A+ YI  N GI  E +YPY  +    C F      A + +   I  N E  M   +  
1571 Sbjct: 187 SQAFEYIRYNKGIMGEDTYPYKGQ-DDHCKFQPDKAIAFVKDVANITMNDEEAMVEAVAL 245
1573 Query: 255 TGPLAIAADAV-EWQFYIGGVF-DIPCN--PNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVK 310
1574              P++ A +   ++  Y  G++    C+  P+ ++H +L VGY  +N I     PYWIVK
1575 Sbjct: 246 YNPVSFAFEVTNDFLMYRKGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEENGI-----PYWIVK 300
1577 Query: 311 NSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
1578            NSWG  WG  GY  + RGKN CG++   S  I
1579 Sbjct: 301 NSWGPQWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPI 332
1582 >sp|P05167|ALEU_HORVU THIOL PROTEASE ALEURAIN PRECURSOR
1583           Length = 362
1585  Score =  191 bits (481), Expect = 2e-48
1586  Identities = 111/322 (34%), Positives = 167/322 (51%), Gaps = 27/322 (8%)
1588 Query: 28  QFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSD 86
1589            +F  F  ++ K Y S  E   RF IF  +L ++   N   + ++     G+N+F+D+S +
1590 Sbjct: 60  RFARFAVRYGKSYESAAEVRRRFRIFSESLEEVRSTNRKGLPYR----LGINRFSDMSWE 115
1592 Query: 87  EFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFS 146
1593            EF+   L    A  T    +A         ++P   DWR  G V+PVKNQ  CGSCW+FS
1594 Sbjct: 116 EFQATRLG---AAQTCSATLAGNHLMRDAAALPETKDWREDGIVSPVKNQAHCGSCWTFS 172
1596 Query: 147 TTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNG 206
1597            TTG +E  +  +  K +SLSEQ LVDC      +        GCNGGL   A+ YI  NG
1598 Sbjct: 173 TTGALEAAYTQATGKNISLSEQQLVDCAGGFNNF--------GCNGGLPSQAFEYIKYNG 224
1600 Query: 207 GIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKN-ETVMAGYIVSTGPLAIAADAV 265
1601            GI TE SYPY    G  C++ + N   ++ +   I  N E  +   +    P+++A   +
1602 Sbjct: 225 GIDTEESYPYKGVNGV-CHYKAENAAVQVLDSVNITLNAEDELKNAVGLVRPVSVAFQVI 283
1604 Query: 266 E-WQFYIGGVF---DIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQG 321
1605            + ++ Y  GV+        P+ ++H +L VGY  +N      +PYW++KNSWGADWG+ G
1606 Sbjct: 284 DGFRQYKSGVYTSDHCGTTPDDVNHAVLAVGYGVEN-----GVPYWLIKNSWGADWGDNG 338
1608 Query: 322 YIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
1609            Y  +  GKN C ++   S  ++
1610 Sbjct: 339 YFKMEMGKNMCAIATCASYPVV 360
1613 >sp|P43236|CATK_RABIT CATHEPSIN K PRECURSOR (OC-2 PROTEIN)
1614           Length = 329
1616  Score =  191 bits (480), Expect = 2e-48
1617  Identities = 119/339 (35%), Positives = 179/339 (52%), Gaps = 25/339 (7%)
1619 Query: 9   LAVFTVFVSSRGIPPEE--QSQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKIEELNLI 65
1620            L V  + V S  + PEE   +Q+  ++  ++K+Y+ + + + R  I++ NL  I   NL 
1621 Sbjct: 4   LKVLLLPVVSFALHPEEILDTQWELWKKTYSKQYNSKVDEISRRLIWEKNLKHISIHNLE 63
1623 Query: 66  AINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWR 125
1624            A       +  +N   D++S+E        K            Y+ D +    P + D+R
1625 Sbjct: 64  ASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLKVPPSRSHSNDTLYIPD-WEGRTPDSIDYR 122
1627 Query: 126 TRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEA 185
1628             +G VTPVKNQGQCGSCW+FS+ G +EGQ      KL++LS QNLVDC  E         
1629 Sbjct: 123 KKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSE--------- 173
1631 Query: 186 CDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPK-N 244
1632             + GC GG   NA+ Y+ +N GI +E +YPY  +    C +N     AK   +  IP+ N
1633 Sbjct: 174 -NYGCGGGYMTNAFQYVQRNRGIDSEDAYPYVGQ-DESCMYNPTGKAAKCRGYREIPEGN 231
1635 Query: 245 ETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGV-FDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFR 301
1636            E  +   +   GP+++A DA    +QFY  GV +D  C+ ++++H +L VGY       +
1637 Sbjct: 232 EKALKRAVARVGPVSVAIDASLTSFQFYSKGVYYDENCSSDNVNHAVLAVGYG-----IQ 286
1639 Query: 302 KNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVS 339
1640            K   +WI+KNSWG  WG +GYI + R K N CG++N  S
1641 Sbjct: 287 KGNKHWIIKNSWGESWGNKGYILMARNKNNACGIANLAS 325
1644 >sp|P10056|PAP3_CARPA CARICAIN PRECURSOR (PAPAYA PROTEINASE OMEGA) (PAPAYA PROTEINASE
1645            III) (PPIII) (PAPAYA PEPTIDASE A)
1646           Length = 348
1648  Score =  190 bits (479), Expect = 3e-48
1649  Identities = 122/319 (38%), Positives = 166/319 (51%), Gaps = 46/319 (14%)
1651 Query: 37  NKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKF--GVNKFADLSSDEFKNYYL 93
1652            NK Y + +E L RFEIFK NL  I+E N      K +  +  G+N+FADLS+DEF   Y+
1653 Sbjct: 56  NKFYENVDEKLYRFEIFKDNLNYIDETN------KKNNSYWLGLNEFADLSNDEFNEKYV 109
1655 Query: 94  NNKEAIFTDDLPVADYLDDEFIN----SIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTG 149
1656             +       D  +    D+EFIN    ++P   DWR +GAVTPV++QG CGSCW+FS   
1657 Sbjct: 110 GS-----LIDATIEQSYDEEFINEDTVNLPENVDWRKKGAVTPVRHQGSCGSCWAFSAVA 164
1659 Query: 150 NVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQ 209
1660             VEG + I   KLV LSEQ LVDC+              GC GG  P A  Y+ KN GI 
1661 Sbjct: 165 TVEGINKIRTGKLVELSEQELVDCERR----------SHGCKGGYPPYALEYVAKN-GIH 213
1663 Query: 210 TESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMI----PKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV 265
1664              S YPY A+ GT     +  +G  I   + +    P NE  +   I    P+++  ++ 
1665 Sbjct: 214 LRSKYPYKAKQGT---CRAKQVGGPIVKTSGVGRVQPNNEGNLLNAIAKQ-PVSVVVESK 269
1667 Query: 266 --EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYI 323
1668               +Q Y GG+F+ PC    +DH +  VGY            Y ++KNSWG  WGE+GYI
1669 Sbjct: 270 GRPFQLYKGGIFEGPCG-TKVDHAVTAVGYGKSG-----GKGYILIKNSWGTAWGEKGYI 323
1671 Query: 324 YLRRGK-NTCGVSNFVSTS 341
1672             ++R   N+ GV     +S
1673 Sbjct: 324 RIKRAPGNSPGVCGLYKSS 342
1676 >sp|P49935|CATH_MOUSE CATHEPSIN H PRECURSOR (CATHEPSIN B3) (CATHEPSIN BA)
1677           Length = 333
1679  Score =  189 bits (476), Expect = 6e-48
1680  Identities = 117/324 (36%), Positives = 167/324 (51%), Gaps = 28/324 (8%)
1682 Query: 25  EQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLS 84
1683            E+  F  +  +  K YS  EY  R ++F +N  KI+  N    NH    K  +N+F+D+S
1684 Sbjct: 29  EKFHFKSWMKQHQKTYSSVEYNHRLQMFANNWRKIQAHN--QRNHTF--KMALNQFSDMS 84
1686 Query: 85  SDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRG-AVTPVKNQGQCGSCW 143
1687              E K+ +L ++          ++YL        P++ DWR +G  V+PVKNQG C SCW
1688 Sbjct: 85  FAEIKHKFLWSEPQ--NCSATKSNYLRGT--GPYPSSMDWRKKGNVVSPVKNQGACASCW 140
1690 Query: 144 SFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYII 203
1691            +FSTTG +E    I+  K++SL+EQ LVDC         +   + GC GGL   A+ YI+
1692 Sbjct: 141 TFSTTGALESAVAIASGKMLSLAEQQLVDC--------AQAFNNHGCKGGLPSQAFEYIL 192
1694 Query: 204 KNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKN-ETVMAGYIVSTGPLAIAA 262
1695             N GI  E SYPY  +  + C FN     A + N   I  N E  M   +    P++ A 
1696 Sbjct: 193 YNKGIMEEDSYPYIGK-DSSCRFNPQKAVAFVKNVVNITLNDEAAMVEAVALYNPVSFAF 251
1698 Query: 263 DAVE-WQFYIGGVFDIPC---NPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWG 318
1699            +  E +  Y  GV+        P+ ++H +L VGY  +N +      YWIVKNSWG+ WG
1700 Sbjct: 252 EVTEDFLMYKSGVYSSKSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEQNGLL-----YWIVKNSWGSQWG 306
1702 Query: 319 EQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
1703            E GY  + RGKN CG++   S  I
1704 Sbjct: 307 ENGYFLIERGKNMCGLAACASYPI 330
1707 >sp|P55097|CATK_MOUSE CATHEPSIN K PRECURSOR
1708           Length = 329
1710  Score =  188 bits (473), Expect = 1e-47
1711  Identities = 117/344 (34%), Positives = 181/344 (52%), Gaps = 35/344 (10%)
1713 Query: 9   LAVFTVFVSSRGIPPEEQ--SQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKIEELNLI 65
1714            L V  + + S  + PEE   +Q+  ++    K+Y+ + + + R  I++ NL +I   NL 
1715 Sbjct: 4   LKVLLLPMVSFALSPEEMLDTQWELWKKTHQKQYNSKVDEISRRLIWEKNLKQISAHNLE 63
1717 Query: 66  AINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDD-----EFINSIPT 120
1718            A       +  +N   D++S+E        +        P   Y +D     E+   +P 
1719 Sbjct: 64  ASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLRIP------PSRSYSNDTLYTPEWEGRVPD 117
1721 Query: 121 AFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEY 180
1722            + D+R +G VTPVKNQGQCGSCW+FS+ G +EGQ      KL++LS QNLVDC  E    
1723 Sbjct: 118 SIDYRKKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSSAGALEGQLKKKTGKLLALSPQNLVDCVTE---- 173
1725 Query: 181 EGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTM 240
1726                  + GC GG    A+ Y+ +NGGI +E ++PY  +    C +N+    AK   +  
1727 Sbjct: 174 ------NYGCGGGYMTTAFQYVQQNGGIDSEDAFPYVGQ-DESCMYNATAKAAKCRGYRE 226
1729 Query: 241 IP-KNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGV-FDIPCNPNSLDHGILIVGYSAK 296
1730            IP  NE  +   +   GP++++ DA    +QFY  GV +D  C+ ++++H +L+VGY   
1731 Sbjct: 227 IPVGNEKALKRAVARVGPISVSIDASLASFQFYSRGVYYDENCDRDNVNHAVLVVGYGT- 285
1733 Query: 297 NTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVS 339
1734                +K   +WI+KNSWG  WG +GY  L R K N CG++N  S
1735 Sbjct: 286 ----QKGSKHWIIKNSWGESWGNKGYALLARNKNNACGITNMAS 325
1738 >sp|P56203|CATW_MOUSE CATHEPSIN W PRECURSOR (LYMPHOPAIN)
1739           Length = 371
1741  Score =  185 bits (466), Expect = 9e-47
1742  Identities = 110/338 (32%), Positives = 164/338 (47%), Gaps = 32/338 (9%)
1744 Query: 22  PPEEQSQFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKF 80
1745            P E +  F  FQ +FN+ Y +  EY  R  IF  NL + + L    +      +FG   F
1746 Sbjct: 33  PLELKEVFKLFQIRFNRSYWNPAEYTRRLSIFAHNLAQAQRLQQEDLG---TAEFGETPF 89
1748 Query: 81  ADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWR-TRGAVTPVKNQGQC 139
1749            +DL+ +EF   Y   +    T ++       + +  S+P   DWR  +  ++ VKNQG C
1750 Sbjct: 90  SDLTEEEFGQLYGQERSPERTPNM-TKKVESNTWGESVPRTCDWRKAKNIISSVKNQGSC 148
1752 Query: 140 GSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAY 199
1753              CW+ +   N++    I   + V +S Q L+DC          E C  GCNGG   +AY
1754 Sbjct: 149 KCCWAMAAADNIQALWRIKHQQFVDVSVQELLDC----------ERCGNGCNGGFVWDAY 198
1756 Query: 200 NYIIKNGGIQTESSYPYTAETGT-QCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPL 258
1757              ++ N G+ +E  YP+  +    +C        A I +FTM+  NE  +A Y+   GP+
1758 Sbjct: 199 LTVLNNSGLASEKDYPFQGDRKPHRCLAKKYKKVAWIQDFTMLSNNEQAIAHYLAVHGPI 258
1760 Query: 259 AIAADAVEWQFYIGGVFDIP---CNPNSLDHGILIVGYSAKN------TIF------RKN 303
1761             +  +    Q Y  GV       C+P  +DH +L+VG+  K       T+       R +
1762 Sbjct: 259 TVTINMKLLQHYQKGVIKATPSSCDPRQVDHSVLLVGFGKKKEGMQTGTVLSHSRKRRHS 318
1764 Query: 304 MPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTS 341
1765             PYWI+KNSWGA WGE+GY  L RG NTCGV+ +  T+
1766 Sbjct: 319 SPYWILKNSWGAHWGEKGYFRLYRGNNTCGVTKYPFTA 356
1769 >sp|P25250|CYS2_HORVU CYSTEINE PROTEINASE EP-B 2 PRECURSOR
1770           Length = 373
1772  Score =  184 bits (463), Expect = 2e-46
1773  Identities = 123/345 (35%), Positives = 172/345 (49%), Gaps = 40/345 (11%)
1775 Query: 8   VLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLE---------FQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGK 58
1776            VLAV  V + S  IP E++    E         +Q     +  H E   RF  FKSN   
1777 Sbjct: 17  VLAVAAVELCS-AIPMEDKDLESEEALWDLYERWQSAHRVRRHHAEKHRRFGTFKSNAHF 75
1779 Query: 59  IEELNLIAINHKADTKFGV--NKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLP-VADYLDDEF- 114
1780            I      + N + D  + +  N+F D+   EF+  ++ +         P V  ++     
1781 Sbjct: 76  IH-----SHNKRGDHPYRLHLNRFGDMDQAEFRATFVGDLRRDTPSKPPSVPGFMYAALN 130
1783 Query: 115 INSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCD 174
1784            ++ +P + DWR +GAVT VK+QG+CGSCW+FST  +VEG + I    LVSLSEQ L+DCD
1785 Sbjct: 131 VSDLPPSVDWRQKGAVTGVKDQGKCGSCWAFSTVVSVEGINAIRTGSLVSLSEQELIDCD 190
1787 Query: 175 HECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNF----NSAN 230
1788                      A ++GC GGL  NA+ YI  NGG+ TE++YPY A  GT CN      ++ 
1789 Sbjct: 191 ---------TADNDGCQGGLMDNAFEYIKNNGGLITEAAYPYRAARGT-CNVARAAQNSP 240
1791 Query: 231 IGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGI 288
1792            +   I     +P N        V+  P+++A +A    + FY  GVF   C    LDHG+
1793 Sbjct: 241 VVVHIDGHQDVPANSEEDLARAVANQPVSVAVEASGKAFMFYSEGVFTGECG-TELDHGV 299
1795 Query: 289 LIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCG 333
1796             +VGY     +      YW VKNSWG  WGEQGYI + +     G
1797 Sbjct: 300 AVVGYG----VAEDGKAYWTVKNSWGPSWGEQGYIRVEKDSGASG 340
1800 >sp|P25249|CYS1_HORVU CYSTEINE PROTEINASE EP-B 1 PRECURSOR
1801           Length = 371
1803  Score =  184 bits (462), Expect = 3e-46
1804  Identities = 124/349 (35%), Positives = 171/349 (48%), Gaps = 48/349 (13%)
1806 Query: 8   VLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLE---------FQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGK 58
1807            VLAV  V + S  IP E++    E         +Q     +  H E   RF  FKSN   
1808 Sbjct: 17  VLAVAAVELCS-AIPMEDKDLESEEALWDLYERWQSAHRVRRHHAEKHRRFGTFKSNAHF 75
1810 Query: 59  IEELNLIAINHKADTKFGV--NKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEF-- 114
1811            I      + N + D  + +  N+F D+   EF+  ++ +       D P        F  
1812 Sbjct: 76  IH-----SHNKRGDHPYRLHLNRFGDMDQAEFRATFVGDLRR----DTPAKPPSVPGFMY 126
1814 Query: 115 ----INSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNL 170
1815                ++ +P + DWR +GAVT VK+QG+CGSCW+FST  +VEG + I    LVSLSEQ L
1816 Sbjct: 127 AALNVSDLPPSVDWRQKGAVTGVKDQGKCGSCWAFSTVVSVEGINAIRTGSLVSLSEQEL 186
1818 Query: 171 VDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNF---- 226
1819            +DCD          A ++GC GGL  NA+ YI  NGG+ TE++YPY A  GT CN     
1820 Sbjct: 187 IDCD---------TADNDGCQGGLMDNAFEYIKNNGGLITEAAYPYRAARGT-CNVARAA 236
1822 Query: 227 NSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCNPNSL 284
1823             ++ +   I     +P N        V+  P+++A +A    + FY  GVF   C    L
1824 Sbjct: 237 QNSPVVVHIDGHQDVPANSEEDLARAVANQPVSVAVEASGKAFMFYSEGVFTGDCG-TEL 295
1826 Query: 285 DHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCG 333
1827            DHG+ +VGY     +      YW VKNSWG  WGEQGYI + +     G
1828 Sbjct: 296 DHGVAVVGYG----VAEDGKAYWTVKNSWGPSWGEQGYIRVEKDSGASG 340
1831 >sp|P05994|PAP4_CARPA PAPAYA PROTEINASE IV PRECURSOR (PPIV) (PAPAYA PEPTIDASE B) (GLYCYL
1832            ENDOPEPTIDASE)
1833           Length = 348
1835  Score =  183 bits (461), Expect = 3e-46
1836  Identities = 112/309 (36%), Positives = 164/309 (52%), Gaps = 33/309 (10%)
1838 Query: 35  KFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYL 93
1839            K NK Y + +E L RFEIFK NL  I+E N +   +      G+N+F+DLS+DEFK  Y+
1840 Sbjct: 54  KHNKNYKNVDEKLYRFEIFKDNLKYIDERNKMINGYW----LGLNEFSDLSNDEFKEKYV 109
1842 Query: 94  NNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEG 153
1843             +    +T+     ++++++ ++ +P + DWR +GAVTPVK+QG C SCW+FST   VEG
1844 Sbjct: 110 GSLPEDYTNQPYDEEFVNEDIVD-LPESVDWRAKGAVTPVKHQGYCESCWAFSTVATVEG 168
1846 Query: 154 QHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESS 213
1847             + I    LV LSEQ LVDCD +            GCN G Q  +  Y+ +N GI   + 
1848 Sbjct: 169 INKIKTGNLVELSEQELVDCDKQ----------SYGCNRGYQSTSLQYVAQN-GIHLRAK 217
1850 Query: 214 YPYTAETGTQCNFNSANIGAKI--SNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQF 269
1851            YPY A+  T C  N    G K+  +    +  N        ++  P+++  ++   ++Q 
1852 Sbjct: 218 YPYIAKQQT-CRANQVG-GPKVKTNGVGRVQSNNEGSLLNAIAHQPVSVVVESAGRDFQN 275
1854 Query: 270 YIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK 329
1855            Y GG+F+  C    +DH +  VGY            Y ++KNSWG  WGE GYI +RR  
1856 Sbjct: 276 YKGGIFEGSCG-TKVDHAVTAVGYGKSG-----GKGYILIKNSWGPGWGENGYIRIRRAS 329
1858 Query: 330 ----NTCGV 334
1859                  CGV
1860 Sbjct: 330 GNSPGVCGV 338
1863 >sp|P22895|P34_SOYBN P34 PROBABLE THIOL PROTEASE PRECURSOR
1864           Length = 379
1866  Score =  183 bits (461), Expect = 3e-46
1867  Identities = 108/318 (33%), Positives = 171/318 (52%), Gaps = 38/318 (11%)
1869 Query: 40  YSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKA--DTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKE 97
1870            ++HEE  +R EIFK+N   I ++N    N K+    + G+NKFAD++  EF   YL   +
1871 Sbjct: 56  HNHEEEAKRLEIFKNNSNYIRDMNA---NRKSPHSHRLGLNKFADITPQEFSKKYLQAPK 112
1873 Query: 98  AIFTDDLPVADYL---DDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQ 154
1874             + +  + +A+     +    +  P ++DWR +G +T VK QG CG  W+FS TG +E  
1875 Sbjct: 113 DV-SQQIKMANKKMKKEQYSCDHPPASWDWRKKGVITQVKYQGGCGRGWAFSATGAIEAA 171
1877 Query: 155 HFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSY 214
1878            H I+   LVSLSEQ LVDC  E           EG   G Q  ++ +++++GGI T+  Y
1879 Sbjct: 172 HAIATGDLVSLSEQELVDCVEE----------SEGSYNGWQYQSFEWVLEHGGIATDDDY 221
1881 Query: 215 PYTAETGTQCNFNSANIGAKISNF-TMIPKNETVMAG------YIVSTGPLAIAADAVEW 267
1882            PY A+ G +C  N       I  + T+I  +E+  +         +   P++++ DA ++
1883 Sbjct: 222 PYRAKEG-RCKANKIQDKVTIDGYETLIMSDESTESETEQAFLSAILEQPISVSIDAKDF 280
1885 Query: 268 QFYIGGVFDIP--CNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYL 325
1886              Y GG++D     +P  ++H +L+VGY + +      + YWI KNSWG DWGE GYI++
1887 Sbjct: 281 HLYTGGIYDGENCTSPYGINHFVLLVGYGSAD-----GVDYWIAKNSWGFDWGEDGYIWI 335
1889 Query: 326 RRGK----NTCGVSNFVS 339
1890            +R        CG++ F S
1891 Sbjct: 336 QRNTGNLLGVCGMNYFAS 353
1894 >sp|P43234|CATO_HUMAN CATHEPSIN O PRECURSOR
1895           Length = 321
1897  Score =  182 bits (458), Expect = 8e-46
1898  Identities = 98/299 (32%), Positives = 155/299 (51%), Gaps = 28/299 (9%)
1900 Query: 52  FKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLD 111
1901            F+ +L +   LN +  +  +   +G+N+F+ L  +EFK  YL +K + F        Y  
1902 Sbjct: 44  FRESLNRHRYLNSLFPSENSTAFYGINQFSYLFPEEFKAIYLRSKPSKFPR------YSA 97
1904 Query: 112 DEFIN----SIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSE 167
1905            +  ++    S+P  FDWR +  VT V+NQ  CG CW+FS  G VE  + I    L  LS 
1906 Sbjct: 98  EVHMSIPNVSLPLRFDWRDKQVVTQVRNQQMCGGCWAFSVVGAVESAYAIKGKPLEDLSV 157
1908 Query: 168 QNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK-NGGIQTESSYPYTAETGTQCNF 226
1909            Q ++DC +           + GCNGG   NA N++ K    +  +S YP+ A+ G    F
1910 Sbjct: 158 QQVIDCSYN----------NYGCNGGSTLNALNWLNKMQVKLVKDSEYPFKAQNGLCHYF 207
1912 Query: 227 NSANIGAKISNFTM--IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSL 284
1913            + ++ G  I  ++       E  MA  +++ GPL +  DAV WQ Y+GG+    C+    
1914 Sbjct: 208 SGSHSGFSIKGYSAYDFSDQEDEMAKALLTFGPLVVIVDAVSWQDYLGGIIQHHCSSGEA 267
1916 Query: 285 DHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
1917            +H +LI G+         + PYWIV+NSWG+ WG  GY +++ G N CG+++ VS+  +
1918 Sbjct: 268 NHAVLITGFDKTG-----STPYWIVRNSWGSSWGVDGYAHVKMGSNVCGIADSVSSIFV 321
1921 >sp|P56202|CATW_HUMAN CATHEPSIN W PRECURSOR (LYMPHOPAIN)
1922           Length = 376
1924  Score =  182 bits (457), Expect = 1e-45
1925  Identities = 109/341 (31%), Positives = 170/341 (48%), Gaps = 35/341 (10%)
1927 Query: 22  PPEEQSQFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKF 80
1928            P E +  F  FQ +FN+ Y S EE+  R +IF  NL + + L    +      +FGV  F
1929 Sbjct: 35  PLELKEAFKLFQIQFNRSYLSPEEHAHRLDIFAHNLAQAQRLQEEDLG---TAEFGVTPF 91
1931 Query: 81  ADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWR-TRGAVTPVKNQGQC 139
1932            +DL+ +EF   Y   + A     +   +   +E   S+P + DWR   GA++P+K+Q  C
1933 Sbjct: 92  SDLTEEEFGQLYGYRRAAGGVPSMG-REIRSEEPEESVPFSCDWRKVAGAISPIKDQKNC 150
1935 Query: 140 GSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAY 199
1936              CW+ +  GN+E    IS    V +S   L+DC            C +GC+GG   +A+
1937 Sbjct: 151 NCCWAMAAAGNIETLWRISFWDFVDVSVHELLDCGR----------CGDGCHGGFVWDAF 200
1939 Query: 200 NYIIKNGGIQTESSYPYTAETGT-QCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPL 258
1940              ++ N G+ +E  YP+  +    +C+       A I +F M+  NE  +A Y+ + GP+
1941 Sbjct: 201 ITVLNNSGLASEKDYPFQGKVRAHRCHPKKYQKVAWIQDFIMLQNNEHRIAQYLATYGPI 260
1943 Query: 259 AIAADAVEWQFYIGGVFDIP---CNPNSLDHGILIVGYSA--------KNTIFRKNMP-- 305
1944             +  +    Q Y  GV       C+P  +DH +L+VG+ +          T+  ++ P  
1945 Sbjct: 261 TVTINMKPLQLYRKGVIKATPTTCDPQLVDHSVLLVGFGSVKSEEGIWAETVSSQSQPQP 320
1947 Query: 306 -----YWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTS 341
1948                 YWI+KNSWGA WGE+GY  L RG NTCG++ F  T+
1949 Sbjct: 321 PHPTPYWILKNSWGAQWGEKGYFRLHRGSNTCGITKFPLTA 361
1952 >sp|P25774|CATS_HUMAN CATHEPSIN S PRECURSOR
1953           Length = 331
1955  Score =  177 bits (444), Expect = 3e-44
1956  Identities = 116/347 (33%), Positives = 176/347 (50%), Gaps = 35/347 (10%)
1958 Query: 5   LLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYS--HEEYLERFEIFKSNLGKIEEL 62
1959            L+ VL V +  V+     P     +  ++  + K+Y   +EE + R  I++ NL  +   
1960 Sbjct: 4   LVCVLLVCSSAVAQLHKDPTLDHHWHLWKKTYGKQYKEKNEEAVRRL-IWEKNLKFVMLH 62
1962 Query: 63  NLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINS----- 117
1963            NL           G+N   D++S+E  +          T  L V                
1964 Sbjct: 63  NLEHSMGMHSYDLGMNHLGDMTSEEVMS---------LTSSLRVPSQWQRNITYKSNPNR 113
1966 Query: 118 -IPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHE 176
1967             +P + DWR +G VT VK QG CG+CW+FS  G +E Q  +   KLV+LS QNLVDC   
1968 Sbjct: 114 ILPDSVDWREKGCVTEVKYQGSCGACWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVTLSAQNLVDC--- 170
1970 Query: 177 CMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKIS 236
1971                  E+  ++GCNGG    A+ YII N GI +++SYPY A    +C ++S    A  S
1972 Sbjct: 171 ----STEKYGNKGCNGGFMTTAFQYIIDNKGIDSDASYPYKA-MDQKCQYDSKYRAATCS 225
1974 Query: 237 NFTMIP-KNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYI--GGVFDIPCNPNSLDHGILIVGY 293
1975             +T +P   E V+   + + GP+++  DA    F++   GV+  P    +++HG+L+VGY
1976 Sbjct: 226 KYTELPYGREDVLKEAVANKGPVSVGVDARHPSFFLYRSGVYYEPSCTQNVNHGVLVVGY 285
1978 Query: 294 SAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVS 339
1979               N        YW+VKNSWG ++GE+GYI + R K N CG+++F S
1980 Sbjct: 286 GDLN-----GKEYWLVKNSWGHNFGEEGYIRMARNKGNHCGIASFPS 327
1983 >sp|P00784|PAPA_CARPA PAPAIN PRECURSOR (PAPAYA PROTEINASE I) (PPI)
1984           Length = 345
1986  Score =  176 bits (442), Expect = 6e-44
1987  Identities = 116/315 (36%), Positives = 161/315 (50%), Gaps = 37/315 (11%)
1989 Query: 35  KFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKF--GVNKFADLSSDEFKNY 91
1990            K NK Y + +E + RFEIFK NL  I+E N      K +  +  G+N FAD+S+DEFK  
1991 Sbjct: 54  KHNKIYKNIDEKIYRFEIFKDNLKYIDETN------KKNNSYWLGLNVFADMSNDEFKEK 107
1993 Query: 92  YLNNKEAIFTD-DLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGN 150
1994            Y  +    +T  +L   + L+D  +N IP   DWR +GAVTPVKNQG CGSCW+FS    
1995 Sbjct: 108 YTGSIAGNYTTTELSYEEVLNDGDVN-IPEYVDWRQKGAVTPVKNQGSCGSCWAFSAVVT 166
1997 Query: 151 VEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQT 210
1998            +EG   I    L   SEQ L+DCD              GCNGG   +A   ++   GI  
1999 Sbjct: 167 IEGIIKIRTGNLNEYSEQELLDCDRR----------SYGCNGGYPWSALQ-LVAQYGIHY 215
2001 Query: 211 ESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMI-PKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EW 267
2002             ++YPY        +       AK      + P NE  +  Y ++  P+++  +A   ++
2003 Sbjct: 216 RNTYPYEGVQRYCRSREKGPYAAKTDGVRQVQPYNEGALL-YSIANQPVSVVLEAAGKDF 274
2005 Query: 268 QFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRR 327
2006            Q Y GG+F  PC  N +DH +  VGY            Y ++KNSWG  WGE GYI ++R
2007 Sbjct: 275 QLYRGGIFVGPCG-NKVDHAVAAVGYGPN---------YILIKNSWGTGWGENGYIRIKR 324
2009 Query: 328 GK-NTCGVSNFVSTS 341
2010            G  N+ GV    ++S
2011 Sbjct: 325 GTGNSYGVCGLYTSS 339
2014 >sp||CATL_CHICK_1 [Segment 1 of 2] CATHEPSIN L
2015           Length = 176
2017  Score =  175 bits (439), Expect = 1e-43
2018  Identities = 88/179 (49%), Positives = 117/179 (65%), Gaps = 12/179 (6%)
2020 Query: 119 PTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECM 178
2021            P + DWR +G VTPVK+QGQCGSCW+FSTTG +EGQHF ++ KLVSLSEQNLVDC     
2022 Sbjct: 2   PRSVDWREKGYVTPVKDQGQCGSCWAFSTTGALEGQHFRTKGKLVSLSEQNLVDCSRP-- 59
2024 Query: 179 EYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNF 238
2025              EG    ++GCNGGL   A+ Y+  NGGI +E SYPYTA+    C + +    A  + F
2026 Sbjct: 60  --EG----NQGCNGGLMDQAFQYVQDNGGIDSEESYPYTAKDDEDCRYKAEYNAANDTGF 113
2028 Query: 239 TMIPK-NETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGY 293
2029              IP+ +E  +   + S GP+++A DA    +QFY  G++  P C+   LDHG+L+VGY
2030 Sbjct: 114 VDIPQGHERALMKAVASVGPVSVAIDAGHSSFQFYQSGIYYEPDCSSEDLDHGVLVVGY 172
2033 >sp|P25326|CATS_BOVIN CATHEPSIN S
2034           Length = 217
2036  Score =  173 bits (434), Expect = 5e-43
2037  Identities = 91/226 (40%), Positives = 131/226 (57%), Gaps = 17/226 (7%)
2039 Query: 118 IPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHEC 177
2040            +P + DWR +G VT VK QG CGSCW+FS  G +E Q  +   KLVSLS QNLVDC    
2041 Sbjct: 1   LPDSMDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQVKLKTGKLVSLSAQNLVDC---- 56
2043 Query: 178 MEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISN 237
2044                  +  ++GCNGG    A+ YII N GI +E+SYPY A  G +C ++  N  A  S 
2045 Sbjct: 57  ---STAKYGNKGCNGGFMTEAFQYIIDNNGIDSEASYPYKAMDG-KCQYDVKNRAATCSR 112
2047 Query: 238 FTMIP-KNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYI--GGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYS 294
2048            +  +P  +E  +   + + GP+++  DA    F++   GV+  P    +++HG+L+VGY 
2049 Sbjct: 113 YIELPFGSEEALKEAVANKGPVSVGIDASHSSFFLYKTGVYYDPSCTQNVNHGVLVVGYG 172
2051 Query: 295 AKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVS 339
2052              +        YW+VKNSWG  +G+QGYI + R   N CG++N+ S
2053 Sbjct: 173 NLD-----GKDYWLVKNSWGLHFGDQGYIRMARNSGNHCGIANYPS 213
2056 >sp|P80884|ANAN_ANACO ANANAIN
2057           Length = 216
2059  Score =  167 bits (419), Expect = 3e-41
2060  Identities = 93/223 (41%), Positives = 124/223 (54%), Gaps = 22/223 (9%)
2062 Query: 118 IPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHEC 177
2063            +P + DWR  GAVT VKNQG+CGSCW+F++   VE  + I +  LVSLSEQ ++DC    
2064 Sbjct: 1   VPQSIDWRDSGAVTSVKNQGRCGSCWAFASIATVESIYKIKRGNLVSLSEQQVLDC---- 56
2066 Query: 178 MEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISN 237
2067                   A   GC GG    AY++II N G+ + + YPY A  GT C  N     A I+ 
2068 Sbjct: 57  -------AVSYGCKGGWINKAYSFIISNKGVASAAIYPYKAAKGT-CKTNGVPNSAYITR 108
2070 Query: 238 FTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAK 296
2071            +T + +N      Y VS  P+A A DA   +Q Y  GVF  PC    L+H I+I+GY   
2072 Sbjct: 109 YTYVQRNNERNMMYAVSNQPIAAALDASGNFQHYKRGVFTGPCG-TRLNHAIVIIGYGQD 167
2074 Query: 297 NTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNT----CGVS 335
2075            +        +WIV+NSWGA WGE GYI L R  ++    CG++
2076 Sbjct: 168 SA----GKKFWIVRNSWGAGWGEGGYIRLARDVSSSFGICGIA 206
2079 >sp|Q02765|CATS_RAT CATHEPSIN S PRECURSOR
2080           Length = 330
2082  Score =  167 bits (418), Expect = 4e-41
2083  Identities = 90/228 (39%), Positives = 132/228 (57%), Gaps = 18/228 (7%)
2085 Query: 117 SIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHE 176
2086            ++P + DWR +G VT VK QG CGSCW+FS  G +EGQ  +   KLVSLS QNLVDC  E
2087 Sbjct: 112 TLPDSVDWREKGCVTNVKYQGSCGSCWAFSAEGALEGQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSTE 171
2089 Query: 177 CMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKIS 236
2090                  E+  ++GC GG    A+ YII +  I +E+SYPY A    +C ++  N  A  S
2091 Sbjct: 172 ------EKYGNKGCGGGFMTEAFQYII-DTSIDSEASYPYKA-MDEKCLYDPKNRAATCS 223
2093 Query: 237 NFTMIP-KNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV---EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVG 292
2094             +  +P  +E  +   + + GP+++  D      +  Y  GV+D P    +++HG+L+VG
2095 Sbjct: 224 RYIELPFGDEEALKEAVATKGPVSVGIDDASHSSFFLYQSGVYDDPSCTENMNHGVLVVG 283
2097 Query: 293 YSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYL-RRGKNTCGVSNFVS 339
2098            Y   +        YW+VKNSWG  +G+QGYI + R  KN CG++++ S
2099 Sbjct: 284 YGTLD-----GKDYWLVKNSWGLHFGDQGYIRMARNNKNHCGIASYCS 326
2102 >sp|P20721|CYSL_LYCES LOW-TEMPERATURE-INDUCED CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR
2103           Length = 346
2105  Score =  164 bits (410), Expect = 3e-40
2106  Identities = 86/226 (38%), Positives = 127/226 (56%), Gaps = 21/226 (9%)
2108 Query: 116 NSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDH 175
2109            +S+P + DWR +G +  VK+QG CGSCW+FS    +E  + I    L+SLSEQ LVDCD 
2110 Sbjct: 16  DSLPESIDWREKGVLVGVKDQGSCGSCWAFSAVAAMESINAIVTGNLISLSEQELVDCD- 74
2112 Query: 176 ECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKI 235
2113                     + +EGC+GGL   A+ ++IKNGGI TE  YPY    G    +       KI
2114 Sbjct: 75  --------RSYNEGCDGGLMDYAFEFVIKNGGIDTEEDYPYKERNGVCDQYRKNAKVVKI 126
2116 Query: 236 SNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGY 293
2117             ++  +P N        V+  P++IA +A   ++Q Y  G+F   C   ++DHG++I GY
2118 Sbjct: 127 DSYEDVPVNNEKALQKAVAHQPVSIALEAGGRDFQHYKSGIFTGKCG-TAVDHGVVIAGY 185
2120 Query: 294 SAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNT----CGVS 335
2121              +N      M YWIV+NSWGA+  E GY+ ++R  ++    CG++
2122 Sbjct: 186 GTEN-----GMDYWIVRNSWGANCRENGYLRVQRNVSSSSGLCGLA 226
2125 >sp|P36184|ACP1_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE ACP1 PRECURSOR
2126           Length = 308
2128  Score =  162 bits (407), Expect = 7e-40
2129  Identities = 105/312 (33%), Positives = 150/312 (47%), Gaps = 40/312 (12%)
2131 Query: 29  FLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDE 87
2132            F ++    NK +++  EYL RF +F  N   +E          A+    +N FAD++ +E
2133 Sbjct: 18  FKQWAATHNKVFANRAEYLYRFAVFLDNKKFVE----------ANANTELNVFADMTHEE 67
2135 Query: 88  FKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFST 147
2136            F   +L       T ++P         + + P + DWR+   + P K+QGQCGSCW+F T
2137 Sbjct: 68  FIQTHLG-----MTYEVPETTSNVKAAVKAAPESVDWRS--IMNPAKDQGQCGSCWTFCT 120
2139 Query: 148 TGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGG 207
2140            T  +EG+      KL S SEQ LVDCD          A D GC GG   N+  +I +N G
2141 Sbjct: 121 TAVLEGRVNKDLGKLYSFSEQQLVDCD----------ASDNGCEGGHPSNSLKFIQENNG 170
2143 Query: 208 IQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--V 265
2144            +  ES YPY A  GT C     N+     +  +   +ET +   I   GP+A+  DA   
2145 Sbjct: 171 LGLESDYPYKAVAGT-CK-KVKNVATVTGSRRVTDGSETGLQTIIAENGPVAVGMDASRP 228
2147 Query: 266 EWQFYIGGVF--DIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYI 323
2148             +Q Y  G    D  C    ++H +  VGY + +     N  YWI++NSWG  WG+ GY 
2149 Sbjct: 229 SFQLYKKGTIYSDTKCRSRMMNHCVTAVGYGSNS-----NGKYWIIRNSWGTSWGDAGYF 283
2151 Query: 324 YLRR-GKNTCGV 334
2152             L R   N CG+
2153 Sbjct: 284 LLARDSNNMCGI 295
2156 >sp|O17473|CATL_BRUPA CATHEPSIN L-LIKE PRECURSOR
2157           Length = 395
2159  Score =  159 bits (398), Expect = 8e-39
2160  Identities = 101/323 (31%), Positives = 155/323 (47%), Gaps = 21/323 (6%)
2162 Query: 26  QSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSS 85
2163            ++++ ++     K Y  +E   R  IF+SN    E +N             +N  ADL+ 
2164 Sbjct: 88  ETEWKDYVTALGKHYDQKENNFRMAIFESNELMTERINKKYEQGLVSYTTALNDLADLTD 147
2166 Query: 86  DEF--KNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCW 143
2167            +EF  +N      +         +++   +    +P   DWRT+GAVTPV+NQG+CGSC+
2168 Sbjct: 148 EEFMVRNGLRLPNQTDLRGKRQTSEFYRYDKSERLPDQVDWRTKGAVTPVRNQGECGSCY 207
2170 Query: 144 SFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYII 203
2171            +F+T   +E  H     +L+ LS QN+VDC             + GC+GG  P A+ Y  
2172 Sbjct: 208 AFATAAALEAYHKQMTGRLLDLSPQNIVDCT--------RNLGNNGCSGGYMPTAFQYAS 259
2174 Query: 204 KNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMI-PKNETVMAGYIVSTGP--LAI 260
2175            +  GI  ES YPY   T  +C +  +      + F  I P +E  +   +   GP  + I
2176 Sbjct: 260 RY-GIAMESRYPYVG-TEQRCRWQQSIAVVTDNGFNEIQPGDELALKHAVAKRGPVVVGI 317
2178 Query: 261 AADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQ 320
2179            +     ++FY  GV+    N    DH +L VGY    +       YWIVKNSWG DWG+ 
2180 Sbjct: 318 SGSKRSFRFYKDGVYS-EGNCGRPDHAVLAVGYGTHPSY----GDYWIVKNSWGTDWGKD 372
2182 Query: 321 GYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTSI 342
2183            GY+Y+ R + N C +++  S  I
2184 Sbjct: 373 GYVYMARNRGNMCHIASAASFPI 395
2187 >sp|Q01957|CPP1_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR
2188           Length = 315
2190  Score =  156 bits (391), Expect = 5e-38
2191  Identities = 108/309 (34%), Positives = 166/309 (52%), Gaps = 39/309 (12%)
2193 Query: 37  NKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADT-KFGVN-KFADLSSDEFKNYYLN 94
2194            NK ++  E L R  IF  N        ++A N++ +T K  V+  FA ++++E+ N  L 
2195 Sbjct: 24  NKHFTAVESLRRRAIFNMNA------RIVAENNRKETFKLSVDGPFAAMTNEEY-NSLLK 76
2197 Query: 95  NKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQ 154
2198             K +   ++     YL+ +     P A DWR +G VTP+++QG CGSC++F +   +EG+
2199 Sbjct: 77  LKRS--GEEKGEVRYLNIQ----APKAVDWRKKGKVTPIRDQGNCGSCYTFGSIAALEGR 130
2201 Query: 155 HFISQ---NKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTE 211
2202              I +   ++ + LSE+++V C  E    +G    + GCNGGL  N YNYI++N GI  E
2203 Sbjct: 131 LLIEKGGDSETLDLSEEHMVQCTRE----DG----NNGCNGGLGSNVYNYIMEN-GIAKE 181
2205 Query: 212 SSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQF 269
2206            S YPYT    T C  +     AKI ++  + +N  V     +S G + ++ DA  V++Q 
2207 Sbjct: 182 SDYPYTGSDST-CR-SDVKAFAKIKSYNRVARNNEVELKAAISQGLVDVSIDASSVQFQL 239
2209 Query: 270 YIGGVF-DIPCNPN--SLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLR 326
2210            Y  G + D  C  N  +L+H +  VGY   +         WIV+NSWG  WGE+GYI + 
2211 Sbjct: 240 YKSGAYTDTQCKNNYFALNHEVCAVGYGVVD-----GKECWIVRNSWGTGWGEKGYINMV 294
2213 Query: 327 RGKNTCGVS 335
2214               NTCGV+
2215 Sbjct: 295 IEGNTCGVA 303
2218 >sp|Q06964|CPP3_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE 3 PRECURSOR (CYSTEINE PROTEINASE ACP3)
2219           Length = 308
2221  Score =  153 bits (384), Expect = 4e-37
2222  Identities = 103/308 (33%), Positives = 159/308 (51%), Gaps = 37/308 (12%)
2224 Query: 37  NKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVN-KFADLSSDEFKNYYLNN 95
2225            NK ++  E L R  IF  N   + E N      K   K  V+  FA ++++E++   L +
2226 Sbjct: 17  NKHFTAVEALRRRAIFNMNARFVAEFN-----KKGSFKLSVDGPFAAMTNEEYRTL-LKS 70
2228 Query: 96  KEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQH 155
2229            K  +  ++     YL+ +     P + DWR +G VTP+++Q QCGSC++F +   +EG+ 
2230 Sbjct: 71  KRTV--EENGKVTYLNIQ----APESVDWRAQGKVTPIRDQAQCGSCYTFGSLAALEGRL 124
2232 Query: 156 FISQN---KLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTES 212
2233             I +      + LSE++LV C          +  + GCNGGL  N Y+YII+N G+  ES
2234 Sbjct: 125 LIEKGGNANTLDLSEEHLVQCT--------RDNGNNGCNGGLGSNVYDYIIQN-GVAKES 175
2236 Query: 213 SYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFY 270
2237             YPYT  T + C  N     AKI+ +  +P+N        +S G + ++ DA   ++Q Y
2238 Sbjct: 176 DYPYTG-TDSTCKTN-VKAFAKITGYNKVPRNNEAELKAALSQGLVDVSIDASSAKFQLY 233
2240 Query: 271 IGGVF-DIPCNPN--SLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRR 327
2241              G + D  C  N  +L+H +  VGY   +         WIV+NSWG  WG++GYI +  
2242 Sbjct: 234 KSGAYSDTKCKNNFFALNHEVCAVGYGVVD-----GKECWIVRNSWGTGWGDKGYINMVI 288
2244 Query: 328 GKNTCGVS 335
2245              NTCGV+
2246 Sbjct: 289 EGNTCGVA 296
2249 >sp|Q01958|CPP2_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR
2250           Length = 315
2252  Score =  153 bits (383), Expect = 5e-37
2253  Identities = 102/316 (32%), Positives = 161/316 (50%), Gaps = 37/316 (11%)
2255 Query: 29  FLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVN-KFADLSSDE 87
2256            F  +  K NK ++  E L R  IF  N   ++  N I        K  V+  FA ++++E
2257 Sbjct: 16  FNTWASKNNKHFTAIEKLRRRAIFNMNAKFVDSFNKIG-----SFKLSVDGPFAAMTNEE 70
2259 Query: 88  FKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFST 147
2260            ++    + +    T++     YL+ +     P + DWR  G VTP+++Q QCGSC++F +
2261 Sbjct: 71  YRTLLKSKRT---TEENGQVKYLNIQ----APESVDWRKEGKVTPIRDQAQCGSCYTFGS 123
2263 Query: 148 TGNVEGQHFISQN---KLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK 204
2264               +EG+  I +      + LSE+++V C          +  + GCNGGL  N Y+YII+
2265 Sbjct: 124 LAALEGRLLIEKGGDANTLDLSEEHMVQCT--------RDNGNNGCNGGLGSNVYDYIIE 175
2267 Query: 205 NGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA 264
2268            + G+  ES YPYT    T C  N  +  AKI+ +T +P+N        +S G + ++ DA
2269 Sbjct: 176 H-GVAKESDYPYTGSDST-CKTNVKSF-AKITGYTKVPRNNEAELKAALSQGLVDVSIDA 232
2271 Query: 265 --VEWQFYIGGVF-DIPCNPN--SLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGE 319
2272               ++Q Y  G + D  C  N  +L+H +  VGY   +         WIV+NSWG  WG+
2273 Sbjct: 233 SSAKFQLYKSGAYTDTKCKNNYFALNHEVCAVGYGVVD-----GKECWIVRNSWGTGWGD 287
2275 Query: 320 QGYIYLRRGKNTCGVS 335
2276            +GYI +    NTCGV+
2277 Sbjct: 288 KGYINMVIEGNTCGVA 303
2280 >sp|P46102|CYSP_PLAVN CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR
2281           Length = 506
2283  Score =  153 bits (382), Expect = 6e-37
2284  Identities = 115/358 (32%), Positives = 176/358 (49%), Gaps = 62/358 (17%)
2286 Query: 27  SQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSS 85
2287            S+F ++  + NKKY + +E L+RFE FK    K ++ N +   +       VN+++D S 
2288 Sbjct: 160 SKFFKYMKENNKKYENMDEQLQRFENFKIRYMKTQKHNEMVGKNGLTYVQKVNQYSDFSK 219
2290 Query: 86  DEFKNYYLNNKEAIFTDDL------PVADYLDDEFINSI-------PTAFDWRTRGAVTP 132
2291            +EF NY+   K      DL      P+  +L +  + S+       P + D+R++    P
2292 Sbjct: 220 EEFDNYF--KKLLSVPMDLKSKYIVPLKKHLANTNLISVDNKSKDFPDSRDYRSKFNFLP 277
2294 Query: 133 VKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKL-VSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCN 191
2295             K+QG CGSCW+F+  GN E  +  +++++ +S SEQ +VDC  E          + GC+
2296 Sbjct: 278 PKDQGNCGSCWAFAAIGNFEYLYVHTRHEMPISFSEQQMVDCSTE----------NYGCD 327
2298 Query: 192 GGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGY 251
2299            GG    A+ Y+I NG +     YPY       C     ++  ++     +  NE +MA  
2300 Sbjct: 328 GGNPFYAFLYMINNG-VCLGDEYPYKGHEDFFCLNYRCSLLGRVHFIGDVKPNELIMALN 386
2302 Query: 252 IVSTGPLAIAADAVE-WQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSA--------------- 295
2303             V  GP+ IA  A E +  Y GGVFD  CNP  L+H +L+VGY                 
2304 Sbjct: 387 YV--GPVTIAVGASEDFVLYSGGVFDGECNPE-LNHSVLLVGYGQVKKSLAFEDSHSNVD 443
2306 Query: 296 KNTI--FRKNMP---------YWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK----NTCGVSNFV 338
2307             N I  +++N+          YWIV+NSWG +WGE GYI ++R K      CGV + V
2308 Sbjct: 444 SNLIKKYKENIKGDDDDDIIYYWIVRNSWGPNWGEGGYIRIKRNKAGDDGFCGVGSDV 501
2311 >sp|P36185|ACP2_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE ACP2 PRECURSOR
2312           Length = 310
2314  Score =  150 bits (374), Expect = 5e-36
2315  Identities = 102/322 (31%), Positives = 160/322 (49%), Gaps = 32/322 (9%)
2317 Query: 20  GIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVN- 78
2318            GI       F  +  K NK ++  E L R  IF  N   ++  N I        K  V+ 
2319 Sbjct: 3   GIRIASAIDFNTWASKNNKHFTAIEKLRRRAIFNMNAKFVDSFNKIG-----SFKLSVDG 57
2321 Query: 79  KFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQ 138
2322             FA ++++E++    + +    T++     YL+ +     P + DWR  G VTP+++Q Q
2323 Sbjct: 58  PFAAMTNEEYRTLLKSKRT---TEENGQVKYLNIQ----APESVDWRKEGKVTPLRDQAQ 110
2325 Query: 139 CGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNA 198
2326            CGSC++F +   +EG+  I +       + N +D   E M+   +   + GCNGGL  N 
2327 Sbjct: 111 CGSCYTFGSLAALEGRLLIEKG-----GDANTLDLSEEHMQCTRDNG-NNGCNGGLGSNV 164
2329 Query: 199 YNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPL 258
2330            Y+YII++ G+  ES YPYT    T C  N  +   KI+ +T +P+N        +S G L
2331 Sbjct: 165 YDYIIEH-GVAKESDYPYTGSDST-CKTNVKSF-RKITGYTKVPRNNEAELKAALSQGLL 221
2333 Query: 259 AIAAD--AVEWQFYIGGVF-DIPCNPN--SLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSW 313
2334             ++ D  + ++Q Y  G + D  C  N  +L+H +  VGY   +         WIV+NSW
2335 Sbjct: 222 DVSIDVSSAKFQLYKSGAYTDTKCKNNYFALNHEVCAVGYGVVD-----GKECWIVRNSW 276
2337 Query: 314 GADWGEQGYIYLRRGKNTCGVS 335
2338            G  WG++GYI +    NTCGV+
2339 Sbjct: 277 GTSWGDKGYINMVIEGNTCGVA 298
2342 >sp|P25781|CYSP_THEAN CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR
2343           Length = 441
2345  Score =  146 bits (366), Expect = 5e-35
2346  Identities = 107/339 (31%), Positives = 164/339 (47%), Gaps = 54/339 (15%)
2348 Query: 28  QFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGV--NKFADLS 84
2349            +F  F +K+ K + S ++ ++RF  F+ N   ++        HK    + +  NKF+DLS
2350 Sbjct: 119 EFDAFVEKYKKVHRSFDQRVQRFLTFRKNYHIVK-------THKPTEPYSLDLNKFSDLS 171
2352 Query: 85  SDEFKNYY--------------------LNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTA--F 122
2353             +EFK  Y                    +++K  I+   L  A  +++    S+ T    
2354 Sbjct: 172 DEEFKALYPVITPPKTYTSLSKHLEFKKMSHKNPIYISKLKKAKGIEEIKDLSLITGENL 231
2356 Query: 123 DWRTRGAVTPVKNQGQ-CGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYE 181
2357            +W    AV+P K+QG  CGSCW+FS+  +VE  + + +NK   LSEQ LV+CD   M   
2358 Sbjct: 232 NWARTDAVSPTKDQGDHCGSCWAFSSIASVESLYRLYKNKSYFLSEQELVNCDKSSM--- 288
2360 Query: 182 GEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMI 241
2361                   GC GGL   A  Y I + G+  ES  PYT    + C  +  N    I + +++
2362 Sbjct: 289 -------GCAGGLPITALEY-IHSKGVSFESEVPYTGIV-SPCKPSIKN-KVFIDSISIL 338
2364 Query: 242 PKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFR 301
2365              N+ V    ++S   + IA    E + Y GG+F   C    L+H +L+VG    +    
2366 Sbjct: 339 KGNDVVNKSLVISPTVVGIAV-TKELKLYSGGIFTGKCG-GELNHAVLLVGEGVDH---E 393
2368 Query: 302 KNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRR---GKNTCGVSNF 337
2369              M YWI+KNSWG DWGE G++ L+R   G + CG+  F
2370 Sbjct: 394 TGMRYWIIKNSWGEDWGENGFLRLQRTKKGLDKCGILTF 432
2373 >sp|P14518|BROM_ANACO BROMELAIN, STEM
2374           Length = 212
2376  Score =  146 bits (365), Expect = 6e-35
2377  Identities = 81/224 (36%), Positives = 115/224 (51%), Gaps = 27/224 (12%)
2379 Query: 117 SIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHE 176
2380            ++P + DWR  GAVT VKNQ  CG+CW+F+    VE  + I +  L  LSEQ ++DC   
2381 Sbjct: 1   AVPQSIDWRDYGAVTSVKNQNPCGACWAFAAIATVESIYKIKKGILEPLSEQQVLDC--- 57
2383 Query: 177 CMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKIS 236
2384                    A   GC GG +  A+ +II N G+ + + YPY A  GT C  +     A I+
2385 Sbjct: 58  --------AKGYGCKGGWEFRAFEFIISNKGVASGAIYPYKAAKGT-CKTDGVPNSAYIT 108
2387 Query: 237 NFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA-VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSA 295
2388             +  +P+N      Y VS  P+ +A DA   +Q+Y  GVF+ PC   SL+H +  +GY  
2389 Sbjct: 109 GYARVPRNNESSMMYAVSKQPITVAVDANANFQYYKSGVFNGPCG-TSLNHAVTAIGYGQ 167
2391 Query: 296 KNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRR----GKNTCGVS 335
2392             + I+ K          WGA WGE GYI + R        CG++
2393 Sbjct: 168 DSIIYPK---------KWGAKWGEAGYIRMARDVSSSSGICGIA 202
2396 >sp|P22497|CYSP_THEPA CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR
2397           Length = 439
2399  Score =  145 bits (363), Expect = 1e-34
2400  Identities = 104/343 (30%), Positives = 159/343 (46%), Gaps = 64/343 (18%)
2402 Query: 24  EEQSQFLEFQDKFNKKYS-HEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKF--GVNKF 80
2403            E   +F EF  K+N++++  +E L R   F+SN  +++E        K D  +  G+N+F
2404 Sbjct: 119 EVYREFEEFNSKYNRRHATQQERLNRLVTFRSNYLEVKE-------QKGDEPYVKGINRF 171
2406 Query: 81  ADLSSDEF--------------------------KNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEF 114
2407            +DL+  EF                          K Y  N K+A+ TD+       D + 
2408 Sbjct: 172 SDLTEREFYKLFPVMKPPKATYSNGYYLLSHMANKTYLKNLKKALNTDE-------DVDL 224
2410 Query: 115 INSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCD 174
2411                    DWR   +VT VK+Q  CG CW+FST G+VEG +    +K   LS Q L+DCD
2412 Sbjct: 225 AKLTGENLDWRRSSSVTSVKDQSNCGGCWAFSTVGSVEGYYMSHFDKSYELSVQELLDCD 284
2414 Query: 175 HECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAK 234
2415                      +   GC GGL  +AY Y+ K  G+ +    P+  +   +C+   A     
2416 Sbjct: 285 ----------SFSNGCQGGLLESAYEYVRKY-GLVSAKDLPF-VDKARRCSVPKAK-KVS 331
2418 Query: 235 ISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYS 294
2419            + ++ +  K + VM   + S+      + + E   Y  GVF   C   SL+H +++VG  
2420 Sbjct: 332 VPSYHVF-KGKEVMTRSLTSSPCSVYLSVSPELAKYKSGVFTGECG-KSLNHAVVLVGEG 389
2422 Query: 295 AKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRR---GKNTCGV 334
2423                  ++   YW+V+NSWG DWGE GY+ L R   G + CGV
2424 Sbjct: 390 YDEVTKKR---YWVVQNSWGTDWGENGYMRLERTNMGTDKCGV 429
2427 >sp|P16311|MMAL_DERFA MAJOR MITE FECAL ALLERGEN DER F 1 PRECURSOR (DER F I)
2428           Length = 321
2430  Score =  144 bits (359), Expect = 3e-34
2431  Identities = 116/346 (33%), Positives = 158/346 (45%), Gaps = 48/346 (13%)
2433 Query: 7   FVLAVFTVFVSSRGIP-PEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLI 65
2434            FVLA+ ++ V S     P     F EF+  FNK Y+    +E  E+ + N   +E L  +
2435 Sbjct: 3   FVLAIASLLVLSTVYARPASIKTFEEFKKAFNKNYAT---VEEEEVARKNF--LESLKYV 57
2437 Query: 66  AINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEF----INSI--P 119
2438              N     K  +N  +DLS DEFKN YL + EA   + L     L+ E     INS+  P
2439 Sbjct: 58  EAN-----KGAINHLSDLSLDEFKNRYLMSAEAF--EQLKTQFDLNAETSACRINSVNVP 110
2441 Query: 120 TAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECME 179
2442            +  D R+   VTP++ QG CGSCW+FS     E  +   +N  + LSEQ LVDC      
2443 Sbjct: 111 SELDLRSLRTVTPIRMQGGCGSCWAFSGVAATESAYLAYRNTSLDLSEQELVDC------ 164
2445 Query: 180 YEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFT 239
2446                 A   GC+G   P    YI +NG ++ E SYPY A        NS + G  ISN+ 
2447 Sbjct: 165 -----ASQHGCHGDTIPRGIEYIQQNGVVE-ERSYPYVAREQRCRRPNSQHYG--ISNYC 216
2449 Query: 240 MIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAA-----DAVEWQFYIGGVF---DIPCNPNSLDHGILIV 291
2450             I   +       ++    AIA      D   +Q Y G      D    PN   H + IV
2451 Sbjct: 217 QIYPPDVKQIREALTQTHTAIAVIIGIKDLRAFQHYDGRTIIQHDNGYQPNY--HAVNIV 274
2453 Query: 292 GYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNF 337
2454            GY +      +   YWIV+NSW   WG+ GY Y + G N   +  +
2455 Sbjct: 275 GYGS-----TQGDDYWIVRNSWDTTWGDSGYGYFQAGNNLMMIEQY 315
2458 >sp|P25805|CYSP_PLAFA THROPHOZOITE CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR (TCP)
2459           Length = 569
2461  Score =  144 bits (359), Expect = 3e-34
2462  Identities = 102/363 (28%), Positives = 167/363 (45%), Gaps = 62/363 (17%)
2464 Query: 27  SQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSS 85
2465            S+F +F  + NK Y + +E + +FEIFK N   I+  N   +N  A  K  VN+F+D S 
2466 Sbjct: 223 SKFFKFMKEHNKVYKNIDEQMRKFEIFKINYISIKNHN--KLNKNAMYKKKVNQFSDYSE 280
2468 Query: 86  DEFKNY--------------YLNNKEAIFTDDLPVADYL------DDEFINSIPTAFDWR 125
2469            +E K Y              Y    E    D++ ++++       + +  + +P   D+R
2470 Sbjct: 281 EELKEYFKTLLHVPNHMIEKYSKPFENHLKDNILISEFYTNGKRNEKDIFSKVPEILDYR 340
2472 Query: 126 TRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEA 185
2473             +G V   K+QG CGSCW+F++ GN+E         ++S SEQ +VDC  +         
2474 Sbjct: 341 EKGIVHEPKDQGLCGSCWAFASVGNIESVFAKKNKNILSFSEQEVVDCSKD--------- 391
2476 Query: 186 CDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNE 245
2477             + GC+GG    ++ Y+++N  +     Y Y A+    C          +S+   + +N+
2478 Sbjct: 392 -NFGCDGGHPFYSFLYVLQN-ELCLGDEYKYKAKDDMFCLNYRCKRKVSLSSIGAVKENQ 449
2480 Query: 246 TVMAGYIVSTGPLAIAADA-VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGY----------- 293
2481             ++A  +   GPL++      ++  Y  GV++  C+   L+H +L+VGY           
2482 Sbjct: 450 LILA--LNEVGPLSVNVGVNNDFVAYSEGVYNGTCS-EELNHSVLLVGYGQVEKTKLNYN 506
2484 Query: 294 ---SAKNTIFRKNMP------YWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKN----TCGVSNFVST 340
2485                  NT    N P      YWI+KNSW   WGE G++ L R KN     CG+   V  
2486 Sbjct: 507 NKIQTYNTKENSNQPDDNIIYYWIIKNSWSKKWGENGFMRLSRNKNGDNVFCGIGEEVFY 566
2488 Query: 341 SII 343
2489             I+
2490 Sbjct: 567 PIL 569
2493 >sp|P42666|CYSP_PLAVI CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR
2494           Length = 583
2496  Score =  132 bits (329), Expect = 1e-30
2497  Identities = 102/367 (27%), Positives = 165/367 (44%), Gaps = 86/367 (23%)
2499 Query: 27  SQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSS 85
2500            S+F  F +K+ + Y    E +E+++ FK N  KI++ N          K  VN+F+D S 
2501 Sbjct: 235 SKFFNFMNKYKRSYKDINEQMEKYKNFKMNYLKIKKHN----ETNQMYKMKVNQFSDYSK 290
2503 Query: 86  DEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFI------------------------NSIPTA 121
2504             +F++Y        F   +P+ D+L  +++                          +P  
2505 Sbjct: 291 KDFESY--------FRKLVPIPDHLKKKYVVPFSSMNNGKGKNVVTSSSGANLLADVPEI 342
2507 Query: 122 FDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNK-LVSLSEQNLVDCDHECMEY 180
2508             D+R +G V   K+QG CGSCW+F++ GNVE  +    NK +++LSEQ +VDC       
2509 Sbjct: 343 LDYREKGIVHEPKDQGLCGSCWAFASVGNVECMYAKEHNKTILTLSEQEVVDC------- 395
2511 Query: 181 EGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQC-NFNSANIGAKISNFT 239
2512                  + GC+GG    ++ Y I+N GI     Y Y A     C N+   N    +S+  
2513 Sbjct: 396 ---SKLNFGCDGGHPFYSFIYAIEN-GICMGDDYKYKAMDNLFCLNYRCKN-KVTLSSVG 450
2515 Query: 240 MIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYS--AK 296
2516             + +NE + A  +   GP+++      ++ FY GG+F+  C    L+H +L+VGY     
2517 Sbjct: 451 GVKENELIRA--LNEVGPVSVNVGVTDDFSFYGGGIFNGTCT-EELNHSVLLVGYGQVQS 507
2519 Query: 297 NTIFRKN-------------------------MPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKN- 330
2520            + IF++                            YWI+KNSW   WGE G++ + R K  
2521 Sbjct: 508 SKIFQEKNAYDDASGVTKKGALSYPSKADDGIQYYWIIKNSWSKFWGENGFMRISRNKEG 567
2523 Query: 331 ---TCGV 334
2524                CG+
2525 Sbjct: 568 DNVFCGI 574
2528 >sp|P08176|MMAL_DERPT MAJOR MITE FECAL ALLERGEN DER P 1 PRECURSOR (DER P I)
2529           Length = 320
2531  Score =  123 bits (305), Expect = 7e-28
2532  Identities = 110/338 (32%), Positives = 151/338 (44%), Gaps = 51/338 (15%)
2534 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIE 60
2535            MK++L     +    V +R   P     F E++  FNK Y+     E  E  + N   +E
2536 Sbjct: 1   MKIVLAIASLLALSAVYAR---PSSIKTFEEYKKAFNKSYAT---FEDEEAARKNF--LE 52
2538 Query: 61  ELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEF----IN 116
2539             +  +  N  A     +N  +DLS DEFKN +L + EA   + L     L+ E     IN
2540 Sbjct: 53  SVKYVQSNGGA-----INHLSDLSLDEFKNRFLMSAEAF--EHLKTQFDLNAETNACSIN 105
2542 Query: 117 -SIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDH 175
2543             + P   D R    VTP++ QG CGSCW+FS     E  +   +N+ + L+EQ LVDC  
2544 Sbjct: 106 GNAPAEIDLRQMRTVTPIRMQGGCGSCWAFSGVAATESAYLAYRNQSLDLAEQELVDC-- 163
2546 Query: 176 ECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKI 235
2547                     A   GC+G   P    YI  NG +Q ES Y Y A   +    N+   G  I
2548 Sbjct: 164 ---------ASQHGCHGDTIPRGIEYIQHNGVVQ-ESYYRYVAREQSCRRPNAQRFG--I 211
2550 Query: 236 SNFTMI-PKNETVMAGYIVSTGPLAIAA-----DAVEWQFYIGGVF---DIPCNPNSLDH 286
2551            SN+  I P N   +   +  T   AIA      D   ++ Y G      D    PN   H
2552 Sbjct: 212 SNYCQIYPPNVNKIREALAQTHS-AIAVIIGIKDLDAFRHYDGRTIIQRDNGYQPNY--H 268
2554 Query: 287 GILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIY 324
2555             + IVGYS       + + YWIV+NSW  +WG+ GY Y
2556 Sbjct: 269 AVNIVGYSN-----AQGVDYWIVRNSWDTNWGDNGYGY 301
2559 >sp|P80067|CATC_RAT DIPEPTIDYL-PEPTIDASE I PRECURSOR (DPP-I) (DPPI) (CATHEPSIN C)
2560            (CATHEPSIN J) (DIPEPTIDYL TRANSFERASE)
2561           Length = 462
2563  Score =  117 bits (291), Expect = 3e-26
2564  Identities = 81/255 (31%), Positives = 128/255 (49%), Gaps = 32/255 (12%)
2566 Query: 105 PVADYLDDEFINSIPTAFDWRT-RGA--VTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNK 161
2567            P+ D +  + + S+P ++DWR  RG   V+PV+NQ  CGSC+SF++ G +E +  I  N 
2568 Sbjct: 218 PITDEIQQQIL-SLPESWDWRNVRGINFVSPVRNQESCGSCYSFASIGMLEARIRILTNN 276
2570 Query: 162 LVS--LSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAE 219
2571              +  LS Q +V C              +GC+GG          ++ G+  E+ +PYTA 
2572 Sbjct: 277 SQTPILSPQEVVSCSPYA----------QGCDGGFPYLIAGKYAQDFGVVEENCFPYTA- 325
2574 Query: 220 TGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPK-----NETVMAGYIVSTGPLAIAADAVE-WQFYIGG 273
2575            T   C      +    S +  +       NE +M   +V  GP+A+A +  + +  Y  G
2576 Sbjct: 326 TDAPCKPKENCLRYYSSEYYYVGGFYGGCNEALMKLELVKHGPMAVAFEVHDDFLHYHSG 385
2578 Query: 274 VF-----DIPCNPNSL-DHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRR 327
2579            ++       P NP  L +H +L+VGY  K+ +    + YWIVKNSWG+ WGE GY  +RR
2580 Sbjct: 386 IYHHTGLSDPFNPFELTNHAVLLVGYG-KDPV--TGLDYWIVKNSWGSQWGESGYFRIRR 442
2582 Query: 328 GKNTCGVSNFVSTSI 342
2583            G + C + +    +I
2584 Sbjct: 443 GTDECAIESIAMAAI 457
2587 >sp|P97821|CATC_MOUSE DIPEPTIDYL-PEPTIDASE I PRECURSOR (DPP-I) (DPPI) (CATHEPSIN C)
2588            (CATHEPSIN J) (DIPEPTIDYL TRANSFERASE)
2589           Length = 462
2591  Score =  116 bits (287), Expect = 8e-26
2592  Identities = 90/331 (27%), Positives = 156/331 (46%), Gaps = 42/331 (12%)
2594 Query: 34  DKFNKKYSH-----EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEF 88
2595            +K N   +H     E Y ER  ++  N   ++ +N +    K+ T     ++  +S  + 
2596 Sbjct: 147 EKVNMNAAHLGGLQERYSER--LYTHNHNFVKAINTV---QKSWTATAYKEYEKMSLRDL 201
2598 Query: 89  KNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRT-RGA--VTPVKNQGQCGSCWSF 145
2599                 +++        P+ D +  + +N +P ++DWR  +G   V+PV+NQ  CGSC+SF
2600 Sbjct: 202 IRRSGHSQRIPRPKPAPMTDEIQQQILN-LPESWDWRNVQGVNYVSPVRNQESCGSCYSF 260
2602 Query: 146 STTGNVEGQHFISQNKLVS--LSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYII 203
2603            ++ G +E +  I  N   +  LS Q +V C              +GC+GG          
2604 Sbjct: 261 ASMGMLEARIRILTNNSQTPILSPQEVVSCSPYA----------QGCDGGFPYLIAGKYA 310
2606 Query: 204 KNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPK-----NETVMAGYIVSTGPL 258
2607            ++ G+  ES +PYTA+  + C      +    S++  +       NE +M   +V  GP+
2608 Sbjct: 311 QDFGVVEESCFPYTAKD-SPCKPRENCLRYYSSDYYYVGGFYGGCNEALMKLELVKHGPM 369
2610 Query: 259 AIAADAVE-WQFYIGGVF-----DIPCNPNSL-DHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKN 311
2611            A+A +  + +  Y  G++       P NP  L +H +L+VGY          + YWI+KN
2612 Sbjct: 370 AVAFEVHDDFLHYHSGIYHHTGLSDPFNPFELTNHAVLLVGYGRDPVT---GIEYWIIKN 426
2614 Query: 312 SWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
2615            SWG++WGE GY  +RRG + C + +    +I
2616 Sbjct: 427 SWGSNWGESGYFRIRRGTDECAIESIAVAAI 457
2619 >sp|P53634|CATC_HUMAN DIPEPTIDYL-PEPTIDASE I PRECURSOR (DPP-I) (DPPI) (CATHEPSIN C)
2620            (CATHEPSIN J) (DIPEPTIDYL TRANSFERASE)
2621           Length = 463
2623  Score =  113 bits (281), Expect = 4e-25
2624  Identities = 75/236 (31%), Positives = 113/236 (47%), Gaps = 31/236 (13%)
2626 Query: 118 IPTAFDWRTRGA---VTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVS--LSEQNLVD 172
2627            +PT++DWR       V+PV+NQ  CGSC+SF++ G +E +  I  N   +  LS Q +V 
2628 Sbjct: 231 LPTSWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARIRILTNNSQTPILSPQEVVS 290
2630 Query: 173 CDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIG 232
2631            C              +GC GG          ++ G+  E+ +PYT  T + C        
2632 Sbjct: 291 CSQYA----------QGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEACFPYTG-TDSPCKMKEDCFR 339
2634 Query: 233 AKISNFTMIPK-----NETVMAGYIVSTGPLAIAADAVE-WQFYIGGVFDI-----PCNP 281
2635               S +  +       NE +M   +V  GP+A+A +  + +  Y  G++       P NP
2636 Sbjct: 340 YYSSEYHYVGGFYGGCNEALMKLELVHHGPMAVAFEVYDDFLHYKKGIYHHTGLRDPFNP 399
2638 Query: 282 NSL-DHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSN 336
2639              L +H +L+VGY   +      M YWIVKNSWG  WGE GY  +RRG + C + +
2640 Sbjct: 400 FELTNHAVLLVGYGTDSA---SGMDYWIVKNSWGTGWGENGYFRIRRGTDECAIES 452
2643 >sp|Q26563|CATC_SCHMA CATHEPSIN C PRECURSOR
2644           Length = 454
2646  Score =  113 bits (279), Expect = 7e-25
2647  Identities = 75/242 (30%), Positives = 113/242 (45%), Gaps = 35/242 (14%)
2649 Query: 117 SIPTAFDWRT-----RGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQN--KLVSLSEQN 169
2650            ++P  FDW +     R  VTP++NQG CGSC++  +   +E +  +  N  +   LS Q 
2651 Sbjct: 217 NLPLEFDWTSPPDGSRSPVTPIRNQGICGSCYASPSAAALEARIRLVSNFSEQPILSPQT 276
2653 Query: 170 LVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSA 229
2654            +VDC              EGCNGG          ++ G+  +   PYT E   +C  +  
2655 Sbjct: 277 VVDCS----------PYSEGCNGGFPFLIAGKYGEDFGLPQKIVIPYTGEDTGKCTVSKN 326
2657 Query: 230 NIGAKISNFTMI-----PKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVE-WQFYIGGVFDIPC---- 279
2658                  ++++ I       NE +M   ++S GP  +  +  E +QFY  G++        
2659 Sbjct: 327 CTRYYTTDYSYIGGYYGATNEKLMQLELISNGPFPVGFEVYEDFQFYKEGIYHHTTVQTD 386
2661 Query: 280 ----NPNSL-DHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGV 334
2662                NP  L +H +L+VGY           PYW VKNSWG +WGEQGY  + RG + CGV
2663 Sbjct: 387 HYNFNPFELTNHAVLLVGYGVDKL---SGEPYWKVKNSWGVEWGEQGYFRILRGTDECGV 443
2665 Query: 335 SN 336
2666             +
2667 Sbjct: 444 ES 445
2670 >sp|P25773|CATL_FELCA CATHEPSIN L (PROGESTERONE-DEPENDENT PROTEIN) (PDP)
2671           Length = 139
2673  Score =  113 bits (279), Expect = 7e-25
2674  Identities = 55/141 (39%), Positives = 84/141 (59%), Gaps = 5/141 (3%)
2676 Query: 192 GGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGY 251
2677            GGL  +A+ Y+  NGG+ +E SYPY A+ G  C +   N  A ++++  IP  E  +   
2678 Sbjct: 1   GGLIDDAFQYVKDNGGLDSEESYPYHAQ-GDSCKYRPENSVANVTDYWDIPSKENELMIT 59
2680 Query: 252 IVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVF-DIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWI 308
2681            + + GP++ A DA    ++FY  G++ D  C+   +DHG+L+VGY A  T   +N  YWI
2682 Sbjct: 60  LAAVGPISAAIDASLDTFRFYKEGIYYDPSCSSEDVDHGVLVVGYGADGTE-TENKKYWI 118
2684 Query: 309 VKNSWGADWGEQGYIYLRRGK 329
2685            +KNSWG DWG  GYI + + +
2686 Sbjct: 119 IKNSWGTDWGMDGYIKMAKDR 139
2689 >sp|P25780|EUM1_EURMA MITE GROUP I ALLERGEN EUR M 1 (EUR M I)
2690           Length = 211
2692  Score =  105 bits (260), Expect = 1e-22
2693  Identities = 73/222 (32%), Positives = 102/222 (45%), Gaps = 29/222 (13%)
2695 Query: 117 SIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHE 176
2696            S+P+  D R+   VTP++ QG CGSCW+FS   + E  +   +N  + L+EQ LVDC   
2697 Sbjct: 10  SLPSELDLRSLRTVTPIRMQGGCGSCWAFSGVASTESAYLAYRNMSLDLAEQELVDC--- 66
2699 Query: 177 CMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKIS 236
2700                    A   GC+G   P    YI +NG +Q E  YPY A   +    N+   G K  
2701 Sbjct: 67  --------ASQNGCHGDTIPRGIEYIQQNGVVQ-EHYYPYVAREQSCHRPNAQRYGLK-- 115
2703 Query: 237 NFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAA-----DAVEWQFYIGGVF---DIPCNPNSLDHGI 288
2704            N+  I   ++      ++    A+A      D   ++ Y G      D    PN   H +
2705 Sbjct: 116 NYCQISPPDSNKIRQALTQTHTAVAVIIGIKDLNAFRHYDGRTIMQHDNGYQPNY--HAV 173
2707 Query: 289 LIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKN 330
2708             IVGY   NT   + + YWIV+NSW   WG+ GY Y     N
2709 Sbjct: 174 NIVGYG--NT---QGVDYWIVRNSWDTTWGDNGYGYFAANIN 210
2712 >sp|Q23894|CYS3_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 3 (CYSTEINE PROTEINASE II)
2713           Length = 151
2715  Score = 95.6 bits (234), Expect = 1e-19
2716  Identities = 61/157 (38%), Positives = 86/157 (53%), Gaps = 17/157 (10%)
2718 Query: 41  SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIF 100
2719            +H+E++ R+E FK N+  +   N    +  + T  G+N+ ADLS++E++  YL  +  I 
2720 Sbjct: 1   THKEFMPRYEEFKKNMDYVHNWN----SKGSKTVLGLNQHADLSNEEYRLNYLGTRAHIK 56
2722 Query: 101 TDDLPVADY---LDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFI 157
2723             +     +    L+       P   DWR + AVTPVK+QGQCGSC   STTG+VEG   I
2724 Sbjct: 57  LNGYHKRNLGLRLNRPHFKQ-PLNVDWREKDAVTPVKDQGQCGSC-IISTTGSVEGVTAI 114
2726 Query: 158 SQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGL 194
2727               KLVSLSEQN++               +EGCNGGL
2728 Sbjct: 115 KTGKLVSLSEQNILRL--------SSSFGNEGCNGGL 143
2731 >sp|P43508|CPR4_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 4 PRECURSOR
2732           Length = 335
2734  Score = 94.4 bits (231), Expect = 3e-19
2735  Identities = 82/300 (27%), Positives = 129/300 (42%), Gaps = 60/300 (20%)
2737 Query: 82  DLSSDEFKNYYLNNK-EAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRG----AVTPVKNQ 136
2738            D++ ++ K   +  +  A  T D+ V  +  +E  ++IP  FD RT+     ++  +++Q
2739 Sbjct: 46  DITIEQVKKRLMRTEFVAPHTPDVEVVKHDINE--DTIPATFDARTQWPNCMSINNIRDQ 103
2741 Query: 137 GQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVS--LSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGL 194
2742              CGSCW+F+       +  I+ N  V+  LS ++++ C   C        C  GC GG 
2743 Sbjct: 104 SDCGSCWAFAAAEAASDRFCIASNGAVNTLLSAEDVLSC---CSN------CGYGCEGGY 154
2745 Query: 195 QPNAYNYIIKNGGIQTESSY-------PYT-AETG------------------------- 221
2746              NA+ Y++K+G   T  SY       PY+ A  G                         
2747 Sbjct: 155 PINAWKYLVKSG-FCTGGSYEAQFGCKPYSLAPCGETVGNVTWPSCPDDGYDTPACVNKC 213
2749 Query: 222 TQCNFNSANIGAKISNFTM--IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVE-WQFYIGGVFDIP 278
2750            T  N+N A    K    T   + K  + +   I++ GP+  A    E +  Y  GV+   
2751 Sbjct: 214 TNKNYNVAYTADKHFGSTAYAVGKKVSQIQAEIIAHGPVEAAFTVYEDFYQYKTGVYVHT 273
2753 Query: 279 CNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFV 338
2754                   H I I+G+   N       PYW+V NSW  +WGE GY  + RG N CG+ + V
2755 Sbjct: 274 TGQELGGHAIRILGWGTDN-----GTPYWLVANSWNVNWGENGYFRIIRGTNECGIEHAV 328
2758 >sp|P05993|PAP5_CARPA CYSTEINE PROTEINASE (CLONE PLBPC13)
2759           Length = 96
2761  Score = 90.5 bits (221), Expect = 5e-18
2762  Identities = 43/87 (49%), Positives = 55/87 (62%), Gaps = 2/87 (2%)
2764 Query: 256 GPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKN--TIFRKNMPYWIVKNSW 313
2765            GPLA+A +A   Q YIGGV         L+HG+L+VGY +     I  K  PYW++KNSW
2766 Sbjct: 1   GPLAVAINAAYMQTYIGGVSCPYICSRRLNHGVLLVGYGSAGYAPIRLKEKPYWVIKNSW 60
2768 Query: 314 GADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVST 340
2769            G +WGE GY  + RG+N CGV + VST
2770 Sbjct: 61  GENWGENGYYKICRGRNICGVDSMVST 87
2773 >sp|P25807|CYS1_CAEEL GUT-SPECIFIC CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR
2774           Length = 329
2776  Score = 90.5 bits (221), Expect = 5e-18
2777  Identities = 69/288 (23%), Positives = 118/288 (40%), Gaps = 46/288 (15%)
2779 Query: 82  DLSSDEFKNYYLNNK-EAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGA----VTPVKNQ 136
2780            +++ +E K   ++ K  A  +D++   +   +  + S+P  FD RT+ +    +  +++Q
2781 Sbjct: 50  EITEEEMKFKLMDGKYAAAHSDEIRATE--QEVVLASVPATFDSRTQWSECKSIKLIRDQ 107
2783 Query: 137 GQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVS--LSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGL 194
2784              CGSCW+F     +  +  I         +S  +L+ C   C       +C  GC GG 
2785 Sbjct: 108 ATCGSCWAFGAAEMISDRTCIETKGAQQPIISPDDLLSC---C-----GSSCGNGCEGGY 159
2787 Query: 195 QPNAYNY-----IIKNGGIQTESSYPY--------------TAETGTQCNFNSANIGAKI 235
2788               A  +     ++  G        PY              T      C    +   AK 
2789 Sbjct: 160 PIQALRWWDSKGVVTGGDYHGAGCKPYPIAPCTSGNCPESKTPSCSMSCQSGYSTAYAKD 219
2791 Query: 236 SNFTM----IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVE-WQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILI 290
2792             +F +    +PKN   +   I + GP+  A    E +  Y  GV+          H I I
2793 Sbjct: 220 KHFGVSAYAVPKNAASIQAEIYANGPVEAAFSVYEDFYKYKSGVYKHTAGKYLGGHAIKI 279
2795 Query: 291 VGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFV 338
2796            +G+  ++       PYW+V NSWG +WGE G+  + RG + CG+ + V
2797 Sbjct: 280 IGWGTES-----GSPYWLVANSWGVNWGESGFFKIYRGDDQCGIESAV 322
2800 >sp|P43509|CPR5_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 5 PRECURSOR
2801           Length = 344
2803  Score = 89.3 bits (218), Expect = 1e-17
2804  Identities = 69/272 (25%), Positives = 113/272 (41%), Gaps = 55/272 (20%)
2806 Query: 108 DYLDDEFINSIPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLV 163
2807            D +  E  ++IP  FD    W    ++  +++Q  CGSCW+F+    +  +  I+ N  V
2808 Sbjct: 72  DIVATEVSDAIPDHFDARDQWPNCMSINNIRDQSDCGSCWAFAAAEAISDRTCIASNGAV 131
2810 Query: 164 S--LSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSY------- 214
2811            +  LS ++L+ C        G  +C  GC GG    A+ + +K+G + T  SY       
2812 Sbjct: 132 NTLLSSEDLLSC------CTGMFSCGNGCEGGYPIQAWKWWVKHG-LVTGGSYETQFGCK 184
2814 Query: 215 -------------------PYTAETGTQC--------NFNSANIGAKISNFTM--IPKNE 245
2815                               P   E   +C        N+ +  +  K    T   + K  
2816 Sbjct: 185 PYSIAPCGETVNGVKWPACPEDTEPTPKCVDSCTSKNNYATPYLQDKHFGSTAYAVGKKV 244
2818 Query: 246 TVMAGYIVSTGPLAIAADAVE-WQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNM 304
2819              +   I++ GP+ +A    E +  Y  GV+      +   H + I+G+   N       
2820 Sbjct: 245 EQIQTEILTNGPIEVAFTVYEDFYQYTTGVYVHTAGASLGGHAVKILGWGVDN-----GT 299
2822 Query: 305 PYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSN 336
2823            PYW+V NSW   WGE+GY  + RG N CG+ +
2824 Sbjct: 300 PYWLVANSWNVAWGEKGYFRIIRGLNECGIEH 331
2827 >sp|P00787|CATB_RAT CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1) (RSG-2)
2828           Length = 339
2830  Score = 87.8 bits (214), Expect = 3e-17
2831  Identities = 68/264 (25%), Positives = 114/264 (42%), Gaps = 51/264 (19%)
2833 Query: 117 SIPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSL--SEQNL 170
2834            ++P +FD    W     +  +++QG CGSCW+F     +  +  I  N  V++  S ++L
2835 Sbjct: 79  NLPESFDAREQWSNCPTIAQIRDQGSCGSCWAFGAVEAMSDRICIHTNGRVNVEVSAEDL 138
2837 Query: 171 VDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK----NGGIQTE--------------- 211
2838            + C   C        C +GCNGG    A+N+  +    +GG+                  
2839 Sbjct: 139 LTC---C-----GIQCGDGCNGGYPSGAWNFWTRKGLVSGGVYNSHIGCLPYTIPPCEHH 190
2841 Query: 212 ---SSYPYTAETGT-QCN------FNSANIGAKISNFTM--IPKNETVMAGYIVSTGPLA 259
2842               S  P T E  T +CN      ++++    K   +T   +  +E  +   I   GP+ 
2843 Sbjct: 191 VNGSRPPCTGEGDTPKCNKMCEAGYSTSYKEDKHYGYTSYSVSDSEKEIMAEIYKNGPVE 250
2845 Query: 260 IAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWG 318
2846             A     ++  Y  GV+          H I I+G+  +N +     PYW+V NSW  DWG
2847 Sbjct: 251 GAFTVFSDFLTYKSGVYKHEAGDVMGGHAIRILGWGIENGV-----PYWLVANSWNVDWG 305
2849 Query: 319 EQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
2850            + G+  + RG+N CG+ + +   I
2851 Sbjct: 306 DNGFFKILRGENHCGIESEIVAGI 329
2854 >sp|P07688|CATB_BOVIN CATHEPSIN B PRECURSOR
2855           Length = 335
2857  Score = 87.0 bits (212), Expect = 5e-17
2858  Identities = 67/259 (25%), Positives = 103/259 (38%), Gaps = 55/259 (21%)
2860 Query: 118 IPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSL---SEQNL 170
2861            +P +FD    W     +  +++QG CGSCW+F     +  +  I  N  V++   +E  L
2862 Sbjct: 80  LPESFDAREQWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRICIHSNGRVNVEVSAEDML 139
2864 Query: 171 VDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQ--------------------- 209
2865              C  EC          +GCNGG    A+N+  K G +                      
2866 Sbjct: 140 TCCGGEC---------GDGCNGGFPSGAWNFWTKKGLVSGGLYNSHVGCRPYSIPPCEHH 190
2868 Query: 210 -TESSYPYTAETGT-QCNFNSANIGAKIS---------NFTMIPKNETVMAGYIVSTGPL 258
2869               S  P T E  T +CN  +   G   S         +   +  NE  +   I   GP+
2870 Sbjct: 191 VNGSRPPCTGEGDTPKCN-KTCEPGYSPSYKEDKHFGCSSYSVANNEKEIMAEIYKNGPV 249
2872 Query: 259 AIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADW 317
2873              A     ++  Y  GV+          H I I+G+  +N       PYW+V NSW  DW
2874 Sbjct: 250 EGAFSVYSDFLLYKSGVYQHVSGEIMGGHAIRILGWGVEN-----GTPYWLVGNSWNTDW 304
2876 Query: 318 GEQGYIYLRRGKNTCGVSN 336
2877            G+ G+  + RG++ CG+ +
2878 Sbjct: 305 GDNGFFKILRGQDHCGIES 323
2881 >sp|P07858|CATB_HUMAN CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1) (APP SECRETASE)
2882           Length = 339
2884  Score = 85.8 bits (209), Expect = 1e-16
2885  Identities = 70/285 (24%), Positives = 110/285 (38%), Gaps = 63/285 (22%)
2887 Query: 96  KEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNV 151
2888            +  +FT+DL             +P +FD    W     +  +++QG CGSCW+F     +
2889 Sbjct: 70  QRVMFTEDL------------KLPASFDAREQWPQCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAI 117
2891 Query: 152 EGQHFISQNKLVSL--SEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQ 209
2892              +  I  N  VS+  S ++L+ C   C        C +GCNGG    A+N+  + G + 
2893 Sbjct: 118 SDRICIHTNAHVSVEVSAEDLLTC---C-----GSMCGDGCNGGYPAEAWNFWTRKGLVS 169
2895 Query: 210 ----------------------TESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKIS---------NF 238
2896                                    S  P T E  T         G   +         N 
2897 Sbjct: 170 GGLYESHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCTGEGDTPKCSKICEPGYSPTYKQDKHYGYNS 229
2899 Query: 239 TMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKN 297
2900              +  +E  +   I   GP+  A     ++  Y  GV+          H I I+G+  +N
2901 Sbjct: 230 YSVSNSEKDIMAEIYKNGPVEGAFSVYSDFLLYKSGVYQHVTGEMMGGHAIRILGWGVEN 289
2903 Query: 298 TIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
2904                   PYW+V NSW  DWG+ G+  + RG++ CG+ + V   I
2905 Sbjct: 290 -----GTPYWLVANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEVVAGI 329
2908 >sp|P43157|CYSP_SCHJA CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR (ANTIGEN SJ31)
2909           Length = 342
2911  Score = 84.7 bits (206), Expect = 3e-16
2912  Identities = 66/268 (24%), Positives = 111/268 (40%), Gaps = 59/268 (22%)
2914 Query: 118 IPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQN--KLVSLSEQNLV 171
2915            IP+ FD    W    +++ +++Q +CGSCW+F     +  +  I     +   LS  +L+
2916 Sbjct: 90  IPSQFDSRKKWPHCKSISQIRDQSRCGSCWAFGAVEAMTDRICIQSGGGQSAELSALDLI 149
2918 Query: 172 DCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGI---------------------QT 210
2919             C   C +      C +GC GG    A++Y +K G +                      T
2920 Sbjct: 150 SC---CKD------CGDGCQGGFPGVAWDYWVKRGIVTGGSKENHTGCQPYPFPKCEHHT 200
2922 Query: 211 ESSYP-------------YTAETGTQCNFNS-ANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTG 256
2923            +  YP              T + G +  +    + G +  N   +  NE V+   I+  G
2924 Sbjct: 201 KGKYPACGTKIYKTPQCKQTCQKGYKTPYEQDKHYGDESYN---VQNNEKVIQRDIMMYG 257
2926 Query: 257 PLAIAADAVE-WQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGA 315
2927            P+  A D  E +  Y  G++          H I I+G+  +     K  PYW++ NSW  
2928 Sbjct: 258 PVEAAFDVYEDFLNYKSGIYRHVTGSIVGGHAIRIIGWGVE-----KRTPYWLIANSWNE 312
2930 Query: 316 DWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
2931            DWGE+G   + RG++ C + + V   +I
2932 Sbjct: 313 DWGEKGLFRMVRGRDECSIESDVVAGLI 340
2935 >sp|P25792|CYSP_SCHMA CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR (ANTIGEN SM31)
2936           Length = 340
2938  Score = 84.7 bits (206), Expect = 3e-16
2939  Identities = 66/260 (25%), Positives = 109/260 (41%), Gaps = 53/260 (20%)
2941 Query: 118 IPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQN--KLVSLSEQNLV 171
2942            IP+ FD    W    ++  +++Q +CGSCWSF     +  +  I     + V LS  +L+
2943 Sbjct: 89  IPSNFDSRKKWPGCKSIATIRDQSRCGSCWSFGAVEAMSDRSCIQSGGKQNVELSAVDLL 148
2945 Query: 172 DCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTA---ETGTQCNFNS 228
2946             C   C      E+C  GC GG+   A++Y +K G +   S   +T        +C  ++
2947 Sbjct: 149 TC---C------ESCGLGCEGGILGPAWDYWVKEGIVTASSKENHTGCEPYPFPKCEHHT 199
2949 Query: 229 AN----IGAKISN---------------FTM----------IPKNETVMAGYIVSTGPLA 259
2950                   G+KI N               +T           +  +E  +   I+  GP+ 
2951 Sbjct: 200 KGKYPPCGSKIYNTPRCKQTCQRKYKTPYTQDKHRGKSSYNVKNDEKAIQKEIMKYGPVE 259
2953 Query: 260 IAADAVE-WQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWG 318
2954             +    E +  Y  G++          H I I+G+  +N       PYW++ NSW  DWG
2955 Sbjct: 260 ASFTVYEDFLNYKSGIYKHITGEALGGHAIRIIGWGVEN-----KTPYWLIANSWNEDWG 314
2957 Query: 319 EQGYIYLRRGKNTCGVSNFV 338
2958            E GY  + RG++ C + + V
2959 Sbjct: 315 ENGYFRIVRGRDECSIESEV 334
2962 >sp|P10605|CATB_MOUSE CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1)
2963           Length = 339
2965  Score = 83.9 bits (204), Expect = 5e-16
2966  Identities = 69/265 (26%), Positives = 111/265 (41%), Gaps = 55/265 (20%)
2968 Query: 118 IPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSL--SEQNLV 171
2969            +P  FD    W     +  +++QG CGSCW+F     +  +  I  N  V++  S ++L+
2970 Sbjct: 80  LPETFDAREQWSNCPTIGQIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRTCIHTNGRVNVEVSAEDLL 139
2972 Query: 172 DCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK----NGGIQTE---------------- 211
2973             C   C        C +GCNGG    A+++  K    +GG+                   
2974 Sbjct: 140 TC---C-----GIQCGDGCNGGYPSGAWSFWTKKGLVSGGVYNSHVGCLPYTIPPCEHHV 191
2976 Query: 212 --SSYPYTAETGT-QCNFNSANIGAKIS----------NFTMIPKNETVMAGYIVSTGPL 258
2977              S  P T E  T +CN  S   G   S          ++++    + +MA  I   GP+
2978 Sbjct: 192 NGSRPPCTGEGDTPRCN-KSCEAGYSPSYKEDKHFGYTSYSVSNSVKEIMAE-IYKNGPV 249
2980 Query: 259 AIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADW 317
2981              A     ++  Y  GV+          H I I+G+  +N +     PYW+  NSW  DW
2982 Sbjct: 250 EGAFTVFSDFLTYKSGVYKHEAGDMMGGHAIRILGWGVENGV-----PYWLAANSWNLDW 304
2984 Query: 318 GEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
2985            G+ G+  + RG+N CG+ + +   I
2986 Sbjct: 305 GDNGFFKILRGENHCGIESEIVAGI 329
2989 >sp|P43510|CPR6_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 6 PRECURSOR
2990           Length = 379
2992  Score = 83.5 bits (203), Expect = 6e-16
2993  Identities = 72/265 (27%), Positives = 114/265 (42%), Gaps = 61/265 (23%)
2995 Query: 118 IPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNK--LVSLSEQNLV 171
2996            IP +FD    W    ++  +++Q  CGSCW+F     +  +  I+ +    V+LS  +L+
2997 Sbjct: 105 IPESFDSRDNWPKCDSIKVIRDQSSCGSCWAFGAVEAMSDRICIASHGELQVTLSADDLL 164
2999 Query: 172 DCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQ------CN 225
3000             C   C      ++C  GCNGG    A+ Y +K+G I T S+Y  TA  G +      C 
3001 Sbjct: 165 SC---C------KSCGFGCNGGDPLAAWRYWVKDG-IVTGSNY--TANNGCKPYPFPPCE 212
3003 Query: 226 FNSANIGAK----------------ISNFTMIPKNETVMAGY---------------IVS 254
3004             +S                      +S++T    +E    G                +++
3005 Sbjct: 213 HHSKKTHFDPCPHDLYPTPKCEKKCVSDYTDKTYSEDKFFGASAYGVKDDVEAIQKELMT 272
3007 Query: 255 TGPLAIAADAVE-WQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSW 313
3008             GPL IA +  E +  Y GGV+          H + ++G+   + I     PYW V NSW
3009 Sbjct: 273 HGPLEIAFEVYEDFLNYDGGVYVHTGGKLGGGHAVKLIGWGIDDGI-----PYWTVANSW 327
3011 Query: 314 GADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFV 338
3012              DWGE G+  + RG + CG+ + V
3013 Sbjct: 328 NTDWGEDGFFRILRGVDECGIESGV 352
3016 >sp|P43233|CATB_CHICK CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1)
3017           Length = 340
3019  Score = 83.5 bits (203), Expect = 6e-16
3020  Identities = 69/278 (24%), Positives = 112/278 (39%), Gaps = 56/278 (20%)
3022 Query: 100 FTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQ 159
3023            F +D+ + D  D        T   W     ++ +++QG CGSCW+F     +  +  +  
3024 Sbjct: 74  FAEDMDLPDTFD--------TRKQWPNCPTISEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRICVHT 125
3026 Query: 160 NKLVSL--SEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQ-------- 209
3027            N  VS+  S ++L+ C   C    G E C  GCNGG    A+ Y  + G +         
3028 Sbjct: 126 NAKVSVEVSAEDLLSC---C----GFE-CGMGCNGGYPSGAWRYWTERGLVSGGLYDSHV 177
3030 Query: 210 --------------TESSYPYTAETGT--QCN------FNSANIGAKISNFTM--IPKNE 245
3031                            S  P T E G   +C+      ++ +    K    T   +P++E
3032 Sbjct: 178 GCRAYTIPPCEHHVNGSRPPCTGEGGETPRCSRHCEPGYSPSYKEDKHYGITSYGVPRSE 237
3034 Query: 246 TVMAGYIVSTGPLAIAADAVE-WQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNM 304
3035              +   I   GP+  A    E +  Y  GV+          H I I+G+  +N       
3036 Sbjct: 238 KEIMAEIYKNGPVEGAFIVYEDFLMYKSGVYQHVSGEQVGGHAIRILGWGVEN-----GT 292
3038 Query: 305 PYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
3039            PYW+  NSW  DWG  G+  + RG++ CG+ + +   +
3040 Sbjct: 293 PYWLAANSWNTDWGITGFFKILRGEDHCGIESEIVAGV 330
3043 >sp|P25802|CYS1_OSTOS CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR
3044           Length = 341
3046  Score = 76.1 bits (184), Expect = 1e-13
3047  Identities = 65/270 (24%), Positives = 104/270 (38%), Gaps = 54/270 (20%)
3049 Query: 103 DLPVADYLDDEFINSIPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFIS 158
3050            D  V D   +E  + IP ++D    W    ++  + +Q  CGSCW+ S+   +  +  I+
3051 Sbjct: 76  DEEVEDEELEENNDDIPESYDPRIQWANCSSLFHIPDQANCGSCWAVSSAAAMSDRICIA 135
3053 Query: 159 QN--KLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNY-----IIKNGGIQTE 211
3054                K V +S Q++V C   C        C +GC GG   +A+ +     ++  G   T+
3055 Sbjct: 136 SKGAKQVLISAQDVVSC---CTW------CGDGCEGGWPISAFRFHADEGVVTGGDYNTK 186
3057 Query: 212 SSY-PYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGY------------------- 251
3058             S  PY        + N    G  +            + GY                   
3059 Sbjct: 187 GSCRPYEIHPCGH-HGNETYYGECVGMADTPRCKRRCLLGYPKSYPSDRYYKKAYQLKNS 245
3061 Query: 252 -------IVSTGPLAIAADAVE-WQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKN 303
3062                   I+  GP+       E +  Y  G++       +  H + ++G+  +     K 
3063 Sbjct: 246 VKAIQKDIMKNGPVVATYTVYEDFAHYRSGIYKHKAGRKTGLHAVKVIGWGEE-----KG 300
3065 Query: 304 MPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCG 333
3066             PYWIV NSW  DWGE G+  + RG N CG
3067 Sbjct: 301 TPYWIVANSWHDDWGENGFFRMHRGSNDCG 330
3070 >sp|P25793|CYS2_HAECO CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR
3071           Length = 342
3073  Score = 75.3 bits (182), Expect = 2e-13
3074  Identities = 55/247 (22%), Positives = 102/247 (41%), Gaps = 50/247 (20%)
3076 Query: 133 VKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQN--KLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGC 190
3077            +++Q  CGSCW+ ST   +  +  I+    K V++S  +++ C   C        C +GC
3078 Sbjct: 105 IRDQANCGSCWAVSTAAAISDRICIASKAEKQVNISATDIMTC---C-----RPQCGDGC 156
3080 Query: 191 NGGLQPNAYNYIIKNGGIQ------TESSYPYTAET----GTQCNFNSANIGAKI----- 235
3081             GG    A+ Y I +G +        +   PY        G    +      A       
3082 Sbjct: 157 EGGWPIEAWKYFIYDGVVSGGEYLTKDVCRPYPIHPCGHHGNDTYYGECRGTAPTPPCKR 216
3084 Query: 236 -----------------SNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFD 276
3085                              +  ++ ++   +   I+  GP+ +A+ AV  +++ Y  G++ 
3086 Sbjct: 217 KCRPGVRKMYRIDKRYGKDAYIVKQSVKAIQSEILKNGPV-VASFAVYEDFRHYKSGIYK 275
3088 Query: 277 IPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSN 336
3089                     H + ++G+  +N     N  +W++ NSW  DWGE+GY  + RG N CG+  
3090 Sbjct: 276 HTAGELRGYHAVKMIGWGNEN-----NTDFWLIANSWHNDWGEKGYFRIVRGSNDCGIEG 330
3092 Query: 337 FVSTSII 343
3093             ++  I+
3094 Sbjct: 331 TIAAGIV 337
3097 >sp|P19092|CYS1_HAECO CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR
3098           Length = 342
3100  Score = 74.5 bits (180), Expect = 3e-13
3101  Identities = 55/247 (22%), Positives = 102/247 (41%), Gaps = 50/247 (20%)
3103 Query: 133 VKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQN--KLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGC 190
3104            +++Q  CGSCW+ ST   +  +  I+    K V++S  +++ C   C        C +GC
3105 Sbjct: 105 IRDQANCGSCWAVSTAAAISDRICIASKAEKQVNISATDIMTC---C-----RPQCGDGC 156
3107 Query: 191 NGGLQPNAYNYIIKNGGIQ------TESSYPYTAET----GTQCNFNSANIGAKI----- 235
3108             GG    A+ Y I +G +        +   PY        G    +      A       
3109 Sbjct: 157 EGGWPIEAWKYFIYDGVVSGGEYLTKDVCRPYPIHPCGHHGNDTYYGECRGTAPTPPCKR 216
3111 Query: 236 -----------------SNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFD 276
3112                              +  ++ ++   +   I+  GP+ +A+ AV  +++ Y  G++ 
3113 Sbjct: 217 KCRPGVRKMYRIDKRYGKDAYIVKQSVKAIQSEILRNGPV-VASFAVYEDFRHYKSGIYK 275
3115 Query: 277 IPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSN 336
3116                     H + ++G+  +N     N  +W++ NSW  DWGE+GY  + RG N CG+  
3117 Sbjct: 276 HTAGELRGYHAVKMIGWGNEN-----NTDFWLIANSWHNDWGEKGYFRIIRGTNDCGIEG 330
3119 Query: 337 FVSTSII 343
3120             ++  I+
3121 Sbjct: 331 TIAAGIV 337
3124 >sp|P43507|CPR3_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 3 PRECURSOR
3125           Length = 370
3127  Score = 73.4 bits (177), Expect = 7e-13
3128  Identities = 61/259 (23%), Positives = 101/259 (38%), Gaps = 49/259 (18%)
3130 Query: 118 IPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVS--LSEQNLV 171
3131            +P  FD    W     +  ++NQ  CGSCW+F     +  +  I  N      +S ++++
3132 Sbjct: 92  LPDTFDAREKWPDCNTIKLIRNQATCGSCWAFGAAEVISDRVCIQSNGTQQPVISVEDIL 151
3134 Query: 172 DCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQ---------------------T 210
3135             C   C        C  GC GG    A  +   +G +                       
3136 Sbjct: 152 SC---C-----GTTCGYGCKGGYSIEALRFWASSGAVTGGDYGGHGCMPYSFAPCTKNCP 203
3138 Query: 211 ESSYPYTAETGTQCNFNSA------NIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA 264
3139            ES+ P + +T  Q ++ +       + GA     T   K+ T +   I   GP+  +   
3140 Sbjct: 204 ESTTP-SCKTTCQSSYKTEEYKKDKHYGASAYKVTTT-KSVTEIQTEIYHYGPVEASYKV 261
3142 Query: 265 VE-WQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYI 323
3143             E +  Y  GV+          H + I+G+  +N +      YW++ NSWG  +GE+G+ 
3144 Sbjct: 262 YEDFYHYKSGVYHYTSGKLVGGHAVKIIGWGVENGV-----DYWLIANSWGTSFGEKGFF 316
3146 Query: 324 YLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
3147             +RRG N C +   V   I
3148 Sbjct: 317 KIRRGTNECQIEGNVVAGI 335
3151 >sp|P13823|SERA_PLAFG SERINE-REPEAT ANTIGEN PROTEIN PRECURSOR (P126) (111 KD ANTIGEN)
3152           Length = 989
3154  Score = 70.6 bits (170), Expect = 4e-12
3155  Identities = 61/247 (24%), Positives = 101/247 (40%), Gaps = 50/247 (20%)
3157 Query: 133 VKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGE--EACDEGC 190
3158            V++QG C + W F++  ++E    +   +   +S   + +C      Y+GE  + CDEG 
3159 Sbjct: 579 VEDQGNCDTSWIFASKYHLETIRCMKGYEPTKISALYVANC------YKGEHKDRCDEGS 632
3161 Query: 191 NGGLQPNAYNYIIKNGG-IQTESSYPYT-AETGTQCN----------------------- 225
3162            +    P  +  II++ G +  ES+YPY   + G QC                        
3163 Sbjct: 633 S----PMEFLQIIEDYGFLPAESNYPYNYVKVGEQCPKVEDHWMNLWDNGKILHNKNEPN 688
3165 Query: 226 ---------FNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFD 276
3166                     + S      +  F  I K E +  G +++     I A+ V    + G    
3167 Sbjct: 689 SLDGKGYTAYESERFHDNMDAFVKIIKTEVMNKGSVIAY----IKAENVMGYEFSGKKVQ 744
3169 Query: 277 IPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSN 336
3170              C  ++ DH + IVGY        +   YWIV+NSWG  WG++GY  +     T    N
3171 Sbjct: 745 NLCGDDTADHAVNIVGYGNYVNSEGEKKSYWIVRNSWGPYWGDEGYFKVDMYGPTHCHFN 804
3173 Query: 337 FVSTSII 343
3174            F+ + +I
3175 Sbjct: 805 FIHSVVI 811
3178 >sp|P32956|CC3_CARCN CYSTEINE PROTEINASE III (CC-III)
3179           Length = 43
3181  Score = 63.2 bits (151), Expect = 8e-10
3182  Identities = 25/35 (71%), Positives = 28/35 (79%)
3184 Query: 119 PTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEG 153
3185            P + DWR +GAVTPVKNQG CGSCW+FST   VEG
3186 Sbjct: 2   PESIDWRKKGAVTPVKNQGSCGSCWAFSTIATVEG 36
3189 >sp|P32957|CC4_CARCN CYSTEINE PROTEINASE IV (CC-IV)
3190           Length = 43
3192  Score = 62.1 bits (148), Expect = 2e-09
3193  Identities = 25/35 (71%), Positives = 28/35 (79%)
3195 Query: 119 PTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEG 153
3196            P + DWR +GAVTPVKNQG CGSCW+FST   VEG
3197 Sbjct: 2   PESIDWRKKGAVTPVKNQGSCGSCWAFSTIVTVEG 36
3200 >sp|Q06544|CYS3_OSTOS CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 3
3201           Length = 174
3203  Score = 59.3 bits (141), Expect = 1e-08
3204  Identities = 31/103 (30%), Positives = 49/103 (47%), Gaps = 15/103 (14%)
3206 Query: 241 IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIF 300
3207            I KN  V+AG+IV            ++  Y  G++       +  H + I+G+  +    
3208 Sbjct: 87  IMKNGPVVAGFIVYE----------DFAHYKSGIYKHTAGRMTGGHAVKIIGWGKE---- 132
3210 Query: 301 RKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
3211             K  PYW++ NSW  DWGE+G+  + RG N C +   V   I+
3212 Sbjct: 133 -KGTPYWLIANSWHDDWGEKGFYRMIRGINNCRIEEMVFAGIV 174
3215 >sp|P32954|CC1_CARCN CYSTEINE PROTEINASE I (CC-I)
3216           Length = 43
3218  Score = 58.6 bits (139), Expect = 2e-08
3219  Identities = 23/36 (63%), Positives = 28/36 (76%)
3221 Query: 118 IPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEG 153
3222            I  + DWR +GAVTPV+NQG CGSCW+FS+   VEG
3223 Sbjct: 1   IVASIDWRQKGAVTPVRNQGSCGSCWTFSSVAAVEG 36
3226 >sp|P32955|CC2_CARCN CYSTEINE PROTEINASE II (CC-II)
3227           Length = 43
3229  Score = 58.2 bits (138), Expect = 3e-08
3230  Identities = 23/35 (65%), Positives = 27/35 (76%)
3232 Query: 119 PTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEG 153
3233            P + DWR +GAVTPVK+Q  CGSCW+FST   VEG
3234 Sbjct: 2   PGSVDWRQKGAVTPVKDQNPCGSCWAFSTVATVEG 36
3237 >sp||CATL_CHICK_2 [Segment 2 of 2] CATHEPSIN L
3238           Length = 42
3240  Score = 51.9 bits (122), Expect = 2e-06
3241  Identities = 20/39 (51%), Positives = 28/39 (71%), Gaps = 1/39 (2%)
3243 Query: 306 YWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG-KNTCGVSNFVSTSII 343
3244            YWIVKNSWG  WG++GYIY+ +  KN CG++   S  ++
3245 Sbjct: 4   YWIVKNSWGEKWGDKGYIYMAKDRKNHCGIATAASYPLV 42
3248 >sp|P12399|CT2A_MOUSE CTLA-2-ALPHA PROTEIN PRECURSOR
3249           Length = 136
3251  Score = 41.8 bits (96), Expect = 0.002
3252  Identities = 31/101 (30%), Positives = 50/101 (48%), Gaps = 4/101 (3%)
3254 Query: 9   LAVFTVFVSSRGIPPEEQ--SQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIA 66
3255            L +  + + S   PP+    +++ E++ KF K Y+  E   R  +++ N  KIE  N   
3256 Sbjct: 17  LLILCLGMMSAAPPPDPSLDNEWKEWKTKFAKAYNLNEERHRRLVWEENKKKIEAHNADY 76
3258 Query: 67  INHKADTKFGVNKFADLSSDEFK-NYYLNN-KEAIFTDDLP 105
3259               K     G+N+F+DL+ +EFK N Y N+        DLP
3260 Sbjct: 77  EQGKTSFYMGLNQFSDLTPEEFKTNCYGNSLNRGEMAPDLP 117
3263 >sp|P21381|THPA_THADA THAUMATOPAIN
3264           Length = 35
3266  Score = 40.6 bits (93), Expect = 0.005
3267  Identities = 16/31 (51%), Positives = 22/31 (70%)
3269 Query: 117 SIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFST 147
3270            ++P + DW  +GAV  VKNQ  CGSC +FS+
3271 Sbjct: 1   NLPNSVDWWKKGAVAAVKNQRXCGSCXAFSS 31
3274 >sp|P05689|CATX_BOVIN CATHEPSIN
3275           Length = 73
3277  Score = 40.2 bits (92), Expect = 0.006
3278  Identities = 15/40 (37%), Positives = 24/40 (59%), Gaps = 5/40 (12%)
3280 Query: 284 LDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYI 323
3281            ++H + + G+   +      M YWIV+NSWG  WGE G++
3282 Sbjct: 9   INHIVSVAGWGVSD-----GMEYWIVRNSWGEPWGEHGWM 43
3285 >sp|P12400|CT2B_MOUSE CTLA-2-BETA PROTEIN PRECURSOR
3286           Length = 141
3288  Score = 38.7 bits (88), Expect = 0.018
3289  Identities = 25/85 (29%), Positives = 45/85 (52%), Gaps = 1/85 (1%)
3291 Query: 6   LFVLAVFTVFVSSRGIP-PEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNL 64
3292            +F+L +    +S+   P P   +++ E++  F K YS +E   R  +++ N  KIE  N 
3293 Sbjct: 20  VFLLILCLGMMSAAPSPDPSLDNEWKEWKTTFAKAYSLDEERHRRLMWEENKKKIEAHNA 79
3295 Query: 65  IAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFK 89
3296                 K     G+N+F+DL+ +EF+
3297 Sbjct: 80  DYERGKTSFYMGLNQFSDLTPEEFR 104
3300 >sp|P20736|BM86_BOOMI GLYCOPROTEIN ANTIGEN BM86 PRECURSOR (PROTECTIVE ANTIGEN)
3301           Length = 650
3303  Score = 35.2 bits (79), Expect = 0.21
3304  Identities = 24/81 (29%), Positives = 36/81 (43%), Gaps = 5/81 (6%)
3306 Query: 147 TTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDC----DHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYI 202
3307            TT N +        KL  + + +  +C    DHEC     +++C E  NG  Q +    +
3308 Sbjct: 533 TTCNPKEIQECQDKKLECVYKNHKAECECPDDHECYREPAKDSCSEEDNGKCQSSGQRCV 592
3310 Query: 203 IKNG-GIQTESSYPYTAETGT 222
3311            I+NG  +  E S   TA T T
3312 Sbjct: 593 IENGKAVCKEKSEATTAATTT 613
3315 >sp|Q11121|PLB1_TORDE LYSOPHOSPHOLIPASE PRECURSOR (PHOSPHOLIPASE B)
3316           Length = 649
3318  Score = 34.8 bits (78), Expect = 0.27
3319  Identities = 31/144 (21%), Positives = 56/144 (38%), Gaps = 13/144 (9%)
3321 Query: 109 YLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQ 168
3322            Y DDE +  I   F+  TRG +T   +   C +C              + + K  SL+  
3323 Sbjct: 519 YTDDERLKMIKNGFEAATRGNLTDDSSFMGCVAC-------------AVMRRKQQSLNAT 565
3325 Query: 169 NLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNS 228
3326               +C      Y      D+    GL  + ++    +      ++  Y++ + T    N 
3327 Sbjct: 566 LPEECSTCFTNYCWNGTIDDTPVSGLDNSDFDPTAASSAYSAYNTESYSSSSATGSKKNG 625
3329 Query: 229 ANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYI 252
3330            A + A  ++FT I    T +AG++
3331 Sbjct: 626 AGLPATPTSFTSILTLLTAIAGFL 649
3334 >sp|P46992|YJR1_YEAST HYPOTHETICAL 43.0 KD PROTEIN IN CPS1-FPP1 INTERGENIC REGION
3335           Length = 396
3337  Score = 33.6 bits (75), Expect = 0.61
3338  Identities = 40/191 (20%), Positives = 76/191 (38%), Gaps = 43/191 (22%)
3340 Query: 77  VNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEF------------------INSI 118
3341            VNKF D++++E     + ++      + P+ADYL   F                  +N+ 
3342 Sbjct: 42  VNKFKDITNNESCTCEVGDRVWFSGKNAPLADYLSVHFRGPLKLKQFAFYTSPGFTVNNS 101
3344 Query: 119 PTAFDW----------RTRGAVTPVKNQGQCGSCW-------SFSTTGNVEGQHFISQNK 161
3345             ++ DW          +T   VT + + G+   C        S + TG+      ++   
3346 Sbjct: 102 RSSSDWNRLAYYESSSKTADNVTFLNHGGEASPCLGNALSYASSNGTGSASEATVLADGT 161
3348 Query: 162 LVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETG 221
3349            L+S  ++ ++  +  C +   ++ C    +G   P  Y Y    GG  T   + +  E  
3350 Sbjct: 162 LISSDQEYIIYSNVSCPKSGYDKGCGVYRSG--IPAYYGY----GG--TTKMFLFEFEMP 213
3352 Query: 222 TQCNFNSANIG 232
3353            T+   NS++IG
3354 Sbjct: 214 TETEKNSSSIG 224
3357 >sp|P28493|PR5_ARATH PATHOGENESIS-RELATED PROTEIN 5 PRECURSOR (PR-5)
3358           Length = 239
3360  Score = 32.1 bits (71), Expect = 1.8
3361  Identities = 24/93 (25%), Positives = 36/93 (37%), Gaps = 7/93 (7%)
3363 Query: 133 VKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNG 192
3364            ++  G  G C      G V   +    + L  + + N+V C   C  +  ++ C  G N 
3365 Sbjct: 137 IRPSGGSGDC---KYAGCVSDLNAACPDMLKVMDQNNVVACKSACERFNTDQYCCRGAND 193
3367 Query: 193 GLQ---PNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGT 222
3368              +   P  Y+ I KN       SY Y  ET T
3369 Sbjct: 194 KPETCPPTDYSRIFKN-ACPDAYSYAYDDETST 225
3372 >sp|P41901|SPR3_YEAST SPORULATION-SPECIFIC SEPTIN
3373           Length = 512
3375  Score = 31.7 bits (70), Expect = 2.4
3376  Identities = 18/63 (28%), Positives = 30/63 (47%), Gaps = 9/63 (14%)
3378 Query: 60  EELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP 119
3379            + +NLI +  K+D          L+ +E KN+    +E I   D+PV  +  DE +N+  
3380 Sbjct: 237 KRVNLIPVIAKSDL---------LTKEELKNFKTQVREIIRVQDIPVCFFFGDEVLNATQ 287
3382 Query: 120 TAF 122
3383              F
3384 Sbjct: 288 DIF 290
3387 >sp|P54634|POLN_LORDV NON-STRUCTURAL POLYPROTEIN [CONTAINS: RNA-DIRECTED RNA POLYMERASE ;
3388            THIOL PROTEASE 3C ; HELICASE (2C LIKE PROTEIN)]
3389           Length = 1699
3391  Score = 31.3 bits (69), Expect = 3.1
3392  Identities = 13/31 (41%), Positives = 21/31 (66%)
3394 Query: 17  SSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLE 47
3395            SS+G+  EE  ++   +++ N KYS EEYL+
3396 Sbjct: 893 SSKGLSDEEYDEYKRIREERNGKYSIEEYLQ 923
3399 >sp|P21173|DNAA_MICLU CHROMOSOMAL REPLICATION INITIATOR PROTEIN DNAA
3400           Length = 515
3402  Score = 31.3 bits (69), Expect = 3.1
3403  Identities = 25/104 (24%), Positives = 46/104 (44%), Gaps = 13/104 (12%)
3405 Query: 31  EFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKN 90
3406            EF + F     H+E     +++++    ++ L +  I   AD +  V +F       F  
3407 Sbjct: 247 EFTNDFINSIRHDEGASFKQVYRN----VDILLIDDIQFLADKEATVEEFFHT----FNT 298
3409 Query: 91  YYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVK 134
3410             Y NNK+ + T DLP        F + + + F+W   G +T ++
3411 Sbjct: 299 LYNNNKQVVITSDLPPKQL--SGFEDRLRSRFEW---GLITDIQ 337
3414 >sp|P89263|Y022_GVXN HYPOTHETICAL ORF22 HOMOLOG
3415           Length = 166
3417  Score = 30.5 bits (67), Expect = 5.3
3418  Identities = 27/107 (25%), Positives = 43/107 (39%), Gaps = 9/107 (8%)
3420 Query: 144 SFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYII 203
3421            SF T     G H  SQ   V +S Q+LV        Y+    CD+          Y+ ++
3422 Sbjct: 66  SFDTLEGPGGGHCFSQP--VRVSRQDLVT-------YDCASLCDDVRAAYFYVGPYDRLV 116
3424 Query: 204 KNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAG 250
3425             +G    E  Y  T      CN  ++ +   I+++T I ++    AG
3426 Sbjct: 117 VDGNELQEGGYCTTNSVPRNCNRETSILLHSINHWTCIAEDPRYYAG 163
3429 >sp|P24896|NU5M_CAEEL NADH-UBIQUINONE OXIDOREDUCTASE CHAIN 5
3430           Length = 527
3432  Score = 30.5 bits (67), Expect = 5.3
3433  Identities = 21/52 (40%), Positives = 26/52 (49%), Gaps = 7/52 (13%)
3435 Query: 44  EYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNN 95
3436            +YL +  I+K    K  +L L  IN K  T F       LSS  FKNYYL +
3437 Sbjct: 466 DYLAKNSIYKMKNLKFMDLFLNNINSKGYTLF-------LSSGMFKNYYLKS 510
3440 >sp|P25648|SRB8_YEAST SUPPRESSOR OF RNA POLYMERASE B SRB8
3441           Length = 1427
3443  Score = 30.1 bits (66), Expect = 7.0
3444  Identities = 22/89 (24%), Positives = 44/89 (48%), Gaps = 10/89 (11%)
3446 Query: 21   IPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGV--- 77
3447             +PP + S F++     +  Y  EE  ++ E F  NLG    + ++ I H+ + K+ +   
3448 Sbjct: 1314 LPPFQVSSFVKETKLHSGDYGEEEDADQEESFSLNLG----IGIVEIAHENEQKWLIYDK 1369
3450 Query: 78   --NKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDL 104
3451               +K+    S E   ++++N    +TDD+
3452 Sbjct: 1370 KDHKYVCTFSME-PYHFISNYNTKYTDDM 1397
3455 >sp|Q04723|PEPC_LACLC AMINOPEPTIDASE C
3456           Length = 436
3458  Score = 30.1 bits (66), Expect = 7.0
3459  Identities = 11/20 (55%), Positives = 14/20 (70%)
3461 Query: 303 NMPYWIVKNSWGADWGEQGY 322
3462            N   W V+NSWG D G++GY
3463 Sbjct: 370 NSTKWKVENSWGKDAGQKGY 389
3466 >sp|Q13867|BLMH_HUMAN BLEOMYCIN HYDROLASE (BLM HYDROLASE) (BMH)
3467           Length = 455
3469  Score = 29.7 bits (65), Expect = 9.1
3470  Identities = 10/17 (58%), Positives = 13/17 (75%)
3472 Query: 307 WIVKNSWGADWGEQGYI 323
3473            W V+NSWG D G +GY+
3474 Sbjct: 392 WRVENSWGEDHGHKGYL 408
3477 >sp|P87362|BLMH_CHICK BLEOMYCIN HYDROLASE (BLM HYDROLASE) (BMH) (AMINOPEPTIDASE H)
3478           Length = 455
3480  Score = 29.7 bits (65), Expect = 9.1
3481  Identities = 10/19 (52%), Positives = 14/19 (73%)
3483 Query: 307 WIVKNSWGADWGEQGYIYL 325
3484            W V+NSWG D G +GY+ +
3485 Sbjct: 392 WRVENSWGEDRGNKGYLIM 410
3488 >sp|P70645|BLMH_RAT BLEOMYCIN HYDROLASE (BLM HYDROLASE) (BMH)
3489           Length = 454
3491  Score = 29.7 bits (65), Expect = 9.1
3492  Identities = 10/17 (58%), Positives = 13/17 (75%)
3494 Query: 307 WIVKNSWGADWGEQGYI 323
3495            W V+NSWG D G +GY+
3496 Sbjct: 392 WRVENSWGEDHGHKGYL 408
3499 Searching..................................................done
3502 Results from round 2
3505                                                                    Score     E
3506 Sequences producing significant alignments:                        (bits)  Value
3507 Sequences used in model and found again:
3509 sp|P04988|CYS1_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR                  527  e-149
3510 sp|P25975|CATL_BOVIN CATHEPSIN L PRECURSOR                            440  e-123
3511 sp|P07154|CATL_RAT CATHEPSIN L PRECURSOR (MAJOR EXCRETED PROTEIN...   431  e-121
3512 sp|P06797|CATL_MOUSE CATHEPSIN L PRECURSOR (MAJOR EXCRETED PROTE...   431  e-120
3513 sp|Q28944|CATL_PIG CATHEPSIN L PRECURSOR                              430  e-120
3514 sp|P07711|CATL_HUMAN CATHEPSIN L PRECURSOR (MAJOR EXCRETED PROTE...   421  e-118
3515 sp|O60911|CATM_HUMAN CATHEPSIN L2 PRECURSOR (CATHEPSIN V)             417  e-116
3516 sp|P43296|RD19_ARATH CYSTEINE PROTEINASE RD19A PRECURSOR              412  e-115
3517 sp|P25776|ORYA_ORYSA ORYZAIN ALPHA CHAIN PRECURSOR                    407  e-113
3518 sp|P25782|CYS2_HOMAM DIGESTIVE CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR        403  e-112
3519 sp|P43295|A494_ARATH PROBABLE CYSTEINE PROTEINASE A494 PRECURSOR      402  e-112
3520 sp|P43235|CATK_HUMAN CATHEPSIN K PRECURSOR (CATHEPSIN O) (CATHEP...   401  e-111
3521 sp|P25804|CYSP_PEA CYSTEINE PROTEINASE 15A PRECURSOR (TURGOR-RES...   399  e-111
3522 sp|P04989|CYS2_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR (PRESTALK C...   398  e-111
3523 sp|P43236|CATK_RABIT CATHEPSIN K PRECURSOR (OC-2 PROTEIN)             395  e-110
3524 sp|P54640|CYS5_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 5 PRECURSOR                  394  e-109
3525 sp|P13277|CYS1_HOMAM DIGESTIVE CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR        393  e-109
3526 sp|P25784|CYS3_HOMAM DIGESTIVE CYSTEINE PROTEINASE 3 PRECURSOR        392  e-109
3527 sp|P25774|CATS_HUMAN CATHEPSIN S PRECURSOR                            392  e-109
3528 sp|P15242|TES1_RAT TESTIN 1/2 PRECURSOR (CMB-22/CMB-23)               391  e-109
3529 sp|Q10716|CYS1_MAIZE CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR                  391  e-108
3530 sp|P12412|CYSP_VIGMU VIGNAIN PRECURSOR (BEAN ENDOPEPTIDASE) (CYS...   389  e-108
3531 sp|P43297|RD21_ARATH CYSTEINE PROTEINASE RD21A PRECURSOR              387  e-107
3532 sp|P55097|CATK_MOUSE CATHEPSIN K PRECURSOR                            384  e-106
3533 sp|P09668|CATH_HUMAN CATHEPSIN H PRECURSOR                            383  e-106
3534 sp|O46427|CATH_PIG CATHEPSIN H PRECURSOR                              382  e-106
3535 sp|P25803|CYSP_PHAVU VIGNAIN PRECURSOR (BEAN ENDOPEPTIDASE) (CYS...   380  e-105
3536 sp|P00786|CATH_RAT CATHEPSIN H PRECURSOR (CATHEPSIN B3) (CATHEPS...   377  e-104
3537 sp|P25251|CYS4_BRANA CYSTEINE PROTEINASE COT44 PRECURSOR              376  e-104
3538 sp|P05167|ALEU_HORVU THIOL PROTEASE ALEURAIN PRECURSOR                375  e-104
3539 sp|Q10717|CYS2_MAIZE CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR                  374  e-103
3540 sp|P25777|ORYB_ORYSA ORYZAIN BETA CHAIN PRECURSOR                     374  e-103
3541 sp|Q40143|CYS3_LYCES CYSTEINE PROTEINASE 3 PRECURSOR                  373  e-103
3542 sp|P43156|CYSP_HEMSP THIOL PROTEASE SEN102 PRECURSOR                  373  e-103
3543 sp|P49935|CATH_MOUSE CATHEPSIN H PRECURSOR (CATHEPSIN B3) (CATHE...   372  e-103
3544 sp|P25778|ORYC_ORYSA ORYZAIN GAMMA CHAIN PRECURSOR                    370  e-102
3545 sp|P00785|ACTN_ACTCH ACTINIDAIN PRECURSOR (ACTINIDIN)                 368  e-102
3546 sp|P41721|CATV_NPVBM VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)                         367  e-101
3547 sp|Q02765|CATS_RAT CATHEPSIN S PRECURSOR                              365  e-100
3548 sp|P14658|CYSP_TRYBB CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR                    365  e-100
3549 sp|P25783|CATV_NPVAC VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)                         363  e-100
3550 sp|P41715|CATV_NPVCF VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)                         363  e-100
3551 sp|P25250|CYS2_HORVU CYSTEINE PROTEINASE EP-B 2 PRECURSOR             361  e-100
3552 sp|P25249|CYS1_HORVU CYSTEINE PROTEINASE EP-B 1 PRECURSOR             361  1e-99
3553 sp|Q26534|CATL_SCHMA CATHEPSIN L PRECURSOR (SMCL1)                    361  2e-99
3554 sp|P25779|CYSP_TRYCR CRUZIPAIN PRECURSOR (MAJOR CYSTEINE PROTEIN...   356  4e-98
3555 sp|O10364|CATV_NPVOP VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)                         351  2e-96
3556 sp|P36400|LCPB_LEIME CYSTEINE PROTEINASE B PRECURSOR                  348  1e-95
3557 sp|P25775|LCPA_LEIME CYSTEINE PROTEINASE A PRECURSOR                  348  1e-95
3558 sp|Q05094|CYS2_LEIPI CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR (AMASTIGOTE...   347  2e-95
3559 sp|P35591|CYS1_LEIPI CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR (AMASTIGOTE...   347  3e-95
3560 sp|P05994|PAP4_CARPA PAPAYA PROTEINASE IV PRECURSOR (PPIV) (PAPA...   346  3e-95
3561 sp|P10056|PAP3_CARPA CARICAIN PRECURSOR (PAPAYA PROTEINASE OMEGA...   341  1e-93
3562 sp|P14080|PAP2_CARPA CHYMOPAPAIN PRECURSOR (PAPAYA PROTEINASE II...   339  6e-93
3563 sp|P00784|PAPA_CARPA PAPAIN PRECURSOR (PAPAYA PROTEINASE I) (PPI)     334  1e-91
3564 sp|P22895|P34_SOYBN P34 PROBABLE THIOL PROTEASE PRECURSOR             331  1e-90
3565 sp|O17473|CATL_BRUPA CATHEPSIN L-LIKE PRECURSOR                       327  2e-89
3566 sp|Q10991|CATL_SHEEP CATHEPSIN L                                      325  1e-88
3567 sp|P54639|CYS4_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 4 PRECURSOR                  323  4e-88
3568 sp|P56203|CATW_MOUSE CATHEPSIN W PRECURSOR (LYMPHOPAIN)               319  4e-87
3569 sp|P56202|CATW_HUMAN CATHEPSIN W PRECURSOR (LYMPHOPAIN)               318  9e-87
3570 sp|Q01958|CPP2_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR                  318  9e-87
3571 sp|P36185|ACP2_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE ACP2 PRECURSOR               315  8e-86
3572 sp|Q06964|CPP3_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE 3 PRECURSOR (CYSTEINE P...   312  9e-85
3573 sp|P36184|ACP1_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE ACP1 PRECURSOR               309  5e-84
3574 sp|P25326|CATS_BOVIN CATHEPSIN S                                      307  2e-83
3575 sp|Q01957|CPP1_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR                  301  1e-81
3576 sp|P25805|CYSP_PLAFA THROPHOZOITE CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR ...   299  5e-81
3577 sp|P20721|CYSL_LYCES LOW-TEMPERATURE-INDUCED CYSTEINE PROTEINASE...   298  9e-81
3578 sp|P43234|CATO_HUMAN CATHEPSIN O PRECURSOR                            296  5e-80
3579 sp|P46102|CYSP_PLAVN CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR                    291  1e-78
3580 sp|P42666|CYSP_PLAVI CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR                    278  1e-74
3581 sp|P16311|MMAL_DERFA MAJOR MITE FECAL ALLERGEN DER F 1 PRECURSOR...   272  8e-73
3582 sp|P80884|ANAN_ANACO ANANAIN                                          271  1e-72
3583 sp||CATL_CHICK_1 [Segment 1 of 2] CATHEPSIN L                         264  1e-70
3584 sp|P97821|CATC_MOUSE DIPEPTIDYL-PEPTIDASE I PRECURSOR (DPP-I) (D...   262  9e-70
3585 sp|P25781|CYSP_THEAN CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR                    259  6e-69
3586 sp|P08176|MMAL_DERPT MAJOR MITE FECAL ALLERGEN DER P 1 PRECURSOR...   255  1e-67
3587 sp|P14518|BROM_ANACO BROMELAIN, STEM                                  253  4e-67
3588 sp|P53634|CATC_HUMAN DIPEPTIDYL-PEPTIDASE I PRECURSOR (DPP-I) (D...   251  2e-66
3589 sp|P80067|CATC_RAT DIPEPTIDYL-PEPTIDASE I PRECURSOR (DPP-I) (DPP...   250  4e-66
3590 sp|P22497|CYSP_THEPA CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR                    243  5e-64
3591 sp|P07858|CATB_HUMAN CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1) (APP S...   238  1e-62
3592 sp|P00787|CATB_RAT CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1) (RSG-2)       236  4e-62
3593 sp|P10605|CATB_MOUSE CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1)             233  4e-61
3594 sp|P43509|CPR5_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 5 PREC...   232  8e-61
3595 sp|P07688|CATB_BOVIN CATHEPSIN B PRECURSOR                            232  8e-61
3596 sp|P43233|CATB_CHICK CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1)             232  1e-60
3597 sp|Q26563|CATC_SCHMA CATHEPSIN C PRECURSOR                            231  1e-60
3598 sp|P25807|CYS1_CAEEL GUT-SPECIFIC CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR       231  1e-60
3599 sp|P43508|CPR4_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 4 PREC...   231  2e-60
3600 sp|P43510|CPR6_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 6 PREC...   225  8e-59
3601 sp|P43157|CYSP_SCHJA CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE PRECUR...   222  1e-57
3602 sp|P25792|CYSP_SCHMA CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE PRECUR...   216  5e-56
3603 sp|P25802|CYS1_OSTOS CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 1 PREC...   213  4e-55
3604 sp|P25793|CYS2_HAECO CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 2 PREC...   212  1e-54
3605 sp|P19092|CYS1_HAECO CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 1 PREC...   208  2e-53
3606 sp|P43507|CPR3_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 3 PREC...   204  3e-52
3607 sp|P25780|EUM1_EURMA MITE GROUP I ALLERGEN EUR M 1 (EUR M I)          201  1e-51
3608 sp|P25773|CATL_FELCA CATHEPSIN L (PROGESTERONE-DEPENDENT PROTEIN...   185  2e-46
3609 sp|Q23894|CYS3_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 3 (CYSTEINE PROTEINASE II)   158  2e-38
3610 sp|P13823|SERA_PLAFG SERINE-REPEAT ANTIGEN PROTEIN PRECURSOR (P1...   157  3e-38
3611 sp|Q06544|CYS3_OSTOS CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 3           139  6e-33
3612 sp|P05993|PAP5_CARPA CYSTEINE PROTEINASE (CLONE PLBPC13)              131  2e-30
3613 sp|P32957|CC4_CARCN CYSTEINE PROTEINASE IV (CC-IV)                     85  3e-16
3614 sp|P32956|CC3_CARCN CYSTEINE PROTEINASE III (CC-III)                   84  4e-16
3615 sp|P32955|CC2_CARCN CYSTEINE PROTEINASE II (CC-II)                     81  2e-15
3616 sp||CATL_CHICK_2 [Segment 2 of 2] CATHEPSIN L                          77  5e-14
3617 sp|P32954|CC1_CARCN CYSTEINE PROTEINASE I (CC-I)                       76  1e-13
3619 Sequences not found previously or not previously below threshold:
3621 sp|P12399|CT2A_MOUSE CTLA-2-ALPHA PROTEIN PRECURSOR                    98  2e-20
3622 sp|P12400|CT2B_MOUSE CTLA-2-BETA PROTEIN PRECURSOR                     96  1e-19
3623 sp|P05689|CATX_BOVIN CATHEPSIN                                         60  9e-09
3624 sp|P94869|PEPG_LACDL AMINOPEPTIDASE G                                  46  1e-04
3625 sp|P94870|PEPE_LACHE AMINOPEPTIDASE E                                  43  0.001
3626 sp|P94868|PEPW_LACDL AMINOPEPTIDASE W                                  42  0.002
3627 sp|Q10744|PEPC_LACHE AMINOPEPTIDASE C                                  41  0.003
3628 sp|Q04723|PEPC_LACLC AMINOPEPTIDASE C                                  40  0.009
3629 sp|Q48543|PEPC_LACDL AMINOPEPTIDASE C                                  38  0.025
3630 sp|P21381|THPA_THADA THAUMATOPAIN                                      38  0.025
3631 sp|Q56115|PEPC_STRTR AMINOPEPTIDASE C                                  36  0.13
3632 sp|P09983|HLY1_ECOLI HEMOLYSIN, CHROMOSOMAL                            36  0.17
3633 sp|P33403|CYSP_TRIFO CYSTEINE PROTEINASE                               35  0.28
3634 sp|P08715|HLYA_ECOLI HEMOLYSIN, PLASMID                                35  0.28
3635 sp|P87362|BLMH_CHICK BLEOMYCIN HYDROLASE (BLM HYDROLASE) (BMH) (...    34  0.37
3636 sp|P54704|PSPB_DICDI PRESPORE PROTEIN B PRECURSOR                      34  0.37
3637 sp|Q13867|BLMH_HUMAN BLEOMYCIN HYDROLASE (BLM HYDROLASE) (BMH)         34  0.49
3638 sp|P70645|BLMH_RAT BLEOMYCIN HYDROLASE (BLM HYDROLASE) (BMH)           34  0.49
3639 sp|P80532|CAT3_FASHE PUTATIVE CATHEPSIN L3 (NEWLY EXCYSTED JUVEN...    34  0.49
3640 sp|P16462|LKTA_ACTAC LEUKOTOXIN                                        34  0.49
3641 sp|P13438|TSP_MOUSE TROPHOBLAST-SPECIFIC PROTEIN PRECURSOR             32  1.4
3642 sp|Q00951|HLYA_ACTSU HEMOLYSIN (CYTOLYSIN II) (CLY-IIA) (HLY-IIA...    32  1.4
3643 sp|P15377|RT2A_ACTPL RTX-II TOXIN DETERMINANT A (APX-IIA) (HEMOL...    32  1.4
3644 sp|P52181|TGLC_PAGMA PROTEIN-GLUTAMINE GAMMA-GLUTAMYLTRANSFERASE...    32  1.9
3645 sp|P35681|TCTP_ORYSA TRANSLATIONALLY CONTROLLED TUMOR PROTEIN HO...    32  1.9
3646 sp|Q01532|BLH1_YEAST CYSTEINE PROTEINASE 1 (Y3) (BLEOMYCIN HYDRO...    32  2.5
3647 sp|P16312|MMAL_DERMI MAJOR MITE FECAL ALLERGEN DER M 1 (DER M I)       31  3.2
3648 sp|O03992|TCTP_FRAAN TRANSLATIONALLY CONTROLLED TUMOR PROTEIN HO...    31  4.2
3649 sp|Q04489|YMJ6_YEAST HYPOTHETICAL 59.5 KD PROTEIN IN VPS9-RAD10 ...    31  4.2
3650 sp|Q03164|HRX_HUMAN ZINC FINGER PROTEIN HRX (ALL-1) (TRITHORAX-L...    31  4.2
3651 sp||CATB_COTJA_1 [Segment 1 of 2] CATHEPSIN B (CATHEPSIN B1)           30  5.6
3652 sp|Q62703|RCN2_RAT RETICULOCALBIN 2 PRECURSOR (CALCIUM-BINDING P...    30  5.6
3653 sp|P48651|PSS1_HUMAN PHOSPHATIDYLSERINE SYNTHASE I (SERINE-EXCHA...    30  5.6
3654 sp|P33404|CYSP_TRIVA CYSTEINE PROTEINASE                               30  5.6
3655 sp|Q00576|PSS1_CRILO PHOSPHATIDYLSERINE SYNTHASE I (SERINE-EXCHA...    30  5.6
3656 sp|Q9ZRX0|TCTP_PSEMZ TRANSLATIONALLY CONTROLLED TUMOR PROTEIN HO...    30  7.3
3657 sp|Q94480|V136_DICDI VEG136 PROTEIN                                    30  7.3
3658 sp|P55131|RT32_ACTPL RTX-III TOXIN DETERMINANT A FROM SEROTYPE 8...    30  7.3
3659 sp|P55130|RT31_ACTPL RTX-III TOXIN DETERMINANT A FROM SEROTYPE 2...    30  7.3
3660 sp|P40101|YE16_YEAST HYPOTHETICAL 35.9 KD PROTEIN IN ISC10 3'REGION    30  7.3
3661 sp|P13388|XMRK_XIPMA MELANOMA RECEPTOR PROTEIN-TYROSINE KINASE P...    30  7.3
3662 sp|Q9ZL75|MOAA_HELPJ MOLYBDENUM COFACTOR BIOSYNTHESIS PROTEIN A        30  9.5
3663 sp|P55129|RT12_ACTPL RTX-I TOXIN DETERMINANT A FROM SEROTYPES 5/...    30  9.5
3664 sp|P55128|RT11_ACTPL RTX-I TOXIN DETERMINANT A FROM SEROTYPES 1/...    30  9.5
3665 sp|P35669|GSHB_SCHPO GLUTATHIONE SYNTHETASE LARGE CHAIN (GLUTATH...    30  9.5
3666 sp|P11140|ABRA_ABRPR ABRIN-A PRECURSOR (RRNA N-GLYCOSIDASE)            30  9.5
3667 sp|Q00690|LEM2_MOUSE E-SELECTIN PRECURSOR (ENDOTHELIAL LEUKOCYTE...    30  9.5
3668 sp|P06620|ICEN_PSESY ICE NUCLEATION PROTEIN                            30  9.5
3670 >sp|P04988|CYS1_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR
3671           Length = 343
3673  Score =  527 bits (1343), Expect = e-149
3674  Identities = 343/343 (100%), Positives = 343/343 (100%)
3676 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIE 60
3677            MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIE
3678 Sbjct: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIE 60
3680 Query: 61  ELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPT 120
3681            ELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPT
3682 Sbjct: 61  ELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPT 120
3684 Query: 121 AFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEY 180
3685            AFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEY
3686 Sbjct: 121 AFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEY 180
3688 Query: 181 EGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTM 240
3689            EGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTM
3690 Sbjct: 181 EGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTM 240
3692 Query: 241 IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIF 300
3693            IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIF
3694 Sbjct: 241 IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIF 300
3696 Query: 301 RKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
3697            RKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII
3698 Sbjct: 301 RKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
3701 >sp|P25975|CATL_BOVIN CATHEPSIN L PRECURSOR
3702           Length = 334
3704  Score =  440 bits (1119), Expect = e-123
3705  Identities = 120/343 (34%), Positives = 176/343 (50%), Gaps = 19/343 (5%)
3707 Query: 7   FVLAVFTVFVSSRG--IPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNL 64
3708            F L V  + V+S    + P   + + +++    + Y   E   R  +++ N   I+  N 
3709 Sbjct: 5   FFLTVLCLGVASAAPKLDPNLDAHWHQWKATHRRLYGMNEEEWRRAVWEKNKKIIDLHNQ 64
3711 Query: 65  IAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDW 124
3712                 K   +  +N F D++++EF+                      +  +  +P + DW
3713 Sbjct: 65  EYSEGKHAFRMAMNAFGDMTNEEFRQVMNG----FQNQKHKKGKLFHEPLLVDVPKSVDW 120
3715 Query: 125 RTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEE 184
3716              +G VTPVKNQGQCGSCW+FS TG +EGQ F    KLVSLSEQNLVDC           
3717 Sbjct: 121 TKKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSATGALEGQMFRKTGKLVSLSEQNLVDCSRA-------- 172
3719 Query: 185 ACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKN 244
3720              ++GCNGGL  NA+ YI  NGG+ +E SYPY A     CN+      A  + F  IP+ 
3721 Sbjct: 173 QGNQGCNGGLMDNAFQYIKDNGGLDSEESYPYLATDTNSCNYKPECSAANDTGFVDIPQR 232
3723 Query: 245 ETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGV-FDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFR 301
3724            E  +   + + GP+++A DA    +QFY  G+ +D  C+   LDHG+L+VGY  + T   
3725 Sbjct: 233 EKALMKAVATVGPISVAIDAGHTSFQFYKSGIYYDPDCSCKDLDHGVLVVGYGFEGTDSN 292
3727 Query: 302 KNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG-KNTCGVSNFVSTSII 343
3728             N  +WIVKNSWG +WG  GY+ + +   N CG++   S   +
3729 Sbjct: 293 NNK-FWIVKNSWGPEWGWNGYVKMAKDQNNHCGIATAASYPTV 334
3732 >sp|P07154|CATL_RAT CATHEPSIN L PRECURSOR (MAJOR EXCRETED PROTEIN) (MEP) (CYCLIC
3733            PROTEIN-2) (CP-2)
3734           Length = 334
3736  Score =  431 bits (1097), Expect = e-121
3737  Identities = 123/345 (35%), Positives = 187/345 (53%), Gaps = 19/345 (5%)
3739 Query: 3   VILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEEL 62
3740            ++LL VL + T   + +       +Q+ +++    + Y   E   R  +++ N+  I+  
3741 Sbjct: 4   LLLLAVLCLGTALATPKF-DQTFNAQWHQWKSTHRRLYGTNEEEWRRAVWEKNMRMIQLH 62
3743 Query: 63  NLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAF 122
3744            N    N K      +N F D++++EF+      +               +  +  IP   
3745 Sbjct: 63  NGEYSNGKHGFTMEMNAFGDMTNEEFRQIVNGYRHQKH----KKGRLFQEPLMLQIPKTV 118
3747 Query: 123 DWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEG 182
3748            DWR +G VTPVKNQGQCGSCW+FS +G +EGQ F+   KL+SLSEQNLVDC H       
3749 Sbjct: 119 DWREKGCVTPVKNQGQCGSCWAFSASGCLEGQMFLKTGKLISLSEQNLVDCSH------- 171
3751 Query: 183 EEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIP 242
3752             +  ++GCNGGL   A+ YI +NGG+ +E SYPY A+ G  C + +    A  + F  IP
3753 Sbjct: 172 -DQGNQGCNGGLMDFAFQYIKENGGLDSEESYPYEAKDG-SCKYRAEYAVANDTGFVDIP 229
3755 Query: 243 KNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGYSAKNTI 299
3756            + E  +   + + GP+++A DA     QFY  G++  P C+   LDHG+L+VGY  + T 
3757 Sbjct: 230 QQEKALMKAVATVGPISVAMDASHPSLQFYSSGIYYEPNCSSKDLDHGVLVVGYGYEGTD 289
3759 Query: 300 FRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTSII 343
3760              K+  YW+VKNSWG +WG  GYI + + + N CG++   S  I+
3761 Sbjct: 290 SNKDK-YWLVKNSWGKEWGMDGYIKIAKDRNNHCGLATAASYPIV 333
3764 >sp|P06797|CATL_MOUSE CATHEPSIN L PRECURSOR (MAJOR EXCRETED PROTEIN) (MEP)
3765           Length = 334
3767  Score =  431 bits (1096), Expect = e-120
3768  Identities = 120/347 (34%), Positives = 189/347 (53%), Gaps = 18/347 (5%)
3770 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIE 60
3771            M ++LL  +      +++        +++ +++    + Y   E   R  I++ N+  I+
3772 Sbjct: 1   MNLLLLLAVLCLGTALATPKFDQTFSAEWHQWKSTHRRLYGTNEEEWRRAIWEKNMRMIQ 60
3774 Query: 61  ELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPT 120
3775              N    N +      +N F D++++EF+      +               +  +  IP 
3776 Sbjct: 61  LHNGEYSNGQHGFSMEMNAFGDMTNEEFRQVVNGYRHQKH----KKGRLFQEPLMLKIPK 116
3778 Query: 121 AFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEY 180
3779            + DWR +G VTPVKNQGQCGSCW+FS +G +EGQ F+   KL+SLSEQNLVDC H     
3780 Sbjct: 117 SVDWREKGCVTPVKNQGQCGSCWAFSASGCLEGQMFLKTGKLISLSEQNLVDCSHA---- 172
3782 Query: 181 EGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTM 240
3783                  ++GCNGGL   A+ YI +NGG+ +E SYPY A+ G  C + +    A  + F  
3784 Sbjct: 173 ----QGNQGCNGGLMDFAFQYIKENGGLDSEESYPYEAKDG-SCKYRAEFAVANDTGFVD 227
3786 Query: 241 IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGYSAKN 297
3787            IP+ E  +   + + GP+++A DA     QFY  G++  P C+  +LDHG+L+VGY  + 
3788 Sbjct: 228 IPQQEKALMKAVATVGPISVAMDASHPSLQFYSSGIYYEPNCSSKNLDHGVLLVGYGYEG 287
3790 Query: 298 TIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTSII 343
3791            T   KN  YW+VKNSWG++WG +GYI + + + N CG++   S  ++
3792 Sbjct: 288 TDSNKNK-YWLVKNSWGSEWGMEGYIKIAKDRDNHCGLATAASYPVV 333
3795 >sp|Q28944|CATL_PIG CATHEPSIN L PRECURSOR
3796           Length = 334
3798  Score =  430 bits (1094), Expect = e-120
3799  Identities = 115/343 (33%), Positives = 171/343 (49%), Gaps = 19/343 (5%)
3801 Query: 7   FVLAVFTVFVSSRG--IPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNL 64
3802              L    + ++S    +     + + +++    + Y   E   R  +++ N+  IE  N 
3803 Sbjct: 5   LFLTALCLGIASAAPKLDQNLDADWYKWKATHGRLYGMNEEGWRRAVWEKNMKMIELHNQ 64
3805 Query: 65  IAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDW 124
3806                 K      +N F D++++EF+                      +  +  +P + DW
3807 Sbjct: 65  EYSQGKHGFSMAMNAFGDMTNEEFRQVMNG----FQNQKHKKGKVFHESLVLEVPKSVDW 120
3809 Query: 125 RTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEE 184
3810            R +G VT VKNQGQCGSCW+FS TG +EGQ F    KLVSLSEQNLVDC           
3811 Sbjct: 121 REKGYVTAVKNQGQCGSCWAFSATGALEGQMFRKTGKLVSLSEQNLVDCS--------RP 172
3813 Query: 185 ACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKN 244
3814              ++GCNGGL  NA+ Y+  NGG+ TE SYPY       C +      A  + F  IP+ 
3815 Sbjct: 173 QGNQGCNGGLMDNAFQYVKDNGGLDTEESYPYLGRETNSCTYKPECSAANDTGFVDIPQR 232
3817 Query: 245 ETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGV-FDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFR 301
3818            E  +   + + GP+++A DA    +QFY  G+ +D  C+   LDHG+L+VGY  + T   
3819 Sbjct: 233 EKALMKAVATVGPISVAIDAGHSSFQFYKSGIYYDPDCSSKDLDHGVLVVGYGFEGTDSN 292
3821 Query: 302 KNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG-KNTCGVSNFVSTSII 343
3822             +  +WIVKNSWG +WG  GY+ + +   N CG+S   S   +
3823 Sbjct: 293 SSK-FWIVKNSWGPEWGWNGYVKMAKDQNNHCGISTAASYPTV 334
3826 >sp|P07711|CATL_HUMAN CATHEPSIN L PRECURSOR (MAJOR EXCRETED PROTEIN) (MEP)
3827           Length = 333
3829  Score =  421 bits (1072), Expect = e-118
3830  Identities = 118/343 (34%), Positives = 180/343 (52%), Gaps = 20/343 (5%)
3832 Query: 7   FVLAVFTVFVSSRGIPPE--EQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNL 64
3833             +LA F + ++S  +  +   ++Q+ +++   N+ Y   E   R  +++ N+  IE  N 
3834 Sbjct: 5   LILAAFCLGIASATLTFDHSLEAQWTKWKAMHNRLYGMNEEGWRRAVWEKNMKMIELHNQ 64
3836 Query: 65  IAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDW 124
3837                 K      +N F D++S+EF+                      +      P + DW
3838 Sbjct: 65  EYREGKHSFTMAMNAFGDMTSEEFRQVMNG----FQNRKPRKGKVFQEPLFYEAPRSVDW 120
3840 Query: 125 RTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEE 184
3841            R +G VTPVKNQGQCGSCW+FS TG +EGQ F    +L+SLSEQNLVDC           
3842 Sbjct: 121 REKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSATGALEGQMFRKTGRLISLSEQNLVDCS--------GP 172
3844 Query: 185 ACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKN 244
3845              +EGCNGGL   A+ Y+  NGG+ +E SYPY A     C +N     A  + F  IPK 
3846 Sbjct: 173 QGNEGCNGGLMDYAFQYVQDNGGLDSEESYPYEATE-ESCKYNPKYSVANDTGFVDIPKQ 231
3848 Query: 245 ETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVF-DIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFR 301
3849            E  +   + + GP+++A DA    + FY  G++ +  C+   +DHG+L+VGY  ++T   
3850 Sbjct: 232 EKALMKAVATVGPISVAIDAGHESFLFYKEGIYFEPDCSSEDMDHGVLVVGYGFESTESD 291
3852 Query: 302 KNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG-KNTCGVSNFVSTSII 343
3853             N  YW+VKNSWG +WG  GY+ + +  +N CG+++  S   +
3854 Sbjct: 292 NNK-YWLVKNSWGEEWGMGGYVKMAKDRRNHCGIASAASYPTV 333
3857 >sp|O60911|CATM_HUMAN CATHEPSIN L2 PRECURSOR (CATHEPSIN V)
3858           Length = 334
3860  Score =  417 bits (1061), Expect = e-116
3861  Identities = 118/346 (34%), Positives = 179/346 (51%), Gaps = 21/346 (6%)
3863 Query: 5   LLFVLAVFTVFVSSRGI--PPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEEL 62
3864            L  VLA F + ++S          +++ +++    + Y   E   R  +++ N+  IE  
3865 Sbjct: 3   LSLVLAAFCLGIASAVPKFDQNLDTKWYQWKATHRRLYGANEEGWRRAVWEKNMKMIELH 62
3867 Query: 63  NLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAF 122
3868            N      K      +N F D++++EF+      +   F           +     +P + 
3869 Sbjct: 63  NGEYSQGKHGFTMAMNAFPDMTNEEFRQMMGCFRNQKFR----KGKVFREPLFLDLPKSV 118
3871 Query: 123 DWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEG 182
3872            DWR +G VTPVKNQ QCGSCW+FS TG +EGQ F    KLVSLSEQNLVDC         
3873 Sbjct: 119 DWRKKGYVTPVKNQKQCGSCWAFSATGALEGQMFRKTGKLVSLSEQNLVDCS-------- 170
3875 Query: 183 EEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMI- 241
3876                ++GCNGG    A+ Y+ +NGG+ +E SYPY A     C +   N  A  + FT++ 
3877 Sbjct: 171 RPQGNQGCNGGFMARAFQYVKENGGLDSEESYPYVAVD-EICKYRPENSVANDTGFTVVA 229
3879 Query: 242 PKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVF-DIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNT 298
3880            P  E  +   + + GP+++A DA    +QFY  G++ +  C+  +LDHG+L+VGY  +  
3881 Sbjct: 230 PGKEKALMKAVATVGPISVAMDAGHSSFQFYKSGIYFEPDCSSKNLDHGVLVVGYGFE-G 288
3883 Query: 299 IFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTSII 343
3884                N  YW+VKNSWG +WG  GY+ + + K N CG++   S   +
3885 Sbjct: 289 ANSNNSKYWLVKNSWGPEWGSNGYVKIAKDKNNHCGIATAASYPNV 334
3888 >sp|P43296|RD19_ARATH CYSTEINE PROTEINASE RD19A PRECURSOR
3889           Length = 368
3891  Score =  412 bits (1048), Expect = e-115
3892  Identities = 148/356 (41%), Positives = 199/356 (55%), Gaps = 28/356 (7%)
3894 Query: 6   LFVLAVFTVFVSSRGIP------------------PEEQSQFLEFQDKFNKKY-SHEEYL 46
3895            +FVL+ F V VSS  +                      +  F  F+ KF K Y S+EE+ 
3896 Sbjct: 10  VFVLSFFIVSVSSSDVNDGDDLVIRQVVGGAEPQVLTSEDHFSLFKRKFGKVYASNEEHD 69
3898 Query: 47  ERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPV 106
3899             RF +FK+NL +      +          GV +F+DL+  EF+  +L  +          
3900 Sbjct: 70  YRFSVFKANLRRARRHQKLDP----SATHGVTQFSDLTRSEFRKKHLGVRSGFKLP--KD 123
3902 Query: 107 ADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLS 166
3903            A+        ++P  FDWR  GAVTPVKNQG CGSCWSFS TG +EG +F++  KLVSLS
3904 Sbjct: 124 ANKAPILPTENLPEDFDWRDHGAVTPVKNQGSCGSCWSFSATGALEGANFLATGKLVSLS 183
3906 Query: 167 EQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNF 226
3907            EQ LVDCDHEC + E  ++CD GCNGGL  +A+ Y +K GG+  E  YPYT + G  C  
3908 Sbjct: 184 EQQLVDCDHEC-DPEEADSCDSGCNGGLMNSAFEYTLKTGGLMKEEDYPYTGKDGKTCKL 242
3910 Query: 227 NSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDH 286
3911            + + I A +SNF++I  +E  +A  +V  GPLA+A +A   Q YIGGV         L+H
3912 Sbjct: 243 DKSKIVASVSNFSVISIDEEQIAANLVKNGPLAVAINAGYMQTYIGGVSCPYICTRRLNH 302
3914 Query: 287 GILIVGYSAKN--TIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVST 340
3915            G+L+VGY A        K  PYWI+KNSWG  WGE G+  + +G+N CGV + VST
3916 Sbjct: 303 GVLLVGYGAAGYAPARFKEKPYWIIKNSWGETWGENGFYKICKGRNICGVDSMVST 358
3919 >sp|P25776|ORYA_ORYSA ORYZAIN ALPHA CHAIN PRECURSOR
3920           Length = 458
3922  Score =  407 bits (1036), Expect = e-113
3923  Identities = 121/350 (34%), Positives = 183/350 (51%), Gaps = 27/350 (7%)
3925 Query: 3   VILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQ--FLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKI 59
3926            ++LL  LA   + + S G   EE+++  + E++ +  K Y+   E   R+  F+ NL  I
3927 Sbjct: 12  LLLLLSLAAADMSIVSYGERSEEEARRLYAEWKAEHGKSYNAVGEEERRYAAFRDNLRYI 71
3929 Query: 60  EELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP 119
3930            +E N  A       + G+N+FADL+++E+++ YL  +     +   V+D        ++P
3931 Sbjct: 72  DEHNAAADAGVHSFRLGLNRFADLTNEEYRDTYLGLRNKPRRER-KVSDRYLAADNEALP 130
3933 Query: 120 TAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECME 179
3934             + DWRT+GAV  +K+QG CGSCW+FS    VE  + I    L+SLSEQ LVDCD     
3935 Sbjct: 131 ESVDWRTKGAVAEIKDQGGCGSCWAFSAIAAVEDINQIVTGDLISLSEQELVDCD----- 185
3937 Query: 180 YEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANI-GAKISNF 238
3938                 + +EGCNGGL   A+++II NGGI TE  YPY  +   +C+ N  N     I ++
3939 Sbjct: 186 ----TSYNEGCNGGLMDYAFDFIINNGGIDTEDDYPYKGKD-ERCDVNRKNAKVVTIDSY 240
3941 Query: 239 TMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAK 296
3942              +  N        V   P+++A +A    +Q Y  G+F   C   +LDHG+  VGY  +
3943 Sbjct: 241 EDVTPNSETSLQKAVRNQPVSVAIEAGGRAFQLYSSGIFTGKCG-TALDHGVAAVGYGTE 299
3945 Query: 297 NTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG----KNTCGVSNFVSTSI 342
3946            N        YWIV+NSWG  WGE GY+ + R        CG++   S  +
3947 Sbjct: 300 N-----GKDYWIVRNSWGKSWGESGYVRMERNIKASSGKCGIAVEPSYPL 344
3950 >sp|P25782|CYS2_HOMAM DIGESTIVE CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR
3951           Length = 323
3953  Score =  403 bits (1024), Expect = e-112
3954  Identities = 132/349 (37%), Positives = 187/349 (52%), Gaps = 32/349 (9%)
3956 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKI 59
3957            MKV +LF+  V     S           +  F+ K+ ++Y   EE   R  IF+ N   I
3958 Sbjct: 1   MKVAVLFLCGVALAAASPS---------WEHFKGKYGRQYVDAEEDSYRRVIFEQNQKYI 51
3960 Query: 60  EELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP 119
3961            EE N    N +      +NKF D++ +EF      N   I     PV+ +   +      
3962 Sbjct: 52  EEFNKKYENGEVTFNLAMNKFGDMTLEEFNAVMKGN---IPRRSAPVSVFYPKKETGPQA 108
3964 Query: 120 TAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECME 179
3965            T  DWRT+GAVTPVK+QGQCGSCW+FSTTG++EGQHF+    L+SL+EQ LVDC      
3966 Sbjct: 109 TEVDWRTKGAVTPVKDQGQCGSCWAFSTTGSLEGQHFLKTGSLISLAEQQLVDCS----- 163
3968 Query: 180 YEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFT 239
3969                    +GCNGG   +A++YI  N GI TE++YPY A  G  C F+S ++ A  S  T
3970 Sbjct: 164 ---RPYGPQGCNGGWMNDAFDYIKANNGIDTEAAYPYEARDG-SCRFDSNSVAATCSGHT 219
3972 Query: 240 MI-PKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGYSA 295
3973             I   +ET +   +   GP+++  DA    +QFY  GV+  P C+P+ LDH +L VGY +
3974 Sbjct: 220 NIASGSETGLQQAVRDIGPISVTIDAAHSSFQFYSSGVYYEPSCSPSYLDHAVLAVGYGS 279
3976 Query: 296 KNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTSII 343
3977            +         +W+VKNSW   WG+ GYI + R + N CG++   S  ++
3978 Sbjct: 280 EG-----GQDFWLVKNSWATSWGDAGYIKMSRNRNNNCGIATVASYPLV 323
3981 >sp|P43295|A494_ARATH PROBABLE CYSTEINE PROTEINASE A494 PRECURSOR
3982           Length = 313
3984  Score =  402 bits (1021), Expect = e-112
3985  Identities = 141/312 (45%), Positives = 187/312 (59%), Gaps = 10/312 (3%)
3987 Query: 32  FQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKN 90
3988            F+ KF K Y   EE+  RF +FK+NL +      +  + +     GV +F+DL+  EF+ 
3989 Sbjct: 3   FKKKFGKVYGSIEEHYYRFSVFKANLLRAMRHQKMDPSARH----GVTQFSDLTRSEFRR 58
3991 Query: 91  YYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGN 150
3992             +L  K          A+        ++P  FDWR RGAVTPVKNQG CGSCWSFSTTG 
3993 Sbjct: 59  KHLGVKGGFKLP--KDANQAPILPTQNLPEEFDWRDRGAVTPVKNQGSCGSCWSFSTTGA 116
3995 Query: 151 VEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQT 210
3996            +EG HF++  KLVSLSEQ LVDCDHEC + E E +CD GCNGGL  +A+ Y +K GG+  
3997 Sbjct: 117 LEGAHFLATGKLVSLSEQQLVDCDHEC-DPEEEGSCDSGCNGGLMNSAFEYTLKTGGLMR 175
3999 Query: 211 ESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFY 270
4000            E  YPYT   G  C  + + I A +SNF+++  NE  +A  ++  GPLA+A +A   Q Y
4001 Sbjct: 176 EKDYPYTGTDGGSCKLDRSKIVASVSNFSVVSINEDQIAANLIKNGPLAVAINAAYMQTY 235
4003 Query: 271 IGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKN--TIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG 328
4004            IGGV         L+HG+L+VGY +        K  PYWI+KNSWG  WGE G+  + +G
4005 Sbjct: 236 IGGVSCPYICSRRLNHGVLLVGYGSAGFSQARLKEKPYWIIKNSWGESWGENGFYKICKG 295
4007 Query: 329 KNTCGVSNFVST 340
4008            +N CGV + VST
4009 Sbjct: 296 RNICGVDSLVST 307
4012 >sp|P43235|CATK_HUMAN CATHEPSIN K PRECURSOR (CATHEPSIN O) (CATHEPSIN X) (CATHEPSIN O2)
4013           Length = 329
4015  Score =  401 bits (1020), Expect = e-111
4016  Identities = 121/341 (35%), Positives = 179/341 (52%), Gaps = 25/341 (7%)
4018 Query: 9   LAVFTVFVSSRGIPPEE--QSQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKIEELNLI 65
4019            L V  + V S  + PEE   + +  ++    K+Y+++ + + R  I++ NL  I   NL 
4020 Sbjct: 4   LKVLLLPVVSFALYPEEILDTHWELWKKTHRKQYNNKVDEISRRLIWEKNLKYISIHNLE 63
4022 Query: 66  AINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWR 125
4023            A       +  +N   D++S+E        K  +         Y+  E+    P + D+R
4024 Sbjct: 64  ASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLKVPLSHSRSNDTLYIP-EWEGRAPDSVDYR 122
4026 Query: 126 TRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEA 185
4027             +G VTPVKNQGQCGSCW+FS+ G +EGQ      KL++LS QNLVDC  E         
4028 Sbjct: 123 KKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSE--------- 173
4030 Query: 186 CDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIP-KN 244
4031             ++GC GG   NA+ Y+ KN GI +E +YPY  +    C +N     AK   +  IP  N
4032 Sbjct: 174 -NDGCGGGYMTNAFQYVQKNRGIDSEDAYPYVGQE-ESCMYNPTGKAAKCRGYREIPEGN 231
4034 Query: 245 ETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGV-FDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFR 301
4035            E  +   +   GP+++A DA    +QFY  GV +D  CN ++L+H +L VGY       +
4036 Sbjct: 232 EKALKRAVARVGPVSVAIDASLTSFQFYSKGVYYDESCNSDNLNHAVLAVGYG-----IQ 286
4038 Query: 302 KNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNT-CGVSNFVSTS 341
4039            K   +WI+KNSWG +WG +GYI + R KN  CG++N  S  
4040 Sbjct: 287 KGNKHWIIKNSWGENWGNKGYILMARNKNNACGIANLASFP 327
4043 >sp|P25804|CYSP_PEA CYSTEINE PROTEINASE 15A PRECURSOR (TURGOR-RESPONSIVE PROTEIN 15A)
4044           Length = 363
4046  Score =  399 bits (1015), Expect = e-111
4047  Identities = 141/322 (43%), Positives = 196/322 (60%), Gaps = 12/322 (3%)
4049 Query: 23  PEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYL-ERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFA 81
4050               +  F  F+ KF+K Y+ +E    RF +FKSNL K +       N     + G+ KF+
4051 Sbjct: 42  LNAEHHFTSFKSKFSKSYATKEEHDYRFGVFKSNLIKAKLHQ----NRDPTAEHGITKFS 97
4053 Query: 82  DLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGS 141
4054            DL++ EF+  +L  K+ +       A         ++P  FDWR +GAVTPVK+QG CGS
4055 Sbjct: 98  DLTASEFRRQFLGLKKRLRLPAH--AQKAPILPTTNLPEDFDWREKGAVTPVKDQGSCGS 155
4057 Query: 142 CWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNY 201
4058            CW+FSTTG +EG H+++  KLVSLSEQ LVDCDH C + E   +CD GCNGGL  NA+ Y
4059 Sbjct: 156 CWAFSTTGALEGAHYLATGKLVSLSEQQLVDCDHVC-DPEQAGSCDSGCNGGLMNNAFEY 214
4061 Query: 202 IIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIA 261
4062            ++++GG+  E  Y YT   G  C F+ + + A +SNF+++  +E  +A  +V  GPLA+A
4063 Sbjct: 215 LLESGGVVQEKDYAYTGRDG-SCKFDKSKVVASVSNFSVVTLDEDQIAANLVKNGPLAVA 273
4065 Query: 262 ADAVEWQFYIGGVFD-IPCNPNSLDHGILIVGY--SAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWG 318
4066             +A   Q Y+ GV     C  + LDHG+L+VG+   A   I  K  PYWI+KNSWG +WG
4067 Sbjct: 274 INAAWMQTYMSGVSCPYVCAKSRLDHGVLLVGFGKGAYAPIRLKEKPYWIIKNSWGQNWG 333
4069 Query: 319 EQGYIYLRRGKNTCGVSNFVST 340
4070            EQGY  + RG+N CGV + VST
4071 Sbjct: 334 EQGYYKICRGRNVCGVDSMVST 355
4074 >sp|P04989|CYS2_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR (PRESTALK CATHEPSIN)
4075           Length = 376
4077  Score =  398 bits (1012), Expect = e-111
4078  Identities = 145/386 (37%), Positives = 211/386 (54%), Gaps = 55/386 (14%)
4080 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIP-------PEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFK 53
4081            M++++  +L +F  F  +   P        + ++ F E+  KFN++YS  E+  R+ IFK
4082 Sbjct: 1   MRLLVFLILLIFVNFSFANVRPNGRRFSESQYRTAFTEWTLKFNRQYSSSEFSNRYSIFK 60
4084 Query: 54  SNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKE-AIFTDDLPVADYLDD 112
4085            SN+  ++  N       + T  G+N FAD++++E++  YL  +  A   +     + L+ 
4086 Sbjct: 61  SNMDYVDNWNSK---GDSQTVLGLNNFADITNEEYRKTYLGTRVNAHSYNGYDGREVLNV 117
4088 Query: 113 EFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVD 172
4089            E + + P + DWRT+ AVTP+K+QGQCGSCWSFSTTG+ EG H +   KLVSLSEQNLVD
4090 Sbjct: 118 EDLQTNPKSIDWRTKNAVTPIKDQGQCGSCWSFSTTGSTEGAHALKTKKLVSLSEQNLVD 177
4092 Query: 173 CDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIG 232
4093            C      +        GC+GGL  NA++YIIKN GI TESSYPYTAETG+ C FN ++IG
4094 Sbjct: 178 CSGPEENF--------GCDGGLMNNAFDYIIKNKGIDTESSYPYTAETGSTCLFNKSDIG 229
4096 Query: 233 AKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGIL 289
4097            A I  +  I     +        GP+++A DA    +Q Y  G++  P C+P  LDHG+L
4098 Sbjct: 230 ATIKGYVNITAGSEISLENGAQHGPVSVAIDASHNSFQLYTSGIYYEPKCSPTELDHGVL 289
4100 Query: 290 IVGYSA--------------------------------KNTIFRKNMPYWIVKNSWGADW 317
4101            +VGY                                   +++  K   YWIVKNSWG  W
4102 Sbjct: 290 VVGYGVQGKDDEGPVLNRKQTIVIHKNEDNKVESSDDSSDSVRPKANNYWIVKNSWGTSW 349
4104 Query: 318 GEQGYIYLRRG-KNTCGVSNFVSTSI 342
4105            G +GYI + +  KN CG+++  S  +
4106 Sbjct: 350 GIKGYILMSKDRKNNCGIASVSSYPL 375
4109 >sp|P43236|CATK_RABIT CATHEPSIN K PRECURSOR (OC-2 PROTEIN)
4110           Length = 329
4112  Score =  395 bits (1005), Expect = e-110
4113  Identities = 118/341 (34%), Positives = 178/341 (51%), Gaps = 25/341 (7%)
4115 Query: 9   LAVFTVFVSSRGIPPEE--QSQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKIEELNLI 65
4116            L V  + V S  + PEE   +Q+  ++  ++K+Y+ + + + R  I++ NL  I   NL 
4117 Sbjct: 4   LKVLLLPVVSFALHPEEILDTQWELWKKTYSKQYNSKVDEISRRLIWEKNLKHISIHNLE 63
4119 Query: 66  AINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWR 125
4120            A       +  +N   D++S+E        K            Y+  ++    P + D+R
4121 Sbjct: 64  ASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLKVPPSRSHSNDTLYIP-DWEGRTPDSIDYR 122
4123 Query: 126 TRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEA 185
4124             +G VTPVKNQGQCGSCW+FS+ G +EGQ      KL++LS QNLVDC  E         
4125 Sbjct: 123 KKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSSVGALEGQLKKKTGKLLNLSPQNLVDCVSE--------- 173
4127 Query: 186 CDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIP-KN 244
4128             + GC GG   NA+ Y+ +N GI +E +YPY  +    C +N     AK   +  IP  N
4129 Sbjct: 174 -NYGCGGGYMTNAFQYVQRNRGIDSEDAYPYVGQD-ESCMYNPTGKAAKCRGYREIPEGN 231
4131 Query: 245 ETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGV-FDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFR 301
4132            E  +   +   GP+++A DA    +QFY  GV +D  C+ ++++H +L VGY       +
4133 Sbjct: 232 EKALKRAVARVGPVSVAIDASLTSFQFYSKGVYYDENCSSDNVNHAVLAVGYG-----IQ 286
4135 Query: 302 KNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNT-CGVSNFVSTS 341
4136            K   +WI+KNSWG  WG +GYI + R KN  CG++N  S  
4137 Sbjct: 287 KGNKHWIIKNSWGESWGNKGYILMARNKNNACGIANLASFP 327
4140 >sp|P54640|CYS5_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 5 PRECURSOR
4141           Length = 344
4143  Score =  394 bits (1001), Expect = e-109
4144  Identities = 138/362 (38%), Positives = 200/362 (55%), Gaps = 37/362 (10%)
4146 Query: 1   MKVI-LLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKI 59
4147            MKV+  L VL V       +    + ++ F ++     K Y+ EE+  R+ IF +N+  +
4148 Sbjct: 1   MKVLSFLCVLLVSVATAKQQFSELQYRNAFTDWMITHQKSYTSEEFGARYNIFTANMDYV 60
4150 Query: 60  EELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP 119
4151            ++ N    +  ++T  G+N FAD++++E++N YL  K   F     +    +    NS  
4152 Sbjct: 61  QQWN----SKGSETVLGLNNFADITNEEYRNTYLGTK---FDASSLIGTQEEKVHTNSSA 113
4154 Query: 120 TAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECME 179
4155             + DWR+ GAVTPVKNQGQCG CWSFSTTG+ EG HF S+ +LVSLSEQNL+DC  E   
4156 Sbjct: 114 ASKDWRSEGAVTPVKNQGQCGGCWSFSTTGSTEGAHFQSKGELVSLSEQNLIDCSTE--- 170
4158 Query: 180 YEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFT 239
4159                   + GC+GGL   A+ YII N GI TESSYPY AE G +C + S N GA +S++ 
4160 Sbjct: 171 -------NSGCDGGLMTYAFEYIINNNGIDTESSYPYKAENG-KCEYKSENSGATLSSYK 222
4162 Query: 240 MIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGYS-- 294
4163             +           V+  P+++A DA    +Q Y  G++  P C+  +LDHG+L VGY   
4164 Sbjct: 223 TVTAGSESSLESAVNVNPVSVAIDASHQSFQLYTSGIYYEPECSSENLDHGVLAVGYGSG 282
4166 Query: 295 ------------AKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTS 341
4167                        + N     +  YWIVKNSWG  WG +GYI + R + N CG+++  S  
4168 Sbjct: 283 SGSSSGQSSGQSSGNLSASSSNEYWIVKNSWGTSWGIEGYILMSRNRDNNCGIASSASFP 342
4170 Query: 342 II 343
4171            ++
4172 Sbjct: 343 VV 344
4175 >sp|P13277|CYS1_HOMAM DIGESTIVE CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR
4176           Length = 322
4178  Score =  393 bits (998), Expect = e-109
4179  Identities = 130/351 (37%), Positives = 186/351 (52%), Gaps = 37/351 (10%)
4181 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKI 59
4182            MKV+ LF+  +     +           + EF+ KF +KY   EE   R  +F  NL  I
4183 Sbjct: 1   MKVVALFLFGLALAAANPS---------WEEFKGKFGRKYVDLEEERYRLNVFLDNLQYI 51
4185 Query: 60  EELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP 119
4186            EE N      +      +N+F+D+++++F       K+      +  +        ++ P
4187 Sbjct: 52  EEFNKKYERGEVTYNLAINQFSDMTNEKFNAVMKGYKKGPRPAAVFTS-------TDAAP 104
4189 Query: 120 TA--FDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHEC 177
4190             +   DWRT+GAVTPVK+QGQCGSCW+FSTTG +EGQHF+   +LVSLSEQ LVDC    
4191 Sbjct: 105 ESTEVDWRTKGAVTPVKDQGQCGSCWAFSTTGGIEGQHFLKTGRLVSLSEQQLVDC---- 160
4193 Query: 178 MEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISN 237
4194                G    ++GCNGG    A  Y+  NGG+ TESSYPY A   T C FNS  IGA  + 
4195 Sbjct: 161 ---AGGSYYNQGCNGGWVERAIMYVRDNGGVDTESSYPYEARDNT-CRFNSNTIGATCTG 216
4197 Query: 238 FTMIPK-NETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGY 293
4198            +  I + +E+ +       GP+++A DA    +Q Y  GV+  P C+ + LDH +L VGY
4199 Sbjct: 217 YVGIAQGSESALKTATRDIGPISVAIDASHRSFQSYYTGVYYEPSCSSSQLDHAVLAVGY 276
4201 Query: 294 SAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTSII 343
4202             ++         +W+VKNSW   WGE GYI + R + N CG++       +
4203 Sbjct: 277 GSEG-----GQDFWLVKNSWATSWGESGYIKMARNRNNNCGIATDACYPTV 322
4206 >sp|P25784|CYS3_HOMAM DIGESTIVE CYSTEINE PROTEINASE 3 PRECURSOR
4207           Length = 321
4209  Score =  392 bits (997), Expect = e-109
4210  Identities = 126/348 (36%), Positives = 185/348 (52%), Gaps = 32/348 (9%)
4212 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKI 59
4213            MKV  LF+  +     S           +  F+ ++ +KY   +E L R  +F+ N   I
4214 Sbjct: 1   MKVAALFLCGLALATASPS---------WDHFKTQYGRKYGDAKEELYRQRVFQQNEQLI 51
4216 Query: 60  EELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP 119
4217            E+ N    N +   K  +N+F D++++EF       K+            +       + 
4218 Sbjct: 52  EDFNKKFENGEVTFKVAMNQFGDMTNEEFNAVMKGYKKG----SRGEPKAVFTAEAGPMA 107
4220 Query: 120 TAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECME 179
4221               DWRT+  VTPVK+Q QCGSCW+FS TG +EGQHF+  ++LVSLSEQ LVDC      
4222 Sbjct: 108 ADVDWRTKALVTPVKDQEQCGSCWAFSATGALEGQHFLKNDELVSLSEQQLVDCST---- 163
4224 Query: 180 YEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFT 239
4225                +  ++GC GG   +A++YI  NGGI TESSYPY AE    C F++ +IGA  +   
4226 Sbjct: 164 ----DYGNDGCGGGWMTSAFDYIKDNGGIDTESSYPYEAED-RSCRFDANSIGAICTGSV 218
4228 Query: 240 MIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFDI-PCNPNSLDHGILIVGYSAK 296
4229             +   E  +   +   GP+++A DA    +QFY  GV+    C+P  LDHG+L VGY  +
4230 Sbjct: 219 EVQHTEEALQEAVSGVGPISVAIDASHFSFQFYSSGVYYEQNCSPTFLDHGVLAVGYGTE 278
4232 Query: 297 NTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTSII 343
4233            +T       YW+VKNSWG+ WG+ GYI + R + N CG+++  S   +
4234 Sbjct: 279 ST-----KDYWLVKNSWGSSWGDAGYIKMSRNRDNNCGIASEPSYPTV 321
4237 >sp|P25774|CATS_HUMAN CATHEPSIN S PRECURSOR
4238           Length = 331
4240  Score =  392 bits (996), Expect = e-109
4241  Identities = 112/342 (32%), Positives = 172/342 (49%), Gaps = 21/342 (6%)
4243 Query: 5   LLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELN 63
4244            L+ VL V +  V+     P     +  ++  + K+Y    E   R  I++ NL  +   N
4245 Sbjct: 4   LVCVLLVCSSAVAQLHKDPTLDHHWHLWKKTYGKQYKEKNEEAVRRLIWEKNLKFVMLHN 63
4247 Query: 64  LIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD 123
4248            L           G+N   D++S+E  +   + +               +     +P + D
4249 Sbjct: 64  LEHSMGMHSYDLGMNHLGDMTSEEVMSLTSSLRVPSQWQRNITYKSNPNRI---LPDSVD 120
4251 Query: 124 WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGE 183
4252            WR +G VT VK QG CG+CW+FS  G +E Q  +   KLV+LS QNLVDC  E       
4253 Sbjct: 121 WREKGCVTEVKYQGSCGACWAFSAVGALEAQLKLKTGKLVTLSAQNLVDCSTE------- 173
4255 Query: 184 EACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIP- 242
4256            +  ++GCNGG    A+ YII N GI +++SYPY A    +C ++S    A  S +T +P 
4257 Sbjct: 174 KYGNKGCNGGFMTTAFQYIIDNKGIDSDASYPYKAMD-QKCQYDSKYRAATCSKYTELPY 232
4259 Query: 243 KNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIF 300
4260              E V+   + + GP+++  DA    +  Y  GV+  P    +++HG+L+VGY   N   
4261 Sbjct: 233 GREDVLKEAVANKGPVSVGVDARHPSFFLYRSGVYYEPSCTQNVNHGVLVVGYGDLN--- 289
4263 Query: 301 RKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTS 341
4264                 YW+VKNSWG ++GE+GYI + R K N CG+++F S  
4265 Sbjct: 290 --GKEYWLVKNSWGHNFGEEGYIRMARNKGNHCGIASFPSYP 329
4268 >sp|P15242|TES1_RAT TESTIN 1/2 PRECURSOR (CMB-22/CMB-23)
4269           Length = 333
4271  Score =  391 bits (995), Expect = e-109
4272  Identities = 112/347 (32%), Positives = 175/347 (50%), Gaps = 20/347 (5%)
4274 Query: 3   VILLFVLAVFTVFVSSRGI--PPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIE 60
4275            +I +  LA+  + V S      P    ++ E++ K  K Y+  E   +  +++ N   IE
4276 Sbjct: 1   MIAVLFLAILCLEVDSTAPTPDPSLDVEWNEWRTKHGKTYNMNEERLKRAVWEKNFKMIE 60
4278 Query: 61  ELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPT 120
4279              N   +  + D    +N F DL++ EF               +       D     +P 
4280 Sbjct: 61  LHNWEYLEGRHDFTMAMNAFGDLTNIEFVKMMTG----FQRQKIKKTHIFQDHQFLYVPK 116
4282 Query: 121 AFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEY 180
4283              DWR  G VTPVKNQG C S W+FS TG++EGQ F    +L+ LSEQNL+DC    + +
4284 Sbjct: 117 RVDWRQLGYVTPVKNQGHCASSWAFSATGSLEGQMFRKTERLIPLSEQNLLDCMGSNVTH 176
4286 Query: 181 EGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTM 240
4287                    GC+GG    A+ Y+  NGG+ TE SYPY  + G +C +++ N  A + +F  
4288 Sbjct: 177 --------GCSGGFMQYAFQYVKDNGGLATEESYPYRGQ-GRECRYHAENSAANVRDFVQ 227
4290 Query: 241 IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGYSAKN 297
4291            IP +E  +   +   GP+++A DA    +QFY  G++  P C    L+H +L+VGY  + 
4292 Sbjct: 228 IPGSEEALMKAVAKVGPISVAVDASHGSFQFYGSGIYYEPQCKRVHLNHAVLVVGYGFE- 286
4294 Query: 298 TIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG-KNTCGVSNFVSTSII 343
4295                    +W+VKNSWG +WG +GY+ L +   N CG++ + +  I+
4296 Sbjct: 287 GEESDGNSFWLVKNSWGEEWGMKGYMKLAKDWSNHCGIATYSTYPIV 333
4299 >sp|Q10716|CYS1_MAIZE CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR
4300           Length = 371
4302  Score =  391 bits (993), Expect = e-108
4303  Identities = 141/368 (38%), Positives = 201/368 (54%), Gaps = 34/368 (9%)
4305 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEE-------------------QSQFLEFQDKFNKKYS 41
4306            M   +L +L++ +    +  +  E+                   +S FL F  +F K Y 
4307 Sbjct: 1   MAHRVLLLLSLASAAAVAAAVDAEDPLIRQVVPGGDDNDLELNAESHFLSFVQRFGKSYK 60
4309 Query: 42  H-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLN---NKE 97
4310              +E+  R  +FK NL +     L+        + GV KF+DL+  EF+  YL    ++ 
4311 Sbjct: 61  DADEHAYRLSVFKDNLRRARRHQLLDP----SAEHGVTKFSDLTPAEFRRTYLGLRKSRR 116
4313 Query: 98  AIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFI 157
4314            A+  +    A        + +P  FDWR  GAV PVKNQG CGSCWSFS +G +EG H++
4315 Sbjct: 117 ALLRELGESAHEAPVLPTDGLPDDFDWRDHGAVGPVKNQGSCGSCWSFSASGALEGAHYL 176
4317 Query: 158 SQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYT 217
4318            +  KL  LSEQ  VDCDHEC +    ++CD GCNGGL   A++Y+ K GG+++E  YPYT
4319 Sbjct: 177 ATGKLEVLSEQQFVDCDHEC-DSSEPDSCDSGCNGGLMTTAFSYLQKAGGLESEKDYPYT 235
4321 Query: 218 AETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDI 277
4322               G +C F+ + I A + NF+++  +E  ++  ++  GPLAI  +A   Q YIGGV   
4323 Sbjct: 236 GSDG-KCKFDKSKIVASVQNFSVVSVDEAQISANLIKHGPLAIGINAAYMQTYIGGVSCP 294
4325 Query: 278 PCNPNSLDHGILIVGYSAKN--TIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG---KNTC 332
4326                  LDHG+L+VGY A     I  K+ PYWI+KNSWG +WGE GY  + RG   +N C
4327 Sbjct: 295 YICGRHLDHGVLLVGYGASGFAPIRLKDKPYWIIKNSWGENWGENGYYKICRGSNVRNKC 354
4329 Query: 333 GVSNFVST 340
4330            GV + VST
4331 Sbjct: 355 GVDSMVST 362
4334 >sp|P12412|CYSP_VIGMU VIGNAIN PRECURSOR (BEAN ENDOPEPTIDASE) (CYSTEINE PROTEINASE)
4335            (SULFHYDRYL-ENDOPEPTIDASE) (SH-EP)
4336           Length = 362
4338  Score =  389 bits (989), Expect = e-108
4339  Identities = 131/360 (36%), Positives = 187/360 (51%), Gaps = 36/360 (10%)
4341 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQ---------FLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEI 51
4342            MK +L  VL++  V   +      E+           +  ++       S  E  +RF +
4343 Sbjct: 3   MKKLLWVVLSLSLVLGVANSFDFHEKDLESEESLWDLYERWRSHHTVSRSLGEKHKRFNV 62
4345 Query: 52  FKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAI---FTDDLPVAD 108
4346            FK+N+  +   N +        K  +NKFAD+++ EF++ Y  +K      F      + 
4347 Sbjct: 63  FKANVMHVHNTNKMDKP----YKLKLNKFADMTNHEFRSTYAGSKVNHHKMFRGSQHGSG 118
4349 Query: 109 YLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQ 168
4350                E + S+P + DWR +GAVT VK+QGQCGSCW+FST   VEG + I  NKLVSLSEQ
4351 Sbjct: 119 TFMYEKVGSVPASVDWRKKGAVTDVKDQGQCGSCWAFSTIVAVEGINQIKTNKLVSLSEQ 178
4353 Query: 169 NLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNS 228
4354             LVDCD E          ++GCNGGL  +A+ +I + GGI TES+YPYTA+ GT      
4355 Sbjct: 179 ELVDCDKE---------ENQGCNGGLMESAFEFIKQKGGITTESNYPYTAQEGTCDESKV 229
4357 Query: 229 ANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDH 286
4358             ++   I     +P N+       V+  P+++A DA   ++QFY  GVF   C    L+H
4359 Sbjct: 230 NDLAVSIDGHENVPVNDENALLKAVANQPVSVAIDAGGSDFQFYSEGVFTGDC-NTDLNH 288
4361 Query: 287 GILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG----KNTCGVSNFVSTSI 342
4362            G+ IVGY            YWIV+NSWG +WGEQGYI ++R     +  CG++   S  I
4363 Sbjct: 289 GVAIVGYGTTV----DGTNYWIVRNSWGPEWGEQGYIRMQRNISKKEGLCGIAMMASYPI 344
4366 >sp|P43297|RD21_ARATH CYSTEINE PROTEINASE RD21A PRECURSOR
4367           Length = 462
4369  Score =  387 bits (984), Expect = e-107
4370  Identities = 120/330 (36%), Positives = 167/330 (50%), Gaps = 29/330 (8%)
4372 Query: 22  PPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHE---EYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVN 78
4373              E  S +  +  K  K  S     E   RFEIFK NL  ++E N   +      + G+ 
4374 Sbjct: 43  EAEVMSIYEAWLVKHGKAQSQNSLVEKDRRFEIFKDNLRFVDEHNEKNL----SYRLGLT 98
4376 Query: 79  KFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQ 138
4377            +FADL++DE+++ YL  K      +   +   +    + +P + DWR +GAV  VK+QG 
4378 Sbjct: 99  RFADLTNDEYRSKYLGAKME-KKGERRTSLRYEARVGDELPESIDWRKKGAVAEVKDQGG 157
4380 Query: 139 CGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNA 198
4381            CGSCW+FST G VEG + I    L++LSEQ LVDCD          + +EGCNGGL   A
4382 Sbjct: 158 CGSCWAFSTIGAVEGINQIVTGDLITLSEQELVDCD---------TSYNEGCNGGLMDYA 208
4384 Query: 199 YNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPL 258
4385            + +IIKNGGI T+  YPY    GT            I ++  +P          V+  P+
4386 Sbjct: 209 FEFIIKNGGIDTDKDYPYKGVDGTCDQIRKNAKVVTIDSYEDVPTYSEESLKKAVAHQPI 268
4388 Query: 259 AIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGAD 316
4389            +IA +A    +Q Y  G+FD  C    LDHG++ VGY  +N        YWIV+NSWG  
4390 Sbjct: 269 SIAIEAGGRAFQLYDSGIFDGSCG-TQLDHGVVAVGYGTEN-----GKDYWIVRNSWGKS 322
4392 Query: 317 WGEQGYIYLRRG----KNTCGVSNFVSTSI 342
4393            WGE GY+ + R        CG++   S  I
4394 Sbjct: 323 WGESGYLRMARNIASSSGKCGIAIEPSYPI 352
4397 >sp|P55097|CATK_MOUSE CATHEPSIN K PRECURSOR
4398           Length = 329
4400  Score =  384 bits (976), Expect = e-106
4401  Identities = 115/341 (33%), Positives = 178/341 (51%), Gaps = 25/341 (7%)
4403 Query: 9   LAVFTVFVSSRGIPPEE--QSQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKIEELNLI 65
4404            L V  + + S  + PEE   +Q+  ++    K+Y+ + + + R  I++ NL +I   NL 
4405 Sbjct: 4   LKVLLLPMVSFALSPEEMLDTQWELWKKTHQKQYNSKVDEISRRLIWEKNLKQISAHNLE 63
4407 Query: 66  AINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWR 125
4408            A       +  +N   D++S+E        +            Y   E+   +P + D+R
4409 Sbjct: 64  ASLGVHTYELAMNHLGDMTSEEVVQKMTGLRIPPSRSYSNDTLYTP-EWEGRVPDSIDYR 122
4411 Query: 126 TRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEA 185
4412             +G VTPVKNQGQCGSCW+FS+ G +EGQ      KL++LS QNLVDC  E         
4413 Sbjct: 123 KKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSSAGALEGQLKKKTGKLLALSPQNLVDCVTE--------- 173
4415 Query: 186 CDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIP-KN 244
4416             + GC GG    A+ Y+ +NGGI +E ++PY  +    C +N+    AK   +  IP  N
4417 Sbjct: 174 -NYGCGGGYMTTAFQYVQQNGGIDSEDAFPYVGQD-ESCMYNATAKAAKCRGYREIPVGN 231
4419 Query: 245 ETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGV-FDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFR 301
4420            E  +   +   GP++++ DA    +QFY  GV +D  C+ ++++H +L+VGY       +
4421 Sbjct: 232 EKALKRAVARVGPISVSIDASLASFQFYSRGVYYDENCDRDNVNHAVLVVGYGT-----Q 286
4423 Query: 302 KNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNT-CGVSNFVSTS 341
4424            K   +WI+KNSWG  WG +GY  L R KN  CG++N  S  
4425 Sbjct: 287 KGSKHWIIKNSWGESWGNKGYALLARNKNNACGITNMASFP 327
4428 >sp|P09668|CATH_HUMAN CATHEPSIN H PRECURSOR
4429           Length = 335
4431  Score =  383 bits (974), Expect = e-106
4432  Identities = 119/341 (34%), Positives = 167/341 (48%), Gaps = 28/341 (8%)
4434 Query: 8   VLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAI 67
4435            +L V     +   +   E+  F  +  K  K YS EEY  R + F SN  KI   N    
4436 Sbjct: 14  LLGVPVCGAAELSVNSLEKFHFKSWMSKHRKTYSTEEYHHRLQTFASNWRKINAHN---- 69
4438 Query: 68  NHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTR 127
4439            N     K  +N+F+D+S  E K+ YL ++          ++YL        P + DWR +
4440 Sbjct: 70  NGNHTFKMALNQFSDMSFAEIKHKYLWSEPQ--NCSATKSNYLRGT--GPYPPSVDWRKK 125
4442 Query: 128 GA-VTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEAC 186
4443            G  V+PVKNQG CGSCW+FSTTG +E    I+  K++SL+EQ LVDC  +   Y      
4444 Sbjct: 126 GNFVSPVKNQGACGSCWTFSTTGALESAIAIATGKMLSLAEQQLVDCAQDFNNY------ 179
4446 Query: 187 DEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIP-KNE 245
4447              GC GGL   A+ YI+ N GI  E +YPY  + G  C F        + +   I   +E
4448 Sbjct: 180 --GCQGGLPSQAFEYILYNKGIMGEDTYPYQGKDGY-CKFQPGKAIGFVKDVANITIYDE 236
4450 Query: 246 TVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCN---PNSLDHGILIVGYSAKNTIFR 301
4451              M   +    P++ A +   ++  Y  G++        P+ ++H +L VGY  KN    
4452 Sbjct: 237 EAMVEAVALYNPVSFAFEVTQDFMMYRTGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEKN---- 292
4454 Query: 302 KNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
4455              +PYWIVKNSWG  WG  GY  + RGKN CG++   S  I
4456 Sbjct: 293 -GIPYWIVKNSWGPQWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPI 332
4459 >sp|O46427|CATH_PIG CATHEPSIN H PRECURSOR
4460           Length = 335
4462  Score =  382 bits (971), Expect = e-106
4463  Identities = 117/336 (34%), Positives = 165/336 (48%), Gaps = 28/336 (8%)
4465 Query: 13  TVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKAD 72
4466                S+  +   E+  F  +  +  KKYS EEY  R ++F SN  KI   N         
4467 Sbjct: 19  ACGASNLAVSSFEKLHFKSWMVQHQKKYSLEEYHHRLQVFVSNWRKINAHNA----GNHT 74
4469 Query: 73  TKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGA-VT 131
4470             K G+N+F+D+S DE ++ YL ++           +YL        P + DWR +G  V+
4471 Sbjct: 75  FKLGLNQFSDMSFDEIRHKYLWSEPQ--NCSATKGNYLRGT--GPYPPSMDWRKKGNFVS 130
4473 Query: 132 PVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCN 191
4474            PVKNQG CGSCW+FSTTG +E    I+  K++SL+EQ LVDC             + GC 
4475 Sbjct: 131 PVKNQGSCGSCWTFSTTGALESAVAIATGKMLSLAEQQLVDCAQNFN--------NHGCQ 182
4477 Query: 192 GGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKN-ETVMAG 250
4478            GGL   A+ YI  N GI  E +YPY  +    C F      A + +   I  N E  M  
4479 Sbjct: 183 GGLPSQAFEYIRYNKGIMGEDTYPYKGQDD-HCKFQPDKAIAFVKDVANITMNDEEAMVE 241
4481 Query: 251 YIVSTGPLAIAADA-VEWQFYIGGVFDIPCN---PNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPY 306
4482             +    P++ A +   ++  Y  G++        P+ ++H +L VGY  +N      +PY
4483 Sbjct: 242 AVALYNPVSFAFEVTNDFLMYRKGIYSSTSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEEN-----GIPY 296
4485 Query: 307 WIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
4486            WIVKNSWG  WG  GY  + RGKN CG++   S  I
4487 Sbjct: 297 WIVKNSWGPQWGMNGYFLIERGKNMCGLAACASYPI 332
4490 >sp|P25803|CYSP_PHAVU VIGNAIN PRECURSOR (BEAN ENDOPEPTIDASE) (CYSTEINE PROTEINASE EP-C1)
4491           Length = 362
4493  Score =  380 bits (966), Expect = e-105
4494  Identities = 128/354 (36%), Positives = 182/354 (51%), Gaps = 32/354 (9%)
4496 Query: 3   VILLFVLAVFTVFVSSRGIP--PEEQSQF---LEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLG 57
4497            V+L F L +               E+S +     ++       S  E  +RF +FK+NL 
4498 Sbjct: 9   VVLSFSLVLGVANSFDFHDKDLASEESLWDLYERWRSHHTVSRSLGEKHKRFNVFKANLM 68
4500 Query: 58  KIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNK---EAIFTDDLPVADYLDDEF 114
4501             +   N +        K  +NKFAD+++ EF++ Y  +K     +F            E 
4502 Sbjct: 69  HVHNTNKMDKP----YKLKLNKFADMTNHEFRSTYAGSKVNHPRMFRGTPHENGAFMYEK 124
4504 Query: 115 INSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCD 174
4505            + S+P + DWR +GAVT VK+QGQCGSCW+FST   VEG + I  NKLV+LSEQ LVDCD
4506 Sbjct: 125 VVSVPPSVDWRKKGAVTDVKDQGQCGSCWAFSTVVAVEGINQIKTNKLVALSEQELVDCD 184
4508 Query: 175 HECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAK 234
4509             E          ++GCNGGL  +A+ +I + GGI TES+YPY A+ GT       ++   
4510 Sbjct: 185 KE---------ENQGCNGGLMESAFEFIKQKGGITTESNYPYKAQEGTCDASKVNDLAVS 235
4512 Query: 235 ISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVG 292
4513            I     +P N+       V+  P+++A DA   ++QFY  GVF   C    L+HG+ IVG
4514 Sbjct: 236 IDGHENVPANDEDALLKAVANQPVSVAIDAGGSDFQFYSEGVFTGDC-STDLNHGVAIVG 294
4516 Query: 293 YSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG----KNTCGVSNFVSTSI 342
4517            Y            YWIV+NSWG +WGE GYI ++R     +  CG++   S  I
4518 Sbjct: 295 YGTTV----DGTNYWIVRNSWGPEWGEHGYIRMQRNISKKEGLCGIAMLPSYPI 344
4521 >sp|P00786|CATH_RAT CATHEPSIN H PRECURSOR (CATHEPSIN B3) (CATHEPSIN BA)
4522           Length = 333
4524  Score =  377 bits (958), Expect = e-104
4525  Identities = 117/324 (36%), Positives = 167/324 (51%), Gaps = 28/324 (8%)
4527 Query: 25  EQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLS 84
4528            E+  F  +  +  K YS  EY  R ++F +N  KI+  N          K G+N+F+D+S
4529 Sbjct: 29  EKFHFTSWMKQHQKTYSSREYSHRLQVFANNWRKIQAHNQRN----HTFKMGLNQFSDMS 84
4531 Query: 85  SDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAV-TPVKNQGQCGSCW 143
4532              E K+ YL ++          ++YL        P++ DWR +G V +PVKNQG CGSCW
4533 Sbjct: 85  FAEIKHKYLWSEPQ--NCSATKSNYLRGT--GPYPSSMDWRKKGNVVSPVKNQGACGSCW 140
4535 Query: 144 SFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYII 203
4536            +FSTTG +E    I+  K+++L+EQ LVDC             + GC GGL   A+ YI+
4537 Sbjct: 141 TFSTTGALESAVAIASGKMMTLAEQQLVDCAQNFN--------NHGCQGGLPSQAFEYIL 192
4539 Query: 204 KNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKN-ETVMAGYIVSTGPLAIAA 262
4540             N GI  E SYPY  + G QC FN     A + N   I  N E  M   +    P++ A 
4541 Sbjct: 193 YNKGIMGEDSYPYIGKNG-QCKFNPEKAVAFVKNVVNITLNDEAAMVEAVALYNPVSFAF 251
4543 Query: 263 DAV-EWQFYIGGVFDIPCN---PNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWG 318
4544            +   ++  Y  GV+        P+ ++H +L VGY  +N +      YWIVKNSWG++WG
4545 Sbjct: 252 EVTEDFMMYKSGVYSSNSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEQNGLL-----YWIVKNSWGSNWG 306
4547 Query: 319 EQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
4548              GY  + RGKN CG++   S  I
4549 Sbjct: 307 NNGYFLIERGKNMCGLAACASYPI 330
4552 >sp|P25251|CYS4_BRANA CYSTEINE PROTEINASE COT44 PRECURSOR
4553           Length = 328
4555  Score =  376 bits (955), Expect = e-104
4556  Identities = 115/329 (34%), Positives = 167/329 (49%), Gaps = 32/329 (9%)
4558 Query: 29  FLEFQDKFNKKYSH-----EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADL 83
4559            +L +  +  K  S+      +  ERF IFK NL  I+  N    N  A  K G+  FA+L
4560 Sbjct: 4   YLRWSLEHGKSNSNSNGIINQQDERFNIFKDNLRFIDLHNE--NNKNATYKLGLTIFANL 61
4562 Query: 84  SSDEFKNYYLNNK----EAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQC 139
4563            ++DE+++ YL  +      I         Y     ++ +P   DWR +GAV  +K+QG C
4564 Sbjct: 62  TNDEYRSLYLGARTEPVRRITKAKNVNMKYSAAVNVDEVPVTVDWRQKGAVNAIKDQGTC 121
4566 Query: 140 GSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAY 199
4567            GSCW+FST   VEG + I   +LVSLSEQ LVDCD          + ++GCNGGL   A+
4568 Sbjct: 122 GSCWAFSTAAAVEGINKIVTGELVSLSEQELVDCDK---------SYNQGCNGGLMDYAF 172
4570 Query: 200 NYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLA 259
4571             +I+KNGG+ TE  YPY    G   +    +    I  +  +P  +       VS  P++
4572 Sbjct: 173 QFIMKNGGLNTEKDYPYHGTNGKCNSLLKNSRVVTIDGYEDVPSKDETALKRAVSYQPVS 232
4574 Query: 260 IAADA--VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADW 317
4575            +A DA    +Q Y  G+F   C   ++DH ++ VGY ++N +      YWIV+NSWG  W
4576 Sbjct: 233 VAIDAGGRAFQHYQSGIFTGKCG-TNMDHAVVAVGYGSENGV-----DYWIVRNSWGTRW 286
4578 Query: 318 GEQGYIYLRRG----KNTCGVSNFVSTSI 342
4579            GE GYI + R        CG++   S  +
4580 Sbjct: 287 GEDGYIRMERNVASKSGKCGIAIEASYPV 315
4583 >sp|P05167|ALEU_HORVU THIOL PROTEASE ALEURAIN PRECURSOR
4584           Length = 362
4586  Score =  375 bits (954), Expect = e-104
4587  Identities = 119/374 (31%), Positives = 179/374 (47%), Gaps = 54/374 (14%)
4589 Query: 3   VILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQ---------------------------SQFLEFQDK 35
4590            ++ L VLA   V V+S     +                              +F  F  +
4591 Sbjct: 8   LLALAVLATAAVAVASSSSFADSNPIRPVTDRAASTLESAVLGALGRTRHALRFARFAVR 67
4593 Query: 36  FNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLN 94
4594            + K Y S  E   RF IF  +L ++   N   + ++     G+N+F+D+S +EF+   L 
4595 Sbjct: 68  YGKSYESAAEVRRRFRIFSESLEEVRSTNRKGLPYR----LGINRFSDMSWEEFQATRLG 123
4597 Query: 95  NKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQ 154
4598               A  T    +A         ++P   DWR  G V+PVKNQ  CGSCW+FSTTG +E  
4599 Sbjct: 124 ---AAQTCSATLAGNHLMRDAAALPETKDWREDGIVSPVKNQAHCGSCWTFSTTGALEAA 180
4601 Query: 155 HFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSY 214
4602            +  +  K +SLSEQ LVDC      +        GCNGGL   A+ YI  NGGI TE SY
4603 Sbjct: 181 YTQATGKNISLSEQQLVDCAGGFNNF--------GCNGGLPSQAFEYIKYNGGIDTEESY 232
4605 Query: 215 PYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKN-ETVMAGYIVSTGPLAIAADAVE-WQFYIG 272
4606            PY    G  C++ + N   ++ +   I  N E  +   +    P+++A   ++ ++ Y  
4607 Sbjct: 233 PYKGVNGV-CHYKAENAAVQVLDSVNITLNAEDELKNAVGLVRPVSVAFQVIDGFRQYKS 291
4609 Query: 273 GVFD-IPCN--PNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK 329
4610            GV+    C   P+ ++H +L VGY  +N +     PYW++KNSWGADWG+ GY  +  GK
4611 Sbjct: 292 GVYTSDHCGTTPDDVNHAVLAVGYGVENGV-----PYWLIKNSWGADWGDNGYFKMEMGK 346
4613 Query: 330 NTCGVSNFVSTSII 343
4614            N C ++   S  ++
4615 Sbjct: 347 NMCAIATCASYPVV 360
4618 >sp|Q10717|CYS2_MAIZE CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR
4619           Length = 360
4621  Score =  374 bits (951), Expect = e-103
4622  Identities = 114/322 (35%), Positives = 168/322 (51%), Gaps = 26/322 (8%)
4624 Query: 28  QFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSD 86
4625            +F  F  ++ K Y S  E  +RF IF  +L  +   N   +      + G+N+FAD+S +
4626 Sbjct: 58  RFARFAVRYGKSYESAAEVHKRFRIFSESLQLVRSTNRKGL----SYRLGINRFADMSWE 113
4628 Query: 87  EFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFS 146
4629            EF+   L   +          ++       ++P   DWR  G V+PVKNQG CGSCW+FS
4630 Sbjct: 114 EFRATRLGAAQNCSAT--LTGNHRMRAAAVALPETKDWREDGIVSPVKNQGHCGSCWTFS 171
4632 Query: 147 TTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNG 206
4633            TTG +E  +  +  K +SLSEQ LVDC      +        GCNGGL   A+ YI  NG
4634 Sbjct: 172 TTGALEAAYTQATGKPISLSEQQLVDCGFAFNNF--------GCNGGLPSQAFEYIKYNG 223
4636 Query: 207 GIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKN-ETVMAGYIVSTGPLAIAADAV 265
4637            G+ TE SYPY    G  C F + N+G K+ +   I    E  +   +    P+++A + +
4638 Sbjct: 224 GLDTEESYPYQGVNGI-CKFKNENVGVKVLDSVNITLGAEDELKDAVGLVRPVSVAFEVI 282
4640 Query: 266 E-WQFYIGGVFD-IPCN--PNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQG 321
4641              ++ Y  GV+    C   P  ++H +L VGY  ++ +     PYW++KNSWGADWG++G
4642 Sbjct: 283 TGFRLYKSGVYTSDHCGTTPMDVNHAVLAVGYGVEDGV-----PYWLIKNSWGADWGDEG 337
4644 Query: 322 YIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
4645            Y  +  GKN CGV+   S  I+
4646 Sbjct: 338 YFKMEMGKNMCGVATCASYPIV 359
4649 >sp|P25777|ORYB_ORYSA ORYZAIN BETA CHAIN PRECURSOR
4650           Length = 471
4652  Score =  374 bits (951), Expect = e-103
4653  Identities = 112/304 (36%), Positives = 159/304 (51%), Gaps = 23/304 (7%)
4655 Query: 44  EYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDD 103
4656            E+  RF +F  NL  ++  N  A       + G+N+FADL+++EF+  +L  K A     
4657 Sbjct: 69  EHERRFLVFWDNLKFVDAHNARADEGGG-FRLGMNRFADLTNEEFRATFLGAKVAER--S 125
4659 Query: 104 LPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLV 163
4660                +    + +  +P + DWR +GAV PVKNQGQCGSCW+FS    VE  + +   +++
4661 Sbjct: 126 RAAGERYRHDGVEELPESVDWREKGAVAPVKNQGQCGSCWAFSAVSTVESINQLVTGEMI 185
4663 Query: 164 SLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQ 223
4664            +LSEQ LV+C             + GCNGGL  +A+++IIKNGGI TE  YPY A  G  
4665 Sbjct: 186 TLSEQELVECST--------NGQNSGCNGGLMADAFDFIIKNGGIDTEDDYPYKAVDGKC 237
4667 Query: 224 CNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCNP 281
4668                       I  F  +P+N+       V+  P+++A +A   E+Q Y  GVF   C  
4669 Sbjct: 238 DINRENAKVVSIDGFEDVPQNDEKSLQKAVAHQPVSVAIEAGGREFQLYHSGVFSGRCG- 296
4671 Query: 282 NSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKN----TCGVSNF 337
4672             SLDHG++ VGY   N        YWIV+NSWG  WGE GY+ + R  N     CG++  
4673 Sbjct: 297 TSLDHGVVAVGYGTDN-----GKDYWIVRNSWGPKWGESGYVRMERNINVTTGKCGIAMM 351
4675 Query: 338 VSTS 341
4676             S  
4677 Sbjct: 352 ASYP 355
4680 >sp|Q40143|CYS3_LYCES CYSTEINE PROTEINASE 3 PRECURSOR
4681           Length = 356
4683  Score =  373 bits (948), Expect = e-103
4684  Identities = 123/321 (38%), Positives = 169/321 (52%), Gaps = 28/321 (8%)
4686 Query: 29  FLEFQDKFNKKYSHEEYL-ERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDE 87
4687            F  F  +  K+Y   E + +RFEIF  NL  I   N   +      K G+N+F DL+ DE
4688 Sbjct: 57  FARFAIRHRKRYDSVEEIKQRFEIFLDNLKMIRSHNRKGL----SYKLGINEFTDLTWDE 112
4690 Query: 88  FKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFST 147
4691            F+ + L    A           L    +  +P   DWR  G V+PVK QG+CGSCW+FST
4692 Sbjct: 113 FRKHKLG---ASQNCSATTKGNLKLTNVV-LPETKDWRKDGIVSPVKAQGKCGSCWTFST 168
4694 Query: 148 TGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGG 207
4695            TG +E  +  +  K +SLSEQ LVDC      +        GCNGGL   A+ YI  NGG
4696 Sbjct: 169 TGALEAAYAQAFGKGISLSEQQLVDCAGAFNNF--------GCNGGLPSQAFEYIKFNGG 220
4698 Query: 208 IQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKN-ETVMAGYIVSTGPLAIAADAVE 266
4699            + TE +YPYT + G  C F+ ANIG K+ +   I    E  +   +    P+++A + V+
4700 Sbjct: 221 LDTEEAYPYTGKNGI-CKFSQANIGVKVISSVNITLGAEYELKYAVALVRPVSVAFEVVK 279
4702 Query: 267 -WQFYIGGVF-DIPCN--PNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGY 322
4703             ++ Y  GV+    C   P  ++H +L VGY  +N       PYW++KNSWGADWGE GY
4704 Sbjct: 280 GFKQYKSGVYASTECGDTPMDVNHAVLAVGYGVEN-----GTPYWLIKNSWGADWGEDGY 334
4706 Query: 323 IYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
4707              +  GKN CGV+   S  I+
4708 Sbjct: 335 FKMEMGKNMCGVATCASYPIV 355
4711 >sp|P43156|CYSP_HEMSP THIOL PROTEASE SEN102 PRECURSOR
4712           Length = 360
4714  Score =  373 bits (947), Expect = e-103
4715  Identities = 127/352 (36%), Positives = 181/352 (51%), Gaps = 30/352 (8%)
4717 Query: 3   VILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQ--SQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIE 60
4718            V L F+    ++  + + +  E+   + + +++         +E   RF +FK N+  I 
4719 Sbjct: 12  VALSFLSIAQSIPFTEKDLASEDSLWNLYEKWRTHHTVARDLDEKNRRFNVFKENVKFIH 71
4721 Query: 61  ELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADY---LDDEFINS 117
4722            E N       A  K  +NKF D+++ EF++ Y  +K         +         E + S
4723 Sbjct: 72  EFNQK---KDAPYKLALNKFGDMTNQEFRSKYAGSKIQHHRSQRGIQKNTGSFMYENVGS 128
4725 Query: 118 IPT-AFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHE 176
4726            +P  + DWR +GAVT VK+QGQCGSCW+FST  +VEG + I   +LVSLSEQ LVDCD  
4727 Sbjct: 129 LPAASIDWRAKGAVTGVKDQGQCGSCWAFSTIASVEGINQIKTGELVSLSEQELVDCD-- 186
4729 Query: 177 CMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKIS 236
4730                    + +EGCNGGL   A+ +I KN GI TE SYPY  + GT  +    +    I 
4731 Sbjct: 187 -------TSYNEGCNGGLMDYAFEFIQKN-GITTEDSYPYAEQDGTCASNLLNSPVVSID 238
4733 Query: 237 NFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYS 294
4734                +P N        V+  P++++ +A    +QFY  GVF   C    LDHG+ IVGY 
4735 Sbjct: 239 GHQDVPANNENALMQAVANQPISVSIEASGYGFQFYSEGVFTGRCG-TELDHGVAIVGYG 297
4737 Query: 295 AKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG----KNTCGVSNFVSTSI 342
4738            A     R    YWIVKNSWG +WGE GYI ++RG    +  CG++   S  I
4739 Sbjct: 298 AT----RDGTKYWIVKNSWGEEWGESGYIRMQRGISDKRGKCGIAMEASYPI 345
4742 >sp|P49935|CATH_MOUSE CATHEPSIN H PRECURSOR (CATHEPSIN B3) (CATHEPSIN BA)
4743           Length = 333
4745  Score =  372 bits (944), Expect = e-103
4746  Identities = 114/324 (35%), Positives = 164/324 (50%), Gaps = 28/324 (8%)
4748 Query: 25  EQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLS 84
4749            E+  F  +  +  K YS  EY  R ++F +N  KI+  N          K  +N+F+D+S
4750 Sbjct: 29  EKFHFKSWMKQHQKTYSSVEYNHRLQMFANNWRKIQAHNQRN----HTFKMALNQFSDMS 84
4752 Query: 85  SDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAV-TPVKNQGQCGSCW 143
4753              E K+ +L ++          ++YL        P++ DWR +G V +PVKNQG C SCW
4754 Sbjct: 85  FAEIKHKFLWSEPQ--NCSATKSNYLRGT--GPYPSSMDWRKKGNVVSPVKNQGACASCW 140
4756 Query: 144 SFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYII 203
4757            +FSTTG +E    I+  K++SL+EQ LVDC             + GC GGL   A+ YI+
4758 Sbjct: 141 TFSTTGALESAVAIASGKMLSLAEQQLVDCAQAFN--------NHGCKGGLPSQAFEYIL 192
4760 Query: 204 KNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKN-ETVMAGYIVSTGPLAIAA 262
4761             N GI  E SYPY  +  + C FN     A + N   I  N E  M   +    P++ A 
4762 Sbjct: 193 YNKGIMEEDSYPYIGKD-SSCRFNPQKAVAFVKNVVNITLNDEAAMVEAVALYNPVSFAF 251
4764 Query: 263 DAV-EWQFYIGGVFDIPCN---PNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWG 318
4765            +   ++  Y  GV+        P+ ++H +L VGY  +N +      YWIVKNSWG+ WG
4766 Sbjct: 252 EVTEDFLMYKSGVYSSKSCHKTPDKVNHAVLAVGYGEQNGLL-----YWIVKNSWGSQWG 306
4768 Query: 319 EQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
4769            E GY  + RGKN CG++   S  I
4770 Sbjct: 307 ENGYFLIERGKNMCGLAACASYPI 330
4773 >sp|P25778|ORYC_ORYSA ORYZAIN GAMMA CHAIN PRECURSOR
4774           Length = 362
4776  Score =  370 bits (940), Expect = e-102
4777  Identities = 110/322 (34%), Positives = 164/322 (50%), Gaps = 27/322 (8%)
4779 Query: 28  QFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSD 86
4780            +F  F  +  K+Y    E   RF IF  +L  +   N   + ++     G+N+FAD+S +
4781 Sbjct: 61  RFARFAVRHGKRYGDAAEVQRRFRIFSESLELVRSTNRRGLPYR----LGINRFADMSWE 116
4783 Query: 87  EFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFS 146
4784            EF+   L    A       +A         ++P   DWR  G V+PVK+QG CGSCW FS
4785 Sbjct: 117 EFQASRLG---AAQNCSATLAGNHRMRDAPALPETKDWREDGIVSPVKDQGHCGSCWPFS 173
4787 Query: 147 TTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNG 206
4788            TTG++E ++  +    VSLSEQ L DC      +        GC+GGL   A+ YI  NG
4789 Sbjct: 174 TTGSLEARYTQATGPPVSLSEQQLADCATRYNNF--------GCSGGLPSQAFEYIKYNG 225
4791 Query: 207 GIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIP-KNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV 265
4792            G+ TE +YPYT   G  C++   N G K+ +   I    E  +   +    P+++A   +
4793 Sbjct: 226 GLDTEEAYPYTGVNGI-CHYKPENAGVKVLDSVNITLVAEDELKNAVGLVRPVSVAFQVI 284
4795 Query: 266 E-WQFYIGGVF---DIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQG 321
4796              ++ Y  GV+       +P  ++H +L VGY  +N +     PYW++KNSWGADWG+ G
4797 Sbjct: 285 NGFRMYKSGVYTSDHCGTSPMDVNHAVLAVGYGVENGV-----PYWLIKNSWGADWGDNG 339
4799 Query: 322 YIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
4800            Y  +  GKN CG++   S  I+
4801 Sbjct: 340 YFTMEMGKNMCGIATCASYPIV 361
4804 >sp|P00785|ACTN_ACTCH ACTINIDAIN PRECURSOR (ACTINIDIN)
4805           Length = 380
4807  Score =  368 bits (936), Expect = e-102
4808  Identities = 116/352 (32%), Positives = 180/352 (50%), Gaps = 29/352 (8%)
4810 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPP----EEQSQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSN 55
4811            M ++    L + ++  +++ +      E ++ +  +  K+ K Y+   E+  RFEIFK  
4812 Sbjct: 10  MSLLFFSTLLILSLAFNAKNLTQRTNDEVKAMYESWLIKYGKSYNSLGEWERRFEIFKET 69
4814 Query: 56  LGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFI 115
4815            L  I+E N    +     K G+N+FADL+ +EF++ YL       ++   V++  +  F 
4816 Sbjct: 70  LRFIDEHNA---DTNRSYKVGLNQFADLTDEEFRSTYLGFTSG--SNKTKVSNRYEPRFG 124
4818 Query: 116 NSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDH 175
4819              +P+  DWR+ GAV  +K+QG+CG CW+FS    VEG + I    L+SLSEQ L+DC  
4820 Sbjct: 125 QVLPSYVDWRSAGAVVDIKSQGECGGCWAFSAIATVEGINKIVTGVLISLSEQELIDC-- 182
4822 Query: 176 ECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKI 235
4823                  G      GCNGG   + + +II NGGI TE +YPYTA+ G             I
4824 Sbjct: 183 ------GRTQNTRGCNGGYITDGFQFIINNGGINTEENYPYTAQDGECNLDLQNEKYVTI 236
4826 Query: 236 SNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGY 293
4827              +  +P N        V+  P+++A DA    ++ Y  G+F  PC   ++DH + IVGY
4828 Sbjct: 237 DTYENVPYNNEWALQTAVTYQPVSVALDAAGDAFKHYSSGIFTGPCG-TAIDHAVTIVGY 295
4830 Query: 294 SAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK---NTCGVSNFVSTSI 342
4831              +       + YWIVKNSW   WGE+GY+ + R      TCG++   S  +
4832 Sbjct: 296 GTEG-----GIDYWIVKNSWDTTWGEEGYMRILRNVGGAGTCGIATMPSYPV 342
4835 >sp|P41721|CATV_NPVBM VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)
4836           Length = 323
4838  Score =  367 bits (932), Expect = e-101
4839  Identities = 131/342 (38%), Positives = 180/342 (52%), Gaps = 26/342 (7%)
4841 Query: 5   LLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKIEELN 63
4842            +LF L V+ V  S+   P +  + F EF  +FNK YS E E L RF+IF+ NL +I    
4843 Sbjct: 4   ILFYLFVYAVVKSAAYDPLKAPNYFEEFVHRFNKNYSSEVEKLRRFKIFQHNLNEI---- 59
4845 Query: 64  LIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD 123
4846             I  N     K+ +NKF+DLS DE    Y        T +      LD       P  FD
4847 Sbjct: 60  -INKNQNDSAKYEINKFSDLSKDETIAKYTGLSLPTQTQNFCKVILLDQPPGKG-PLEFD 117
4849 Query: 124 WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGE 183
4850            WR    VT VKNQG CG+CW+F+T G++E Q  I  N+L++LSEQ ++DCD         
4851 Sbjct: 118 WRRLNKVTSVKNQGMCGACWAFATLGSLESQFAIKHNELINLSEQQMIDCD--------- 168
4853 Query: 184 EACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISN-FTMIP 242
4854               D GCNGGL   A+  IIK GG+Q ES YPY A     C  NS     ++ + +  I 
4855 Sbjct: 169 -FVDAGCNGGLLHTAFEAIIKMGGVQLESDYPYEA-DNNNCRMNSNKFLVQVKDCYRYII 226
4857 Query: 243 KNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRK 302
4858              E  +   +   GP+ +A DA +   Y  G+    C  + L+H +L+VGY  +N     
4859 Sbjct: 227 VYEEKLKDLLPLVGPIPMAIDAADIVNYKQGIIKY-CFDSGLNHAVLLVGYGVEN----- 280
4861 Query: 303 NMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSN-FVSTSII 343
4862            N+PYW  KN+WG DWGE G+  +++  N CG+ N   ST++I
4863 Sbjct: 281 NIPYWTFKNTWGTDWGEDGFFRVQQNINACGMRNELASTAVI 322
4866 >sp|Q02765|CATS_RAT CATHEPSIN S PRECURSOR
4867           Length = 330
4869  Score =  365 bits (926), Expect = e-100
4870  Identities = 104/330 (31%), Positives = 161/330 (48%), Gaps = 22/330 (6%)
4872 Query: 18  SRGIPPEEQSQFLEFQD-KFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFG 76
4873            +    P     +  ++  +  +     E   R  I++ NL  I   NL           G
4874 Sbjct: 15  ATAERPTLDHHWDLWKKTRMRRNTDQNEEDVRRLIWEKNLKFIMLHNLEHSMGMHSYSVG 74
4876 Query: 77  VNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQ 136
4877            +N   D++ +E   Y  + +     +         ++    +P + DWR +G VT VK Q
4878 Sbjct: 75  MNHMGDMTPEEVIGYMGSLRIPRPWNRSGTLKSSSNQT---LPDSVDWREKGCVTNVKYQ 131
4880 Query: 137 GQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQP 196
4881            G CGSCW+FS  G +EGQ  +   KLVSLS QNLVDC  E      E+  ++GC GG   
4882 Sbjct: 132 GSCGSCWAFSAEGALEGQLKLKTGKLVSLSAQNLVDCSTE------EKYGNKGCGGGFMT 185
4884 Query: 197 NAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIP-KNETVMAGYIVST 255
4885             A+ YII +  I +E+SYPY A    +C ++  N  A  S +  +P  +E  +   + + 
4886 Sbjct: 186 EAFQYII-DTSIDSEASYPYKAMD-EKCLYDPKNRAATCSRYIELPFGDEEALKEAVATK 243
4888 Query: 256 GPLAIAADA---VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNS 312
4889            GP+++  D      +  Y  GV+D P    +++HG+L+VGY            YW+VKNS
4890 Sbjct: 244 GPVSVGIDDASHSSFFLYQSGVYDDPSCTENMNHGVLVVGYGT-----LDGKDYWLVKNS 298
4892 Query: 313 WGADWGEQGYIYLRR-GKNTCGVSNFVSTS 341
4893            WG  +G+QGYI + R  KN CG++++ S  
4894 Sbjct: 299 WGLHFGDQGYIRMARNNKNHCGIASYCSYP 328
4897 >sp|P14658|CYSP_TRYBB CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR
4898           Length = 450
4900  Score =  365 bits (926), Expect = e-100
4901  Identities = 136/346 (39%), Positives = 190/346 (54%), Gaps = 26/346 (7%)
4903 Query: 3   VILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEE 61
4904            V+L     + +V + S  +    + +F  F+ K+ K Y   +E   RF  F+ N+ + + 
4905 Sbjct: 15  VLLAMAACLASVALGSLHVEESLEMRFAAFKKKYGKVYKDAKEEAFRFRAFEENMEQAK- 73
4907 Query: 62  LNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTA 121
4908               I         FGV  F+D++ +EF+  Y N           +   ++       P A
4909 Sbjct: 74  ---IQAAANPYATFGVTPFSDMTREEFRARYRNGASYFAAAQKRLRKTVNVT-TGRAPAA 129
4911 Query: 122 FDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYE 181
4912             DWR +GAVTPVK QGQCGSCW+FST GN+EGQ  ++ N LVSLSEQ LV CD       
4913 Sbjct: 130 VDWREKGAVTPVKVQGQCGSCWAFSTIGNIEGQWQVAGNPLVSLSEQMLVSCDT------ 183
4915 Query: 182 GEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK-NGG-IQTESSYPYTAETGT--QCNFNSANIGAKISN 237
4916                 D GCNGGL  NA+N+I+  NGG + TE+SYPY +  G   QC  N   IGA I++
4917 Sbjct: 184 ----IDSGCNGGLMDNAFNWIVNSNGGNVFTEASYPYVSGNGEQPQCQMNGHEIGAAITD 239
4919 Query: 238 FTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKN 297
4920               +P++E  +A Y+   GPLAIA DA  +  Y GG+    C    LDHG+L+VGY+   
4921 Sbjct: 240 HVDLPQDEDAIAAYLAENGPLAIAVDAESFMDYNGGIL-TSCTSKQLDHGVLLVGYN--- 295
4923 Query: 298 TIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
4924                 N PYWI+KNSW   WGE GYI + +G N C ++  VS++++
4925 Sbjct: 296 --DNSNPPYWIIKNSWSNMWGEDGYIRIEKGTNQCLMNQAVSSAVV 339
4928 >sp|P25783|CATV_NPVAC VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)
4929           Length = 323
4931  Score =  363 bits (923), Expect = e-100
4932  Identities = 129/342 (37%), Positives = 178/342 (51%), Gaps = 26/342 (7%)
4934 Query: 5   LLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKIEELN 63
4935            +LF L V+ V  S+     +  + F EF  +FNK Y  E E L RF+IF+ NL +I    
4936 Sbjct: 4   ILFYLFVYGVVNSAAYDLLKAPNYFEEFVHRFNKDYGSEVEKLRRFKIFQHNLNEI---- 59
4938 Query: 64  LIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD 123
4939             I  N     K+ +NKF+DLS DE    Y      I T +      LD       P  FD
4940 Sbjct: 60  -INKNQNDSAKYEINKFSDLSKDETIAKYTGLSLPIQTQNFCKVIVLDQPPGKG-PLEFD 117
4942 Query: 124 WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGE 183
4943            WR    VT VKNQG CG+CW+F+T  ++E Q  I  N+L++LSEQ ++DCD         
4944 Sbjct: 118 WRRLNKVTSVKNQGMCGACWAFATLASLESQFAIKHNQLINLSEQQMIDCD--------- 168
4946 Query: 184 EACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISN-FTMIP 242
4947               D GCNGGL   A+  IIK GG+Q ES YPY A     C  NS     ++ + +  I 
4948 Sbjct: 169 -FVDAGCNGGLLHTAFEAIIKMGGVQLESDYPYEA-DNNNCRMNSNKFLVQVKDCYRYIT 226
4950 Query: 243 KNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRK 302
4951              E  +   +   GP+ +A DA +   Y  G+    C  + L+H +L+VGY  +N     
4952 Sbjct: 227 VYEEKLKDLLRLVGPIPMAIDAADIVNYKQGIIKY-CFNSGLNHAVLLVGYGVEN----- 280
4954 Query: 303 NMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSN-FVSTSII 343
4955            N+PYW  KN+WG DWGE G+  +++  N CG+ N   ST++I
4956 Sbjct: 281 NIPYWTFKNTWGTDWGEDGFFRVQQNINACGMRNELASTAVI 322
4959 >sp|P41715|CATV_NPVCF VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)
4960           Length = 324
4962  Score =  363 bits (922), Expect = e-100
4963  Identities = 128/343 (37%), Positives = 187/343 (54%), Gaps = 25/343 (7%)
4965 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKI 59
4966            M  I+L++L    V  ++  +  +  + F +F  KFNK YS E E L RF+IF+ NL +I
4967 Sbjct: 1   MNKIVLYLLVYGAVQCAAYDV-LKAPNYFEDFLHKFNKSYSSESEKLRRFQIFRHNLEEI 59
4969 Query: 60  EELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP 119
4970               N    ++ +  ++ +NKFADLS DE  + Y      + T +      LD       P
4971 Sbjct: 60  INKN----HNDSTAQYEINKFADLSKDETISKYTGLSLPLQTQNFCEVVVLDRPPDKG-P 114
4973 Query: 120 TAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECME 179
4974              FDWR    VT VKNQG CG+CW+F+T G++E Q  I  N+ ++LSEQ L+DCD     
4975 Sbjct: 115 LEFDWRRLNKVTSVKNQGMCGACWAFATLGSLESQFAIKHNQFINLSEQQLIDCD----- 169
4977 Query: 180 YEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISN-F 238
4978                   D GC+GGL   A+  ++  GGIQ ES YPY A  G  C  N+A    K+   +
4979 Sbjct: 170 -----FVDAGCDGGLLHTAFEAVMNMGGIQAESDYPYEANNG-DCRANAAKFVVKVKKCY 223
4981 Query: 239 TMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNT 298
4982              I   E  +   + S GP+ +A DA +   Y  G+    C  + L+H +L+VGY+ +N 
4983 Sbjct: 224 RYITVFEEKLKDLLRSVGPIPVAIDASDIVNYKRGIMKY-CANHGLNHAVLLVGYAVENG 282
4985 Query: 299 IFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTS 341
4986            +     P+WI+KN+WGADWGEQGY  +++  N CG+ N + +S
4987 Sbjct: 283 V-----PFWILKNTWGADWGEQGYFRVQQNINACGIQNELPSS 320
4990 >sp|P25250|CYS2_HORVU CYSTEINE PROTEINASE EP-B 2 PRECURSOR
4991           Length = 373
4993  Score =  361 bits (918), Expect = e-100
4994  Identities = 121/358 (33%), Positives = 170/358 (46%), Gaps = 38/358 (10%)
4996 Query: 5   LLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQ---------FLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSN 55
4997            +  VLAV  V + S  IP E++           +  +Q     +  H E   RF  FKSN
4998 Sbjct: 14  VAAVLAVAAVELCS-AIPMEDKDLESEEALWDLYERWQSAHRVRRHHAEKHRRFGTFKSN 72
5000 Query: 56  LGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFI 115
5001               I   N          +  +N+F D+   EF+  ++ +         P         +
5002 Sbjct: 73  AHFIHSHNKR---GDHPYRLHLNRFGDMDQAEFRATFVGDLRRDTPSKPPSVPGFMYAAL 129
5004 Query: 116 N--SIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDC 173
5005            N   +P + DWR +GAVT VK+QG+CGSCW+FST  +VEG + I    LVSLSEQ L+DC
5006 Sbjct: 130 NVSDLPPSVDWRQKGAVTGVKDQGKCGSCWAFSTVVSVEGINAIRTGSLVSLSEQELIDC 189
5008 Query: 174 DHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQ---CNFNSAN 230
5009            D          A ++GC GGL  NA+ YI  NGG+ TE++YPY A  GT        ++ 
5010 Sbjct: 190 D---------TADNDGCQGGLMDNAFEYIKNNGGLITEAAYPYRAARGTCNVARAAQNSP 240
5012 Query: 231 IGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGI 288
5013            +   I     +P N        V+  P+++A +A    + FY  GVF   C    LDHG+
5014 Sbjct: 241 VVVHIDGHQDVPANSEEDLARAVANQPVSVAVEASGKAFMFYSEGVFTGECG-TELDHGV 299
5016 Query: 289 LIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK----NTCGVSNFVSTSI 342
5017             +VGY     +      YW VKNSWG  WGEQGYI + +        CG++   S  +
5018 Sbjct: 300 AVVGYG----VAEDGKAYWTVKNSWGPSWGEQGYIRVEKDSGASGGLCGIAMEASYPV 353
5021 >sp|P25249|CYS1_HORVU CYSTEINE PROTEINASE EP-B 1 PRECURSOR
5022           Length = 371
5024  Score =  361 bits (917), Expect = 1e-99
5025  Identities = 121/358 (33%), Positives = 170/358 (46%), Gaps = 38/358 (10%)
5027 Query: 5   LLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQ---------FLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSN 55
5028            +  VLAV  V + S  IP E++           +  +Q     +  H E   RF  FKSN
5029 Sbjct: 14  VAAVLAVAAVELCS-AIPMEDKDLESEEALWDLYERWQSAHRVRRHHAEKHRRFGTFKSN 72
5031 Query: 56  LGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFI 115
5032               I   N          +  +N+F D+   EF+  ++ +         P         +
5033 Sbjct: 73  AHFIHSHNKR---GDHPYRLHLNRFGDMDQAEFRATFVGDLRRDTPAKPPSVPGFMYAAL 129
5035 Query: 116 N--SIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDC 173
5036            N   +P + DWR +GAVT VK+QG+CGSCW+FST  +VEG + I    LVSLSEQ L+DC
5037 Sbjct: 130 NVSDLPPSVDWRQKGAVTGVKDQGKCGSCWAFSTVVSVEGINAIRTGSLVSLSEQELIDC 189
5039 Query: 174 DHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQ---CNFNSAN 230
5040            D          A ++GC GGL  NA+ YI  NGG+ TE++YPY A  GT        ++ 
5041 Sbjct: 190 D---------TADNDGCQGGLMDNAFEYIKNNGGLITEAAYPYRAARGTCNVARAAQNSP 240
5043 Query: 231 IGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGI 288
5044            +   I     +P N        V+  P+++A +A    + FY  GVF   C    LDHG+
5045 Sbjct: 241 VVVHIDGHQDVPANSEEDLARAVANQPVSVAVEASGKAFMFYSEGVFTGDCG-TELDHGV 299
5047 Query: 289 LIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK----NTCGVSNFVSTSI 342
5048             +VGY     +      YW VKNSWG  WGEQGYI + +        CG++   S  +
5049 Sbjct: 300 AVVGYG----VAEDGKAYWTVKNSWGPSWGEQGYIRVEKDSGASGGLCGIAMEASYPV 353
5052 >sp|Q26534|CATL_SCHMA CATHEPSIN L PRECURSOR (SMCL1)
5053           Length = 319
5055  Score =  361 bits (916), Expect = 2e-99
5056  Identities = 128/326 (39%), Positives = 190/326 (58%), Gaps = 22/326 (6%)
5058 Query: 21  IPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKF 80
5059            +P     ++++F+ K+ K+Y   E   RF IFKSN+ K +   L  +  +    +GV  +
5060 Sbjct: 12  LPGNVDEKYVQFKLKYRKQYHETEDEIRFNIFKSNILKAQ---LYQVFVRGSAIYGVTPY 68
5062 Query: 81  ADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCG 140
5063            +DL++DEF   +L     + +        L  E +N+IP  FDWR +GAVT VKNQG CG
5064 Sbjct: 69  SDLTTDEFARTHLTASWVVPSSRSNTPTSLGKE-VNNIPKNFDWREKGAVTEVKNQGMCG 127
5066 Query: 141 SCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYN 200
5067            SCW+FSTTGNVE Q F    KL+SLSEQ LVDCD            D+GCNGGL  NAY 
5068 Sbjct: 128 SCWAFSTTGNVESQWFRKTGKLLSLSEQQLVDCDG----------LDDGCNGGLPSNAYE 177
5070 Query: 201 YIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAI 260
5071             IIK GG+  E +YPY A+   +C+  +  +   I++   + ++ET +A ++     +++
5072 Sbjct: 178 SIIKMGGLMLEDNYPYDAKN-EKCHLKTDGVAVYINSSVNLTQDETELAAWLYHNSTISV 236
5074 Query: 261 AADAVEWQFYIGGV---FDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADW 317
5075              +A+  QFY  G+   + I C+   LDH +L+VGY     +  KN P+WIVKNSWG +W
5076 Sbjct: 237 GMNALLLQFYQHGISHPWWIFCSKYLLDHAVLLVGYG----VSEKNEPFWIVKNSWGVEW 292
5078 Query: 318 GEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
5079            GE GY  + RG  +CG++   ++++I
5080 Sbjct: 293 GENGYFRMYRGDGSCGINTVATSAMI 318
5083 >sp|P25779|CYSP_TRYCR CRUZIPAIN PRECURSOR (MAJOR CYSTEINE PROTEINASE) (CRUZAINE)
5084           Length = 467
5086  Score =  356 bits (904), Expect = 4e-98
5087  Identities = 133/350 (38%), Positives = 184/350 (52%), Gaps = 30/350 (8%)
5089 Query: 3   VILLFVLAVFTVFV----SSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLG 57
5090            ++L  VL V    V    +S        SQF EF+ K  + Y S  E   R  +F+ NL 
5091 Sbjct: 8   LLLAAVLVVMACLVPAATASLHAEETLTSQFAEFKQKHGRVYESAAEEAFRLSVFRENLF 67
5093 Query: 58  KIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINS 117
5094                      +      FGV  F+DL+ +EF++ Y +N  A F      A       +  
5095 Sbjct: 68  LARLHAAANPH----ATFGVTPFSDLTREEFRSRY-HNGAAHFAAAQERARVPVKVEVVG 122
5097 Query: 118 IPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHEC 177
5098             P A DWR RGAVT VK+QGQCGSCW+FS  GNVE Q F++ + L +LSEQ LV CD   
5099 Sbjct: 123 APAAVDWRARGAVTAVKDQGQCGSCWAFSAIGNVECQWFLAGHPLTNLSEQMLVSCDK-- 180
5101 Query: 178 MEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK--NGGIQTESSYPYTAETG--TQCNFNSANIGA 233
5102                     D GC+GGL  NA+ +I++  NG + TE SYPY +  G    C  +   +GA
5103 Sbjct: 181 --------TDSGCSGGLMNNAFEWIVQENNGAVYTEDSYPYASGEGISPPCTTSGHTVGA 232
5105 Query: 234 KISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGY 293
5106             I+    +P++E  +A ++   GP+A+A DA  W  Y GGV    C    LDHG+L+VGY
5107 Sbjct: 233 TITGHVELPQDEAQIAAWLAVNGPVAVAVDASSWMTYTGGVM-TSCVSEQLDHGVLLVGY 291
5109 Query: 294 SAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
5110            +    +     PYWI+KNSW   WGE+GYI + +G N C V    S++++
5111 Sbjct: 292 NDSAAV-----PYWIIKNSWTTQWGEEGYIRIAKGSNQCLVKEEASSAVV 336
5114 >sp|O10364|CATV_NPVOP VIRAL CATHEPSIN (V-CATH)
5115           Length = 324
5117  Score =  351 bits (890), Expect = 2e-96
5118  Identities = 122/343 (35%), Positives = 181/343 (52%), Gaps = 25/343 (7%)
5120 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKI 59
5121            M  I+L +L    V  ++  +  +  + F +F  KFNK YS E E L RF+IF+ NL +I
5122 Sbjct: 1   MNKIMLCLLVCGVVHAATYDL-LKAPNYFEDFLHKFNKNYSSESEKLHRFKIFQHNLEEI 59
5124 Query: 60  EELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP 119
5125               N     + +  ++ +NKF+DLS +E  + Y        T +      LD    +  P
5126 Sbjct: 60  INKNQ----NDSTAQYEINKFSDLSKEEAISKYTGLSLPHQTQNFCEVVILDRPP-DRGP 114
5128 Query: 120 TAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECME 179
5129              FDWR    VT VKNQG CG+CW+F+T G++E Q  I  N+L++LSEQ  +DCD     
5130 Sbjct: 115 LEFDWRQFNKVTSVKNQGVCGACWAFATLGSLESQFAIKYNRLINLSEQQFIDCDR---- 170
5132 Query: 180 YEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKI-SNF 238
5133                   + GC+GGL   A+   ++ GG+Q ES YPY    G QC  N       + S  
5134 Sbjct: 171 ------VNAGCDGGLLHTAFESAMEMGGVQMESDYPYETANG-QCRINPNRFVVGVRSCR 223
5136 Query: 239 TMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNT 298
5137              I   E  +   + + GP+ +A DA +   Y  G+    C  + L+H +L+VGY+ +N 
5138 Sbjct: 224 RYIVMFEEKLKDLLRAVGPIPVAIDASDIVNYRRGIMR-QCANHGLNHAVLLVGYAVEN- 281
5140 Query: 299 IFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTS 341
5141                N+PYWI+KN+WG DWGE GY  +++  N CG+ N + +S
5142 Sbjct: 282 ----NIPYWILKNTWGTDWGEDGYFRVQQNINACGIRNELVSS 320
5145 >sp|P36400|LCPB_LEIME CYSTEINE PROTEINASE B PRECURSOR
5146           Length = 443
5148  Score =  348 bits (883), Expect = 1e-95
5149  Identities = 123/348 (35%), Positives = 184/348 (52%), Gaps = 28/348 (8%)
5151 Query: 4   ILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEEL 62
5152            ++  VLA       +  +     + F EF+  + + Y    E  +R   F+ NL  + E 
5153 Sbjct: 13  VVCVVLAAACAPARAIHVGTPAAALFEEFKRTYGRAYETLAEEQQRLANFERNLELMREH 72
5155 Query: 63  NLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDE--FINSIPT 120
5156                 +     +FG+ KF DLS  EF   YLN            A +       ++++P 
5157 Sbjct: 73  QARNPH----AQFGITKFFDLSEAEFAARYLNGAAYFAAAKRHAAQHYRKARADLSAVPD 128
5159 Query: 121 AFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEY 180
5160            A DWR +GAVTPVK+QG CGSCW+FS  GN+EGQ +++ ++LVSLSEQ LV CD      
5161 Sbjct: 129 AVDWREKGAVTPVKDQGACGSCWAFSAVGNIEGQWYLAGHELVSLSEQQLVSCDD----- 183
5163 Query: 181 EGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK--NGGIQTESSYPYTAETG---TQCNFNSANIGAKI 235
5164                  ++GC+GGL   A++++++  NG + TE SYPY +  G      N +   +GA+I
5165 Sbjct: 184 -----MNDGCDGGLMLQAFDWLLQNTNGHLHTEDSYPYVSGNGYVPECSNSSELVVGAQI 238
5167 Query: 236 SNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSA 295
5168                +I  +E  MA ++   GP+AIA DA  +  Y  GV    C    L+HG+L+VGY  
5169 Sbjct: 239 DGHVLIGSSEKAMAAWLAKNGPIAIALDASSFMSYKSGVL-TACIGKQLNHGVLLVGYDM 297
5171 Query: 296 KNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
5172               +     PYW++KNSWG DWGEQGY+ +  G N C +S +  ++ +
5173 Sbjct: 298 TGEV-----PYWVIKNSWGGDWGEQGYVRVVMGVNACLLSEYPVSAHV 340
5176 >sp|P25775|LCPA_LEIME CYSTEINE PROTEINASE A PRECURSOR
5177           Length = 354
5179  Score =  348 bits (883), Expect = 1e-95
5180  Identities = 143/355 (40%), Positives = 190/355 (53%), Gaps = 36/355 (10%)
5182 Query: 5   LLFVLAVFTVFVSSRGI-------PPEEQ----SQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIF 52
5183            LLF + V  +FV   G        PP +     + +  F+ +  K +  + E   RF  F
5184 Sbjct: 7   LLFAIVVTILFVVCYGSALIAQTPPPVDNFVASAHYGSFKKRHGKAFGGDAEEGHRFNAF 66
5186 Query: 53  KSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDD 112
5187            K N+     LN    +   D      KFADL+  EF   YLN             D   D
5188 Sbjct: 67  KQNMQTAYFLNTQNPHAHYDVS---GKFADLTPQEFAKLYLNPDYYARHLKNHKEDVHVD 123
5190 Query: 113 EFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVD 172
5191            +   S   + DWR +GAVTPVKNQG CGSCW+FS  GN+EGQ   S + LVSLSEQ LV 
5192 Sbjct: 124 DSAPSGVMSVDWRDKGAVTPVKNQGLCGSCWAFSAIGNIEGQWAASGHSLVSLSEQMLVS 183
5194 Query: 173 CDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK--NGGIQTESSYPYTAETGTQ--CNFNS 228
5195            CD            DEGCNGGL   A N+I++  NG + TE+SYPYT+  GT+  C+ + 
5196 Sbjct: 184 CD----------NIDEGCNGGLMDQAMNWIMQSHNGSVFTEASYPYTSGGGTRPPCH-DE 232
5198 Query: 229 ANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGI 288
5199              +GAKI+ F  +P +E  +A ++   GP+A+A DA  WQ Y GGV    C   SL+HG+
5200 Sbjct: 233 GEVGAKITGFLSLPHDEERIAEWVEKRGPVAVAVDATTWQLYFGGVVS-LCLAWSLNHGV 291
5202 Query: 289 LIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
5203            LIVG++          PYWIVKNSWG+ WGE+GYI L  G N C + N+  ++ +
5204 Sbjct: 292 LIVGFN-----KNAKPPYWIVKNSWGSSWGEKGYIRLAMGSNQCMLKNYPVSATV 341
5207 >sp|Q05094|CYS2_LEIPI CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR (AMASTIGOTE CYSTEINE PROTEINASE
5208            A-2)
5209           Length = 444
5211  Score =  347 bits (882), Expect = 2e-95
5212  Identities = 124/349 (35%), Positives = 187/349 (53%), Gaps = 29/349 (8%)
5214 Query: 4   ILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEEL 62
5215            ++  VLA       +  +     + F EF+  + + Y    E  +R   F+ NL  + E 
5216 Sbjct: 13  VVCVVLAAACAPARAIHVGTPAAALFEEFKRTYGRAYETLAEEQQRLANFERNLELMREH 72
5218 Query: 63  NLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDE--FINSIPT 120
5219                 +     +FG+ KF DLS  EF   YLN            A +       ++++P 
5220 Sbjct: 73  QARNPH----AQFGITKFFDLSEAEFAARYLNGAAYFAAAKRHAAQHYRKARADLSAVPD 128
5222 Query: 121 AFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEY 180
5223            A DWR +GAVTPVK+QG CGSCW+FS  GN+EGQ +++ ++LVSLSEQ LV CD      
5224 Sbjct: 129 AVDWREKGAVTPVKDQGACGSCWAFSAVGNIEGQWYLAGHELVSLSEQQLVSCDD----- 183
5226 Query: 181 EGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK--NGGIQTESSYPYTAETG--TQCNFNSAN--IGAK 234
5227                  ++GC+GGL   A++++++  NG + TE SYPY +  G   +C+ +S    +GA+
5228 Sbjct: 184 -----MNDGCDGGLMLQAFDWLLQNTNGHLHTEDSYPYVSGNGYVPECSNSSEELVVGAQ 238
5230 Query: 235 ISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYS 294
5231            I    +I  +E  MA ++   GP+AIA DA  +  Y  GV    C    L+HG+L+VGY 
5232 Sbjct: 239 IDGHVLIGSSEKAMAAWLAKNGPIAIALDASSFMSYKSGVL-TACIGKQLNHGVLLVGYD 297
5234 Query: 295 AKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
5235                +     PYW++KNSWG DWGEQGY+ +  G N C +S +  ++ +
5236 Sbjct: 298 MTGEV-----PYWVIKNSWGGDWGEQGYVRVVMGVNACLLSEYPVSAHV 341
5239 >sp|P35591|CYS1_LEIPI CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR (AMASTIGOTE CYSTEINE PROTEINASE
5240            A-1)
5241           Length = 354
5243  Score =  347 bits (880), Expect = 3e-95
5244  Identities = 143/355 (40%), Positives = 190/355 (53%), Gaps = 36/355 (10%)
5246 Query: 5   LLFVLAVFTVFVSSRGI-------PPEEQ----SQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIF 52
5247            LLF + V  +FV   G        PP +     + +  F+ +  K +  + E   RF  F
5248 Sbjct: 7   LLFAIVVTILFVVCYGSALIAQTPPPVDNFVASAHYGSFKKRHGKAFGGDAEEGHRFNAF 66
5250 Query: 53  KSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDD 112
5251            K N+     LN    +   D      KFADL+  EF   YLN             D   D
5252 Sbjct: 67  KQNMQTAYFLNTQNPHAHYDVS---GKFADLTPQEFAKLYLNPDYYARHLKDHKEDVHVD 123
5254 Query: 113 EFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVD 172
5255            +   S   + DWR +GAVTPVKNQG CGSCW+FS  GN+EGQ   S + LVSLSEQ LV 
5256 Sbjct: 124 DSAPSGVMSVDWRDKGAVTPVKNQGLCGSCWAFSAIGNIEGQWAASGHSLVSLSEQMLVS 183
5258 Query: 173 CDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK--NGGIQTESSYPYTAETGTQ--CNFNS 228
5259            CD            DEGCNGGL   A N+I++  NG + TE+SYPYT+  GT+  C+ + 
5260 Sbjct: 184 CD----------NIDEGCNGGLMDQAMNWIMQSHNGSVFTEASYPYTSGGGTRPPCH-DE 232
5262 Query: 229 ANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGI 288
5263              +GAKI+ F  +P +E  +A ++   GP+A+A DA  WQ Y GGV    C   SL+HG+
5264 Sbjct: 233 GEVGAKITGFLSLPHDEERIAEWVEKRGPVAVAVDATTWQLYFGGVVS-LCLAWSLNHGV 291
5266 Query: 289 LIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
5267            LIVG++          PYWIVKNSWG+ WGE+GYI L  G N C + N+  ++ +
5268 Sbjct: 292 LIVGFN-----KNAKPPYWIVKNSWGSSWGEKGYIRLAMGSNQCMLKNYPVSATV 341
5271 >sp|P05994|PAP4_CARPA PAPAYA PROTEINASE IV PRECURSOR (PPIV) (PAPAYA PEPTIDASE B) (GLYCYL
5272            ENDOPEPTIDASE)
5273           Length = 348
5275  Score =  346 bits (879), Expect = 3e-95
5276  Identities = 111/321 (34%), Positives = 163/321 (50%), Gaps = 29/321 (9%)
5278 Query: 29  FLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDE 87
5279            F  +  K NK Y + +E L RFEIFK NL  I+E N +   +      G+N+F+DLS+DE
5280 Sbjct: 48  FNSWMLKHNKNYKNVDEKLYRFEIFKDNLKYIDERNKMINGYW----LGLNEFSDLSNDE 103
5282 Query: 88  FKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFST 147
5283            FK  Y+ +    +T+     ++++++ ++ +P + DWR +GAVTPVK+QG C SCW+FST
5284 Sbjct: 104 FKEKYVGSLPEDYTNQPYDEEFVNEDIVD-LPESVDWRAKGAVTPVKHQGYCESCWAFST 162
5286 Query: 148 TGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGG 207
5287               VEG + I    LV LSEQ LVDCD +            GCN G Q  +  Y+ +N G
5288 Sbjct: 163 VATVEGINKIKTGNLVELSEQELVDCDKQ----------SYGCNRGYQSTSLQYVAQN-G 211
5290 Query: 208 IQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-- 265
5291            I   + YPY A+  T           K +    +  N        ++  P+++  ++   
5292 Sbjct: 212 IHLRAKYPYIAKQQTCRANQVGGPKVKTNGVGRVQSNNEGSLLNAIAHQPVSVVVESAGR 271
5294 Query: 266 EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYL 325
5295            ++Q Y GG+F+  C    +DH +  VGY            Y ++KNSWG  WGE GYI +
5296 Sbjct: 272 DFQNYKGGIFEGSCG-TKVDHAVTAVGYGKSG-----GKGYILIKNSWGPGWGENGYIRI 325
5298 Query: 326 RRGKNT----CGVSNFVSTSI 342
5299            RR        CGV       I
5300 Sbjct: 326 RRASGNSPGVCGVYRSSYYPI 346
5303 >sp|P10056|PAP3_CARPA CARICAIN PRECURSOR (PAPAYA PROTEINASE OMEGA) (PAPAYA PROTEINASE
5304            III) (PPIII) (PAPAYA PEPTIDASE A)
5305           Length = 348
5307  Score =  341 bits (865), Expect = 1e-93
5308  Identities = 114/317 (35%), Positives = 162/317 (50%), Gaps = 26/317 (8%)
5310 Query: 29  FLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDE 87
5311            F  +    NK Y + +E L RFEIFK NL  I+E N    ++      G+N+FADLS+DE
5312 Sbjct: 48  FNSWMLNHNKFYENVDEKLYRFEIFKDNLNYIDETNKKNNSYW----LGLNEFADLSNDE 103
5314 Query: 88  FKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFST 147
5315            F   Y+ +      +     ++++++ +N +P   DWR +GAVTPV++QG CGSCW+FS 
5316 Sbjct: 104 FNEKYVGSLIDATIEQSYDEEFINEDTVN-LPENVDWRKKGAVTPVRHQGSCGSCWAFSA 162
5318 Query: 148 TGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGG 207
5319               VEG + I   KLV LSEQ LVDC+              GC GG  P A  Y+ KN G
5320 Sbjct: 163 VATVEGINKIRTGKLVELSEQELVDCERR----------SHGCKGGYPPYALEYVAKN-G 211
5322 Query: 208 IQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--V 265
5323            I   S YPY A+ GT           K S    +  N        ++  P+++  ++   
5324 Sbjct: 212 IHLRSKYPYKAKQGTCRAKQVGGPIVKTSGVGRVQPNNEGNLLNAIAKQPVSVVVESKGR 271
5326 Query: 266 EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYL 325
5327             +Q Y GG+F+ PC    +DH +  VGY            Y ++KNSWG  WGE+GYI +
5328 Sbjct: 272 PFQLYKGGIFEGPCG-TKVDHAVTAVGYGKSG-----GKGYILIKNSWGTAWGEKGYIRI 325
5330 Query: 326 RRG-KNTCGVSNFVSTS 341
5331            +R   N+ GV     +S
5332 Sbjct: 326 KRAPGNSPGVCGLYKSS 342
5335 >sp|P14080|PAP2_CARPA CHYMOPAPAIN PRECURSOR (PAPAYA PROTEINASE II) (PPII)
5336           Length = 352
5338  Score =  339 bits (860), Expect = 6e-93
5339  Identities = 119/321 (37%), Positives = 160/321 (49%), Gaps = 29/321 (9%)
5341 Query: 29  FLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDE 87
5342            F  +  K NK Y S +E + RFEIF+ NL  I+E N    ++      G+N FADLS+DE
5343 Sbjct: 48  FDSWMLKHNKIYESIDEKIYRFEIFRDNLMYIDETNKKNNSYW----LGLNGFADLSNDE 103
5345 Query: 88  FKNYYLNNKEAIFTDDLP-VADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFS 146
5346            FK  Y+      FT       +    + + + P + DWR +GAVTPVKNQG CGSCW+FS
5347 Sbjct: 104 FKKKYVGFVAEDFTGLEHFDNEDFTYKHVTNYPQSIDWRAKGAVTPVKNQGACGSCWAFS 163
5349 Query: 147 TTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNG 206
5350            T   VEG + I    L+ LSEQ LVDCD              GC GG Q  +  Y+  N 
5351 Sbjct: 164 TIATVEGINKIVTGNLLELSEQELVDCDKH----------SYGCKGGYQTTSLQYVANN- 212
5353 Query: 207 GIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA-- 264
5354            G+ T   YPY A+       +      KI+ +  +P N        ++  PL++  +A  
5355 Sbjct: 213 GVHTSKVYPYQAKQYKCRATDKPGPKVKITGYKRVPSNCETSFLGALANQPLSVLVEAGG 272
5357 Query: 265 VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIY 324
5358              +Q Y  GVFD PC    LDH +  VGY   +        Y I+KNSWG +WGE+GY+ 
5359 Sbjct: 273 KPFQLYKSGVFDGPCG-TKLDHAVTAVGYGTSD-----GKNYIIIKNSWGPNWGEKGYMR 326
5361 Query: 325 LRR----GKNTCGVSNFVSTS 341
5362            L+R     + TCGV       
5363 Sbjct: 327 LKRQSGNSQGTCGVYKSSYYP 347
5366 >sp|P00784|PAPA_CARPA PAPAIN PRECURSOR (PAPAYA PROTEINASE I) (PPI)
5367           Length = 345
5369  Score =  334 bits (848), Expect = 1e-91
5370  Identities = 107/321 (33%), Positives = 152/321 (47%), Gaps = 32/321 (9%)
5372 Query: 29  FLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDE 87
5373            F  +  K NK Y + +E + RFEIFK NL  I+E N    ++      G+N FAD+S+DE
5374 Sbjct: 48  FESWMLKHNKIYKNIDEKIYRFEIFKDNLKYIDETNKKNNSYW----LGLNVFADMSNDE 103
5376 Query: 88  FKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFST 147
5377            FK  Y  +    +T      + + ++   +IP   DWR +GAVTPVKNQG CGSCW+FS 
5378 Sbjct: 104 FKEKYTGSIAGNYTTTELSYEEVLNDGDVNIPEYVDWRQKGAVTPVKNQGSCGSCWAFSA 163
5380 Query: 148 TGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGG 207
5381               +EG   I    L   SEQ L+DCD              GCNGG   +A   + +  G
5382 Sbjct: 164 VVTIEGIIKIRTGNLNEYSEQELLDCDRR----------SYGCNGGYPWSALQLVAQ-YG 212
5384 Query: 208 IQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-- 265
5385            I   ++YPY        +       AK      +         Y ++  P+++  +A   
5386 Sbjct: 213 IHYRNTYPYEGVQRYCRSREKGPYAAKTDGVRQVQPYNEGALLYSIANQPVSVVLEAAGK 272
5388 Query: 266 EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYL 325
5389            ++Q Y GG+F  PC  N +DH +  VGY            Y ++KNSWG  WGE GYI +
5390 Sbjct: 273 DFQLYRGGIFVGPCG-NKVDHAVAAVGYG---------PNYILIKNSWGTGWGENGYIRI 322
5392 Query: 326 RRGKNT----CGVSNFVSTSI 342
5393            +RG       CG+       +
5394 Sbjct: 323 KRGTGNSYGVCGLYTSSFYPV 343
5397 >sp|P22895|P34_SOYBN P34 PROBABLE THIOL PROTEASE PRECURSOR
5398           Length = 379
5400  Score =  331 bits (840), Expect = 1e-90
5401  Identities = 109/334 (32%), Positives = 169/334 (49%), Gaps = 33/334 (9%)
5403 Query: 24  EEQSQFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFAD 82
5404            +  S F  ++ +  + Y +HEE  +R EIFK+N   I ++N          + G+NKFAD
5405 Sbjct: 39  QVSSLFQLWKSEHGRVYHNHEEEAKRLEIFKNNSNYIRDMNA-NRKSPHSHRLGLNKFAD 97
5407 Query: 83  LSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDE--FINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCG 140
5408            ++  EF   YL   + +          +  E    +  P ++DWR +G +T VK QG CG
5409 Sbjct: 98  ITPQEFSKKYLQAPKDVSQQIKMANKKMKKEQYSCDHPPASWDWRKKGVITQVKYQGGCG 157
5411 Query: 141 SCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYN 200
5412              W+FS TG +E  H I+   LVSLSEQ LVDC  E           EG   G Q  ++ 
5413 Sbjct: 158 RGWAFSATGAIEAAHAIATGDLVSLSEQELVDCVEE----------SEGSYNGWQYQSFE 207
5415 Query: 201 YIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNF-TMIPKNE------TVMAGYIV 253
5416            +++++GGI T+  YPY A+ G +C  N       I  + T+I  +E             +
5417 Sbjct: 208 WVLEHGGIATDDDYPYRAKEG-RCKANKIQDKVTIDGYETLIMSDESTESETEQAFLSAI 266
5419 Query: 254 STGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIP--CNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKN 311
5420               P++++ DA ++  Y GG++D     +P  ++H +L+VGY + + +      YWI KN
5421 Sbjct: 267 LEQPISVSIDAKDFHLYTGGIYDGENCTSPYGINHFVLLVGYGSADGV-----DYWIAKN 321
5423 Query: 312 SWGADWGEQGYIYLRRGKNT----CGVSNFVSTS 341
5424            SWG DWGE GYI+++R        CG++ F S  
5425 Sbjct: 322 SWGFDWGEDGYIWIQRNTGNLLGVCGMNYFASYP 355
5428 >sp|O17473|CATL_BRUPA CATHEPSIN L-LIKE PRECURSOR
5429           Length = 395
5431  Score =  327 bits (829), Expect = 2e-89
5432  Identities = 99/325 (30%), Positives = 153/325 (46%), Gaps = 23/325 (7%)
5434 Query: 25  EQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLS 84
5435             ++++ ++     K Y  +E   R  IF+SN    E +N             +N  ADL+
5436 Sbjct: 87  LETEWKDYVTALGKHYDQKENNFRMAIFESNELMTERINKKYEQGLVSYTTALNDLADLT 146
5438 Query: 85  SDEF--KNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSC 142
5439             +EF  +N      +         +++   +    +P   DWRT+GAVTPV+NQG+CGSC
5440 Sbjct: 147 DEEFMVRNGLRLPNQTDLRGKRQTSEFYRYDKSERLPDQVDWRTKGAVTPVRNQGECGSC 206
5442 Query: 143 WSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYI 202
5443            ++F+T   +E  H     +L+ LS QN+VDC             + GC+GG  P A+ Y 
5444 Sbjct: 207 YAFATAAALEAYHKQMTGRLLDLSPQNIVDC--------TRNLGNNGCSGGYMPTAFQY- 257
5446 Query: 203 IKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMI-PKNETVMAGYIVSTGPLAIA 261
5447                GI  ES YPY      +C +  +      + F  I P +E  +   +   GP+ + 
5448 Sbjct: 258 ASRYGIAMESRYPYVGTE-QRCRWQQSIAVVTDNGFNEIQPGDELALKHAVAKRGPVVVG 316
5450 Query: 262 A--DAVEWQFYIGGVF-DIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWG 318
5451                   ++FY  GV+ +  C     DH +L VGY    +       YWIVKNSWG DWG
5452 Sbjct: 317 ISGSKRSFRFYKDGVYSEGNCG--RPDHAVLAVGYGTHPSY----GDYWIVKNSWGTDWG 370
5454 Query: 319 EQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTSI 342
5455            + GY+Y+ R + N C +++  S  I
5456 Sbjct: 371 KDGYVYMARNRGNMCHIASAASFPI 395
5459 >sp|Q10991|CATL_SHEEP CATHEPSIN L
5460           Length = 217
5462  Score =  325 bits (824), Expect = 1e-88
5463  Identities = 104/230 (45%), Positives = 140/230 (60%), Gaps = 17/230 (7%)
5465 Query: 118 IPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHEC 177
5466            +P + DW  +G VTPVKNQGQCGSCW+FS TG +EGQ F    KLVSLSEQNLVD     
5467 Sbjct: 1   VPKSVDWTKKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSATGALEGQMFRKTGKLVSLSEQNLVD----- 55
5469 Query: 178 MEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISN 237
5470                     ++GCNGGL  NA+ YI +NGG+ +E SYPY A T T CN+      AK + 
5471 Sbjct: 56  ---SSRPQGNQGCNGGLMDNAFQYIKENGGLDSEESYPYEA-TDTSCNYKPEYSAAKDTG 111
5473 Query: 238 FTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGV-FDIPCNPNSLDHGILIVGYS 294
5474            F  IP+ E  +   + + GP+++A DA    +QFY  G+ +D  C+   LDHG+L+VGY 
5475 Sbjct: 112 FVDIPQREKALMKAVATVGPISVAIDAGHSSFQFYKSGIYYDPDCSSKDLDHGVLVVGYG 171
5477 Query: 295 AKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG-KNTCGVSNFVSTSII 343
5478             + T    N  +WIVKNSWG +WG +GY+ + +   N CG++   S   +
5479 Sbjct: 172 FEGT----NNKFWIVKNSWGPEWGNKGYVKMAKDQNNHCGIATAASYPTV 217
5482 >sp|P54639|CYS4_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 4 PRECURSOR
5483           Length = 442
5485  Score =  323 bits (819), Expect = 4e-88
5486  Identities = 115/308 (37%), Positives = 166/308 (53%), Gaps = 23/308 (7%)
5488 Query: 1   MKVI-LLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKI 59
5489            M+V+  L +L V       +    + ++ F  +     + YS EE+  R++IFKSN+  +
5490 Sbjct: 1   MRVLSFLCLLLVSYASAKQQFSELQYRNAFTNWMQAHQRTYSSEEFNARYQIFKSNMDYV 60
5492 Query: 60  EELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP 119
5493             + N    +   +T  G+N FAD+++ E++  YL      F     +    +  F    P
5494 Sbjct: 61  HQWN----SKGGETVLGLNVFADITNQEYRTTYLGTP---FDGSALIGTEEEKIFSTPAP 113
5496 Query: 120 TAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQN---KLVSLSEQNLVDCDHE 176
5497               DWR +GAVTP+KNQGQCG CWSFSTTG+ EG HFI+      LVSLSEQNL+DC   
5498 Sbjct: 114 -TVDWRAQGAVTPIKNQGQCGGCWSFSTTGSTEGAHFIASGTKKDLVSLSEQNLIDCSK- 171
5500 Query: 177 CMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKIS 236
5501                      + GC GGL    + YII N GI TESSYPYTAE G +C F ++NIGA+I 
5502 Sbjct: 172 -------SYGNNGCEGGLMTLGFEYIINNKGIDTESSYPYTAEDGKECKFKTSNIGAQIV 224
5504 Query: 237 NFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGY 293
5505            ++  +            +  P+++A DA    +Q Y  G++  P C P  LDHG+L+VGY
5506 Sbjct: 225 SYQNVTSGSEASLQSASNNAPVSVAIDASNESFQLYESGIYYEPACTPTQLDHGVLVVGY 284
5508 Query: 294 SAKNTIFR 301
5509             + ++   
5510 Sbjct: 285 GSGSSSSS 292
5513  Score = 70.2 bits (169), Expect = 6e-12
5514  Identities = 18/46 (39%), Positives = 26/46 (56%), Gaps = 1/46 (2%)
5516 Query: 297 NTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTS 341
5517              +   +  YWIVKNSWG  WG  GYI++ + + N CG++   S  
5518 Sbjct: 392 GAVEASSGNYWIVKNSWGTSWGMDGYIFMSKDRNNNCGIATMASFP 437
5521 >sp|P56203|CATW_MOUSE CATHEPSIN W PRECURSOR (LYMPHOPAIN)
5522           Length = 371
5524  Score =  319 bits (810), Expect = 4e-87
5525  Identities = 108/340 (31%), Positives = 162/340 (46%), Gaps = 32/340 (9%)
5527 Query: 22  PPEEQSQFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKF 80
5528            P E +  F  FQ +FN+ Y +  EY  R  IF  NL + + L    +      +FG   F
5529 Sbjct: 33  PLELKEVFKLFQIRFNRSYWNPAEYTRRLSIFAHNLAQAQRLQQEDL---GTAEFGETPF 89
5531 Query: 81  ADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRT-RGAVTPVKNQGQC 139
5532            +DL+ +EF   Y   +    T ++       + +  S+P   DWR  +  ++ VKNQG C
5533 Sbjct: 90  SDLTEEEFGQLYGQERSPERTPNMTK-KVESNTWGESVPRTCDWRKAKNIISSVKNQGSC 148
5535 Query: 140 GSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAY 199
5536              CW+ +   N++    I   + V +S Q L+DC          E C  GCNGG   +AY
5537 Sbjct: 149 KCCWAMAAADNIQALWRIKHQQFVDVSVQELLDC----------ERCGNGCNGGFVWDAY 198
5539 Query: 200 NYIIKNGGIQTESSYPYTAETGT-QCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPL 258
5540              ++ N G+ +E  YP+  +    +C        A I +FTM+  NE  +A Y+   GP+
5541 Sbjct: 199 LTVLNNSGLASEKDYPFQGDRKPHRCLAKKYKKVAWIQDFTMLSNNEQAIAHYLAVHGPI 258
5543 Query: 259 AIAADAVEWQFYIGGVFDIP---CNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNM----------- 304
5544             +  +    Q Y  GV       C+P  +DH +L+VG+  K    +              
5545 Sbjct: 259 TVTINMKLLQHYQKGVIKATPSSCDPRQVDHSVLLVGFGKKKEGMQTGTVLSHSRKRRHS 318
5547 Query: 305 -PYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
5548             PYWI+KNSWGA WGE+GY  L RG NTCGV+ +  T+ +
5549 Sbjct: 319 SPYWILKNSWGAHWGEKGYFRLYRGNNTCGVTKYPFTAQV 358
5552 >sp|P56202|CATW_HUMAN CATHEPSIN W PRECURSOR (LYMPHOPAIN)
5553           Length = 376
5555  Score =  318 bits (807), Expect = 9e-87
5556  Identities = 114/368 (30%), Positives = 177/368 (47%), Gaps = 44/368 (11%)
5558 Query: 6   LFVLAVFTVFVSSRGI---------PPEEQSQFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSN 55
5559            L  L V  +    RG          P E +  F  FQ +FN+ Y S EE+  R +IF  N
5560 Sbjct: 10  LLALLVAGLAQGIRGPLRAQDLGPQPLELKEAFKLFQIQFNRSYLSPEEHAHRLDIFAHN 69
5562 Query: 56  LGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFI 115
5563            L + + L    +      +FGV  F+DL+ +EF   Y   + A     +   +   +E  
5564 Sbjct: 70  LAQAQRLQEEDL---GTAEFGVTPFSDLTEEEFGQLYGYRRAAGGVPSMG-REIRSEEPE 125
5566 Query: 116 NSIPTAFDWRT-RGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCD 174
5567             S+P + DWR   GA++P+K+Q  C  CW+ +  GN+E    IS    V +S   L+DC 
5568 Sbjct: 126 ESVPFSCDWRKVAGAISPIKDQKNCNCCWAMAAAGNIETLWRISFWDFVDVSVHELLDCG 185
5570 Query: 175 HECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGT-QCNFNSANIGA 233
5571                       C +GC+GG   +A+  ++ N G+ +E  YP+  +    +C+       A
5572 Sbjct: 186 R----------CGDGCHGGFVWDAFITVLNNSGLASEKDYPFQGKVRAHRCHPKKYQKVA 235
5574 Query: 234 KISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFD---IPCNPNSLDHGILI 290
5575             I +F M+  NE  +A Y+ + GP+ +  +    Q Y  GV       C+P  +DH +L+
5576 Sbjct: 236 WIQDFIMLQNNEHRIAQYLATYGPITVTINMKPLQLYRKGVIKATPTTCDPQLVDHSVLL 295
5578 Query: 291 VGYSA--------KNTIFRKN-------MPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVS 335
5579            VG+ +          T+  ++        PYWI+KNSWGA WGE+GY  L RG NTCG++
5580 Sbjct: 296 VGFGSVKSEEGIWAETVSSQSQPQPPHPTPYWILKNSWGAQWGEKGYFRLHRGSNTCGIT 355
5582 Query: 336 NFVSTSII 343
5583             F  T+ +
5584 Sbjct: 356 KFPLTARV 363
5587 >sp|Q01958|CPP2_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR
5588           Length = 315
5590  Score =  318 bits (807), Expect = 9e-87
5591  Identities = 102/330 (30%), Positives = 160/330 (47%), Gaps = 37/330 (11%)
5593 Query: 21  IPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVN-K 79
5594            +       F  +  K NK ++  E L R  IF  N   ++  N I        K  V+  
5595 Sbjct: 8   LAIASAIDFNTWASKNNKHFTAIEKLRRRAIFNMNAKFVDSFNKIG-----SFKLSVDGP 62
5597 Query: 80  FADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQC 139
5598            FA ++++E++    + +    T++     YL+ +     P + DWR  G VTP+++Q QC
5599 Sbjct: 63  FAAMTNEEYRTLLKSKRT---TEENGQVKYLNIQA----PESVDWRKEGKVTPIRDQAQC 115
5601 Query: 140 GSCWSFSTTGNVEGQHFISQN---KLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQP 196
5602            GSC++F +   +EG+  I +      + LSE+++V C          +  + GCNGGL  
5603 Sbjct: 116 GSCYTFGSLAALEGRLLIEKGGDANTLDLSEEHMVQC--------TRDNGNNGCNGGLGS 167
5605 Query: 197 NAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTG 256
5606            N Y+YII++ G+  ES YPYT    T C  N  +  AKI+ +T +P+N        +S G
5607 Sbjct: 168 NVYDYIIEH-GVAKESDYPYTGSDST-CKTNVKSF-AKITGYTKVPRNNEAELKAALSQG 224
5609 Query: 257 PLAIAADAVE--WQFYIGGVF-DIPCNPNS--LDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKN 311
5610             + ++ DA    +Q Y  G + D  C  N   L+H +  VGY   +         WIV+N
5611 Sbjct: 225 LVDVSIDASSAKFQLYKSGAYTDTKCKNNYFALNHEVCAVGYGVVD-----GKECWIVRN 279
5613 Query: 312 SWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTS 341
5614            SWG  WG++GYI +    NTCGV+      
5615 Sbjct: 280 SWGTGWGDKGYINMVIEGNTCGVATDPLYP 309
5618 >sp|P36185|ACP2_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE ACP2 PRECURSOR
5619           Length = 310
5621  Score =  315 bits (799), Expect = 8e-86
5622  Identities = 102/330 (30%), Positives = 158/330 (46%), Gaps = 32/330 (9%)
5624 Query: 18  SRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGV 77
5625            + GI       F  +  K NK ++  E L R  IF  N   ++  N I        K  V
5626 Sbjct: 1   AAGIRIASAIDFNTWASKNNKHFTAIEKLRRRAIFNMNAKFVDSFNKIG-----SFKLSV 55
5628 Query: 78  N-KFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQ 136
5629            +  FA ++++E++    + +    T++     YL+ +     P + DWR  G VTP+++Q
5630 Sbjct: 56  DGPFAAMTNEEYRTLLKSKRT---TEENGQVKYLNIQA----PESVDWRKEGKVTPLRDQ 108
5632 Query: 137 GQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQP 196
5633             QCGSC++F +   +EG+  I +       + N +D   E M+    +  + GCNGGL  
5634 Sbjct: 109 AQCGSCYTFGSLAALEGRLLIEKG-----GDANTLDLSEEHMQCT-RDNGNNGCNGGLGS 162
5636 Query: 197 NAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTG 256
5637            N Y+YII++ G+  ES YPYT    T C  N  +   KI+ +T +P+N        +S G
5638 Sbjct: 163 NVYDYIIEH-GVAKESDYPYTGSDST-CKTNVKSFR-KITGYTKVPRNNEAELKAALSQG 219
5640 Query: 257 PLAIAADAVE--WQFYIGGVF-DIPCNPNS--LDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKN 311
5641             L ++ D     +Q Y  G + D  C  N   L+H +  VGY   +         WIV+N
5642 Sbjct: 220 LLDVSIDVSSAKFQLYKSGAYTDTKCKNNYFALNHEVCAVGYGVVD-----GKECWIVRN 274
5644 Query: 312 SWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTS 341
5645            SWG  WG++GYI +    NTCGV+      
5646 Sbjct: 275 SWGTSWGDKGYINMVIEGNTCGVATDPLYP 304
5649 >sp|Q06964|CPP3_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE 3 PRECURSOR (CYSTEINE PROTEINASE ACP3)
5650           Length = 308
5652  Score =  312 bits (790), Expect = 9e-85
5653  Identities = 102/322 (31%), Positives = 157/322 (48%), Gaps = 37/322 (11%)
5655 Query: 29  FLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVN-KFADLSSDE 87
5656            F  +    NK ++  E L R  IF  N   + E N      K   K  V+  FA ++++E
5657 Sbjct: 9   FNTWAANNNKHFTAVEALRRRAIFNMNARFVAEFNK-----KGSFKLSVDGPFAAMTNEE 63
5659 Query: 88  FKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFST 147
5660            ++    + +     ++     YL+ +     P + DWR +G VTP+++Q QCGSC++F +
5661 Sbjct: 64  YRTLLKSKRTV---EENGKVTYLNIQA----PESVDWRAQGKVTPIRDQAQCGSCYTFGS 116
5663 Query: 148 TGNVEGQHFISQN---KLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK 204
5664               +EG+  I +      + LSE++LV C          +  + GCNGGL  N Y+YII+
5665 Sbjct: 117 LAALEGRLLIEKGGNANTLDLSEEHLVQC--------TRDNGNNGCNGGLGSNVYDYIIQ 168
5667 Query: 205 NGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA 264
5668            N G+  ES YPYT    T C  N     AKI+ +  +P+N        +S G + ++ DA
5669 Sbjct: 169 N-GVAKESDYPYTGTDST-CKTN-VKAFAKITGYNKVPRNNEAELKAALSQGLVDVSIDA 225
5671 Query: 265 VE--WQFYIGGVF-DIPCNPN--SLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGE 319
5672                +Q Y  G + D  C  N  +L+H +  VGY   +         WIV+NSWG  WG+
5673 Sbjct: 226 SSAKFQLYKSGAYSDTKCKNNFFALNHEVCAVGYGVVD-----GKECWIVRNSWGTGWGD 280
5675 Query: 320 QGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTS 341
5676            +GYI +    NTCGV+      
5677 Sbjct: 281 KGYINMVIEGNTCGVATDPLYP 302
5680 >sp|P36184|ACP1_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE ACP1 PRECURSOR
5681           Length = 308
5683  Score =  309 bits (784), Expect = 5e-84
5684  Identities = 109/348 (31%), Positives = 156/348 (44%), Gaps = 53/348 (15%)
5686 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKI 59
5687            M  ++LFV       V+           F ++    NK +++  EYL RF +F  N   +
5688 Sbjct: 1   MFALILFVSLACANEVA-----------FKQWAATHNKVFANRAEYLYRFAVFLDNKKFV 49
5690 Query: 60  EELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP 119
5691            E          A+    +N FAD++ +EF   +L       T ++P         + + P
5692 Sbjct: 50  E----------ANANTELNVFADMTHEEFIQTHLG-----MTYEVPETTSNVKAAVKAAP 94
5694 Query: 120 TAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECME 179
5695             + DWR+   + P K+QGQCGSCW+F TT  +EG+      KL S SEQ LVDCD     
5696 Sbjct: 95  ESVDWRS--IMNPAKDQGQCGSCWTFCTTAVLEGRVNKDLGKLYSFSEQQLVDCD----- 147
5698 Query: 180 YEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFT 239
5699                 A D GC GG   N+  +I +N G+  ES YPY A  GT          A ++   
5700 Sbjct: 148 -----ASDNGCEGGHPSNSLKFIQENNGLGLESDYPYKAVAGTC---KKVKNVATVTGSR 199
5702 Query: 240 MIP-KNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVF--DIPCNPNSLDHGILIVGYS 294
5703             +   +ET +   I   GP+A+  DA    +Q Y  G    D  C    ++H +  VGY 
5704 Sbjct: 200 RVTDGSETGLQTIIAENGPVAVGMDASRPSFQLYKKGTIYSDTKCRSRMMNHCVTAVGYG 259
5706 Query: 295 AKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTS 341
5707                    N  YWI++NSWG  WG+ GY  L R   N CG+    +  
5708 Sbjct: 260 -----SNSNGKYWIIRNSWGTSWGDAGYFLLARDSNNMCGIGRDSNYP 302
5711 >sp|P25326|CATS_BOVIN CATHEPSIN S
5712           Length = 217
5714  Score =  307 bits (778), Expect = 2e-83
5715  Identities = 91/228 (39%), Positives = 129/228 (55%), Gaps = 17/228 (7%)
5717 Query: 118 IPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHEC 177
5718            +P + DWR +G VT VK QG CGSCW+FS  G +E Q  +   KLVSLS QNLVDC    
5719 Sbjct: 1   LPDSMDWREKGCVTEVKYQGACGSCWAFSAVGALEAQVKLKTGKLVSLSAQNLVDCST-- 58
5721 Query: 178 MEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISN 237
5722                  +  ++GCNGG    A+ YII N GI +E+SYPY A  G +C ++  N  A  S 
5723 Sbjct: 59  -----AKYGNKGCNGGFMTEAFQYIIDNNGIDSEASYPYKAMDG-KCQYDVKNRAATCSR 112
5725 Query: 238 FTMIP-KNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYS 294
5726            +  +P  +E  +   + + GP+++  DA    +  Y  GV+  P    +++HG+L+VGY 
5727 Sbjct: 113 YIELPFGSEEALKEAVANKGPVSVGIDASHSSFFLYKTGVYYDPSCTQNVNHGVLVVGYG 172
5729 Query: 295 AKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK-NTCGVSNFVSTS 341
5730                       YW+VKNSWG  +G+QGYI + R   N CG++N+ S  
5731 Sbjct: 173 N-----LDGKDYWLVKNSWGLHFGDQGYIRMARNSGNHCGIANYPSYP 215
5734 >sp|Q01957|CPP1_ENTHI CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR
5735           Length = 315
5737  Score =  301 bits (763), Expect = 1e-81
5738  Identities = 103/322 (31%), Positives = 155/322 (47%), Gaps = 37/322 (11%)
5740 Query: 29  FLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVN-KFADLSSDE 87
5741            F  +    NK ++  E L R  IF  N   + E N          K  V+  FA ++++E
5742 Sbjct: 16  FNTWVANNNKHFTAVESLRRRAIFNMNARIVAENNRKE-----TFKLSVDGPFAAMTNEE 70
5744 Query: 88  FKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFST 147
5745            + +     +     ++     YL+ +     P A DWR +G VTP+++QG CGSC++F +
5746 Sbjct: 71  YNSLLKLKRSG---EEKGEVRYLNIQA----PKAVDWRKKGKVTPIRDQGNCGSCYTFGS 123
5748 Query: 148 TGNVEGQHFISQN---KLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIK 204
5749               +EG+  I +    + + LSE+++V C  E          + GCNGGL  N YNYI++
5750 Sbjct: 124 IAALEGRLLIEKGGDSETLDLSEEHMVQCTRE--------DGNNGCNGGLGSNVYNYIME 175
5752 Query: 205 NGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA 264
5753            N GI  ES YPYT    T C  +     AKI ++  + +N  V     +S G + ++ DA
5754 Sbjct: 176 N-GIAKESDYPYTGSDST-CRSD-VKAFAKIKSYNRVARNNEVELKAAISQGLVDVSIDA 232
5756 Query: 265 VE--WQFYIGGVF-DIPCNPNS--LDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGE 319
5757                +Q Y  G + D  C  N   L+H +  VGY   +         WIV+NSWG  WGE
5758 Sbjct: 233 SSVQFQLYKSGAYTDTQCKNNYFALNHEVCAVGYGVVD-----GKECWIVRNSWGTGWGE 287
5760 Query: 320 QGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTS 341
5761            +GYI +    NTCGV+      
5762 Sbjct: 288 KGYINMVIEGNTCGVATDPLYP 309
5765 >sp|P25805|CYSP_PLAFA THROPHOZOITE CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR (TCP)
5766           Length = 569
5768  Score =  299 bits (758), Expect = 5e-81
5769  Identities = 100/363 (27%), Positives = 161/363 (43%), Gaps = 62/363 (17%)
5771 Query: 27  SQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSS 85
5772            S+F +F  + NK Y + +E + +FEIFK N   I+  N   +N  A  K  VN+F+D S 
5773 Sbjct: 223 SKFFKFMKEHNKVYKNIDEQMRKFEIFKINYISIKNHNK--LNKNAMYKKKVNQFSDYSE 280
5775 Query: 86  DEFKN--------------YYLNNKEAIFTDDLPVADYL------DDEFINSIPTAFDWR 125
5776            +E K                Y    E    D++ ++++       + +  + +P   D+R
5777 Sbjct: 281 EELKEYFKTLLHVPNHMIEKYSKPFENHLKDNILISEFYTNGKRNEKDIFSKVPEILDYR 340
5779 Query: 126 TRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEA 185
5780             +G V   K+QG CGSCW+F++ GN+E         ++S SEQ +VDC  +         
5781 Sbjct: 341 EKGIVHEPKDQGLCGSCWAFASVGNIESVFAKKNKNILSFSEQEVVDCSKD--------- 391
5783 Query: 186 CDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNE 245
5784             + GC+GG    ++ Y+++N  +     Y Y A+    C          +S+   +   E
5785 Sbjct: 392 -NFGCDGGHPFYSFLYVLQN-ELCLGDEYKYKAKDDMFCLNYRCKRKVSLSSIGAV--KE 447
5787 Query: 246 TVMAGYIVSTGPLAIAADA-VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYS---------- 294
5788              +   +   GPL++      ++  Y  GV++  C    L+H +L+VGY           
5789 Sbjct: 448 NQLILALNEVGPLSVNVGVNNDFVAYSEGVYNGTC-SEELNHSVLLVGYGQVEKTKLNYN 506
5791 Query: 295 ----AKNTIFRKNMP------YWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKN----TCGVSNFVST 340
5792                  NT    N P      YWI+KNSW   WGE G++ L R KN     CG+   V  
5793 Sbjct: 507 NKIQTYNTKENSNQPDDNIIYYWIIKNSWSKKWGENGFMRLSRNKNGDNVFCGIGEEVFY 566
5795 Query: 341 SII 343
5796             I+
5797 Sbjct: 567 PIL 569
5800 >sp|P20721|CYSL_LYCES LOW-TEMPERATURE-INDUCED CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR
5801           Length = 346
5803  Score =  298 bits (756), Expect = 9e-81
5804  Identities = 88/243 (36%), Positives = 130/243 (53%), Gaps = 21/243 (8%)
5806 Query: 106 VADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSL 165
5807             +D    +  +S+P + DWR +G +  VK+QG CGSCW+FS    +E  + I    L+SL
5808 Sbjct: 6   KSDRYLPKVGDSLPESIDWREKGVLVGVKDQGSCGSCWAFSAVAAMESINAIVTGNLISL 65
5810 Query: 166 SEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCN 225
5811            SEQ LVDCD          + +EGC+GGL   A+ ++IKNGGI TE  YPY    G    
5812 Sbjct: 66  SEQELVDCDR---------SYNEGCDGGLMDYAFEFVIKNGGIDTEEDYPYKERNGVCDQ 116
5814 Query: 226 FNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIPCNPNS 283
5815            +       KI ++  +P N        V+  P++IA +A   ++Q Y  G+F   C   +
5816 Sbjct: 117 YRKNAKVVKIDSYEDVPVNNEKALQKAVAHQPVSIALEAGGRDFQHYKSGIFTGKCG-TA 175
5818 Query: 284 LDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG----KNTCGVSNFVS 339
5819            +DHG++I GY  +N      M YWIV+NSWGA+  E GY+ ++R        CG++   S
5820 Sbjct: 176 VDHGVVIAGYGTEN-----GMDYWIVRNSWGANCRENGYLRVQRNVSSSSGLCGLAIEPS 230
5822 Query: 340 TSI 342
5823              +
5824 Sbjct: 231 YPV 233
5827 >sp|P43234|CATO_HUMAN CATHEPSIN O PRECURSOR
5828           Length = 321
5830  Score =  296 bits (750), Expect = 5e-80
5831  Identities = 98/297 (32%), Positives = 151/297 (49%), Gaps = 20/297 (6%)
5833 Query: 50  EIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADY 109
5834              F+ +L +   LN +  +  +   +G+N+F+ L  +EFK  YL +K + F      A+ 
5835 Sbjct: 42  AAFRESLNRHRYLNSLFPSENSTAFYGINQFSYLFPEEFKAIYLRSKPSKFPR--YSAEV 99
5837 Query: 110 LDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQN 169
5838                   S+P  FDWR +  VT V+NQ  CG CW+FS  G VE  + I    L  LS Q 
5839 Sbjct: 100 HMSIPNVSLPLRFDWRDKQVVTQVRNQQMCGGCWAFSVVGAVESAYAIKGKPLEDLSVQQ 159
5841 Query: 170 LVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGG-IQTESSYPYTAETGTQCNFNS 228
5842            ++DC             + GCNGG   NA N++ K    +  +S YP+ A+ G    F+ 
5843 Sbjct: 160 VIDCS----------YNNYGCNGGSTLNALNWLNKMQVKLVKDSEYPFKAQNGLCHYFSG 209
5845 Query: 229 ANIGAKISNF--TMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDH 286
5846            ++ G  I  +        E  MA  +++ GPL +  DAV WQ Y+GG+    C+    +H
5847 Sbjct: 210 SHSGFSIKGYSAYDFSDQEDEMAKALLTFGPLVVIVDAVSWQDYLGGIIQHHCSSGEANH 269
5849 Query: 287 GILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
5850             +LI G+         + PYWIV+NSWG+ WG  GY +++ G N CG+++ VS+  +
5851 Sbjct: 270 AVLITGFDKTG-----STPYWIVRNSWGSSWGVDGYAHVKMGSNVCGIADSVSSIFV 321
5854 >sp|P46102|CYSP_PLAVN CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR
5855           Length = 506
5857  Score =  291 bits (738), Expect = 1e-78
5858  Identities = 108/360 (30%), Positives = 167/360 (46%), Gaps = 58/360 (16%)
5860 Query: 27  SQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSS 85
5861            S+F ++  + NKKY + +E L+RFE FK    K ++ N +   +       VN+++D S 
5862 Sbjct: 160 SKFFKYMKENNKKYENMDEQLQRFENFKIRYMKTQKHNEMVGKNGLTYVQKVNQYSDFSK 219
5864 Query: 86  DEFKNYYLNNKEAIFTDDL----PVADYLDDEFINSI-------PTAFDWRTRGAVTPVK 134
5865            +EF NY+                P+  +L +  + S+       P + D+R++    P K
5866 Sbjct: 220 EEFDNYFKKLLSVPMDLKSKYIVPLKKHLANTNLISVDNKSKDFPDSRDYRSKFNFLPPK 279
5868 Query: 135 NQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKL-VSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGG 193
5869            +QG CGSCW+F+  GN E  +  +++++ +S SEQ +VDC  E          + GC+GG
5870 Sbjct: 280 DQGNCGSCWAFAAIGNFEYLYVHTRHEMPISFSEQQMVDCSTE----------NYGCDGG 329
5872 Query: 194 LQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIV 253
5873                A+ Y+I N G+     YPY       C     ++  ++     +  NE +M   + 
5874 Sbjct: 330 NPFYAFLYMINN-GVCLGDEYPYKGHEDFFCLNYRCSLLGRVHFIGDVKPNELIM--ALN 386
5876 Query: 254 STGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFR----------- 301
5877              GP+ IA  A  ++  Y GGVFD  CNP  L+H +L+VGY                   
5878 Sbjct: 387 YVGPVTIAVGASEDFVLYSGGVFDGECNP-ELNHSVLLVGYGQVKKSLAFEDSHSNVDSN 445
5880 Query: 302 ---------KNMP------YWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK----NTCGVSNFVSTSI 342
5881                     K         YWIV+NSWG +WGE GYI ++R K      CGV + V   I
5882 Sbjct: 446 LIKKYKENIKGDDDDDIIYYWIVRNSWGPNWGEGGYIRIKRNKAGDDGFCGVGSDVFFPI 505
5885 >sp|P42666|CYSP_PLAVI CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR
5886           Length = 583
5888  Score =  278 bits (704), Expect = 1e-74
5889  Identities = 100/383 (26%), Positives = 164/383 (42%), Gaps = 68/383 (17%)
5891 Query: 11  VFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSH-EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINH 69
5892            V    +    +  +  S+F  F +K+ + Y    E +E+++ FK N  KI++ N      
5893 Sbjct: 219 VSVAQIEGLFVNLKYASKFFNFMNKYKRSYKDINEQMEKYKNFKMNYLKIKKHNETNQM- 277
5895 Query: 70  KADTKFGVNKFADLSSDEFKNYY---------LNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINS--- 117
5896                K  VN+F+D S  +F++Y+         L  K  +    +      +    +S   
5897 Sbjct: 278 ---YKMKVNQFSDYSKKDFESYFRKLVPIPDHLKKKYVVPFSSMNNGKGKNVVTSSSGAN 334
5899 Query: 118 ----IPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLV-SLSEQNLVD 172
5900                +P   D+R +G V   K+QG CGSCW+F++ GNVE  +    NK + +LSEQ +VD
5901 Sbjct: 335 LLADVPEILDYREKGIVHEPKDQGLCGSCWAFASVGNVECMYAKEHNKTILTLSEQEVVD 394
5903 Query: 173 CDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIG 232
5904            C             + GC+GG    ++ Y I+N GI     Y Y A     C        
5905 Sbjct: 395 CSK----------LNFGCDGGHPFYSFIYAIEN-GICMGDDYKYKAMDNLFCLNYRCKNK 443
5907 Query: 233 AKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIV 291
5908              +S+   + +NE  +   +   GP+++      ++ FY GG+F+  C    L+H +L+V
5909 Sbjct: 444 VTLSSVGGVKENE--LIRALNEVGPVSVNVGVTDDFSFYGGGIFNGTC-TEELNHSVLLV 500
5911 Query: 292 GYS---------------AKNTIFRKN------------MPYWIVKNSWGADWGEQGYIY 324
5912            GY                  + + +K               YWI+KNSW   WGE G++ 
5913 Sbjct: 501 GYGQVQSSKIFQEKNAYDDASGVTKKGALSYPSKADDGIQYYWIIKNSWSKFWGENGFMR 560
5915 Query: 325 LRRGKN----TCGVSNFVSTSII 343
5916            + R K      CG+   V   I+
5917 Sbjct: 561 ISRNKEGDNVFCGIGVEVFYPIL 583
5920 >sp|P16311|MMAL_DERFA MAJOR MITE FECAL ALLERGEN DER F 1 PRECURSOR (DER F I)
5921           Length = 321
5923  Score =  272 bits (688), Expect = 8e-73
5924  Identities = 110/350 (31%), Positives = 150/350 (42%), Gaps = 46/350 (13%)
5926 Query: 7   FVLAVFTVFVSSRGIP-PEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLE-RFEIFKSNLGKIEELNL 64
5927            FVLA+ ++ V S     P     F EF+  FNK Y+  E  E   + F  +L  +E    
5928 Sbjct: 3   FVLAIASLLVLSTVYARPASIKTFEEFKKAFNKNYATVEEEEVARKNFLESLKYVEA--- 59
5930 Query: 65  IAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFIN------SI 118
5931                     K  +N  +DLS DEFKN YL + EA   + L     L+ E         ++
5932 Sbjct: 60  --------NKGAINHLSDLSLDEFKNRYLMSAEAF--EQLKTQFDLNAETSACRINSVNV 109
5934 Query: 119 PTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECM 178
5935            P+  D R+   VTP++ QG CGSCW+FS     E  +   +N  + LSEQ LVDC     
5936 Sbjct: 110 PSELDLRSLRTVTPIRMQGGCGSCWAFSGVAATESAYLAYRNTSLDLSEQELVDC----- 164
5938 Query: 179 EYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNF 238
5939                  A   GC+G   P    YI +N G+  E SYPY A        NS + G  ISN+
5940 Sbjct: 165 ------ASQHGCHGDTIPRGIEYIQQN-GVVEERSYPYVAREQRCRRPNSQHYG--ISNY 215
5942 Query: 239 TMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAA-----DAVEWQFYIGG-VFDIPCNPNSLDHGILIVG 292
5943              I   +       ++    AIA      D   +Q Y G  +           H + IVG
5944 Sbjct: 216 CQIYPPDVKQIREALTQTHTAIAVIIGIKDLRAFQHYDGRTIIQHDNGYQPNYHAVNIVG 275
5946 Query: 293 YSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
5947            Y        +   YWIV+NSW   WG+ GY Y + G N   +  +    I
5948 Sbjct: 276 YG-----STQGDDYWIVRNSWDTTWGDSGYGYFQAGNNLMMIEQYPYVVI 320
5951 >sp|P80884|ANAN_ANACO ANANAIN
5952           Length = 216
5954  Score =  271 bits (687), Expect = 1e-72
5955  Identities = 93/229 (40%), Positives = 122/229 (52%), Gaps = 22/229 (9%)
5957 Query: 118 IPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHEC 177
5958            +P + DWR  GAVT VKNQG+CGSCW+F++   VE  + I +  LVSLSEQ ++DC    
5959 Sbjct: 1   VPQSIDWRDSGAVTSVKNQGRCGSCWAFASIATVESIYKIKRGNLVSLSEQQVLDC---- 56
5961 Query: 178 MEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISN 237
5962                   A   GC GG    AY++II N G+ + + YPY A  GT C  N     A I+ 
5963 Sbjct: 57  -------AVSYGCKGGWINKAYSFIISNKGVASAAIYPYKAAKGT-CKTNGVPNSAYITR 108
5965 Query: 238 FTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAK 296
5966            +T + +N      Y VS  P+A A DA   +Q Y  GVF  PC    L+H I+I+GY   
5967 Sbjct: 109 YTYVQRNNERNMMYAVSNQPIAAALDASGNFQHYKRGVFTGPCG-TRLNHAIVIIGYGQD 167
5969 Query: 297 NTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGK----NTCGVSNFVSTS 341
5970            +        +WIV+NSWGA WGE GYI L R        CG++      
5971 Sbjct: 168 SA----GKKFWIVRNSWGAGWGEGGYIRLARDVSSSFGICGIAMDPLYP 212
5974 >sp||CATL_CHICK_1 [Segment 1 of 2] CATHEPSIN L
5975           Length = 176
5977  Score =  264 bits (669), Expect = 1e-70
5978  Identities = 86/183 (46%), Positives = 115/183 (61%), Gaps = 12/183 (6%)
5980 Query: 119 PTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECM 178
5981            P + DWR +G VTPVK+QGQCGSCW+FSTTG +EGQHF ++ KLVSLSEQNLVDC     
5982 Sbjct: 2   PRSVDWREKGYVTPVKDQGQCGSCWAFSTTGALEGQHFRTKGKLVSLSEQNLVDCS---- 57
5984 Query: 179 EYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNF 238
5985                    ++GCNGGL   A+ Y+  NGGI +E SYPYTA+    C + +    A  + F
5986 Sbjct: 58  ----RPEGNQGCNGGLMDQAFQYVQDNGGIDSEESYPYTAKDDEDCRYKAEYNAANDTGF 113
5988 Query: 239 TMIPKN-ETVMAGYIVSTGPLAIAADA--VEWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGYS 294
5989              IP+  E  +   + S GP+++A DA    +QFY  G++  P C+   LDHG+L+VGY 
5990 Sbjct: 114 VDIPQGHERALMKAVASVGPVSVAIDAGHSSFQFYQSGIYYEPDCSSEDLDHGVLVVGYG 173
5992 Query: 295 AKN 297
5993             + 
5994 Sbjct: 174 FEG 176
5997 >sp|P97821|CATC_MOUSE DIPEPTIDYL-PEPTIDASE I PRECURSOR (DPP-I) (DPPI) (CATHEPSIN C)
5998            (CATHEPSIN J) (DIPEPTIDYL TRANSFERASE)
5999           Length = 462
6001  Score =  262 bits (662), Expect = 9e-70
6002  Identities = 86/317 (27%), Positives = 148/317 (46%), Gaps = 37/317 (11%)
6004 Query: 43  EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTD 102
6005            E Y ER   +  N   ++ +N +    K+ T     ++  +S  +      +++      
6006 Sbjct: 161 ERYSERL--YTHNHNFVKAINTVQ---KSWTATAYKEYEKMSLRDLIRRSGHSQRIPRPK 215
6008 Query: 103 DLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTR---GAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQ 159
6009              P+ D +  + +N +P ++DWR       V+PV+NQ  CGSC+SF++ G +E +  I  
6010 Sbjct: 216 PAPMTDEIQQQILN-LPESWDWRNVQGVNYVSPVRNQESCGSCYSFASMGMLEARIRILT 274
6012 Query: 160 NKLVS--LSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYT 217
6013            N   +  LS Q +V C              +GC+GG          ++ G+  ES +PYT
6014 Sbjct: 275 NNSQTPILSPQEVVSCSPYA----------QGCDGGFPYLIAGKYAQDFGVVEESCFPYT 324
6016 Query: 218 AETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPK-----NETVMAGYIVSTGPLAIAADAVE-WQFYI 271
6017            A+  + C      +    S++  +       NE +M   +V  GP+A+A +  + +  Y 
6018 Sbjct: 325 AKD-SPCKPRENCLRYYSSDYYYVGGFYGGCNEALMKLELVKHGPMAVAFEVHDDFLHYH 383
6020 Query: 272 GGVFDI-----PCNPNSL-DHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYL 325
6021             G++       P NP  L +H +L+VGY          + YWI+KNSWG++WGE GY  +
6022 Sbjct: 384 SGIYHHTGLSDPFNPFELTNHAVLLVGYGRDPVT---GIEYWIIKNSWGSNWGESGYFRI 440
6024 Query: 326 RRGKNTCGVSNFVSTSI 342
6025            RRG + C + +    +I
6026 Sbjct: 441 RRGTDECAIESIAVAAI 457
6029 >sp|P25781|CYSP_THEAN CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR
6030           Length = 441
6032  Score =  259 bits (655), Expect = 6e-69
6033  Identities = 105/343 (30%), Positives = 162/343 (46%), Gaps = 50/343 (14%)
6035 Query: 28  QFLEFQDKFNKKY-SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSD 86
6036            +F  F +K+ K + S ++ ++RF  F+ N   ++                +NKF+DLS +
6037 Sbjct: 119 EFDAFVEKYKKVHRSFDQRVQRFLTFRKNYHIVKTHKPTEP-----YSLDLNKFSDLSDE 173
6039 Query: 87  EFKNYY--------------------LNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP--TAFDW 124
6040            EFK  Y                    +++K  I+   L  A  +++    S+      +W
6041 Sbjct: 174 EFKALYPVITPPKTYTSLSKHLEFKKMSHKNPIYISKLKKAKGIEEIKDLSLITGENLNW 233
6043 Query: 125 RTRGAVTPVKNQG-QCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGE 183
6044                AV+P K+QG  CGSCW+FS+  +VE  + + +NK   LSEQ LV+CD   M     
6045 Sbjct: 234 ARTDAVSPTKDQGDHCGSCWAFSSIASVESLYRLYKNKSYFLSEQELVNCDKSSM----- 288
6047 Query: 184 EACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPK 243
6048                 GC GGL   A  YI  + G+  ES  PYT    + C  +  N    I + +++  
6049 Sbjct: 289 -----GCAGGLPITALEYI-HSKGVSFESEVPYTGIV-SPCKPSIKN-KVFIDSISILKG 340
6051 Query: 244 NETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKN 303
6052            N+ V    ++S   + IA    E + Y GG+F   C    L+H +L+VG    +      
6053 Sbjct: 341 NDVVNKSLVISPTVVGIAVT-KELKLYSGGIFTGKCG-GELNHAVLLVGEGVDH---ETG 395
6055 Query: 304 MPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRR---GKNTCGVSNFVSTSII 343
6056            M YWI+KNSWG DWGE G++ L+R   G + CG+  F    I+
6057 Sbjct: 396 MRYWIIKNSWGEDWGENGFLRLQRTKKGLDKCGILTFGLNPIL 438
6060 >sp|P08176|MMAL_DERPT MAJOR MITE FECAL ALLERGEN DER P 1 PRECURSOR (DER P I)
6061           Length = 320
6063  Score =  255 bits (644), Expect = 1e-67
6064  Identities = 105/356 (29%), Positives = 153/356 (42%), Gaps = 49/356 (13%)
6066 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIE 60
6067            MK++L     +    V +R   P     F E++  FNK Y+  E     E  + N   +E
6068 Sbjct: 1   MKIVLAIASLLALSAVYAR---PSSIKTFEEYKKAFNKSYATFEDE---EAARKN--FLE 52
6070 Query: 61  ELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFI----- 115
6071             +  +  N        +N  +DLS DEFKN +L + EA   + L     L+ E       
6072 Sbjct: 53  SVKYVQSNGG-----AINHLSDLSLDEFKNRFLMSAEAF--EHLKTQFDLNAETNACSIN 105
6074 Query: 116 NSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDH 175
6075             + P   D R    VTP++ QG CGSCW+FS     E  +   +N+ + L+EQ LVDC  
6076 Sbjct: 106 GNAPAEIDLRQMRTVTPIRMQGGCGSCWAFSGVAATESAYLAYRNQSLDLAEQELVDC-- 163
6078 Query: 176 ECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKI 235
6079                     A   GC+G   P    YI  NG +Q ES Y Y A   +    N+   G  I
6080 Sbjct: 164 ---------ASQHGCHGDTIPRGIEYIQHNGVVQ-ESYYRYVAREQSCRRPNAQRFG--I 211
6082 Query: 236 SNFTMI-PKNETVMAGYIV-STGPLAIAA---DAVEWQFYIGGVF---DIPCNPNSLDHG 287
6083            SN+  I P N   +   +  +   +A+     D   ++ Y G      D    PN   H 
6084 Sbjct: 212 SNYCQIYPPNVNKIREALAQTHSAIAVIIGIKDLDAFRHYDGRTIIQRDNGYQPNY--HA 269
6086 Query: 288 ILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
6087            + IVGYS       + + YWIV+NSW  +WG+ GY Y     +   +  +    I+
6088 Sbjct: 270 VNIVGYSN-----AQGVDYWIVRNSWDTNWGDNGYGYFAANIDLMMIEEYPYVVIL 320
6091 >sp|P14518|BROM_ANACO BROMELAIN, STEM
6092           Length = 212
6094  Score =  253 bits (640), Expect = 4e-67
6095  Identities = 80/230 (34%), Positives = 114/230 (48%), Gaps = 27/230 (11%)
6097 Query: 117 SIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHE 176
6098            ++P + DWR  GAVT VKNQ  CG+CW+F+    VE  + I +  L  LSEQ ++DC   
6099 Sbjct: 1   AVPQSIDWRDYGAVTSVKNQNPCGACWAFAAIATVESIYKIKKGILEPLSEQQVLDCAK- 59
6101 Query: 177 CMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKIS 236
6102                        GC GG +  A+ +II N G+ + + YPY A  GT C  +     A I+
6103 Sbjct: 60  ----------GYGCKGGWEFRAFEFIISNKGVASGAIYPYKAAKGT-CKTDGVPNSAYIT 108
6105 Query: 237 NFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA-VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSA 295
6106             +  +P+N      Y VS  P+ +A DA   +Q+Y  GVF+ PC   SL+H +  +GY  
6107 Sbjct: 109 GYARVPRNNESSMMYAVSKQPITVAVDANANFQYYKSGVFNGPCG-TSLNHAVTAIGYGQ 167
6109 Query: 296 KNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG----KNTCGVSNFVSTS 341
6110             + I+ K          WGA WGE GYI + R        CG++      
6111 Sbjct: 168 DSIIYPK---------KWGAKWGEAGYIRMARDVSSSSGICGIAIDPLYP 208
6114 >sp|P53634|CATC_HUMAN DIPEPTIDYL-PEPTIDASE I PRECURSOR (DPP-I) (DPPI) (CATHEPSIN C)
6115            (CATHEPSIN J) (DIPEPTIDYL TRANSFERASE)
6116           Length = 463
6118  Score =  251 bits (634), Expect = 2e-66
6119  Identities = 86/318 (27%), Positives = 137/318 (43%), Gaps = 36/318 (11%)
6121 Query: 41  SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIF 100
6122            S E+Y  R   +K +   ++ +N I  +  A T      +  L+  +       +   I 
6123 Sbjct: 159 SQEKYSNRL--YKYDHNFVKAINAIQKSWTATTYME---YETLTLGDMIRRSGGHSRKIP 213
6125 Query: 101 TDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGA---VTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFI 157
6126                        + I  +PT++DWR       V+PV+NQ  CGSC+SF++ G +E +  I
6127 Sbjct: 214 RPKPAPLTAEIQQKILHLPTSWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARIRI 273
6129 Query: 158 SQNKLVS--LSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYP 215
6130              N   +  LS Q +V C              +GC GG          ++ G+  E+ +P
6131 Sbjct: 274 LTNNSQTPILSPQEVVSCSQYA----------QGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEACFP 323
6133 Query: 216 YTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPK-----NETVMAGYIVSTGPLAIAADAVE-WQF 269
6134            YT    + C           S +  +       NE +M   +V  GP+A+A +  + +  
6135 Sbjct: 324 YTGTD-SPCKMKEDCFRYYSSEYHYVGGFYGGCNEALMKLELVHHGPMAVAFEVYDDFLH 382
6137 Query: 270 YIGGVFDI-----PCNPNSL-DHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYI 323
6138            Y  G++       P NP  L +H +L+VGY   +      M YWIVKNSWG  WGE GY 
6139 Sbjct: 383 YKKGIYHHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSAS---GMDYWIVKNSWGTGWGENGYF 439
6141 Query: 324 YLRRGKNTCGVSNFVSTS 341
6142             +RRG + C + +    +
6143 Sbjct: 440 RIRRGTDECAIESIAVAA 457
6146 >sp|P80067|CATC_RAT DIPEPTIDYL-PEPTIDASE I PRECURSOR (DPP-I) (DPPI) (CATHEPSIN C)
6147            (CATHEPSIN J) (DIPEPTIDYL TRANSFERASE)
6148           Length = 462
6150  Score =  250 bits (631), Expect = 4e-66
6151  Identities = 86/317 (27%), Positives = 145/317 (45%), Gaps = 37/317 (11%)
6153 Query: 43  EEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTD 102
6154            E+Y ER   +  +   ++ +N +  +  A T     ++  LS  +      ++   +   
6155 Sbjct: 161 EKYSERL--YSHHHNFVKAINSVQKSWTATT---YRRYEKLSIRDLIRRSGHSGRILRPK 215
6157 Query: 103 DLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGA---VTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQ 159
6158              P+ D +  + + S+P ++DWR       V+PV+NQ  CGSC+SF++ G +E +  I  
6159 Sbjct: 216 PAPITDEIQQQIL-SLPESWDWRNVRGINFVSPVRNQESCGSCYSFASIGMLEARIRILT 274
6161 Query: 160 NKLVS--LSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYT 217
6162            N   +  LS Q +V C              +GC+GG          ++ G+  E+ +PYT
6163 Sbjct: 275 NNSQTPILSPQEVVSCSPYA----------QGCDGGFPYLIAGKYAQDFGVVEENCFPYT 324
6165 Query: 218 AETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPK-----NETVMAGYIVSTGPLAIAADAVE-WQFYI 271
6166            A     C      +    S +  +       NE +M   +V  GP+A+A +  + +  Y 
6167 Sbjct: 325 ATDAP-CKPKENCLRYYSSEYYYVGGFYGGCNEALMKLELVKHGPMAVAFEVHDDFLHYH 383
6169 Query: 272 GGVFDI-----PCNPNSL-DHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYL 325
6170             G++       P NP  L +H +L+VGY          + YWIVKNSWG+ WGE GY  +
6171 Sbjct: 384 SGIYHHTGLSDPFNPFELTNHAVLLVGYGKDPVT---GLDYWIVKNSWGSQWGESGYFRI 440
6173 Query: 326 RRGKNTCGVSNFVSTSI 342
6174            RRG + C + +    +I
6175 Sbjct: 441 RRGTDECAIESIAMAAI 457
6178 >sp|P22497|CYSP_THEPA CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR
6179           Length = 439
6181  Score =  243 bits (613), Expect = 5e-64
6182  Identities = 98/342 (28%), Positives = 155/342 (44%), Gaps = 48/342 (14%)
6184 Query: 24  EEQSQFLEFQDKFNKKYSHE-EYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFAD 82
6185            E   +F EF  K+N++++ + E L R   F+SN  +++E              G+N+F+D
6186 Sbjct: 119 EVYREFEEFNSKYNRRHATQQERLNRLVTFRSNYLEVKE-----QKGDEPYVKGINRFSD 173
6188 Query: 83  LSSDEFKN---------------YYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIP----TAFD 123
6189            L+  EF                 YYL +  A  T    +   L+ +    +        D
6190 Sbjct: 174 LTEREFYKLFPVMKPPKATYSNGYYLLSHMANKTYLKNLKKALNTDEDVDLAKLTGENLD 233
6192 Query: 124 WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGE 183
6193            WR   +VT VK+Q  CG CW+FST G+VEG +    +K   LS Q L+DCD         
6194 Sbjct: 234 WRRSSSVTSVKDQSNCGGCWAFSTVGSVEGYYMSHFDKSYELSVQELLDCD--------- 284
6196 Query: 184 EACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPK 243
6197             +   GC GGL  +AY Y+ K  G+ +    P+  +   +C+   A     + ++ +   
6198 Sbjct: 285 -SFSNGCQGGLLESAYEYVRK-YGLVSAKDLPFV-DKARRCSVPKAK-KVSVPSYHVFKG 340
6200 Query: 244 NETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRK 302
6201             E  +    +++ P ++      E   Y  GVF   C   SL+H +++VG          
6202 Sbjct: 341 KE--VMTRSLTSSPCSVYLSVSPELAKYKSGVFTGECG-KSLNHAVVLVGEGYDEV---T 394
6204 Query: 303 NMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRR---GKNTCGVSNFVSTS 341
6205               YW+V+NSWG DWGE GY+ L R   G + CGV +   ++
6206 Sbjct: 395 KKRYWVVQNSWGTDWGENGYMRLERTNMGTDKCGVLDTSMSA 436
6209 >sp|P07858|CATB_HUMAN CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1) (APP SECRETASE)
6210           Length = 339
6212  Score =  238 bits (602), Expect = 1e-62
6213  Identities = 71/299 (23%), Positives = 114/299 (37%), Gaps = 58/299 (19%)
6215 Query: 82  DLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD----WRTRGAVTPVKNQG 137
6216            D+S       YL      F         +       +P +FD    W     +  +++QG
6217 Sbjct: 51  DMS-------YLKRLCGTFLGGPKPPQRVMFTEDLKLPASFDAREQWPQCPTIKEIRDQG 103
6219 Query: 138 QCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSL--SEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQ 195
6220             CGSCW+F     +  +  I  N  VS+  S ++L+ C   C        C +GCNGG  
6221 Sbjct: 104 SCGSCWAFGAVEAISDRICIHTNAHVSVEVSAEDLLTC---C-----GSMCGDGCNGGYP 155
6223 Query: 196 PNAYNYIIKNGGIQ----------------------TESSYPYTAETGT-QCN------F 226
6224              A+N+  + G +                         S  P T E  T +C+      +
6225 Sbjct: 156 AEAWNFWTRKGLVSGGLYESHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCTGEGDTPKCSKICEPGY 215
6227 Query: 227 NSANIGAKISNF--TMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNS 283
6228            +      K   +    +  +E  +   I   GP+  A     ++  Y  GV+        
6229 Sbjct: 216 SPTYKQDKHYGYNSYSVSNSEKDIMAEIYKNGPVEGAFSVYSDFLLYKSGVYQHVTGEMM 275
6231 Query: 284 LDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
6232              H I I+G+  +N       PYW+V NSW  DWG+ G+  + RG++ CG+ + V   I
6233 Sbjct: 276 GGHAIRILGWGVEN-----GTPYWLVANSWNTDWGDNGFFKILRGQDHCGIESEVVAGI 329
6236 >sp|P00787|CATB_RAT CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1) (RSG-2)
6237           Length = 339
6239  Score =  236 bits (597), Expect = 4e-62
6240  Identities = 69/289 (23%), Positives = 117/289 (39%), Gaps = 51/289 (17%)
6242 Query: 92  YLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFST 147
6243            YL            + + +      ++P +FD    W     +  +++QG CGSCW+F  
6244 Sbjct: 54  YLKKLCGTVLGGPNLPERVGFSEDINLPESFDAREQWSNCPTIAQIRDQGSCGSCWAFGA 113
6246 Query: 148 TGNVEGQHFISQNKLVSL--SEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKN 205
6247               +  +  I  N  V++  S ++L+ C   C        C +GCNGG    A+N+  + 
6248 Sbjct: 114 VEAMSDRICIHTNGRVNVEVSAEDLLTC---C-----GIQCGDGCNGGYPSGAWNFWTRK 165
6250 Query: 206 GGIQ----------------------TESSYPYTAETGT-QCN------FNSANIGAKIS 236
6251            G +                         S  P T E  T +CN      ++++    K  
6252 Sbjct: 166 GLVSGGVYNSHIGCLPYTIPPCEHHVNGSRPPCTGEGDTPKCNKMCEAGYSTSYKEDKHY 225
6254 Query: 237 NFTM--IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA-VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGY 293
6255             +T   +  +E  +   I   GP+  A     ++  Y  GV+          H I I+G+
6256 Sbjct: 226 GYTSYSVSDSEKEIMAEIYKNGPVEGAFTVFSDFLTYKSGVYKHEAGDVMGGHAIRILGW 285
6258 Query: 294 SAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
6259              +N +     PYW+V NSW  DWG+ G+  + RG+N CG+ + +   I
6260 Sbjct: 286 GIENGV-----PYWLVANSWNVDWGDNGFFKILRGENHCGIESEIVAGI 329
6263 >sp|P10605|CATB_MOUSE CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1)
6264           Length = 339
6266  Score =  233 bits (588), Expect = 4e-61
6267  Identities = 67/289 (23%), Positives = 111/289 (38%), Gaps = 51/289 (17%)
6269 Query: 92  YLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFST 147
6270            YL            +   +       +P  FD    W     +  +++QG CGSCW+F  
6271 Sbjct: 54  YLKKLCGTVLGGPKLPGRVAFGEDIDLPETFDAREQWSNCPTIGQIRDQGSCGSCWAFGA 113
6273 Query: 148 TGNVEGQHFISQNKLVSL--SEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKN 205
6274               +  +  I  N  V++  S ++L+ C   C        C +GCNGG    A+++  K 
6275 Sbjct: 114 VEAISDRTCIHTNGRVNVEVSAEDLLTC---C-----GIQCGDGCNGGYPSGAWSFWTKK 165
6277 Query: 206 GGIQ----------------------TESSYPYTAETGT-QCN------FNSANIGAKIS 236
6278            G +                         S  P T E  T +CN      ++ +    K  
6279 Sbjct: 166 GLVSGGVYNSHVGCLPYTIPPCEHHVNGSRPPCTGEGDTPRCNKSCEAGYSPSYKEDKHF 225
6281 Query: 237 NFTM--IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADA-VEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGY 293
6282             +T   +  +   +   I   GP+  A     ++  Y  GV+          H I I+G+
6283 Sbjct: 226 GYTSYSVSNSVKEIMAEIYKNGPVEGAFTVFSDFLTYKSGVYKHEAGDMMGGHAIRILGW 285
6285 Query: 294 SAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
6286              +N +     PYW+  NSW  DWG+ G+  + RG+N CG+ + +   I
6287 Sbjct: 286 GVENGV-----PYWLAANSWNLDWGDNGFFKILRGENHCGIESEIVAGI 329
6290 >sp|P43509|CPR5_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 5 PRECURSOR
6291           Length = 344
6293  Score =  232 bits (586), Expect = 8e-61
6294  Identities = 68/280 (24%), Positives = 114/280 (40%), Gaps = 53/280 (18%)
6296 Query: 105 PVADYLDDEFINSIPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQN 160
6297               D +  E  ++IP  FD    W    ++  +++Q  CGSCW+F+    +  +  I+ N
6298 Sbjct: 69  KDEDIVATEVSDAIPDHFDARDQWPNCMSINNIRDQSDCGSCWAFAAAEAISDRTCIASN 128
6300 Query: 161 KLVS--LSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTES------ 212
6301              V+  LS ++L+ C        G  +C  GC GG    A+ + +K+G +   S      
6302 Sbjct: 129 GAVNTLLSSEDLLSC------CTGMFSCGNGCEGGYPIQAWKWWVKHGLVTGGSYETQFG 182
6304 Query: 213 SYPYTA-------------------ETGTQC--------NFNSANIGAKISNFTM--IPK 243
6305              PY+                    E   +C        N+ +  +  K    T   + K
6306 Sbjct: 183 CKPYSIAPCGETVNGVKWPACPEDTEPTPKCVDSCTSKNNYATPYLQDKHFGSTAYAVGK 242
6308 Query: 244 NETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRK 302
6309                +   I++ GP+ +A     ++  Y  GV+      +   H + I+G+   N     
6310 Sbjct: 243 KVEQIQTEILTNGPIEVAFTVYEDFYQYTTGVYVHTAGASLGGHAVKILGWGVDN----- 297
6312 Query: 303 NMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
6313              PYW+V NSW   WGE+GY  + RG N CG+ +     I
6314 Sbjct: 298 GTPYWLVANSWNVAWGEKGYFRIIRGLNECGIEHSAVAGI 337
6317 >sp|P07688|CATB_BOVIN CATHEPSIN B PRECURSOR
6318           Length = 335
6320  Score =  232 bits (586), Expect = 8e-61
6321  Identities = 66/263 (25%), Positives = 108/263 (40%), Gaps = 51/263 (19%)
6323 Query: 118 IPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSL--SEQNLV 171
6324            +P +FD    W     +  +++QG CGSCW+F     +  +  I  N  V++  S ++++
6325 Sbjct: 80  LPESFDAREQWPNCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRICIHSNGRVNVEVSAEDML 139
6327 Query: 172 DCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQ---------------------- 209
6328             C        GE  C +GCNGG    A+N+  K G +                       
6329 Sbjct: 140 TC------CGGE--CGDGCNGGFPSGAWNFWTKKGLVSGGLYNSHVGCRPYSIPPCEHHV 191
6331 Query: 210 TESSYPYTAETGT-QCN------FNSANIGAKISN--FTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAI 260
6332              S  P T E  T +CN      ++ +    K        +  NE  +   I   GP+  
6333 Sbjct: 192 NGSRPPCTGEGDTPKCNKTCEPGYSPSYKEDKHFGCSSYSVANNEKEIMAEIYKNGPVEG 251
6335 Query: 261 AADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGE 319
6336            A     ++  Y  GV+          H I I+G+  +N       PYW+V NSW  DWG+
6337 Sbjct: 252 AFSVYSDFLLYKSGVYQHVSGEIMGGHAIRILGWGVEN-----GTPYWLVGNSWNTDWGD 306
6339 Query: 320 QGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
6340             G+  + RG++ CG+ + +   +
6341 Sbjct: 307 NGFFKILRGQDHCGIESEIVAGM 329
6344 >sp|P43233|CATB_CHICK CATHEPSIN B PRECURSOR (CATHEPSIN B1)
6345           Length = 340
6347  Score =  232 bits (585), Expect = 1e-60
6348  Identities = 72/323 (22%), Positives = 122/323 (37%), Gaps = 62/323 (19%)
6350 Query: 59  IEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSI 118
6351            +  +N +    +A   F      D+S       Y+      F       + +D      +
6352 Sbjct: 31  VNHINKLNTTGRAGHNF---HNTDMS-------YVKKLCGTFLGGPKAPERVDFAEDMDL 80
6354 Query: 119 PTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVS--LSEQNLVD 172
6355            P  FD    W     ++ +++QG CGSCW+F     +  +  +  N  VS  +S ++L+ 
6356 Sbjct: 81  PDTFDTRKQWPNCPTISEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRICVHTNAKVSVEVSAEDLLS 140
6358 Query: 173 CDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGI----------------------QT 210
6359            C   C        C  GCNGG    A+ Y  + G +                        
6360 Sbjct: 141 C---C-----GFECGMGCNGGYPSGAWRYWTERGLVSGGLYDSHVGCRAYTIPPCEHHVN 192
6362 Query: 211 ESSYPYTAETGT--QCN------FNSANIGAKISNFTM--IPKNETVMAGYIVSTGPLAI 260
6363             S  P T E G   +C+      ++ +    K    T   +P++E  +   I   GP+  
6364 Sbjct: 193 GSRPPCTGEGGETPRCSRHCEPGYSPSYKEDKHYGITSYGVPRSEKEIMAEIYKNGPVEG 252
6366 Query: 261 AADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGE 319
6367            A     ++  Y  GV+          H I I+G+  +N       PYW+  NSW  DWG 
6368 Sbjct: 253 AFIVYEDFLMYKSGVYQHVSGEQVGGHAIRILGWGVEN-----GTPYWLAANSWNTDWGI 307
6370 Query: 320 QGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
6371             G+  + RG++ CG+ + +   +
6372 Sbjct: 308 TGFFKILRGEDHCGIESEIVAGV 330
6375 >sp|Q26563|CATC_SCHMA CATHEPSIN C PRECURSOR
6376           Length = 454
6378  Score =  231 bits (584), Expect = 1e-60
6379  Identities = 80/281 (28%), Positives = 124/281 (43%), Gaps = 38/281 (13%)
6381 Query: 81  ADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFI---NSIPTAFDWRT-----RGAVTP 132
6382            +  + DE +N     K  +    +        E I    ++P  FDW +     R  VTP
6383 Sbjct: 178 SKYTIDELRNRAGGVKSMVTRPSVLNRKTPSKELISLTGNLPLEFDWTSPPDGSRSPVTP 237
6385 Query: 133 VKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQN--KLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGC 190
6386            ++NQG CGSC++  +   +E +  +  N  +   LS Q +VDC              EGC
6387 Sbjct: 238 IRNQGICGSCYASPSAAALEARIRLVSNFSEQPILSPQTVVDCSPY----------SEGC 287
6389 Query: 191 NGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPK-----NE 245
6390            NGG          ++ G+  +   PYT E   +C  +        ++++ I       NE
6391 Sbjct: 288 NGGFPFLIAGKYGEDFGLPQKIVIPYTGEDTGKCTVSKNCTRYYTTDYSYIGGYYGATNE 347
6393 Query: 246 TVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPC--------NPNSL-DHGILIVGYSA 295
6394             +M   ++S GP  +  +   ++QFY  G++            NP  L +H +L+VGY  
6395 Sbjct: 348 KLMQLELISNGPFPVGFEVYEDFQFYKEGIYHHTTVQTDHYNFNPFELTNHAVLLVGYGV 407
6397 Query: 296 KNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSN 336
6398                     PYW VKNSWG +WGEQGY  + RG + CGV +
6399 Sbjct: 408 DKLS---GEPYWKVKNSWGVEWGEQGYFRILRGTDECGVES 445
6402 >sp|P25807|CYS1_CAEEL GUT-SPECIFIC CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR
6403           Length = 329
6405  Score =  231 bits (584), Expect = 1e-60
6406  Identities = 69/290 (23%), Positives = 114/290 (38%), Gaps = 46/290 (15%)
6408 Query: 83  LSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQ 138
6409            ++ +E K   ++ K A    D  +     +  + S+P  FD    W    ++  +++Q  
6410 Sbjct: 51  ITEEEMKFKLMDGKYAAAHSD-EIRATEQEVVLASVPATFDSRTQWSECKSIKLIRDQAT 109
6412 Query: 139 CGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVS--LSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQP 196
6413            CGSCW+F     +  +  I         +S  +L+ C   C       +C  GC GG   
6414 Sbjct: 110 CGSCWAFGAAEMISDRTCIETKGAQQPIISPDDLLSC---C-----GSSCGNGCEGGYPI 161
6416 Query: 197 NAYNYIIKNGGIQTESSY------PYTAETGTQ--------------CNFNSANIGAKIS 236
6417             A  +   + G+ T   Y      PY     T               C    +   AK  
6418 Sbjct: 162 QALRWW-DSKGVVTGGDYHGAGCKPYPIAPCTSGNCPESKTPSCSMSCQSGYSTAYAKDK 220
6420 Query: 237 NFTM----IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIV 291
6421            +F +    +PKN   +   I + GP+  A     ++  Y  GV+          H I I+
6422 Sbjct: 221 HFGVSAYAVPKNAASIQAEIYANGPVEAAFSVYEDFYKYKSGVYKHTAGKYLGGHAIKII 280
6424 Query: 292 GYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTS 341
6425            G+  ++       PYW+V NSWG +WGE G+  + RG + CG+ + V   
6426 Sbjct: 281 GWGTES-----GSPYWLVANSWGVNWGESGFFKIYRGDDQCGIESAVVAG 325
6429 >sp|P43508|CPR4_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 4 PRECURSOR
6430           Length = 335
6432  Score =  231 bits (583), Expect = 2e-60
6433  Identities = 78/304 (25%), Positives = 126/304 (40%), Gaps = 60/304 (19%)
6435 Query: 82  DLSSDEFKNYYLNNK-EAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD----WRTRGAVTPVKNQ 136
6436            D++ ++ K   +  +  A  T D+ V  +  +E  ++IP  FD    W    ++  +++Q
6437 Sbjct: 46  DITIEQVKKRLMRTEFVAPHTPDVEVVKHDINE--DTIPATFDARTQWPNCMSINNIRDQ 103
6439 Query: 137 GQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVS--LSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGL 194
6440              CGSCW+F+       +  I+ N  V+  LS ++++ C   C        C  GC GG 
6441 Sbjct: 104 SDCGSCWAFAAAEAASDRFCIASNGAVNTLLSAEDVLSC---CSN------CGYGCEGGY 154
6443 Query: 195 QPNAYNYIIKNGGIQTESSY-------PYT-------------------AETGTQC---- 224
6444              NA+ Y++K+G   T  SY       PY+                         C    
6445 Sbjct: 155 PINAWKYLVKSG-FCTGGSYEAQFGCKPYSLAPCGETVGNVTWPSCPDDGYDTPACVNKC 213
6447 Query: 225 ---NFNSANIGAKISNFTM--IPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIP 278
6448               N+N A    K    T   + K  + +   I++ GP+  A     ++  Y  GV+   
6449 Sbjct: 214 TNKNYNVAYTADKHFGSTAYAVGKKVSQIQAEIIAHGPVEAAFTVYEDFYQYKTGVYVHT 273
6451 Query: 279 CNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFV 338
6452                   H I I+G+   N       PYW+V NSW  +WGE GY  + RG N CG+ + V
6453 Sbjct: 274 TGQELGGHAIRILGWGTDN-----GTPYWLVANSWNVNWGENGYFRIIRGTNECGIEHAV 328
6455 Query: 339 STSI 342
6456               +
6457 Sbjct: 329 VGGV 332
6460 >sp|P43510|CPR6_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 6 PRECURSOR
6461           Length = 379
6463  Score =  225 bits (569), Expect = 8e-59
6464  Identities = 83/388 (21%), Positives = 143/388 (36%), Gaps = 78/388 (20%)
6466 Query: 1   MKVILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIE 60
6467            MK +L     V   + +                DK+  +    E  E        L   +
6468 Sbjct: 1   MKTLLFLSCIVVAAYCAC-------NDNLESVLDKYRNREIDSEAAE--------LDGDD 45
6470 Query: 61  ELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSI-- 118
6471             ++ +  N    T     +F+ +  +  K  +           +    +L       +  
6472 Sbjct: 46  LIDYVNENQNLWTAKKQRRFSSVYGENDKAKWGLMGVNHVRLSVKGKQHLSKTKDLDLDI 105
6474 Query: 119 PTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNK--LVSLSEQNLVD 172
6475            P +FD    W    ++  +++Q  CGSCW+F     +  +  I+ +    V+LS  +L+ 
6476 Sbjct: 106 PESFDSRDNWPKCDSIKVIRDQSSCGSCWAFGAVEAMSDRICIASHGELQVTLSADDLLS 165
6478 Query: 173 CDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQ------CNF 226
6479            C           +C  GCNGG    A+ Y +K+G I T S+Y  TA  G +      C  
6480 Sbjct: 166 CCK---------SCGFGCNGGDPLAAWRYWVKDG-IVTGSNY--TANNGCKPYPFPPCEH 213
6482 Query: 227 NSANIGA----------------KISNFTMIPKNE---------------TVMAGYIVST 255
6483            +S                      +S++T    +E                 +   +++ 
6484 Sbjct: 214 HSKKTHFDPCPHDLYPTPKCEKKCVSDYTDKTYSEDKFFGASAYGVKDDVEAIQKELMTH 273
6486 Query: 256 GPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWG 314
6487            GPL IA +   ++  Y GGV+          H + ++G+   + I     PYW V NSW 
6488 Sbjct: 274 GPLEIAFEVYEDFLNYDGGVYVHTGGKLGGGHAVKLIGWGIDDGI-----PYWTVANSWN 328
6490 Query: 315 ADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
6491             DWGE G+  + RG + CG+ + V   I
6492 Sbjct: 329 TDWGEDGFFRILRGVDECGIESGVVGGI 356
6495 >sp|P43157|CYSP_SCHJA CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR (ANTIGEN SJ31)
6496           Length = 342
6498  Score =  222 bits (559), Expect = 1e-57
6499  Identities = 69/299 (23%), Positives = 114/299 (38%), Gaps = 53/299 (17%)
6501 Query: 84  SSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQC 139
6502            S D+ +      KE               +    IP+ FD    W    +++ +++Q +C
6503 Sbjct: 56  SLDDARILMGARKEDAEMKRNRRPTVDHHDLNVEIPSQFDSRKKWPHCKSISQIRDQSRC 115
6505 Query: 140 GSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVS--LSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPN 197
6506            GSCW+F     +  +  I      S  LS  +L+ C   C +      C +GC GG    
6507 Sbjct: 116 GSCWAFGAVEAMTDRICIQSGGGQSAELSALDLISC---CKD------CGDGCQGGFPGV 166
6509 Query: 198 AYNYIIKNGGIQTESS--------YPY----------------TAETGTQCN------FN 227
6510            A++Y +K G +   S         YP+                      QC       + 
6511 Sbjct: 167 AWDYWVKRGIVTGGSKENHTGCQPYPFPKCEHHTKGKYPACGTKIYKTPQCKQTCQKGYK 226
6513 Query: 228 SANIGAKISN--FTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSL 284
6514            +     K        +  NE V+   I+  GP+  A D   ++  Y  G++         
6515 Sbjct: 227 TPYEQDKHYGDESYNVQNNEKVIQRDIMMYGPVEAAFDVYEDFLNYKSGIYRHVTGSIVG 286
6517 Query: 285 DHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
6518             H I I+G+  +     K  PYW++ NSW  DWGE+G   + RG++ C + + V   +I
6519 Sbjct: 287 GHAIRIIGWGVE-----KRTPYWLIANSWNEDWGEKGLFRMVRGRDECSIESDVVAGLI 340
6522 >sp|P25792|CYSP_SCHMA CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE PRECURSOR (ANTIGEN SM31)
6523           Length = 340
6525  Score =  216 bits (545), Expect = 5e-56
6526  Identities = 67/303 (22%), Positives = 117/303 (38%), Gaps = 55/303 (18%)
6528 Query: 78  NKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD----WRTRGAVTPV 133
6529            N+F  L     +      +  +     P  D+  +++   IP+ FD    W    ++  +
6530 Sbjct: 51  NRFHSLDDARIQMGARREEPDLRRKRRPTVDH--NDWNVEIPSNFDSRKKWPGCKSIATI 108
6532 Query: 134 KNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQN--KLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCN 191
6533            ++Q +CGSCWSF     +  +  I     + V LS  +L+ C   C      E+C  GC 
6534 Sbjct: 109 RDQSRCGSCWSFGAVEAMSDRSCIQSGGKQNVELSAVDLLTC---C------ESCGLGCE 159
6536 Query: 192 GGLQPNAYNYIIKNGGIQTESS--------YPY----------------------TAETG 221
6537            GG+   A++Y +K G +   S         YP+                        +  
6538 Sbjct: 160 GGILGPAWDYWVKEGIVTASSKENHTGCEPYPFPKCEHHTKGKYPPCGSKIYNTPRCKQT 219
6540 Query: 222 TQCNFNSANIGAKISN--FTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIP 278
6541             Q  + +     K        +  +E  +   I+  GP+  +     ++  Y  G++   
6542 Sbjct: 220 CQRKYKTPYTQDKHRGKSSYNVKNDEKAIQKEIMKYGPVEASFTVYEDFLNYKSGIYKHI 279
6544 Query: 279 CNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFV 338
6545                   H I I+G+  +N       PYW++ NSW  DWGE GY  + RG++ C + + V
6546 Sbjct: 280 TGEALGGHAIRIIGWGVEN-----KTPYWLIANSWNEDWGENGYFRIVRGRDECSIESEV 334
6548 Query: 339 STS 341
6549               
6550 Sbjct: 335 IAG 337
6553 >sp|P25802|CYS1_OSTOS CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR
6554           Length = 341
6556  Score =  213 bits (537), Expect = 4e-55
6557  Identities = 64/297 (21%), Positives = 110/297 (36%), Gaps = 56/297 (18%)
6559 Query: 88  FKNYYLNNKEAIFTD--DLPVADYLDDEFINSIPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGS 141
6560            FK   ++ K     +  D  V D   +E  + IP ++D    W    ++  + +Q  CGS
6561 Sbjct: 59  FKQRLMDLKYIDQNNIPDEEVEDEELEENNDDIPESYDPRIQWANCSSLFHIPDQANCGS 118
6563 Query: 142 CWSFSTTGNVEGQHFISQN--KLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAY 199
6564            CW+ S+   +  +  I+    K V +S Q++V C   C        C +GC GG   +A+
6565 Sbjct: 119 CWAVSSAAAMSDRICIASKGAKQVLISAQDVVSC---CTW------CGDGCEGGWPISAF 169
6567 Query: 200 NYIIKNGGIQ------TESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKI------------------ 235
6568             +    G +         S  PY        + N    G  +                  
6569 Sbjct: 170 RFHADEGVVTGGDYNTKGSCRPYEIHPCGH-HGNETYYGECVGMADTPRCKRRCLLGYPK 228
6571 Query: 236 --------SNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDH 286
6572                         +  +   +   I+  GP+        ++  Y  G++       +  H
6573 Sbjct: 229 SYPSDRYYKKAYQLKNSVKAIQKDIMKNGPVVATYTVYEDFAHYRSGIYKHKAGRKTGLH 288
6575 Query: 287 GILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
6576             + ++G+  +     K  PYWIV NSW  DWGE G+  + RG N CG    ++   +
6577 Sbjct: 289 AVKVIGWGEE-----KGTPYWIVANSWHDDWGENGFFRMHRGSNDCGFEERMAAGSV 340
6580 >sp|P25793|CYS2_HAECO CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 2 PRECURSOR
6581           Length = 342
6583  Score =  212 bits (534), Expect = 1e-54
6584  Identities = 64/302 (21%), Positives = 119/302 (39%), Gaps = 56/302 (18%)
6586 Query: 81  ADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD----WRTRGAVTPVKNQ 136
6587            +D + D F+   ++ K      +L V +  D E    IP ++D    W+       +++Q
6588 Sbjct: 53  SDPTPD-FEQKIMSIKYKHQKLNLMVKEDPDPEVD--IPPSYDPRDVWKNCTTFY-IRDQ 108
6590 Query: 137 GQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQN--KLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGL 194
6591              CGSCW+ ST   +  +  I+    K V++S  +++ C   C        C +GC GG 
6592 Sbjct: 109 ANCGSCWAVSTAAAISDRICIASKAEKQVNISATDIMTC---C-----RPQCGDGCEGGW 160
6594 Query: 195 QPNAYNYIIKNGGIQTES------SYPYTAET----GTQCNFNSANIGAKI--------- 235
6595               A+ Y I +G +            PY        G    +      A           
6596 Sbjct: 161 PIEAWKYFIYDGVVSGGEYLTKDVCRPYPIHPCGHHGNDTYYGECRGTAPTPPCKRKCRP 220
6598 Query: 236 -------------SNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNP 281
6599                          +  ++ ++   +   I+  GP+  +     +++ Y  G++      
6600 Sbjct: 221 GVRKMYRIDKRYGKDAYIVKQSVKAIQSEILKNGPVVASFAVYEDFRHYKSGIYKHTAGE 280
6602 Query: 282 NSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTS 341
6603                H + ++G+  +N     N  +W++ NSW  DWGE+GY  + RG N CG+   ++  
6604 Sbjct: 281 LRGYHAVKMIGWGNEN-----NTDFWLIANSWHNDWGEKGYFRIVRGSNDCGIEGTIAAG 335
6606 Query: 342 II 343
6607            I+
6608 Sbjct: 336 IV 337
6611 >sp|P19092|CYS1_HAECO CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 1 PRECURSOR
6612           Length = 342
6614  Score =  208 bits (523), Expect = 2e-53
6615  Identities = 62/295 (21%), Positives = 115/295 (38%), Gaps = 55/295 (18%)
6617 Query: 88  FKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCW 143
6618            F+   ++ K      +L V +  D E    IP ++D    W+       +++Q  CGSCW
6619 Sbjct: 59  FEQKIMDIKYKHQKLNLMVKEDPDPEVD--IPPSYDPRDVWKNCTTFY-IRDQANCGSCW 115
6621 Query: 144 SFSTTGNVEGQHFISQN--KLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNY 201
6622            + ST   +  +  I+    K V++S  +++ C   C        C +GC GG    A+ Y
6623 Sbjct: 116 AVSTAAAISDRICIASKAEKQVNISATDIMTC---C-----RPQCGDGCEGGWPIEAWKY 167
6625 Query: 202 IIKNGGIQTES------SYPYTAET----GTQCNFNSANIGAKI---------------- 235
6626             I +G +            PY        G    +      A                  
6627 Sbjct: 168 FIYDGVVSGGEYLTKDVCRPYPIHPCGHHGNDTYYGECRGTAPTPPCKRKCRPGVRKMYR 227
6629 Query: 236 ------SNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGI 288
6630                   +  ++ ++   +   I+  GP+  +     +++ Y  G++          H +
6631 Sbjct: 228 IDKRYGKDAYIVKQSVKAIQSEILRNGPVVASFAVYEDFRHYKSGIYKHTAGELRGYHAV 287
6633 Query: 289 LIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSII 343
6634             ++G+  +N     N  +W++ NSW  DWGE+GY  + RG N CG+   ++  I+
6635 Sbjct: 288 KMIGWGNEN-----NTDFWLIANSWHNDWGEKGYFRIIRGTNDCGIEGTIAAGIV 337
6638 >sp|P43507|CPR3_CAEEL CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 3 PRECURSOR
6639           Length = 370
6641  Score =  204 bits (513), Expect = 3e-52
6642  Identities = 61/265 (23%), Positives = 99/265 (37%), Gaps = 49/265 (18%)
6644 Query: 112 DEFINSIPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVS--L 165
6645            +     +P  FD    W     +  ++NQ  CGSCW+F     +  +  I  N      +
6646 Sbjct: 86  EIVPEPLPDTFDAREKWPDCNTIKLIRNQATCGSCWAFGAAEVISDRVCIQSNGTQQPVI 145
6648 Query: 166 SEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSY------PYTAE 219
6649            S ++++ C   C        C  GC GG    A  +   +G + T   Y      PY+  
6650 Sbjct: 146 SVEDILSC---C-----GTTCGYGCKGGYSIEALRFWASSGAV-TGGDYGGHGCMPYSFA 196
6652 Query: 220 TGTQ---------CNF------------NSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPL 258
6653              T+         C                 + GA     T   K+ T +   I   GP+
6654 Sbjct: 197 PCTKNCPESTTPSCKTTCQSSYKTEEYKKDKHYGASAYKVTT-TKSVTEIQTEIYHYGPV 255
6656 Query: 259 AIAADAV-EWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADW 317
6657              +     ++  Y  GV+          H + I+G+  +N +      YW++ NSWG  +
6658 Sbjct: 256 EASYKVYEDFYHYKSGVYHYTSGKLVGGHAVKIIGWGVENGV-----DYWLIANSWGTSF 310
6660 Query: 318 GEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVSTSI 342
6661            GE+G+  +RRG N C +   V   I
6662 Sbjct: 311 GEKGFFKIRRGTNECQIEGNVVAGI 335
6665 >sp|P25780|EUM1_EURMA MITE GROUP I ALLERGEN EUR M 1 (EUR M I)
6666           Length = 211
6668  Score =  201 bits (507), Expect = 1e-51
6669  Identities = 69/220 (31%), Positives = 99/220 (44%), Gaps = 25/220 (11%)
6671 Query: 117 SIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHE 176
6672            S+P+  D R+   VTP++ QG CGSCW+FS   + E  +   +N  + L+EQ LVDC   
6673 Sbjct: 10  SLPSELDLRSLRTVTPIRMQGGCGSCWAFSGVASTESAYLAYRNMSLDLAEQELVDC--- 66
6675 Query: 177 CMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKIS 236
6676                    A   GC+G   P    YI +NG +Q E  YPY A   +    N+   G K  
6677 Sbjct: 67  --------ASQNGCHGDTIPRGIEYIQQNGVVQ-EHYYPYVAREQSCHRPNAQRYGLK-- 115
6679 Query: 237 NFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAA-----DAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLD-HGILI 290
6680            N+  I   ++      ++    A+A      D   ++ Y G       N    + H + I
6681 Sbjct: 116 NYCQISPPDSNKIRQALTQTHTAVAVIIGIKDLNAFRHYDGRTIMQHDNGYQPNYHAVNI 175
6683 Query: 291 VGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKN 330
6684            VGY        + + YWIV+NSW   WG+ GY Y     N
6685 Sbjct: 176 VGYGN-----TQGVDYWIVRNSWDTTWGDNGYGYFAANIN 210
6688 >sp|P25773|CATL_FELCA CATHEPSIN L (PROGESTERONE-DEPENDENT PROTEIN) (PDP)
6689           Length = 139
6691  Score =  185 bits (464), Expect = 2e-46
6692  Identities = 55/141 (39%), Positives = 84/141 (59%), Gaps = 5/141 (3%)
6694 Query: 192 GGLQPNAYNYIIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGY 251
6695            GGL  +A+ Y+  NGG+ +E SYPY A+ G  C +   N  A ++++  IP  E  +   
6696 Sbjct: 1   GGLIDDAFQYVKDNGGLDSEESYPYHAQ-GDSCKYRPENSVANVTDYWDIPSKENELMIT 59
6698 Query: 252 IVSTGPLAIAADAV--EWQFYIGGVFDIP-CNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWI 308
6699            + + GP++ A DA    ++FY  G++  P C+   +DHG+L+VGY A  T   +N  YWI
6700 Sbjct: 60  LAAVGPISAAIDASLDTFRFYKEGIYYDPSCSSEDVDHGVLVVGYGADGT-ETENKKYWI 118
6702 Query: 309 VKNSWGADWGEQGYIYLRRGK 329
6703            +KNSWG DWG  GYI + + +
6704 Sbjct: 119 IKNSWGTDWGMDGYIKMAKDR 139
6707 >sp|Q23894|CYS3_DICDI CYSTEINE PROTEINASE 3 (CYSTEINE PROTEINASE II)
6708           Length = 151
6710  Score =  158 bits (395), Expect = 2e-38
6711  Identities = 61/158 (38%), Positives = 86/158 (53%), Gaps = 17/158 (10%)
6713 Query: 41  SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIF 100
6714            +H+E++ R+E FK N+  +   N    +  + T  G+N+ ADLS++E++  YL  +  I 
6715 Sbjct: 1   THKEFMPRYEEFKKNMDYVHNWN----SKGSKTVLGLNQHADLSNEEYRLNYLGTRAHIK 56
6717 Query: 101 TDDLPVAD---YLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFI 157
6718             +     +    L+       P   DWR + AVTPVK+QGQCGSC   STTG+VEG   I
6719 Sbjct: 57  LNGYHKRNLGLRLNRPHFKQ-PLNVDWREKDAVTPVKDQGQCGSC-IISTTGSVEGVTAI 114
6721 Query: 158 SQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQ 195
6722               KLVSLSEQN++               +EGCNGGL 
6723 Sbjct: 115 KTGKLVSLSEQNILRLSSSF--------GNEGCNGGLM 144
6726 >sp|P13823|SERA_PLAFG SERINE-REPEAT ANTIGEN PROTEIN PRECURSOR (P126) (111 KD ANTIGEN)
6727           Length = 989
6729  Score =  157 bits (393), Expect = 3e-38
6730  Identities = 60/255 (23%), Positives = 101/255 (39%), Gaps = 46/255 (18%)
6732 Query: 123 DWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEG 182
6733            D     +   V++QG C + W F++  ++E    +   +   +S   + +C      Y+G
6734 Sbjct: 569 DENNCISNLQVEDQGNCDTSWIFASKYHLETIRCMKGYEPTKISALYVANC------YKG 622
6736 Query: 183 EEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGG-IQTESSYPYT-AETGTQCN--------------- 225
6737            E    + C+ G  P  +  II++ G +  ES+YPY   + G QC                
6738 Sbjct: 623 EHK--DRCDEGSSPMEFLQIIEDYGFLPAESNYPYNYVKVGEQCPKVEDHWMNLWDNGKI 680
6740 Query: 226 -----------------FNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQ 268
6741                             + S      +  F  I K E +  G +++     I A+ V   
6742 Sbjct: 681 LHNKNEPNSLDGKGYTAYESERFHDNMDAFVKIIKTEVMNKGSVIAY----IKAENVMGY 736
6744 Query: 269 FYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG 328
6745             + G      C  ++ DH + IVGY        +   YWIV+NSWG  WG++GY  +   
6746 Sbjct: 737 EFSGKKVQNLCGDDTADHAVNIVGYGNYVNSEGEKKSYWIVRNSWGPYWGDEGYFKVDMY 796
6748 Query: 329 KNTCGVSNFVSTSII 343
6749              T    NF+ + +I
6750 Sbjct: 797 GPTHCHFNFIHSVVI 811
6753 >sp|Q06544|CYS3_OSTOS CATHEPSIN B-LIKE CYSTEINE PROTEINASE 3
6754           Length = 174
6756  Score =  139 bits (348), Expect = 6e-33
6757  Identities = 31/130 (23%), Positives = 53/130 (39%), Gaps = 8/130 (6%)
6759 Query: 217 TAETGTQCNFNSANIGAKISN--FTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAV-EWQFYIGG 273
6760              +   Q  +  A    K        +P N   +   I+  GP+        ++  Y  G
6761 Sbjct: 50  KCQKTCQRGYLKAYKEDKHFGKSAYRLPNNVKAIQRDIMKNGPVVAGFIVYEDFAHYKSG 109
6763 Query: 274 VFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRGKNTCG 333
6764            ++       +  H + I+G+  +     K  PYW++ NSW  DWGE+G+  + RG N C 
6765 Sbjct: 110 IYKHTAGRMTGGHAVKIIGWGKE-----KGTPYWLIANSWHDDWGEKGFYRMIRGINNCR 164
6767 Query: 334 VSNFVSTSII 343
6768            +   V   I+
6769 Sbjct: 165 IEEMVFAGIV 174
6772 >sp|P05993|PAP5_CARPA CYSTEINE PROTEINASE (CLONE PLBPC13)
6773           Length = 96
6775  Score =  131 bits (327), Expect = 2e-30
6776  Identities = 43/87 (49%), Positives = 55/87 (62%), Gaps = 2/87 (2%)
6778 Query: 256 GPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKN--TIFRKNMPYWIVKNSW 313
6779            GPLA+A +A   Q YIGGV         L+HG+L+VGY +     I  K  PYW++KNSW
6780 Sbjct: 1   GPLAVAINAAYMQTYIGGVSCPYICSRRLNHGVLLVGYGSAGYAPIRLKEKPYWVIKNSW 60
6782 Query: 314 GADWGEQGYIYLRRGKNTCGVSNFVST 340
6783            G +WGE GY  + RG+N CGV + VST
6784 Sbjct: 61  GENWGENGYYKICRGRNICGVDSMVST 87
6787 >sp|P12399|CT2A_MOUSE CTLA-2-ALPHA PROTEIN PRECURSOR
6788           Length = 136
6790  Score = 98.2 bits (241), Expect = 2e-20
6791  Identities = 32/131 (24%), Positives = 53/131 (40%), Gaps = 14/131 (10%)
6793 Query: 8   VLAVFTVFVSSRGIPPE--EQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLI 65
6794             L +  + + S   PP+    +++ E++ KF K Y+  E   R  +++ N  KIE  N  
6795 Sbjct: 16  FLLILCLGMMSAAPPPDPSLDNEWKEWKTKFAKAYNLNEERHRRLVWEENKKKIEAHNAD 75
6797 Query: 66  AINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWR 125
6798                K     G+N+F+DL+ +EFK     N                 E    +P   D  
6799 Sbjct: 76  YEQGKTSFYMGLNQFSDLTPEEFKTNCYGNSL------------NRGEMAPDLPEYEDLG 123
6801 Query: 126 TRGAVTPVKNQ 136
6802                +TP + Q
6803 Sbjct: 124 KNSYLTPGRAQ 134
6806 >sp|P12400|CT2B_MOUSE CTLA-2-BETA PROTEIN PRECURSOR
6807           Length = 141
6809  Score = 95.9 bits (235), Expect = 1e-19
6810  Identities = 29/133 (21%), Positives = 54/133 (39%), Gaps = 13/133 (9%)
6812 Query: 4   ILLFVLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELN 63
6813            + L +L +  +  +     P   +++ E++  F K YS +E   R  +++ N  KIE  N
6814 Sbjct: 20  VFLLILCLGMMSAAPS-PDPSLDNEWKEWKTTFAKAYSLDEERHRRLMWEENKKKIEAHN 78
6816 Query: 64  LIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFD 123
6817                  K     G+N+F+DL+ +EF+             +   +     E    +P   D
6818 Sbjct: 79  ADYERGKTSFYMGLNQFSDLTPEEFR------------TNCCGSSMCRGEMAPDLPEYED 126
6820 Query: 124 WRTRGAVTPVKNQ 136
6821                  +TP + Q
6822 Sbjct: 127 LGKNSYLTPGRAQ 139
6825 >sp|P32957|CC4_CARCN CYSTEINE PROTEINASE IV (CC-IV)
6826           Length = 43
6828  Score = 84.6 bits (206), Expect = 3e-16
6829  Identities = 26/42 (61%), Positives = 30/42 (70%)
6831 Query: 119 PTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQN 160
6832            P + DWR +GAVTPVKNQG CGSCW+FST   VEG + I   
6833 Sbjct: 2   PESIDWRKKGAVTPVKNQGSCGSCWAFSTIVTVEGINKIRTG 43
6836 >sp|P32956|CC3_CARCN CYSTEINE PROTEINASE III (CC-III)
6837           Length = 43
6839  Score = 84.2 bits (205), Expect = 4e-16
6840  Identities = 26/42 (61%), Positives = 30/42 (70%)
6842 Query: 119 PTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQN 160
6843            P + DWR +GAVTPVKNQG CGSCW+FST   VEG + I   
6844 Sbjct: 2   PESIDWRKKGAVTPVKNQGSCGSCWAFSTIATVEGINKIVHG 43
6847 >sp|P32955|CC2_CARCN CYSTEINE PROTEINASE II (CC-II)
6848           Length = 43
6850  Score = 81.5 bits (198), Expect = 2e-15
6851  Identities = 24/42 (57%), Positives = 29/42 (68%)
6853 Query: 119 PTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQN 160
6854            P + DWR +GAVTPVK+Q  CGSCW+FST   VEG + I   
6855 Sbjct: 2   PGSVDWRQKGAVTPVKDQNPCGSCWAFSTVATVEGINKIVTG 43
6858 >sp||CATL_CHICK_2 [Segment 2 of 2] CATHEPSIN L
6859           Length = 42
6861  Score = 77.2 bits (187), Expect = 5e-14
6862  Identities = 20/42 (47%), Positives = 28/42 (66%), Gaps = 1/42 (2%)
6864 Query: 303 NMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG-KNTCGVSNFVSTSII 343
6865               YWIVKNSWG  WG++GYIY+ +  KN CG++   S  ++
6866 Sbjct: 1   GKKYWIVKNSWGEKWGDKGYIYMAKDRKNHCGIATAASYPLV 42
6869 >sp|P32954|CC1_CARCN CYSTEINE PROTEINASE I (CC-I)
6870           Length = 43
6872  Score = 76.0 bits (184), Expect = 1e-13
6873  Identities = 24/40 (60%), Positives = 29/40 (72%)
6875 Query: 118 IPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFI 157
6876            I  + DWR +GAVTPV+NQG CGSCW+FS+   VEG   I
6877 Sbjct: 1   IVASIDWRQKGAVTPVRNQGSCGSCWTFSSVAAVEGIIKI 40
6880 >sp|P05689|CATX_BOVIN CATHEPSIN
6881           Length = 73
6883  Score = 59.7 bits (142), Expect = 9e-09
6884  Identities = 15/41 (36%), Positives = 24/41 (57%), Gaps = 5/41 (12%)
6886 Query: 285 DHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYL 325
6887            +H + + G+   +      M YWIV+NSWG  WGE G++ +
6888 Sbjct: 10  NHIVSVAGWGVSD-----GMEYWIVRNSWGEPWGEHGWMRI 45
6891 >sp|P94869|PEPG_LACDL AMINOPEPTIDASE G
6892           Length = 437
6894  Score = 46.0 bits (107), Expect = 1e-04
6895  Identities = 13/49 (26%), Positives = 21/49 (42%), Gaps = 4/49 (8%)
6897 Query: 280 NPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG 328
6898                + H + +VG        R+    W V+NSWG   GE+G+  +   
6899 Sbjct: 355 GAGEVSHAMTLVGVDEDKGDIRQ----WKVENSWGDKSGEKGFFVMSHN 399
6902 >sp|P94870|PEPE_LACHE AMINOPEPTIDASE E
6903           Length = 438
6905  Score = 42.9 bits (99), Expect = 0.001
6906  Identities = 14/48 (29%), Positives = 21/48 (43%), Gaps = 4/48 (8%)
6908 Query: 278 PCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYL 325
6909                  + H + +VG    N   R+    W V+NSWG   G +GY  +
6910 Sbjct: 354 KTGVGEVSHAMTLVGVDEDNGEVRQ----WKVENSWGDKSGAKGYYVM 397
6913 >sp|P94868|PEPW_LACDL AMINOPEPTIDASE W
6914           Length = 437
6916  Score = 42.1 bits (97), Expect = 0.002
6917  Identities = 14/43 (32%), Positives = 20/43 (45%), Gaps = 4/43 (9%)
6919 Query: 286 HGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYLRRG 328
6920            H + +VG        R+    W V+NSWG   GE+GY  +   
6921 Sbjct: 361 HDMALVGVDVDGGQVRQ----WKVENSWGDKSGEKGYFTMSAD 399
6924 >sp|Q10744|PEPC_LACHE AMINOPEPTIDASE C
6925           Length = 449
6927  Score = 41.4 bits (95), Expect = 0.003
6928  Identities = 13/46 (28%), Positives = 22/46 (47%), Gaps = 4/46 (8%)
6930 Query: 280 NPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYL 325
6931              + +DH ++I G    +    K    W ++NSWG   G +GY  +
6932 Sbjct: 358 GESMMDHAMVITGVDIVDGKPTK----WKIENSWGEKPGFKGYFVM 399
6935 >sp|Q04723|PEPC_LACLC AMINOPEPTIDASE C
6936           Length = 436
6938  Score = 39.8 bits (91), Expect = 0.009
6939  Identities = 15/68 (22%), Positives = 29/68 (42%), Gaps = 9/68 (13%)
6941 Query: 262 ADAVEWQ------FYIGGVFDIPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGA 315
6942             D+ +++      F       +    + + H +++ G    +     N   W V+NSWG 
6943 Sbjct: 326 MDSYDFKSSLDIEFTQSKAGRLDYGESLMTHAMVLAG---VDLDADGNSTKWKVENSWGK 382
6945 Query: 316 DWGEQGYI 323
6946            D G++GY 
6947 Sbjct: 383 DAGQKGYF 390
6950  Score = 31.6 bits (70), Expect = 2.5
6951  Identities = 15/77 (19%), Positives = 28/77 (35%), Gaps = 10/77 (12%)
6953 Query: 77  VNKFADLSS---DEFKN--YYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPT-AFDWRTRGAV 130
6954            +   +D +    + F         + A+  + L  +  +      ++P  + D       
6955 Sbjct: 1   MTVTSDFTQKLYENFAENTKLRAVENAVTKNGLLSSLEVRGSHAANLPEFSLDLTKD--- 57
6957 Query: 131 TPVKNQGQCGSCWSFST 147
6958             PV NQ Q G CW F+ 
6959 Sbjct: 58  -PVTNQKQSGRCWMFAA 73
6962 >sp|Q48543|PEPC_LACDL AMINOPEPTIDASE C
6963           Length = 449
6965  Score = 38.2 bits (87), Expect = 0.025
6966  Identities = 12/46 (26%), Positives = 23/46 (49%), Gaps = 4/46 (8%)
6968 Query: 280 NPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIVKNSWGADWGEQGYIYL 325
6969              + ++H ++I    A + +  K    W ++NSWG   G +GY  +
6970 Sbjct: 358 GESMMNHAMVIT---AVDLVDDKPTK-WKIENSWGDKSGFKGYFVM 399
6973 >sp|P21381|THPA_THADA THAUMATOPAIN
6974           Length = 35
6976  Score = 38.2 bits (87), Expect = 0.025
6977  Identities = 14/27 (51%), Positives = 19/27 (69%), Gaps = 2/27 (7%)
6979 Query: 117 SIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQ-CGSC 142
6980            ++P + DW  +GAV  VKNQ + CGSC
6981 Sbjct: 1   NLPNSVDWWKKGAVAAVKNQ-RXCGSC 26
6984 >sp|Q56115|PEPC_STRTR AMINOPEPTIDASE C
6985           Length = 445
6987  Score = 35.9 bits (81), Expect = 0.13
6988  Identities = 11/46 (23%), Positives = 21/46 (44%), Gaps = 5/46 (10%)
6990 Query: 279 CNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPY-WIVKNSWGADWGEQGYI 323
6991             + + + H +++ G            P  W ++NSWG   G++GY 
6992 Sbjct: 356 YSESLMTHAMVLTGVDLD----ADGKPIKWKIENSWGDKVGQKGYF 397
6995 >sp|P09983|HLY1_ECOLI HEMOLYSIN, CHROMOSOMAL
6996           Length = 1023
6998  Score = 35.5 bits (80), Expect = 0.17
6999  Identities = 21/119 (17%), Positives = 35/119 (28%), Gaps = 20/119 (16%)
7001 Query: 31  EFQDKFNKKYSHEEYLERFEIF-KSNLGKIEELNLIAI-------NHKADTKF-----GV 77
7002            E++ K  K Y    Y  R   F + N   + + N             +          GV
7003 Sbjct: 430 EWEKKHGKNYFENGYDARHAAFLEDNFKILSQYNKEYSVERSVLITQQHWDTLIGELAGV 489
7005 Query: 78  NKFAD--LSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVK 134
7006             +  D  LS   + +YY   K           D    +  + +    D     + T +K
7007 Sbjct: 490 TRNGDKTLSGKSYIDYYEEGKR-----LEKKPDEFQKQVFDPLKGNIDLSDSKSSTLLK 543
7010 >sp|P33403|CYSP_TRIFO CYSTEINE PROTEINASE
7011           Length = 23
7013  Score = 34.7 bits (78), Expect = 0.28
7014  Identities = 8/19 (42%), Positives = 12/19 (63%)
7016 Query: 120 TAFDWRTRGAVTPVKNQGQ 138
7017             + DWR +G V  +K+Q Q
7018 Sbjct: 2   DSLDWREKGVVNSIKDQAQ 20
7021 >sp|P08715|HLYA_ECOLI HEMOLYSIN, PLASMID
7022           Length = 1024
7024  Score = 34.7 bits (78), Expect = 0.28
7025  Identities = 9/38 (23%), Positives = 14/38 (36%), Gaps = 1/38 (2%)
7027 Query: 31  EFQDKFNKKYSHEEYLERFEIF-KSNLGKIEELNLIAI 67
7028            E++ K  K Y    Y  R   F + N   + + N    
7029 Sbjct: 431 EWEKKHGKNYFENGYDARHAAFLEDNFKILSQYNKEYS 468
7032 >sp|P87362|BLMH_CHICK BLEOMYCIN HYDROLASE (BLM HYDROLASE) (BMH) (AMINOPEPTIDASE H)
7033           Length = 455
7035  Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.37
7036  Identities = 10/19 (52%), Positives = 14/19 (73%)
7038 Query: 307 WIVKNSWGADWGEQGYIYL 325
7039            W V+NSWG D G +GY+ +
7040 Sbjct: 392 WRVENSWGEDRGNKGYLIM 410
7043 >sp|P54704|PSPB_DICDI PRESPORE PROTEIN B PRECURSOR
7044           Length = 379
7046  Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.37
7047  Identities = 24/109 (22%), Positives = 41/109 (37%), Gaps = 15/109 (13%)
7049 Query: 210 TESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQF 269
7050            T   YP T   G    +N   +  K  +  ++PK E   + Y+   GP     D   W++
7051 Sbjct: 78  TGKIYP-TVNMGDCHRYNVDLVFKKDKSGNVMPKKELRESAYVP-HGP----IDPATWKY 131
7053 Query: 270 YI--GGVFDI-PCNPNSL------DHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIV 309
7054            Y    G +    C+P ++          L +GY A        +  W++
7055 Sbjct: 132 YTFVQGKWTGFGCDPQNVVFSGAEGGMPLQLGYGANGKNGDNGISVWLI 180
7058 >sp|Q13867|BLMH_HUMAN BLEOMYCIN HYDROLASE (BLM HYDROLASE) (BMH)
7059           Length = 455
7061  Score = 34.0 bits (76), Expect = 0.49
7062  Identities = 10/19 (52%), Positives = 14/19 (73%)
7064 Query: 307 WIVKNSWGADWGEQGYIYL 325
7065            W V+NSWG D G +GY+ +
7066 Sbjct: 392 WRVENSWGEDHGHKGYLCM 410
7069 >sp|P70645|BLMH_RAT BLEOMYCIN HYDROLASE (BLM HYDROLASE) (BMH)
7070           Length = 454
7072  Score = 34.0 bits (76), Expect = 0.49
7073  Identities = 10/19 (52%), Positives = 14/19 (73%)
7075 Query: 307 WIVKNSWGADWGEQGYIYL 325
7076            W V+NSWG D G +GY+ +
7077 Sbjct: 392 WRVENSWGEDHGHKGYLCM 410
7080 >sp|P80532|CAT3_FASHE PUTATIVE CATHEPSIN L3 (NEWLY EXCYSTED JUVENILE PROTEIN 8)
7081           Length = 19
7083  Score = 34.0 bits (76), Expect = 0.49
7084  Identities = 9/18 (50%), Positives = 12/18 (66%)
7086 Query: 118 IPTAFDWRTRGAVTPVKN 135
7087            +P + DWR  G VT VK+
7088 Sbjct: 2   VPASIDWREYGYVTEVKD 19
7091 >sp|P16462|LKTA_ACTAC LEUKOTOXIN
7092           Length = 1050
7094  Score = 34.0 bits (76), Expect = 0.49
7095  Identities = 11/68 (16%), Positives = 25/68 (36%), Gaps = 2/68 (2%)
7097 Query: 12  FTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKA 71
7098             +    S  I  +   +   +++K+ K YS   Y  R   F      ++  N +   +K 
7099 Sbjct: 410 ASKQAVSEHIANQLADKIKAWENKYGKNYSENGYDARHSAFLE--DSLKLFNELREKYKT 467
7101 Query: 72  DTKFGVNK 79
7102            +    + +
7103 Sbjct: 468 ENILSITQ 475
7106 >sp|P13438|TSP_MOUSE TROPHOBLAST-SPECIFIC PROTEIN PRECURSOR
7107           Length = 124
7109  Score = 32.4 bits (72), Expect = 1.4
7110  Identities = 19/129 (14%), Positives = 41/129 (31%), Gaps = 12/129 (9%)
7112 Query: 8   VLAVFTVFVSSRGIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAI 67
7113             L +  + V+S  I PE Q      + K       +E L +  ++   +   +  +    
7114 Sbjct: 6   FLVILCLGVASAVIVPEAQLDAELQEQK------DKEVLIK-AVWSKFMKTNKLHSSEND 58
7116 Query: 68  NHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTR 127
7117                 +   ++    L+ +E           +F ++         + +   P   D+   
7118 Sbjct: 59  QETEGSNIEMSASGQLTDEELMKIMTTVLHPMFEEEENKP-----QPVVDDPEFEDYTES 113
7120 Query: 128 GAVTPVKNQ 136
7121            G    V NQ
7122 Sbjct: 114 GDGFFVPNQ 122
7125 >sp|Q00951|HLYA_ACTSU HEMOLYSIN (CYTOLYSIN II) (CLY-IIA) (HLY-IIA) (CYTC) (APPA)
7126           Length = 956
7128  Score = 32.4 bits (72), Expect = 1.4
7129  Identities = 10/36 (27%), Positives = 16/36 (43%), Gaps = 1/36 (2%)
7131 Query: 31  EFQDKFNKKYSHEEYLER-FEIFKSNLGKIEELNLI 65
7132            E++ K NK Y  + Y  R     + N+  +  LN  
7133 Sbjct: 427 EWEKKHNKNYFEQGYDSRHLADLQDNMKFLINLNKE 462
7136 >sp|P15377|RT2A_ACTPL RTX-II TOXIN DETERMINANT A (APX-IIA) (HEMOLYSIN IIA) (HLY-IIA)
7137            (CYTOLYSIN IIA) (CLY-IIA)
7138           Length = 956
7140  Score = 32.4 bits (72), Expect = 1.4
7141  Identities = 10/36 (27%), Positives = 16/36 (43%), Gaps = 1/36 (2%)
7143 Query: 31  EFQDKFNKKYSHEEYLER-FEIFKSNLGKIEELNLI 65
7144            E++ K NK Y  + Y  R     + N+  +  LN  
7145 Sbjct: 427 EWEKKHNKNYFEQGYDSRHLADLQDNMKFLINLNKE 462
7148 >sp|P52181|TGLC_PAGMA PROTEIN-GLUTAMINE GAMMA-GLUTAMYLTRANSFERASE (TISSUE
7149            TRANSGLUTAMINASE) (TGASE C) (TGC)
7150           Length = 695
7152  Score = 32.0 bits (71), Expect = 1.9
7153  Identities = 12/48 (25%), Positives = 17/48 (35%), Gaps = 5/48 (10%)
7155 Query: 102 DDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTG 149
7156            ++          +  S+P    W   G V PVK     G CW F+   
7157 Sbjct: 237 EEPYTDGVAPYRWTGSVPILQQWSKAG-VRPVKY----GQCWVFAAVA 279
7160 >sp|P35681|TCTP_ORYSA TRANSLATIONALLY CONTROLLED TUMOR PROTEIN HOMOLOG (TCTP)
7161           Length = 168
7163  Score = 32.0 bits (71), Expect = 1.9
7164  Identities = 12/34 (35%), Positives = 19/34 (55%)
7166 Query: 22  PPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSN 55
7167            PP ++ QF+ F  ++ K  S +   E+ E FK N
7168 Sbjct: 80  PPFDKKQFVTFMKRYIKNLSAKLDAEKQEEFKKN 113
7171 >sp|Q01532|BLH1_YEAST CYSTEINE PROTEINASE 1 (Y3) (BLEOMYCIN HYDROLASE) (BLM HYDROLASE)
7172           Length = 454
7174  Score = 31.6 bits (70), Expect = 2.5
7175  Identities = 16/40 (40%), Positives = 19/40 (47%), Gaps = 9/40 (22%)
7177 Query: 131 TPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNL 170
7178            TPV NQ   G CW F+ T  +         +L  LSE NL
7179 Sbjct: 62  TPVTNQKSSGRCWLFAATNQL---------RLNVLSELNL 92
7182 >sp|P16312|MMAL_DERMI MAJOR MITE FECAL ALLERGEN DER M 1 (DER M I)
7183           Length = 30
7185  Score = 31.2 bits (69), Expect = 3.2
7186  Identities = 8/24 (33%), Positives = 14/24 (58%)
7188 Query: 114 FINSIPTAFDWRTRGAVTPVKNQG 137
7189               ++P+  D R+   VTP++ QG
7190 Sbjct: 7   NSGNVPSELDLRSLRTVTPIRMQG 30
7193 >sp|O03992|TCTP_FRAAN TRANSLATIONALLY CONTROLLED TUMOR PROTEIN HOMOLOG (TCTP)
7194           Length = 170
7196  Score = 30.8 bits (68), Expect = 4.2
7197  Identities = 16/62 (25%), Positives = 30/62 (47%), Gaps = 13/62 (20%)
7199 Query: 22  PPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFA 81
7200            PP ++ QF+ +  ++ K  + +   E+ E FK N+             +  TKF ++K +
7201 Sbjct: 82  PPFDKKQFVTWVKRYIKLLTPKLEGEQQETFKKNI-------------EGATKFLLSKLS 128
7203 Query: 82  DL 83
7204            DL
7205 Sbjct: 129 DL 130
7208 >sp|Q04489|YMJ6_YEAST HYPOTHETICAL 59.5 KD PROTEIN IN VPS9-RAD10 INTERGENIC REGION
7209           Length = 525
7211  Score = 30.8 bits (68), Expect = 4.2
7212  Identities = 26/122 (21%), Positives = 43/122 (34%), Gaps = 20/122 (16%)
7214 Query: 174 DHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKN-----GGIQ----TESSYPYTAET--GT 222
7215            D   +++ GE    E   G         +++N     G I      E  Y YT      +
7216 Sbjct: 87  DRYFLQFNGELYNKEISQGDNDSLYIASMLQNLKEGMGVIDVIKSLEGEYAYTIYDVNSS 146
7218 Query: 223 QCNFNSANIGAKISNFTMIPKNETVMAGYIVSTGPLAIAADAVEWQFYIGGVFDIPCNPN 282
7219            +  F    IG +  ++++ P NE  +A         ++   A  +Q  IGGV        
7220 Sbjct: 147 KLYFGRDPIGRRSLSYSVTPDNELYVA---------SVTGSAGSFQDCIGGVIYEYDTRT 197
7222 Query: 283 SL 284
7223             L
7224 Sbjct: 198 KL 199
7227 >sp|Q03164|HRX_HUMAN ZINC FINGER PROTEIN HRX (ALL-1) (TRITHORAX-LIKE PROTEIN)
7228           Length = 3969
7230  Score = 30.8 bits (68), Expect = 4.2
7231  Identities = 17/81 (20%), Positives = 38/81 (45%), Gaps = 7/81 (8%)
7233 Query: 126  TRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDC-DHECMEYEGEE 184
7234                +V+ VK QGQ  S  +     ++E    +  +     S++NL+D  + E ++ + + 
7235 Sbjct: 2782 NCHSVSRVKTQGQ-DSLEA--QLSSLESSRRVHTSTP---SDKNLLDTYNTELLKSDSDN 2835
7237 Query: 185  ACDEGCNGGLQPNAYNYIIKN 205
7238                + C   L  +  ++++KN
7239 Sbjct: 2836 NNSDDCGNILPSDIMDFVLKN 2856
7242 >sp||CATB_COTJA_1 [Segment 1 of 2] CATHEPSIN B (CATHEPSIN B1)
7243           Length = 25
7245  Score = 30.4 bits (67), Expect = 5.6
7246  Identities = 6/25 (24%), Positives = 12/25 (48%), Gaps = 4/25 (16%)
7248 Query: 118 IPTAFD----WRTRGAVTPVKNQGQ 138
7249            +P  FD    W     ++ +++QG 
7250 Sbjct: 1   LPDTFDSRKQWPNCPTISEIRDQGS 25
7253 >sp|Q62703|RCN2_RAT RETICULOCALBIN 2 PRECURSOR (CALCIUM-BINDING PROTEIN ERC-55)
7254            (TAIPOXIN-ASSOCIATED CALCIUM-BINDING PROTEIN-49)
7255            (TCBP-49)
7256           Length = 318
7258  Score = 30.4 bits (67), Expect = 5.6
7259  Identities = 17/109 (15%), Positives = 40/109 (36%), Gaps = 4/109 (3%)
7261 Query: 26  QSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIA-INHKADTKFGVNKFADLS 84
7262            +++  ++     K Y+ +E  ++F  +  N       +      +     F  N   D +
7263 Sbjct: 84  ENELSQWIQMSFKHYAMQEAKQQFVEYDKNSDGTVTWDEYNVQMYDRVIDFDENTALDDT 143
7265 Query: 85  SDE-FKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSI--PTAFDWRTRGAV 130
7266             +E F+  +L +K+     +      L+ E   +   P   D+ T   +
7267 Sbjct: 144 EEESFRQLHLKDKKRFEKANQDSGPGLNLEEFIAFEHPEEVDYMTEFVI 192
7270 >sp|P48651|PSS1_HUMAN PHOSPHATIDYLSERINE SYNTHASE I (SERINE-EXCHANGE ENZYME I) (KIAA0024)
7271           Length = 473
7273  Score = 30.4 bits (67), Expect = 5.6
7274  Identities = 6/20 (30%), Positives = 8/20 (40%)
7276 Query: 142 CWSFSTTGNVEGQHFISQNK 161
7277            CW F   G +E    I   +
7278 Sbjct: 354 CWVFGVIGFLEAIVCIKFGQ 373
7281 >sp|P33404|CYSP_TRIVA CYSTEINE PROTEINASE
7282           Length = 22
7284  Score = 30.4 bits (67), Expect = 5.6
7285  Identities = 10/17 (58%), Positives = 13/17 (75%), Gaps = 1/17 (5%)
7287 Query: 123 DWRTRGAVTPV-KNQGQ 138
7288            DWR +GAV  + K+QGQ
7289 Sbjct: 6   DWRKKGAVNVIXKDQGQ 22
7292 >sp|Q00576|PSS1_CRILO PHOSPHATIDYLSERINE SYNTHASE I (SERINE-EXCHANGE ENZYME I)
7293           Length = 471
7295  Score = 30.4 bits (67), Expect = 5.6
7296  Identities = 6/20 (30%), Positives = 8/20 (40%)
7298 Query: 142 CWSFSTTGNVEGQHFISQNK 161
7299            CW F   G +E    I   +
7300 Sbjct: 354 CWVFGVIGFLEAIVCIKFGQ 373
7303 >sp|Q9ZRX0|TCTP_PSEMZ TRANSLATIONALLY CONTROLLED TUMOR PROTEIN HOMOLOG (TCTP)
7304           Length = 167
7306  Score = 30.1 bits (66), Expect = 7.3
7307  Identities = 17/62 (27%), Positives = 27/62 (43%), Gaps = 13/62 (20%)
7309 Query: 22  PPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFA 81
7310            PP ++ QFL F  ++ K  + +   ER   FK N+             +   K  V+K +
7311 Sbjct: 79  PPFDKKQFLGFIKRYIKNLATKLSEERQAEFKKNV-------------EGAAKMLVSKLS 125
7313 Query: 82  DL 83
7314            DL
7315 Sbjct: 126 DL 127
7318 >sp|Q94480|V136_DICDI VEG136 PROTEIN
7319           Length = 357
7321  Score = 30.1 bits (66), Expect = 7.3
7322  Identities = 21/95 (22%), Positives = 34/95 (35%), Gaps = 3/95 (3%)
7324 Query: 70  KADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIFTDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDWRTRGA 129
7325                 +G++ F  LS DE    Y ++       +     Y     I S    ++W     
7326 Sbjct: 79  NKKYDYGLDLFL-LSIDEGITGYRDDSLETVKRNQEQ--YPIPSQILSYKELYNWTMDDI 135
7328 Query: 130 VTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVS 164
7329            V  +  +G C SC  F       G   +  NK+V+
7330 Sbjct: 136 VKEIGLKGNCTSCGVFRRQALDRGAVMLKANKIVT 170
7333 >sp|P55131|RT32_ACTPL RTX-III TOXIN DETERMINANT A FROM SEROTYPE 8 (APX-IIIA) (CYTOLYSIN
7334            IIIA) (CLY-IIIA)
7335           Length = 1052
7337  Score = 30.1 bits (66), Expect = 7.3
7338  Identities = 9/53 (16%), Positives = 21/53 (38%), Gaps = 1/53 (1%)
7340 Query: 20  GIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIF-KSNLGKIEELNLIAINHKA 71
7341             +  +  ++  E++ K+ K Y    Y  R + F + +   +   N      +A
7342 Sbjct: 427 HVASKIGNKIDEWEKKYGKNYFENGYDARHKAFLEDSFSLLSSFNKQYETERA 479
7345 >sp|P55130|RT31_ACTPL RTX-III TOXIN DETERMINANT A FROM SEROTYPE 2 (APX-IIIA) (CYTOLYSIN
7346            IIIA) (CLY-IIIA)
7347           Length = 1049
7349  Score = 30.1 bits (66), Expect = 7.3
7350  Identities = 9/53 (16%), Positives = 21/53 (38%), Gaps = 1/53 (1%)
7352 Query: 20  GIPPEEQSQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIF-KSNLGKIEELNLIAINHKA 71
7353             +  +  ++  E++ K+ K Y    Y  R + F + +   +   N      +A
7354 Sbjct: 427 HVASKIGNKIDEWEKKYGKNYFENGYDARHKAFLEDSFSLLSSFNKQYETERA 479
7357 >sp|P40101|YE16_YEAST HYPOTHETICAL 35.9 KD PROTEIN IN ISC10 3'REGION
7358           Length = 306
7360  Score = 30.1 bits (66), Expect = 7.3
7361  Identities = 13/48 (27%), Positives = 16/48 (33%), Gaps = 1/48 (2%)
7363 Query: 199 YNY-IIKNGGIQTESSYPYTAETGTQCNFNSANIGAKISNFTMIPKNE 245
7364            Y Y I+KNG    ES Y    E      F       K+   +     E
7365 Sbjct: 103 YQYEILKNGDFPEESDYEVKGECDGFTLFKVLFCTVKVKKTSYYRNKE 150
7368 >sp|P13388|XMRK_XIPMA MELANOMA RECEPTOR PROTEIN-TYROSINE KINASE PRECURSOR
7369           Length = 1166
7371  Score = 30.1 bits (66), Expect = 7.3
7372  Identities = 16/54 (29%), Positives = 23/54 (41%), Gaps = 11/54 (20%)
7374 Query: 140 GSCWSFSTTGNVEGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGG 193
7375            GSCW+          H     KL+  +EQ    C+  C   +  + C+E C GG
7376 Sbjct: 202 GSCWAPGPG------HCQKFTKLL-CAEQ----CNRRCRGPKPIDCCNEHCAGG 244
7379 >sp|Q9ZL75|MOAA_HELPJ MOLYBDENUM COFACTOR BIOSYNTHESIS PROTEIN A
7380           Length = 321
7382  Score = 29.7 bits (65), Expect = 9.5
7383  Identities = 23/162 (14%), Positives = 51/162 (31%), Gaps = 9/162 (5%)
7385 Query: 41  SHEEYLERFEIFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSDEFKNYYLNNKEAIF 100
7386            + +E LE  E  K+   +I  +  +   H      G+ +   L     K   +  ++   
7387 Sbjct: 165 NDDEILELLEYAKNRSIQIRYIEFMENTHAKSLVKGLKEKEILDLIAQKYKIMGMEKPKQ 224
7389 Query: 101 TDDLPVADYLDDEFINSIPTAFDW-RTRGAVTPVKNQGQCGSCWSFSTTGNVEGQHFISQ 159
7390                        +F    P + D+ ++   +    +   C   +        E       
7391 Sbjct: 225 GSSKIYTLENGYQFGIIAPHSDDFCQSCNRIRLASDGKICPCLYYQDAIDAKEAIINKDT 284
7393 Query: 160 NKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNY 201
7394              +  L +Q++++   + M  +         NGG    A+ Y
7395 Sbjct: 285 KMMKRLLKQSIINKPEKNMWNDK--------NGGTPTRAFYY 318
7398 >sp|P55129|RT12_ACTPL RTX-I TOXIN DETERMINANT A FROM SEROTYPES 5/10 (APX-IA) (HEMOLYSIN
7399            IA) (HLY-IA) (CYTOLYSIN IA) (CLY-IA)
7400           Length = 1023
7402  Score = 29.7 bits (65), Expect = 9.5
7403  Identities = 8/42 (19%), Positives = 15/42 (35%), Gaps = 1/42 (2%)
7405 Query: 27  SQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIF-KSNLGKIEELNLIAI 67
7406            ++  E++ K  K Y    Y  R   F +     + + N    
7407 Sbjct: 423 NKIDEWEKKHGKNYFENGYDARHSAFLEDTFELLSQYNKEYS 464
7410 >sp|P55128|RT11_ACTPL RTX-I TOXIN DETERMINANT A FROM SEROTYPES 1/9 (APX-IA) (HEMOLYSIN
7411            IA) (HLY-IA) (CYTOLYSIN IA) (CLY-IA)
7412           Length = 1023
7414  Score = 29.7 bits (65), Expect = 9.5
7415  Identities = 8/42 (19%), Positives = 15/42 (35%), Gaps = 1/42 (2%)
7417 Query: 27  SQFLEFQDKFNKKYSHEEYLERFEIF-KSNLGKIEELNLIAI 67
7418            ++  E++ K  K Y    Y  R   F +     + + N    
7419 Sbjct: 423 NKIDEWEKKHGKNYFENGYDARHSAFLEDTFELLSQYNKEYS 464
7422 >sp|P35669|GSHB_SCHPO GLUTATHIONE SYNTHETASE LARGE CHAIN (GLUTATHIONE SYNTHASE LARGE
7423            CHAIN) (GSH SYNTHETASE LARGE CHAIN) (GSH-S)
7424            (PHYTOCHELATIN SYNTHETASE)
7425           Length = 498
7427  Score = 29.7 bits (65), Expect = 9.5
7428  Identities = 16/67 (23%), Positives = 26/67 (37%), Gaps = 6/67 (8%)
7430 Query: 33  QDKFNKKYSHEEYLERFE------IFKSNLGKIEELNLIAINHKADTKFGVNKFADLSSD 86
7431            Q  +NK Y+       F       I K +    +  NL   + +A      N+F  LS  
7432 Sbjct: 66  QKAYNKLYAKIANDYEFLRLHLQSITKYDEFMNKLWNLYQKHREAVAHLKENQFQPLSLG 125
7434 Query: 87  EFKNYYL 93
7435             F++ Y+
7436 Sbjct: 126 VFRSDYM 132
7439 >sp|P11140|ABRA_ABRPR ABRIN-A PRECURSOR (RRNA N-GLYCOSIDASE)
7440           Length = 528
7442  Score = 29.7 bits (65), Expect = 9.5
7443  Identities = 12/59 (20%), Positives = 22/59 (36%), Gaps = 2/59 (3%)
7445 Query: 152 EGQHFISQNKLVSLSEQNLVDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYNYIIKNGGIQT 210
7446            E Q  +  +  +  S QN  +C       +G      GC+ G     + +   +G I +
7447 Sbjct: 436 EQQWALYTDGSIR-SVQNTNNCLTSKDHKQGSTILLMGCSNGWASQRWVF-KNDGSIYS 492
7450 >sp|Q00690|LEM2_MOUSE E-SELECTIN PRECURSOR (ENDOTHELIAL LEUKOCYTE ADHESION MOLECULE 1)
7451            (ELAM-1) (LEUKOCYTE-ENDOTHELIAL CELL ADHESION MOLECULE
7452            2) (LECAM2) (CD62E)
7453           Length = 612
7455  Score = 29.7 bits (65), Expect = 9.5
7456  Identities = 7/30 (23%), Positives = 13/30 (43%)
7458 Query: 171 VDCDHECMEYEGEEACDEGCNGGLQPNAYN 200
7459            ++C H    +    +C  GC  G  P++  
7460 Sbjct: 191 LNCSHPFGPFSYNSSCSFGCKRGYLPSSME 220
7463 >sp|P06620|ICEN_PSESY ICE NUCLEATION PROTEIN
7464           Length = 1200
7466  Score = 29.7 bits (65), Expect = 9.5
7467  Identities = 9/33 (27%), Positives = 13/33 (39%), Gaps = 3/33 (9%)
7469 Query: 277 IPCNPNSLDHGILIVGYSAKNTIFRKNMPYWIV 309
7470               N  + +H  LI GY +  T        W+V
7471 Sbjct: 194 YGSNETAGNHSDLIAGYGSTGTA---GSDSWLV 223
7474   Database: /home/peter/blast/data/swissprot.pr
7475     Posted date:  Oct 10, 2000 10:43 AM
7476   Number of letters in database: 31,984,247
7477   Number of sequences in database:  88,780
7478   
7479 Lambda     K      H
7480    0.318    0.140    0.482 
7482 Lambda     K      H
7483    0.270   0.0491    0.230 
7486 Matrix: BLOSUM62
7487 Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
7488 Number of Hits to DB: 48087047
7489 Number of Sequences: 88780
7490 Number of extensions: 2165712
7491 Number of successful extensions: 7103
7492 Number of sequences better than 10.0: 284
7493 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 253
7494 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 31
7495 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 5661
7496 Number of HSP's gapped (non-prelim): 339
7497 length of query: 343
7498 length of database: 31,984,247
7499 effective HSP length: 49
7500 effective length of query: 294
7501 effective length of database: 27,634,027
7502 effective search space: 8124403938
7503 effective search space used: 8124403938
7504 T: 11
7505 A: 40
7506 X1: 16 ( 7.3 bits)
7507 X2: 38 (14.8 bits)
7508 X3: 64 (24.9 bits)
7509 S1: 41 (21.6 bits)
7510 S2: 65 (29.7 bits)