t/data/ssp160.embl.1

   1 ID   AF036895   standard; DNA; INV; 3693 BP.
   2 XX
   3 AC   AF036895;
   4 XX
   5 SV   AF036895.1
   6 XX
   7 DT   22-DEC-1997 (Rel. 54, Created)
   8 DT   03-MAR-2000 (Rel. 62, Last updated, Version 6)
   9 XX
  10 DE   Chironomus thummi special lobe-specific silk protein ssp160 gene, complete
  11 DE   cds.
  12 XX
  13 KW   .
  14 XX
  15 OS   Chironomus thummi
  16 OC   Eukaryota; Metazoa; Arthropoda; Hexapoda; Insecta; Pterygota; Neoptera;
  17 OC   Endopterygota; Diptera; Nematocera; Chironomoidea; Chironomidae;
  18 OC   Chironominae; Chironomus.
  19 XX
  20 RN   [1]
  21 RP   1-3644
  22 RX   MEDLINE; 96199249.
  23 RX   PUBMED; 8621663.
  24 RA   Hoffman R.T., Schmidt E.R., Case S.T.;
  25 RT   "A cell-specific glycosylated silk protein from Chironomus thummi salivary
  26 RT   glands. Cloning, chromosomal localization, and characterization of cDNA";
  27 RL   J. Biol. Chem. 271(16):9809-9815(1996).
  28 XX
  29 RN   [2]
  30 RP   1-3693
  31 RX   MEDLINE; 99077856.
  32 RX   PUBMED; 9858763.
  33 RA   Berezikov E., Blinov A.G., Scherbik S., Cox C.K., Case S.T.;
  34 RT   "Structure and polymorphism of the Chironomus thummi gene encoding special
  35 RT   lobe-specific silk protein, ssp160";
  36 RL   Gene 223(1-2):347-354(1998).
  37 XX
  38 RN   [3]
  39 RP   1-3693
  40 RA   Berezikov E., Blinov A.G., Scherbik S.S., Cox C.C., Case S.T.;
  41 RT   ;
  42 RL   Submitted (05-DEC-1997) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
  43 RL   Biochemistry, University of Mississippi Medical Center, 2500 North State
  44 RL   Street, Jackson, MS 39216-4505, USA
  45 XX
  46 CC   On Mar 4, 1998 this sequence version replaced gi:2707296.
  47 XX
  48 FH   Key             Location/Qualifiers
  49 FH
  50 FT   source          1..3693
  51 FT                   /chromosome="IV"
  52 FT                   /db_xref="taxon:7154"
  53 FT                   /organism="Chironomus thummi"
  54 FT                   /strain="German"
  55 FT                   /map="A2b"
  56 FT                   /dev_stage="larval"
  57 FT                   /cell_type="lobe-specific secretory"
  58 FT                   /tissue_type="salivary gland"
  59 FT   CAAT_signal     84..87
  60 FT                   /gene="ssp160"
  61 FT   TATA_signal     169..172
  62 FT                   /gene="ssp160"
  63 FT   mRNA            join(198..288,604..759,825..2408,2874..3129,3188..3241,
  64 FT                   3299..3569)
  65 FT                   /gene="ssp160"
  66 FT                   /product="special lobe-specific silk protein ssp160"
  67 FT   5'UTR           198..234
  68 FT                   /gene="ssp160"
  69 FT   CDS             join(235..288,604..759,825..2408,2874..3129,3188..3241,
  70 FT                   3299..3441)
  71 FT                   /codon_start=1
  72 FT                   /db_xref="UniProt/TrEMBL:O44416"
  73 FT                   /note="160 kDa secretory protein"
  74 FT                   /gene="ssp160"
  75 FT                   /product="special lobe-specific silk protein ssp160"
  76 FT                   /protein_id="AAD11516.1"
  77 FT                   /translation="MNIKVILVCALVAIFFAQVAEGGPIANFVGFIISLLFSLFEVMLS
  78 FT                   VVFDVKSFTSLSNATANATMPGFASSVGGGRFTVIMKGTFNLIAMISANIQAIQSGSGS
  79 FT                   ASSNSSSSANSTTSSNSTTSSNSTTSSNSTTSSNSTSSGLTTGASVVSLIDTCAWVYQD
  80 FT                   SSVGIAYLMVSILALFYGQSVSAPPYADLGIPALPANTSGAGVPQSVQIKAAITYINVT
  81 FT                   INFITLTGQQFEDLQGPVTTDCGCPNTTSVAPLVAEWEAIMAALEAFASGSASSNSTSN
  82 FT                   STSTSNSTTTSNSTTTTNSTTSTNSTSSSNSTTIAGSIDIAANLTVALQNLQALLMQEA
  83 FT                   TCAPCLAANAKKSGVREFGPCKAAGSSCARSGQRKVKRKARLEKMRAKSRRAVGNRKGS
  84 FT                   MKKRVRSRAKKFGKAAKSGVRRYRKNIKFVYIPPVMASLNAYAALMASLSDSISYQSES
  85 FT                   ALNSTDSACNSTSNSTDEAVINATTAVTDMFVNFTAMVINNTVAHPNCTQYADMALSMV
  86 FT                   SQINEQIIACGSQSDSAQSSIYANVTISIVAMAQEYNNFASMSDKCTRSFANSWLWMYI
  87 FT                   KWVFYRMGMTSGVPNFLACQTKAQSSLTAFLASFNATVSATISAASANNSEVQSSEAAC
  88 FT                   IESSLAEAAVILEMFEAAYQNCTDPGSVTVPAETTTTTSTTTTTTTTTTTAAPTTTTTK
  89 FT                   AANAPFTYPLCTLIMSTTCSLGGAGCTYPLISSAGCCPSGKTLNTGLGGRGCCK"
  90 FT   3'UTR           3442..3569
  91 FT                   /gene="ssp160"
  92 FT   polyA_signal    order(3520..3523,3532..3537,3539..3544)
  93 FT                   /gene="ssp160"
  94 XX
  95 SQ   Sequence 3693 BP; 1171 A; 768 C; 633 G; 1121 T; 0 other;
  96      aagctttcaa ctctcattta aacctaaata agcacatcat atccacaatt catcagccaa        60
  97      taaaaattca ctttatttta atccaatcaa agaaagtttc acgatgtcaa aaacattcgt       120
  98      ggatgtcccg tcaagtggaa ggagaaacga aaattcacga aatttcacaa taaaaagtga       180
  99      gtaagttgtg tggtccatgt catatcgatc taatttatcg aatagtgata aaatatgaat       240
 100      attaaagtga tcttagtgtg cgccttggtt gcgatcttct ttgcacaggt aagttggtaa       300
 101      cttgggttgg gatcttcttt aaatttgact agctttgtac aagatatgag ttgtatagtc       360
 102      tgtagttgta gtgtcatggg ttgtatactg tcttgtaggc taggttttgc ggctcttgca       420
 103      caaatatatc ttaaaaagat cttaaaagtc aacgagagtg ttcaataacg tgatcaataa       480
 104      caagcccatg atacgtctca gctccttaaa tccaccaaat atgactcata tacagacaca       540
 105      accctaatct taaagtacta agcaatttta atcacaattt taaattttcc acatcttatc       600
 106      caggttgcag aaggcggacc aatcgccaat tttgtaggct tcatcatctc cctcttgttc       660
 107      tccttgtttg aagtcatgct gtcagttgtg ttcgatgtca agtcgttcac aagcttgtca       720
 108      aatgccacag caaatgcaac gatgcctggt tttgcatctg tgagtatttt tagctatagc       780
 109      ttgacctgca aaatccttga taaatatgtt gattccattt ctagagcgtt ggtggtggtc       840
 110      gcttcacagt catcatgaaa ggaacattca atttgattgc catgatatcg gcaaatattc       900
 111      aagccattca gtcaggatca ggatcagcat cgtctaattc ctcatcaagt gctaattcta       960
 112      caacatcctc aaactcaaca acaagctcaa actcaacgac atcctcgaac tcaacaacaa      1020
 113      gctcaaactc tacatccagt ggattaacaa ccggtgctag cgttgtaagc ttgattgata      1080
 114      cctgtgcttg ggtctatcag gacagttcag ttggaattgc ctacttgatg gtctcaattt      1140
 115      tggcactttt ctatggacaa tctgtctcag caccgccata tgctgatctt ggtataccag      1200
 116      ctctaccagc aaatacctct ggtgctggag ttccacaatc tgtacaaatt aaagcagcaa      1260
 117      ttacttacat caatgttact attaacttta ttaccttaac tggtcaacaa tttgaagatt      1320
 118      tacaaggtcc agttaccaca gattgtggat gtccaaatac aactagtgtt gcgccacttg      1380
 119      ttgctgaatg ggaagccata atggctgctc ttgaagcttt cgctagtgga tcagcatcat      1440
 120      ctaattctac atctaattca acatcaacaa gtaactcaac aacgacaagc aactcaacaa      1500
 121      ctacgacaaa ttcaacaact tcaactaatt caacatcctc gtcaaattcg acaacaattg      1560
 122      ctggatctat tgacattgct gctaatctta cagttgccct ccagaacctc caagccttgc      1620
 123      tcatgcaaga agctacttgt gctccatgcc tagctgcaaa tgccaaaaag agtggtgttc      1680
 124      gtgaatttgg accatgtaaa gctgctggct catcatgtgc tagatcagga caaagaaaag      1740
 125      tcaagcgtaa ggcacgattg gagaagatgc gtgccaagtc ccgtcgtgca gtcggtaaca      1800
 126      gaaaaggatc aatgaagaag cgcgtccgta gtcgtgcaaa gaaattcgga aaggctgcaa      1860
 127      agtcaggagt tagacgatac cgcaagaaca tcaagtttgt ctacattcca ccagtcatgg      1920
 128      cttcacttaa tgcatatgca gcattgatgg catctttaag tgacagcatc tcatatcaat      1980
 129      ctgaatcggc tttgaactca acagactctg catgtaactc aacatcaaac agcacagatg      2040
 130      aggctgtaat taatgcaaca accgctgtta ctgatatgtt tgtcaacttt actgctatgg      2100
 131      tcatcaataa tactgttgca catccaaatt gtactcaata tgctgacatg gctctttcaa      2160
 132      tggtctctca aatcaacgag caaatcattg catgcggaag tcagtctgat tctgctcagt      2220
 133      catcaatcta tgcaaatgtt acaatcagta ttgttgcaat ggctcaagaa tacaataact      2280
 134      ttgcatctat gtctgataag tgtaccagat catttgccaa tagttggttg tggatgtaca      2340
 135      ttaagtgggt cttctatcga atgggaatga cttctggagt tcctaacttc ctcgcttgtc      2400
 136      aaactaaggt ttgtgattta cttaacaaat acttgaaact aaacgtatcc cttagaactg      2460
 137      aacttatcat tagaaattga acttatcctt taaaaactga acttatcccg agaaaagaaa      2520
 138      tgtatcctta gaaacgaaat cggttttaaa aactgagctt attcttcagg aactaaactc      2580
 139      atccttagaa actgaccata tccttaaaaa ctgaacgtat tcttagaagc taactcatta      2640
 140      ttcagaaact gaacttgacc ttagaaactg aacatattct tcggactaaa ctcatcctaa      2700
 141      gaaactgacc gtatccttaa aaactgaact tagaagctga actcattatt cagaaactga      2760
 142      agttcaccct tagaaactga acttattctt caggaactaa acttatcctt tgaaactgaa      2820
 143      cttatcctta aaaactgatt ttactgagtc cttctttaat ccttcattaa taggctcaaa      2880
 144      gcagtcttac agcattcttg gcatcattta atgccacagt cagtgccacg atttcagcag      2940
 145      caagtgcaaa taattctgaa gttcaaagct ctgaagcagc ttgtattgaa agtagtcttg      3000
 146      cggaagcagc cgttatttta gaaatgtttg aggcagcata tcaaaactgt acagatccag      3060
 147      gatccgtaac agttccagca gagactacaa caacgaccag tacaaccacc actacaacta      3120
 148      ccacaacaag taggttaaaa ttggaaaagt ttagaatttt gtgtgcaatt tttttaattt      3180
 149      tttacagcaa ccgcagcacc aacaacaacc acaactaagg ctgctaatgc accattcaca      3240
 150      tgtaagatat gaaatcaaat tgtgactttt tctaagaaat tgtttccttt ttttctagat      3300
 151      ccattgtgta ctttgatcat gtcaacaaca tgctcactgg gtggagcagg atgtacatat      3360
 152      ccacttatct catctgctgg ctgctgtcca tctggcaaaa cattaaacac tggtctcggt      3420
 153      ggacgtggtt gttgcaaata aaatctacag cgacagttaa attgaagcaa ttattttttc      3480
 154      ctatttcttg atgtagaaca ttttttgtac ttaattttga taaaatgtgg cattaaacat      3540
 155      ataatctgaa atgtggacga gaaactttat tttaaactat ttatttattt tttaatcttt      3600
 156      tcagaaactc aatttatccc ataggaactg aacttatcct taataaactg gtcttatctt      3660
 157      aagcaacaaa acgttttctt ttcaactgaa ttc                                   3693
 158 //