t/data/testaln.mega

   1 #mega
   2 !Title: Amino acid sequences of hemoglobin alpha chains;
   3 !Format datatype=protein identical=. indel=-;
   4
   5 [
   6 M. Nei and S. Kumar (2000) Molecular Evolution and Phylogenetics.
   7 Oxford University Press. New York.
   8 Data for Example 2.1.
   9 ]
  10
  11
  12
  13 #Human    V-LSPADKTN VKAAWGKVGA HAGEYGAEAL ERMFLSFPTT KTYFPHF-DL SHGSAQVKGH
  14 #Horse    ....A..... .....S...G .......... .....G.... .......... ........A.
  15 #Cow      ....A...G. .........G ..A....... .......... .......... ..........
  16 #Kangaroo ....A...GH ...I.....G .....A..G. ..T.H..... .......... ......IQA.
  17 #Newt     MK..AE..H. ..TT.DHIKG .EEAL..... F...T.L.A. R....AK... .E..SFLHS.
  18 #Carp     S...DK..AA ..I..A.ISP K.DDI..... G..LTVY.Q. ....A.WA.. .P..GP..-.
  19
  20 #Human    GKKVA-DALT NAVAHVDDMP NALSALSDLH AHKLRVDPVN FKLLSHCLLV TLAAHLPAEF
  21 #Horse    .......G.. L..G.L..L. G...D..N.. .......... .........S ...V...ND.
  22 #Cow      .A....A... K..E.L..L. G...E..... .......... ......S... ...S...SD.
  23 #Kangaroo ...I.....G Q..E.I..L. GT..K..... .......... .......... .F....GDA.
  24 #Newt     ....M.G..S .....I..ID A..CK...K. .QD.M...A. .PK.A.NI.. VMGI..K.HL
  25 #Carp     ....IMG.VG D..SKI..LV GG.AS..E.. .S......A. ..I.ANHIV. GIMFY..GD.
  26
  27 #Human    TPAVHASLDK FLASVSTVLT SKYR
  28 #Horse    .......... ..S....... ....
  29 #Cow      .......... ...N...... ....
  30 #Kangaroo ..E....... ...A...... ....
  31 #Newt     .YP..C.V.. ..DV.GH... ....
  32 #Carp     P.E..M.V.. .FQNLALA.S E...
  33