maint: remove Travis stuff which has been replaced with Github actions (#325)
[bioperl-live.git] / t / data / consed_project / phd_dir / ML4922R.phd.1
blob477cc6c32360178b43f3246e5ba6c09c45f61fe7
1 BEGIN_SEQUENCE ML4922R
3 BEGIN_COMMENT
5 CHROMAT_FILE: ML4922R
6 ABI_THUMBPRINT: 0
7 PHRED_VERSION: 0.980904.e
8 CALL_METHOD: phred
9 QUALITY_LEVELS: 99
10 TIME: Thu Jun 21 11:28:31 2001
11 TRACE_ARRAY_MIN_INDEX: 0
12 TRACE_ARRAY_MAX_INDEX: 8877
13 CHEM: term
14 DYE: big
16 END_COMMENT
18 BEGIN_DNA
19 c 4 5
20 c 4 17
21 t 6 20
22 t 6 30
23 g 9 45
24 g 19 55
25 t 24 64
26 a 24 72
27 c 19 81
28 g 16 96
29 c 10 103
30 c 8 117
31 c 8 126
32 g 9 139
33 c 21 147
34 a 20 159
35 g 32 166
36 g 34 178
37 t 34 191
38 a 39 200
39 c 39 209
40 c 40 221
41 g 39 234
42 g 46 244
43 t 40 256
44 c 37 269
45 c 32 279
46 g 32 291
47 g 28 300
48 a 28 317
49 a 25 325
50 t 25 331
51 t 34 342
52 c 32 352
53 c 40 363
54 c 40 372
55 g 40 385
56 g 40 394
57 g 40 406
58 t 40 417
59 c 34 430
60 g 35 441
61 a 35 452
62 c 35 459
63 c 35 471
64 c 35 482
65 a 35 491
66 c 35 498
67 g 35 511
68 c 35 521
69 g 51 534
70 t 51 544
71 c 39 556
72 c 39 567
73 g 39 579
74 c 35 587
75 g 31 600
76 g 31 610
77 a 31 625
78 c 31 631
79 g 31 644
80 c 32 652
81 g 35 666
82 t 35 676
83 g 45 688
84 g 51 699
85 g 56 710
86 g 51 723
87 t 39 734
88 g 39 746
89 a 40 756
90 c 40 764
91 c 39 776
92 c 39 787
93 c 45 798
94 g 40 811
95 g 40 821
96 a 40 835
97 a 35 844
98 g 35 853
99 a 39 866
100 t 35 874
101 t 35 886
102 c 35 896
103 g 37 910
104 a 40 919
105 g 40 929
106 t 40 941
107 g 40 953
108 c 40 962
109 t 40 976
110 t 40 987
111 c 45 997
112 g 51 1010
113 t 51 1020
114 c 51 1031
115 t 51 1043
116 g 46 1055
117 g 46 1066
118 t 40 1077
119 a 40 1086
120 a 39 1096
121 t 39 1109
122 c 39 1120
123 a 39 1128
124 a 40 1139
125 a 40 1151
126 a 46 1162
127 t 40 1173
128 c 40 1184
129 a 40 1193
130 g 40 1206
131 g 40 1218
132 t 51 1230
133 t 51 1242
134 t 51 1254
135 c 51 1264
136 t 45 1277
137 c 45 1287
138 c 45 1298
139 g 45 1312
140 g 51 1323
141 t 51 1334
142 t 56 1347
143 g 56 1359
144 g 56 1370
145 a 56 1381
146 t 51 1392
147 c 51 1403
148 t 51 1416
149 c 51 1426
150 a 51 1436
151 a 40 1447
152 a 40 1458
153 c 40 1468
154 t 40 1483
155 c 40 1493
156 a 40 1503
157 a 51 1514
158 g 51 1526
159 g 39 1538
160 t 39 1551
161 t 38 1563
162 a 38 1571
163 t 38 1584
164 g 35 1598
165 c 39 1607
166 c 39 1621
167 g 39 1636
168 t 39 1646
169 g 43 1659
170 g 43 1671
171 c 43 1680
172 a 46 1692
173 c 46 1702
174 a 51 1714
175 a 51 1726
176 a 56 1738
177 t 56 1751
178 g 45 1763
179 t 35 1774
180 c 35 1786
181 g 35 1801
182 c 35 1809
183 c 35 1823
184 t 35 1837
185 g 43 1849
186 c 43 1858
187 t 43 1873
188 g 43 1886
189 t 43 1897
190 t 43 1910
191 t 43 1922
192 c 43 1932
193 a 43 1941
194 t 43 1954
195 c 43 1966
196 t 51 1980
197 g 51 1993
198 t 51 2004
199 c 56 2016
200 a 56 2027
201 g 56 2039
202 t 56 2052
203 g 56 2065
204 a 43 2077
205 t 43 2088
206 g 43 2101
207 c 43 2110
208 t 43 2126
209 c 43 2136
210 c 43 2148
211 c 43 2160
212 t 43 2175
213 c 43 2185
214 a 43 2197
215 t 45 2208
216 t 45 2222
217 a 43 2232
218 g 43 2245
219 a 43 2259
220 c 43 2267
221 a 43 2280
222 c 43 2290
223 a 43 2304
224 c 43 2313
225 a 43 2327
226 g 43 2340
227 a 43 2354
228 g 43 2365
229 a 43 2379
230 c 43 2388
231 a 43 2401
232 a 43 2412
233 c 45 2424
234 g 45 2439
235 a 43 2450
236 g 43 2463
237 a 43 2478
238 t 43 2488
239 a 43 2499
240 t 51 2512
241 t 51 2525
242 c 51 2537
243 a 51 2548
244 g 51 2562
245 t 51 2574
246 c 51 2586
247 c 56 2599
248 a 56 2610
249 g 45 2623
250 g 43 2636
251 c 43 2647
252 t 43 2662
253 a 43 2672
254 g 43 2685
255 c 43 2696
256 t 43 2712
257 a 43 2721
258 a 43 2734
259 c 43 2745
260 a 51 2757
261 g 51 2770
262 t 56 2784
263 g 56 2797
264 g 51 2809
265 t 56 2822
266 t 56 2835
267 c 56 2846
268 a 56 2857
269 g 56 2870
270 a 56 2883
271 t 56 2895
272 g 51 2908
273 a 45 2919
274 t 45 2932
275 t 45 2946
276 c 45 2956
277 t 45 2970
278 g 45 2984
279 a 51 2995
280 t 45 3006
281 g 43 3019
282 a 43 3032
283 c 43 3042
284 g 43 3057
285 a 43 3068
286 a 45 3081
287 g 51 3092
288 a 51 3106
289 t 51 3117
290 c 51 3128
291 c 51 3140
292 t 45 3154
293 g 45 3167
294 a 45 3180
295 t 51 3190
296 g 51 3203
297 g 51 3216
298 a 56 3229
299 g 51 3241
300 a 43 3254
301 g 36 3265
302 a 36 3279
303 c 36 3287
304 t 36 3302
305 g 36 3315
306 t 43 3326
307 a 51 3338
308 a 51 3350
309 c 51 3360
310 a 51 3372
311 a 51 3384
312 c 56 3395
313 a 56 3408
314 g 56 3421
315 t 56 3434
316 g 56 3447
317 a 56 3459
318 a 56 3471
319 t 56 3483
320 g 56 3496
321 a 56 3508
322 t 56 3520
323 g 56 3533
324 a 56 3544
325 t 51 3556
326 c 51 3567
327 c 43 3580
328 t 43 3594
329 a 43 3605
330 c 43 3614
331 c 43 3628
332 g 43 3643
333 a 45 3655
334 t 45 3666
335 g 51 3678
336 t 51 3690
337 t 51 3703
338 a 51 3713
339 a 43 3725
340 g 43 3738
341 c 43 3749
342 g 43 3765
343 t 43 3776
344 g 43 3788
345 c 43 3798
346 t 43 3814
347 a 43 3824
348 g 43 3836
349 g 51 3849
350 a 56 3862
351 g 56 3873
352 g 56 3886
353 a 43 3899
354 t 43 3910
355 g 43 3923
356 c 43 3932
357 t 43 3948
358 t 43 3960
359 t 43 3973
360 c 51 3983
361 a 51 3994
362 a 51 4005
363 a 43 4018
364 c 43 4028
365 c 43 4041
366 g 43 4056
367 a 45 4068
368 g 45 4079
369 a 56 4092
370 a 56 4104
371 t 51 4115
372 c 43 4126
373 c 43 4139
374 g 43 4153
375 c 43 4162
376 t 43 4177
377 a 43 4188
378 g 45 4199
379 g 43 4212
380 c 43 4223
381 g 43 4238
382 c 43 4247
383 t 43 4262
384 c 43 4273
385 t 45 4286
386 a 56 4297
387 g 56 4309
388 a 56 4322
389 a 56 4334
390 g 56 4345
391 a 56 4358
392 a 56 4369
393 g 56 4381
394 a 56 4393
395 a 56 4404
396 a 56 4416
397 g 56 4428
398 c 56 4439
399 a 56 4451
400 a 56 4462
401 g 56 4475
402 a 56 4488
403 g 56 4499
404 c 56 4511
405 a 56 4522
406 a 56 4534
407 a 56 4547
408 t 56 4559
409 g 56 4571
410 a 56 4583
411 g 56 4596
412 t 56 4609
413 g 56 4621
414 a 56 4632
415 a 56 4644
416 t 56 4657
417 t 56 4669
418 t 56 4681
419 g 51 4694
420 a 51 4705
421 t 45 4716
422 t 45 4730
423 c 45 4741
424 a 45 4751
425 c 51 4762
426 a 51 4774
427 g 56 4787
428 g 56 4800
429 t 56 4812
430 t 51 4825
431 g 45 4838
432 g 45 4850
433 c 45 4860
434 c 45 4874
435 a 45 4884
436 a 45 4896
437 t 51 4909
438 t 43 4922
439 a 43 4932
440 c 43 4943
441 g 43 4958
442 t 45 4969
443 g 45 4982
444 g 56 4994
445 t 56 5007
446 g 56 5020
447 a 56 5031
448 g 56 5043
449 c 56 5054
450 a 56 5066
451 t 51 5079
452 t 51 5092
453 c 51 5103
454 a 43 5113
455 a 43 5125
456 c 43 5136
457 t 43 5151
458 a 43 5160
459 t 43 5173
460 g 43 5186
461 c 43 5197
462 t 43 5212
463 t 43 5224
464 a 43 5234
465 a 43 5245
466 g 40 5258
467 c 45 5269
468 g 45 5284
469 t 45 5295
470 c 45 5307
471 t 56 5320
472 t 56 5332
473 a 56 5343
474 g 56 5355
475 t 56 5368
476 g 56 5380
477 a 56 5391
478 g 56 5403
479 g 51 5416
480 t 51 5429
481 c 40 5440
482 a 40 5450
483 c 40 5461
484 t 40 5476
485 c 45 5488
486 a 45 5499
487 g 56 5511
488 a 56 5524
489 a 56 5536
490 g 56 5547
491 t 51 5560
492 t 51 5572
493 t 51 5584
494 a 51 5594
495 g 51 5607
496 c 51 5618
497 a 51 5630
498 c 45 5641
499 c 40 5654
500 g 37 5668
501 c 37 5678
502 t 37 5693
503 g 40 5705
504 t 45 5716
505 t 56 5729
506 g 51 5741
507 t 51 5753
508 c 51 5764
509 g 51 5778
510 a 51 5789
511 t 51 5800
512 a 56 5811
513 a 56 5823
514 c 56 5834
515 a 56 5846
516 g 56 5859
517 a 56 5871
518 a 56 5883
519 t 56 5895
520 c 56 5907
521 t 56 5920
522 t 56 5932
523 a 56 5943
524 a 56 5954
525 a 56 5966
526 a 51 5977
527 g 51 5989
528 c 51 6001
529 t 51 6015
530 g 51 6027
531 a 51 6038
532 t 56 6050
533 a 45 6061
534 t 40 6073
535 c 40 6085
536 g 40 6100
537 a 40 6110
538 a 40 6121
539 a 51 6134
540 c 51 6144
541 a 51 6155
542 t 51 6168
543 t 56 6181
544 g 56 6193
545 a 56 6205
546 g 56 6217
547 a 56 6230
548 a 56 6241
549 c 56 6252
550 a 56 6263
551 a 51 6274
552 a 51 6287
553 g 51 6298
554 g 51 6312
555 t 51 6324
556 g 51 6337
557 a 56 6348
558 a 56 6360
559 g 56 6372
560 a 56 6385
561 t 56 6396
562 g 56 6408
563 g 56 6421
564 c 56 6432
565 a 51 6444
566 g 45 6457
567 a 45 6470
568 g 45 6480
569 g 45 6494
570 a 45 6506
571 c 40 6516
572 a 40 6528
573 c 40 6538
574 t 40 6553
575 g 40 6566
576 t 51 6578
577 g 56 6590
578 a 56 6602
579 a 56 6614
580 a 56 6625
581 a 56 6638
582 g 56 6649
583 a 56 6662
584 g 56 6673
585 t 51 6686
586 g 51 6698
587 a 51 6709
588 c 40 6719
589 a 40 6731
590 g 40 6743
591 g 56 6757
592 g 56 6769
593 a 46 6782
594 t 48 6794
595 g 46 6806
596 a 46 6817
597 a 44 6830
598 c 44 6840
599 c 40 6853
600 c 40 6866
601 t 32 6879
602 a 29 6890
603 g 24 6900
604 g 24 6914
605 c 29 6925
606 t 40 6939
607 t 40 6950
608 t 40 6962
609 t 44 6975
610 g 44 6987
611 g 40 6999
612 c 34 7009
613 a 34 7021
614 a 40 7031
615 a 40 7045
616 a 40 7057
617 c 40 7066
618 c 40 7080
619 a 40 7090
620 t 40 7103
621 a 44 7114
622 c 56 7125
623 a 56 7137
624 g 56 7149
625 c 56 7161
626 a 51 7173
627 t 40 7185
628 a 45 7196
629 c 45 7206
630 c 45 7220
631 a 45 7230
632 t 40 7243
633 t 45 7257
634 c 46 7268
635 g 51 7281
636 a 56 7292
637 t 56 7304
638 a 56 7315
639 g 51 7326
640 g 51 7339
641 a 51 7352
642 c 40 7362
643 a 40 7374
644 c 40 7384
645 t 40 7399
646 g 37 7411
647 a 40 7423
648 t 56 7435
649 g 56 7446
650 g 51 7459
651 g 40 7472
652 t 40 7484
653 t 40 7498
654 c 40 7508
655 t 40 7520
656 t 40 7533
657 c 40 7543
658 a 40 7554
659 c 44 7564
660 a 32 7576
661 g 32 7588
662 c 32 7599
663 c 25 7613
664 a 24 7623
665 a 24 7635
666 a 29 7648
667 c 40 7658
668 t 40 7671
669 t 40 7684
670 g 48 7696
671 a 48 7707
672 a 32 7719
673 t 32 7730
674 c 26 7742
675 a 25 7751
676 a 25 7763
677 a 25 7776
678 c 32 7785
679 c 30 7799
680 g 32 7813
681 a 34 7824
682 c 34 7834
683 a 40 7845
684 t 40 7857
685 g 40 7869
686 a 32 7881
687 t 32 7892
688 t 29 7906
689 c 25 7916
690 c 25 7929
691 a 29 7939
692 a 29 7950
693 a 34 7963
694 t 40 7975
695 c 40 7986
696 a 40 7996
697 a 44 8007
698 a 44 8020
699 t 40 8032
700 a 40 8042
701 t 40 8054
702 c 40 8066
703 a 25 8076
704 g 24 8089
705 a 18 8102
706 g 15 8111
707 g 15 8125
708 a 25 8138
709 c 29 8148
710 a 29 8159
711 a 29 8171
712 c 48 8182
713 a 40 8194
714 g 40 8206
715 t 40 8218
716 t 44 8232
717 t 32 8243
718 t 29 8256
719 g 27 8268
720 c 25 8277
721 a 24 8289
722 a 26 8300
723 g 29 8312
724 c 29 8323
725 a 25 8335
726 a 25 8345
727 c 32 8357
728 t 32 8371
729 c 29 8383
730 g 29 8394
731 g 34 8407
732 t 25 8418
733 t 25 8431
734 g 25 8443
735 t 22 8454
736 t 24 8466
737 a 29 8476
738 c 29 8486
739 t 28 8500
740 t 25 8512
741 t 34 8525
742 g 32 8536
743 g 32 8548
744 a 22 8561
745 a 22 8570
746 t 24 8583
747 c 18 8592
748 c 16 8605
749 g 19 8618
750 g 19 8630
751 t 18 8641
752 t 18 8655
753 g 23 8666
754 c 20 8675
755 a 19 8687
756 a 22 8696
757 t 25 8710
758 g 27 8721
759 c 29 8732
760 t 25 8746
761 t 29 8758
762 t 26 8769
763 t 29 8782
764 g 29 8794
765 a 29 8804
766 a 24 8815
767 g 17 8826
768 c 12 8836
769 c 8 8850
770 a 4 8859
771 n 4 8874
772 END_DNA
774 END_SEQUENCE