t/data/nucmatrix.txt

   1      A    C    G    T    .    N
   2 A  100 -150  -50 -150    0  -50
   3 C -150  100 -150  -50    0  -50
   4 G  -50 -150  100 -150    0  -50
   5 T -150  -50 -150  100    0  -50
   6 .    0    0    0    0    0    0
   7 N  -50  -50  -50  -50    0  -50
   8
   9 -300 -25