t/data/5X_1895.FASTXY

   1  FASTXY compares a DNA sequence to a protein sequence data bank
   2  version 3.4t07 Nov 21, 2001
   3 Please cite:
   4  Pearson et al, Genomics (1997) 46:24-36
   5
   6  5X_1895.fa, 7972 aa
   7  vs /home/jason/genomes/S_cerevisea/pep/yeast_nrpep.fasta library
   8
   9        opt      E()
  10 < 20    53     0:====
  11   22     0     0:           one = represents 17 library sequences
  12   24     0     0:
  13   26     0     0:
  14   28     0     2:*
  15   30     4    13:*
  16   32    11    49:= *
  17   34    55   132:====   *
  18   36   202   270:============   *
  19   38   373   447:======================    *
  20   40   619   623:====================================*
  21   42   895   762:============================================*========
  22   44  1008   840:=================================================*==========
  23   46  1000   856:==================================================*========
  24   48   915   819:================================================*=====
  25   50   820   748:===========================================*=====
  26   52   694   657:======================================*==
  27   54   552   562:=================================*
  28   56   428   469:========================== *
  29   58   381   385:======================*
  30   60   279   312:================= *
  31   62   194   250:============  *
  32   64   163   199:========== *
  33   66   117   157:=======  *
  34   68    62   124:====   *
  35   70    50    97:===  *
  36   72    36    76:=== *
  37   74    26    59:== *
  38   76    17    46:= *
  39   78    26    36:==*
  40   80    18    28:=*
  41   82    11    21:=*
  42   84    25    17:*=
  43   86    19    13:*=
  44   88    11    10:*          inset = represents 1 library sequences
  45   90    11     8:*
  46   92     9     6:*         :=====*===
  47   94     9     5:*         :====*====
  48   96    13     4:*         :===*=========
  49   98     5     3:*         :==*==
  50  100     6     2:*         :=*====
  51  102    13     2:*         :=*===========
  52  104     5     1:*         :*====
  53  106     5     1:*         :*====
  54  108     4     1:*         :*===
  55  110     1     1:*         :*
  56  112     0     0:          *
  57  114     4     0:=         *====
  58  116     1     0:=         *=
  59  118     5     0:=         *=====
  60 >120    32     0:==        *================================
  61 4215311 residues in  9190 sequences
  62   Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.0381+/-0.00065; mu= 23.8752+/- 0.039
  63  mean_var=56.2146+/-11.145, 0's: 53 Z-trim: 75  B-trim: 416 in 2/58
  64  Lambda= 0.1711
  65  Kolmogorov-Smirnov  statistic: 0.0414 (N=29) at  52
  66
  67 FASTY (3.42 Sept 2001) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
  68  join: 62, opt: 62, gap-pen: -14/ -2 shift: -20, subs: -20 width:  16
  69 The best scores are:                                       opt bits E(9190)
  70 NR_SC:SW-YNN2_YEAST SW:YNN2_YEAST P53914 sacch (1056) [f] 2172  547 1.6e-154
  71 NR_SC:SW-MPCP_YEAST SW:MPCP_YEAST P23641 sacch ( 311) [r]  432  117 1.3e-25
  72 NR_SC:SW-YEO3_YEAST SW:YEO3_YEAST P40035 sacch ( 300) [r]  154   48 5.7e-05
  73 NR_SC:SW-RIM2_YEAST SW:RIM2_YEAST P38127 sacch ( 377) [r]  134   44   0.002
  74 NR_SC:SW-Q05330 SW:Q05330 Q05330 saccharomyces ( 302) [f]  122   41   0.014
  75 NR_SC:SW-AMYH_YEAST SW:AMYH_YEAST P08640 sacch (1367) [f]  128   43   0.014
  76 NR_SC:SW-PET8_YEAST SW:PET8_YEAST P38921 sacch ( 284) [r]  121   40   0.016
  77 NR_SC:SW-AGA1_YEAST SW:AGA1_YEAST P32323 sacch ( 725) [f]  124   41   0.018
  78 NR_SC:SW-PMT_YEAST SW:PMT_YEAST P32332 sacchar ( 324) [r]  120   40    0.02
  79 NR_SC:GP-CAA81388_1 gi|439289|emb|CAA81388.1 ( ( 751) [r]  115   39   0.085
  80 NR_SC:SW-Q07229 SW:Q07229 Q07229 saccharomyces ( 817) [r]  115   39    0.09
  81 NR_SC:SW-VRP1_YEAST SW:VRP1_YEAST P37370 sacch ( 817) [r]  115   39    0.09
  82 NR_SC:SW-Q12215 SW:Q12215 Q12215 saccharomyces ( 556) [f]  112   38    0.12
  83 NR_SC:SW-YH17_YEAST SW:YH17_YEAST P38898 sacch ( 153) [r]  106   36    0.13
  84 NR_SC:GP-CAB58511_1 gi|6064291|emb|CAB58511.1  ( 894) [f]  113   39    0.13
  85 NR_SC:SW-YN23_YEAST SW:YN23_YEAST P53832 sacch ( 503) [f]  110   38    0.15
  86 NR_SC:SW-YHC8_YEAST SW:YHC8_YEAST P38739 sacch ( 605) [f]  110   38    0.17
  87 NR_SC:SW-FLO1_YEAST SW:FLO1_YEAST P32768 sacch (1537) [f]  113   39     0.2
  88 NR_SC:PIR-S53465 PIR:S53465 flocculation prote (1537) [f]  113   39     0.2
  89 NR_SC:SW-Q06143 SW:Q06143 Q06143 saccharomyces ( 298) [r]  105   36    0.25
  90 NR_SC:PIR-S58652 PIR:S58652 hypothetical prote ( 216) [r]  103   36    0.28
  91 NR_SC:SW-YKT9_YEAST SW:YKT9_YEAST P36045 sacch ( 187) [f]  102   35     0.3
  92 NR_SC:SW-YAG3_YEAST SW:YAG3_YEAST P39712 sacch (1322) [f]  109   38    0.35
  93 NR_SC:PIR-S51959 PIR:S51959 hypothetical prote (1367) [f]  109   38    0.36
  94 NR_SC:SW-Q12444 SW:Q12444 Q12444 saccharomyces ( 126) [f]   99   34    0.38
  95 NR_SC:SW-TOA1_YEAST SW:TOA1_YEAST P32773 sacch ( 286) [r]  102   36     0.4
  96 NR_SC:SW-SIM1_YEAST SW:SIM1_YEAST P40472 sacch ( 475) [f]  104   36    0.41
  97 NR_SC:GP-CAA47602_1 gi|4824|emb|CAA47602.1 (X6 ( 307) [r]  102   36    0.42
  98 NR_SC:SW-YMC1_YEAST SW:YMC1_YEAST P32331 sacch ( 307) [r]  102   36    0.42
  99 NR_SC:SW-YG5F_YEAST SW:YG5F_YEAST P53320 sacch ( 366) [r]  102   36    0.48
 100 NR_SC:SW-TIR3_YEAST SW:TIR3_YEAST P40552 sacch ( 269) [f]  100   35    0.54
 101 NR_SC:SW-Q08428 SW:Q08428 Q08428 saccharomyces ( 113) [f]   96   34    0.59
 102 NR_SC:SW-FLO5_YEAST SW:FLO5_YEAST P38894 sacch (1075) [f]  104   37    0.71
 103 NR_SC:SW-YK82_YEAST SW:YK82_YEAST P36170 sacch (1169) [f]  104   37    0.76
 104 NR_SC:SW-YOD0_YEAST SW:YOD0_YEAST Q08193 sacch ( 484) [f]  100   35    0.82
 105 NR_SC:SW-CW14_YEAST SW:CW14_YEAST O13547 sacch ( 238) [f]   97   34    0.84
 106 NR_SC:SW-TIR1_YEAST SW:TIR1_YEAST P10863 sacch ( 254) [r]   97   34    0.87
 107 NR_SC:SW-Q08873 SW:Q08873 Q08873 saccharomyces ( 200) [f]   95   34       1
 108 NR_SC:SW-TIR2_YEAST SW:TIR2_YEAST P33890 sacch ( 251) [f]   95   34     1.2
 109 NR_SC:SW-CBF5_YEAST SW:CBF5_YEAST P33322 sacch ( 483) [f]   97   35     1.4
 110 NR_SC:SW-KRE1_YEAST SW:KRE1_YEAST P17260 sacch ( 313) [f]   95   34     1.4
 111 NR_SC:GP-CAA52447_1 gi|396560|emb|CAA52447.1 ( ( 250) [f]   94   34     1.4
 112 NR_SC:GP-CAA81388_1 gi|439289|emb|CAA81388.1 ( ( 751) [f]   98   35     1.6
 113 NR_SC:SW-VRP1_YEAST SW:VRP1_YEAST P37370 sacch ( 817) [f]   98   35     1.7
 114 NR_SC:SW-Q07229 SW:Q07229 Q07229 saccharomyces ( 817) [f]   98   35     1.7
 115 NR_SC:SW-Q12218 SW:Q12218 Q12218 saccharomyces ( 487) [f]   94   34     2.3
 116 NR_SC:GP-AAA35091_1 gi|295671|gb|AAA35091.1 (L ( 406) [f]   92   33     2.8
 117 NR_SC:SW-SR40_YEAST SW:SR40_YEAST P32583 sacch ( 406) [f]   92   33     2.8
 118 NR_SC:SW-TIP1_YEAST SW:TIP1_YEAST P27654 sacch ( 210) [f]   89   32       3
 119 NR_SC:SW-O94086 SW:O94086 O94086 saccharomyces ( 168) [f]   88   32     3.1
 120 NR_SC:SW-YM8Z_YEAST SW:YM8Z_YEAST Q04951 sacch ( 389) [f]   91   33     3.3
 121 NR_SC:SW-YGC8_YEAST SW:YGC8_YEAST P53189 sacch ( 542) [f]   92   33     3.5
 122 NR_SC:SW-YG1F_YEAST SW:YG1F_YEAST P53214 sacch ( 551) [f]   92   33     3.5
 123 NR_SC:GP-AAA35015_1 gi|172526|gb|AAA35015.1 (M ( 570) [f]   92   33     3.6
 124 NR_SC:SW-HRB1_YEAST SW:HRB1_YEAST P38922 sacch ( 429) [f]   90   33     4.2
 125 NR_SC:SW-MID2_YEAST SW:MID2_YEAST P36027 sacch ( 376) [f]   89   33     4.5
 126 NR_SC:SW-Q08438 SW:Q08438 Q08438 saccharomyces ( 674) [r]   91   33     4.8
 127 NR_SC:SW-CCC1_YEAST SW:CCC1_YEAST P47818 sacch ( 322) [f]   88   32     4.8
 128
 129
 130 >>NR_SC:SW-YNN2_YEAST SW:YNN2_YEAST P53914 saccharomyces  (1056 aa)
 131  initn: 3325 init1: 1027 opt: 2172  Z-score: 2877.6  bits: 547.0 E(): 1.6e-154
 132 Smith-Waterman score: 3401;  51.588% identity (58.124% ungapped) in 1165 aa overlap (2180-5623:3-1053)
 133
 134     2180      2210      2240      2270      2300      2330
 135 5X_189 RKQLDPRIPALINNGVKANHRSFFVMVGDKGRDQVCPGMQAAMRFD*HRCR/LVNLHFLL
 136        .: .: :::.:: :::....::.::.:::..:.:                  : :::.:.
 137 NR_SC: KKAIDSRIPSLIRNGVQTKQRSIFVIVGDRARNQ------------------LPNLHYLM
 138              10        20        30                          40
 139
 140      2360      2390       2420      2450      2480      2510
 141 5X_189 SQARVSSRPSVLWCYKKD-LGFTT*VAASENLQQTIYFRPIATSHRKKREAKIKRDVKRG
 142         .: ..   :::: :::  ::::                    ::::::: :::...:::
 143 NR_SC: MSADLKMNKSVLWAYKKKLLGFT--------------------SHRKKRENKIKKEIKRG
 144            50        60                            70        80
 145
 146       2540      2570      2600      2630      2660      2690
 147 5X_189 IRDANEQDPFELFVTVTDIRYTYYKDSAKILGQTFGMLVLQDYEAITPNLLARTIETVEG
 148         :..::.:::: :..  .:::.:::.: ::::.:.:: .:::.::.::::::::::::::
 149 NR_SC: TREVNEMDPFESFISNQNIRYVYYKESEKILGNTYGMCILQDFEALTPNLLARTIETVEG
 150            90       100       110       120       130       140
 151
 152       2720      2750       2780      2810      2840      2870
 153 5X_189 GGIVVLLLKTMSSLKQLYAMAM/DKL*CRDGVE*SDFS*LLI*DVHSRYRTDAHQFVQPR
 154        :::::.:::.::::::::.:.: :                    ::.::::.::  :  :
 155 NR_SC: GGIVVILLKSMSSLKQLYTMTM-D--------------------VHARYRTEAHGDVVAR
 156           150       160                            170       180
 157
 158        2900      2930      2960      2990      3020      3050
 159 5X_189 FNERFILSLGSNPDCLVLDDELNVLPLSKGKDIQIGKAGEEDDRGRKRKAEELKEMKENL
 160        :::::::::::::.:::.:::::::::: .:...     :.:.   :.   ::.:.::.:
 161 NR_SC: FNERFILSLGSNPNCLVVDDELNVLPLSGAKNVKPLPPKEDDELPPKQL--ELQELKESL
 162            190       200       210       220       230         240
 163
 164        3080      3110      3140      3170      3200      3230
 165 5X_189 EGVDIVGSLAKLAKTVDQAKAILTFVEAISEKNLSSTVALTAGRGRGKSAALGLAIGAAL
 166        : :. .:::..:.:::.::.:::.:..:::::.:. :::::::::::::::::..:.::.
 167 NR_SC: EDVQPAGSLVSLSKTVNQAHAILSFIDAISEKTLNFTVALTAGRGRGKSAALGISIAAAV
 168              250       260       270       280       290       300
 169
 170        3260      3290      3320      3350      3380      3410
 171 5X_189 AHDYSNIFVTSPDPENLKTLFEFVFKALDALGYEEHIDYDVVQSTNPDFKKAIVRVNIFR
 172        .: :::::::::.::::::::::.::..:::::.::::::..:::::::.::::::.: :
 173 NR_SC: SHGYSNIFVTSPSPENLKTLFEFIFKGFDALGYQEHIDYDIIQSTNPDFNKAIVRVDIKR
 174              310       320       330       340       350       360
 175
 176        3440      3470      3500      3530      3560      3590
 177 5X_189 GHRQTIQYISPEDSHVLGQAELVIIDEAAAIPLPLVRKLIGPYLVFMASTINGYEGTGRS
 178         :::::::: :.: .::::::::.::::::::::.:..:.::::::::::::::::::::
 179 NR_SC: DHRQTIQYIVPQDHQVLGQAELVVIDEAAAIPLPIVKNLLGPYLVFMASTINGYEGTGRS
 180              370       380       390       400       410       420
 181
 182        3620      3650      3680      3710      3740      3770
 183 5X_189 LSIKLIQQLREQTRPSITKDSENAAASSAGSSSKAAAAGRSGAGLVRSLREIKLDEPIRY
 184        ::.:::::::.:.  :  .....:..:  .. . .   ..:     :.::::.:::::::
 185 NR_SC: LSLKLIQQLRNQNNTSGRESTQTAVVSRDNKEKDSHLHSQS-----RQLREISLDEPIRY
 186              430       440       450       460            470
 187
 188        3800      3830         3860      3890      3920      3950
 189 5X_189 SPGDNVEKWLNNLLCLDATIVSK---SIQGCPHPSKCELYYVNRDTLFSYHPASEVFLQR
 190        .::: .:::::.:::::.:....   . .: ::::.:.:. :::::::::::.:: ::..
 191 NR_SC: APGDPIEKWLNKLLCLDVTLIKNPRFATRGTPHPSQCNLFVVNRDTLFSYHPVSENFLEK
 192         480       490       500       510       520       530
 193
 194           3980      4010      4040      4070       4100      4130
 195 5X_189 MMALYVASHYKNSPNDLQMLSDAPAHHLFVLLPPIDEND-NTLPDPLVVLQVALEGNISR
 196        ::::::.:::::::::::..::::::.::::::::: .: . .:::: :.:.::::.::.
 197 NR_SC: MMALYVSSHYKNSPNDLQLMSDAPAHKLFVLLPPIDPKDGGRIPDPLCVIQIALEGEISK
 198         540       550       560       570       580       590
 199
 200            4160      4190      4220      4250      4280      4310
 201 5X_189 EAILKEMAQSGMRSSGDMIPWIISTQFQDNDFATLSGARVVRIATHPDYARMGYGSRAME
 202        :.. . ... :.:..::.:::.:: ::::..::.:::::.:::::.:.:: :::::::.:
 203 NR_SC: ESVRNSLSR-GQRAGGDLIPWLISQQFQDEEFASLSGARIVRIATNPEYASMGYGSRAIE
 204         600        610       620       630       640       650
 205
 206            4340      4370       4400      4430      4460      4490
 207 5X_189 ALESFYNGTSYNFDDVPVDMGESFAD\VPRSDL*VTSFIPFPQNRTSTECVSQNANLQND
 208         :.....:         .::.:   : :  .:  .        .:.: . .... :: .:
 209 NR_SC: LLRDYFEGKF-------TDMSE---D-VRPKDYSI--------KRVSDKELAKT-NLLKD
 210          660              670                   680       690
 211
 212             4520      4550      4580      4610      4640      4670
 213 5X_189 TIAIRDPSRMPPLLQRLSERKPETLDYLGVSFGLTRDLLRFWKKGGFTPLYASQKENALT
 214         . .:: . .:::: .:::. :. : :::::.:::..: .:::...:.:.:  :  : ::
 215 NR_SC: DVKLRDAKTLPPLLLKLSEQPPHYLHYLGVSYGLTQSLHKFWKNNSFVPVYLRQTANDLT
 216          700       710       720       730       740       750
 217
 218             4700      4730      4760      4790      4820      4850
 219 5X_189 GEYTFVMLKVLASAGGGGEWLGAFAQGMSCLLLQDEVHMGND*RL*TDFRQRFMNLLSYE
 220        ::.: :::.::   :  ..::  ::.                     :::.::..::::.
 221 NR_SC: GEHTCVMLNVLE--GRESNWLVEFAK---------------------DFRKRFLSLLSYD
 222          760         770                            780       790
 223
 224             4880      4910          4940      4970      5000
 225 5X_189 AFKKFDASIALSILESTVPRNSPSPAP----KLLTNTELSSLLTPFDIKRLESYADSMLD
 226         :.:: :  :::..::.   .. :       : :: :.:.....:::.:::.::....::
 227 NR_SC: -FHKFTAVQALSVIESSKKAQDLSDDEKHDNKELTRTHLDDIFSPFDLKRLDSYSNNLLD
 228              800       810       820       830       840       850
 229
 230       5030      5060      5090        5120      5150      5180
 231 5X_189 YHVVLDLVPTIASLFFGKRLETS--LPPAQQAILLALGLQRKNVEALENELGITSTQTLA
 232        :::. :..: .: :.:: ..  :  :  .:.:::::.::::::.... .::.. :.::.:
 233 NR_SC: YHVIGDMIPMLALLYFGDKMGDSVKLSSVQSAILLAIGLQRKNIDTIAKELNLPSNQTIA
 234              860       870       880       890       900       910
 235
 236         5210      5240      5270           5300      5330      5360
 237 5X_189 LFGKVLRKMTKSLEDIRKASIASELP-----AEPTLAGRSANGSNKFVALQQTIEQDLAD
 238        .:.:..:::.. .... . ::   ::     :   . :.  .. :   ::.: .:.:: .
 239 NR_SC: MFAKIMRKMSQYFRQLLSQSIEETLPNIKDDAIAEMDGEEIKNYNAAEALDQ-MEEDLEE
 240              920       930       940       950       960        970
 241
 242              5390      5420      5450       5480      5510
 243 5X_189 SAVQLNGEDDDASKKEQRELLNTLNMEEFAI-DQGGDWTEAEKQVERLASGKGGTRLSST
 244        ..    .:  .: ...:.::.:.::....:: :.. .:.:..:..:  :..:: . :..
 245 NR_SC: AG----SEAVQAMREKQKELINSLNLDKYAINDNSEEWAESQKSLEIAAKAKGVVSLKTG
 246                   980       990      1000      1010      1020
 247
 248     5540       5570      5600
 249 5X_189 VSVKVDKLDD\AKRRRRRARMRVPRMRRR
 250         .  ..: .:   :.. .: :. ::  ..
 251 NR_SC: KKRTTEKAED-IYRQEMKA-MKKPRKSKK
 252        1030       1040       1050
 253
 254 >>NR_SC:SW-MPCP_YEAST SW:MPCP_YEAST P23641 saccharomyces  (311 aa)
 255 rev-comp initn: 1094 init1: 429 opt: 432  Z-score: 563.4  bits: 117.1 E(): 1.3e-25
 256 Smith-Waterman score: 964;  54.242% identity (66.543% ungapped) in 330 aa overlap (7938-6947:19-287)
 257
 258       7930      7900      7870      7840      7810      7780
 259 5X_18- RFALAGALGCAVTHGALTPVDVVKTRIQLEPEVYNRVGRFFNSS*GF*EL*GVVLMSQT\
 260        .::::::.::. ::....:.::::::::::: :::
 261 NR_SC: KFALAGAIGCGSTHSSMVPIDVVKTRIQLEPTVYN-------------------------
 262        20        30        40        50
 263
 264        7750      7720      7690      7660      7630      7600
 265 5X_18- KGMVASFRQIIAKEGAGALLTGFGPTAVGYAIQGAFKFGG*VMMSLQITA*SRANLPISY
 266        ::::.::.:::: ::::::::::::: .::.:::::::::                   :
 267 NR_SC: KGMVGSFKQIIAGEGAGALLTGFGPTLLGYSIQGAFKFGG-------------------Y
 268             60        70        80        90
 269
 270        7570      7540      7510      7480      7450      7420
 271 5X_18- EFWKKKAIDLVGVDKARENRQAIYLGASAIAEFFADIALCPLEATRIRLVSQPSFANGLS
 272        : .::  :: .: : : . ....:.:..:.:::.:::::::::::::::::::.:::::
 273 NR_SC: EVFKKFFIDNLGYDTASRYKNSVYMGSAAMAEFLADIALCPLEATRIRLVSQPQFANGLV
 274           100       110       120       130       140       150
 275
 276        7390      7360      7330      7300       7270      7240
 277 5X_18- GGFLRILREEGPAAFYAGFGPILFKQVPYTMAKFAV*VDRTA*\YQTFG*YYRSYEVAVE
 278        ::: :::.::: ..::.:: ::::::.::..::: :    .   :  :.
 279 NR_SC: GGFSRILKEEGIGSFYSGFTPILFKQIPYNIAKFLVFERASEF-YYGFAG----------
 280           160       170       180       190        200
 281
 282         7210      7180      7150      7120      7090      7060
 283 5X_18- KILKATGKSKDSLTGGQLTGLNLTSGLIAGLAAAVISQPADTLLSKINKTKGAPGQSTTS
 284                 :..:.. . : ::: ::: ::::::..::::::::::.:::: ::::::..
 285 NR_SC: --------PKEKLSSTSTTLLNLLSGLTAGLAAAIVSQPADTLLSKVNKTKKAPGQSTVG
 286                    210       220       230       240       250
 287
 288         7030      7000      6970
 289 5X_18- RLVQMAGQLGVSGLFTGMTTRLVMIGTLTAGQ
 290         :.:.: :::  : :.:. :::::.::::. :
 291 NR_SC: LLAQLAKQLGFFGSFAGLPTRLVMVGTLTSLQ
 292          260       270       280
 293
 294 >>NR_SC:SW-YEO3_YEAST SW:YEO3_YEAST P40035 saccharomyces  (300 aa)
 295 rev-comp initn: 412 init1: 136 opt: 154  Z-score: 192.8  bits: 48.5 E(): 5.7e-05
 296 Smith-Waterman score: 469;  33.043% identity (41.455% ungapped) in 345 aa overlap (7943-6915:18-294)
 297
 298             7920      7890      7860       7830      7800
 299 5X_18- YAD/CALAGALGCAVTHGALTPVDVVKTRIQLEPEVY\TGLVVFSTVPKDFENCKAWC*C
 300        ::  :.:.: ..:. ::...::.:.:: :.:..:..: :.
 301 NR_SC: YAT-CTLGGIIACGPTHSSITPLDLVKCRLQVNPKLY-TS--------------------
 302         20         30        40        50
 303
 304    7770      7740      7710      7680      7650      7620
 305 5X_18- HKQ*GMVASFRQIIAKEGAGALLTGFGPTAVGYAIQGAFKFGG*VMMSLQITA*SRANLP
 306              . .::.:::.::   . :::: : :::..::: :.::  ...
 307 NR_SC: -----NLQGFRKIIANEGWKKVYTGFGATFVGYSLQGAGKYGGYEYFKHL----------
 308                60        70        80        90       100
 309
 310    7590      7560      7530      7500      7470      7440
 311 5X_18- ISYEFWKKKAIDLVGVDKARENRQAIYLGASAIAEFFADIALCPLEATRIR-LVSQPSFA
 312          :  : . ..             ..:: ::: :::.::: :::.:: ...  ...: :
 313 NR_SC: --YSSWLSPGV-------------TVYLMASATAEFLADIMLCPFEAIKVKQQTTMPPFC
 314                              110       120       130       140
 315
 316     7410      7380       7350      7320      7290      7260
 317 5X_18- NGLSGGFLRILREEGP-AAFYAGFGPILFKQVPYTMAKFAV*VDRTA**SNIWLILS\SY
 318        :..  :. ..  : :   ::: :. :.  .:.:::: ::                 . :.
 319 NR_SC: NNVVDGWKKMYAESGGMKAFYKGIVPLWCRQIPYTMCKF-----------------T-SF
 320          150       160       170       180
 321
 322       7230      7200      7170      7140      7110      7080
 323 5X_18- EVAVEKILKATGKSKDSLTGGQLTGLNLTSGLIAGLAAAVISQPADTLLSKINKTKGAPG
 324        :  :.:: ..  :.:. ... :  ......: .::.  :..:.:::...::::. . : .
 325 NR_SC: EKIVQKIYSVLPKKKEEMNALQQISVSFVGGYLAGILCAAVSHPADVMVSKINSERKA-N
 326        190       200       210       220       230       240
 327
 328       7050      7020      6990      6960       6930
 329 5X_18- QSTTSRLVQMAGQLGVSGLFTGMTTRLVMIGTLTAGQ/W*VSNAFDAGV
 330        .: .    ..  ..: .::..:. .:.:::::::. : : . ..: : :
 331 NR_SC: ESMSVASKRIYQKIGFTGLWNGLMVRIVMIGTLTSFQ-WLIYDSFKAYV
 332         250       260       270       280        290
 333
 334 >>NR_SC:SW-RIM2_YEAST SW:RIM2_YEAST P38127 saccharomyces  (377 aa)
 335 rev-comp initn:  79 init1:  79 opt: 134  Z-score: 164.9  bits: 43.6 E(): 0.002
 336 Smith-Waterman score: 145;  26.047% identity (30.769% ungapped) in 215 aa overlap (7929-7299:180-366)
 337
 338    7930      7900      7870      7840      7810       7780
 339 5X_18- LAGALGCAVTHGALTPVDVVKTRIQLEPEVYNRVGRFFNSS*GF\WNCKAWC*CHKQ*GM
 340        .:.: .  .:  : .:. ..:::.::.    . : .. ::     :.:
 341 NR_SC: MAAATAGWATATATNPIWLIKTRVQLDKAGKTSVRQYKNS-----WDC------------
 342      180       190       200       210            220
 343
 344     7750      7720      7690      7660      7630      7600
 345 5X_18- VASFRQIIAKEGAGALLTGFGPTAVGYAIQGAFKFGG*VMMSLQITA*SRANLPISYEFW
 346           ....: .::  .:  :.. . .: ...: ...    .:.  :   :  ..  . :
 347 NR_SC: ---LKSVIRNEGFTGLYKGLSASYLG-SVEGILQWLLYEQMKRLIKERSIEKFGYQAEGT
 348                230       240        250       260       270
 349
 350     7570      7540      7510      7480      7450      7420
 351 5X_18- KKKAIDLVGVDKARENRQAIYLGASAIAEFFADIALCPLEATRIRLVSQPSFA-----NG
 352        :. .      .:..:  :    :....:.: :.::  : :..: :: . :.       .:
 353 NR_SC: KSTS------EKVKEWCQ--RSGSAGLAKFVASIATYPHEVVRTRLRQTPKENGKRKYTG
 354       280             290         300       310       320       330
 355
 356          7390      7360      7330
 357 5X_18- LSGGFLRILREEGPAAFYAGFGPILFKQVPYTMAKF
 358        :  .:  :..:::  ..:.:. : :.. :: ..  :
 359 NR_SC: LVQSFKVIIKEEGLFSMYSGLTPHLMRTVPNSIIMF
 360               340       350       360
 361
 362 >>NR_SC:SW-Q05330 SW:Q05330 Q05330 saccharomyces cerevis  (302 aa)
 363  initn:  76 init1:  76 opt: 122  Z-score: 150.1  bits: 40.6 E(): 0.014
 364 Smith-Waterman score: 123;  24.713% identity (28.667% ungapped) in 174 aa overlap (896-1372:55-219)
 365
 366              920       950       980      1010      1040      1070
 367 5X_189 RTHRKRYQRHFHPHHRRHHL*THHRSHLDRNR*RRPLAANLQRLVPVCDRPQPIPNNH*C
 368        :::..... : : :. :.:   :::.:: ..: ..      ::   . .: . : . :
 369 NR_SC: RTHQHHHRTHQHHHRTRQH---HHRTHLHHHRIHQRHHHIRQRHHHIRQRRHRILQRHHR
 370            60        70           80        90       100       110
 371
 372             1100      1130                    1160       1190
 373 5X_189 QRHEKSKEGRRNENTPLRLL--------------TA*PRQGPSSL*FHPVVV-HSALVPH
 374         :...     : . : ::::              ..  :.  ..  ..:.   :...: :
 375 NR_SC: IRQRRLPTLPRRQATALRLLLILLHLHHTLLRHQVTAQRHQVTAQRLQPIPQHHQVIVLH
 376              120       130       140       150       160       170
 377
 378        1220      1250      1280      1310      1340      1370
 379 5X_189 R*QTHLCPARLLQEHQAWQHSSLGLAPAEGMGTYRPIGNLKDQRGVKKLRALIQ
 380        : .:      : ..:   ::  : : : . ..  . .   . :  .. :  ..:
 381 NR_SC: RLHT------LQHHHPIPQHHLLTLPPLQTIALLHLLTPQHLQATAQDLLHILQ
 382                    180       190       200       210
 383
 384 >>NR_SC:SW-AMYH_YEAST SW:AMYH_YEAST P08640 saccharomyces  (1367 aa)
 385  initn: 142 init1:  95 opt: 128  Z-score: 150.0  bits: 42.7 E(): 0.014
 386 Smith-Waterman score: 152;  26.792% identity (28.629% ungapped) in 265 aa overlap (3295-4068:302-556)
 387
 388          3310      3340      3370      3400      3430      3460
 389 5X_189 TSKLCLNLSSKPLMPWVTRSTLIMMSCKAQTPTSKRLL*GSTSSEVTDKPSNTSPPKILT
 390        ::: :   ..:   :  : :.    : .: .:: .   . :.:. ::.. ...:   . :
 391 NR_SC: TSKTC---TKKTTTPVPTPSSSTTESSSAPVPTPSSSTTESSSAPVTSSTTESSSAPVPT
 392                 310       320       330       340       350
 393
 394          3490      3520      3550      3580      3610      3640
 395 5X_189 FSAKLSLSSLMKLPPSLFPLFVNSSAPISCLWPPPSTVTRVLAVHCPSSSFSNSVNR/PR
 396         :.. . ::   .  :      .::::..      .: .    :  :::: ..: .  :
 397 NR_SC: PSSSTTESSSAPVTSSTTE---SSSAPVTS----STTESSSAPVPTPSSSTTESSSA-PV
 398       360       370          380           390       400        410
 399
 400           3670      3700       3730      3760      3790      3820
 401 5X_189 PSITKDSENAAASSAGSSSKAAA\VVDRALVSCDLFVRSSLMSLSVTPPETMLKSG*TTS
 402         : : .: .: ..:. . :..:  :.. .  : .  : ::    : .:  :  .: . .:
 403 NR_SC: TSSTTESSSAPVTSSTTESSSAP-VTSSTTESSSAPVTSSTTESSSAPVPTPSSSTTESS
 404               420       430        440       450       460
 405
 406            3850      3880            3910      3940      3970
 407 5X_189 SASMPPSSPNLSKVALTLPNASFT------MSTATLSSLITPLQKCSCKG*WRSTS-LPT
 408        :: .  :. . :.. .  :..: :      ....:  :  .:.   : . .  :..  ::
 409 NR_SC: SAPVTSSTTESSSAPVPTPSSSTTESSSAPVTSSTTESSSAPVPTPSSSTTESSSAPAPT
 410      470       480       490       500       510       520
 411
 412         4000      4030      4060
 413 5X_189 TRTLLTTCRCFPMLPLIIFSFSSPLST
 414          .  :     :.      : :.:. :
 415 NR_SC: PSSSTTESSSAPVTSSTTESSSAPVPT
 416      530       540       550
 417
 418 >>NR_SC:SW-PET8_YEAST SW:PET8_YEAST P38921 saccharomyces  (284 aa)
 419 rev-comp initn:  91 init1:  91 opt: 121  Z-score: 149.1  bits: 40.3 E(): 0.016
 420 Smith-Waterman score: 121;  34.146% identity (35.897% ungapped) in 82 aa overlap (7583-7338:172-249)
 421
 422            7560      7530      7500      7470      7440      7410
 423 5X_18- YEFWKKKAIDLVGVDKARENRQAIYLGASAIAEFFADIALCPLEATRIRLVSQPSFANGL
 424        ::. ::      : ....  . ::    ..::  .:  .  ::.  . ::. . . :. :
 425 NR_SC: YEYLKKTWAKANGQSQVEPWKGAI---CGSIAGGIAAATTTPLDFLKTRLMLNKTTAS-L
 426              180       190          200       210       220
 427
 428            7380      7350
 429 5X_18- SGGFLRILREEGPAAFYAGFGP
 430        .. ..:: ::::::.:..: ::
 431 NR_SC: GSVIIRIYREEGPAVFFSGVGP
 432        230       240
 433
 434 >>NR_SC:SW-AGA1_YEAST SW:AGA1_YEAST P32323 saccharomyces  (725 aa)
 435  initn: 156 init1:  88 opt: 124  Z-score: 148.1  bits: 41.4 E(): 0.018
 436 Smith-Waterman score: 144;  23.699% identity (26.032% ungapped) in 346 aa overlap (3286-4232:176-520)
 437
 438             3310      3340      3370      3400      3430      3460
 439 5X_189 TPKTSKLCLNLSSKPLMPWVTRSTLIMMSCKAQTPTSKRLL*GSTSSEVTDKPSNTSPPK
 440        : ...    .:::    :  : ..    : .... ...   ....:: .. .::.::  .
 441 NR_SC: TTSSNPTTTSLSSTSTSPSSTSTSPSSTSTSSSSTSTSSSSTSTSSSSTSTSPSSTSTSS
 442          180       190       200       210       220       230
 443
 444             3490      3520      3550      3580      3610       3640
 445 5X_189 ILTFSAKLSLSSLMKLPPSLFPLFVNSSAPISCLWPPPSTVTRVLAVHCPSSSFSN/YRE
 446         :: ... : :. ..   .      .: .  :      ::     ..   :.: :. :
 447 NR_SC: SLTSTSSSSTSTSQSSTSTSSSSTSTSPSSTSTSSSSTSTSPSSKSTSASSTSTSS-YST
 448          240       250       260       270       280       290
 449
 450              3670      3700      3730       3760      3790
 451 5X_189 QTRPSITKDSENAAASSAGSSSKAAAAGRSGAGL\GDLFVRSSLMSLSVTPPETMLKSG*
 452        .: ::.:..: . :..: .:.: ...   : ..: :. .. ::  :.:.  : : . :
 453 NR_SC: STSPSLTSSSPTLASTSPSSTSISSTFTDSTSSL-GSSIASSST-SVSLYSPSTPVYSVP
 454           300       310       320        330        340       350
 455
 456     3820                     3850      3880      3910       3940
 457 5X_189 TTSSASMPP---------------SSPNLSKVALTLPNASFTMSTA-TLSSLITPLQKCS
 458        .:::    :               ::  ..: ...    ::.:::  :  : .: .
 459 NR_SC: STSSNVATPSMTSSTVETTVSSQSSSEYITKSSISTTIPSFSMSTYFTTVSGVTTMYTTW
 460             360       370       380       390       400       410
 461
 462           3970               4000      4030      4060         4090
 463 5X_189 CKG*WRS---------TSLPTTRTLLTTCRCFPMLPLIIFSFSSPLSTRMIIPSL---TL
 464        :    .:          .. :  :. :   :.:     ... :  .::. .  :.   :.
 465 NR_SC: CPYSSESETSTLTSMHETVTTDATVCTHESCMPSQTTSLITSSIKMSTKNVATSVSTSTV
 466             420       430       440       450       460       470
 467
 468                4120      4150      4180      4210
 469 5X_189 LSSFK/CAL--EGNISREAILKEMAQSGMRSSGDMIPWIISTQFQDNDF
 470         ::.  :.   : . :  ..    ..:  ... .   :. :   .:.::
 471 NR_SC: ESSYA-CSTCAETSHSYSSVQTASSSSVTQQTTSTKSWVSSMTTSDEDF
 472              480       490       500       510       520
 473
 474 >>NR_SC:SW-PMT_YEAST SW:PMT_YEAST P32332 saccharomyces c  (324 aa)
 475 rev-comp initn:  86 init1:  86 opt: 120  Z-score: 147.1  bits: 40.1 E(): 0.02
 476 Smith-Waterman score: 120;  29.630% identity (29.630% ungapped) in 81 aa overlap (7162-6920:231-311)
 477
 478     7160      7130      7100      7070      7040      7010
 479 5X_18- LNLTSGLIAGLAAAVISQPADTLLSKINKTKGAPGQSTTSRLVQMAGQLGVSGLFTGMTT
 480        :.::.. :.::..::. .: :..:..: . ::   ..  . ::. .   ::..:. :...
 481 NR_SC: LHLTASTISGLGVAVVMNPWDVILTRIYNQKGDLYKGPIDCLVKTVRIEGVTALYKGFAA
 482               240       250       260       270       280       290
 483
 484     6980      6950
 485 5X_18- RLVMIGTLTAGQCKFQMRLMQ
 486        ..  :.  :     :. . :.
 487 NR_SC: QVFRIAPHTIMCLTFMEQTMK
 488               300       310
 489
 490 >>NR_SC:GP-CAA81388_1 gi|439289|emb|CAA81388.1 (Z26645)   (751 aa)
 491 rev-comp initn:  83 init1:  83 opt: 115  Z-score: 135.9  bits: 39.2 E(): 0.085
 492 Smith-Waterman score: 139;  26.996% identity (29.218% ungapped) in 263 aa overlap (7747-6985:222-472)
 493
 494          7730      7700      7670      7640      7610
 495 5X_18- PLSDKSLPRRVPVLFSLVSAPPPSVTPSRVPSSSVGK**CLFK*PPRAALTCQ----LVT
 496        :: . ::: .:    .  .::::  ::.   .:.  : .     :: . .       :.
 497 NR_SC: PLPSASLPTHVS---NPPQAPPPPPTPTIGLDSKNIKPTDNAVSPPSSEVPAGGLPFLAE
 498              230          240       250       260       270
 499
 500    7580        7550      7520      7490      7460       7430
 501 5X_18- SFGRR--RPLTSLVSTRPVRTDRPSTLVPLPSPSSSPTLLSVPLRPLESGLS/PQPS\LP
 502          .::  :  .  ::.  ..:.  ..    : :::.: . .    ::      : :: ::
 503 NR_SC: INARRSERGAVEGVSSTKIQTENHKSPSQRPLPSSAPPIPTSHAPPLPPTAP-PPPS-LP
 504       280       290       300       310       320       330
 505
 506        7400      7370      7340      7310      7280        7250
 507 5X_18- TVFPVVSLGF*GRKVPLPSTPVSALSSSSRFLIPWPSSPCKSTVL/P**SNIW/PNTIAA
 508        .:  . . .  . . : :  :..  :.:.  .   :  :  .  : : ....  ::  ..
 509 NR_SC: NVTSAPKKATSAPRPPPPPLPAAMSSASTNSVKATPVPPTLAPPL-PNTTSVP-PNKASS
 510         340       350       360       370       380         390
 511
 512          7220      7190      7160      7130      7100      7070
 513 5X_18- TRSPSRRSSRPLASPRTLLLVDSSLVLTLLPVLSPVWPPPLSLNPPTPSCLRSTRPRAPP
 514          .:      :   :   . ..:.:  . .: :.:. :::    ::. .    . :  ::
 515 NR_SC: MPAPPP----PPPPPPGAFSTSSALSASSIP-LAPLPPPP----PPSVATSVPSAPPPPP
 516           400           410       420            430       440
 517
 518            7040      7010
 519 5X_18- --ASLPPLGSSRWLVSSVFPVSSPV*P
 520          ..  : .::.    :    :: :.:
 521 NR_SC: TLTTNKPSASSKQSKISSSSSSSAVTP
 522          450       460       470
 523
 524 >>NR_SC:SW-Q07229 SW:Q07229 Q07229 saccharomyces cerevis  (817 aa)
 525 rev-comp initn:  83 init1:  83 opt: 115  Z-score: 135.4  bits: 39.3 E(): 0.09
 526 Smith-Waterman score: 134;  26.996% identity (29.218% ungapped) in 263 aa overlap (7747-6985:222-472)
 527
 528          7730      7700      7670      7640      7610
 529 5X_18- PLSDKSLPRRVPVLFSLVSAPPPSVTPSRVPSSSVGK**CLFK*PPRAALTCQ----LVT
 530        :: . ::: .:    .  .::::  ::.   .:.  : .     :: . .       :.
 531 NR_SC: PLPSASLPTHVS---NPPQAPPPPPTPTIGLDSKNIKPTDNAVSPPSSEVPAGGLPFLAE
 532              230          240       250       260       270
 533
 534    7580        7550      7520      7490      7460       7430
 535 5X_18- SFGRR--RPLTSLVSTRPVRTDRPSTLVPLPSPSSSPTLLSVPLRPLESGLS/PQPS\LP
 536          .::  :  .  ::.  ..:.  ..    : :::.: . .    ::      : :: ::
 537 NR_SC: INARRSERGAVEGVSSTKIQTENHKSPSQPPLPSSAPPIPTSHAPPLPPTAP-PPPS-LP
 538       280       290       300       310       320       330
 539
 540        7400      7370      7340      7310      7280        7250
 541 5X_18- TVFPVVSLGF*GRKVPLPSTPVSALSSSSRFLIPWPSSPCKSTVL/P**SNIW/PNTIAA
 542        .:  . . .  .   : :  :..  :.:.  .   :  :  .  : : ....  ::  ..
 543 NR_SC: NVTSAPKKATSAPAPPPPPLPAAMSSASTNSVKATPVPPTLAPPL-PNTTSVP-PNKASS
 544         340       350       360       370       380         390
 545
 546          7220      7190      7160      7130      7100      7070
 547 5X_18- TRSPSRRSSRPLASPRTLLLVDSSLVLTLLPVLSPVWPPPLSLNPPTPSCLRSTRPRAPP
 548          .:      :   :   . ..:.:  . .: :.:. :::    ::. .    . :  ::
 549 NR_SC: MPAPPP----PPPPPPGAFSTSSALSASSIP-LAPLPPPP----PPSVATSVPSAPPPPP
 550           400           410       420            430       440
 551
 552            7040      7010
 553 5X_18- --ASLPPLGSSRWLVSSVFPVSSPV*P
 554          ..  : .::.    :    :: :.:
 555 NR_SC: TLTTNKPSASSKQSKISSSSSSSAVTP
 556          450       460       470
 557
 558 >>NR_SC:SW-VRP1_YEAST SW:VRP1_YEAST P37370 saccharomyces  (817 aa)
 559 rev-comp initn:  83 init1:  83 opt: 115  Z-score: 135.4  bits: 39.3 E(): 0.09
 560 Smith-Waterman score: 134;  26.996% identity (29.218% ungapped) in 263 aa overlap (7747-6985:222-472)
 561
 562          7730      7700      7670      7640      7610
 563 5X_18- PLSDKSLPRRVPVLFSLVSAPPPSVTPSRVPSSSVGK**CLFK*PPRAALTCQ----LVT
 564        :: . ::: .:    .  .::::  ::.   .:.  : .     :: . .       :.
 565 NR_SC: PLPSASLPTHVS---NPPQAPPPPPTPTIGLDSKNIKPTDNAVSPPSSEVPAGGLPFLAE
 566              230          240       250       260       270
 567
 568    7580        7550      7520      7490      7460       7430
 569 5X_18- SFGRR--RPLTSLVSTRPVRTDRPSTLVPLPSPSSSPTLLSVPLRPLESGLS/PQPS\LP
 570          .::  :  .  ::.  ..:.  ..    : :::.: . .    ::      : :: ::
 571 NR_SC: INARRSERGAVEGVSSTKIQTENHKSPSQPPLPSSAPPIPTSHAPPLPPTAP-PPPS-LP
 572       280       290       300       310       320       330
 573
 574        7400      7370      7340      7310      7280        7250
 575 5X_18- TVFPVVSLGF*GRKVPLPSTPVSALSSSSRFLIPWPSSPCKSTVL/P**SNIW/PNTIAA
 576        .:  . . .  .   : :  :..  :.:.  .   :  :  .  : : ....  ::  ..
 577 NR_SC: NVTSAPKKATSAPAPPPPPLPAAMSSASTNSVKATPVPPTLAPPL-PNTTSVP-PNKASS
 578         340       350       360       370       380         390
 579
 580          7220      7190      7160      7130      7100      7070
 581 5X_18- TRSPSRRSSRPLASPRTLLLVDSSLVLTLLPVLSPVWPPPLSLNPPTPSCLRSTRPRAPP
 582          .:      :   :   . ..:.:  . .: :.:. :::    ::. .    . :  ::
 583 NR_SC: MPAPPP----PPPPPPGAFSTSSALSASSIP-LAPLPPPP----PPSVATSVPSAPPPPP
 584           400           410       420            430       440
 585
 586            7040      7010
 587 5X_18- --ASLPPLGSSRWLVSSVFPVSSPV*P
 588          ..  : .::.    :    :: :.:
 589 NR_SC: TLTTNKPSASSKQSKISSSSSSSAVTP
 590          450       460       470
 591
 592 >>NR_SC:SW-Q12215 SW:Q12215 Q12215 saccharomyces cerevis  (556 aa)
 593  initn:  89 init1:  89 opt: 112  Z-score: 133.5  bits: 38.4 E(): 0.12
 594 Smith-Waterman score: 115;  27.381% identity (29.677% ungapped) in 168 aa overlap (789-1284:154-311)
 595
 596             810       840       870        900       930       960
 597 5X_189 PSSTCSLLFGPISTKTRDQHM*LATEGNDETAT\TLSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSS
 598        ::.: ::  . ::. ::     . .  ..  :: :.: :. : :.. :..  .::  .::
 599 NR_SC: PSTTSSLSSAQISSTTRRTSTDMKS--SEMIAT-TVSTTSTTSSSTSSTTSSTTSSTTSS
 600            160       170         180        190       200       210
 601
 602              990      1020      1050      1080      1110      1140
 603 5X_189 SESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRIT
 604        . :: . : :::  :. ..  .. . ::. . ..  ..:        ..  ..  .  .:
 605 NR_SC: TTSSTTSSSTSSTTSSTTSSTTSSTTSSTTSSTTSSTTS--------STTSSTTSIFSVT
 606               220       230       240               250       260
 607
 608             1170      1200      1230         1260
 609 5X_189 SSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVP---SAPTPGAPGMAALEPWT
 610        ::.: .:: :     . . :   .. .::   :. : ..: .... : :
 611 NR_SC: SSSSSITLSSSEHTTVDSRTSSPSSTLVPVSSSSSTLSTPKVTSMTPST
 612             270       280       290       300       310
 613
 614 >>NR_SC:SW-YH17_YEAST SW:YH17_YEAST P38898 saccharomyces  (153 aa)
 615 rev-comp initn:  71 init1:  71 opt: 106  Z-score: 132.4  bits: 36.3 E(): 0.13
 616 Smith-Waterman score: 106;  26.897% identity (28.889% ungapped) in 145 aa overlap (5788-5367:6-144)
 617
 618       5780      5750      5720      5690      5660      5630
 619 5X_18- CIPFRTMQESYILLNQI*VKE*EP*SQI*I*NQKHPLTPSLPSSFHPSPLHSLSSSSSHP
 620        :.   .:: : :    : . . .:  .    .. :: ::.     ::   :  .. .  :
 621 NR_SC: CLTPSSMQYSDIY---IHTPHPHPHPHPHTPTHTHPHTPTPTPHPHPHTPHPHTTPTPTP
 622           10           20        30        40        50        60
 623
 624          5600      5570       5540      5510      5480      5450
 625 5X_18- WH---PHPCPSPPSLCH/PSSLSTFTLTVLDSLAPPLPDASLSTCFSASVQSPP*SIANS
 626         :   ::   :  ::   ::   :  :..:   . :::    .  .:.    ::  :. .
 627 NR_SC: HHTHTPHTTLSNLSLNL-PSHYPTSPLVTLPHSTIPLPT---TIHLSTYYYHPPPIITVT
 628              70         80        90       100          110
 629
 630           5420       5390
 631 5X_18- SMLRVFNSSLCS-FFDASSSSPFSCT
 632         .: . ::.  . ..      :  ::
 633 NR_SC: LQLPISNSTTITLLLPYHPPCPTHCT
 634       120       130       140
 635
 636 >>NR_SC:GP-CAB58511_1 gi|6064291|emb|CAB58511.1 (A74265)  (894 aa)
 637  initn:  70 init1:  70 opt: 113  Z-score: 132.3  bits: 38.8 E(): 0.13
 638 Smith-Waterman score: 113;  27.820% identity (28.244% ungapped) in 133 aa overlap (892-1290:514-644)
 639
 640            910       940       970      1000      1030      1060
 641 5X_189 LSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SL
 642        .: .  : .. :: :  :.   .::: :. ::: ::: ::  ..   .   :.. :  :
 643 NR_SC: ISSSTTTSTSIFSESSKSSVIPTSSSTSGSSESETSSAGSVSSSSFISSESSKSPTYSSS
 644            520       530       540       550       560       570
 645
 646           1090      1120      1150      1180      1210      1240
 647 5X_189 MSAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVPSAPTPG
 648                   :..  . :: .   .: .  :::.   :   .::  .. : . :. :
 649 NR_SC: SLPLVTSATTSQETASSLPPATTTKTSEQT-TLVTVTSCESHVCTESIS-PAIVSTATVT
 650            580       590       600        610       620        630
 651
 652           1270
 653 5X_189 APGMAALEPWTCP
 654        . :...     ::
 655 NR_SC: VSGVTTEYTTWCP
 656              640
 657
 658 >>NR_SC:SW-YN23_YEAST SW:YN23_YEAST P53832 saccharomyces  (503 aa)
 659  initn: 117 init1:  72 opt: 110  Z-score: 131.4  bits: 37.8 E(): 0.15
 660 Smith-Waterman score: 110;  29.752% identity (30.252% ungapped) in 121 aa overlap (895-1256:165-283)
 661
 662           910       940       970      1000      1030      1060
 663 5X_189 SYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLM
 664        : ...: ::. :::  .::  .::: :: : . :.:  :. .. .:.  ::.. . .:
 665 NR_SC: SSSSSTTSTTTSSSETTTSSSSSSSSSSTSTTSTTSTTSSTTSTSSS--PSTTSSSTSAS
 666           170       180       190       200       210         220
 667
 668           1090      1120      1150      1180      1210      1240
 669 5X_189 SAS*/TRAKRAAEMRTHRSAS*PHNLVRVHLHSSFTLLLSTRHLYPTVDKPICAQRAYSR
 670        :.:  : . .:.   :  ..:   . . .   :: ..  ::..   .: . . .:   .
 671 NR_SC: SSSE-TSSTQATSSSTTSTSSSTSTATVTSTPSSTSIGTSTHYTTRVVTQSVVSQANQQA
 672              230       240       250       260       270       280
 673
 674
 675 5X_189 ST
 676        ::
 677 NR_SC: ST
 678
 679
 680 >>NR_SC:SW-YHC8_YEAST SW:YHC8_YEAST P38739 saccharomyces  (605 aa)
 681  initn:  90 init1:  90 opt: 110  Z-score: 130.4  bits: 37.9 E(): 0.17
 682 Smith-Waterman score: 110;  29.545% identity (29.545% ungapped) in 88 aa overlap (4832-5095:216-303)
 683
 684           4850      4880      4910      4940      4970      5000
 685 5X_189 S*TFSHMRHSKSLTLLSLSPSSNLPSLATLPPPHPNFSPTPSSLRSSLRLTSNVLNRTPT
 686        . . :    . : ::.: : ::.  :  :     :  . : ::  .:   :: . . .::
 687 NR_SC: TSSTSTTTSTTSSTLISTSTSSSSSSTPTTTSSAPISTSTTSSTSTSTSTTSPTSSSAPT
 688          220       230       240       250       260       270
 689
 690           5030      5060      5090
 691 5X_189 ACSTITSSSTLFLPSLPYSSARGLKPAY
 692        . :. : .:: :  . : ..  .   .:
 693 NR_SC: SSSNTTPTSTTFTTTSPSTAPSSTTVTY
 694          280       290       300
 695
 696 >>NR_SC:SW-FLO1_YEAST SW:FLO1_YEAST P32768 saccharomyces  (1537 aa)
 697  initn:  70 init1:  70 opt: 113  Z-score: 129.4  bits: 39.1 E():  0.2
 698 Smith-Waterman score: 113;  27.820% identity (28.244% ungapped) in 133 aa overlap (892-1290:1144-1274)
 699
 700            910       940       970      1000      1030      1060
 701 5X_189 LSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SL
 702        .: .  : .. :: :  :.   .::: :. ::: ::: ::  ..   .   :.. :  :
 703 NR_SC: ISSSTTTSTSIFSESSKSSVIPTSSSTSGSSESETSSAGSVSSSSFISSESSKSPTYSSS
 704           1150      1160      1170      1180      1190      1200
 705
 706           1090      1120      1150      1180      1210      1240
 707 5X_189 MSAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVPSAPTPG
 708                   :..  . :: .   .: .  :::.   :   .::  .. : . :. :
 709 NR_SC: SLPLVTSATTSQETASSLPPATTTKTSEQT-TLVTVTSCESHVCTESIS-PAIVSTATVT
 710           1210      1220      1230       1240      1250       1260
 711
 712           1270
 713 5X_189 APGMAALEPWTCP
 714        . :...     ::
 715 NR_SC: VSGVTTEYTTWCP
 716             1270
 717
 718 >>NR_SC:PIR-S53465 PIR:S53465 flocculation protein FLO1   (1537 aa)
 719  initn:  70 init1:  70 opt: 113  Z-score: 129.4  bits: 39.1 E():  0.2
 720 Smith-Waterman score: 113;  27.820% identity (28.244% ungapped) in 133 aa overlap (892-1290:1144-1274)
 721
 722            910       940       970      1000      1030      1060
 723 5X_189 LSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SL
 724        .: .  : .. :: :  :.   .::: :. ::: ::: ::  ..   .   :.. :  :
 725 NR_SC: ISSSTTTSTSIFSESSKSSVIPTSSSTSGSSESETSSAGSVSSSSFISSESSKSPTYSSS
 726           1150      1160      1170      1180      1190      1200
 727
 728           1090      1120      1150      1180      1210      1240
 729 5X_189 MSAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVPSAPTPG
 730                   :..  . :: .   .: .  :::.   :   .::  .. : . :. :
 731 NR_SC: SLPLVTSATTSQETASSLPPATTTKTSEQT-TLVTVTSCESHVCTESIS-PAIVSTATVT
 732           1210      1220      1230       1240      1250       1260
 733
 734           1270
 735 5X_189 APGMAALEPWTCP
 736        . :...     ::
 737 NR_SC: VSGVTTEYTTWCP
 738             1270
 739
 740 >>NR_SC:SW-Q06143 SW:Q06143 Q06143 saccharomyces cerevis  (298 aa)
 741 rev-comp initn: 153 init1: 102 opt: 105  Z-score: 127.5  bits: 36.4 E(): 0.25
 742 Smith-Waterman score: 105;  30.986% identity (30.986% ungapped) in 71 aa overlap (7509-7299:16-86)
 743
 744    7510        7480      7450      7420      7390      7360
 745 5X_18- PW/W/HSAIAEFFADIALCPLEATRIRLVSQPSFANGLSGGFLRILREEGPAAFYAGFGP
 746        :: : ... : .:: ..  ::. ...:: . :     :   .  :: .:: ...:.:..
 747 NR_SC: PW-W-YGGAAGIFATMVTHPLDLAKVRLQAAPMPKPTLFRMLESILANEGVVGLYSGLSA
 748             20        30        40        50        60        70
 749
 750      7330      7300
 751 5X_18- ILFKQVPYTMAKF
 752         ...:  :: ..:
 753 NR_SC: AVLRQCTYTTVRF
 754             80
 755
 756 >>NR_SC:PIR-S58652 PIR:S58652 hypothetical protein YFR03  (216 aa)
 757 rev-comp initn:  77 init1:  77 opt: 103  Z-score: 126.6  bits: 35.7 E(): 0.28
 758 Smith-Waterman score: 103;  44.444% identity (44.444% ungapped) in 36 aa overlap (5677-5570:44-79)
 759
 760          5660      5630      5600
 761 5X_18- TPSLPSSFHPSPLHSLSSSSSHPWHPHPCPSPPSLC
 762        .::::. : : :.  : ::::  :       : : :
 763 NR_SC: SPSLPTRFTPCPVAVLPSSSSPSWSFSTSCMPESTC
 764             50        60        70
 765
 766 >>NR_SC:SW-YKT9_YEAST SW:YKT9_YEAST P36045 saccharomyces  (187 aa)
 767  initn:  81 init1:  81 opt: 102  Z-score: 126.0  bits: 35.4 E():  0.3
 768 Smith-Waterman score: 102;  28.235% identity (28.571% ungapped) in 85 aa overlap (4862-5116:96-179)
 769
 770           4880      4910      4940      4970      5000      5030
 771 5X_189 KSLTLLSLSPSSNLPSLATLPPPHPNFSPTPSSLRSSLRLTSNVLNRTPTACSTITSSST
 772        .:.. ..  :: .   ::. ::: :  . .:.    .:: :      : :      .. .
 773 NR_SC: RSMVDIAAHPSPTATVLASSPPPPPPATHVPAEALFTLRETPPPQLATLTLSEEPPATPA
 774          100       110       120       130       140       150
 775
 776           5060      5090
 777 5X_189 LFLPSLPYSSARGLKPAYRLPSRPS
 778           :: : . .:: .: .:. . ::
 779 NR_SC: PSAPSAPSARVRGHSP-HRVGASPS
 780          160       170
 781
 782 >>NR_SC:SW-YAG3_YEAST SW:YAG3_YEAST P39712 saccharomyces  (1322 aa)
 783  initn:  71 init1:  71 opt: 109  Z-score: 124.8  bits: 38.0 E(): 0.35
 784 Smith-Waterman score: 117;  27.612% identity (28.906% ungapped) in 134 aa overlap (892-1290:933-1061)
 785
 786            910       940        970      1000      1030      1060
 787 5X_189 LSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSS-SESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*S
 788        .: :  . :    ::  :. : .:: : ::.::. ..: .:. ....:   :.:.:.  :
 789 NR_SC: ISSTTTSASILSESSKSSVIPTSSSTSGSSESETGSASSASSSSSISSE-SPKSTYSSSS
 790             940       950       960       970       980        990
 791
 792            1090      1120      1150      1180      1210      1240
 793 5X_189 LMSAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVPSAPTP
 794        :  ..       :.   . ::..   .: .  :::.   :   .::  ... .: .: .
 795 NR_SC: LPPVTSATTS--QEITSSLPPVTTTKTSEQT-TLVTVTSCESHVCTESISSAIVSTATVT
 796             1000        1010      1020       1030      1040
 797
 798            1270
 799 5X_189 GAPGMAALEPWTCP
 800         . . .    : ::
 801 NR_SC: VSGATTEYTTW-CP
 802      1050       1060
 803
 804 >>NR_SC:PIR-S51959 PIR:S51959 hypothetical protein YAL06  (1367 aa)
 805  initn:  71 init1:  71 opt: 109  Z-score: 124.6  bits: 38.0 E(): 0.36
 806 Smith-Waterman score: 117;  27.612% identity (28.906% ungapped) in 134 aa overlap (892-1290:978-1106)
 807
 808            910       940        970      1000      1030      1060
 809 5X_189 LSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSS-SESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*S
 810        .: :  . :    ::  :. : .:: : ::.::. ..: .:. ....:   :.:.:.  :
 811 NR_SC: ISSTTTSASILSESSKSSVIPTSSSTSGSSESETGSASSASSSSSISSE-SPKSTYSSSS
 812        980       990      1000      1010      1020       1030
 813
 814            1090      1120      1150      1180      1210      1240
 815 5X_189 LMSAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVPSAPTP
 816        :  ..       :.   . ::..   .: .  :::.   :   .::  ... .: .: .
 817 NR_SC: LPPVTSATTS--QEITSSLPPVTTTKTSEQT-TLVTVTSCESHVCTESISSAIVSTATVT
 818        1040        1050      1060       1070      1080      1090
 819
 820            1270
 821 5X_189 GAPGMAALEPWTCP
 822         . . .    : ::
 823 NR_SC: VSGATTEYTTW-CP
 824           1100
 825
 826 >>NR_SC:SW-Q12444 SW:Q12444 Q12444 saccharomyces cerevis  (126 aa)
 827  initn:  79 init1:  79 opt:  99  Z-score: 124.2  bits: 34.5 E(): 0.38
 828 Smith-Waterman score: 99;  25.472% identity (25.962% ungapped) in 106 aa overlap (5480-5790:19-124)
 829
 830     5480      5510      5540      5570      5600      5630
 831 5X_189 LRSKLRDLHLVRAARDCPAQSA*KWTSLTMTKRRRRRARMRVPRMRRRRGERVEGRRVER
 832        .. : :  .  :  :.   .      .:   .: ::. : :  : ::.: .: . :  ..
 833 NR_SC: MKRKKRKKRKKRRERETMMKIPRILKKLRRKRRTRRKRRKRRKRRRRKRRKRRRKRSPRK
 834        20        30        40        50        60        70
 835
 836     5660      5690       5720        5750      5780
 837 5X_189 RR*GESKRMFLVSYL-DL*LWLLF-FNSYLV/LVKCMILAWF*MVYN
 838        ::  ..:  : .  . :    ::: : .. . ...:.    : ....
 839 NR_SC: RRKRRNKDAFYILIISDPSRSLLFGFRKFSI-IIQCLTYFSFHILFH
 840        80        90       100        110       120
 841
 842 >>NR_SC:SW-TOA1_YEAST SW:TOA1_YEAST P32773 saccharomyces  (286 aa)
 843 rev-comp initn:  66 init1:  66 opt: 102  Z-score: 123.7  bits: 35.6 E():  0.4
 844 Smith-Waterman score: 124;  34.091% identity (47.619% ungapped) in 88 aa overlap (998-736:216-278)
 845
 846        990       960       930       900       870       840
 847 5X_18- DVIDSDLDDSDDEFRGDVDGGEDENDVDIVFCVYDKVCCCLIIPLCG*LHMLIARFCGNR
 848        : . :.::::::..  . .: ::  : ....:.::::
 849 NR_SC: DEVGSELDDSDDDYLIS-EGEEDGPDENLMLCLYDKV-----------------------
 850          220       230        240       250
 851
 852         810       780       750
 853 5X_18- S/TRVKNKWKTVFKDGMIHLNGKDYLFAK
 854          ::.: .::  .:::.. .: .:: : :
 855 NR_SC: --TRTKARWKCSLKDGVVTINRNDYTFQK
 856                260       270
 857
 858 >>NR_SC:SW-SIM1_YEAST SW:SIM1_YEAST P40472 saccharomyces  (475 aa)
 859  initn: 145 init1:  99 opt: 104  Z-score: 123.7  bits: 36.3 E(): 0.41
 860 Smith-Waterman score: 120;  27.632% identity (30.216% ungapped) in 152 aa overlap (916-1359:109-251)
 861
 862              940       970      1000      1030      1060      1090
 863 5X_189 STSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS*KEQ
 864        :.. :.:  ..:  .::: .:  :: . : .:. ::  : .  .:. :. :  ::. .
 865 NR_SC: SATASTSQGASSSSSSSSATSTLESSSVSSSSEEAAPTSTVVSTSSATQSSASSATKSST
 866       110       120       130       140       150       160
 867
 868             1120      1150      1180      1210      1240      1270
 869 5X_189 RGPQK*EHTAPPLNRITSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVPSAPTPGAPGMAALE
 870         . .    :.   .  .::.:  .  :      :.    :..   ::           ..
 871 NR_SC: SSTSPSTSTSTSTSSTSSSSSSSSSSSSSSSGSGSIYGDLADFSGPSEK---------FQ
 872       170       180       190       200       210
 873
 874                 1300      1330
 875 5X_189 PWTCPC----RGNGNISADWEFEGPAGGEEAS
 876          : ::     :.: :: ::  ::  .: : .
 877 NR_SC: DGTIPCDKFPSGQGVISIDWIGEGGWSGVENT
 878      220       230       240       250
 879
 880 >>NR_SC:GP-CAA47602_1 gi|4824|emb|CAA47602.1 (X67122) mi  (307 aa)
 881 rev-comp initn:  77 init1:  77 opt: 102  Z-score: 123.4  bits: 35.6 E(): 0.42
 882 Smith-Waterman score: 102;  32.609% identity (32.609% ungapped) in 46 aa overlap (7433-7296:252-297)
 883
 884            7410      7380      7350      7320
 885 5X_18- VSQPSFANGLSGGFLRILREEGPAAFYAGFGPILFKQVPYTMAKFA
 886        ...:.:.:..:.    .  . : .::. :::: ... .: . : ::
 887 NR_SC: LQKPKFGNSISSVAKTLYANGGIGAFFKGFGPTMLRAAPANGATFA
 888              260       270       280       290
 889
 890 >>NR_SC:SW-YMC1_YEAST SW:YMC1_YEAST P32331 saccharomyces  (307 aa)
 891 rev-comp initn:  77 init1:  77 opt: 102  Z-score: 123.4  bits: 35.6 E(): 0.42
 892 Smith-Waterman score: 102;  32.609% identity (32.609% ungapped) in 46 aa overlap (7433-7296:252-297)
 893
 894            7410      7380      7350      7320
 895 5X_18- VSQPSFANGLSGGFLRILREEGPAAFYAGFGPILFKQVPYTMAKFA
 896        ...:.:.:..:.    .  . : .::. :::: ... .: . : ::
 897 NR_SC: LQKPKFGNSISSVAKTLYANGGIGAFFKGFGPTMLRAAPANGATFA
 898              260       270       280       290
 899
 900 >>NR_SC:SW-YG5F_YEAST SW:YG5F_YEAST P53320 saccharomyces  (366 aa)
 901 rev-comp initn:  64 init1:  64 opt: 102  Z-score: 122.4  bits: 35.7 E(): 0.48
 902 Smith-Waterman score: 103;  19.597% identity (21.935% ungapped) in 347 aa overlap (7944-6968:12-342)
 903
 904         7930      7900      7870      7840             7810
 905 5X_18- IRRFALAGALGCAVTHGALTPVDVVKTRIQLEPEVYN-------RVGRFFNSS*GF*EL*
 906        ...  :... : ..:   :::.:::. :.: .  . .       .:    .:.  .  ..
 907 NR_SC: LKERMLSAGAGSVLTSLILTPMDVVRIRLQQQQMIPDCSCDGAAEVPNAVSSGSKMKTFT
 908               20        30        40        50        60        70
 909
 910      7780      7750        7720       7690          7660      7630
 911 5X_18- GVVLMSQTIGYGCLFPTNHC--QGGCRCSS\TGFGPTAVGY----AIQGAFKFGG*VMMS
 912        .:   .:... . .:  . :  .  :. ::   :. :  ..    ...:  ..   . ..
 913 NR_SC: NV--GGQNLNNAKIFWESACFQELHCKNSS-LKFNGTLEAFTKIASVEGITSLWRGISLT
 914                 80        90        100       110       120
 915
 916             7600      7570      7540      7510      7480      7450
 917 5X_18- LQITA*SRANLPISYEFWKKKAIDLVGVDKARENRQAIYLGASAIAEFFADIALCPLEAT
 918        : ..  .      .::. .    :.  . ..  . . .. ::  ::. ::  .. ::: .
 919 NR_SC: LLMAIPANMVYFSGYEYIR----DVSPIASTYPTLNPLFCGA--IARVFAATSIAPLELV
 920       130       140           150       160         170       180
 921
 922              7420      7390      7360      7330      7300
 923 5X_18- RIRLVSQPS/SRQRSFRWFP*DFEGGRSRCLLRRFRPYPLQAGSLYHGQVRRVSRPY/WR
 924        . .: : :  : . .  :.      ...:  ..   :    . .:..:    .     ::
 925 NR_SC: KTKLQSIPR-SSKSTKTWMMVKDLLNETRQEMKMVGP----SRALFKG----LEITL-WR
 926             190        200       210           220           230
 927
 928     7270      7240      7210      7180      7150      7120
 929 5X_18- NNQTFG*YYRSYEVAVEKILKATGKSKDSLTGGQLTGLNLTSGLIAGLAAAVISQPAD--
 930        .    . :. :::.  :..   . .  .. ..      ...:: :.:. ::. ..: :
 931 NR_SC: DVPFSAIYWSSYELCKERLWLDSTRFASKDANWVHFINSFASGCISGMIAAICTHPFDVG
 932             240       250       260       270       280       290
 933
 934             7090      7060      7030      7000      6970
 935 5X_18- ------TLLSKINKTKGAPGQSTTSRLVQMAGQLGVSGLFTGMTTRLVMI
 936              ..... .   :  ...  . :  .    :...:.::...:.. :
 937 NR_SC: KTRWQISMMNNSDPKGGNRSRNMFKFLETIWRTEGLAALYTGLAARVIKI
 938             300       310       320       330       340
 939
 940 >>NR_SC:SW-TIR3_YEAST SW:TIR3_YEAST P40552 saccharomyces  (269 aa)
 941  initn:  91 init1:  91 opt: 100  Z-score: 121.4  bits: 35.1 E(): 0.54
 942 Smith-Waterman score: 100;  29.091% identity (29.358% ungapped) in 110 aa overlap (829-1158:112-220)
 943
 944             850       880       910       940       970      1000
 945 5X_189 QKRAISICN*PQRGMMRQQHTLSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPG
 946        :. .::: .  :      ... . .. . :.: :::  :.:  .::: .: : : .:: .
 947 NR_SC: QSAGISITSLGQTVSESGSESATASSDASSASESSSAASSSASESSSAASSSASESSSAA
 948              120       130       140       150       160       170
 949
 950            1030      1060      1090      1120      1150
 951 5X_189 SKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGS
 952        :. :. .:.   ::: .: .  :.: : . .      ..   .. .:..:
 953 NR_SC: SSSASESSSAASSSA-SEAAKSSSSAKSSGSSAASSAASSASSKASSAAS
 954              180        190       200       210       220
 955
 956 >>NR_SC:SW-Q08428 SW:Q08428 Q08428 saccharomyces cerevis  (113 aa)
 957  initn:  95 init1:  95 opt:  96  Z-score: 120.7  bits: 33.7 E(): 0.59
 958 Smith-Waterman score: 121;  54.545% identity (60.000% ungapped) in 33 aa overlap (902-1000:31-60)
 959
 960            920       950       980
 961 5X_189 HRKRYQRHFHPHHRRHHL*THHRSHLDRNR*RR
 962        ::.: .:: . ::::::   ::: .  : : ::
 963 NR_SC: HRRRRRRHHRRHHRRHH---HHRRRRRRRRRRR
 964                40           50        60
 965
 966 >>NR_SC:SW-FLO5_YEAST SW:FLO5_YEAST P38894 saccharomyces  (1075 aa)
 967  initn:  72 init1:  72 opt: 104  Z-score: 119.3  bits: 36.7 E(): 0.71
 968 Smith-Waterman score: 121;  28.030% identity (31.624% ungapped) in 132 aa overlap (895-1290:707-823)
 969
 970           910       940       970      1000      1030      1060
 971 5X_189 SYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLM
 972        : :...: :: :.:  : :  .:.: :: : ::.:   ..:.  .:.: : .. :
 973 NR_SC: SSTSSVIPTSSSTSGSSESKTSSASSSSSSSSISSESPKSPTNSSSSLPPVTSATTG---
 974         710       720       730       740       750       760
 975
 976          1090      1120      1150      1180      1210      1240
 977 5X_189 SAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPFVPSAPTPGA
 978                  :..  . :: .   .: .  :::.   :   .::  ... .: .: .  .
 979 NR_SC: ----------QETASSLPPATTTKTSEQT-TLVTVTSCESHVCTESISSAIVSTATVTVS
 980                      770       780        790       800       810
 981
 982          1270
 983 5X_189 PGMAALEPWTCP
 984           .    : ::
 985 NR_SC: GVTTEYTTW-CP
 986             820
 987
 988 >>NR_SC:SW-YK82_YEAST SW:YK82_YEAST P36170 saccharomyces  (1169 aa)
 989  initn:  64 init1:  64 opt: 104  Z-score: 118.8  bits: 36.7 E(): 0.76
 990 Smith-Waterman score: 104;  25.532% identity (26.471% ungapped) in 141 aa overlap (880-1290:839-978)
 991
 992      880       910         940       970      1000      1030
 993 5X_189 QQHTLSYTQKTISTSF--SSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSA
 994        .. . . :.  ::..:   ::: ::    :.. .:..:: .::  .  .  .... :::.
 995 NR_SC: HETSTASTSVQISSQFVTPSSPISTVAPRSTGLNSQTESTNSSKETMSSENSASVMPSSS
 996       840       850       860       870       880       890
 997
 998         1060       1090      1120       1150      1180      1210
 999 5X_189 YT--E*SLMSAS\EKSKEGRRNENTPLRLLTA*/PSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTN
1000         :  ... .... : :.   :...:  :. . . ::..   ::..   :  ..:.  ...
1001 NR_SC: ATSPKTGKVTSD-ETSSGFSRDRTTVYRMTSET-PSTNEQTTLITVSSCESNSCSNTVSS
1002       900       910        920       930        940       950
1003
1004           1240      1270
1005 5X_189 PFVPSAPTPGAPGMAALEPWTCP
1006          : .: :      .    : ::
1007 NR_SC: AVVSTATTTINGITTEYTTW-CP
1008         960       970
1009
1010 >>NR_SC:SW-YOD0_YEAST SW:YOD0_YEAST Q08193 saccharomyces  (484 aa)
1011  initn: 116 init1:  69 opt: 100  Z-score: 118.2  bits: 35.3 E(): 0.82
1012 Smith-Waterman score: 100;  46.429% identity (48.148% ungapped) in 56 aa overlap (916-1083:405-458)
1013
1014              940       970      1000      1030      1060
1015 5X_189 STSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS
1016        :.: :::  :.:  .:::::: : : .::  :.:.:  ..:  :.: .  : .:.:
1017 NR_SC: SSSSSSSSSSSSSASSSSESSSSTSKASS--SSPSASETSLLKSAASATSSSQSSS
1018           410       420       430         440       450
1019
1020 >>NR_SC:SW-CW14_YEAST SW:CW14_YEAST O13547 saccharomyces  (238 aa)
1021  initn:  77 init1:  77 opt:  97  Z-score: 118.1  bits: 34.3 E(): 0.84
1022 Smith-Waterman score: 97;  24.183% identity (24.667% ungapped) in 153 aa overlap (784-1234:53-205)
1023
1024        790        820       850       880       910         940
1025 5X_189 EHRLPLVLYSLD-LFPQKRAISICN*PQRGMMRQQHTLSYTQKTISTSFSSS--PPSTSP
1026        ::.   :   :: . :.. : .  .  . .  .:. .:. .... :.: :::    :..
1027 NR_SC: EHENSAVKKCLDSICPNNDADAAYSAFKSSCSEQNASLGDSSSSASSSASSSSKASSSTK
1028              60        70        80        90       100       110
1029
1030           970      1000      1030      1060      1090      1120
1031 5X_189 LNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS*KEQRGPQK*EHTAPPL
1032         .::: :: ... .:: .:.  : .:.  :::. .  .  :.: . .    . :...
1033 NR_SC: ASSSSASSSTKASSSSASSSTKASSSSAAPSSSKASSTESSSSSSSSTKAPSSEESSSTY
1034             120       130       140       150       160       170
1035
1036           1150      1180      1210
1037 5X_189 \TA*PRQGPSSL*FHPVVVHSALVPHR*QTHLCP
1038         ..  .:. :.   :   . :. : ... .   :
1039 NR_SC: -VSSSKQASSTSEAHSSSAASSTVSQETVSSALP
1040              180       190       200
1041
1042 >>NR_SC:SW-TIR1_YEAST SW:TIR1_YEAST P10863 saccharomyces  (254 aa)
1043 rev-comp initn:  78 init1:  78 opt:  97  Z-score: 117.7  bits: 34.3 E(): 0.87
1044 Smith-Waterman score: 97;  39.241% identity (41.892% ungapped) in 79 aa overlap (1483-1263:100-178)
1045
1046            1460      1430           1400       1370      1340
1047 5X_18- SRLLTC*KTRNGKLSCSKHES----PT/SARAGSSSRSP-SPTLESKPEASSPPAGPSNS
1048        :::    :. ::  : :   :    :: :. : ::: .: : .  :. ::.:  :.::.:
1049 NR_SC: SRLEPALKSLNGDASSSAAPSSSAAPT-SSAAPSSSAAPTSSAASSSSEAKSSSAAPSSS
1050      100       110       120        130       140       150
1051
1052        1310      1280
1053 5X_18- QSADMFPFPRQGQVQGSSAA
1054        .. .    : ......::::
1055 NR_SC: EAKSSSAAPSSSEAKSSSAA
1056       160       170
1057
1058 >>NR_SC:SW-Q08873 SW:Q08873 Q08873 saccharomyces cerevis  (200 aa)
1059  initn:  85 init1:  85 opt:  95  Z-score: 116.3  bits: 33.7 E():    1
1060 Smith-Waterman score: 95;  31.868% identity (32.222% ungapped) in 91 aa overlap (7-275:63-153)
1061
1062        10        40        70        100        130       160
1063 5X_189 LVNIIYGVKRGDVNTRYEVIPVLISIQI/DSIS-FLSPTRSYGCLFPSLYYFIDIMNVSA
1064        :.::.: .  :..:        .  .:. :.:: ::: .:.::     :.  ::... .
1065 NR_SC: LANILYEADTGEANHISWKSSKMPFVQM-DQISQFLSFSRKYGVPEDELFQTIDLFEKKD
1066              70        80        90        100       110       120
1067
1068         190       220       250
1069 5X_189 LFT*T*MLSELSVQLSKVHCDEFPNES*EIST
1070               :. ::   .: : :.::  . ..::
1071 NR_SC: PAIVFQTLKSLSRYANKKHTDRFPVLGPQLST
1072              130       140       150
1073
1074 >>NR_SC:SW-TIR2_YEAST SW:TIR2_YEAST P33890 saccharomyces  (251 aa)
1075  initn:  92 init1:  92 opt:  95  Z-score: 115.1  bits: 33.8 E():  1.2
1076 Smith-Waterman score: 95;  33.846% identity (33.846% ungapped) in 65 aa overlap (889-1083:120-184)
1077
1078             910       940       970      1000      1030      1060
1079 5X_189 TLSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*S
1080        : . .  : :.  :::  ..: . ::::.. :   .:: .:. :: .:..  ::  :  .
1081 NR_SC: TEASSAATSSAVASSSETTSSAVASSSEATSSAVASSSEASSSAATSSAVASSSEATSST
1082      120       130       140       150       160       170
1083
1084
1085 5X_189 LMSAS
1086        . :..
1087 NR_SC: VASST
1088      180
1089
1090 >>NR_SC:SW-CBF5_YEAST SW:CBF5_YEAST P33322 saccharomyces  (483 aa)
1091  initn:  77 init1:  77 opt:  97  Z-score: 114.2  bits: 34.6 E():  1.4
1092 Smith-Waterman score: 97;  20.635% identity (21.757% ungapped) in 252 aa overlap (4951-5685:225-470)
1093
1094        4960      4990      5020      5050      5080      5110
1095 5X_189 TELSSLLTPFDIKRLESYADSMLDYHVVLDLVPTIASLFFGKRLETSLPPAQQAI-----
1096        .: ....:  :.   .   :.  :   . ...  . .:. : .  .    : .:.
1097 NR_SC: SENDNMVTLHDVMDAQWVYDNTRDESYLRSIIQPLETLLVGYKRIVVKDSAVNAVCYGAK
1098           230       240       250       260       270       280
1099
1100               5140      5170      5200      5230      5260
1101 5X_189 LLALGLQR--KNVEALENELGITSTQTLALFGKVLRKMTKSLEDIRKASIAS/VTSC*AD
1102        :.  :: :  ...: : .:. . .:.  :.   . .  : .: .  .. .:: :  :  .
1103 NR_SC: LMIPGLLRYEEGIE-LYDEIVLITTKGEAIAVAIAQMSTVDLASCDHGVVAS-VKRCIME
1104           290        300       310       320       330        340
1105
1106      5290      5320       5350      5380      5410      5440
1107 5X_189 PRRPISQRV*QVC\PLQQTIEQDLADSAVQLNGEDDDASKKEQRELLNTLNMEEFAIDQG
1108          : .  :   .  :. :  .:  ::. ..  :. .. . .. ..    :.  : . ...
1109 NR_SC: --RDLYPRRWGLG-PVAQKKKQMKADGKLDKYGRVNENTPEQWKKEYVPLDNAEQSTSSS
1110               350        360       370       380       390
1111
1112       5470      5500      5530      5560      5590      5620
1113 5X_189 GDWTEAEKQVERLASGKGGTRLSSTVSVKVDKLDDDKAKAEKGKDAGAKDAKKKRRESGG
1114         .  :.:.. ..   .:  . .. . . : .  .::. : .: :    .  .::....
1115 NR_SC: QETKETEEEPKK---AKEDSLIKEVETEKEEVKEDDSKKEKKEKKDKKEKKEKKEKKDKK
1116      400       410          420       430       440       450
1117
1118       5650      5680
1119 5X_189 EKGGKKKVRRE*ED
1120        ::  ::. .:. ::
1121 NR_SC: EKKEKKEKKRKSED
1122         460       470
1123
1124 >>NR_SC:SW-KRE1_YEAST SW:KRE1_YEAST P17260 saccharomyces  (313 aa)
1125  initn:  88 init1:  88 opt:  95  Z-score: 113.9  bits: 33.9 E():  1.4
1126 Smith-Waterman score: 95;  39.655% identity (40.351% ungapped) in 58 aa overlap (889-1062:139-195)
1127
1128             910       940       970      1000      1030      1060
1129 5X_189 TLSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE
1130        : ..:... :.. ::.  :.:   ::: :: : . :.: ::  :  :.   ::. .::
1131 NR_SC: TQTFTHSSTSAT-SSASSSVSSSVSSSGSSSSVKTTTSTGSAVAETGTRPDPSTDFTE
1132       140       150        160       170       180       190
1133
1134 >>NR_SC:GP-CAA52447_1 gi|396560|emb|CAA52447.1 (X74428)   (250 aa)
1135  initn:  91 init1:  91 opt:  94  Z-score: 113.8  bits: 33.6 E():  1.4
1136 Smith-Waterman score: 94;  33.846% identity (33.846% ungapped) in 65 aa overlap (889-1083:119-183)
1137
1138             910       940       970      1000      1030      1060
1139 5X_189 TLSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*S
1140        : . .  : :.  :::  ..: . ::::.. :   .:: .:. :: .:..  ::  :  .
1141 NR_SC: TEASSAATSSAVASSSETTSSAVASSSEATSSAVASSSEASSSAATSSAVASSSEATSSA
1142       120       130       140       150       160       170
1143
1144
1145 5X_189 LMSAS
1146        . :..
1147 NR_SC: VASST
1148       180
1149
1150 >>NR_SC:GP-CAA81388_1 gi|439289|emb|CAA81388.1 (Z26645)   (751 aa)
1151  initn:  76 init1:  76 opt:  98  Z-score: 113.2  bits: 35.0 E():  1.6
1152 Smith-Waterman score: 105;  23.759% identity (24.723% ungapped) in 282 aa overlap (3283-4117:140-414)
1153
1154              3310      3340      3370      3400       3430
1155 5X_189 LTPKTSKLCLNLSSKPLMPWVTRSTLIMMSCKAQTPTSKRLL*GSTS\PRSPTNHPIHLP
1156        :.:  .   .  :: : .: .  :.   .    ..:.    : :... :. : :.: :.:
1157 NR_SC: LSPAPAVPSIPSSSAPPIPDIPSSAAPPIPIVPSSPAPPLPLSGASA-PKVPQNRP-HMP
1158      140       150       160       170       180        190
1159
1160     3460       3490      3520      3550          3580       3610
1161 5X_189 RRFSRSRPS*/RLSSLMKLPPSLFPLFVNSSAPISC----LWPPPSTVTRVLA/DSLSIK
1162              :    : :: ..::    : . ..: :         :::  .  .   :: .::
1163 NR_SC: SVRPAHRSHQ-RKSSNISLPSVSAPPLPSASLPTHVSNPPQAPPPPPTPTIGL-DSKNIK
1164        200        210       220       230       240        250
1165
1166            3640      3670      3700       3730      3760      3790
1167 5X_189 \PFSNSVNRHDHRLPRIARMRLPALLVHLPR\RGCW*IGRWSRAISS*DQA**AYPLLPR
1168         : .:.:.  . ..:  .   :  . ..  . ::       ..  .   ..    ::
1169 NR_SC: -PTDNAVSPPSSEVPAGGLPFLAEINARRSE-RGAVEGVSSTKIQTENHKSPSQRPLPSS
1170           260       270       280        290       300       310
1171
1172             3820       3850      3880      3910      3940      3970
1173 5X_189 RQC*KVVEQPPLP/PMPPSSPNLSKVALTLPNASFTMSTATLSSLITPLQKCSCKG*WRS
1174             . . :::: :  :  :.: .:. . :. . .        : . ... : ..   .
1175 NR_SC: APPIPTSHAPPLP-PTAPPPPSLPNVT-SAPKKATSAPRPPPPPLPAAMSSASTNSVKAT
1176            320        330        340       350       360       370
1177
1178              4000       4030      4060      4090
1179 5X_189 TSLPTTRTLLTTCRCFP\SSRSSSFRSPPPYRRE**YPP*PSCRPSSRA
1180           ::    : .    :  ...::. .:::       :: :.   .: :
1181 NR_SC: PVPPTLAPPLPNTTSVP-PNKASSMPAPPP-----PPPPPPGAFSTSSA
1182              380        390       400            410
1183
1184 >>NR_SC:SW-VRP1_YEAST SW:VRP1_YEAST P37370 saccharomyces  (817 aa)
1185  initn:  76 init1:  76 opt:  98  Z-score: 112.7  bits: 35.1 E():  1.7
1186 Smith-Waterman score: 110;  25.088% identity (26.296% ungapped) in 283 aa overlap (3283-4117:140-414)
1187
1188              3310      3340      3370      3400       3430
1189 5X_189 LTPKTSKLCLNLSSKPLMPWVTRSTLIMMSCKAQTPTSKRLL*GSTS\PRSPTNHPIHLP
1190        :.:  .   .  :: : .: .  :.   .    ..:.    : :... :. : :.: :.:
1191 NR_SC: LSPAPAVPSIPSSSAPPIPDIPSSAAPPIPIVPSSPAPPLPLSGASA-PKVPQNRP-HMP
1192      140       150       160       170       180        190
1193
1194     3460       3490      3520      3550          3580       3610
1195 5X_189 RRFSRSRPS*/RLSSLMKLPPSLFPLFVNSSAPISC----LWPPPSTVTRVLA/DSLSIK
1196              :    : :: ..::    : . ..: :         :::  .  .   :: .::
1197 NR_SC: SVRPAHRSHQ-RKSSNISLPSVSAPPLPSASLPTHVSNPPQAPPPPPTPTIGL-DSKNIK
1198        200        210       220       230       240        250
1199
1200            3640      3670      3700       3730      3760      3790
1201 5X_189 \PFSNSVNRHDHRLPRIARMRLPALLVHLPR\RGCW*IGRWSRAISS*DQA**AYPLLPR
1202         : .:.:.  . ..:  .   :  . ..  . ::    :  :  :.. ..   . : ::
1203 NR_SC: -PTDNAVSPPSSEVPAGGLPFLAEINARRSE-RGAVE-GVSSTKIQTENHKSPSQPPLPS
1204           260       270       280        290        300       310
1205
1206              3820       3850      3880      3910      3940
1207 5X_189 R-QC*KVVEQPPLP/PMPPSSPNLSKVALTLPNASFTMSTATLSSLITPLQKCSCKG*WR
1208              . . :::: :  :  :.: .:. . :. . .  .     : . ... : ..
1209 NR_SC: SAPPIPTSHAPPLP-PTAPPPPSLPNVT-SAPKKATSAPAPPPPPLPAAMSSASTNSVKA
1210             320        330        340       350       360       370
1211
1212     3970      4000       4030      4060      4090
1213 5X_189 STSLPTTRTLLTTCRCFP\SSRSSSFRSPPPYRRE**YPP*PSCRPSSRA
1214        .   ::    : .    :  ...::. .:::       :: :.   .: :
1215 NR_SC: TPVPPTLAPPLPNTTSVP-PNKASSMPAPPP-----PPPPPPGAFSTSSA
1216               380        390       400            410
1217
1218 >>NR_SC:SW-Q07229 SW:Q07229 Q07229 saccharomyces cerevis  (817 aa)
1219  initn:  76 init1:  76 opt:  98  Z-score: 112.7  bits: 35.1 E():  1.7
1220 Smith-Waterman score: 102;  24.735% identity (25.926% ungapped) in 283 aa overlap (3283-4117:140-414)
1221
1222              3310      3340      3370      3400       3430
1223 5X_189 LTPKTSKLCLNLSSKPLMPWVTRSTLIMMSCKAQTPTSKRLL*GSTS\PRSPTNHPIHLP
1224        :.:  .   .  :: : .: .   .   .    ..:.    : :... :. : :.: :.:
1225 NR_SC: LSPAPAVPSIPSSSAPPIPDIPSFAAPPIPIVPSSPAPPLPLSGASA-PKVPQNRP-HMP
1226      140       150       160       170       180        190
1227
1228     3460       3490      3520      3550          3580       3610
1229 5X_189 RRFSRSRPS*/RLSSLMKLPPSLFPLFVNSSAPISC----LWPPPSTVTRVLA/DSLSIK
1230              :    : :: ..::    : . ..: :         :::  .  .   :: .::
1231 NR_SC: SVRPAHRSHQ-RKSSNISLPSVSAPPLPSASLPTHVSNPPQAPPPPPTPTIGL-DSKNIK
1232        200        210       220       230       240        250
1233
1234            3640      3670      3700       3730      3760      3790
1235 5X_189 \PFSNSVNRHDHRLPRIARMRLPALLVHLPR\RGCW*IGRWSRAISS*DQA**AYPLLPR
1236         : .:.:.  . ..:  .   :  . ..  . ::    :  :  :.. ..   . : ::
1237 NR_SC: -PTDNAVSPPSSEVPAGGLPFLAEINARRSE-RGAVE-GVSSTKIQTENHKSPSQPPLPS
1238           260       270       280        290        300       310
1239
1240              3820       3850      3880      3910      3940
1241 5X_189 R-QC*KVVEQPPLP/PMPPSSPNLSKVALTLPNASFTMSTATLSSLITPLQKCSCKG*WR
1242              . . :::: :  :  :.: .:. . :. . .  .     : . ... : ..
1243 NR_SC: SAPPIPTSHAPPLP-PTAPPPPSLPNVT-SAPKKATSAPAPPPPPLPAAMSSASTNSVKA
1244             320        330        340       350       360       370
1245
1246     3970      4000       4030      4060      4090
1247 5X_189 STSLPTTRTLLTTCRCFP\SSRSSSFRSPPPYRRE**YPP*PSCRPSSRA
1248        .   ::    : .    :  ...::. .:::       :: :.   .: :
1249 NR_SC: TPVPPTLAPPLPNTTSVP-PNKASSMPAPPP-----PPPPPPGAFSTSSA
1250               380        390       400            410
1251
1252 >>NR_SC:SW-Q12218 SW:Q12218 Q12218 saccharomyces cerevis  (487 aa)
1253  initn:  63 init1:  63 opt:  94  Z-score: 110.2  bits: 33.9 E():  2.3
1254 Smith-Waterman score: 97;  27.778% identity (28.302% ungapped) in 108 aa overlap (775-1092:87-194)
1255
1256           790        820       850       880       910       940
1257 5X_189 SVFEHRLPLV-LYSLDLFPQKRAISICN*PQRGMMRQQHTLSYTQKTISTSFSSSPPSTS
1258        :. :: : .:  ::  :.:. .:..   . . .   ..  .. .. . ::: : .: :.
1259 NR_SC: SAVEHMLTMVPWYSSRLLPELEAMDASLTTSSSAATSSSEVASSSIASSTSSSVAPSSSE
1260          90       100       110       120       130       140
1261
1262            970      1000       1030      1060      1090
1263 5X_189 PLNSSSESSRSESITSS-PGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS*KE
1264         ..::   : :: ..::   :.  . .:..  ::. .  : .. : .:
1265 NR_SC: VVSSSVAPSSSEVVSSSVAPSSSEVVSSSVASSSSEVASSSVAPSSSE
1266         150       160       170       180       190
1267
1268 >>NR_SC:GP-AAA35091_1 gi|295671|gb|AAA35091.1 (L11275) s  (406 aa)
1269  initn:  78 init1:  78 opt:  92  Z-score: 108.5  bits: 33.3 E():  2.8
1270 Smith-Waterman score: 109;  30.682% identity (30.682% ungapped) in 88 aa overlap (895-1158:26-113)
1271
1272           910       940       970      1000      1030      1060
1273 5X_189 SYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLM
1274        : .... :.: :::  :.:  .::.::: : : .:: .:. .. .:    ::. .  :
1275 NR_SC: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGESSSSSSSSSSSSSSDSSDSSDSESSSSSSSSSSS
1276           30        40        50        60        70        80
1277
1278          1090      1120      1150
1279 5X_189 SAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGS
1280        :.: ..... .. . ..   .  .::.:
1281 NR_SC: SSSSSDSESSSESDSSSSGSSSSSSSSS
1282           90       100       110
1283
1284 >>NR_SC:SW-SR40_YEAST SW:SR40_YEAST P32583 saccharomyces  (406 aa)
1285  initn:  78 init1:  78 opt:  92  Z-score: 108.5  bits: 33.3 E():  2.8
1286 Smith-Waterman score: 109;  30.682% identity (30.682% ungapped) in 88 aa overlap (895-1158:26-113)
1287
1288           910       940       970      1000      1030      1060
1289 5X_189 SYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLM
1290        : .... :.: :::  :.:  .::.::: : : .:: .:. .. .:    ::. .  :
1291 NR_SC: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSGESSSSSSSSSSSSSSDSSDSSDSESSSSSSSSSSS
1292           30        40        50        60        70        80
1293
1294          1090      1120      1150
1295 5X_189 SAS*KEQRGPQK*EHTAPPLNRITSSGS
1296        :.: ..... .. . ..   .  .::.:
1297 NR_SC: SSSSSDSESSSESDSSSSGSSSSSSSSS
1298           90       100       110
1299
1300 >>NR_SC:SW-TIP1_YEAST SW:TIP1_YEAST P27654 saccharomyces  (210 aa)
1301  initn:  77 init1:  77 opt:  89  Z-score: 108.1  bits: 32.3 E():    3
1302 Smith-Waterman score: 89;  35.000% identity (35.593% ungapped) in 60 aa overlap (913-1089:104-163)
1303
1304               940       970       1000      1030      1060
1305 5X_189 ISTSFSSSPPSTSPLNSSSE-SSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS*K
1306        :.....:  :..:   :::: .: :.. .:: ... :: .:.  :::. .  :   .: :
1307 NR_SC: IAAALASVSPASSEAASSSEAASSSKAASSSEATSSAAPSSSAAPSSSAAPSSSAESSSK
1308            110       120       130       140       150       160
1309
1310 >>NR_SC:SW-O94086 SW:O94086 O94086 saccharomyces cerevis  (168 aa)
1311  initn:  74 init1:  74 opt:  88  Z-score: 107.9  bits: 31.9 E():  3.1
1312 Smith-Waterman score: 88;  29.348% identity (29.348% ungapped) in 92 aa overlap (7217-7491:5-96)
1313
1314      7220      7250       7280      7310      7340      7370
1315 5X_189 DLLDGNLVAAIVLAKYSI/TYAVRSTYTANLAMV*GTCLKRIGPKPA*KAAGPSSLKILR
1316        .. .:.  : .:  . .: :..  ..:. ::..:   ::.  . .:  . . ::  :::
1317 NR_SC: NMEQGKRYAMLVNCSRGI-TFSFNKSYAPNLTVVYVHCLNTAALRPEYNPTTPSFAKILS
1318            10        20         30        40        50        60
1319
1320       7400      7430      7460      7490
1321 5X_189 KPPERPLAKDG*ETSLIRVASRGQRAMSAKNSA
1322        .  .      :   ::  . :::  .: ::  :
1323 NR_SC: NILKSVGLGIGAACSLTLAKSRGCVTMVAKIPA
1324             70        80        90
1325
1326 >>NR_SC:SW-YM8Z_YEAST SW:YM8Z_YEAST Q04951 saccharomyces  (389 aa)
1327  initn:  69 init1:  69 opt:  91  Z-score: 107.4  bits: 33.0 E():  3.3
1328 Smith-Waterman score: 91;  47.222% identity (47.222% ungapped) in 36 aa overlap (895-1002:99-134)
1329
1330           910       940       970      1000
1331 5X_189 SYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSS
1332        : . .:...: :::: :.:  .::. :: : ::..:
1333 NR_SC: SEAASTVGSSTSSSPSSSSSTSSSASSSASSSISAS
1334       100       110       120       130
1335
1336 >>NR_SC:SW-YGC8_YEAST SW:YGC8_YEAST P53189 saccharomyces  (542 aa)
1337  initn:  76 init1:  76 opt:  92  Z-score: 107.0  bits: 33.4 E():  3.5
1338 Smith-Waterman score: 93;  27.551% identity (28.125% ungapped) in 98 aa overlap (829-1122:192-287)
1339
1340             850       880       910       940       970      1000
1341 5X_189 QKRAISICN*PQRGMMRQQHTLSYTQKTISTSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPG
1342        :  : :  :      . .:..   :.   :.: :::  :..  .::. :: : : .:: .
1343 NR_SC: QAAATSTLNQQTSTSIASQESTESTNTPTSSSTSSSTSSST--SSSTSSSTSSSTSSSTS
1344              200       210       220       230         240
1345
1346            1030      1060      1090      1120
1347 5X_189 SKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS*KEQRGPQK*EHT
1348        :. ..  :.   ..: :  .  :.:     .:.   ..
1349 NR_SC: SSTSSSTSSTQETAATTSEGSSSSSAAITSSPKAIAYS
1350      250       260       270       280
1351
1352 >>NR_SC:SW-YG1F_YEAST SW:YG1F_YEAST P53214 saccharomyces  (551 aa)
1353  initn:  63 init1:  63 opt:  92  Z-score: 106.9  bits: 33.4 E():  3.5
1354 Smith-Waterman score: 123;  27.010% identity (27.815% ungapped) in 311 aa overlap (3034-3951:8-313)
1355
1356       3040      3070        3100      3130       3160      3190
1357 5X_189 RQRSSKR*RKTWK-V*TSLVLLP-SWQRLSTRPRLS*LLS/TAISEKNLSSTVALTAGRG
1358        :..::    . :. .  .:. :: :       :  :.  : :: :  .::.. ..:..
1359 NR_SC: RKKSSASSLSMWRTILMALTTLPLSVLSQELVPANSTTSS-TAPSITSLSAVESFTSSTD
1360         10        20        30        40         50        60
1361
1362          3220       3250      3280      3310      3340      3370
1363 5X_189 RGKSAALG\SPSVQLLLMTTLTSLLLLLTPKTSKLCLNLSSKPLMPWVTRSTLIMMSCKA
1364          .::.:. .::.  . .:.. .   :::  .: :  .:::. ..  :. :.    : ..
1365 NR_SC: ATSSASLS-TPSIASVSFTSFPQSSSLLT-LSSTLSSELSSSSMQ--VSSSSTSSSSSEV
1366          70         80        90        100         110       120
1367
1368           3400      3430      3460      3490      3520      3550
1369 5X_189 QTPTSKRLL*GSTSSEVTDKPSNTSPPKILTFSAKLSLSSLMKLPPSLFPLFVNSSAPIS
1370         . .:.  .  :.:: .  . :.. :   .. ...   :: ..   ::     .:.  .:
1371 NR_SC: TSSSSSSSISPSSSSSTIISSSSSLPTFTVASTSSTVASSTLSTSSSLVISTSSSTFTFS
1372             130       140       150       160       170       180
1373
1374             3580      3610      3640      3670      3700      3730
1375 5X_189 CL/SAST-INGYEGTGRSLSIKLIQQLREQTRPSITKDSENAAASSAGSSSKAAAAGRSG
1376           :.:. :..  .:. : :   . .   .. :: ...  ... ::..:::   . . :
1377 NR_SC: SE-SSSSLISSSISTSVSTSSVYVPSSSTSSPPSSSSELTSSSYSSSSSSSTLFSYSSSF
1378              190       200       210       220       230       240
1379
1380               3760      3790      3820      3850       3880
1381 5X_189 A/ASRAISS/SRSSLMSLSVTPPETMLKSG*TTSSASMPPSS-PNLSKVALTLPNASFTM
1382        . .: . :: : ::  : : .   ...  ....::. .  :: :..:. . . :..:.:
1383 NR_SC: S-SSSSSSS-SSSSSSSSSSSSSSSYFTLSTSSSSSIYSSSSYPSFSSSSSSNPTSSITS
1384                250       260       270       280       290
1385
1386      3910      3940
1387 5X_189 STATLSSLITPLQKCS
1388        ..:  :: ::: .. :
1389 NR_SC: TSA--SSSITPASEYS
1390      300         310
1391
1392 >>NR_SC:GP-AAA35015_1 gi|172526|gb|AAA35015.1 (M16165) S  (570 aa)
1393  initn:  79 init1:  79 opt:  92  Z-score: 106.7  bits: 33.4 E():  3.6
1394 Smith-Waterman score: 113;  26.923% identity (27.723% ungapped) in 104 aa overlap (916-1227:24-124)
1395
1396              940       970      1000      1030      1060      1090
1397 5X_189 STSFSSSPPSTSPLNSSSESSRSESITSSPGSKPAAFGSGL*PSSAYTE*SLMSAS*KEQ
1398        ::. ::: :  .: .:..::: .   : : .:. .. . . .: :. :: : . . .  .
1399 NR_SC: STTESSSAPVPTPSSSTTESSVAPVPTPSSSSNITSSAPSSTPFSSSTESSSVPVPTPSS
1400             30        40        50        60        70        80
1401
1402             1120      1150      1180      1210
1403 5X_189 RGPQK*EHTAPPLNRITSSGSIFTLVSPCCCPLGTCTPPLTNPF
1404           . .: .. :..  :. .:.  . .:      : . : . ::
1405 NR_SC: ---STTESSSAPVSSSTTESSVAPVPTPSSSSNITSSAPSSIPF
1406                90       100       110       120
1407
1408 >>NR_SC:SW-HRB1_YEAST SW:HRB1_YEAST P38922 saccharomyces  (429 aa)
1409  initn:  68 init1:  68 opt:  90  Z-score: 105.5  bits: 32.8 E():  4.2
1410 Smith-Waterman score: 90;  28.947% identity (29.730% ungapped) in 76 aa overlap (6937-7158:28-103)
1411
1412      6940        6970      7000      7030      7060      7090
1413 5X_189 ETYTGQQ*--GYRS*QDEWSYR*RDRKHRADQPSGRA*RW*TGRGRPWSC*S*TRGCRRV
1414        .:: :..    ::. ... .:: :.: .  :.: .:       :::  .    .:
1415 NR_SC: DTYRGSRDRGEYRGGRERSDYRERERFNNRDNPRSRDRYDDRRRGRDVTGRYGNRRDDYP
1416         30        40        50        60        70        80
1417
1418        7120      7150
1419 5X_189 ER*RRRPNQR*DRK*G
1420        .  : : : : : . :
1421 NR_SC: RSFRSRHNTRDDSRRG
1422         90       100
1423
1424 >>NR_SC:SW-MID2_YEAST SW:MID2_YEAST P36027 saccharomyces  (376 aa)
1425  initn:  73 init1:  73 opt:  89  Z-score: 104.9  bits: 32.5 E():  4.5
1426 Smith-Waterman score: 97;  24.742% identity (27.273% ungapped) in 194 aa overlap (3349-3930:11-186)
1427
1428            3370      3400      3430      3460      3490      3520
1429 5X_189 RSTLIMMSCKAQTPTSKRLL*GSTSSEVTDKPSNTSPPKILTFSAKLSLSSLMKLPPSLF
1430        :  :...::  .:  .. .. .:.:.  . . . .:  .. . :. :: :
1431 NR_SC: RLLLLILSC-ISTIRAQFFVQSSSSNSSAVSTARSSVSRVSSSSSILSSS----------
1432                 20        30        40        50
1433
1434            3550      3580      3610      3640       3670      3700
1435 5X_189 PLFVNSSAPISCLWPPPSTVTRVLAVHCPSSSFSNSVN/MTRPSITKDSENAAASSAGSS
1436         .  .:::  : :    :: .: :. :  ::.   :.. .:  :...:: ....:::.:.
1437 NR_SC: -MVSSSSADSSSL--TSSTSSRSLVSHTSSSTSIASIS-FTSFSFSSDSSTSSSSSASSD
1438        60        70          80        90        100       110
1439
1440             3730      3760       3790      3820      3850      3880
1441 5X_189 SKAAAAGRSGAGLVRSLRE\TSLMSLSVTPPETMLKSG*TTSSASMPPSSPNLSKVALTL
1442        :.....   ..  . :    ::  . :..   .. ..  ..:: :   :.:. :    .
1443 NR_SC: SSSSSSFSISSTSATSESS-TSSTQTSTSSSSSLSSTPSSSSSPSTITSAPSTS----ST
1444          120       130        140       150       160           170
1445
1446              3910
1447 5X_189 PNASFTMSTATLSSLI
1448        :...   . .:..:.:
1449 NR_SC: PSTTAYNQGSTITSII
1450               180
1451
1452 >>NR_SC:SW-Q08438 SW:Q08438 Q08438 saccharomyces cerevis  (674 aa)
1453 rev-comp initn:  78 init1:  78 opt:  91  Z-score: 104.4  bits: 33.3 E():  4.8
1454 Smith-Waterman score: 103;  35.714% identity (35.714% ungapped) in 56 aa overlap (1082-915:586-641)
1455
1456     1080      1050      1020       990       960       930
1457 5X_18- DADINDYSV*AEDGHKPEPNAAGLLPGDDVIDSDLDDSDDEFRGDVDGGEDENDVD
1458        : : .: .   . : : : :       ::  :.: ::.::.   : :  .:..: :
1459 NR_SC: DNDEEDDNKKNDTGGKDEDNDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
1460          590       600       610       620       630       640
1461
1462 >>NR_SC:SW-CCC1_YEAST SW:CCC1_YEAST P47818 saccharomyces  (322 aa)
1463  initn:  81 init1:  81 opt:  88  Z-score: 104.4  bits: 32.2 E():  4.8
1464 Smith-Waterman score: 88;  23.188% identity (23.188% ungapped) in 69 aa overlap (2052-2258:247-315)
1465
1466           2070      2100      2130      2160      2190      2220
1467 5X_189 GIIPLFFFFFVPEFQSVGVLNIIFVYIQLLSFSTTYSKHHKQ*GSNSTHASQRLSTMVSK
1468        :..::  .::: .  .  . .:: . . :. :. . .:     ::....   .   ::
1469 NR_SC: GLVPLVPYFFVSDVGTGLIYSIIVMVVTLFWFGYVKTKLSMGSGSSTSKKVTEGVEMVVV
1470         250       260       270       280       290       300
1471
1472           2250
1473 5X_189 RTTGVSSSW
1474          ......:
1475 NR_SC: GGVAAGAAW
1476         310
1477
1478
1479
1480
1481 7972 residues in 1 query   sequences
1482 4215311 residues in 9190 library sequences
1483  Scomplib [34t10]
1484  start: Tue Jan  8 20:41:56 2002 done: Tue Jan  8 20:43:22 2002
1485  Scan time: 25.790 Display time: 58.770
1486
1487 Function used was FASTXY [version 3.4t07 Nov 21, 2001]