Bio::Align::Graphics: move into its own distribution and drop dependency on GD
[bioperl-live.git] / t / data / NM_002254.gb
blobf1cac614a5e42730ce4118b269c4db4ed54ce4ef
1 LOCUS       KIF3C                   4913 bp    mRNA    linear   PRI 06-APR-2003
2 DEFINITION  Homo sapiens kinesin family member 3C (KIF3C), mRNA.
3 ACCESSION   NM_002254
4 VERSION     NM_002254.2  GI:19923139
5 KEYWORDS    .
6 SOURCE      Homo sapiens (human)
7   ORGANISM  Homo sapiens
8             Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
9             Mammalia; Eutheria; Primates; Catarrhini; Hominidae; Homo.
10 REFERENCE   1  (bases 1 to 4913)
11   AUTHORS   Sardella,M., Navone,F., Rocchi,M., Rubartelli,A., Viggiano,L.,
12             Vignali,G., Consalez,G.G., Sitia,R. and Cabibbo,A.
13   TITLE     KIF3C, a novel member of the kinesin superfamily: sequence,
14             expression, and mapping to human chromosome 2 at 2p23
15   JOURNAL   Genomics 47 (3), 405-408 (1998)
16   MEDLINE   98149989
17    PUBMED   9480755
18 REFERENCE   2  (bases 1 to 4913)
19   AUTHORS   Telford,E.A., Wightman,P., Leek,J., Markham,A.F., Lench,N.J. and
20             Bonthron,D.T.
21   TITLE     cDNA cloning, genomic organization, and chromosomal localization of
22             a novel human gene that encodes a kinesin-related protein highly
23             similar to mouse Kif3C
24   JOURNAL   Biochem. Biophys. Res. Commun. 242 (2), 407-412 (1998)
25   MEDLINE   98113366
26    PUBMED   9446808
27 REFERENCE   3  (bases 1 to 4913)
28   AUTHORS   Telford,E.A.R., Wightman,P., Leek,J., Lench,N.J., Markham,A.F. and
29             Bonthron,D.T.
30   TITLE     Homo sapiens kinesin family member 3C (KIF3C), mRNA
31   JOURNAL   Unpublished (1997)
32 COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
33             NCBI review. The reference sequence was derived from AF035621.1.
34             On Apr 4, 2002 this sequence version replaced gi:4504868.
35 FEATURES             Location/Qualifiers
36      source          1..4913
37                      /organism="Homo sapiens"
38                      /mol_type="mRNA"
39                      /db_xref="taxon:9606"
40                      /chromosome="2"
41                      /map="2p23"
42      gene            1..4913
43                      /gene="KIF3C"
44                      /db_xref="LocusID:3797"
45                      /db_xref="MIM:602845"
46      CDS             154..2535
47                      /gene="KIF3C"
48                      /codon_start=1
49                      /product="kinesin family member 3C"
50                      /protein_id="NP_002245.2"
51                      /db_xref="GI:19923140"
52                      /db_xref="LocusID:3797"
53                      /db_xref="MIM:602845"
54                      /translation="MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTL
55                      RNPRAAPGELPKTFTFDAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTG
56                      KTYTMQGTWVEPELRGVIPNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKE
57                      PGKRLELKENPETGVYIKDLSSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHA
58                      IFIITVECSERGSDGQDHIRVGKLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGG
59                      GSGGGAGGERPKEASKINLSLSALGNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNA
60                      KTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFANRAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKA
61                      QLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPGYPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILE
62                      SALEKNMENYLQEQKERLEEEKAAIQDDRSLVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATE
63                      LLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTNEQQKMLELKRQEIAEQKRREREMQQEMMLRDEE
64                      TMELRGTYTSLQQEVEVKTKKLKKLYAKLQAVKAEIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQT
65                      RELKLKYLIIENFIPPEEKNKIMNRLFLDCEEEQWKFQPLVPAGVSSSQMKKRPTSAV
66                      GYKRPISQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLELDVSPPAVFEMEFSHDQEQDPRALHME
67                      RLMRLDSFLERPSTSKVRKSRSWCQSPQRPPPSTTHASLASASLRPATVADHE"
68      misc_feature    199..1251
69                      /gene="KIF3C"
70                      /note="kinesin; Region: Kinesin motor domain"
71                      /db_xref="CDD:pfam00225"
72      misc_feature    442..465
73                      /gene="KIF3C"
74                      /note="encodes ATP/GTP-binding site motif"
75      misc_feature    871..906
76                      /gene="KIF3C"
77                      /note="encodes kinesin motor domain signature"
78      polyA_signal    4889..4894
79                      /gene="KIF3C"
80 BASE COUNT     1150 a   1342 c   1355 g   1066 t
81 ORIGIN      
82         1 cctcccagcg tccccaccct aggaggctgc atgcggattg aagacgtgcg cctgggggct
83        61 gggccggccc cgctgatccc gacctagcga gcaggatagc aggaccgccc aggctgcgga
84       121 ggggctcggg ggcaggaagg tcagagcagc aagatggcca gtaagaccaa ggccagcgag
85       181 gccctcaagg tggtggcccg gtgccgcccc ctcagcagga aggaggaggc tgctggtcac
86       241 gagcagatcc tgaccatgga cgtgaaactg ggccaggtga ccctgcggaa cccccgcgcc
87       301 gccccggggg agctgcccaa gaccttcacc tttgacgccg tgtatgatgc cagctccaag
88       361 caggccgacc tgtatgacga aaccgtgagg cccctgatag actccgtgct ccagggtttc
89       421 aatggcacgg tgtttgccta tggccagacg ggcactggca agacctatac catgcagggg
90       481 acctgggtgg agcccgagct gcgcggggtc atcccgaatg cctttgagca catcttcacc
91       541 cacatctccc gctcccagaa ccaacagtac ctggtccggg cctcctattt ggagatctac
92       601 caggaagaga ttcgagacct gctctccaag gagccgggca agaggctaga gctgaaagag
93       661 aaccccgaga ctggcgtcta catcaaggac ctctcctcct tcgtcaccaa gaatgtcaag
94       721 gagattgagc atgtgatgaa cctggggaac cagacccggg ctgtgggcag cacccacatg
95       781 aatgaggtca gctcccgctc ccatgccatc ttcatcatca ctgtggagtg cagcgaacgt
96       841 ggctctgatg gccaggacca catccgagtg ggcaagctca acctcgtgga cctggctggc
97       901 agcgagaggc agaacaaggc aggccccaac acagcgggag gggcagccac accatcctcg
98       961 ggtggcggtg gtggcggtgg aggcagtggt ggtggtgctg gtggagagag gcctaaggaa
99      1021 gcctccaaaa tcaacctctc attatctgcc ctgggcaacg tgattgctgc cctggcgggc
100      1081 aacaggagca cccacattcc ctaccgggac tccaagctga cccggctgct ccaggactcc
101      1141 ctggggggga atgcgaagac catcatggta gccacactgg ggccagcttc tcacagctac
102      1201 gatgagagcc tctccacctt gcgctttgcc aaccgagcca agaacatcaa gaacaagccc
103      1261 cgggtgaacg aggaccccaa ggacacactg ctgcgggaat tccaagagga gattgcccgc
104      1321 ctgaaggccc agctggagaa gagggggatg ctggggaagc ggccccggag gaagagcagc
105      1381 cgcaggaaga aggccgtgtc cgccccgcct gggtaccctg agggcccagt gattgaggct
106      1441 tgggtggcag aagaggagga tgacaacaac aacaaccacc gcccgcccca gcccatcctg
107      1501 gagtcagcct tggagaagaa catggagaat tacctgcagg aacagaagga gcggctggag
108      1561 gaggagaagg cagccatcca ggatgaccgc agcctggtga gcgaggagaa gcagaagctg
109      1621 ctggaggaga aggagaagat gctggaggac ctgcggcggg aacagcaggc cacagagctg
110      1681 cttgcggcca agtacaaggc catggagagc aagctcctca tcgggggcag gaacatcatg
111      1741 gatcacacca acgaacagca gaagatgttg gaactgaaga ggcaggagat tgccgagcag
112      1801 aaacgtcgtg agcgggagat gcagcaggag atgatgctcc gggacgagga gactatggag
113      1861 ctccggggca cctacacatc cctgcagcag gaggtggagg tcaaaaccaa gaaactcaag
114      1921 aagctctacg ccaagctgca ggcggtgaag gcggagatcc aggaccagca tgatgagtat
115      1981 atccgcgtgc ggcaggacct ggaggaggcg cagaacgagc agacccgcga actcaagctc
116      2041 aagtacctaa tcatcgagaa cttcatcccg ccggaggaga agaacaagat catgaaccgg
117      2101 cttttcctgg actgtgagga ggagcagtgg aagttccagc cactggtgcc agccggcgtc
118      2161 agtagcagcc agatgaagaa gcggccaaca tctgcagtgg gctacaagag gcctatcagc
119      2221 cagtatgctc gggttgccat ggcaatgggg tcccacccca ggtacagggc tgaaaacata
120      2281 atgtttctgg agttggatgt gtcccctcca gctgtctttg agatggaatt ctctcacgac
121      2341 caagaacaag accctcgtgc gctacacatg gagaggctca tgcgattgga cagctttctg
122      2401 gaaagacctt ccacgtctaa agtccgaaag tccagatcct ggtgccagag tcctcagcgg
123      2461 cctccacctt ccaccacaca tgcctccctg gcctctgctt ctctgcgccc tgcaacagtg
124      2521 gcggaccatg agtgacaacc atcacgtcag gctgcccatc caatagactc ctgggatggg
125      2581 gcagccaacc ctggctcatc tcatctgccg cttggtgcgt gtgcgtgtgc gtgcatgtgc
126      2641 gtgtgcgtgt gtgcaggggt gagaatctgg cagatggtgc ctctgcctgc tcttcttcgc
127      2701 ctcctttatt taattcatgt tatttattcg cggacgtctg ttcgtgttgg ggagatgccc
128      2761 tcgcctgagc cgtctgggcc taccgtggtc actgcgtacg ctctttttct tctgacttga
129      2821 gagctccccc agtcagatct caggcttgtc cccctgtcag ctgcctccag aagggaaggt
130      2881 agccagtgcc tgagaagaca gtcccttttc tacccaccgc actccataac ctccatcttc
131      2941 tcccacactg atggcgagca gcccctgagc actttctggg actgggagac tgcttggtgt
132      3001 tccctgagga caagagacat cctgacagtg ttgggcatct gctccccgtg gacacagccc
133      3061 cactctccac tttctgagcc tcagacaacc tcattcagcc tcttgggctc cttttcaagg
134      3121 acattaataa cctcaccaac atagctcatg cccttcagct ttgacaagaa ctcacggctt
135      3181 cccaaactct gctttctgcc caccttggat gggaactgtg gaccaagcaa ttaccatcgc
136      3241 cttggaacct gcaggaaatg gaacagcaat tgagacaact tgaacagtca tcaacggaag
137      3301 tccctccact ggattccttt gtttctgtcc cctccgagga gtcattttgg tcgacaggct
138      3361 ctcaaggcaa ctccccattt tcaagaggct gctcctgcct gcttcgatca tttctccctg
139      3421 cagctgccta gaccccgttc acagtgggag gagtcaatgt cattctaccc ctcgctaaac
140      3481 gaagatatta acatctattg ctttttccct tcatctgtca caggaaacag aagcccaggc
141      3541 acaatctttt ccagctttgc ctgttacccc tgtttctgaa ttgcatcttt aaggtattat
142      3601 tttgttgaca atagatcctt tattcactag ttacgcaaat tggttcctag ggggatactc
143      3661 cttaccttcc tttgtgatgg cccaaaatgt ctctaggtat ctcaagtgat aagtaaattt
144      3721 ctacaaaaaa aaaatggtta atgttcattg actggctttt taagtgtata ttttggagga
145      3781 cgggtgaaga ggtcataacg aaagcaagcg agtgaattag gatttcaaag tgccctaata
146      3841 gtgtgagtct ccagttccta gaatatgaag agtgctgtcg ttggggtgaa accatgagac
147      3901 tgacagatct gcctgaaatg gggggtgtgg gaggtggtgg cgggggttat tctctttcct
148      3961 tcaggaaatg aacccttctt acatcattca agttctgctc tgaggatcaa gcttgggtct
149      4021 gatttaactc agcgacactg tcatttctgc ttcattactg gactagaggg ttgagccacc
150      4081 cacttgccat ttgctcctgt ccttccagga aatcacaatt ttcatcagag cccaagagat
151      4141 tatttgagac tcaggattca gatcagaggt tcgactgtgg ctgggacagg agttgtgtgt
152      4201 agaaattcac caggtggcct gagcgcaggg ggacctccag gctgcgttga gcagcctctc
153      4261 ccactgacct ctttctcgtt tgtggacaaa gcagcacgta tcacctcatt catcacttgg
154      4321 acacatcgcc tttgcattgt cttgtcacac ctccctcaca gtcttatagc acaatatacc
155      4381 caaatcagcc cccccagtcc gaggctgggc ccaaggtatg gtcggaggag gagctcctgc
156      4441 ctgcggtttt gtgtatgtgt gtatgtgtgt gcgtgtttgt gtgcgtgttt acctccacag
157      4501 gggacactct acactcagtg taagatctgc tgggaacagg gccaccagga gtgcgtggat
158      4561 ctcagtctct ctgtctctct ttctctcctt ttaattttgg tgtatcaaat atttgattga
159      4621 caaagtaagg gccttgatta ggaccaaatt ctcgtgtgtt gctatggtct ttatttagga
160      4681 caacaattaa caatgcagtg gcccattctt gtcactctac acatatgact atacgggaca
161      4741 tatgtaatat ataaatatat atataaaaca ttcccctctg tccccttggc ttcggatgga
162      4801 ggaatttctg ttgagctgaa atgcacctgc agctgggtgc tgccagcagc ttgcaggccc
163      4861 cagccctgtt ccaatcaatg cagttgacaa taaaggaatg agtatcgtca cgg