t/data/bl2seq+.blastn

   1 BLASTN 2.2.29+
   2
   3
   4 Query= gi|2695846|emb|Y13255.1| Acipenser baeri mRNA for immunoglobulin
   5 heavy chain, clone ScH 3.3
   6
   7 Length=606
   8
   9 Subject= gi|2695846|emb|Y13255.1| Acipenser baeri mRNA for immunoglobulin
  10 heavy chain, clone ScH 3.3
  11
  12 Length=606
  13
  14
  15  Score =  1120 bits (606),  Expect = 0.0
  16  Identities = 606/606 (100%), Gaps = 0/606 (0%)
  17  Strand=Plus/Plus
  18
  19 Query  1    TGGTTACAACACTTTCTTCTTTCAATAACCACAATACTGCAGTACAATGGGGATTTTAAC  60
  20             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  21 Sbjct  1    TGGTTACAACACTTTCTTCTTTCAATAACCACAATACTGCAGTACAATGGGGATTTTAAC  60
  22
  23 Query  61   AGCTCTCTGTATAATAATGACAGCTCTATCAAGTGTCCGGTCTGATGTAGTGTTGACTGA  120
  24             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25 Sbjct  61   AGCTCTCTGTATAATAATGACAGCTCTATCAAGTGTCCGGTCTGATGTAGTGTTGACTGA  120
  26
  27 Query  121  GTCCGGACCAGCAGTTATAAAGCCTGGAGAGTCCCATAAACTGTCCTGTAAAGCCTCTGG  180
  28             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  29 Sbjct  121  GTCCGGACCAGCAGTTATAAAGCCTGGAGAGTCCCATAAACTGTCCTGTAAAGCCTCTGG  180
  30
  31 Query  181  ATTCACATTCAGCAGCGCCTACATGAGCTGGGTTCGACAAGCTCCTGGAAAGGGTCTGGA  240
  32             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33 Sbjct  181  ATTCACATTCAGCAGCGCCTACATGAGCTGGGTTCGACAAGCTCCTGGAAAGGGTCTGGA  240
  34
  35 Query  241  ATGGGTGGCTTATATTTACTCAGGTGGTAGTAGTACATACTATGCCCAGTCTGTCCAGGG  300
  36             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  37 Sbjct  241  ATGGGTGGCTTATATTTACTCAGGTGGTAGTAGTACATACTATGCCCAGTCTGTCCAGGG  300
  38
  39 Query  301  AAGATTCGCCATCTCCAGAGACGATTCCAACAGCATGCTGTATTTACAAATGAACAGCCT  360
  40             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  41 Sbjct  301  AAGATTCGCCATCTCCAGAGACGATTCCAACAGCATGCTGTATTTACAAATGAACAGCCT  360
  42
  43 Query  361  GAAGACTGAAGACACTGCCGTGTATTACTGTGCTCGGGGCGGGCTGGGGTGGTCCCTTGA  420
  44             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  45 Sbjct  361  GAAGACTGAAGACACTGCCGTGTATTACTGTGCTCGGGGCGGGCTGGGGTGGTCCCTTGA  420
  46
  47 Query  421  CTACTGGGGGAAAGGCACAATGATCACCGTAACTTCTGCTACGCCATCACCACCGACAGT  480
  48             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  49 Sbjct  421  CTACTGGGGGAAAGGCACAATGATCACCGTAACTTCTGCTACGCCATCACCACCGACAGT  480
  50
  51 Query  481  GTTTCCGCTTATGGAGTCATGTTGTTTGAGCGATATCTCGGGTCCTGTTGCTACGGGCTG  540
  52             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  53 Sbjct  481  GTTTCCGCTTATGGAGTCATGTTGTTTGAGCGATATCTCGGGTCCTGTTGCTACGGGCTG  540
  54
  55 Query  541  CTTAGCAACCGGATTCTGCCTACCCCCGCGACCTTCTCGTGGACTGATCAATCTGGAAAA  600
  56             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  57 Sbjct  541  CTTAGCAACCGGATTCTGCCTACCCCCGCGACCTTCTCGTGGACTGATCAATCTGGAAAA  600
  58
  59 Query  601  GCTTTT  606
  60             ||||||
  61 Sbjct  601  GCTTTT  606
  62
  63
  64
  65 Lambda      K        H
  66     1.33    0.621     1.12
  67
  68 Gapped
  69 Lambda      K        H
  70     1.28    0.460    0.850
  71
  72 Effective search space used: 352836
  73
  74
  75
  76
  77 Matrix: blastn matrix 1 -2
  78 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5