t/data/cmsearch.nohit.out

   1 # cmsearch :: search CM(s) against a sequence database
   2 # INFERNAL 1.1.1 (July 2014)
   3 # Copyright (C) 2014 Howard Hughes Medical Institute.
   4 # Freely distributed under the GNU General Public License (GPLv3).
   5 # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
   6 # query CM file:                         Cobalamin.c.cm
   7 # target sequence database:              mrum-tRNAs10.fa
   8 # number of worker threads:              4
   9 # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
  10
  11 Query:       Cobalamin  [CLEN=191]
  12 Accession:   RF00174
  13 Description: Cobalamin riboswitch
  14 Hit scores:
  15  rank     E-value  score  bias  sequence  start    end   mdl trunc   gc  description
  16  ----   --------- ------ -----  -------- ------ ------   --- ----- ----  -----------
  17
  18    [No hits detected that satisfy reporting thresholds]
  19
  20
  21 Hit alignments:
  22
  23    [No hits detected that satisfy reporting thresholds]
  24
  25
  26 Internal CM pipeline statistics summary:
  27 ----------------------------------------
  28 Query model(s):                                                  1  (191 consensus positions)
  29 Target sequences:                                               10  (1544 residues searched)
  30 Target sequences re-searched for truncated hits:                10  (4632 residues re-searched)
  31 Windows   passing  local HMM SSV           filter:               1  (0.01198); expected (0.35)
  32 Windows   passing  local HMM Viterbi       filter:                  (off)
  33 Windows   passing  local HMM Viterbi  bias filter:                  (off)
  34 Windows   passing  local HMM Forward       filter:               0  (0); expected (0.02)
  35 Windows   passing  local HMM Forward  bias filter:               0  (0); expected (0.02)
  36 Windows   passing glocal HMM Forward       filter:               0  (0); expected (0.02)
  37 Windows   passing glocal HMM Forward  bias filter:               0  (0); expected (0.02)
  38 Envelopes passing glocal HMM envelope defn filter:               0  (0); expected (0.02)
  39 Envelopes passing  local CM  CYK           filter:               0  (0); expected (0.0001)
  40 Total CM hits reported:                                          0  (0); includes 0 truncated hit(s)
  41
  42 # CPU time: 0.01u 0.01s 00:00:00.02 Elapsed: 00:00:00.03
  43 //
  44 [ok]