Bio::Align::Graphics: move into its own distribution and drop dependency on GD
[bioperl-live.git] / t / data / consed_project / edit_dir / test_project.fasta.screen.ace.1
blobf3194b8b3a4a0600ccb659848b6d08d6701f325e
1 AS 1 2
3 CO Contig1 708 2 51 U
4 atatcTCGAGGGTACTTGAGGATTCTACCACCACAACAACAAAGCCTTAT
5 CATCCAGAACCGCAAATTATAAAAAAGAGCCAACACCACAAAACAAAATG
6 AAAAGAAACAAACTCTTCAACCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGGATA
7 ACACCTTCGTACTTAACTTGGAACCACTTCATGGCATCATCCTTGGTAAC
8 TCTATGCTGAATCCCAACGCGAGTCTTGCACCTACGGCGACGTGCAACAC
9 GGTATCCCGGGCGTTCAAGAACAACATAGAAGTCCATTCCATAGATACCC
10 GTAGAAGGATCGTACTTGATTCCAAGATCAATGTGCTCCTGGATACCGAA
11 TCCAAAACAGCCAGTGTCACTGAAGTTCCTCCTCAACAGCTCGTACTCCT
12 TGACTTTCAAGCCACTCTCAAGAAGCTGCATTGCCTTGTCTCCTCTCACG
13 GTGACGTAGCACGCAATCTTTTCATTACGTCTAATACCGAAAGACCTCAC
14 AGTGTACCTCGCCTTGGAGAAGACAGGTGTTTGACCACTGAGCTGTTCCA
15 AAACCTTGGAGGCACGGGTGAGACGATCACCACTCTCACCAACGGAGATG
16 TTGAGAACGAGCTTCTGAACCTTGATATCCCTCATTGGGTTCGAGAGCTT
17 CTTCTCTGACGCCATTCTGAGGATTAAGGGATGCAAAGTCAGAGGGAGAT
18 GAGCAAAg
21  0 0 0 12 17 32 26 25 25 41 49 50 47 47 51 50 56 55 59 50 50 53 55 55 53 59 57 51 54 61 56 54 53 60 48 48 57 58 58 64 60 62 58 64 57 53 53 59 64 67
22  67 75 72 65 55 47 47 39 44 41 48 54 55 61 52 47 53 53 53 60 67 67 74 76 76 69 65 62 58 54 51 56 60 60 73 73 66 61 61 59 52 56 56 60 64 64 59 57 59 60
23  60 59 71 82 74 69 61 64 61 83 68 72 71 73 75 71 77 66 62 62 60 64 61 63 63 61 75 75 64 64 60 64 64 75 75 72 80 83 61 64 64 72 64 64 61 56 57 60 62 62
24  62 62 60 52 50 56 57 57 61 61 64 59 59 64 60 62 58 54 50 51 58 63 67 69 75 75 78 86 86 84 79 71 71 72 69 69 67 90 90 90 90 79 85 88 69 71 71 67 67 67
25  78 75 75 80 84 80 80 82 86 86 90 90 90 90 90 76 75 67 67 67 70 69 78 75 81 75 73 73 69 68 60 66 70 73 70 70 70 70 69 74 75 72 69 73 75 72 72 88 89 75
26  75 75 75 77 88 90 90 90 81 81 78 78 75 75 80 83 86 82 84 83 86 86 90 85 73 56 56 55 59 54 62 62 72 74 77 90 90 90 90 90 85 90 75 75 78 85 84 88 80 80
27  72 76 72 74 74 90 90 88 75 75 75 72 72 72 77 77 77 80 77 77 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 90 88 86 86 86 90 86 77 83 77 77 77 83 83 90 90 90 90 90
28  90 90 90 90 90 90 87 80 78 74 78 74 81 73 80 78 86 86 86 86 88 80 88 87 87 87 87 90 90 90 90 90 90 90 90 87 87 80 71 70 67 63 63 65 72 80 90 90 90 90
29  86 86 86 88 86 90 89 76 76 78 78 77 77 76 89 89 71 71 56 51 51 43 43 43 43 58 58 80 80 80 80 89 89 71 71 58 38 38 38 43 43 60 60 60 60 60 58 58 58 75
30  79 79 78 88 83 81 81 71 71 69 75 75 78 78 78 85 88 85 85 90 85 85 85 90 90 71 67 60 58 58 58 68 70 78 80 89 90 85 85 85 80 77 78 77 74 74 72 72 70 58
31  58 58 43 43 51 51 51 43 43 43 43 43 58 66 66 66 51 51 45 45 51 51 51 51 60 60 60 69 69 69 66 66 72 76 80 85 81 81 60 60 60 60 58 58 51 51 51 51 56 56
32  71 71 71 71 71 71 61 58 58 58 58 58 60 61 58 58 58 59 62 66 63 67 64 64 64 64 67 67 76 74 76 72 72 58 58 58 58 58 60 73 80 80 74 64 61 54 45 45 45 51
33  51 51 51 51 51 45 40 39 39 49 49 49 54 52 64 65 67 71 72 72 73 73 43 36 39 39 39 39 39 51 51 51 51 51 51 51 51 51 51 51 51 51 40 39 39 39 39 35 35 40
34  51 51 51 51 40 40 40 35 35 45 43 43 52 50 50 49 52 49 51 53 46 46 46 46 46 46 46 51 42 56 40 40 40 40 39 35 35 35 35 35 35 51 51 56 51 51 46 40 40 40
35  40 40 40 40 39 34 34 0
37 AF ML4924F U -5
38 AF ML4924R C 1
39 BS 1 9 ML4924R
40 BS 10 11 ML4924F
41 BS 12 16 ML4924R
42 BS 17 51 ML4924F
43 BS 52 54 ML4924R
44 BS 55 63 ML4924F
45 BS 64 64 ML4924R
46 BS 65 109 ML4924F
47 BS 110 110 ML4924R
48 BS 111 111 ML4924F
49 BS 112 113 ML4924R
50 BS 114 114 ML4924F
51 BS 115 117 ML4924R
52 BS 118 121 ML4924F
53 BS 122 128 ML4924R
54 BS 129 133 ML4924F
55 BS 134 138 ML4924R
56 BS 139 141 ML4924F
57 BS 142 144 ML4924R
58 BS 145 160 ML4924F
59 BS 161 161 ML4924R
60 BS 162 174 ML4924F
61 BS 175 180 ML4924R
62 BS 181 187 ML4924F
63 BS 188 188 ML4924R
64 BS 189 200 ML4924F
65 BS 201 201 ML4924R
66 BS 202 203 ML4924F
67 BS 204 221 ML4924R
68 BS 222 222 ML4924F
69 BS 223 223 ML4924R
70 BS 224 240 ML4924F
71 BS 241 244 ML4924R
72 BS 245 245 ML4924F
73 BS 246 258 ML4924R
74 BS 259 262 ML4924F
75 BS 263 291 ML4924R
76 BS 292 292 ML4924F
77 BS 293 331 ML4924R
78 BS 332 332 ML4924F
79 BS 333 372 ML4924R
80 BS 373 377 ML4924F
81 BS 378 453 ML4924R
82 BS 454 454 ML4924F
83 BS 455 595 ML4924R
84 BS 596 596 ML4924F
85 BS 597 609 ML4924R
86 BS 610 624 ML4924F
87 BS 625 659 ML4924R
88 BS 660 670 ML4924F
89 BS 671 708 ML4924R
91 RD ML4924F 734 0 0
92 ttgttcttttctcgAGGGTACTTGAGGATTCTACCACCACAACAACAAAG
93 CCTTATCATCCAGAACCGCAAATTATAAAAAAGAGCCAACACCACAAAAC
94 AAAATGAAAAGAAACAAACTCTTCAACCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTG
95 AGGATAACACCTTCGTACTTAACTTGGAACCACTTCATGGCATCATCCTT
96 GGTAACTCTATGCTGAATCCCAACGCGAGTCTTGCACCTACGGCGACGTG
97 CAACACGGTATCCCGGGCGTTCAAGAACAACATAGAAGTCCATTCCATAG
98 ATACCCGTAGAAGGATCGTACTTGATTCCAAGATCAATGTGCTCCTGGAT
99 ACCGAATCCAAAACAGCCAGTGTCACTGAAGTTCCTCCTCAACAGCTCGT
100 ACTCCTTGACTTTCAAGCCACTCTCAACaaGCTGCATTGCCTTgccTCCT
101 CTCACGGTGACGTAGCACGCAATCTTTTCATTACGTCTAATACCGAAAGA
102 CCTCACAGtgcaCctggcCTTGgacaacacAGGTGTTTGACCACTGAGCT
103 gttacaAAACCTTGGAGGCACGGGTGAGACGATCACCACTCTCACCAACG
104 GAGATgtcgaGAACGAGCTTCTGAACCTTGATattcctCATtgggctcca
105 cagctctttcTCTGACGCCATTCTGAGGatctagggatgcacacccacaa
106 ggacatgaccaaaatcgacatctgggcccactcg
108 QA 12 601 10 713
109 DS CHROMAT_FILE: ML4924F PHD_FILE: ML4924F.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Thu Jun 21 11:27:03 2001
111 RD ML4924R 763 0 0
112 atatcTCGAGGGTACTTGAGGATTCTACCACCACAACAACAAAGCCTTAT
113 CATCCAGAACCGCAAATTATAAAAAAGAGCCAACACCACAAAACAAAATG
114 AAAAGAAACAAACTCTTCAACCAGTGATGTTCTGAGACTTGTTGAGGATA
115 ACACCTTCGTACTTAACTTGGAACCACTTCATGGCATCATCCTTGGTAAC
116 TCTATGCTGAATCCCAACGCGAGTCTTGCACCTACGGCGACGTGCAACAC
117 GGTATCCCGGGCGTTCAAGAACAACATAGAAGTCCATTCCATAGATACCC
118 GTAGAAGGATCGTACTTGATTCCAAGATCAATGTGCTCCTGGATACCGAA
119 TCCAAAACAGCCAGTGTCACTGAAGTTCCTCCTCAACAGCTCGTACTCCT
120 TGACTTTCAAGCCACTCTCAAGAAGCTGCATTGCCTTGTCTCCTCTCACG
121 GTGACGTAGCACGCAATCTTTTCATTACGTCTAATACCGAAAGACCTCAC
122 AGTGTACCTCGCCTTGGAGAAGACAGGTGTTTGACCACTGAGCTGTTCCA
123 AAACCTTGGAGGCACGGGTGAGACGATCACCACTCTCACCAACGGAGATG
124 TTGAGAACGAGCTTCTGAACCTTGATATCCCTCATTGGGTTCGAGAGCTT
125 CTTCTCTGACGCCATTCTGAGGATTAAGGGATGCAAAGTCAGAGGGAGAT
126 GAGCAAAgxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
127 xxxxxaccaaagt
129 QA 10 707 1 708
130 DS CHROMAT_FILE: ML4924R PHD_FILE: ML4924R.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Thu Jun 21 11:27:03 2001
134 phrap_params phrap 010621:164002
135 /usr/local/genome/bin/phrap test_project.fasta.screen -new_ace -view 
136 phrap version 0.990329