Bio::Align::Graphics: move into its own distribution and drop dependency on GD
[bioperl-live.git] / t / data / cysprot.needle
blob5c65fec2314cb1fac87ba196e00ade9acebb8689
1 Global: PAPA_CARPA vs CATL_HUMAN
2 Score: 499.50
4 PAPA_CARPA      1        MAMIPSISKLLFVAICLFVYMGLSFGDFSIVGYSQNDLTSTERLI 45      
5                            | |:   |:  | ||              | :   ||    | 
6 CATL_HUMAN      1          MNPT...LILAAFCL..............GIASATLTFDHSLE 26      
8 PAPA_CARPA      46       QLFESWMLKHNKIYKNIDEKIYRFEIFKDNLKYIDETNKK....N 86      
9                            :  |   ||::|  ::|: :|  ::: |:| |:  |::     
10 CATL_HUMAN      27       AQWTKWKAMHNRLY.GMNEEGWRRAVWEKNMKMIELHNQEYREGK 70      
12 PAPA_CARPA      87       NSYWLGLNVFADMSNDEFKEKYTG.....SIAGNYTTTELSYEEV 126     
13                          :|: : :| | ||:::||::   |        |      | ||  
14 CATL_HUMAN      71       HSFTMAMNAFGDMTSEEFRQVMNGFQNRKPRKGKVFQEPLFYE.. 113     
16 PAPA_CARPA      127      LNDGDVNIPEYVDWRQKGAVTPVKNQGSCGSCWAFSAVVTIEGII 171     
17                                  |  ||||:|| |||||||| |||||||||   :|| :
18 CATL_HUMAN      114      .......APRSVDWREKGYVTPVKNQGQCGSCWAFSATGALEGQM 151     
20 PAPA_CARPA      172      KIRTGNLNEYSEQELLDCD..RRSYGCNGGYPWSALQLVAQY.GI 213     
21                            :|| |   ||| |:||   : : |||||    | | |    |:
22 CATL_HUMAN      152      FRKTGRLISLSEQNLVDCSGPQGNEGCNGGLMDYAFQYVQDNGGL 196     
24 PAPA_CARPA      214      HYRNTYPYEGVQRYCRSREKGPYAAKTD.GVRQVQPYNEGALLYS 257     
25                              :||||  :  |:   |  |:   | |   : |  | ||: :
26 CATL_HUMAN      197      DSEESYPYEATEESCKYNPK..YSVANDTGFVDI.PKQEKALMKA 238     
28 PAPA_CARPA      258      IAN.QPVSVVLEAAGKDFQLYRGGIFVGP.CGNK.VDHAVAAVGY 299     
29                          :|   |:|| ::|  : |  |: ||:  | | :: :|| |  |||
30 CATL_HUMAN      239      VATVGPISVAIDAGHESFLFYKEGIYFEPDCSSEDMDHGVLVVGY 283     
32 PAPA_CARPA      300      G........PNYILIKNSWGTGWGENGYIRIKRGTGNSYGVCGLY 336     
33                          |          | |:|||||  ||  ||::: :   |    ||: 
34 CATL_HUMAN      284      GFESTESDNNKYWLVKNSWGEEWGMGGYVKMAKDRRNH...CGIA 325     
36 PAPA_CARPA      337      TSSFYPVKN                                     345     
37                          ::: ||   
38 CATL_HUMAN      326      SAASYPTV                                      333     
40 %id = 39.81                     %similarity = 59.22
41 Overall %id = 35.65             Overall %similarity = 53.04