t/data/cysprot1b.msf

   1 PileUp
   2
   3
   4
   5    MSF:  366  Type: P    Check:  8252   ..
   6
   7  Name: CATL_HUMAN oo  Len:  366  Check:  9087  Weight:  21.6
   8  Name: CATL_RAT oo  Len:  366  Check:   271  Weight:  20.7
   9  Name: CATH_RAT oo  Len:  366  Check:  8974  Weight:  27.9
  10  Name: PAPA_CARPA oo  Len:  366  Check:  9920  Weight:  29.7
  11
  12 //
  13
  14
  15
  16 CATL_HUMAN      ......MNPT LILAAFCLGI .......... ...ASATLTF DHSLEAQWTK
  17 CATL_RAT        ......MTPL LLLAVLCLGT .......... ...ALATPKF DQTFNAQWHQ
  18 CATH_RAT        ...MWTALPL LCAGAWLLSA G......... ...ATAELTV NAIEKFHFTS
  19 PAPA_CARPA      MAMIPSISKL LFVAICLFVY MGLSFGDFSI VGYSQNDLTS TERLIQLFES
  20
  21
  22 CATL_HUMAN      WKAMHNRLYG .MNEEGWRRA VWEKNMKMIE LHNQEYREGK HSFTMAMNAF
  23 CATL_RAT        WKSTHRRLYG .TNEEEWRRA VWEKNMRMIQ LHNGEYSNGK HGFTMEMNAF
  24 CATH_RAT        WMKQHQKTYS .SREYSHRLQ VFANNWRKIQ AHNQRN.... HTFKMGLNQF
  25 PAPA_CARPA      WMLKHNKIYK NIDEKIYRFE IFKDNLKYID ETNKKN.... NSYWLGLNVF
  26
  27
  28 CATL_HUMAN      GDMTSEEFRQ VMNGFQNRKP RKGKVFQEPL FY....EAPR SVDWREKG.Y
  29 CATL_RAT        GDMTNEEFRQ IVNGYRHQKH KKGRLFQEPL ML....QIPK TVDWREKG.C
  30 CATH_RAT        SDMSFAEIKH KYLWSEPQNC SATKSNYLRG TG....PYPS SMDWRKKGNV
  31 PAPA_CARPA      ADMSNDEFKE KYTGSIAGNY TTTELSYEEV LNDGDVNIPE YVDWRQKG.A
  32
  33
  34 CATL_HUMAN      VTPVKNQGQC GSCWAFSATG ALEGQMFRKT GRLISLSEQN LVDCSGPQGN
  35 CATL_RAT        VTPVKNQGQC GSCWAFSASG CLEGQMFLKT GKLISLSEQN LVDCSHDQGN
  36 CATH_RAT        VSPVKNQGAC GSCWTFSTTG ALESAVAIAS GKMMTLAEQQ LVDCAQNFNN
  37 PAPA_CARPA      VTPVKNQGSC GSCWAFSAVV TIEGIIKIRT GNLNEYSEQE LLDCDRR..S
  38
  39
  40 CATL_HUMAN      EGCNGGLMDY AFQYVQDNGG LDSEESYPYE ATEESCKYNP KYSVANDTGF
  41 CATL_RAT        QGCNGGLMDF AFQYIKENGG LDSEESYPYE AKDGSCKYRA EYAVANDTGF
  42 CATH_RAT        HGCQGGLPSQ AFEYILYNKG IMGEDSYPYI GKNGQCKFNP EKAVAFVKNV
  43 PAPA_CARPA      YGCNGGYPWS ALQLVAQYG. IHYRNTYPYE GVQRYCRSRE KGPYAAKTDG
  44
  45
  46 CATL_HUMAN      VDIPK.QEKA LMKAVATVGP ISVAIDAGHE SFLFYKEGIY FEPDCSS..E
  47 CATL_RAT        VDIPQ.QEKA LMKAVATVGP ISVAMDASHP SLQFYSSGIY YEPNCSS..K
  48 CATH_RAT        VNITLNDEAA MVEAVALYNP VSFAFEVT.E DFMMYKSGVY SSNSCHKTPD
  49 PAPA_CARPA      VRQVQPYNEG ALLYSIANQP VSVVLEAAGK DFQLYRGGIF VGP.CGN...
  50
  51
  52 CATL_HUMAN      DMDHGVLVVG YGFESTESDN NKYWLVKNSW GEEWGMGGYV KMAKDRR...
  53 CATL_RAT        DLDHGVLVVG YGYEGTDSNK DKYWLVKNSW GKEWGMDGYI KIAKDRN...
  54 CATH_RAT        KVNHAVLAVG YG....EQNG LLYWIVKNSW GSNWGNNGYF LIERGK....
  55 PAPA_CARPA      KVDHAVAAVG YG........ PNYILIKNSW GTGWGENGYI RIKRGTGNSY
  56
  57
  58 CATL_HUMAN      NHCGIASAAS YPTV..
  59 CATL_RAT        NHCGLATAAS YPIVN.
  60 CATH_RAT        NMCGLAACAS YPIPQV
  61 PAPA_CARPA      GVCGLYTSSF YPVKN.
  62