| blob | 0d483534e9ea9c83df597088ffc0c5020a0c0e56 |
1 ID AE000001;
2 FT CDS 202..1557
3 FT /M1_GAS_orthologue="SPy0002"
4 FT /MGAS10394_orthologue="M6_Spy0001"
5 FT /MGAS315_orthologue="dnaA"
6 FT /MGAS8232_orthologue="dnaA"
7 FT /SSI_1_orthologue="SPs0001"
8 FT /cds_id="subject0"
9 FT /cds_id="subject0"
10 FT /class="1.2.1"
11 FT /colour=2
12 FT /fasta_file="fasta/SP_new.tab.seq.00001.out"
13 FT /gene="dnaA"
14 FT /gene="dnaH"
15 FT /product="chromosomal replication initiator protein"
16 FT /systematic_id="SpyM50001"
17 FT misc_feature 535..1488
18 FT /colour=9
19 FT /domain="HMMPfam:PF00308;Bacterial dnaA
20 FT protein;1.7e-156;codon 112-429"
21 FT /id="SpyM50001"
22 FT /label=HMMPfam
23 FT /note="HMMPfam hit to PF00308, Bacterial dnaA protein,
24 FT score 1.7e-156"
25 FT misc_feature 655..678
26 FT /colour=8
27 FT /note="PS00017 ATP/GTP-binding site motif A (P-loop)."
28 FT misc_feature 1429..1488
29 FT /colour=8
30 FT /note="PS01008 DnaA protein signature."
31 SQ Sequence 1841271 BP; 564546 A; 354645 C; 356610 G; 565470 T; 0 other;
32 ttgttgatat tctgtttttt cttttttagt tttccacata aaaaatagtt gaaaacaata 60
33 gcggtgtcac cttaaaatgg cttttccaca ggttgtggag aacccaaatt aacagtgtta 120
34 atttattttc cacaggttgt ggaaaactag aatagtttat ggtagaatag ttctagaatt 180
35 atccacaaga aggaacctag tatgactgaa aatgaacaaa ttttttggaa cagggtcttg 240
36 gaattagctc agagtcaatt aaaacaggca acttatgaat tttttgttca tgatgcccgt 300
37 ctattaaagg tcgataagca tattgcaact atttacttag atcaaatgaa agaactcttt 360
38 tgggaaaaaa atcttaaaga tgttattctt actgctggtt ttgaagttta taacgctcaa 420
39 atttctgttg actatgtttt cgaagaagac ctaatgattg agcaaaatca gaccaaaatc 480
40 aatcaaaaac ctaagcagca agccttaaat tctttgccta ctgttacttc agatttaaac 540
41 tcgaaatata gttttgaaaa ctttattcaa ggagatgaaa atcgttgggc tgttgctgct 600
42 tcaatagcag tagctaatac tcctggaact acctataatc ctttgtttat ttggggtggc 660
43 cctgggcttg gaaaaaccca tttattaaat gctattggta attctgtact attagaaaat 720
44 ccaaatgctc gaattaaata tatcacagct gaaaacttta ttaatgagtt tgttatccat 780
45 attcgccttg ataccatgga tgaattgaaa gaaaaatttc gtaatttaga tttactcctt 840
46 attgatgata tccaatcttt agctaaaaaa acgctctctg gaacacaaga agagttcttt 900
47 aatactttta atgcacttca taataataac aaacaaattg tcctaacaag cgaccgtaca 960
48 ccagatcatc tcaatgattt agaagatcga ttagttactc gttttaaatg gggattaaca 1020
49 gtcaatatca cacctcctga ttttgaaaca cgagtggcta ttttgacaaa taaaattcaa 1080
50 gaatataact ttatttttcc tcaagatacc attgagtatt tggctggtca atttgattct 1140
51 aatgtcagag atttagaagg tgccttaaaa gatattagtc tggttgctaa tttcaaacaa 1200
52 attgacacga ttactgttga cattgctgcc gaagctattc gcgccagaaa gcaagatgga 1260
53 cctaaaatga cagttattcc catcgaagaa attcaagcgc aagttggaaa attttacggt 1320
54 gttaccgtca aagaaattaa agctactaaa cgaacacaaa atattgtttt agcaagacaa 1380
55 gtagctatgt ttttagcacg tgaaatgaca gataacagtc ttcctaaaat tggaaaagaa 1440
56 tttggtggca gagaccattc aacagtactc catgcctata ataaaatcaa aaacatgatc 1500
57 agccaggacg aaagccttag gatcgaaatt gaaaccataa aaaacaaaat taaataacat 1560
58 gtggaaaaga atatctttta tgaaatagtt atccacaagt tgtgaacaac catttagtct 1620
59 tggattctct cgtttattta gagttatcca ctatatacac aagacctact actactactt 1680
60 attattatac ttattaaata aaggagttct catgattcaa ttttcaatta atcgcacatt 1740
61 atttattcat gctttaaatg caactaaacg tgctattagc actaaaaatg ccattcctat 1800
62 tctttcatca ataaaaattg aagtcactcc tacaggagta actttaacag ggtctaacgg 1860
63 tcaaatatca attgaaaaca ctattcctgt aagtaatgaa aatgctggtt tgctaattac 1920
64 ctctccagga gctattttat tagaagctag tttttttatt aatattattt caagtttgcc 1980
65 agatattagt ataaatgtta aagaaattga acaacaccaa gttgttttaa ccagtggtaa 2040
66 atcagagatt accttaaaag gaaaagatgt tgaccagtat cctcgtctac aagaagtatc 2100
67 aacagaaaat cctttgattt taaaaacaaa attattgaag tctattattg ctgaaacagc 2160
68 ttttgcagcc agtttacaag aaagtcgtcc tattttaaca ggagttcata ttgtattaag 2220
69 taatcataaa gattttaaag cagtagcgac tgactctcat cgtatgagcc aacgtttaat 2280
70 cactttggac aatacttcag cagattttga tgtggttatt ccaagtaaat ctttgagaga 2340
71 attttcagca gtatttacag atgatattga gaccgttgag gtatttttct caccaagcca 2400
72 aatcttgttc agaagtgaac acatttcttt ttatacacgc ctcttagaag gaaattatcc 2460
73 cgatacagac cgtttattaa tgacagaatt tgagacggag gttgttttca atacccaatc 2520
74 ccttcgccac gctatggaac gtgccttctt gatttctaat gctactcaaa atggtactgt 2580
75 taagcttgag attactcaaa atcatatttc agctcatgtt aactcacctg aggttggtaa 2640
76 ggtaaacgag gatttagata ttgttagtca gtctggtagt gatttaacta tcagcttcaa 2700
77 tccaacttac cttattgagt ctttaaaagc tattaaaagt gaaacagtaa aaattcattt 2760
78 cttatcacca gttcgaccat tcaccctaac accaggcgat gaggaagaaa gttttatcca 2820
79 attaattaca ccagtacgaa caaactaagt aagaaaaagc tcccttttag gagttttttt 2880
80 gttattataa atattaacga taatataagt ggagaaaagt gaatgtatca aattggatca 2940
81 tttgttgaaa tgaaaaaacc tcatgcttgt gtaattaaag aaactggtaa aaaggctaat 3000
82 caatggaagg tactgagagt aggagctgat attaaaattc agtgtactaa ctgtcagcat 3060
83 gtgattatga tgagtcgtta tgattttgag cgaaaattaa aaaaagtact gcaaccatga 3120
84 aagtcctttt aaataaataa ttctagctat atttgcaacc aatactttcc taaaaaattg 3180
85 ttagtatgcc gttggaaaat tagctattct aacgttatcg aaagaagaaa ggtggctatt 3240
86 gacaatgacg aaagttgtag cacagttact tagtttctcg gcaaactata tcaaaatgag 3300
87 aataatacac caaactttga taatttaaat gaaggtgaaa gagtggcata atgataagca 3360
88 aatctgaaat tttcttctta ttcataccgc tttttcttct attttttggt ataataatct 3420
89 tgattgaaat ttgaatggag attcgctaaa tggctttaac agcaggtatt gtaggcttac 3480
90 caaatgttgg taaatcaacc ttatttaacg caattacaaa agcaggagca gaagctgcta 3540
91 attatccttt tgcgactatt gatcccaatg ttggtatggt agaggttcca gatgagcgtc 3600
92 tgcaaaaatt gacagaattg attacaccta aaaaaacagt tccgacaacc tttgaattta 3660
93 ctgatattgc aggtatcgtt aaaggtgctt ctagagggga aggtctagga aataaatttt 3720
94 tagctaatat tcgtgaagtc gatgctattg ttcatgtggt acgtgctttt gatgatgaaa 3780
95 atgtcatgcg tgaacaaggt cgtgaggatg ctttcgttga tcctatagca gatattgaca 3840
96 ctattaatct tgaattaatc ttagctgatt tagagtcaat caataaacgt tatgcgcgtg 3900
97 ttgaaaaaat ggcacgaact caaaaagata aagaatcagt agcagagttc aatgttttac 3960
98 aaaagattaa acctgttttg gaagatggga aatcagctag gacaattgag tttacagaag 4020
99 aggaagcaaa agttgttaaa ggtctctttt tattaacaac taaacctgtt ttatatgtag 4080
100 ctaatgtcga tgaagataaa gttgctaatc cagatggtat tgattatgtc aaacaaattc 4140
101 gtgactttgc agctactgaa aatgctgaag tagttgttat ctcagcgcgt gcagaagaag 4200
102 aaatttcaga gcttgacgat gaggataaag aagaattttt ggaagctatc ggtcttactg 4260
103 aatcaggcgt tgataaatta accagagcag cttatcatct cttaggcctt ggaacctatt 4320
104 ttacagcagg tgaaaaagag gttcgtgctt ggacgtttaa gcgtggtata aaagctccac 4380
105 aagctgctgg tattatccat tcagattttg aaagaggttt tattcgtgca gtaaccatgt 4440
106 cttatgatga tctaatgatc tacggttcag aaaaagccgt caaagaagct ggacgcttgc 4500
107 gtgaagaagg aaaagaatac gttgttcaag atggggacat catggaattc agatttaatg 4560
108 tgtaattata ttaaaacaat atcagaaggt tggaagaaca ttccagccct tttggcattt 4620
109 tagaaagaga aaatatggta aaaatgattg ttggtctggg aaatccaggc tctaaatatg 4680
110 aaaaaacaaa gcacaatatt ggttttatgg ctattgacaa tattgtcaag aaccttgacg 4740
111 ttacctttac agatgataaa aattttaaag cacagatagg aagtactttt attaatcatg 4800
112 aaaaagttta ctttgtgaaa cctactactt ttatgaataa tagcggcata gcagtaaaag 4860
113 cattactaac ctactataat attgacataa cagatttaat tgttatctat gatgatttag 4920
114 acatggaagt cagtaaatta cgtttacgta gtaagggttc agcaggagga cataatggca 4980
115 ttaagtcaat cattgcccac attggaactc aggaatttaa ccgaatcaaa gttggtattg 5040
116 gacgaccttt aaaaggtatg actgttatta gccatgtgat gggccaattc aataccgaag 5100
117 ataatattgc tatttcgtta actcttgaca gagttgtcaa tgctgtcaag ttttatttac 5160
118 aagaaaatga ttttgaaaaa acaatgcaga aatttaatgg ataatcatgg atattttaga 5220
119 attatttagt cagaataaga aagtccaatc ctggcactct ggattaacca ccttaggaag 5280
120 acaactggta atggggttat cgggttcaag taaagcattg gctatagctt ccgcttattt 5340
121 agatgatcaa aaaaaaatag ttgtggttac atcaactcaa aatgaggttg aaaaattagc 5400
122 cagcgattta tctagtttac ttgatgaaga acttgttttc caattttttg cagacgatgt 5460
123 ggctgcagcg gaatttatct ttgcgtcaat ggataaagct ctatcaagaa tagaaaccct 5520
124 gcaattttta aggaatccta aatctcaggg cgttttaatt gttagtttat caagcttaag 5580
125 aactttattg ccaaacccag atgtttttac aaagagtcag attcaactaa cagttggaga 5640
126 agattatgat agtgatactc ttactaaaca actgatgaca attggctatc agaaggtctc 5700
127 acaggtcatt agtccgggag aatttagccg tcgaggggat attttagata tctatgagat 5760
128 tacacaagaa ttgccttatc gattggaatt ttttggcgat gatattgata gtattaggca 5820
129 attttatcca gaaactcaaa aatcttttga acaactagaa ggtattttta ttaatccagc 5880
130 aagtgatctt atttttgagg ctagtgattt tcaacgtggc attgagcaat tagaaaaggc 5940
131 tctacaaaca gcacaagatg ataaaaaatc ttatttagaa gatgtattag ctgtttcaaa 6000
132 aaacggtttt aaacataagg atatccgtaa atttcaatca ttattttacg aaaaagagtg 6060
133 gtcattatta gattatattc ctaagggaac gccaatcttt tttgatgatt ttcaaaaact 6120
134 agttgataaa aatgcaagat ttgatttaga gattgctaat ctcttgacag aagatttaca 6180
135 gcaaggaaag gctctttcca atcttaacta ctttgcagat aattatcgag agcttaggca 6240
136 ctataagcca gcgaccttct tttcaaattt tcataaggga cttggaaata tcaaatttga 6300
137 tcagatgcat cagctaactc agtatgccat gcaggaattt tttaatcaat ttcctttgtt 6360
138 gattgatgag attaaacggt atcaaaaaaa tcaaacaacg gttattgtac aggtagagtc 6420
139 tcagtatgct tacgaacgac ttgaaaaatc ttttcaagat taccaatttc gccttccttt 6480
140 agtgagtgct aatcaaattg tttcacgtga atcacaaatt gtaattggag ctatctccag 6540
141 tggtttttat tttgctgatg aaaagttagc gttaatcaca gagcatgaaa tttatcataa 6600
142 aaagatcaaa cgacgcgcta gacgatctaa tattagcaat gctgagcgtt tgaaagatta 6660
143 caatgagtta gcagtaggtg attacgtggt tcataatgtc catggtatcg gtcgctttct 6720
144 tggaattgaa acgattcagg ttcagggaat ccatcgagat tacgttacta ttcaatatca 6780
145 aaattcagac cgtatttctc ttccaattga ccaaattggt agcttatcaa agtacgtttc 6840
146 tgctgatgga aaagaaccta aaattaataa actcaatgat ggtcgttttc aaaagacaaa 6900
147 gcaaaaggtc gctagacaag tagaagatat tgctgatgac cttctaaaat tatatgctga 6960
148 aagaagtcag caaaaaggat tttcattttc accagatgat gacttgcagc gcgcttttga 7020
149 tgatgatttt gcttttgtag aaacagaaga tcaacttagg tctataaagg aaattaaagc 7080
150 tgatatggag agcatgcaac ctatggatcg tcttttagta ggcgatgtag gatttggtaa 7140
151 gacagaagta gctatgaggg cagcctttaa agcggtgaat gatcacaaac aagtagctgt 7200
152 cttagttcca accacagtct tggcccagca gcattatgaa aacttcaaag cacgctttga 7260
153 aaattacctt gttgaggttg acgtcttaag tcgtttccgt agtaaaaaag agcaagctga 7320
154 aacactagaa catgtacaaa aaggtcaaat tgacattatt atcggaaccc atcgactcct 7380
155 atcaaaagat gtggtctttt ctgatttagg attaattgtg attgatgagg aacaacggtt 7440
156 tggtgttaag cataaagaaa ctttaaagga attaaaaact aaggttgacg tcttaacctt 7500
157 aacagctact ccgattccta gaaccttaca catgtctatg ttaggtatcc gagatttatc 7560
158 ggttattgag accccaccaa ccaatcgtta tcctgttcaa acctatgttt tggaaaataa 7620
159 tccaggtctc gttagagaag ctatcattcg tgaaatggat cgtggaggac aaatttttta 7680
160 cgtttacaat aaagttgaca ctattgaaaa gaaagttgca gagctacaag aattagtccc 7740
161 agaagcttct atcggttttg ttcatgggca aatgagtgaa attcaacttg aaaatacctt 7800
162 gattgacttt ataaatggtg attatgatgt ccttgtggct acaacaatca tcgaaacagg 7860
163 agttgacatt tctaatgtaa acactttgtt tattgagaat gctgatcata tgggattgtc 7920
164 aactttatat caactgaggg ggcgcgtcgg aagaagtaat cgtattgcct atgcttacct 7980
165 gatgtatcgt cctgataaga tcctaacaga agtctctgaa aaacgtttag aggctattaa 8040
166 aggctttact gaattaggtt caggcttcaa gattgctatg cgagatttgt ctatacgagg 8100
167 agcaggtaat attttaggag cttctcaaag tggctttatt gattcggtcg gttttgaaat 8160
168 gtattctcag ttattggaac aggctattgc tagcaagcaa ggaaaaacga ctgttcgcca 8220
169 aaaaggtaat actgaaatca atcttcagat tgatgcttat ttaccagatg attatattgc 8280
170 agatgagcgc caaaaaattg acatttacaa gcgtattcga gaaattcaat caagagaaga 8340
171 ttatctcaat ttgcaagatg agctgataga tcgttttgga gagtatcctg atcaagttgc 8400
172 ctatttgtta gagatagctc tgctaaaaca ttatatggac aatgcctttg cggaattagt 8460
173 tgaacgcaaa aataatcagg tcattgttcg atttgaagta acttctttaa gttatttctt 8520
174 gactcaggat tatttcgaag ccttatctaa aacccatctt aaagctaaaa ttagtgaaca 8580
175 tcaggggaaa atcgatatcg tctttgacgt tcgccatcaa aaagattata gaattttaga 8640
176 agaattgatg ttatttggag aaaggcttag tgagataaaa atcagaaaaa acaattcagt 8700
177 ttttaaataa taatttgaaa caacttttag actgaatagt attaatgaca atggaacgaa 8760
178 ctagctcttt atacttttgt caaaaatcta agatctttgc tgcgaaatta ggatcttttc 8820
179 taccatttaa aaaataaaaa tgataaaatg aagaggattg taggagaaat tatgagacta 8880
180 gataaatatc taaaggtatc gcgccttatt aaacgtcgtt cagtagcaaa agaagttgcg 8940
181 gataagggac gaattaaagt taatgggata cttgctaaaa gttcaacgaa tgtaaaacta 9000
182 aatgatcaca ttgaaattag ttttggaaat aaattactga cagtaagagt cattgaaata 9060
183 aaagatagta caaaaaaaga agatgctctt aagatgtatg agataatcag tgaaacaagg 9120
184 ataacattaa atgaagaagc ctagtattgt tcaattaaat aatcattata ttaagaaaga 9180
185 gaatctcaaa aaaaaatttg aagaagaaga atctcaaaaa agaaatcgtt ttatgggatg 9240
186 gatccttgta agtatgatgt ttttatttat tttgccaact tataatcttg tcaaaagtta 9300
187 tgttgatttt gaaaagcaaa atcaacaggt ggttaaatta aaaaaagagt ataatgaatt 9360
188 gtcaaagagt acaaaaaaag aaaaacaatt agcagaacga ctaaaagatg ataattttgt 9420
189 caaaaaatat gctagggcaa aatactattt atcgcgtgaa ggagaaatga tttatcctat 9480
190 tccaggacta ttaccaaaat gatgatggac aatattataa aaaaaataga agcatttctt 9540
191 gctttttctg ataaaaaatt agcagagctg caacaggaaa atcaaaaagt taaagaagaa 9600