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1 LOCUS       AAEL01000195           13065 bp    DNA     linear   INV 27-OCT-2004
2 DEFINITION  Cryptosporidium hominis strain TU502 chromosome 2 CHRO012040, whole
3             genome shotgun sequence.
4 ACCESSION   AAEL01000195 AAEL01000000
5 VERSION     AAEL01000195.1  GI:54657549
6 KEYWORDS    WGS.
7 SOURCE      Cryptosporidium hominis
8   ORGANISM  Cryptosporidium hominis
9             Eukaryota; Alveolata; Apicomplexa; Coccidia; Eimeriida;
10             Cryptosporidiidae; Cryptosporidium.
11 REFERENCE   1  (bases 1 to 13065)
12   AUTHORS   Xu,P., Widmer,G., Wang,Y., Ozaki,L.S., Alves,J.M., Serrano,M.G.,
13             Puiu,D., Manque,P., Akiyoshi,D., Mackey,A.J., Pearson,W.R.,
14             Dear,P.H., Bankier,A.T., Peterson,D.L., Abrahamsen,M.S., Kapur,V.,
15             Tzipori,S. and Buck,G.A.
16   TITLE     The genome of Cryptosporidium hominis
17   JOURNAL   Nature 431, 1107-1112 (2004)
18 REFERENCE   2  (bases 1 to 13065)
19   AUTHORS   Xu,P., Widmer,G., Wang,Y., Ozaki,L.S., Alves,J.M., Serrano,M.G.,
20             Puiu,D., Manque,P., Akiyoshi,D., Mackey,A.J., Pearson,W.R.,
21             Dear,P.H., Bankier,A.T., Peterson,D.L., Abrahamsen,M.S., Kapur,V.,
22             Tzipori,S. and Buck,G.A.
23   TITLE     Direct Submission
24   JOURNAL   Submitted (08-JUN-2004) Center for the Study of Biological
25             Complexity, Virginia Commonwealth University, Trani Center for Life
26             Sciences, 1000 W Cary St, Richmond, VA 23298, USA
27 FEATURES             Location/Qualifiers
28      source          1..13065
29                      /organism="Cryptosporidium hominis"
30                      /mol_type="genomic DNA"
31                      /strain="TU502"
32                      /db_xref="taxon:237895"
33                      /chromosome="2"
34      gene            complement(334..2082)
35                      /locus_tag="Chro.rrn021"
36      rRNA            complement(join(334..1392,1456..2082))
37                      /locus_tag="Chro.rrn021"
38                      /product="18S ribosomal RNA"
39 ORIGIN      
40         1 attatgttgt tagagggcgc agaagcacac ancccgacgg accgcgcacg aagggccacc
41        61 ccggacggcg aaccagccga cgcgcgccac agagcaaaga gaggggacca gaggggagcg
42       121 gatggagaca tcccgaagac cgcaatagga gaccacactg agagagcggg ggcaatccgc
43       181 atgcgcgacc tataggtaca cgacgtaaat cttatattat aaataacaaa attaaatttt
44       241 ctttttgttc atgttcattt aatttttaaa tgacatatat atataatata atataatata
45       301 atataatata tcaaaaactc atttctcaaa taagaatgat ccttccgcag gttcacctac
46       361 ggaaaccttg ttacgacttc tccttcctct aaatgataag gtttacgaaa ctttccttac
47       421 atgtattgct acaaagtatg gtccgaataa ttcaccggat cattcaatcg gtaggagcga
48       481 cgggcggtgt gtacaaaggg cagggacgta atcagcgcaa gctgatgact tgcgcttact
49       541 aggaattcct cgttcaagat caataattgc aatgatctat ccccatcacg atgcatattc
50       601 aaaagattac ccatttcctt cgaaacagga atatatactt gatggatgca tcagtgtagc
51       661 gcgcgcgcgg cccaggacat ctaagggcat cacagacctg ttattgccta aaacttccct
52       721 gtattaaaca tacaaagtcc ctctaagaag acagataaaa aatataatat ttcttatgtc
53       781 tatttagcag gttaaggtct cgttcgttaa cggaattaac cagacaaatc actccaccaa
54       841 ctaagaacgg ccatgcacca ccacccatag aatcaagaaa gagctatcaa tctgtcaatc
55       901 cttcctatgt ctggacctgg tgagttttcc cgtgttgagt caaattaagc cgcaggctcc
56       961 actcctggtg gtgcccttcc gtcaattcct ttaagtttca gccttgcgac catactcccc
57      1021 ccagaaccca aagactttga tttctcataa ggtgctgaag gagtaaggaa caacctccaa
58      1081 tctctagttg gcatagttta tggttaagac tacgacggta tctgatcgtc ttcgatcccc
59      1141 taactttcgt tcttgattaa tgaaaacatc cttggcaaat gctttcgcat tagtctgtct
60      1201 ttaacaaatc taagaatttc acctctgact gttaaataca aatgccccca actgtcccta
61      1261 ttaatcatta ttcttatctt agaaccaata agaaagataa aaatctttaa tattattcca
62      1321 tgctggagta ttcaaggcat atgcctgctt taagcactct aattttctca aagtaaaatt
63      1381 tcatatacta aaaaaaatag taatatgaat tatgttaata ttatataaat attcatcaaa
64      1441 atattttata taaattatta acagaaatcc aactacgagc tttttaactg caacaacttt
65      1501 aatatacgct attggagctg gaattaccgc ggctgctggc accagacttg ccctccaatt
66      1561 gatacttgta aaggggttta tacttaactc attccaatta caaaaccaaa aagtcctgta
67      1621 ttgttatttc ttgtcactac ctccctgtat taggattggg taatttgcgc gcctgctgcc
68      1681 ttccttagat gtggtagccg tttctcaggc tccctctccg gaatcgaacc ctaattcccc
69      1741 gttacccgtc attgccacgg taggccaata ccctaccgtc taaagctgat aggtcagaaa
70      1801 cttgaatgat atgtcacatt aattgtgatc cgtaaagtta ttatgagtca ccaatcatat
71      1861 tggttcttta tctaataaat acaacccttc cataaagtcg agttttttcg catgtattag
72      1921 ctctagaatt accacggtta tccatgtaag taaagattat caagtaaact ataactgtta
73      1981 taatgagcca ttcgcagttt aaccgtataa aagtttatac ttagacatgc atggcttaat
74      2041 ctttgagaca agcatatgac tactggcagg atcaaccagg ttactatcat taatattaat
75      2101 aatattttct ctttttattt tgtcctcatg aagtaaaaaa caaaaaaaaa aaatattatc
76      2161 aacattgaat acatattttg tctatcattt ataataaaca aaagaatcat caagaaatta
77      2221 ttaatgatta ttatacatac atcacataca tatatagacc atatatatat aagactgtat
78      2281 aaatatcaca agaacttctc atccagttaa attaataaga aatatcattg acttaactgg
79      2341 caatttaaga tagtattgaa accacattgt aaaatacccc acaaccttga atccaatagt
80      2401 actaataagt actctttaaa caacagtggt tacggaatat tccaacaccg tacgctccaa
81      2461 aacaccatta tatatactct caaattgact tagttatttt tacttcccaa tataaataac
82      2521 atataattaa tcataataaa accaattata cactatccat tgaaagtaat caacacatca
83      2581 aagaaaatat attaacaatg tagagtcata cattgatact tatcacatgt aactctttgg
84      2641 aaaccataat aatacaacaa cctcttgtac ttaacattcg tgtatctgtc aatccgacaa
85      2701 catgctatca aattgaccac actaaataca ccgcgcatac aatcgaaaca caatttcaat
86      2761 cgtaagacgt gcgcatttac ccgcaactca tatatacatt ttaccagtac taatcaattc
87      2821 acagcctttt cagatcgaaa tagactacga gttcttaata ctcaatgtca gcccattact
88      2881 aacacgccaa ttcccacatc cccaggttga atactcttca ccccggaaaa aaaatttacc
89      2941 gctatttttg aataaatttt ctattacaga actgtttcag agctgttcta aagaagctag
90      3001 gtaatacaaa taaataaaag ctaaacttaa tatctctatt atttatttct aatagttctc
91      3061 aataacgcta atttatttac atgaaaaata tctaattcta ccccttatta atttatttca
92      3121 ttccagatgt aatatttcta gttgtccttc taatatgcct taatatgcta gtaatatcac
93      3181 tgatgatcga cccatccgtg aagcatgcag gtacaatata gttcatgctt ttacttacat
94      3241 cgctaaccga atttataatg ctaatgcatt tgttcatgct ttctgaaatt tcatttagta
95      3301 tttgcattac gtcactaggt gtaagagtat cagtaaatgg ttcgaaacag tgaatggttt
96      3361 cttttatcca taatattctc aattttaaat ctgaaataca gttaatttga gaaaaattac
97      3421 cgctggtctt taaagactca attaaatgag gaagagtatc actcaaaatt tttgaaattc
98      3481 ctaatattac tggatggcta ataggaagtg gatcatccaa ccaaacgcat gggtcaaact
99      3541 tatatgcaag gctcaaaaca aaacattctc cacttgggat ttccctctta tctgactgag
100      3601 atagagtaga ttgatcggca gaaattgcta tcgcaaatgc gcgatcgtaa tgtttttgtt
101      3661 ttaaggcatc atcaatttgc aaagctatgt tttgggcgct cttatttgca attgagttgt
102      3721 ctggtgtaag agcttttagt ggtattccat tactgatctg taattccaaa cgattaacag
103      3781 ttgtttgcaa ttgagtaact gcactagtta atgtcccaaa tgaatctgct actacttgag
104      3841 taaagttgtc tattggattc gagctaatgt tatcgcattg tttatttaat ttagtcactt
105      3901 tttcacgaac gcttctagat tcgccaacaa gcctcgaaat gcaagtgtca atacttgtta
106      3961 atttctcatt tgtacttgta aaaagttcct taacatttgt ttcaatttta gaaatttcat
107      4021 tgatattgac ataattatca acagacttct cgattcctga caaatgcgac ttaatagatt
108      4081 gaatatcacg ttcgatcggt tctaaatact tgctaattgc tgaggaaacc gaatcattta
109      4141 actctttgga caagctgaag gtcaattttt ttaattcatc tgtaatcatt tcaaatattt
110      4201 tatcatttaa accaaaatct ttgtggttgg tattgcttgt attcgtattt ttcgattgtg
111      4261 gattgctcat tgactgtttt tcctccatat ttaatgtact aaaaatagat gtaagtaaat
112      4321 ttgatctatc agatggtaat ttattctgag gtgtattatt gtattgaaaa tcgcttttct
113      4381 cagttttatg tgatgcattt gccatcaaaa cagcataata atcatcagca atctcgtcat
114      4441 tcgtgtcaat attagttttt ttctgattag acaagtttat agtaaatgtg tcactaggta
115      4501 tactgatatt ttcggatgaa taatgggctt tattcgcact caaatctaaa acaggtggga
116      4561 taatgattga ttcgagccct ccaaaaatat ttgaaacaaa aacttcgatg ggttgttttg
117      4621 ataaattttc acttgattta gtttttccag catcaagcca ggtaacattt tttggaggtc
118      4681 tgaaagcagc cgtctctaat agtctagagg ggaagaaaaa caaatcttta atgggtagct
119      4741 cttcgccaac agagcaaacg attaattggt taaaaatctg tattgcgaaa tactcacccc
120      4801 aatttggtcc aataatatga gcattaaatt ggttattttt attatcatcc ataatatgaa
121      4861 tatttatgct ctgtaaaagt gtaatttcgc caaagttatt gtttgaatct atcggtaagt
122      4921 tatatatgcg aacagtatag atatcttttt ctactgataa taatgtagct gttacattca
123      4981 tgtggttaat ggtaggatct ctgattctta tattcggata tactgcagta tcaagtagta
124      5041 atgaatttga atcgataatt tgccttgaca ttatcgatct atagtactct ccagggctta
125      5101 aatttgagga aaaagtatca taatagccat ttgaagtaaa aagaattatt agttctccaa
126      5161 taaattggca actagaaatt ttaacatcat ccgggtagtt aatcagtacg caacatgata
127      5221 aattagcagc tgaatgctgg ggagcattgg acttgttgga gttagaacat tcttgtagaa
128      5281 tgtggtattc atatgaagaa cgattccata gacacactga gcatttattc caagcaacaa
129      5341 aacaacgatc atctaaatgg ttaaatacaa cagatttcca atgggtattt ccccttacca
130      5401 aagtattaat agtgtctgat tgaatattta ctattgaaag ttccttccct ttaatataaa
131      5461 caatattatt cgacaccttt gaaagcgaaa aactttccat tccaagccct gataatttac
132      5521 tgctgcattt agatccattg tttagttctt cttggctatt aataccagaa tctaacatga
133      5581 taactcttgg aacatcagaa aacatatgga caacatattc tctattacat tgtagtatag
134      5641 aggctgcttg agatgtagaa gcattgtgag acgatggtat cttaatatct aaagatgaac
135      5701 cagaaacatg gtaccactgc cttttcggta gttcaatcaa ctccatgatg attattaatc
136      5761 tgcaaccaaa taaatagtaa attttttttt taccaaattg cgccataaat ttctcggaat
137      5821 aattaaacta agagggaaaa atattcgttt gaaaaataaa atcttatcat tcacctaatc
138      5881 atgttcagaa actaataagt agaatctggc tttcctagac tatcaagact acctttcata
139      5941 taaaacattg tctctgggag gttatccatt tcaccgctga caatagcatt aaaaccttta
140      6001 attgtatcaa ttaagttgac aaaaacccct ggctttccgg taaaagcttc cgacataaaa
141      6061 aacggttgag taagaaactt ttggactttt cttgccctgg agacaatcaa cctttcctct
142      6121 tcagaaagtg catgagaacc ttgagtagaa attttgctct gtaactgctt atacttttgt
143      6181 aaaatcgaaa gaacttcaat agaaactttg tagtgctctt cgcctataat atttcgatct
144      6241 aaaaccttag acctactttc caatggatca atggatggga atatcccaac ctcggacatc
145      6301 tttctagaga gaactattgt agaatcgagg tgggtgaaag ctgcaacagg tgctggatca
146      6361 ttaatgtcgt cagatggaat ataaagtgcc tgaatagatg ttattgaacc atttctcgtg
147      6421 gttgtgattc tttcttgaag tttaccaaga tcagtagcca gagtaggttg atacccgatt
148      6481 tcagttggta atagccctag aaaaagtcat taaaaaaaaa aataaaaaat aacccatcag
149      6541 tcggtaattc cagctatttt ccagttgttt cagcattgaa actcagataa atatggaaag
150      6601 tttgcatcat ttgggaaaat tacactaaat atttacttac ctaaaagtgc agaaacttca
151      6661 ctccctgcct gagtaaatcg gtaaatatta tctacgaaaa ataatacgtc ttgcatcatt
152      6721 gaatctctaa aatattctgc cattgttaga cctgtaagtg caactcgcgc tcgcgctcct
153      6781 ggagtttcat tcatttgacc atataccagc gctgtcttag aacctaaaaa atcgtatatg
154      6841 ggttgtctct tatgcttgct gtcaactcgt gatccaacaa tcgacttttt attgacgcca
155      6901 tttgctagca tttcattata taaatcgtac ccttccctga tgcgctctcc aacccctgta
156      6961 tagacagagt aaccaccata cttttttgca atattgttta ttagttccat gataagaaca
157      7021 gtcttgccaa cccccgctcc accaaatagt cctattttcc caccttttat gaatggtgta
158      7081 agtagatcta ttgccttaat cccagtaaca attaatgaag gctccattac ttgttccatg
159      7141 tattcagggg ccgttctatg aatcggtttt ttaactttag cgtcgatctc tccacatccg
160      7201 tcaattgcat tccccataac attcaccatt ctaccaagtg tggccttgcc tactggaacg
161      7261 catattgggc ttccagtgtc tataactttc tctcctctag agagtccttc tgtaacatcc
162      7321 attgcaattg ccctaactga attatcactt aagtgttgcg ccacttcaag tactagtttg
163      7381 ttttgatgcc ctttaacttc caaagcgttt aacaattctg gtagtttacc ctcaaatttt
164      7441 acatctacaa ctgaacccat gatttgtgat atatagcctt ctgagagatt tttgctagtt
165      7501 ttactataag acttccatct tttgtttaag ttataatatt ctaggttgcg gatcgctttt
166      7561 ttctggaaaa ataccgaaaa tagtggtaaa aattctcttc gtgtgaattt gaagcatgga
167      7621 agagattgac ttaacaattt tcctcgaatc ataaacattg cctccactct ttaattaaaa
168      7681 ttaaaaagta attgtgcaaa attgcattaa agccaaattc tatgcaattt aatttttgcg
169      7741 tataaacaac ataacaaaaa taggaaatat attctgaaaa tcgatatcca atgtttacta
170      7801 aggaactgag tgtatttaat agcaggaagg caaaatagca gaagttaaat ataaaaaaaa
171      7861 tacaaaaata gagaaatttt caaagcagga ataagtagtg aacaattttg atgagtgaga
172      7921 tgaaagtgtt aagagaatta taattaccat tcaaaataga atataattat cttaagtact
173      7981 aaaacagatt tagagcgggt gttaaacaaa atcaaattgc tgtgggtggg gggaaatgtt
174      8041 attgcaagag taattttcca aatagttgag ttaatttacg ttgtaatacc aatgtcatct
175      8101 gaggaaggca ccgataattg gtctgcagag gaggctgtag agagcgtaaa gactctgagt
176      8161 gttagtgagc ttcagtctag gattcgcctt ttagatggtg aaattcgact tatgaaaagc
177      8221 gaaagtaatc gtcttaagca tgaattaaac cagatgaatg aaagaatcag aagtaatact
178      8281 gaaaaaataa aacttaacaa acagcttcct tatctggttg ccaacattgt cgaatcactg
179      8341 gatttttcag atgaacagga aaatgagggt gaagggatgg aattcgatgg agacaaaaac
180      8401 gataaatgca tggtaataaa aacatcatca aggcagactg tctttctccc tgtcattggg
181      8461 ttggttccag agaatgaatt aaagcctgga gatcttgttg gagtgaataa ggatagttat
182      8521 ttgattcttg ataaattgcc accggagtat gactctagag ttaaggctat ggaagttgat
183      8581 gaaagaccaa tggaagagta ttcagatatt ggaggattag ataagcagat ccaggaatta
184      8641 gtggaggcaa tcgtccttcc gatgacccat aaagaaaggt ttgaaaaaat tggtataaaa
185      8701 cccccaaagg gtgtactaat gtatggacct ccaggcacag ggaaaactct tttggcaagg
186      8761 gcatgtgcag cacaaactaa agccacattt ttgaaattag caggcccgca actcgtacaa
187      8821 atgtttattg gtgatggtgc aaagatggtt agagatgcat ttgaaattgc acgtgaaaaa
188      8881 gctccttcaa taatatttat tgacgagctt gacgctatag gtatgaaaag gtttgatagt
189      8941 gagcatagtg gggatagaga ggtacaaagg actatgcttg agttacttaa tcaattagat
190      9001 ggatttagct cagacgacag agttaaagtt attgctgcaa cgaataggcc ggatactctc
191      9061 gatccagccc ttttaagatc aggtaggctt gaccgtaagg tcgagttacc gcatccaaac
192      9121 gaagaagcaa ggtccagaat acttcaaata catagcagaa aaatgaatgt tgatttaaat
193      9181 gacgtgaatt tccaagagct atcgagatca acagatgatt ttaacggtgc tcagcttaag
194      9241 gcagtttgtg tcgaagcggg gatgacagca ctcagaaggg gagcaacgat actttgccat
195      9301 gaagattatg tcgaagggat tgcagcagta ctagcaaaga agaaatcccc acttagctat
196      9361 ttttcataaa gcaagtgaaa tacaaaaaaa aacttaatca actaattgtt agaattctta
197      9421 aatatatata tatttatacc attagcaata atctttttct ttagccgaaa tatccttatt
198      9481 cttgccttcg tcaaatacct cttctccaaa atatgggtac tcttcccatt tgggatgttt
199      9541 atcaatgatt aaatgtttca tctcctgctc taatacttca aaaaatacat gttcgaagtg
200      9601 tttgtcgccc cattgaattg gaatgatgtt attttctctg tctagcaaca tccatgtggc
201      9661 gttttgagga gcaagcccga gtaaaagctg agttcgatag gcagtacttc tagacgctcc
202      9721 atttaaacag ctcttttgga agcttgaagg tgtaagttgt tcatttggac acgaatgaat
203      9781 atctgatttc tggctttgcg aagatttttg ctttctctta cgcgattccc accacttact
204      9841 tttaatagtt gaattatctg atgaaaattc agattcagaa tctgagattt gtgaattatc
205      9901 tgataattcg caatcatcaa taaaattgtc taccgtattt gtattctgac cctttttagg
206      9961 tgatttatta aaaactctag ctctgttagg tgcggaagaa gttgttgcta agtcaatatg
207     10021 aatattgcct aacctgtttg atgaaattaa tgcagttgca tcaaatgcgc gatagcaatg
208     10081 ttgaaggcta cgctgaatta gtagctcaat tgaagatgga atttccagat cttctctaca
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210     10201 gactgaaact ctcatgcttc ttaaacactc gcttctaatc aataactttc tttttaacct
211     10261 ctctgcatcc gcatctggat ccatatactt tattactctc aattcagacc tgctaaaggg
212     10321 tatcttcgaa tgtggccaat caaaccatac ccaatcaaat tgtgcaacat cgagaacatc
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247     12421 ttccaataga ctccttgtag tttttaaata aatctggatg agaatttcga gtagaaaagt
248     12481 gaatgatata gtcgccgaat gtatctttgc caaaaatagg tggcccttta ccctttaata
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257     13021 atttacaact agaattagtt ttaagtgttc tgcttgtccc attaa