t/data/rpsblast_no_hits.bls

   1 RPS-BLAST 2.2.18 [Mar-02-2008]
   2
   3 Database: CDD.v.2.13
   4            24,083 sequences; 5,982,884 total letters
   5
   6 Searching..................................................done
   7
   8 Query= lcl|YP_134044.1|Plus1 F 4437 4742 NC_006391 hypothetical
   9 protein {Haloarcula marismortui ATCC 43049}
  10          (101 letters)
  11
  12  ***** No hits found ******
  13
  14
  15 Query= lcl|YP_134045.1|Plus1 F 4742 5065 NC_006391 transcription
  16 regulator {Haloarcula marismortui ATCC 43049}
  17          (107 letters)
  18
  19  ***** No hits found ******
  20
  21
  22 Query= lcl|YP_134046.1|Plus1 F 5275 5808 NC_006391 hypothetical
  23 protein {Haloarcula marismortui ATCC 43049}
  24          (177 letters)
  25
  26  ***** No hits found ******
  27
  28
  29   Database: CDD.v.2.13
  30     Posted date:  Nov 8, 2007  6:30 PM
  31   Number of letters in database: 5,982,884
  32   Number of sequences in database:  24,083
  33
  34 Lambda     K      H
  35    0.308    0.126    0.352
  36
  37 Gapped
  38 Lambda     K      H
  39    0.267   0.0606    0.140
  40
  41
  42 Matrix: BLOSUM62
  43 Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
  44 Number of Sequences: 24083
  45 Number of Hits to DB: 200,397,591
  46 Number of extensions: 14170162
  47 Number of successful extensions: 17150
  48 Number of sequences better than 1.0e-005: 6
  49 Number of HSP's gapped: 17124
  50 Number of HSP's successfully gapped: 29
  51 Length of database: 5,982,884
  52 Neighboring words threshold: 11
  53 Window for multiple hits: 40
  54 X1: 15 ( 6.7 bits)
  55 X2: 38 (14.6 bits)
  56 X3: 64 (24.7 bits)
  57 S1: 40 (20.8 bits)
  58 S2: 102 (43.3 bits)