| blob | 21e16af251868c9da26892236d31850a83c68fe9 |
1 SignalP 3.0 Server - prediction results
2 Technical University of Denmark
8 Using neural networks (NN) and hidden Markov models (HMM) trained on Gram-negative bacteria
12 >my_fasta_id
16 SignalP-NN result:
19 >my_fasta_id length = 70
21 # pos aa C S Y
22 1 M 0.006 0.512 0.022
23 2 R 0.006 0.473 0.022
24 3 I 0.006 0.324 0.020
25 4 T 0.006 0.454 0.013
26 5 I 0.006 0.588 0.005
27 6 L 0.006 0.223 0.000
28 7 A 0.006 0.339 0.000
29 8 S 0.012 0.504 0.000
30 9 V 0.006 0.642 0.000
31 10 V 0.008 0.384 0.008
32 11 I 0.007 0.212 0.012
33 12 P 0.007 0.160 0.009
34 13 C 0.007 0.263 0.000
35 14 L 0.009 0.648 0.000
36 15 G 0.006 0.594 0.016
37 16 F 0.011 0.538 0.031
38 17 S 0.007 0.598 0.028
39 18 A 0.016 0.678 0.050
40 19 S 0.026 0.717 0.075
41 20 C 0.008 0.748 0.047
42 21 M 0.010 0.755 0.059
43 22 A 0.064 0.902 0.161
44 23 A 0.916 0.225 0.678
45 24 E 0.467 0.046 0.487
46 25 D 0.016 0.042 0.089
47 26 V 0.011 0.043 0.071
48 27 M 0.007 0.048 0.053
49 28 I 0.009 0.042 0.061
50 29 V 0.009 0.041 0.062
51 30 S 0.007 0.033 0.052
52 31 A 0.007 0.026 0.052
53 32 S 0.028 0.022 0.097
54 33 G 0.007 0.014 0.046
55 34 Y 0.043 0.010 0.107
56 35 E 0.008 0.018 0.042
57 36 K 0.011 0.031 0.046
58 37 K 0.009 0.008 0.036
59 38 L 0.009 0.015 0.029
60 39 T 0.006 0.017 0.015
61 40 N 0.006 0.012 0.013
62 41 A 0.006 0.013 0.013
63 42 A 0.008 0.004 0.014
64 43 A 0.007 0.001 0.013
65 44 S 0.007 0.000 0.012
66 45 V 0.006 0.001 0.010
67 46 S 0.006 0.000 0.009
68 47 V 0.006 0.000 0.008
69 48 I 0.006 0.000 0.008
70 49 N 0.008 0.000 0.008
71 50 Q 0.009 0.000 0.009
72 51 E 0.007 0.000 0.007
73 52 E 0.006 0.000 0.006
74 53 L 0.006 0.000 0.005
75 54 Q 0.007 0.000 0.005
76 55 S 0.006 0.000 0.004
77 56 S 0.007 0.000 0.003
78 57 Q 0.006 0.000 0.003
79 58 Y 0.006 0.000 0.001
80 59 H 0.007 0.000 0.001
81 60 D 0.007 0.000 0.001
82 61 L 0.007 0.000 0.001
83 62 A 0.007 0.000 0.001
84 63 E 0.008 0.000 0.001
85 64 A 0.006 0.000 0.001
86 65 L 0.008 0.000 0.001
87 66 R 0.006 0.000 0.001
88 67 S 0.006 0.000 0.001
89 68 V 0.006 0.000 0.001
90 69 E 0.006 0.000 0.001
91 70 G 0.007 0.000 0.001
94 >my_fasta_id length = 70
95 # Measure Position Value Cutoff signal peptide?
96 max. C 23 0.916 0.52 YES
97 max. Y 23 0.678 0.33 YES
98 max. S 22 0.902 0.92 NO
99 mean S 1-22 0.512 0.49 YES
100 D 1-22 0.595 0.44 YES
101 # Most likely cleavage site between pos. 22 and 23: CMA-AE
105 SignalP-HMM result:
108 >my_fasta_id
109 # pos aa C S n-reg h-reg c-reg
110 1 M 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
111 2 R 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
112 3 I 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
113 4 T 0.000 1.000 0.910 0.090 0.000
114 5 I 0.000 1.000 0.572 0.428 0.000
115 6 L 0.000 1.000 0.224 0.776 0.000
116 7 A 0.000 1.000 0.011 0.989 0.000
117 8 S 0.000 1.000 0.001 0.999 0.000
118 9 V 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000
119 10 V 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000
120 11 I 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000
121 12 P 0.000 1.000 0.000 0.999 0.001
122 13 C 0.000 1.000 0.000 0.997 0.003
123 14 L 0.000 1.000 0.000 0.977 0.023
124 15 G 0.000 1.000 0.000 0.849 0.151
125 16 F 0.000 1.000 0.000 0.224 0.776
126 17 S 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
127 18 A 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
128 19 S 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
129 20 C 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
130 21 M 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
131 22 A 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
132 23 A 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
133 24 E 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
134 25 D 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
135 26 V 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
136 27 M 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
137 28 I 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
138 29 V 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
139 30 S 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
140 31 A 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
141 32 S 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
142 33 G 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
143 34 Y 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
144 35 E 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
145 36 K 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
146 37 K 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
147 38 L 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
148 39 T 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
149 40 N 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
150 41 A 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
151 42 A 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
152 43 A 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
153 44 S 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
154 45 V 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
155 46 S 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
156 47 V 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
157 48 I 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
158 49 N 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
159 50 Q 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
160 51 E 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
161 52 E 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
162 53 L 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
163 54 Q 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
164 55 S 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
165 56 S 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
166 57 Q 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
167 58 Y 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
168 59 H 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
169 60 D 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
170 61 L 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
171 62 A 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
172 63 E 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
173 64 A 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
174 65 L 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
175 66 R 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
176 67 S 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
177 68 V 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
178 69 E 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
179 70 G 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
182 >my_fasta_id
183 Prediction: Signal peptide
184 Signal peptide probability: 1.000
185 Max cleavage site probability: 1.000 between pos. 22 and 23