Bio::Cluster and Bio::ClusterIO moved to their own separate distribution
[bioperl-live.git] / t / data / test.exp
blob09d0a7be801e87f75b14bb242262a4f1cd84d980
1 ID   (stdin)
2 EN   (stdin)
3 LN   (stdin)
4 LT   SCF
5 QR   1107
6 AV   7 7 7 7 7 6 6 6 6 4 4 4 6 6 6 6 12 21 24 29 29 19 16 7 7 8 13 
7 AV        13 22 22 25 29 29 34 32 35 35 35 35 40 40 51 51 51 45 45 
8 AV        45 56 40 40 40 40 40 40 46 46 56 42 42 56 45 40 40 40 40 
9 AV        40 42 42 35 33 33 35 35 35 46 56 56 40 40 40 40 34 33 33 
10 AV        24 24 12 14 9 11 16 31 31 48 48 48 48 40 20 19 8 6 6 6 
11 AV        8 21 25 30 32 32 33 37 40 40 56 56 56 56 42 33 27 15 15 
12 AV        15 33 33 42 56 48 44 42 33 33 20 22 13 13 13 22 22 42 44 
13 AV        42 42 42 42 42 42 42 38 38 45 45 45 40 37 37 36 40 35 37 
14 AV        38 40 40 42 40 45 38 40 42 37 40 40 40 40 45 56 46 42 42 
15 AV        42 43 56 56 43 51 45 40 40 40 40 40 44 44 56 39 40 35 36 
16 AV        36 40 42 42 42 50 50 44 47 44 56 56 44 44 42 42 40 40 40 
17 AV        37 37 40 40 40 45 37 40 35 35 35 35 40 40 40 40 44 44 36 
18 AV        36 19 25 14 33 33 35 35 35 40 36 38 37 37 37 42 42 42 42 
19 AV        35 35 35 42 37 42 36 36 36 35 35 35 42 42 42 42 42 42 42 
20 AV        56 42 42 42 42 42 37 37 42 42 42 42 42 42 34 34 34 42 31 
21 AV        32 28 28 28 31 29 33 29 25 17 24 21 17 9 8 10 13 12 17 
22 AV        10 9 9 9 10 8 11 11 11 8 9 9 9 8 7 10 8 8 6 6 8 8 12 10 
23 AV        9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 11 10 9 9 9 13 9 11 9 9 7 7 10 8 8 
24 AV        8 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 7 8 9 9 9 7 7 7 7 7 7 9 9 8 10 
25 AV        8 8 8 11 10 11 10 11 9 8 6 8 8 8 8 8 9 11 20 20 16 13 6 
26 AV        6 8 8 9 10 10 10 11 13 10 9 9 11 11 15 21 17 13 9 9 10 
27 AV        9 9 8 8 8 9 9 9 6 6 8 8 9 13 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 11 
28 AV        8 8 6 6 6 6 13 10 10 8 8 6 6 8 9 10 10 10 9 9 9 10 10 8 
29 AV        8 6 6 6 6 11 9 8 12 9 9 9 12 10 9 9 9 8 8 6 6 6 8 9 9 9 
30 AV        9 9 9 9 8 4 4 8 8 9 11 16 11 9 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 11 11 
31 AV        11 10 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 7 9 9 9 9 9 11 10 14 10 13 
32 AV        9 9 8 8 8 8 8 9 9 11 11 11 8 7 13 10 12 9 8 8 11 11 8 6 
33 AV        8 6 6 9 6 6 9 13 10 8 8 6 6 8 9 7 7 12 12 6 6 8 8 9 6 8 
34 AV        8 8 6 6 8 13 11 6 6 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 6 6 6 9 9 8 10 
35 AV        6 6 6 6 6 9 6 6 8 6 6 8 8 10 4 4 4 8 9 9 12 12 10 9 8 8 
36 AV        6 6 8 6 6 6 6 8 8 4 4 4 6 6 6 6 6 9 7 8 9 8 8 8 10 10 10 
37 AV        8 6 6 8 8 8 9 9 6 6 12 6 6 8 9 9 7 7 9 9 9 9 7 7 9 9 9 
38 AV        10 8 7 9 9 7 7 7 7 9 7 6 6 6 6 8 8 7 7 9 9 9 13 8 8 6 6 
39 AV        9 6 7 7 8 9 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 6 7 6 6 6 7 7 7 9 
40 AV        9 10 9 11 11 14 13 13 9 9 9 6 6 8 8 8 8 9 14 10 9 9 7 10 
41 AV        9 11 8 8 8 8 10 10 10 9 9 8 8 6 7 7 9 6 6 9 10 11 11 7 
42 AV        7 11 10 10 11 9 11 8 8 11 9 9 7 6 6 6 14 8 8 13 11 11 11 
43 AV        9 9 9 8 11 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 6 9 19 21 15 13 11 9 13 
44 AV        9 10 16 16 9 9 9 9 10 9 9 9 6 6 8 8 6 6 10 8 10 9 9 6 6 
45 AV        8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 9 12 12 
46 AV        12 8 8 9 21 19 15 12 9 9 9 9 9 12 16 11 11 11 12 12 9 7 
47 AV        9 9 10 9 8 8 11 13 12 9 9 9 9 10 9 8 8 6 6 9 8 9 9 11 10 
48 AV        10 11 10 8 7 8 8 6 6 6 8 9 9 11 11 16 9 9 10 9 9 9 9 9 
49 AV        9 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 10 9 10 10 11 
50 AV        14 21 20 18 14 11 9 6 6 6 7 6 6 8 8 9 9 10 10 10 10 9 9 
51 AV        9 11 11 9 10 6 6 8 8 9 9 6 6 6 6 8 8 9 9 9 9 9 7 7 9 9 
52 AV        9 9 9 9 9 12 9 9 9 9 9 9 10 12 9 10 10 11 11 11 12 10 7 
53 AV        7 9 7 7 9 13 9 9 9 6 6 6 8 8 8 6 6 
54 SQ   
55      GATGATTCCG GCTTCGGACG ACTCTAGAGG ATCCCCATTT TTATAGTTTT TATCTTGTAA
56      TAGATGTTTA GATTTTTCGT TGTAATTATT TTCTTTATTG TTGAAATTAG TATCTCTGGG
57      TAATTTATCA TATTCTCTGG AAAATGATTT ACTATCACTA GATACTTCAT AAGATTTATA
58      ATCTTTATTA TGAAAATCAT CTCTATTTTT CAAATTATTA TTATATCTAT CAAAGTTTCT
59      GTCTTCATTA TATCTATTAG CATATCTATC TTTATCTTTA TCCCTATCAC TATATCTATC
60      ATATGGTTCA TCTTGTTCAA CCGATCAGAC TCGATTCGCC ATCGCCTCTA ACGGATGGCC
61      GCTCCCCCTC TCATACCTCG CTCCCCTCGA CATCCCCCGT CTCGCCACCC TATCCGCCCC
62      CTTCATCACC CCCCCTTATC CACACCCTCA CCCCCCGCAT CGCGCACCCA CGACCACCCG
63      AAGAACCGCC CTTACTCCCA AGTACGCCCC GACCTCCATC ACCCTATGCG GTACCACTCC
64      CACCACACCC AGTCCTACTT TCGCCCGCAC ATCGGCCCCG CTTCAGACAG CTCCCAACTA
65      CGCAACCCAC GCTTGTTCTT GTTCACACTC GAATACTCGA ATCTCTCATT ACTCCGCGGA
66      CTCCGCCGCA CCTGTGCACC ATTAACTGTG TAGCGCCTGA ACCGGCACCT CTGATTACCA
67      CTTCCTCCAC CAGCACAGTC CTATTACCGC ATGTCGCTCT GCTAAGACAG TGCAAGACTC
68      TGCGGTCGCT CTGACCCGCA TCCGCCAGGG CACCTCTCAC CCTCGCTGGC CACCCCGCCC
69      CCCTCTCCCT GCCCCTTCAT TCCCCCAAAC CGCTTTCAAC GGGACACACC CCTCCGCGGC
70      GGACCACAAC TCGCCGTCGG CCACCACTCA CACCTTCCCT CCTCCTTCCC CCACATCACG
71      CCAACCCCGT GGGACGGCTC TCCCGCGGCT ACGACGCGCA ACCCCCCCTC GCCGCTTCCC
72      CCCCAACTTC CCACGGGCTC CCCTCCGCCC CTTACCCGCG AGGAGCTTCA CCCGCGAACC
73      ACCTCCCCCC TTTCCCAACA GCACCG