Bio::DB::TFBS namespace has been moved to its own distribution named after itself
[bioperl-live.git] / t / data / BEL16-LTR_AG.embl
blob77d20a5892d7082214c065c508fab2d918df6c18
1 ID   BEL16-LTR_AG repbase; DNA   ; ANG   ; 287 BP.
2 XX
3 AC   .
4 XX
5 DT   03-APR-2003 (Rel. 8.03, Created)
6 DT   03-APR-2003 (Rel. 8.03, Last updated, Version 1)
7 XX
8 DE   BEL16-LTR_AG is a long terminal repeat of the BEL16_AG LTR
9 DE   retrotransposon - a consensus sequence.
11 KW   5-bp TSD; BEL16-I_AG; BEL16-LTR_AG; BEL16_AG; Bel clade;
12 KW   LTR retrotransposon; reverse transcriptase.
14 OS   Anopheles gambiae str. PEST
15 OC   Eukaryota; Metazoa; Arthropoda; Hexapoda; Insecta; Pterygota; Neoptera;
16 OC   Endopterygota; Diptera; Nematocera; Culicoidea; Culicidae; Anophelinae;
17 OC   Anopheles; Anopheles gambiae.
19 RN   [1]
20 RP   1-287
21 RA   Kapitonov V.V., Pavlicek A., Jurka J.;
22 RT   "BEL16_AG, a nonautonomous family of Bel/Pao-like LTR retrotransposons
23 RT   from African malaria mosquito.";
24 RL   Repbase Reports 3(3), 40-40 (2003).
26 CC   [1] (Consensus)
28 CC   BEL16-LTR_AG flank an internal portion of BEL16_AG (deposited as
29 CC   BEL16-I_AG).
31 SQ   Sequence 287 BP; 85 A; 51 C; 75 G; 76 T; 0 others;
32      tgttggaatg taagggttat gaaacggtca ttttgaattg tttgcggttg ttttgtcagt        60
33      tgggaattaa aagttaaatg tattttctgg cagcactgcc gatcgacaat ttgtgattaa       120
34      gtatgtgtgc gaataaagcg gcactagcgc atgaaactcg atacgagccg gacgtgttct       180
35      ttactttgtc tcctttggcg atcgaagacg acacaacaaa acacaacgta gggcgtagag       240
36      gcgtcaaggg ggaaaggaac caacaaacca tgttccagaa cgcaaca                     287