Bio::DB::TFBS namespace has been moved to its own distribution named after itself
[bioperl-live.git] / t / data / HUMBETGLOA.grailexp
blob6e291fc9227ac7255d95dba8c6b672846838d2ea
1 begin genes
2  1 1 summary f 3 866 2289 866 2289 -1 -1
3  1 1 exon 866 957 0 1 96
4  1 1 exon 1088 1310 2 2 100
5  1 1 exon 2161 2289 0 0 94
6  1 1 mrna atggtgcatctgactcctgaggagaagtctgccgttactgccctgtggggcaaggtgaacgtggatgaagttggtggtgaggccctgggcaggctgctggtggtctacccttggacccagaggttctttgagtcctttggggatctgtccactcctgatgctgttatgggcaaccctaaggtgaaggctcatggcaagaaagtgctcggtgcctttagtgatggcctggctcacctggacaacctcaagggcacctttgccacactgagtgagctgcactgtgacaagctgcacgtggatcctgagaacttcaggctcctgggcaacgtgctggtctgtgtgctggcccatcactttggcaaagaattcaccccaccagtgcaggctgcctatcagaaagtggtggctggtgtggctaatgccctggcccacaagtatcactaa
7  1 1 translation MVHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH*
8 end genes
9 begin exons
10  f 1 848 941 1 0 77 0 848 1051 0
11  f 1 848 957 1 0 93 0 848 1051 0
12  f 1 866 919 0 0 85 0 848 1051 0
13  f 1 866 934 0 0 79 0 848 1051 0
14  f 1 866 941 0 0 82 0 848 1051 0
15  f 1 866 957 0 0 96 0 848 1051 1
16  f 1 866 1051 3 0 24 0 848 1051 0
17  f 2 930 1275 0 0 28 0 924 1331 0
18  f 2 930 1310 0 0 56 0 924 1331 0
19  f 2 930 1331 3 0 33 0 924 1331 0
20  f 2 1088 1175 1 2 74 0 924 1331 0
21  f 2 1088 1196 1 2 78 0 924 1331 0
22  f 2 1088 1203 1 2 60 0 924 1331 0
23  f 2 1088 1212 1 2 60 0 924 1331 0
24  f 2 1088 1263 1 2 64 0 924 1331 0
25  f 2 1088 1275 1 2 79 0 924 1331 0
26  f 2 1088 1289 1 2 100 0 924 1331 0
27  f 2 1088 1310 1 2 100 0 924 1331 1
28  f 2 1088 1314 1 2 82 0 924 1331 0
29  f 2 1088 1331 2 2 68 0 924 1331 0
30  f 2 1116 1310 1 0 92 0 924 1331 0
31  f 2 1161 1275 0 0 33 0 924 1331 0
32  f 2 1161 1310 0 0 63 0 924 1331 0
33  f 2 1161 1331 3 0 21 0 924 1331 0
34  f 3 2131 2254 0 0 34 0 2116 2289 0
35  f 3 2131 2289 3 0 37 0 2116 2289 0
36  f 3 2161 2244 1 0 60 0 2116 2289 0
37  f 3 2161 2247 1 0 62 0 2116 2289 0
38  f 3 2161 2254 1 0 65 0 2116 2289 0
39  f 3 2161 2279 1 0 77 0 2116 2289 0
40  f 3 2161 2289 2 0 94 0 2116 2289 1
41  r 1 1062 1296 2 2 79 1 1062 1316 0
42  r 1 1082 1296 1 2 75 1 1062 1316 0
43  r 1 1104 1296 1 2 74 1 1062 1316 0
44  r 1 1112 1296 1 2 79 1 1062 1316 1
45  r 1 1148 1296 1 2 53 1 1062 1316 0
46  r 1 1170 1296 1 2 59 1 1062 1316 0
47 end exons