t/data/ay116458.gb

   1 LOCUS       AY116458                 229 bp    DNA     linear   PLN 09-APR-2003
   2 DEFINITION  Eucalyptus globulus subsp. bicostata isolate EgRT12 Ty1-copia
   3             retrotransposon reverse transcriptase-like (RT) gene, partial
   4             sequence.
   5 ACCESSION   AY116458
   6 VERSION     AY116458.1  GI:22858882
   7 KEYWORDS    .
   8 SOURCE      Eucalyptus globulus subsp. bicostata
   9   ORGANISM  Eucalyptus globulus subsp. bicostata
  10             Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
  11             Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; core eudicotyledons;
  12             rosids; Myrtales; Myrtaceae; Eucalyptus.
  13 REFERENCE   1  (bases 1 to 229)
  14   AUTHORS   Diez,J., Beguiristain,T., Le Tacon,F., Casacuberta,J.M. and Tagu,D.
  15   TITLE     Identification of Ty1- copia retrotransposons in three
  16             ectomycorrhizal basidiomycetes: evolutionary relationships and use
  17             as molecular markers
  18   JOURNAL   Curr. Genet. 43 (1), 34-44 (2003)
  19    PUBMED   12684843
  20 REFERENCE   2  (bases 1 to 229)
  21   AUTHORS   Beguiristain,T., Diez,J., Le Tacon,F., Casacuberta,J. and Tagu,D.
  22   TITLE     Direct Submission
  23   JOURNAL   Submitted (29-MAY-2002) UMR 1136 IaM Interactions
  24             Arbres/Micro-Organismes, INRA-Nancy, Champenoux 54280, France
  25 FEATURES             Location/Qualifiers
  26      source          1..229
  27                      /organism="Eucalyptus globulus subsp. bicostata"
  28                      /mol_type="genomic DNA"
  29                      /isolate="EgRT12"
  30                      /sub_species="bicostata"
  31                      /db_xref="taxon:71272"
  32      gene            <1..>229
  33                      /gene="RT"
  34                      /note="EgRT"
  35      misc_feature    <1..>229
  36                      /gene="RT"
  37                      /note="similar to reverse transcriptase; unknown if
  38                      correctly expressed due to presence of premature
  39                      stopcodons and frameshifts"
  40      repeat_region   <1..>229
  41                      /transposon="Ty1-copia retrotransposon"
  42 ORIGIN
  43         1 aatgggaatt tagaggaaga ggtttatatg gaccaacccg aaggctttcc agttatagga
  44        61 aaggaacaca tggtatgtaa attaaagaag tcaatatatg gacttaaaca agcttcccga
  45       121 caatggtatc ttaagttaaa cgataccata acttcatttg gatttaagga aaacactgtt
  46       181 gatcggtgta tatatatgaa gattagtggg agcaagttta tttttctag
  47 //
  48