t/data/blast.report

   1 TBLASTN 2.0.4 [Feb-24-1998]
   2
   3 Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A.
   4 Sch&auml;ffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman
   5 (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
   6  programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
   7
   8 Query=
   9 gi|1401126
  10          (504 letters)
  11
  12 Database: Non-redundant GenBank+EMBL+DDBJ+PDB sequences
  13            336,723 sequences; 677,679,054 total letters
  14
  15 Searchingdone
  16
  17
  18                                                                    Score     E
  19 Sequences producing significant alignments:                        (bits)  Value
  20
  21 gb|U49928|HSU49928 Homo sapiens TAK1 binding protein (TAB1) mRNA...  1009  0.0
  22 emb|Z36985|PTPP2CMR P.tetraurelia mRNA for protein phosphatase t...    58  4e-07
  23 emb|X77116|ATMRABI1 A.thaliana mRNA for ABI1 protein                   53  1e-05
  24 gb|U12856|ATU12856 Arabidopsis thaliana Col-0 abscisic acid inse...    53  1e-05
  25 dbj|D38109|ATHPP2CA Arabidopsis thaliana mRNA for protein phosph...    52  3e-05
  26 emb|Y08965|ATABI2RNA A.thaliana mRNA for ABI2 protein                  47  8e-04
  27 emb|AL010222|PFSC04009 Plasmodium falciparum DNA *** SEQUENCING ...    45  0.004
  28 gb|AC002409|ATAC002409 Arabidopsis thaliana chromosome II BAC T2...    43  0.012
  29 emb|Z98762|SPAC4A8 S.pombe chromosome I cosmid c4A8                    42  0.020
  30 gb|AF006827|AF006827 Magnaporthe grisea adenylate cyclase (MAC1)...    41  0.045
  31 emb|Y13936|HSY13936 Homo sapiens mRNA for protein phosphatase 2C...    41  0.059
  32 gb|U81159|BTU81159 Bos taurus magnesium-dependent calcium inhibi...    40  0.077
  33 emb|Y10438|SPFKBAD Streptomyces sp. MA6548 fkbA gene and partial...    40  0.077
  34 gb|AF012921|AF012921 Magnaporthe grisea adenylate cyclase (mac1)...    40  0.10
  35 gb|U42383|MMU42383 Mus musculus fibroblast growth factor inducib...    40  0.10
  36 gb|AF023665|AF023665 Plasmodium falciparum protein phosphatase 2...    39  0.13
  37 gb|M24942|YSPCYR1A Yeast (S.pombe) adenylate cyclase (CYR1) gene...    39  0.17
  38 gb|M26699|YSPADC Yeast (S.pombe) cyr1 gene encoding adenylyl cyc...    39  0.17
  39 gb|L43413|PANADCY Podospora anserina adenyl cyclase gene, exons 1-4    38  0.30
  40 gb|M89651|HUMMMDBC Human DNA from cosmid DNA MMDB (f10080) and M...    38  0.30
  41 emb|Z99161|SPAC11G7 S.pombe chromosome I cosmid c11G7                  38  0.30
  42 emb|X56042|SKADECYC Saccharomyces kluyveri gene for adenylyl cyc...    37  0.88
  43 gb|M29235|CELPOLII C.elegans RNA polymerase II largest subunit (...    36  1.1
  44 dbj|D45132|HUMHOXY1 Human kidney mRNA for zinc-finger DNA-bindin...    36  1.1
  45 gb|U70654|MMU70654 Mus musculus musculus sex determining protein...    36  1.1
  46 gb|U53333|CELF36A4 Caenorhabditis elegans cosmid F36A4.                36  1.1
  47 gb|L29028|CREWP6A Chlamydomonas eugametos WP6 mRNA, complete cds       36  1.1
  48 gb|U70653|MMU70653 Mus musculus musculus sex determining protein...    36  1.1
  49 gb|U17838|HSU17838 Human zinc finger protein RIZ mRNA, complete cds    36  1.1
  50 emb|X56432|DMRUNTR D.melanogaster mRNA for runt segmentation gene      36  1.5
  51 emb|X67204|MMSRYLOC M.musculus DNA sequence of Sry locus               36  1.5
  52 gb|U00051|CELF42G9 Caenorhabditis elegans cosmid F42G9.                36  1.5
  53 gb|U70655|MMU70655 Mus musculus sex determining protein (Sry) ge...    36  1.5
  54 gb|AF019985|AF019985 Dictyostelium discoideum Spalten (spnA) mRN...    36  2.0
  55 emb|X78886|ATABI1G A.thaliana (Landsberg erecta) ABI1 gene             36  2.0
  56 gb|U70651|MMU70651 Mus musculus musculus sex determining protein...    36  2.0
  57 gb|U70652|MMU70652 Mus musculus musculus sex determining protein...    36  2.0
  58 emb|X58924|HVRPL11E H.volcanii genes for ribosomal proteins L11e...    36  2.0
  59 emb|X05806|CHAMPER Acetabularia plastid DNA homologous to Drosop...    36  2.0
  60 gb|U82833|OSU82833 Oryza sativa S-adenosyl-L-methionine syntheta...    35  2.6
  61 emb|Z27084|HLHOLLI H.lanatus mRNA for allergen Hol-lI                  35  2.6
  62 dbj|D00676|SH1RSP40 Pseudorabies virus genome, RSp40 and pk genes      35  2.6
  63 emb|Y10421|CCATCOLE1 C.curvatus strain ATCC 20509 Ole1 gene            35  2.6
  64 gb|L14320|HSBBICP4A Bovine herpesvirus type 1 early-intermediate...    35  2.6
  65 emb|AJ004801|BHV1CGEN Bovine herpesvirus 1 complete genome             35  2.6
  66 dbj|AB010074|AB010074 Arabidopsis thaliana genomic DNA, chromoso...    35  3.4
  67 gb|AC004490|AC004490 Homo sapiens chromosome 19, cosmid R29381, ...    35  3.4
  68 dbj|AB011474|AB011474 Arabidopsis thaliana genomic DNA, chromoso...    35  3.4
  69 gb|U03645|MMU03645 Mus musculus domesticus Torino (Sry) gene, co...    35  3.4
  70 gb|U70641|MMU70641 Mus musculus domesticus sex determining prote...    35  3.4
  71 gb|U70650|MMU70650 Mus musculus domesticus sex determining prote...    35  3.4
  72 gb|U70642|MMU70642 Mus musculus domesticus sex determining prote...    35  3.4
  73 gb|U70647|MMU70647 Mus musculus domesticus sex determining prote...    35  3.4
  74 emb|Y11840|ATABI2 Arabidopsis thaliana ABI2 gene                       35  3.4
  75 emb|Y08966|ATABI2DNA A.thaliana gene encoding ABI2 protein             35  3.4
  76 emb|X16144|SVGRA S. violaceoruber DNA for granaticin polyketide ...    35  3.4
  77 emb|X16300|SVPKS Streptomyces violaceoruber polyketide synthase ...    35  3.4
  78 gb|U70657|MMU70657 Mus musculus castaneus sex determining protei...    35  3.4
  79 gb|M57417|HUMMUCCF Human (cystic fibrosis patient) mucin mRNA, p...    35  3.4
  80 gb|L04286|DDIGP100 Dictyostelium discoideum glycoprotein gp100 (...    35  3.4
  81 emb|Z46938|BTTESDNA B.taurus DNA (protamine gene cluster)              35  3.4
  82 gb|L13054|DROZESTEL Drosophila melanogaster zeste (z) gene, part...    34  4.4
  83 gb|L13058|DROZESTEP Drosophila melanogaster zeste (z) gene, part...    34  4.4
  84 gb|M60590|YSCAAGLCS S.cerevisiae a-agglutinin core subunit (AGA1...    34  4.4
  85 gb|AF009521|AF009521 Mus spretus sex determining protein (Sry) g...    34  4.4
  86 emb|Z71659|SCYNR044W S.cerevisiae chromosome XIV reading frame O...    34  4.4
  87 gb|U19361|PMU19361 Petromyzon marinus neurofilament subunit NF-1...    34  4.4
  88 gb|U70646|MMU70646 Mus musculus domesticus sex determining prote...    34  4.4
  89 gb|U23477|DDU23477 Dictyostelium discoideum phosphatidylinositol...    34  4.4
  90 emb|X55695|LEEXTEN15 Tomato mRNA for a glycine-rich protein (clo...    34  4.4
  91 emb|Z95556|MTCY07A7 Mycobacterium tuberculosis cosmid SCY07A7          34  4.4
  92 dbj|AB007645|AB007645 Arabidopsis thaliana genomic DNA, chromoso...    34  5.8
  93 emb|X64346|HSGEND Herpesvirus saimiri complete genome DNA              34  5.8
  94 emb|Z95620|SPBC3D6 S.pombe chromosome II cosmid c3D6                   34  5.8
  95 gb|U70644|MMU70644 Mus musculus domesticus sex determining prote...    34  5.8
  96 gb|U70649|MMU70649 Mus musculus domesticus sex determining prote...    34  5.8
  97 gb|U43491|SCU43491 Saccharomyces cerevisiae cosmid clone pEOA156...    34  5.8
  98 dbj|D00909|NEUNAC N.crassa nac gene coding for adenylate cyclase...    34  5.8
  99 gb|U70645|MMU70645 Mus musculus domesticus sex determining prote...    34  5.8
 100 gb|AF009519|AF009519 Mus musculus domesticus sex determining pro...    34  5.8
 101 gb|M77174|MUSPERPA Mouse perlecan mRNA, complete cds.                  34  5.8
 102 emb|Z74917|SCYOR009W S.cerevisiae chromosome XV reading frame OR...    34  5.8
 103 gb|J04054|MUSPCGBM Mouse basement membrane proteoglycan mRNA, pa...    34  5.8
 104 emb|Z47072|CEF26C11 Caenorhabditis elegans cosmid F26C11, comple...    34  5.8
 105 gb|U70643|MMU70643 Mus musculus sex determining protein (Sry) ge...    34  5.8
 106 gb|AC003671|AC003671 Arabidopsis thaliana chromosome 1 BAC F17O7...    34  5.8
 107 emb|X16481|RN11ZNBP Rat mRNA for zinc(2+) binding protein              34  5.8
 108 gb|U46156|SSU46156 Synechococcus sp. CcmK (ccmK) gene, complete ...    34  5.8
 109 gb|AC000098|YUP8H12 Arabidopsis thaliana chromosome 1 YAC yUP8H1...    34  5.8
 110 emb|Z71781|SCCIVL37K S.cerevisiae chromosome IV left arm (EU) DN...    34  5.8
 111 emb|Y13332|SSTO1AMY Streptomyces sp. TO1 amy gene                      34  5.8
 112 gb|M30473|NEULEURSC N.crassa cytoplasmic leucyl-tRNA synthetase ...    34  5.8
 113 emb|Z74085|SCYDL037C S.cerevisiae chromosome IV reading frame OR...    34  5.8
 114 gb|AF029858|AF029858 Sorghum bicolor cytochrome P450 CYP71E1 (CY...    34  5.8
 115 gb|S47414|S47414 glycine-rich protein {clone atGRP-5} [Arabidops...    34  7.6
 116 emb|X60294|SCSEC1A S.cereale Sec1 gene for omega secalin               34  7.6
 117 emb|Z37975|BTPLAKOPH B.taurus mRNA for plakophilin.                    34  7.6
 118 emb|X60295|SCSEC1B S.cereale Sec1 gene for omega secalin               34  7.6
 119 dbj|D87895|D87895 Aspergillus nidulans DNA for chitinase, comple...    34  7.6
 120 gb|AF017789|AF017789 Homo sapiens putative transcription factor ...    34  7.6
 121
 122 >gb|U49928|HSU49928 Homo sapiens TAK1 binding protein (TAB1) mRNA, complete cds.
 123            Length = 3096
 124
 125  Score = 1009 bits (2580), Expect = 0.0
 126  Identities = 504/504 (100%), Positives = 504/504 (100%)
 127
 128 Query: 1   MAAQRRSLLQSEQQPSWTDDLPLCHLSGVGSASNRSYSADGKGTESHPPEDSWLKFRSEN 60
 129            MAAQRRSLLQSEQQPSWTDDLPLCHLSGVGSASNRSYSADGKGTESHPPEDSWLKFRSEN
 130 Sbjct: 21  MAAQRRSLLQSEQQPSWTDDLPLCHLSGVGSASNRSYSADGKGTESHPPEDSWLKFRSEN 200
 131
 132 Query: 61  NCFLYGVFNGYDGNRVTNFVAQRLSAELLLGQLNAEHAEADVRRVLLQAFDVVERSFLES 120
 133            NCFLYGVFNGYDGNRVTNFVAQRLSAELLLGQLNAEHAEADVRRVLLQAFDVVERSFLES
 134 Sbjct: 201 NCFLYGVFNGYDGNRVTNFVAQRLSAELLLGQLNAEHAEADVRRVLLQAFDVVERSFLES 380
 135
 136 Query: 121 IDDALAEKASLQSQLPEGVPQHQLPPQYQKILERLKTLEREISGGAMAVVAVLLNNKLYV 180
 137            IDDALAEKASLQSQLPEGVPQHQLPPQYQKILERLKTLEREISGGAMAVVAVLLNNKLYV
 138 Sbjct: 381 IDDALAEKASLQSQLPEGVPQHQLPPQYQKILERLKTLEREISGGAMAVVAVLLNNKLYV 560
 139
 140 Query: 181 ANVGTNRALLCKSTVDGLQVTQLNVDHTTENEDELFRLSQLGLDAGKIKQVGIICGQEST 240
 141            ANVGTNRALLCKSTVDGLQVTQLNVDHTTENEDELFRLSQLGLDAGKIKQVGIICGQEST
 142 Sbjct: 561 ANVGTNRALLCKSTVDGLQVTQLNVDHTTENEDELFRLSQLGLDAGKIKQVGIICGQEST 740
 143
 144 Query: 241 RRIGDYKVKYGYTDIDLLSAAKSKPIIAEPEIHGAQPLDGVTGFLVLMSEGLYKALEAAH 300
 145            RRIGDYKVKYGYTDIDLLSAAKSKPIIAEPEIHGAQPLDGVTGFLVLMSEGLYKALEAAH
 146 Sbjct: 741 RRIGDYKVKYGYTDIDLLSAAKSKPIIAEPEIHGAQPLDGVTGFLVLMSEGLYKALEAAH 920
 147
 148 Query: 301 GPGQANQEIAAMIDTEFAKQTSLDAVAQAVVDRVKRIHSDTFASGGERARFCPRHEDMTL 360
 149            GPGQANQEIAAMIDTEFAKQTSLDAVAQAVVDRVKRIHSDTFASGGERARFCPRHEDMTL
 150 Sbjct: 921 GPGQANQEIAAMIDTEFAKQTSLDAVAQAVVDRVKRIHSDTFASGGERARFCPRHEDMTL 1100
 151
 152 Query: 361 LVRNFGYPLGEMSQPTPSPAPAAGGRVYPVSVPYSSAQSTSKTSVTLSLVMPSQGQMVNG 420
 153            LVRNFGYPLGEMSQPTPSPAPAAGGRVYPVSVPYSSAQSTSKTSVTLSLVMPSQGQMVNG
 154 Sbjct: 1101LVRNFGYPLGEMSQPTPSPAPAAGGRVYPVSVPYSSAQSTSKTSVTLSLVMPSQGQMVNG 1280
 155
 156 Query: 421 AHSASTLDEATPTLTNQSPTLTLQSTNTHTQSSSSSSDGGLFRSRPAHSLPPGEDGRVEP 480
 157            AHSASTLDEATPTLTNQSPTLTLQSTNTHTQSSSSSSDGGLFRSRPAHSLPPGEDGRVEP
 158 Sbjct: 1281AHSASTLDEATPTLTNQSPTLTLQSTNTHTQSSSSSSDGGLFRSRPAHSLPPGEDGRVEP 1460
 159
 160 Query: 481 YVDFAEFYRLWSVDHGEQSVVTAP 504
 161            YVDFAEFYRLWSVDHGEQSVVTAP
 162 Sbjct: 1461YVDFAEFYRLWSVDHGEQSVVTAP 1532
 163
 164
 165 >emb|Z36985|PTPP2CMR P.tetraurelia mRNA for protein phosphatase type 2C
 166            Length = 969
 167
 168  Score = 57.8 bits (137), Expect = 4e-07
 169  Identities = 64/261 (24%), Positives = 112/261 (42%), Gaps = 2/261 (0%)
 170
 171 Query: 64  LYGVFNGYDGNRVTNFVAQRLSAELLLGQLNAEHAEADVRRVLLQAFDVVERSFLESIDD 123
 172            ++GVF+G+ G  V  FV +    ELL  +                  +  E+ F E++ +
 173 Sbjct: 182 VFGVFDGHGGREVA*FVEKHFVDELLKNK------------------NFKEQKFEEALKE 307
 174
 175 Query: 124 ALAEKASLQSQLPEGVPQHQLPPQYQKILERLKTLEREIS-GGAMAVVAVLLNNKLYVAN 182
 176               +   L            L P+ QK L   K  + + S  G  A VA++  N LYVAN
 177 Sbjct: 308 TFLKMDELL-----------LTPEGQKELN*YKATDTDESYAGCTANVALIYKNTLYVAN 454
 178
 179 Query: 183 VGTNRALLCKSTVDGLQVTQLNVDHTTENEDELFRLSQLGLDAGKIKQVGIICGQESTRR 242
 180             G +R++LC++  +      ++VDH  +N +E  R+ + G   G +    +      +R
 181 Sbjct: 455 AGDSRSVLCRNNTN----HDMSVDHKPDNPEEKSRIERAG---GFVSDGRVNGNLNLSRA 613
 182
 183 Query: 243 IGDYKVKYGYTDIDLLSAAKSKPIIAEPEIHGAQPLDGVTGFLVLMSEGLYKALEAAHGP 302
 184            +GD + K      D    +    IIA P++   + L     F+++  +G+++ L
 185 Sbjct: 614 LGDLEYKR-----DNKLRSNE*LIIALPDVKKTE-LTP*DKFILMGCDGVFETLNH*ELL 775
 186
 187 Query: 303 GQANQEIA-AMIDTEFAKQTSLD 324
 188             Q N  I  A +  E  K+ + D
 189 Sbjct: 776 KQVNSTIG*AQVTEELLKKAAED 844
 190
 191
 192 >emb|X77116|ATMRABI1 A.thaliana mRNA for ABI1 protein
 193             Length = 1981
 194
 195  Score = 52.7 bits (124), Expect = 1e-05
 196  Identities = 59/242 (24%), Positives = 105/242 (43%), Gaps = 6/242 (2%)
 197
 198 Query: 55   KFRSENNCFLYGVFNGYDGNRVTNFVAQRLSAELLLGQLNAEHAEADVRRVLLQAFDVVE 114
 199             +F  ++    +GV++G+ G++V N+  +R+   L      AE   A  + +L      +E
 200 Sbjct: 918  RFDPQSAAHFFGVYDGHGGSQVANYCRERMHLAL------AEEI-AKEKPMLCDGDTWLE 1076
 201
 202 Query: 115  RSFLESIDDALAEKASLQSQLPEGVPQHQLPPQYQKILERLKTLEREISGGAMAVVAVLL 174
 203             +      +  L   + ++S  PE V                         G+ +VVAV+
 204 Sbjct: 1077 KWKKALFNSFLRVDSEIESVAPETV-------------------------GSTSVVAVVF 1181
 205
 206 Query: 175  NNKLYVANVGTNRALLCKSTVDGLQVTQLNVDHTTENEDELFRLSQLGLDAGKIKQ---- 230
 207              + ++VAN G +RA+LC+    G     L+VDH  + EDE  R+   G   GK+ Q
 208 Sbjct: 1182 PSHIFVANCGDSRAVLCR----GKTALPLSVDHKPDREDEAARIEAAG---GKVIQWNGA 1340
 209
 210 Query: 231  --VGIICGQESTRRIGDYKVKYGYTDIDLLSAAKSKPIIAEPEIHGAQPLDGVTGFLVLM 288
 211                G++     +R IGD  +K                II +PE+   + +      L+L
 212 Sbjct: 1341 RVFGVLA---MSRSIGDRYLK--------------PSIIPDPEVTAVKRVK-EDDCLILA 1466
 213
 214 Query: 289  SEGLYKAL 296
 215             S+G++  +
 216 Sbjct: 1467 SDGVWDVM 1490
 217
 218
 219 >gb|U12856|ATU12856 Arabidopsis thaliana Col-0 abscisic acid insensitive protein (ABI1)
 220             mRNA, complete cds.
 221             Length = 2000
 222
 223  Score = 52.7 bits (124), Expect = 1e-05
 224  Identities = 59/242 (24%), Positives = 105/242 (43%), Gaps = 6/242 (2%)
 225
 226 Query: 55   KFRSENNCFLYGVFNGYDGNRVTNFVAQRLSAELLLGQLNAEHAEADVRRVLLQAFDVVE 114
 227             +F  ++    +GV++G+ G++V N+  +R+   L      AE   A  + +L      +E
 228 Sbjct: 918  RFDPQSAAHFFGVYDGHGGSQVANYCRERMHLAL------AEEI-AKEKPMLCDGDTWLE 1076
 229
 230 Query: 115  RSFLESIDDALAEKASLQSQLPEGVPQHQLPPQYQKILERLKTLEREISGGAMAVVAVLL 174
 231             +      +  L   + ++S  PE V                         G+ +VVAV+
 232 Sbjct: 1077 KWKKALFNSFLRVDSEIESVAPETV-------------------------GSTSVVAVVF 1181
 233
 234 Query: 175  NNKLYVANVGTNRALLCKSTVDGLQVTQLNVDHTTENEDELFRLSQLGLDAGKIKQ---- 230
 235              + ++VAN G +RA+LC+    G     L+VDH  + EDE  R+   G   GK+ Q
 236 Sbjct: 1182 PSHIFVANCGDSRAVLCR----GKTALPLSVDHKPDREDEAARIEAAG---GKVIQWNGA 1340
 237
 238 Query: 231  --VGIICGQESTRRIGDYKVKYGYTDIDLLSAAKSKPIIAEPEIHGAQPLDGVTGFLVLM 288
 239                G++     +R IGD  +K                II +PE+   + +      L+L
 240 Sbjct: 1341 RVFGVLA---MSRSIGDRYLK--------------PSIIPDPEVTAVKRVK-EDDCLILA 1466
 241
 242 Query: 289  SEGLYKAL 296
 243             S+G++  +
 244 Sbjct: 1467 SDGVWDVM 1490
 245
 246
 247 >dbj|D38109|ATHPP2CA Arabidopsis thaliana mRNA for protein phosphatase 2C
 248            Length = 1371
 249
 250  Score = 51.5 bits (121), Expect = 3e-05
 251  Identities = 73/290 (25%), Positives = 132/290 (45%), Gaps = 13/290 (4%)
 252
 253 Query: 47  HPPEDSWLKFRSENNCFLYGVFNGYDGNRVTNFVAQRLSAELLLGQLNAEHAEADVRRVL 106
 254            HP   S+L+  SEN+ F YGVF+G+  + V     +RL  +++  ++    A  +    +
 255 Sbjct: 447 HP---SFLQRNSENHHF-YGVFDGHGCSHVAEKCRERLH-DIVKKEVEVM-ASDEWTETM 608
 256
 257 Query: 107 LQAFDVVERSFLESIDDALAEKASLQSQLPEGVPQHQLPPQYQKILERLKTLEREISGGA 166
 258            +++F  +++   +   + +   A+    +          PQ   +             G+
 259 Sbjct: 609 VKSFQKMDKEVSQRECNLVVNGAT--RSMKNSCRCELQSPQCDAV-------------GS 743
 260
 261 Query: 167 MAVVAVLLNNKLYVANVGTNRALLCKSTVDGLQVTQLNVDHTTENEDELFRLSQLGLDAG 226
 262             AVV+V+   K+ V+N G +RA+LC++ V       L+VDH  +  DEL R+ Q G   G
 263 Sbjct: 744 TAVVSVVTPEKIIVSNCGDSRAVLCRNGV----AIPLSVDHKPDRPDELIRIQQAG---G 902
 264
 265 Query: 227 KI------KQVGIICGQESTRRIGD-YKVKYGYTDIDLLSAAKSKP----IIAEPEIHGA 275
 266            ++      + +G++     +R IGD Y   Y   D ++    ++      I+A   +
 267 Sbjct: 903 RVIYWDGARVLGVLA---MSRAIGDNYLKPYVIPDPEVTVTDRTDEDECLILASDGLWDV 1073
 268
 269 Query: 276 QPLDGVTGF--LVLMSEGLYKALEAAHGPGQANQEIAAMIDTEFAKQTSLDAVAQAVVDR 333
 270             P +   G   + L   G     +AAH    A  + A ++      + S D V+  VVD
 271 Sbjct: 1074VPNETACGVARMCLRGAGAGDDSDAAH---NACSDAALLLTKLALARQSSDNVSVVVVDL 1244
 272
 273 Query: 334 VKR 336
 274             KR
 275 Sbjct: 1245RKR 1253
 276
 277
 278 >emb|Y08965|ATABI2RNA A.thaliana mRNA for ABI2 protein
 279            Length = 1470
 280
 281  Score = 46.9 bits (109), Expect = 8e-04
 282  Identities = 55/241 (22%), Positives = 100/241 (40%), Gaps = 7/241 (2%)
 283
 284 Query: 56  FRSENNCFLYGVFNGYDGNRVTNFVAQRLSAELL--LGQLNAEHAEADV-----RRVLLQ 108
 285            F    +   +GV++G+ G++V N+  +R+   L   + +   E  + D      ++ L
 286 Sbjct: 504 FNPHLSAHFFGVYDGHGGSQVANYCRERMHLALTEEIVKEKPEFCDGDTWQEKWKKALFN 683
 287
 288 Query: 109 AFDVVERSFLESIDDALAEKASLQSQLPEGVPQHQLPPQYQKILERLKTLEREISGGAMA 168
 289            +F  V+ S +E++  A           PE V                         G+ +
 290 Sbjct: 684 SFMRVD-SEIETVAHA-----------PETV-------------------------GSTS 752
 291
 292 Query: 169 VVAVLLNNKLYVANVGTNRALLCKSTVDGLQVTQLNVDHTTENEDELFRLSQLGLDAGKI 228
 293            VVAV+    ++VAN G +RA+LC+    G     L+VDH  + +DE  R+   G    +
 294 Sbjct: 753 VVAVVFPTHIFVANCGDSRAVLCR----GKTPLALSVDHKPDRDDEAARIEAAGGKVIRW 920
 295
 296 Query: 229 KQVGIICGQESTRRIGDYKVKYGYTDIDLLSAAKSKPIIAEPEIHGAQPLDGVTGFLVLM 288
 297                +      +R IGD  +K                +I +PE+   + +      L+L
 298 Sbjct: 921 NGARVFGVLAMSRSIGDRYLK--------------PSVIPDPEVTSVRRVK-EDDCLILA 1055
 299
 300 Query: 289 SEGLYKAL 296
 301            S+GL+  +
 302 Sbjct: 1056SDGLWDVM 1079
 303
 304
 305 >emb|AL010222|PFSC04009 Plasmodium falciparum DNA *** SEQUENCING IN PROGRESS *** from contig
 306             4-9, complete sequence [Plasmodium falciparum]
 307             Length = 5332
 308
 309  Score = 44.5 bits (103), Expect = 0.004
 310  Identities = 48/183 (26%), Positives = 83/183 (45%), Gaps = 15/183 (8%)
 311
 312 Query: 163  SGGAMAVVAVLLNNKLYVANVGTNRALLCKSTVDGLQVTQLNVDHTTE-NEDELFRLSQL 221
 313             S G  A V+V+  N LYVAN+G +R ++ K+     +   L VDH    N+ E  R+ +
 314 Sbjct: 2760 SSGTTACVSVIFKNMLYVANIGDSRCIISKNG----RAIVLTVDHRASINKKEQDRILKS 2593
 315
 316 Query: 222  GLDAGKIKQVGIICGQESTRRIGDYKVKYGYTDIDLLSAAKSKPIIAEPEIHGAQPLDGV 281
 317             G   G +   G + G     R        G+      +  K K +I EP++   +  D
 318 Sbjct: 2592 G---GILDDEGYLGGCLGVCR--------GFGSFHKKTKEKLKGLICEPDLFHIKLTDD- 2449
 319
 320 Query: 282  TGFLVLMSEGLYKALEAAHGPGQANQEIAAMIDTEFA---------KQTSLDAVAQAVV- 331
 321               FL++  +G++  + +          +    D + A         K+ SLD ++  VV
 322 Sbjct: 2448 DEFLIICCDGIFDVITSQEAVNTVKNSLIQSRDAKTAAEALCQLAYKKKSLDNLSVLVVI 2269
 323
 324 Query: 332  ----DRVKRIHSDTFASG 345
 325                 D+  ++ S   +SG
 326 Sbjct: 2268 FQNPDKNNKVSSINESSG 2215
 327
 328
 329 >gb|AC002409|ATAC002409 Arabidopsis thaliana chromosome II BAC T20B5 genomic sequence, complete
 330              sequence [Arabidopsis thaliana]
 331              Length = 72839
 332
 333  Score = 43.0 bits (99), Expect = 0.012
 334  Identities = 21/57 (36%), Positives = 38/57 (65%)
 335
 336 Query: 165   GAMAVVAVLLNNKLYVANVGTNRALLCKSTVDGLQVTQLNVDHTTENEDELFRLSQL 221
 337              G  A+ ++L+ NKL+VANVG +RA+LC++      ++++  D+ TE+E  L+ +  L
 338 Sbjct: 24355 GCTAIASLLVENKLFVANVGDSRAILCRAG-HPFALSKVR*DYHTESELSLYSIGAL 24188
 339
 340
 341 >emb|Z98762|SPAC4A8 S.pombe chromosome I cosmid c4A8
 342             Length = 43895
 343
 344  Score = 42.2 bits (97), Expect = 0.020
 345  Identities = 56/230 (24%), Positives = 104/230 (44%), Gaps = 20/230 (8%)
 346
 347 Query: 63   FLYGVFNGYDGNRVTNFVAQRLSAELLLGQLNAEHAEADVRRVLLQAFDVVERSFLESID 122
 348             F YG+F+G+ G   + F++  L   +    LN      D  ++L +   V    ++  +
 349 Sbjct: 3939 FFYGLFDGHGGTECSEFLSTNLGKIIENQDLN------DTEKILKEVHSV--GGYMAGLK 3784
 350
 351 Query: 123  DALAEKASLQSQLPEGVPQHQLPPQY-QKILERLKTLER----EISGGAMAVVAVLLNNK 177
 352                + +  LQS+  + + + +L   + Q  ++ L    R        GA+  VA++ +
 353 Sbjct: 3783 PPFSLRTVLQSRDEDLLWRARLYYSFLQADMDYLTNYARPSPDSAVPGAVGTVAIITSKN 3604
 354
 355 Query: 178  -----------LYVANVGTNRALLCKSTVDGLQVTQLNVDHTTENEDELFRLSQLGL--- 223
 356                        +++A+VG  RALLC S     +  +L   H   + +E  RL +  +
 357 Sbjct: 3603 NLSYWESDSYIIHLAHVGDTRALLCDSRTG--RAHRLTFQHHPADVEEARRLRRYNMGFS 3430
 358
 359 Query: 224  -DAGKIKQVGIICGQESTRRIGDYKVKYGYTDIDLLSAAKSKPIIAEPEIHGAQPLDGVT 282
 360              D+   K+   +    +TR  GD     GY         K   ++AEP++     L
 361 Sbjct: 3429 RDSFGQKRFAWVA---NTRSFGD-----GY-------KLKKLGVVAEPQLTSIHSLRDDW 3295
 362
 363 Query: 283  GFLVLMSEGL 292
 364              FL L+S+G+
 365 Sbjct: 3294 SFLTLLSDGI 3265
 366
 367
 368 >gb|AF006827|AF006827 Magnaporthe grisea adenylate cyclase (MAC1) gene, complete cds
 369             Length = 8678
 370
 371  Score = 41.0 bits (94), Expect = 0.045
 372  Identities = 63/259 (24%), Positives = 111/259 (42%), Gaps = 8/259 (3%)
 373
 374 Query: 14   QPSWTDDLPLCHLSGVGSASNR-SYS-ADGKGTESHPPEDSWL--KFRSENNCFLYGVFN 69
 375             QPS  +    C +   GS++    Y+ AD  G   H      +  +F +     L G+F+
 376 Sbjct: 5314 QPSIPEQSEDCRVRTSGSSAGYLPYAMADTLGKNEHLSTVDLVVPRFNASETETLLGLFD 5493
 377
 378 Query: 70   GY----DGNRVTNFVAQRLSAELLLGQLNAEHAEADVRRVLLQAFDVVERSFLESIDDAL 125
 379             G      G+++  ++ +        GQ+ A    A    +     D + R+FL +++  L
 380 Sbjct: 5494 GQALSSGGSKIAKYLHENF------GQILATELRALKTGLKETPEDALRRAFL-ALNKEL 5652
 381
 382 Query: 126  AEKASLQSQLPEGVPQHQLPPQYQKILERLKTLEREISGGAMAVVAVLLNNKLYVANVGT 185
 383                A   S+    VP H+   Q   IL +      +++ G +A V  L    LYVANVG
 384 Sbjct: 5653 VTIAIQHSEDRPSVP-HRSGSQAHVILNK-----EDLNSGGVATVVYLQGQDLYVANVGD 5814
 385
 386 Query: 186  NRALLCKSTVDGLQVTQLNVDHTTENEDELFRLSQLGLDAGKIKQVGIICGQESTRRIGD 245
 387              +A++ +S      +T+    H      E  R+ + G   G + + G +  Q    R
 388 Sbjct: 5815 AQAMIIQSDQTHKMLTR---KHDPAEPTERSRIREAG---GWVSRNGKLNDQLGVSR--- 5967
 389
 390 Query: 246  YKVKYGYTDIDLLSAAKSKPIIAEPEI 272
 391                 +GY  +DL+ A ++ P ++   I
 392 Sbjct: 5968 ---AFGY--VDLMPAVQAAPHVSHVAI 6033
 393
 394
 395 CPU time:    78.72 user secs.       0.85 sys. secs         79.57 total secs.
 396
 397   Database: Non-redundant GenBank+EMBL+DDBJ+PDB sequences
 398     Posted date:  Apr 16, 1998  9:38 AM
 399   Number of letters in database: 677,679,054
 400   Number of sequences in database:  336,723
 401
 402 Lambda     K      H
 403    0.313    0.130    0.370
 404
 405 Gapped
 406 Lambda     K      H
 407    0.270   0.0470    0.230
 408
 409
 410 Matrix: BLOSUM62
 411 Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
 412 Number of Hits to DB: 374080624
 413 Number of Sequences: 336723
 414 Number of extensions: 5779396
 415 Number of successful extensions: 37522
 416 Number of sequences better than 10: 214
 417 Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 32
 418 Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 85
 419 Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 35679
 420 Number of HSP's gapped (non-prelim): 445
 421 length of query: 504
 422 length of database: 225893018
 423 effective HSP length: 62
 424 effective length of query: 442
 425 effective length of database: 205016192
 426 effective search space: 90617156864
 427 frameshift window, decay const: 50,  0.1
 428 T: 13
 429 A: 40
 430 X1: 16 ( 7.2 bits)
 431 X2: 38 (14.8 bits)
 432 X3: 64 (24.9 bits)
 433 S1: 42 (21.9 bits)
 434 S2: 74 (33.2 bits)