t/data/echofilter.wublastn

   1 BLASTN 2.0MP-WashU [04-May-2006] [macosx-10.2-g4-ILP32F64 2006-05-07T21:56:24]
   2
   3 Copyright (C) 1996-2006 Washington University, Saint Louis, Missouri USA.
   4 All Rights Reserved.
   5
   6 Reference:  Gish, W. (1996-2006) http://blast.wustl.edu
   7
   8 Notice:  this program and its default parameter settings are optimized to find
   9 nearly identical sequences rapidly.  To identify weak protein similarities
  10 encoded in nucleic acid, use BLASTX, TBLASTN or TBLASTX.
  11
  12 Query=  ref|NM_003201.1| Homo sapiens transcription factor A, mitochondrial
  13     (TFAM), mRNA
  14         (1936 letters)
  15 >Unfiltered+1
  16 CCTCGCTAGTGGCGGGCATGATAACACACGCCGGAGGGTCGCACGCGGGTTCCAGTTGTG
  17 ATTGCTGGAGTTGTGTATTGCCAGGAGGCTCTCCGAGATTGGGGTCGGGTCACTGCCTCA
  18 TCCACCGGAGCGATGGCGTTTCTCCGAAGCATGTGGGGCGTGCTGAGTGCCCTGGGAAGG
  19 TCTGGAGCAGAGCTGTGCACCGGCTGTGGAAGTCGACTGCGCTCCCCCTTCAGTTTTGTG
  20 TATTTACCGAGGTGGTTTTCATCTGTCTTGGCAAGTTGTCCAAAGAAACCTGTAAGTTCT
  21 TACCTTCGATTTTCTAAAGAACAACTACCCATATTTAAAGCTCAGAACCCAGATGCAAAA
  22 ACTACAGAACTAATTAGAAGAATTGCCCAGCGTTGGAGGGAACTTCCTGATTCAAAGAAA
  23 AAAATATATCAAGATGCTTATAGGGCGGAGTGGCAGGTATATAAAGAAGAGATAAGCAGA
  24 TTTAAAGAACAGCTAACTCCAAGTCAGATTATGTCTTTGGAAAAAGAAATCATGGACAAA
  25 CATTTAAAAAGGAAAGCTATGACAAAAAAAAAAGAGTTAACACTGCTTGGAAAACCAAAA
  26 AGACCTCGTTCAGCTTATAACGTTTATGTAGCTGAAAGATTCCAAGAAGCTAAGGGTGAT
  27 TCACCGCAGGAAAAGCTGAAGACTGTAAAGGAAAACTGGAAAAATCTGTCTGACTCTGAA
  28 AAGGAATTATATATTCAGCATGCTAAAGAGGACGAAACTCGTTATCATAATGAAATGAAG
  29 TCTTGGGAAGAACAAATGATTGAAGTTGGACGAAAGGATCTTCTACGTCGCACAATAAAG
  30 AAACAACGAAAATATGGTGCTGAGGAGTGTTAAAAGTAGAAGATTGAGATGTGTTCACAA
  31 TGGATAGGCACAGGAAACCAGTTAGGTCTCAATACCTGAAGCTATCGTAAAATTAAGAAA
  32 GGATAAAGTTGGTAAACCTTTTATATTTAGTATCTTTTTATTCAGCTCATGGACTTCTGC
  33 CAGCATAATACTTGCTTTGGAAAACCCAGATAAAGGTTCATGCAAACTTTATTTTGTGTT
  34 TAGGAACTACTGAGGATCAGAGTAATCCAAGCAAATGTGAATCATTTTACCTTTGACAAA
  35 GGTAAATCAGACTATGAAGTTTTTTTTATACAGGATGATGACTATGGAAAGAGTACTCTT
  36 GTTTCCTTATATTATGGAGGCAGGAGTTTCGTTTTCAAAATTGTTACAAATTGTAGAAGC
  37 CACGGTGTTCTGTGATATAAGTGTGTGTTTTTCATAAAGCAGGCAGAACTCATCTAGGTA
  38 AATTACAGTTCCTAGGTATAATTCACATTGTATTCAGAGTTGATGGTTGTACATATAAGT
  39 GATTGCTGGTTTTAGTTGCAACTTTGTATAAAAGGGACTGAGAAATTTATAAACTTTTTT
  40 CTTACTGTCTTTTTTCTAAAGTAAAAACAAAGAAATTATGTGCCAGATTTATGCATATTA
  41 TTTTATGTTGCATAGAATAAAATTTTTAATCTTTAATTTTACATTTCCTAAATATATTTT
  42 AAGACGAAACATTTGTTCTATAGCTTTTCCCTTTTTTTAAGTAAGGAATTTTATTTTTTT
  43 CTGAATTATTTTCTCTCGTGAGTATATTGATCCAGAAAGAAAACTTGTATTATGTGTGTT
  44 TTAAAATGAGAAATCTAAAAAACGAAAAGTCTCCAAAGTCTCTGGAATTTGAAACACTTT
  45 GCATAACGTATAAAAGCCTGTTTAAGAGACAGCCAACTATGGCCTGTGGATCAAATCCAG
  46 CCTGCTGCCTGCTTTTTATGGCCTGTGAGCTAGGAATTGTGTTTATAATTTTAAATGTTT
  47 TTTTTTAAAGACTTTTATGATACTTGAAAATTAACATGAATATTTAGTGTTCATAAATAA
  48 AGTTTGTTGAAACACA
  49 >Unfiltered-1
  50 TGTGTTTCAACAAACTTTATTTATGAACACTAAATATTCATGTTAATTTTCAAGTATCAT
  51 AAAAGTCTTTAAAAAAAAACATTTAAAATTATAAACACAATTCCTAGCTCACAGGCCATA
  52 AAAAGCAGGCAGCAGGCTGGATTTGATCCACAGGCCATAGTTGGCTGTCTCTTAAACAGG
  53 CTTTTATACGTTATGCAAAGTGTTTCAAATTCCAGAGACTTTGGAGACTTTTCGTTTTTT
  54 AGATTTCTCATTTTAAAACACACATAATACAAGTTTTCTTTCTGGATCAATATACTCACG
  55 AGAGAAAATAATTCAGAAAAAAATAAAATTCCTTACTTAAAAAAAGGGAAAAGCTATAGA
  56 ACAAATGTTTCGTCTTAAAATATATTTAGGAAATGTAAAATTAAAGATTAAAAATTTTAT
  57 TCTATGCAACATAAAATAATATGCATAAATCTGGCACATAATTTCTTTGTTTTTACTTTA
  58 GAAAAAAGACAGTAAGAAAAAAGTTTATAAATTTCTCAGTCCCTTTTATACAAAGTTGCA
  59 ACTAAAACCAGCAATCACTTATATGTACAACCATCAACTCTGAATACAATGTGAATTATA
  60 CCTAGGAACTGTAATTTACCTAGATGAGTTCTGCCTGCTTTATGAAAAACACACACTTAT
  61 ATCACAGAACACCGTGGCTTCTACAATTTGTAACAATTTTGAAAACGAAACTCCTGCCTC
  62 CATAATATAAGGAAACAAGAGTACTCTTTCCATAGTCATCATCCTGTATAAAAAAAACTT
  63 CATAGTCTGATTTACCTTTGTCAAAGGTAAAATGATTCACATTTGCTTGGATTACTCTGA
  64 TCCTCAGTAGTTCCTAAACACAAAATAAAGTTTGCATGAACCTTTATCTGGGTTTTCCAA
  65 AGCAAGTATTATGCTGGCAGAAGTCCATGAGCTGAATAAAAAGATACTAAATATAAAAGG
  66 TTTACCAACTTTATCCTTTCTTAATTTTACGATAGCTTCAGGTATTGAGACCTAACTGGT
  67 TTCCTGTGCCTATCCATTGTGAACACATCTCAATCTTCTACTTTTAACACTCCTCAGCAC
  68 CATATTTTCGTTGTTTCTTTATTGTGCGACGTAGAAGATCCTTTCGTCCAACTTCAATCA
  69 TTTGTTCTTCCCAAGACTTCATTTCATTATGATAACGAGTTTCGTCCTCTTTAGCATGCT
  70 GAATATATAATTCCTTTTCAGAGTCAGACAGATTTTTCCAGTTTTCCTTTACAGTCTTCA
  71 GCTTTTCCTGCGGTGAATCACCCTTAGCTTCTTGGAATCTTTCAGCTACATAAACGTTAT
  72 AAGCTGAACGAGGTCTTTTTGGTTTTCCAAGCAGTGTTAACTCTTTTTTTTTTGTCATAG
  73 CTTTCCTTTTTAAATGTTTGTCCATGATTTCTTTTTCCAAAGACATAATCTGACTTGGAG
  74 TTAGCTGTTCTTTAAATCTGCTTATCTCTTCTTTATATACCTGCCACTCCGCCCTATAAG
  75 CATCTTGATATATTTTTTTCTTTGAATCAGGAAGTTCCCTCCAACGCTGGGCAATTCTTC
  76 TAATTAGTTCTGTAGTTTTTGCATCTGGGTTCTGAGCTTTAAATATGGGTAGTTGTTCTT
  77 TAGAAAATCGAAGGTAAGAACTTACAGGTTTCTTTGGACAACTTGCCAAGACAGATGAAA
  78 ACCACCTCGGTAAATACACAAAACTGAAGGGGGAGCGCAGTCGACTTCCACAGCCGGTGC
  79 ACAGCTCTGCTCCAGACCTTCCCAGGGCACTCAGCACGCCCCACATGCTTCGGAGAAACG
  80 CCATCGCTCCGGTGGATGAGGCAGTGACCCGACCCCAATCTCGGAGAGCCTCCTGGCAAT
  81 ACACAACTCCAGCAATCACAACTGGAACCCGCGTGCGACCCTCCGGCGTGTGTTATCATG
  82 CCCGCCACTAGCGAGG
  83
  84 Database:  NM_003201.fa
  85            1 sequences; 1936 total letters.
  86 Searching done
  87
  88                                                                      Smallest
  89                                                                        Sum
  90                                                               High  Probability
  91 Sequences producing High-scoring Segment Pairs:              Score  P(N)      N
  92
  93 ref|NM_003201.1| Homo sapiens transcription factor A, mit...  9680  0.        1
  94
  95
  96 >ref|NM_003201.1| Homo sapiens transcription factor A, mitochondrial (TFAM),
  97             mRNA
  98         Length = 1936
  99
 100   Plus Strand HSPs:
 101
 102  Score = 9680 (1458.4 bits), Expect = 0., P = 0.
 103  Identities = 1936/1936 (100%), Positives = 1936/1936 (100%), Strand = Plus / Plus
 104
 105 Query:     1 CCTCGCTAGTGGCGGGCATGATAACACACGCCGGAGGGTCGCACGCGGGTTCCAGTTGTG 60
 106              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107 Sbjct:     1 CCTCGCTAGTGGCGGGCATGATAACACACGCCGGAGGGTCGCACGCGGGTTCCAGTTGTG 60
 108
 109 Query:    61 ATTGCTGGAGTTGTGTATTGCCAGGAGGCTCTCCGAGATTGGGGTCGGGTCACTGCCTCA 120
 110              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111 Sbjct:    61 ATTGCTGGAGTTGTGTATTGCCAGGAGGCTCTCCGAGATTGGGGTCGGGTCACTGCCTCA 120
 112
 113 Query:   121 TCCACCGGAGCGATGGCGTTTCTCCGAAGCATGTGGGGCGTGCTGAGTGCCCTGGGAAGG 180
 114              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115 Sbjct:   121 TCCACCGGAGCGATGGCGTTTCTCCGAAGCATGTGGGGCGTGCTGAGTGCCCTGGGAAGG 180
 116
 117 Query:   181 TCTGGAGCAGAGCTGTGCACCGGCTGTGGAAGTCGACTGCGCTCCCCCTTCAGTTTTGTG 240
 118              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119 Sbjct:   181 TCTGGAGCAGAGCTGTGCACCGGCTGTGGAAGTCGACTGCGCTCCCCCTTCAGTTTTGTG 240
 120
 121 Query:   241 TATTTACCGAGGTGGTTTTCATCTGTCTTGGCAAGTTGTCCAAAGAAACCTGTAAGTTCT 300
 122              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123 Sbjct:   241 TATTTACCGAGGTGGTTTTCATCTGTCTTGGCAAGTTGTCCAAAGAAACCTGTAAGTTCT 300
 124
 125 Query:   301 TACCTTCGATTTTCTAAAGAACAACTACCCATATTTAAAGCTCAGAACCCAGATGCAAAA 360
 126              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127 Sbjct:   301 TACCTTCGATTTTCTAAAGAACAACTACCCATATTTAAAGCTCAGAACCCAGATGCAAAA 360
 128
 129 Query:   361 ACTACAGAACTAATTAGAAGAATTGCCCAGCGTTGGAGGGAACTTCCTGATTCAAAGAAA 420
 130              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131 Sbjct:   361 ACTACAGAACTAATTAGAAGAATTGCCCAGCGTTGGAGGGAACTTCCTGATTCAAAGAAA 420
 132
 133 Query:   421 AAAATATATCAAGATGCTTATAGGGCGGAGTGGCAGGTATATAAAGAAGAGATAAGCAGA 480
 134              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135 Sbjct:   421 AAAATATATCAAGATGCTTATAGGGCGGAGTGGCAGGTATATAAAGAAGAGATAAGCAGA 480
 136
 137 Query:   481 TTTAAAGAACAGCTAACTCCAAGTCAGATTATGTCTTTGGAAAAAGAAATCATGGACAAA 540
 138              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139 Sbjct:   481 TTTAAAGAACAGCTAACTCCAAGTCAGATTATGTCTTTGGAAAAAGAAATCATGGACAAA 540
 140
 141 Query:   541 CATTTAAAAAGGAAAGCTATGACAAAAAAAAAAGAGTTAACACTGCTTGGAAAACCAAAA 600
 142              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143 Sbjct:   541 CATTTAAAAAGGAAAGCTATGACAAAAAAAAAAGAGTTAACACTGCTTGGAAAACCAAAA 600
 144
 145 Query:   601 AGACCTCGTTCAGCTTATAACGTTTATGTAGCTGAAAGATTCCAAGAAGCTAAGGGTGAT 660
 146              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147 Sbjct:   601 AGACCTCGTTCAGCTTATAACGTTTATGTAGCTGAAAGATTCCAAGAAGCTAAGGGTGAT 660
 148
 149 Query:   661 TCACCGCAGGAAAAGCTGAAGACTGTAAAGGAAAACTGGAAAAATCTGTCTGACTCTGAA 720
 150              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151 Sbjct:   661 TCACCGCAGGAAAAGCTGAAGACTGTAAAGGAAAACTGGAAAAATCTGTCTGACTCTGAA 720
 152
 153 Query:   721 AAGGAATTATATATTCAGCATGCTAAAGAGGACGAAACTCGTTATCATAATGAAATGAAG 780
 154              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155 Sbjct:   721 AAGGAATTATATATTCAGCATGCTAAAGAGGACGAAACTCGTTATCATAATGAAATGAAG 780
 156
 157 Query:   781 TCTTGGGAAGAACAAATGATTGAAGTTGGACGAAAGGATCTTCTACGTCGCACAATAAAG 840
 158              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159 Sbjct:   781 TCTTGGGAAGAACAAATGATTGAAGTTGGACGAAAGGATCTTCTACGTCGCACAATAAAG 840
 160
 161 Query:   841 AAACAACGAAAATATGGTGCTGAGGAGTGTTAAAAGTAGAAGATTGAGATGTGTTCACAA 900
 162              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163 Sbjct:   841 AAACAACGAAAATATGGTGCTGAGGAGTGTTAAAAGTAGAAGATTGAGATGTGTTCACAA 900
 164
 165 Query:   901 TGGATAGGCACAGGAAACCAGTTAGGTCTCAATACCTGAAGCTATCGTAAAATTAAGAAA 960
 166              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167 Sbjct:   901 TGGATAGGCACAGGAAACCAGTTAGGTCTCAATACCTGAAGCTATCGTAAAATTAAGAAA 960
 168
 169 Query:   961 GGATAAAGTTGGTAAACCTTTTATATTTAGTATCTTTTTATTCAGCTCATGGACTTCTGC 1020
 170              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171 Sbjct:   961 GGATAAAGTTGGTAAACCTTTTATATTTAGTATCTTTTTATTCAGCTCATGGACTTCTGC 1020
 172
 173 Query:  1021 CAGCATAATACTTGCTTTGGAAAACCCAGATAAAGGTTCATGCAAACTTTATTTTGTGTT 1080
 174              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175 Sbjct:  1021 CAGCATAATACTTGCTTTGGAAAACCCAGATAAAGGTTCATGCAAACTTTATTTTGTGTT 1080
 176
 177 Query:  1081 TAGGAACTACTGAGGATCAGAGTAATCCAAGCAAATGTGAATCATTTTACCTTTGACAAA 1140
 178              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179 Sbjct:  1081 TAGGAACTACTGAGGATCAGAGTAATCCAAGCAAATGTGAATCATTTTACCTTTGACAAA 1140
 180
 181 Query:  1141 GGTAAATCAGACTATGAAGTTTTTTTTATACAGGATGATGACTATGGAAAGAGTACTCTT 1200
 182              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183 Sbjct:  1141 GGTAAATCAGACTATGAAGTTTTTTTTATACAGGATGATGACTATGGAAAGAGTACTCTT 1200
 184
 185 Query:  1201 GTTTCCTTATATTATGGAGGCAGGAGTTTCGTTTTCAAAATTGTTACAAATTGTAGAAGC 1260
 186              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187 Sbjct:  1201 GTTTCCTTATATTATGGAGGCAGGAGTTTCGTTTTCAAAATTGTTACAAATTGTAGAAGC 1260
 188
 189 Query:  1261 CACGGTGTTCTGTGATATAAGTGTGTGTTTTTCATAAAGCAGGCAGAACTCATCTAGGTA 1320
 190              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191 Sbjct:  1261 CACGGTGTTCTGTGATATAAGTGTGTGTTTTTCATAAAGCAGGCAGAACTCATCTAGGTA 1320
 192
 193 Query:  1321 AATTACAGTTCCTAGGTATAATTCACATTGTATTCAGAGTTGATGGTTGTACATATAAGT 1380
 194              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195 Sbjct:  1321 AATTACAGTTCCTAGGTATAATTCACATTGTATTCAGAGTTGATGGTTGTACATATAAGT 1380
 196
 197 Query:  1381 GATTGCTGGTTTTAGTTGCAACTTTGTATAAAAGGGACTGAGAAATTTATAAACTTTTTT 1440
 198              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199 Sbjct:  1381 GATTGCTGGTTTTAGTTGCAACTTTGTATAAAAGGGACTGAGAAATTTATAAACTTTTTT 1440
 200
 201 Query:  1441 CTTACTGTCTTTTTTCTAAAGTAAAAACAAAGAAATTATGTGCCAGATTTATGCATATTA 1500
 202              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203 Sbjct:  1441 CTTACTGTCTTTTTTCTAAAGTAAAAACAAAGAAATTATGTGCCAGATTTATGCATATTA 1500
 204
 205 Query:  1501 TTTTATGTTGCATAGAATAAAATTTTTAATCTTTAATTTTACATTTCCTAAATATATTTT 1560
 206              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207 Sbjct:  1501 TTTTATGTTGCATAGAATAAAATTTTTAATCTTTAATTTTACATTTCCTAAATATATTTT 1560
 208
 209 Query:  1561 AAGACGAAACATTTGTTCTATAGCTTTTCCCTTTTTTTAAGTAAGGAATTTTATTTTTTT 1620
 210              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211 Sbjct:  1561 AAGACGAAACATTTGTTCTATAGCTTTTCCCTTTTTTTAAGTAAGGAATTTTATTTTTTT 1620
 212
 213 Query:  1621 CTGAATTATTTTCTCTCGTGAGTATATTGATCCAGAAAGAAAACTTGTATTATGTGTGTT 1680
 214              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215 Sbjct:  1621 CTGAATTATTTTCTCTCGTGAGTATATTGATCCAGAAAGAAAACTTGTATTATGTGTGTT 1680
 216
 217 Query:  1681 TTAAAATGAGAAATCTAAAAAACGAAAAGTCTCCAAAGTCTCTGGAATTTGAAACACTTT 1740
 218              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219 Sbjct:  1681 TTAAAATGAGAAATCTAAAAAACGAAAAGTCTCCAAAGTCTCTGGAATTTGAAACACTTT 1740
 220
 221 Query:  1741 GCATAACGTATAAAAGCCTGTTTAAGAGACAGCCAACTATGGCCTGTGGATCAAATCCAG 1800
 222              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223 Sbjct:  1741 GCATAACGTATAAAAGCCTGTTTAAGAGACAGCCAACTATGGCCTGTGGATCAAATCCAG 1800
 224
 225 Query:  1801 CCTGCTGCCTGCTTTTTATGGCCTGTGAGCTAGGAATTGTGTTTATAATTTTAAATGTTT 1860
 226              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227 Sbjct:  1801 CCTGCTGCCTGCTTTTTATGGCCTGTGAGCTAGGAATTGTGTTTATAATTTTAAATGTTT 1860
 228
 229 Query:  1861 TTTTTTAAAGACTTTTATGATACTTGAAAATTAACATGAATATTTAGTGTTCATAAATAA 1920
 230              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231 Sbjct:  1861 TTTTTTAAAGACTTTTATGATACTTGAAAATTAACATGAATATTTAGTGTTCATAAATAA 1920
 232
 233 Query:  1921 AGTTTGTTGAAACACA 1936
 234              ||||||||||||||||
 235 Sbjct:  1921 AGTTTGTTGAAACACA 1936
 236
 237
 238 Parameters:
 239   echofilter
 240
 241   ctxfactor=2.00
 242   E=10
 243
 244   Query                        -----  As Used  -----    -----  Computed  ----
 245   Strand MatID Matrix name     Lambda    K       H      Lambda    K       H
 246    +1      0   +5,-4           0.192   0.182   0.357    same    same    same
 247                Q=10,R=10       0.104   0.0151  0.0600    n/a     n/a     n/a
 248    -1      0   +5,-4           0.192   0.182   0.357    same    same    same
 249                Q=10,R=10       0.104   0.0151  0.0600    n/a     n/a     n/a
 250
 251   Query
 252   Strand MatID  Length  Eff.Length     E    S  W   T   X   E2     S2
 253    +1      0     1936      1936       9.2  89 11 n/a  73  0.042   83
 254                                                      134  2.1     89
 255    -1      0     1936      1936       9.2  89 11 n/a  73  0.042   83
 256                                                      134  2.1     89
 257
 258
 259 Statistics:
 260
 261   Database:  NM_003201.fa
 262    Title:  NM_003201.fa
 263    Posted:  7:39:50 PM CET Nov 2, 2007
 264    Created:  7:39:50 PM CET Nov 2, 2007
 265    Format:  XDF-1
 266    # of letters in database:  1936
 267    # of sequences in database:  1
 268    # of database sequences satisfying E:  1
 269   No. of states in DFA:  257 (257 KB)
 270   Total size of DFA:  344 KB (2092 KB)
 271   Time to generate neighborhood:  0.00u 0.00s 0.00t   Elapsed:  00:00:00
 272   No. of threads or processors used:  1
 273   Search cpu time:  0.00u 0.01s 0.01t   Elapsed:  00:00:00
 274   Total cpu time:  0.00u 0.01s 0.01t   Elapsed:  00:00:00
 275   Start:  Fri Nov  2 19:42:26 2007   End:  Fri Nov  2 19:42:26 2007