Bio::DB::TFBS namespace has been moved to its own distribution named after itself
[bioperl-live.git] / t / data / humts1.pal
blob1bfff1bc2872f2393b0f082ccc371360775496ef
1 Palindromes of:  HUMTS1 
2 Sequence length is: 18596 
3 Start at position: 1
4 End at position: 18596
5 Minimum length of Palindromes is: 10 
6 Maximum length of Palindromes is: 100 
7 Maximum gap between elements is: 100 
8 Number of mismatches allowed in Palindrome: 0
12 Palindromes:
13 126   caaaaaaaaaaaaaaaa   142
14       |||||||||||||||||
15 217   gtttttttttttttttt   201
17 127   aaaaaaaaaaaaaaaa   142
18       ||||||||||||||||
19 215   tttttttttttttttt   200
21 127   aaaaaaaaaaaaaaaa   142
22       ||||||||||||||||
23 214   tttttttttttttttt   199
25 127   aaaaaaaaaaaaaaaa   142
26       ||||||||||||||||
27 213   tttttttttttttttt   198
29 127   aaaaaaaaaaaaaaaa   142
30       ||||||||||||||||
31 212   tttttttttttttttt   197
33 127   aaaaaaaaaaaaaaaa   142
34       ||||||||||||||||
35 211   tttttttttttttttt   196
37 127   aaaaaaaaaaaaaaaa   142
38       ||||||||||||||||
39 210   tttttttttttttttt   195
41 127   aaaaaaaaaaaaaaaa   142
42       ||||||||||||||||
43 209   tttttttttttttttt   194
45 127   aaaaaaaaaaaaaaaa   142
46       ||||||||||||||||
47 208   tttttttttttttttt   193
49 127   aaaaaaaaaaaaaaaa   142
50       ||||||||||||||||
51 207   tttttttttttttttt   192
53 127   aaaaaaaaaaaaaaaa   142
54       ||||||||||||||||
55 206   tttttttttttttttt   191
57 127   aaaaaaaaaaaaaaaa   142
58       ||||||||||||||||
59 205   tttttttttttttttt   190
61 127   aaaaaaaaaaaaaaaagaccgccagggct   155
62       |||||||||||||||||||||||||||||
63 204   ttttttttttttttttctggcggtcccga   176
65 2278  catttttaac  2287
66       ||||||||||
67 2351  gtaaaaattg  2342
69 3960  agcccagacc  3969
70       ||||||||||
71 4056  tcgggtctgg  4047
73 4367  gattgagaaa  4376
74       ||||||||||
75 4449  ctaactcttt  4440
77 4368  attgagaaat  4377
78       ||||||||||
79 4399  taactcttta  4390
81 4387  gaaatttctc  4396
82       ||||||||||
83 4411  ctttaaagag  4402
85 4408  tttctttgatt  4418
86       |||||||||||
87 4456  aaagaaactaa  4446
89 4428  tttctttgatt  4438
90       |||||||||||
91 4456  aaagaaactaa  4446
93 6809  cataggcatg  6818
94       ||||||||||
95 6839  gtatccgtac  6830
97 11270 atgtttccaa 11279
98       ||||||||||
99 11339 tacaaaggtt 11330
101 14171 ttacctgaat 14180
102       ||||||||||
103 14208 aatggactta 14199