Bio::DB::TFBS namespace has been moved to its own distribution named after itself
[bioperl-live.git] / t / data / map_hem / HEM15.ups.fa_
blobe177566ab242484489b6850428ee79823f6abe40
1 >SGD_Scer_YOR176W HEM15 "Ferrochelatase, a mitochondrial inner membrane protein, catalyzes the insertion of ferrous iron into protoporphyrin IX, the eighth and final step in the heme biosynthetic pathway; Yfh1p mediates the use of iron by Hem15p"
2 TCTTTAAACGTTCTTTTTTTTACTGCTAAATTTGTCCAAATAGCAGGTATGTGTTAAATA
3 TTTCTGTACTTCTTGTAAACCGACTCAAGTGGAACACGAGAATTTACGCTTGTTTGGTGT
4 CAAGCCAAGAGTGACCTTGACCGACCAAAAGTATTCCTTCGCGTCCTCCTTCTTCAATCC
5 CATATCCCCTACGAAAAAAAGCAGCATGAGAAAACGAAGGGCAGCAACTCCTTCGTCATA
6 TAAGGCTTACGGTGACCATTGAAGATTGGGCATGTCTAACGGCTATTGCCAGCGGAGATG
7 TTTCAAGGCATCCTACACATGCTACATATTTGTAATTATTTTACTGAGTTTGTGTATATA
8 AAAAACTTTTTTAAAAAAAAAAAATGGCCAGCATCCTCTTTCATGTAAAGCTGTTGAACC
9 TTCCTGAAATTTACTTCTAAAATTGTTCAGTAAAACTGCTTGTTAAAAGTGCGAAGAGTT
10 CTTTTTTAGCTTTTTTTGTCCTGCTGTTGAGCTGTTTTGCTTTACTGTTCAACAAAACAT
11 TGAAGATCTTTCACATTGCGCGTCGAAACCACAAACCGTCGAAAACAATGGTCATCTAAA
12 TAAAGGGTTCTTATTAAACAGATTTAAAGCCAAGGACAAAATACAGGCACAGGTCAAGCA
13 AGAAGACAAACCGCATACGCCAAGACAAACCGTGGTGATTTAATTCTGCTGCTGATCGCT
14 TCCAACA
15 >MIT_Spar_c278_20970 YOR176W 5' untranslated region, Contig c278 32746 - 34745, 2000 bp (revcom)
16 TCTTCAAACGTTCTTTTCCTACTACTAAGCTTTTCAATAAATAGCGGGTATATGCTAAAT
17 ACTTCTTTGCTTCTTGTACGACCTACTTAATTGAAATACGGATATTTTTGCTTGCTTGGT
18 GCCAAACCAAGAGTGACCTTGACCGACTAAAAGTATTCCTTCGCGTCCTCCTTCTTCAAT
19 CCCATATCCCCTACTGAAAAAAGCAGCGTGCGAAAATGAAGGGCAGCAACTCCTTCGTCA
20 TATAAGGCTTAGGTAATCTTTCAAGGTCAGGTATATCCAGCTGTCGTTACGAGTAGAGAT
21 ATTTCAAGCTGTCCTGCACATGCTACATATTTGTGATTATTTTTATTGAGTTGCGTATAT
22 AAAAAAACAATCTAAAAAAAAAAAAAATGGCCAGCATCTTCTTCCATGTAAAGCTGTTGA
23 ACCTTGCTAAAATCTATTACTATAATTGTTCAGTAAAGTTGCTTGTTAAAAATGCGAAGA
24 GTCTTTTTTAGCTTTTTTTGCCCTGCTGTTGAGCTGTTTTGCTTCACTGTTCAACAAAAC
25 AGTGAAGATCTTTCGAATTGCGCGTCGAAACCACAAACCGTCGAAAATAATGGTCATCTA
26 AATAAAGGGTTCTTATTTGAACAGATTTAAAGCTCAAAGACACGATACAGGCACAGGTCC
27 AGAAAGAATACAAAACGCAAACGCCAAGACAAATTGTGGTAATTTCATTCTGCTGCTGAT
28 CACTGCC
29 >MIT_Smik_c935_20455 YOR176W 5' untranslated region, Contig c935 1803 - 3802(revcom), 2000 bp (revcom)
30 TCTTGAATTGCAATTTTCTACTACTGAAGTTACCAACAATTAGCAAATATGTGATGAGTC
31 CTTTTTACGTTCTTGTATAACCTAAGTTAAATACAAAGGTTTATGCTCCTTTAATGATCA
32 GACCAACAGTGATCTTGGCCGACCAAAAGACTCCTTCGCGTCCTCCTTCTTCAAGTCTCA
33 TATCCCCTACCAGAAAAAGTAGCAGGCGAAAATAAAGAGCAACTGCTCCCCCCCATATAG
34 AGCTTACCATAATTTCTCAAGGAAAGGTATCTCCAGTTGTCGTAAAGAATAAAGAAGTTT
35 CAACGTGTCCTGCATGTTCTACAAATTTGCAATTGACTTTACTAAGTTGCATATATAAAA
36 CTTGTATTAGATAAGTTAGCCAGCATTTTCATTCAAGCTAAGATGTTGAATATGCCAAAG
37 CACATTGCTGAAATTAATCAGTAAAGCTGCTTGCTGAAAGTGGAAATATTTTCAGCTTTT
38 TTTGCTCTGCTGTTGAGCTGTTTTACTTCATTGTTCAACAAAACAATAGAGTTCTCTCCA
39 ATTGCGCGTCAAAACCACAAACCGTCGAAAATAATGATCATCTAAATAAAAGAGTTCACG
40 TTTTCACATATTTAAAGTTGAAATACTCCATACAGGCACAGGTCTAACAAGAAGACAACG
41 CATTCGATAAAACTAATCGTGGTAATTTTTATATCGCTGCTAGCCACTACCAACAATGTA
42 CAATTTT
43 >WashU_Scas_Contig526.5 YOR176W 5' untranslated region, Contig c526 10822 - 11487(revcom), 2000 bp (revcom)
44 TGTTCTCCTTACTCTTCTGATTGTAGCTTTGAATAAGAGAGTCTCACAACTTCAATTGGG
45 TATCCTTGGGTATGACGATTCAATTAAAGTGATATAACAAAGCTTTTATGTTTGTGTGCT
46 TAGTAATTAGACATGGGAAAAAAGACCGTTGTGCAGTGTACAAAGGTCAAATCCGTGATA
47 AGTGAGAAAAATCCAAAAATTGGCCTAAGGGCTTCCTTAATTTTTTCAATAACCCGAATG
48 GCTAAAAATCATGGGGGCATCAGGGTAATTTTTATAGGGCGAAAATCATTGATGTAAGCA
49 GGTAAATGTAGAAGTAACCTTTATTTAGACATATATTATATATATCATTCCAAGTTGAGT
50 TCCTTTGTTAATCTTAAAGCATCATTTAAAGTACAATCTGTGATATTGATTGACCCCAAT
51 TTAATTCTAAGTAAGAAGGACCGTATGATACAAAGATCCTCAAACATTTGATCTGAGAGT
52 TGGCTTTTTCTTTTGTCAAATATTTGTGCCGCCAAGCTGAACAGTCTCTCAGCATGAATC
53 GATGTCGATGGAATACAATGGAATAATTTATTAGCTAATGATAACAGTGGAAACTCTCTT
54 TTATGCCTTGACCAGAATATATTATCTGCCCCCACAATCATCTGGACTTGGCGGTCGAAT
55 GGCGAC
56 >WashU_Skud_Contig2050.4 YOR176W 5' untranslated region, Contig c2050 12271 - 14270(revcom), 2000 bp (revcom)
57 TCTTAGTTTATAGCTTTTCTACTACTCTGGTCATAAACGAACAGAAGATAAGCAAGAAAT
58 CTTTTTTTCCTTCTTTTACGGTCTATTCAAGTGAAGCACGGGGATTCCCGCTTGTTTAAT
59 AATCAGACCAACAATGATATTGACCGACCAAAAGAAGTATTCCTTCGCGTGCTTCTCCTT
60 TCTGTGTCAAATCCCCTACTGAAAAAGCAGCATTGGGAAAGGAACAGCAGCTTCTCCTTC
61 GTCGCAGAGAGCTCGCGGTAGCATTTCATTGTCAGGTATTTATGATATTTGCTAAGAATA
62 ATTAAAATGTCTTCAGGTCTTGCACATACTCCTACATATTTGTAAGTATTTTACTGATTT
63 GAGTATATAAAAGCCGTACTAAAACTAACCAGCACCTGTAGCAAGGTGCAAAATGTTGAA
64 CCTTTCCGAAATTTATTGCCAGAAACCAAGAGCTAAAAGTGCTTGGTAAAAGTGAAAAGA
65 CTCTTTTTCAGCTGTTTTTTGTTCTGCTGTTGAGCTGTTTTGTTCCATCTGTTCAACAAA
66 ACAGCTTCACTGGATCTTTCAAAGTGCGCGTCGAAACCACAAACCGTCGAAAATATTGAT
67 CATCTAAATAAAGGGTTCTTATTTGCACAGTTTCGCATTGAAATATTCCATTCAGGCACA
68 GATCAACAAGAAGACAAAAAGGTATTCGAGAAGACTAATTGTGGTATTTTTACTTTGCTG
69 CTGACCA
70 >WashU_Sbay_Contig480.2 YOR176W 5' untranslated region, Contig c480 3444 - 5443(revcom), 2000 bp (revcom)
71 TTTCAGGGAAGCACCATGTGCACGAATTGTTCTAGAAAGCATTTTTGGTTCGTAAATTCT
72 CTACAACTGAACTTATTAACAAATAGCAAACAGAGAAGAAAATTTTTTTTTTCCTTCTTG
73 TATGGTCAGTTAGTTGAAAACACGGAGATTTTCACTTGTTTAGTAAGCAGAGCCATAATG
74 CTCTTGACCGACCAAAAGAAGTATTCCTACGCGAGCTCCCTCTTCAAGTGCCAAATCCCC
75 TACTGAAAAAAGCAACATGAGAAGCAAAGAGATGCCTCTCGCCATGCAGGGCTTGCGGTC
76 ATGTTTTCTACGTTCAATTGATTTTGTTACAGCTGAAAGATGTTTATAAAACTGTCTTGC
77 ATATGCTCTATTTACTTGTAAACAATTTTATTAAGTTGCGTATATATGATCGTACTAAAA
78 ATTGGCTGGCGCGTTCTCCAGGCAGAGTTGGTTGAACCTTGCTCGAATTGATAGCTCAAA
79 GTGGAGAGACTCTTTTTTAGCTGTTTTTTGTTCTGCTGTTGAGCTGTTTTGCTCCACCTG
80 TTCAACAAAATGGCAGAGATCTTTCGAAGTGCGCGTCGAAACCACAAACCATCAAAAATA
81 TCGACCATCTAAATAAAGGGTTCTTGTTTGAATAAATATCAGGCGAAGCTCTTCATACAG
82 GCACAGGTCAGATAAGAAGACAATTCGAATTCGAGAAGGATATTCGTGGTATCTTTAATC
83 TGCTGCT