Bio::DB::TFBS namespace has been moved to its own distribution named after itself
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blob5ff0e5a1b408e5cea0a8b8af82b1b3fd10d4d7e9
1 >SGD_Scer_YGL040C HEM2 "Delta-aminolevulinate dehydratase, a homo-octameric enzyme, catalyzes the conversion of delta-aminolevulinic acid to porphobilinogen, the second step in the heme biosynthetic pathway; localizes to both the cytoplasm and nucleus"
2 GGTTTTGTCAATTTTCTAGGTATGAATTACTGGAGTAAGCAATAATATGAGTAAGCAGTA
3 AAACTTTTTTTTATTTGGCTGATTGGGCAAGAAAATCAAAGACAATAGAGTGGCGCATAG
4 ATGTTGCTAGCATTTATTAGGTTGCCTTACTCTTATATAAATCAAGCGGGAAGCTTGCCT
5 CAAGCCAATCACCGCACCGAACAGGGATTGCTCGTTTACCCGTATTTTGATTTTTTTTTC
6 ACCTTTTCCAATTTTTTTTTCGGCAACAATTTTTTGGATGATTTTTATCGTCGATCTTGG
7 AATGATGATGTATTTCGGCGTCTCTACAAGACCCAATAAAGTAATTCGGTGACACAGGCT
8 TGTAGCAGATAGAAAACGTTCCGAAAGATGGGTTCCAATTGATGTAACACTTCTTTTTTA
9 TATATTCATGTGGACGTGTACGCCTTCTTCCCTTCTTTGCCTCTTGTGCCACTGTTAATC
10 CTCTTAAGCATATTGTTTTTATTTACAGACATTGGCTGACTCACCAGAAACTATAATTGA
11 CGCTGATTTCTAGTTAATTAAAAATAAAATATATGCAAGAATTAGCACCAGGCAGTCATT
12 TCTGTAAATTGCTTTGTTTTCTATTTCAAATTTGTTTTTTGTATATGTTTCAATGTTCTC
13 GTGACAATGCAGGCTTTTTTTTGTGCGAATTAAAGTAAAGCTAATCAAAACTAAACAATA
14 ATTTATCTTGTTCCCGAAAGAGTGGATCATGAGGAGGAAAGCTAACCGTCCAAGATCCTA
15 TATAATTTTTGAACTGAAAACCAACTGTTCACCTAGAAGACAGGTATCTGGATATGTAAC
16 TACACGCTCTATAAATACAGAAATCGTAAGCTAATCAATATAAATGTAAAAGAAAATAGG
17 AATTGCTGTCGATAGATTTATTTACTTTTGTATTGTCATCTGTGTTCTGTGCCAGTACAC
18 CGGACTCGTATGAGCTGTATGGTGTCGTTTCAATAGAATC
19 >MIT_Spar_c19_8512 YGL040C 5' untranslated region, Contig c19 1 - 1802, 2000 bp (revcom)
20 GGTTTTGTCAATATTCTAAATATGGATTCCTAGGGCAGGCAATAATATGGGGAAGCAGTA
21 AAACTTTTTGTTTTATGTGGCTGATTGGGCCAAAAAACAAGGACAATAGAATGACACATA
22 AAGTTTGCTAGCATTTATTAGGTTGCCTTACTCTTTTATAAATCAAGCGGGCAGCTTGCC
23 TCAGGCCAATCACCGCACCGAACAGGGATTGCTCGTTTACCCGTAGTTTGAATTTTTTTT
24 TCACCTTTTGAAATTTTTTTTTTTCGGCAACAATTTTGAATGACTTTTATCGTCAATCTT
25 GGGAGTATACCTGCCTCTTTACAACACCCAACAAAACACTTAAGTAAGACAAGCTTGTGG
26 CAGGTAGGAAAGGTTTCAAAAAAAAAAAAAAGGTTTTTATCTATGGTCATACTTTTTCTT
27 CGTATATTTATGTGAACACGTACGTCTTGTTTTGCCTTCTTTGGCTCTTGTGTCACTGAA
28 TCTTCACATATTGTTTTTATTTACAGATACTACTTGACTCGCCTAAAATTATAATCGGCG
29 ATGGTTTCTACTACCTTAGTTAAAAAATAAAATGAATCAAAACATTACCATTAATAATTC
30 AATTTTTCCACATTAGTTTGTTTTCTATTTTATGGCTTTCTTCTTGTATATTTCTCAATA
31 TACTGCATGGCAATGCAAGCTCTTCTCTTTTCTTGATTGAAAATAAAGCTGTGAAGAACT
32 AAATAATAATTTATTGATGTCCTCCACAAAATGTACACCTGCGCTAACCTTGCTTAACAG
33 ATACGGTCAAAACGAACTTGAGCATATGTAAAAATCCATGTATTTTTCTTCTTTTGCCAA
34 CTAAATCAAACTTTTTATTGTATATGTCGTACCGCCAATACAAAGATGGAGAGGTTAATG
35 AAAATAGATGTGAAAAAAAAGCAGGAACTATTGTAGATAGATATTTTTAGGGTTCGATTG
36 CTATTTTTCTGTATTATGATCTGTGTTCTATGCCAGTGTA
37 >MIT_Smik_c273_7756 YGL040C 5' untranslated region, Contig c273 1 - 1807, 2000 bp (revcom)
38 GGTTTTACCAGTTTTCTTAATACGGATATCTAGAGTAAGTCACAATTTAAGGAAATTGCA
39 AAATTTTCTTTTTATATAGCTAAATAGGCCAATAAATCAGGAACAATAGAATGACGCACC
40 GAGTTTGCTAGCAACCTACACACTTGCTTTTTTTTATAAATCAAGAGTGTATGTTGCCTC
41 AGGCCAATCACCGCACCGAATAAGGATTGCTCGTTTACCCGTTGTTCGATTTTTTTTTTC
42 ATCTTCTACCAATTTTTTTCGGCAGCGCCTTTGAATGACTTTGATCATCAATCCTGGAGT
43 AATATACACTTGTATGTTTGAAACGCCCAGTTACAATATTTATTGGAATAGCTAACTTAT
44 GAGTAAGTGGACCCAAATTTTCGAGTGATGTTTCCTGTCAACGGTGACACTTATTTTTGG
45 TTTGCAGATATGTATGTGTATATCTTATTCCCACTTTTTTATAGTTATCGTTATCTATGT
46 ATCTCAATACCTTGGACATGAATCACCGAGTAGATATTTTTCTTTACAATGCTTAAAACA
47 AGGCCGCACAGAACTAAACAATAAAGTTACCTTGATCTTTAATAAAATATTCCCCCATTA
48 ATAAGTACTCTCTTCGATTACGATTTAGCCATATTCATTTTGACCATACATTGCAGATGT
49 GAGATGGATTTTAAGTGGTGAAAGCGCTCTAAGCTATGCCATATAAGTACGTAAGGAGAG
50 ACAAAATTAAACATAATTAAGCGCCATGTGAGACTAAATGTGGCCGTCGTTTTGATTATA
51 TGATTGGGAAAAGCTCCTAAACATAGAGGTAGAATTATAGTTCGGAAATTTCGTCTTGCC
52 CTGCTCATTTTGTAGAAAACGAGTCATCATCTCCACCCTTTGTAACCGGTGTCCTGCTCA
53 CATAAATAGTCTCTACTGAGAGATTTGTGAATTTCGAGATAATTTTTGGGATTCCATTGT
54 TGATAAAGGCAATATTATTAGGTATATAAAATATACTAGA
55 >MIT_Sbay_c77_8808 YGL040C 5' untranslated region, Contig c77 1 - 1377, 2000 bp (revcom)
56 ACTTTGTCAGTGTTTTTCTGGTAAGGATATCTGGAAGAAGTAACAATACGTATAAATTAC
57 AAAATTACCGTTTTATGTCGTGGAATGGGCTATGAACTAACATTAACAATAGAGTGATGC
58 ATAGACGTCACTAGCCTTTTATTGTGTTGCCTTGCTCTTTTATAAATCAGGCAGCCTGCC
59 GCAGGCCAATCACCGCACCGCCCGGAGATGCTCGTTTACCGTTGTGCACCAAATTTTTCA
60 TTTTTTGCCTTTTTCTATTTGGCAGCGTTTTCGAAAAATTTTGATCATTAGTCTTCAATG
61 ACTGGACTGTCATATTTTAGGGCACGCAGGTAAAGATATGAACAAATCATATTGATGATG
62 GATGCCAATCCTTCAATGTAAATTCTTTCTAAACATCATGATAAAGAACTTCAGTAAGAG
63 AGTGATAAAAACTTTACATGTATGGCGGGTGTATTCTGTAATTGTTTTTTAGATCTTTTT
64 GTTGTTAACGGTGACACCATTCTTACTACAATAATTGCATGTCAAATGTAAATATCTTGC
65 TTCACATTTCGTTGTTTCTTTACGATAAATTGTTTCGTCGCAAATATATCTTATTTTGCG
66 TGGTTTATCTACAGACACTGCTTGATTTACGCATAAGTACATCATGTAGTAATTCTTATA
67 TTGAGTATAAAACCATATGAATAGAAATATTTTTGTTAATCTATCGTTAATTTACATGCT
68 AGTTTATTTGTCCCTTTAAAATTTCTTTATATATTTGTTGCAATATGTGGACAAGGAAAC
69 ACGAAATATATTGGGATAAAGTTTAAGTAGAGATACATAGAACTAAACAATAAATTCATA
70 TTCAATAATACTTCAAAAGGTACTCTCCTGTCTGAACACAGAGACTCACAGACTTTATTT
71 AGTCGTTATGGCGATGTCAGACATCATGTTTAAGGTAAGCCGAGTGGATTGATATGAAAT
72 TGTCATATCATGAATAAGCTAATTACCCAAAAACAGTAAA
73 >WashU_Skud_Contig2052.17 YGL040C 5' untranslated region, Contig c2052 29967 - 31966, 2000 bp (revcom)
74 GATTTGTCAGTGTTTTCTGATATGGATGCCTGGAGAAAATATTAATATGTGGAAACCACA
75 AAACTTCCACTTATATAGCTAATTTAGCCAGAAATCATGAACAATAGGATGACGCATAGA
76 CGTCACTACTCTTCATATAAGTTGCCTTTCTCTTTTATAAATTGGGCAGGCAGCTTGCCT
77 CAGGCCAATCACCGCACCGAACAGGGATTGCTCGTTTACCCGTTGCGTTCAAAGTTTTTC
78 ATTTTCCGCATCATCTACTTTTTTTTTTTTGACGCCGTTTTTGAATGTCTTGGTCATTGA
79 TCTTGAAATGATTTATGTTCGTGTTTTCACGGCACAAAGGTAGGCAAATCGGTAAATTTT
80 ACTCGTAATAAATAATCAAGGCCTCTAGAGGATTTAATATCAGGAAATAATAATGTGAGT
81 TTTTTGCAAATGGCCTTATATTCCTGACATCTTCTTGAATTTGTGTTTTAGCGTCGATGA
82 AGACTCTTCCTTTTTTCGTACGGTAATCTGGACATCTTGTTTCGTCTTTTCTTTTTTTTT
83 TGCGATTGCTTGTAATTCCAGATATGCAGCATTTATTTACAGGTGCTGATTGATTTACTA
84 TAGAGTTTATCAGGTAGTAGTTCTTTTTCATGTCTCAATTGAAGAAAAGGAACCCATAAA
85 TACATTAGCACTGAACAAACAATAACTGCCGCATTGGTTTGTTTTCTAACTTGAATTTTT
86 CTTTATACATATGCCACTGTATTAGGATGGGTGAATACCGTTTTCTTACTTTCTTCCTAT
87 GAAGGCGAAAGAATGGTGAAGGACAACTAAACAATAAATCGTTTTTCACACATCCCCATA
88 AAGCTTTCTCTGTTTGTCAGTTGTGACTCATCTTTCGTCGATGTTGCTTGGTAGATACAA
89 TTGAACAAGATTGAGATATCTAAAATGTTCAAAAATTATACTCTCTTATGTAGTTTCCGT
90 CATGGCTGAACGAAGGAAAACTACATCACCTGAGAATTAC
91 >SGD_Scer_YOR278W HEM4 "Uroporphyrinogen III synthase, catalyzes the conversion of hydroxymethylbilane to uroporphyrinogen III, the fourth step in the heme biosynthetic pathway"
92 CTCTCGAGCAAGGTCTATTTTACCTTTCTGTTTCCTTATCCTTTGACACTAAAATTCAAA
93 AAACTCACTAGAAAGTTCACTAAAGCGCCTTAGCTGACTACAGCACAACCCAACCCCAAA
94 AACTAGTGAACTACACACTAAGAGAATTTATGGTATTTCCATAATTGAAGTATATGTACG
95 ATGTATACAATGTAAACAAGAGAGTAATGAAGTGAAGATATGTACACCTAGAGCGAACCA
96 ATGATAATTTGTTTTCTTAATTAAGAAAAACCATTAAAACTGGATTAGATTTCAATAATG
97 AAAAGCTAGGAACAAAAAAAATTGGTCTACTTCCAGCCATTTGCGCTTTATATAGACATA
98 TGGAGGCGTGATGTCTTAAGCATGGTAATCCGGAAGATCAGTTTATTGAATGATGGTTTT
99 CTTATCCTGAAGGATCCTGCAAATGAAGTAAGTTCAAAGAATTGAAATGAAATCGCCTTT
100 TATACCCTCGCCGCACCAAGGAGCGCGCTGTGAAAATTTTTCGCTTTATCTCTTAGGGCT
101 CCTACTGTCGGTAGAGAAAAGTTGAGTATATTTAAAGCATGAGGTAACTTTTCTGCCCAT
102 TTTTACTTCTATTTCCATTTGAATTCAGAAAAGTG
103 >MIT_Spar_c261_21317 YOR278W 5' untranslated region, Contig c261 32269 - 34268, 2000 bp (revcom)
104 CGTTCCAAGCAGGGTTTATTCTATTTCTCGGCTCCTTTACCCTGTAACTTCGAGATTCAA
105 AAACTCGCTATAACTTCACTAAAGCGCTTTAGTTGACTACAACACAACCCAACCCCAAAA
106 TAAACTGTCCAACTACACAATACCGAGGATAATCCACGATATTTCGGTGATTGAAGTATA
107 TGTATTACGTATGCAATGTAAGCAAGAAACTAACAAAATGAATATGTACACCTAGAGCGA
108 ACCAATGATAATTTGTTTTCTTAATAAAGAAAAACTATTAAAACTGGATTAGATTTCAAT
109 AATGAAAAGCTAGGAACAGAAAAATTGGTCTACTTCCAGCCATTTGCGCTTTATATAGAC
110 ATATGGAGGCGTGATGTCTTAAGCATGGTAATCCGGAAGATCAGTTTATTGAATGATGGT
111 TCTTTTATCCTGAAGGATAAACGGAAAGCTCCCGATTAAAAACAAGTATAGAGTACTGGA
112 ATAGAATCGCCTTTTATACCCTCCCTCGCCGCATCAAGAAGCGCGCTGTGAAAATTTTTC
113 GTTTTTCTCTTAGGGCTCCCATCCAACTGTCGGCGAGGAAAAGTTGTATATATTTAAAGC
114 ATGAGGTAACTTTGTTGCCCATTATCTTTTTTGTT
115 >MIT_Smik_c492_20940 YOR278W 5' untranslated region, Contig c492 3260 - 5259(revcom), 2000 bp (revcom)
116 ACTTTCAAACACACTCTGGTGTACTCCTCGGTCCCTTCATCTCATTTCTTCAAGATGCAG
117 AACTTCGCCGGAAGTAAACTAAAGTGCTTTAATTAATCAAAAGACAACTTAATTCCCAAA
118 CGGAAATGCAGGCTAGACAAACCGAAGATAATCCCCGATATTTCTGAGTTTAACAAATGT
119 ATGTATAATATGTATGCAATGTAGGCAAGAAAATAACGAAGTGAAGATATGTACACCTAG
120 AGCGAACCAATAATAATTTGTTTTCTTACTAAAGAAAAACTATTAAAACTGGATTAGATT
121 TCAATAATGAAAAGCTAGGAACAAAAGAAATTTGTCTACTTCCAGCCATTTGCGCTTTAT
122 ATAGACATATGGAGGCGTGATGTCTTAAGCATGGTAATCCGGAAGATCAGTTTATTGAAT
123 GATGGTTCTTTTAAACCAAAATTTAAAGAAAAATCTTAACGGTAATATGAGTAGGAGGTT
124 GGAATGGGATCGCTTTTTATACCCTCATTGTGATAAGAGACGCGCAGTGAAAAATTTTCG
125 CTTTTTCTTAGGGCTCCTATCTAACTCTCGGGCGAATAAATATCATGAATGTATTTAAAC
126 GTCAAGTTAGTTAAATGTTTGAGTCTGTTTCTTTT
127 >WashU_Skud_Contig1682.4 YOR278W 5' untranslated region, Contig c1682 3379 - 5378, 2000 bp (revcom)
128 CTCTTCAAACAGACTCCAATTCACTACTGAGCTCTTACCTTGTGACTTCAAGACTCACTA
129 CTCAGTTGAAAGACACGCTCAGTACCAAATTCGGCTGCGAGGCAACTAACGCCTTTAAAC
130 AGGTAGGTAAGGAACAATACCGAAAGGCCATCTCCGATGTTTCGAAGATTGGCAAATGTA
131 TATATTATGTATGCAATATAGGCAAGATGATAACGAAGTAGAGATATGTACACCTAGAGC
132 GAACCAATGATAATTTGTTTTCTTAATGAAGAAAGTATTAAAACTGGATTAGATTTCAAT
133 AATGAAAAGCTAGGAATAAAAGAGATTGGTCTACTTCCAGCCATTTGCGCTTTACATAGA
134 CATATGGAGGCGTGATGTCTTAAGCATGGTAATCCGGAAGATCAGTTTATTGAATGATGG
135 TTCTATTTAAAATGAAATCTAAAGATAAACCCTAGTCATAATCAAGTGGGTTGTGTTAAA
136 ATACAAGCACCTTTTATACTCTCGCAGCGTCAGTGGCGCGTTGTGAAAAATTTTCACTTT
137 TTCTCAGGGCTTTTACCCAACTGCCGACAAATAAAAGCCGTATTTAAGGAATGTGATTAG
138 TTTACTTTCCAATGCTTTCTCTTTTTTGTAGGGTA
139 >WashU_Sbay_Contig635.57 YOR278W 5' untranslated region, Contig c635 91073 - 93072, 2000 bp (revcom)
140 ACGTACAGATGGCGTCTCCTCCTTTCGCGAGCCCCTTGCCTTGTGACTTCAGCCTAACTT
141 CTTGACTAGAAGATACAACAAGAAATACTCAAATCGGTTATTGTGCAACTCATCCCTCAG
142 ACAGTTTGGTAAGAAACACCGAAGACTATTTCCGATATCTCAAAGAATGACAAAAGTATA
143 CATTATATATGCAAGAGAGGCAAGAAAAGAGTAAAAAAGAGTAAAAAAAACATGTACACC
144 TAGAGCGAACCAGTGATAATTTGCTTCTCAATGAAGAAAAAGCGATTAAAACTGGATTAG
145 ATTTCATTAAAGAAAAGCTAGGAACAAAGAAATTGGTCTACTTCCAGCCATTTGCGCTTG
146 ACATAGACATATGGAGGCGTGATGTCTTAAGCATGGTAATCCGGAAGATCAGTTTATTGA
147 ATGATGGCTCTTTTAAATTGAGATCTAAAAGAAATATCCTGGAAAAGAGTAGAGAAGAGT
148 CCAAACTGTAGGAATTCAATCGCTTTTTATACTCTCATCGCGGAAAAGACGCGCTGTGAA
149 AAATTTTCTCTTTTTCTTAGGGCTCCTATCCAGCTGCCTGCGAACAAAAGCCGTATTTAA
150 AGCATGATTTTCACTACTATGTATGTTCTTTCTGC