Bio::DB::TFBS namespace has been moved to its own distribution named after itself
[bioperl-live.git] / t / data / map_hem / HEM2.ups.fa_
blob5d84a1485746cc9481ec32022a27149b151d5e1d
1 >SGD_Scer_YGL040C HEM2 "Delta-aminolevulinate dehydratase, a homo-octameric enzyme, catalyzes the conversion of delta-aminolevulinic acid to porphobilinogen, the second step in the heme biosynthetic pathway; localizes to both the cytoplasm and nucleus"
2 GGTTTTGTCAATTTTCTAGGTATGAATTACTGGAGTAAGCAATAATATGAGTAAGCAGTA
3 AAACTTTTTTTTATTTGGCTGATTGGGCAAGAAAATCAAAGACAATAGAGTGGCGCATAG
4 ATGTTGCTAGCATTTATTAGGTTGCCTTACTCTTATATAAATCAAGCGGGAAGCTTGCCT
5 CAAGCCAATCACCGCACCGAACAGGGATTGCTCGTTTACCCGTATTTTGATTTTTTTTTC
6 ACCTTTTCCAATTTTTTTTTCGGCAACAATTTTTTGGATGATTTTTATCGTCGATCTTGG
7 AATGATGATGTATTTCGGCGTCTCTACAAGACCCAATAAAGTAATTCGGTGACACAGGCT
8 TGTAGCAGATAGAAAACGTTCCGAAAGATGGGTTCCAATTGATGTAACACTTCTTTTTTA
9 TATATTCATGTGGACGTGTACGCCTTCTTCCCTTCTTTGCCTCTTGTGCCACTGTTAATC
10 CTCTTAAGCATATTGTTTTTATTTACAGACATTGGCTGACTCACCAGAAACTATAATTGA
11 CGCTGATTTCTAGTTAATTAAAAATAAAATATATGCAAGAATTAGCACCAGGCAGTCATT
12 TCTGTAAATTGCTTTGTTTTCTATTTCAAATTTGTTTTTTGTATATGTTTCAATGTTCTC
13 GTGACAATGCAGGCTTTTTTTTGTGCGAATTAAAGTAAAGCTAATCAAAACTAAACAATA
14 ATTTATCTTGTTCCCGAAAGAGTGGATCATGAGGAGGAAAGCTAACCGTCCAAGATCCTA
15 TATAATTTTTGAACTGAAAACCAACTGTTCACCTAGAAGACAGGTATCTGGATATGTAAC
16 TACACGCTCTATAAATACAGAAATCGTAAGCTAATCAATATAAATGTAAAAGAAAATAGG
17 AATTGCTGTCGATAGATTTATTTACTTTTGTATTGTCATCTGTGTTCTGTGCCAGTACAC
18 CGGACTCGTATGAGCTGTATGGTGTCGTTTCAATAGAATC
19 >MIT_Spar_c19_8512 YGL040C 5' untranslated region, Contig c19 1 - 1802, 2000 bp (revcom)
20 GGTTTTGTCAATATTCTAAATATGGATTCCTAGGGCAGGCAATAATATGGGGAAGCAGTA
21 AAACTTTTTGTTTTATGTGGCTGATTGGGCCAAAAAACAAGGACAATAGAATGACACATA
22 AAGTTTGCTAGCATTTATTAGGTTGCCTTACTCTTTTATAAATCAAGCGGGCAGCTTGCC
23 TCAGGCCAATCACCGCACCGAACAGGGATTGCTCGTTTACCCGTAGTTTGAATTTTTTTT
24 TCACCTTTTGAAATTTTTTTTTTTCGGCAACAATTTTGAATGACTTTTATCGTCAATCTT
25 GGGAGTATACCTGCCTCTTTACAACACCCAACAAAACACTTAAGTAAGACAAGCTTGTGG
26 CAGGTAGGAAAGGTTTCAAAAAAAAAAAAAAGGTTTTTATCTATGGTCATACTTTTTCTT
27 CGTATATTTATGTGAACACGTACGTCTTGTTTTGCCTTCTTTGGCTCTTGTGTCACTGAA
28 TCTTCACATATTGTTTTTATTTACAGATACTACTTGACTCGCCTAAAATTATAATCGGCG
29 ATGGTTTCTACTACCTTAGTTAAAAAATAAAATGAATCAAAACATTACCATTAATAATTC
30 AATTTTTCCACATTAGTTTGTTTTCTATTTTATGGCTTTCTTCTTGTATATTTCTCAATA
31 TACTGCATGGCAATGCAAGCTCTTCTCTTTTCTTGATTGAAAATAAAGCTGTGAAGAACT
32 AAATAATAATTTATTGATGTCCTCCACAAAATGTACACCTGCGCTAACCTTGCTTAACAG
33 ATACGGTCAAAACGAACTTGAGCATATGTAAAAATCCATGTATTTTTCTTCTTTTGCCAA
34 CTAAATCAAACTTTTTATTGTATATGTCGTACCGCCAATACAAAGATGGAGAGGTTAATG
35 AAAATAGATGTGAAAAAAAAGCAGGAACTATTGTAGATAGATATTTTTAGGGTTCGATTG
36 CTATTTTTCTGTATTATGATCTGTGTTCTATGCCAGTGTA
37 >MIT_Smik_c273_7756 YGL040C 5' untranslated region, Contig c273 1 - 1807, 2000 bp (revcom)
38 GGTTTTACCAGTTTTCTTAATACGGATATCTAGAGTAAGTCACAATTTAAGGAAATTGCA
39 AAATTTTCTTTTTATATAGCTAAATAGGCCAATAAATCAGGAACAATAGAATGACGCACC
40 GAGTTTGCTAGCAACCTACACACTTGCTTTTTTTTATAAATCAAGAGTGTATGTTGCCTC
41 AGGCCAATCACCGCACCGAATAAGGATTGCTCGTTTACCCGTTGTTCGATTTTTTTTTTC
42 ATCTTCTACCAATTTTTTTCGGCAGCGCCTTTGAATGACTTTGATCATCAATCCTGGAGT
43 AATATACACTTGTATGTTTGAAACGCCCAGTTACAATATTTATTGGAATAGCTAACTTAT
44 GAGTAAGTGGACCCAAATTTTCGAGTGATGTTTCCTGTCAACGGTGACACTTATTTTTGG
45 TTTGCAGATATGTATGTGTATATCTTATTCCCACTTTTTTATAGTTATCGTTATCTATGT
46 ATCTCAATACCTTGGACATGAATCACCGAGTAGATATTTTTCTTTACAATGCTTAAAACA
47 AGGCCGCACAGAACTAAACAATAAAGTTACCTTGATCTTTAATAAAATATTCCCCCATTA
48 ATAAGTACTCTCTTCGATTACGATTTAGCCATATTCATTTTGACCATACATTGCAGATGT
49 GAGATGGATTTTAAGTGGTGAAAGCGCTCTAAGCTATGCCATATAAGTACGTAAGGAGAG
50 ACAAAATTAAACATAATTAAGCGCCATGTGAGACTAAATGTGGCCGTCGTTTTGATTATA
51 TGATTGGGAAAAGCTCCTAAACATAGAGGTAGAATTATAGTTCGGAAATTTCGTCTTGCC
52 CTGCTCATTTTGTAGAAAACGAGTCATCATCTCCACCCTTTGTAACCGGTGTCCTGCTCA
53 CATAAATAGTCTCTACTGAGAGATTTGTGAATTTCGAGATAATTTTTGGGATTCCATTGT
54 TGATAAAGGCAATATTATTAGGTATATAAAATATACTAGA
55 >MIT_Sbay_c77_8808 YGL040C 5' untranslated region, Contig c77 1 - 1377, 2000 bp (revcom)
56 ACTTTGTCAGTGTTTTTCTGGTAAGGATATCTGGAAGAAGTAACAATACGTATAAATTAC
57 AAAATTACCGTTTTATGTCGTGGAATGGGCTATGAACTAACATTAACAATAGAGTGATGC
58 ATAGACGTCACTAGCCTTTTATTGTGTTGCCTTGCTCTTTTATAAATCAGGCAGCCTGCC
59 GCAGGCCAATCACCGCACCGCCCGGAGATGCTCGTTTACCGTTGTGCACCAAATTTTTCA
60 TTTTTTGCCTTTTTCTATTTGGCAGCGTTTTCGAAAAATTTTGATCATTAGTCTTCAATG
61 ACTGGACTGTCATATTTTAGGGCACGCAGGTAAAGATATGAACAAATCATATTGATGATG
62 GATGCCAATCCTTCAATGTAAATTCTTTCTAAACATCATGATAAAGAACTTCAGTAAGAG
63 AGTGATAAAAACTTTACATGTATGGCGGGTGTATTCTGTAATTGTTTTTTAGATCTTTTT
64 GTTGTTAACGGTGACACCATTCTTACTACAATAATTGCATGTCAAATGTAAATATCTTGC
65 TTCACATTTCGTTGTTTCTTTACGATAAATTGTTTCGTCGCAAATATATCTTATTTTGCG
66 TGGTTTATCTACAGACACTGCTTGATTTACGCATAAGTACATCATGTAGTAATTCTTATA
67 TTGAGTATAAAACCATATGAATAGAAATATTTTTGTTAATCTATCGTTAATTTACATGCT
68 AGTTTATTTGTCCCTTTAAAATTTCTTTATATATTTGTTGCAATATGTGGACAAGGAAAC
69 ACGAAATATATTGGGATAAAGTTTAAGTAGAGATACATAGAACTAAACAATAAATTCATA
70 TTCAATAATACTTCAAAAGGTACTCTCCTGTCTGAACACAGAGACTCACAGACTTTATTT
71 AGTCGTTATGGCGATGTCAGACATCATGTTTAAGGTAAGCCGAGTGGATTGATATGAAAT
72 TGTCATATCATGAATAAGCTAATTACCCAAAAACAGTAAA
73 >WashU_Sklu_Contig1444.1 YGL040C 5' untranslated region, Contig c1444 1328 - 2770(revcom), 2000 bp (revcom)
74 TGGTTTGACAATAGAAGCTTTGATACTGAACTATGATGAAAGCAGCTTGAAATGTAGCCA
75 ACAATAGTGGTTTTGGTTGTAACAAATTTTTCACCCAGATATGCGTTTCTTTTAAACCAA
76 AAAAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGTTGTGATTAACTTAGAGATGAT
77 GTAGAAAAGTAATCTACGATTAGCAATTGTAGAGCGTAAGAGGTAAAATACAAGCATGTC
78 ACACCAATGCGAGGATGAGCATCATTCGCACAGACACTCCCCACCACCAATTCCAACCAG
79 TTCCAACCAGTCTCTGTACCAGTTCATTGACACTTCAAAGTTACGCTGCCTGAATGTTAC
80 AAGTAATGGTGCCAATCAGTTTCCTCCATGGTTCATAAACCCTCAGGACCAAAAATACGA
81 CGTCTCAAAGTACTTAGAGAGTGATGCAGATTGCCAAATGCTGTTGCATATCCCGTTTAC
82 CGGTGATGTCAGAATATTCTCCCTTATTCTAAGATGCAGTAAGGCGGAGGACGGATGCGG
83 GTCCCCTAAGAGTATTAAGCTTTACAAAAATTTCAACAAAAACACCGATTTTGAAACTAT
84 CAGCGATTCCAAGGAAAGCTACCACGTGGAAAGCCCAGAAGATGTTGGAATTGCTAGCGA
85 TGGGAGCGTGAACACAGTAGAAGACGATTCCACCTTCGTAGAACATCATCTTCCACGCCA
86 CATCTTCCAAAACTGCAATTCAATAACGCTGTTCTTTGAAAACAACTGGAGCGAGGACGA
87 AGACGATTTAACCAGATGTTACTACTTAGAATTGCGTGGCGAGTTCACTGCTAAACGTAC
88 ACCGCACGACGGGATGCCACAGTTAGCCGTCTACGAGGCTGCTCCAAATCCGGCGGATCA
89 CCAGAAGTTAGAGAATGAACAAGAATCTGCAAGTTTAGGCATGTAGGAAGAAATCTACGT
90 AGAAAACACAACAAAAAAAAATTAAAATTTATAAACGAGT
91 >WashU_Scas_Contig575.11 YGL040C 5' untranslated region, Contig c575 17052 - 19051, 2000 bp (revcom)
92 TGTTGGCGTCCTGTTTAGTCAATGTTAAAAAGGTAAGAGTTTGTAAAGTGTATAAGTCAA
93 GAAAGGGACTGTGAAACAATATGTTGAATGTAAGTTGTCTTTTATAATCCTAAGTGAAAT
94 TCCACCAACCAGGAACGAGCGGACATTTAAAGTTAAGGGAATGCGCCGTCGCTTCGTGGA
95 ATGTTAATGACACGTTTTATTTCATTTATTATAATAAAAAAACAATCAGATTGATTGTTG
96 CCCCATTATCCAGGTTGTTTAAAGAAGAGTACTGGATATAACTCTGTTGAGCTGATTTTT
97 CTATTCAAAATGATTAGGTAGCCTCCTTTACATAATTTTTTTTGGCGCAAACACCATGGC
98 TGAGACATTTGAGCAAATATTGATAATATTTTAAGAAAGAAAACAGACATATTGGTTCAA
99 CTGCAAAAGGTGCCTAAGAGGAGCAAATACTGCTCAAGAATACTAGTTGCAATTACAAGC
100 GATCAAAGATTTAATTCAAGCGTTGGAATATTAGCAACCTTTACCTGTATGAACCAACAT
101 TTTAAAGTTTGATAATTATTTTTAATCAATTTTAGTTGAAAAGTTATATAAAGTTCTCCG
102 ACAAATACTTGAATGACGTGCCATGTCTAATTTGGTTTAAGGTAGCAATATTTAGTTTTA
103 TTTTGGTGATATTCTAGAAAGTATTTAAACTGAAAAAACTAATCAAGAAATGAAAATTCA
104 AATATTCAAGAGAAAAAATAAATATTGTCTTAAATTTCTTATTTTCTCGACCCAAAAACC
105 GTAACTATACTTACCATTTACTTTCCTTGATCAGAATCAACTATTCCCCATACAAAGTAA
106 ATTAAATACTCAACTAATAATGGGATGACGGCATGACCGATTTTATGTAATAAAATAGGA
107 GCTCTAAACAAATTTTTTCACATTAATATGGTTGTTTGGCCGAGCGGTCTAAGGCGCCTG
108 ATTCAAGATCAAACATTCTTGACTGTGGAACACCACAGGA
109 >WashU_Skud_Contig2052.17 YGL040C 5' untranslated region, Contig c2052 29967 - 31966, 2000 bp (revcom)
110 GATTTGTCAGTGTTTTCTGATATGGATGCCTGGAGAAAATATTAATATGTGGAAACCACA
111 AAACTTCCACTTATATAGCTAATTTAGCCAGAAATCATGAACAATAGGATGACGCATAGA
112 CGTCACTACTCTTCATATAAGTTGCCTTTCTCTTTTATAAATTGGGCAGGCAGCTTGCCT
113 CAGGCCAATCACCGCACCGAACAGGGATTGCTCGTTTACCCGTTGCGTTCAAAGTTTTTC
114 ATTTTCCGCATCATCTACTTTTTTTTTTTTGACGCCGTTTTTGAATGTCTTGGTCATTGA
115 TCTTGAAATGATTTATGTTCGTGTTTTCACGGCACAAAGGTAGGCAAATCGGTAAATTTT
116 ACTCGTAATAAATAATCAAGGCCTCTAGAGGATTTAATATCAGGAAATAATAATGTGAGT
117 TTTTTGCAAATGGCCTTATATTCCTGACATCTTCTTGAATTTGTGTTTTAGCGTCGATGA
118 AGACTCTTCCTTTTTTCGTACGGTAATCTGGACATCTTGTTTCGTCTTTTCTTTTTTTTT
119 TGCGATTGCTTGTAATTCCAGATATGCAGCATTTATTTACAGGTGCTGATTGATTTACTA
120 TAGAGTTTATCAGGTAGTAGTTCTTTTTCATGTCTCAATTGAAGAAAAGGAACCCATAAA
121 TACATTAGCACTGAACAAACAATAACTGCCGCATTGGTTTGTTTTCTAACTTGAATTTTT
122 CTTTATACATATGCCACTGTATTAGGATGGGTGAATACCGTTTTCTTACTTTCTTCCTAT
123 GAAGGCGAAAGAATGGTGAAGGACAACTAAACAATAAATCGTTTTTCACACATCCCCATA
124 AAGCTTTCTCTGTTTGTCAGTTGTGACTCATCTTTCGTCGATGTTGCTTGGTAGATACAA
125 TTGAACAAGATTGAGATATCTAAAATGTTCAAAAATTATACTCTCTTATGTAGTTTCCGT
126 CATGGCTGAACGAAGGAAAACTACATCACCTGAGAATTAC