| blob | a3e44e21aec22f1c05fd44aed2f3ae6449e7c312 |
1 SignalP 3.0 Server - prediction results
2 Technical University of Denmark
4 Using neural networks (NN) and hidden Markov models (HMM) trained on Gram-negative bacteria
6 >my_fasta_id
10 SignalP-NN result:
13 >my_fasta_id length = 70
15 # pos aa C S Y
16 1 M 0.006 0.019 0.006
17 2 K 0.006 0.016 0.006
18 3 G 0.006 0.019 0.005
19 4 N 0.006 0.012 0.005
20 5 K 0.006 0.011 0.003
21 6 E 0.007 0.014 0.000
22 7 V 0.006 0.012 0.000
23 8 L 0.007 0.012 0.000
24 9 E 0.006 0.001 0.000
25 10 I 0.007 0.015 0.000
26 11 L 0.006 0.007 0.000
27 12 G 0.006 0.011 0.000
28 13 E 0.007 0.010 0.000
29 14 V 0.006 0.002 0.000
30 15 L 0.006 0.005 0.000
31 16 S 0.007 0.058 0.000
32 17 A 0.023 0.023 0.000
33 18 E 0.024 0.019 0.000
34 19 L 0.008 0.038 0.000
35 20 T 0.009 0.036 0.000
36 21 A 0.011 0.038 0.000
37 22 I 0.060 0.049 0.000
38 23 N 0.009 0.120 0.000
39 24 Q 0.028 0.058 0.000
40 25 Y 0.007 0.056 0.000
41 26 F 0.009 0.070 0.000
42 27 I 0.012 0.040 0.008
43 28 H 0.011 0.055 0.010
44 29 A 0.008 0.048 0.011
45 30 K 0.354 0.033 0.086
46 31 M 0.006 0.039 0.012
47 32 N 0.016 0.051 0.022
48 33 K 0.020 0.030 0.025
49 34 N 0.008 0.060 0.017
50 35 W 0.007 0.031 0.017
51 36 G 0.007 0.021 0.017
52 37 F 0.009 0.017 0.019
53 38 K 0.007 0.026 0.017
54 39 K 0.007 0.030 0.017
55 40 L 0.006 0.033 0.015
56 41 A 0.007 0.002 0.017
57 42 D 0.008 0.001 0.017
58 43 F 0.006 0.001 0.014
59 44 M 0.006 0.001 0.014
60 45 K 0.006 0.001 0.013
61 46 R 0.006 0.000 0.012
62 47 E 0.006 0.000 0.011
63 48 S 0.006 0.000 0.011
64 49 I 0.006 0.000 0.010
65 50 D 0.007 0.000 0.010
66 51 E 0.007 0.000 0.009
67 52 M 0.006 0.000 0.007
68 53 K 0.006 0.000 0.007
69 54 H 0.006 0.000 0.006
70 55 A 0.007 0.000 0.005
71 56 D 0.010 0.000 0.005
72 57 E 0.006 0.000 0.002
73 58 V 0.007 0.000 0.001
74 59 I 0.007 0.000 0.001
75 60 D 0.006 0.000 0.001
76 61 R 0.006 0.000 0.001
77 62 I 0.006 0.000 0.000
78 63 L 0.006 0.000 0.000
79 64 Y 0.006 0.000 0.000
80 65 L 0.006 0.000 0.000
81 66 D 0.006 0.000 0.000
82 67 G 0.006 0.000 0.000
83 68 V 0.006 0.000 0.000
84 69 P 0.006 0.000 0.000
85 70 D 0.006 0.000 0.000
88 >my_fasta_id length = 70
89 # Measure Position Value Cutoff signal peptide?
90 max. C 30 0.354 0.52 NO
91 max. Y 30 0.086 0.33 NO
92 max. S 23 0.120 0.92 NO
93 mean S 1-29 0.030 0.49 NO
94 D 1-29 0.058 0.44 NO
98 SignalP-HMM result:
101 >my_fasta_id
102 # pos aa C S n-reg h-reg c-reg
103 1 M 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
104 2 K 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
105 3 G 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
106 4 N 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
107 5 K 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
108 6 E 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
109 7 V 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
110 8 L 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
111 9 E 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
112 10 I 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
113 11 L 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
114 12 G 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
115 13 E 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
116 14 V 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
117 15 L 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
118 16 S 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
119 17 A 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
120 18 E 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
121 19 L 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
122 20 T 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
123 21 A 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
124 22 I 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
125 23 N 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
126 24 Q 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
127 25 Y 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
128 26 F 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
129 27 I 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
130 28 H 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
131 29 A 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
132 30 K 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
133 31 M 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
134 32 N 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
135 33 K 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
136 34 N 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
137 35 W 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
138 36 G 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
139 37 F 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
140 38 K 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
141 39 K 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
142 40 L 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
143 41 A 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
144 42 D 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
145 43 F 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
146 44 M 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
147 45 K 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
148 46 R 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
149 47 E 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
150 48 S 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
151 49 I 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
152 50 D 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
153 51 E 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
154 52 M 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
155 53 K 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
156 54 H 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
157 55 A 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
158 56 D 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
159 57 E 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
160 58 V 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
161 59 I 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
162 60 D 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
163 61 R 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
164 62 I 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
165 63 L 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
166 64 Y 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
167 65 L 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
168 66 D 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
169 67 G 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
170 68 V 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
171 69 P 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
172 70 D 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
175 >my_fasta_id
176 Prediction: Non-secretory protein
177 Signal peptide probability: 0.000
178 Max cleavage site probability: 0.000 between pos. -1 and 0