t/data/signalp.nn.summary

   1 *********************** SignalP 3.0 predictions ***********************
   2 Using neural networks (NN) trained on eukaryotes
   3
   4 ----------------------------------------------------------------------
   5 >BC1G_00001.1 predicted protein (translation)
   6
   7 SignalP-NN result:
   8 >BC1G_00001.1          length = 173
   9 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
  10   max. C    23       0.074   0.32   NO
  11   max. Y    33       0.014   0.33   NO
  12   max. S     2       0.067   0.87   NO
  13   mean S     1-32    0.023   0.48   NO
  14        D     1-32    0.018   0.43   NO
  15
  16
  17 ----------------------------------------------------------------------
  18 >BC1G_00002.1 predicted protein (translation)
  19
  20 SignalP-NN result:
  21 >BC1G_00002.1          length = 120
  22 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
  23   max. C    26       0.079   0.32   NO
  24   max. Y    22       0.059   0.33   NO
  25   max. S     1       0.406   0.87   NO
  26   mean S     1-21    0.100   0.48   NO
  27        D     1-21    0.079   0.43   NO
  28
  29
  30 ----------------------------------------------------------------------
  31 >BC1G_00003.1 hypothetical protein (translation)
  32
  33 SignalP-NN result:
  34 >BC1G_00003.1          length = 323
  35 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
  36   max. C    22       0.934   0.32   YES
  37   max. Y    22       0.866   0.33   YES
  38   max. S    13       0.991   0.87   YES
  39   mean S     1-21    0.938   0.48   YES
  40        D     1-21    0.902   0.43   YES
  41 # Most likely cleavage site between pos. 21 and 22: VQG-AP
  42
  43
  44 ----------------------------------------------------------------------
  45 >BC1G_00004.1 hypothetical protein (translation)
  46
  47 SignalP-NN result:
  48 >BC1G_00004.1          length = 361
  49 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
  50   max. C    30       0.078   0.32   NO
  51   max. Y    17       0.101   0.33   NO
  52   max. S     1       0.425   0.87   NO
  53   mean S     1-16    0.221   0.48   NO
  54        D     1-16    0.161   0.43   NO
  55
  56
  57 ----------------------------------------------------------------------
  58 >BC1G_00005.1 predicted protein (translation)
  59
  60 SignalP-NN result:
  61 >BC1G_00005.1          length = 244
  62 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
  63   max. C    18       0.085   0.32   NO
  64   max. Y    18       0.078   0.33   NO
  65   max. S     3       0.683   0.87   NO
  66   mean S     1-17    0.188   0.48   NO
  67        D     1-17    0.133   0.43   NO
  68
  69
  70 ----------------------------------------------------------------------
  71 >BC1G_00006.1 hypothetical protein (translation)
  72
  73 SignalP-NN result:
  74 >BC1G_00006.1          length = 35
  75 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
  76   max. C    27       0.244   0.32   NO
  77   max. Y    27       0.035   0.33   NO
  78   max. S     2       0.161   0.87   NO
  79   mean S     1-26    0.053   0.48   NO
  80        D     1-26    0.044   0.43   NO
  81
  82
  83 ----------------------------------------------------------------------
  84 >BC1G_00007.1 predicted protein (translation)
  85
  86 SignalP-NN result:
  87 >BC1G_00007.1          length = 73
  88 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
  89   max. C    22       0.257   0.32   NO
  90   max. Y    22       0.176   0.33   NO
  91   max. S     2       0.620   0.87   NO
  92   mean S     1-21    0.258   0.48   NO
  93        D     1-21    0.217   0.43   NO
  94
  95
  96 ----------------------------------------------------------------------
  97 >BC1G_00008.1 Homologue of M.grisea pathogenicity protein (translation)
  98
  99 SignalP-NN result:
 100 >BC1G_00008.1          length = 349
 101 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
 102   max. C    83       0.576   0.32   YES
 103   max. Y    83       0.383   0.33   YES
 104   max. S    45       0.952   0.87   YES
 105   mean S     1-82    0.489   0.48   YES
 106        D     1-82    0.436   0.43   YES
 107 # Most likely cleavage site between pos. 82 and 83: TQG-AR
 108
 109
 110 ----------------------------------------------------------------------
 111 >BC1G_00009.1 hypothetical protein (translation)
 112
 113 SignalP-NN result:
 114 >BC1G_00009.1          length = 514
 115 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
 116   max. C    28       0.425   0.32   YES
 117   max. Y    28       0.153   0.33   NO
 118   max. S     4       0.448   0.87   NO
 119   mean S     1-27    0.140   0.48   NO
 120        D     1-27    0.147   0.43   NO
 121
 122
 123 ----------------------------------------------------------------------
 124 >BC1G_00010.1 hypothetical protein (translation)
 125
 126 SignalP-NN result:
 127 >BC1G_00010.1          length = 440
 128 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
 129   max. C   421       0.380   0.32   YES
 130   max. Y    15       0.057   0.33   NO
 131   max. S     4       0.362   0.87   NO
 132   mean S     1-14    0.146   0.48   NO
 133        D     1-14    0.102   0.43   NO
 134
 135