Bring base classes from BioPerl-run back to BioPerl.
[bioperl-live.git] / t / data / char-interleave.nex
blobaa624fee85a8c980609929b66158dc53ed120e88
1 #NEXUS
3 BEGIN TAXA;
4       dimensions ntax=8;
5       taxlabels A B C D E F G H;  
6 END;
8 BEGIN CHARACTERS;
9       dimensions nchar=6;
10       format interleave datatype=protein missing=? gap=-;
11       charlabels one two three four five six;
12       matrix
13 A     W I T
14 B     W I T
15 C     W I T
16 D     W I T
17 E     W I T
18 F     W I T
19 G     W I T
20 H     W I T
22 A     H - B
23 B     H - A
24 C     H - D
25 D     H - C
26 E     H - F
27 F     H - E
28 G     H - H
29 H     H - G;
30 END;
32 BEGIN TREES;
33        tree basic_bush = (((A:1,B:1):1,(C:1,D:1):1):1,((E:1,F:1):1,(G:1,H:1):1):1);
34 END;