Bring base classes from BioPerl-run back to BioPerl.
[bioperl-live.git] / t / data / component.ontology.test
blob5a8cc98b33fef548c6edab1a5e3ada61a4033bb5
1 !autogenerated-by:     DAG-Edit version 1.311
2 !saved-by:             hjd
3 !date:                 Thu Sep 12 11:05:43 EDT 2002
4 !version: $Revision: 1.1 $
5 !note:     file automatically generated by GO-Editor
6 $Gene_Ontology ; GO:0003673
7  <cellular_component ; GO:0005575
8   %cell ; GO:0005623
9    %ascus ; GO:0005627
10     <ascus lipid droplet ; GO:0005633 % lipid particle ; GO:0005811
11     <prospore membrane ; GO:0005628 % membrane ; GO:0016020
12     <spore wall (sensu Fungi) ; GO:0005619 % cell wall (sensu Fungi) ; GO:0009277
13      <chitosan layer of spore wall ; GO:0005631
14      <dityrosine layer of spore wall ; GO:0005630
15      <inner layer of spore wall ; GO:0005632
16    <axon ; GO:0030424
17    <bud ; GO:0005933
18     <bud neck ; GO:0005935 % site of polarized growth (sensu Saccharomyces) ; GO:0000134
19      <contractile ring (sensu Saccharomyces) ; GO:0000142 ; synonym:cytokinetic ring (sensu Saccharomyces) ; synonym:neck ring % contractile ring (sensu Fungi) ; GO:0030480
20       <septin ring (sensu Saccharomyces) ; GO:0000144 % septin ring (sensu Fungi) ; GO:0030481
21      <polarisome ; GO:0000133 < bud tip ; GO:0005934 < cell cortex ; GO:0005938 < shmoo tip ; GO:0005937
22     <bud tip ; GO:0005934 % site of polarized growth (sensu Saccharomyces) ; GO:0000134
23      <polarisome ; GO:0000133 < bud neck ; GO:0005935 < cell cortex ; GO:0005938 < shmoo tip ; GO:0005937
24    <cell fraction ; GO:0000267
25     %insoluble fraction ; GO:0005626
26     %membrane fraction ; GO:0005624 ; synonym:murein sacculus ; synonym:peptidoglycan
27      %integral membrane protein of membrane fraction ; GO:0000299
28      %microsome ; GO:0005792
29       %rough microsome ; GO:0019718
30       %smooth microsome ; GO:0019719
31      %peripheral membrane protein of membrane fraction ; GO:0000300
32      %synaptosome ; GO:0019717
33     %soluble fraction ; GO:0005625
34      <polarisomeX ; GO:0000666 < bud neck ; GO:0005935  % lipid particle ; GO:0005811 < cell cortex ; GO:0005938 % septin ring (sensu Fungi) ; GO:0030481 < shmoo tip ; GO:0005937
35      <polarisomeY ; GO:0000667 % bud neck ; GO:0005935  < lipid particle ; GO:0005811 % cell cortex ; GO:0005938 < septin ring (sensu Fungi) ; GO:0030481 % shmoo tip ; GO:0005937
36  %dibenzothiophene metabolism ; GO:0018895
37   %dibenzothiophene catabolism ; GO:0018896 ; UM-BBD_pathwayID:dbt2 % xenobiotic catabolism ; GO:0042178
38   %dibenzothiophene desulfurization ; GO:0018897 ; MetaCyc:PWY-681 ; UM-BBD_pathwayID:dbt; synonym:murein sacculus ; synonym:peptidoglycan
39   %thromboxane-A synthase ; GO:0004796, GO:0008400 ; EC:5.3.99.5 ; synonym:cytochrome P450 CYP5 % cytochrome P450 ; GO:0015034