t/data/frac_problems2.blast

   1 BLASTN 2.2.6 [Apr-09-2003]
   2
   3
   4 Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
   5 Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
   6 "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
   7 programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
   8
   9 Query= AEDES_02704.C
  10          (1069 letters)
  11
  12 Database: aaegypti.SCAFFOLDS-MASKED.AEDES1.fa
  13            4758 sequences; 1,383,971,543 total letters
  14
  15 Searching..........done
  16
  17                                                                  Score    E
  18 Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value
  19
  20 supercontig:1:supercont1.157:1:2064756:1 supercontig supercont1.157   858   0.0
  21
  22 >supercontig:1:supercont1.157:1:2064756:1 supercontig supercont1.157
  23           Length = 2064756
  24
  25  Score =  858 bits (433), Expect = 0.0
  26  Identities = 448/453 (98%)
  27  Strand = Plus / Plus
  28
  29
  30 Query: 12     cattttaaatgcatatattgggtgccatcatgactgcctgactcctaaacttgacctcga 71
  31               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32 Sbjct: 759400 cattttaaatgcatatattgggtgccatcatgactgcctgactcctaaacttgacctcga 759459
  33
  34
  35 Query: 72     ggcctatattctatcccttcttacatgtagtggcttaatcctagattgctggtactcacg 131
  36               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  37 Sbjct: 759460 ggcctatattctatcccttcttacatgtagtggcttaatcctagattgctggtactcacg 759519
  38
  39
  40 Query: 132    gcaccggctattatgctcccgccgcctctagctccaccagcctctgcatcctttctgacg 191
  41               |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
  42 Sbjct: 759520 gcaccggccattatgctcccgccgcctttagctccaccagcctccgcatcctttctgacg 759579
  43
  44
  45 Query: 192    gtctgcgctcgccgtcgtcgcacgctctgtgctcctgcaccacctcagctgaagcggcta 251
  46               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  47 Sbjct: 759580 gtctgcgctcgccgtcgtcgcacgctctgtgctcctgcaccacctcagctgaagcggctg 759639
  48
  49
  50 Query: 252    gctctcgacggtcattcaccgccgacgaccttgcactactgtgttgggaacccctggtcg 311
  51               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  52 Sbjct: 759640 gctctcgacggtcattcaccgccgacgaccttgcactactgtgttgggaacccctggtcg 759699
  53
  54
  55 Query: 312    tgagtcacagtccgctcttcctccgatgtgccaaatgtcaaacgctgatatggctacgga 371
  56               |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
  57 Sbjct: 759700 tgagtcacagtccgctcttcctccgatgtgtcaaatgtcaaacgctgatatggctacgga 759759
  58
  59
  60 Query: 372    cgatcctccaccgcggtgttgggaacccctgagtgtagactcgctgggccttccttcgat 431
  61               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  62 Sbjct: 759760 cgatcctccaccgcggtgttgggaacccctgagtgtagactcgctgggccttccttcgat 759819
  63
  64
  65 Query: 432    gagccaaagaacgaaactgcaacgaaaaaaccc 464
  66               |||||||||||||||||||||||||||||||||
  67 Sbjct: 759820 gagccaaagaacgaaactgcaacgaaaaaaccc 759852
  68
  69
  70
  71  Score =  803 bits (405), Expect = 0.0
  72  Identities = 441/453 (97%)
  73  Strand = Plus / Plus
  74
  75
  76 Query: 12     cattttaaatgcatatattgggtgccatcatgactgcctgactcctaaacttgacctcga 71
  77               ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
  78 Sbjct: 768455 cattttaaatgcatatattgggtgccatcatgactacctgactcctaaacttgacctcga 768514
  79
  80
  81 Query: 72     ggcctatattctatcccttcttacatgtagtggcttaatcctagattgctggtactcacg 131
  82               ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
  83 Sbjct: 768515 ggcctatattctatctcttcttacatgtagtggcttaatcctagatttctggtactcacg 768574
  84
  85
  86 Query: 132    gcaccggctattatgctcccgccgcctctagctccaccagcctctgcatcctttctgacg 191
  87               |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||
  88 Sbjct: 768575 gcaccggccattatgctcccgccgcctttagctccaccagcctccgcattctttctgacg 768634
  89
  90
  91 Query: 192    gtctgcgctcgccgtcgtcgcacgctctgtgctcctgcaccacctcagctgaagcggcta 251
  92               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
  93 Sbjct: 768635 gtctgcgctcgccgtcgtcgcacgctctgtgctcctgcaccccctcagctgaagcggctg 768694
  94
  95
  96 Query: 252    gctctcgacggtcattcaccgccgacgaccttgcactactgtgttgggaacccctggtcg 311
  97               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  98 Sbjct: 768695 gctctcgacggtcattcaccgccgacgaccttgcactactgtgttgggaacccctggtcg 768754
  99
 100
 101 Query: 312    tgagtcacagtccgctcttcctccgatgtgccaaatgtcaaacgctgatatggctacgga 371
 102               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||
 103 Sbjct: 768755 tgagtcacagtccgctcttcctccgatgtgccaaatgtcaactgctgatatggctacgga 768814
 104
 105
 106 Query: 372    cgatcctccaccgcggtgttgggaacccctgagtgtagactcgctgggccttccttcgat 431
 107               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108 Sbjct: 768815 cgatcctccaccgcggtgttgggaacccctgagtgtagactcgctgggccttccttcgat 768874
 109
 110
 111 Query: 432    gagccaaagaacgaaactgcaacgaaaaaaccc 464
 112               |||||||||||| ||||||||||||||||||||
 113 Sbjct: 768875 gagccaaagaacaaaactgcaacgaaaaaaccc 768907
 114
 115
 116
 117  Score =  317 bits (160), Expect = 3e-84
 118  Identities = 170/172 (98%), Gaps = 1/172 (0%)
 119  Strand = Plus / Plus
 120
 121
 122 Query: 899    ttcctttcaccgtatggccacgtgacgatgatgagctctggcgcctttcgcgtccggatg 958
 123               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124 Sbjct: 769407 ttcctttcaccgtatggccacgtgacgatgatgagctctggcgcctttcgcgtccggatg 769466
 125
 126
 127 Query: 959    ttttccgccacggccggtaacaactatgtaacctttcactatggaaaactgcaaaagttt 1018
 128               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129 Sbjct: 769467 ttttccgccacggccggtaacaactatgtaacctttcactatggaaaactgcaaaagttc 769526
 130
 131
 132 Query: 1019   tctttcgccggcttt-aacggcactaactttttgtggcaaaatccgcttatt 1069
 133               ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134 Sbjct: 769527 tctttcgccggctttaaacggcactaactttttgtggcaaaatccgcttatt 769578
 135
 136
 137
 138  Score =  311 bits (157), Expect = 2e-82
 139  Identities = 167/169 (98%), Gaps = 1/169 (0%)
 140  Strand = Plus / Plus
 141
 142
 143 Query: 902    ctttcaccgtatggccacgtgacgatgatgagctctggcgcctttcgcgtccggatgttt 961
 144               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145 Sbjct: 760355 ctttcaccgtatggccacgtgacgatgatgagctctggcgcctttcgcgtccggatgttt 760414
 146
 147
 148 Query: 962    tccgccacggccggtaacaactatgtaacctttcactatggaaaactgcaaaagttttct 1021
 149               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 150 Sbjct: 760415 tccgccacggccggtaacaactatgtaacctttcactatggaaaactgcaaaagttctct 760474
 151
 152
 153 Query: 1022   ttcgccggcttt-aacggcactaactttttgtggcaaaatccgcttatt 1069
 154               |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155 Sbjct: 760475 ttcgccggctttaaacggcactaactttttgtggcaaaatccgcttatt 760523
 156
 157
 158
 159  Score =  293 bits (148), Expect = 5e-77
 160  Identities = 151/152 (99%)
 161  Strand = Plus / Plus
 162
 163
 164 Query: 587    ccccctttctttccgtcggaatcacgatccgagcagtagcgtcagcagacaatggatttg 646
 165               ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166 Sbjct: 769138 ccccctttctttccgtcggaatcgcgatccgagcagtagcgtcagcagacaatggatttg 769197
 167
 168
 169 Query: 647    cggcgttcttattgttgaacaatgcgtgcccgtcctgatgccagcgatgatctcgtgatc 706
 170               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171 Sbjct: 769198 cggcgttcttattgttgaacaatgcgtgcccgtcctgatgccagcgatgatctcgtgatc 769257
 172
 173
 174 Query: 707    ggacaatcacgtcggtttcgaagcggttggcc 738
 175               ||||||||||||||||||||||||||||||||
 176 Sbjct: 769258 ggacaatcacgtcggtttcgaagcggttggcc 769289
 177
 178
 179
 180  Score =  293 bits (148), Expect = 5e-77
 181  Identities = 151/152 (99%)
 182  Strand = Plus / Plus
 183
 184
 185 Query: 587    ccccctttctttccgtcggaatcacgatccgagcagtagcgtcagcagacaatggatttg 646
 186               ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187 Sbjct: 760083 ccccctttctttccgtcggaatcgcgatccgagcagtagcgtcagcagacaatggatttg 760142
 188
 189
 190 Query: 647    cggcgttcttattgttgaacaatgcgtgcccgtcctgatgccagcgatgatctcgtgatc 706
 191               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192 Sbjct: 760143 cggcgttcttattgttgaacaatgcgtgcccgtcctgatgccagcgatgatctcgtgatc 760202
 193
 194
 195 Query: 707    ggacaatcacgtcggtttcgaagcggttggcc 738
 196               ||||||||||||||||||||||||||||||||
 197 Sbjct: 760203 ggacaatcacgtcggtttcgaagcggttggcc 760234
 198
 199
 200
 201  Score =  242 bits (122), Expect = 2e-61
 202  Identities = 125/126 (99%)
 203  Strand = Plus / Plus
 204
 205
 206 Query: 463    cccaataaggggtttctcgtcgtgtgtgggtgcttcgagggaagcgacagtcaacctggc 522
 207               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 208 Sbjct: 768959 cccaataaggggtttctcgtcgtgtgtgggtgcttcgagggaagcgacagccaacctggc 769018
 209
 210
 211 Query: 523    tcgcttcgaggtcctcctacggctcttgcagtggctatgcgctattggtggatgcaaaat 582
 212               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213 Sbjct: 769019 tcgcttcgaggtcctcctacggctcttgcagtggctatgcgctattggtggatgcaaaat 769078
 214
 215
 216 Query: 583    cgtccc 588
 217               ||||||
 218 Sbjct: 769079 cgtccc 769084
 219
 220
 221
 222  Score =  242 bits (122), Expect = 2e-61
 223  Identities = 125/126 (99%)
 224  Strand = Plus / Plus
 225
 226
 227 Query: 463    cccaataaggggtttctcgtcgtgtgtgggtgcttcgagggaagcgacagtcaacctggc 522
 228               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 229 Sbjct: 759904 cccaataaggggtttctcgtcgtgtgtgggtgcttcgagggaagcgacagccaacctggc 759963
 230
 231
 232 Query: 523    tcgcttcgaggtcctcctacggctcttgcagtggctatgcgctattggtggatgcaaaat 582
 233               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234 Sbjct: 759964 tcgcttcgaggtcctcctacggctcttgcagtggctatgcgctattggtggatgcaaaat 760023
 235
 236
 237 Query: 583    cgtccc 588
 238               ||||||
 239 Sbjct: 760024 cgtccc 760029
 240
 241
 242
 243  Score =  123 bits (62), Expect = 1e-25
 244  Identities = 65/66 (98%)
 245  Strand = Plus / Plus
 246
 247
 248 Query: 737    ccactctaaaatgcttcttcgtgccttctaggtcgtcgatatttgccgcgaaaaccgtga 796
 249               |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 250 Sbjct: 769344 ccactctaaaatgcttcttcgtgccttctaggtcgttgatatttgccgcgaaaaccgtga 769403
 251
 252
 253 Query: 797    tccttc 802
 254               ||||||
 255 Sbjct: 769404 tccttc 769409
 256
 257
 258
 259  Score =  121 bits (61), Expect = 4e-25
 260  Identities = 64/65 (98%)
 261  Strand = Plus / Plus
 262
 263
 264 Query: 737    ccactctaaaatgcttcttcgtgccttctaggtcgtcgatatttgccgcgaaaaccgtga 796
 265               |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 266 Sbjct: 760289 ccactctaaaatgcttcttcgtgccttctaggtcgttgatatttgccgcgaaaaccgtga 760348
 267
 268
 269 Query: 797    tcctt 801
 270               |||||
 271 Sbjct: 760349 tcctt 760353
 272
 273
 274
 275  Score =  105 bits (53), Expect = 2e-20
 276  Identities = 68/73 (93%)
 277  Strand = Plus / Minus
 278
 279
 280 Query: 806     gttaaaaataatgaagattacacgtcatctaaactccatttatgcgatgtaaacatgacg 865
 281                ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||
 282 Sbjct: 1251522 gttaaaaataatgaagattacacatcatgtaaacttcatttatgcaatgcaaacatgacg 1251463
 283
 284
 285 Query: 866     tcatgtaaattta 878
 286                |||||||||||||
 287 Sbjct: 1251462 tcatgtaaattta 1251450
 288
 289
 290
 291  Score = 97.6 bits (49), Expect = 6e-18
 292  Identities = 70/77 (90%)
 293  Strand = Plus / Plus
 294
 295
 296 Query: 802     cacagttaaaaataatgaagattacacgtcatctaaactccatttatgcgatgtaaacat 861
 297                ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||||||||||||
 298 Sbjct: 1251086 cacagttaaaactaatgaagattaaacgttatctaaactttatatatgcgatgtaaacat 1251145
 299
 300
 301 Query: 862     gacgtcatgtaaattta 878
 302                || ||||||||||||||
 303 Sbjct: 1251146 gaagtcatgtaaattta 1251162
 304
 305
 306
 307  Score = 61.9 bits (31), Expect = 3e-07
 308  Identities = 37/39 (94%)
 309  Strand = Plus / Minus
 310
 311
 312 Query: 802     cacagttaaaaataatgaagattacacgtcatctaaact 840
 313                |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
 314 Sbjct: 1601368 cacagtaaaaaataatgaagattacacgtcatgtaaact 1601330
 315