t/data/signalp.summary

   1 *********************** SignalP 3.0 predictions ***********************
   2 Using neural networks (NN) and hidden Markov models (HMM) trained on eukaryotes
   3
   4 ----------------------------------------------------------------------
   5 >BC1G_00001.1 predicted protein (translation)
   6
   7 SignalP-NN result:
   8 >BC1G_00001.1          length = 173
   9 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
  10   max. C    23       0.074   0.32   NO
  11   max. Y    33       0.014   0.33   NO
  12   max. S     2       0.067   0.87   NO
  13   mean S     1-32    0.023   0.48   NO
  14        D     1-32    0.018   0.43   NO
  15
  16 SignalP-HMM result:
  17 >BC1G_00001.1
  18 Prediction: Non-secretory protein
  19 Signal peptide probability: 0.000
  20 Signal anchor probability: 0.000
  21 Max cleavage site probability: 0.000 between pos. -1 and  0
  22
  23 ----------------------------------------------------------------------
  24 >BC1G_00002.1 predicted protein (translation)
  25
  26 SignalP-NN result:
  27 >BC1G_00002.1          length = 120
  28 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
  29   max. C    26       0.079   0.32   NO
  30   max. Y    22       0.059   0.33   NO
  31   max. S     1       0.406   0.87   NO
  32   mean S     1-21    0.100   0.48   NO
  33        D     1-21    0.079   0.43   NO
  34
  35 SignalP-HMM result:
  36 >BC1G_00002.1
  37 Prediction: Non-secretory protein
  38 Signal peptide probability: 0.000
  39 Signal anchor probability: 0.000
  40 Max cleavage site probability: 0.000 between pos. 21 and 22
  41
  42 ----------------------------------------------------------------------
  43 >BC1G_00003.1 hypothetical protein (translation)
  44
  45 SignalP-NN result:
  46 >BC1G_00003.1          length = 323
  47 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
  48   max. C    22       0.934   0.32   YES
  49   max. Y    22       0.866   0.33   YES
  50   max. S    13       0.991   0.87   YES
  51   mean S     1-21    0.938   0.48   YES
  52        D     1-21    0.902   0.43   YES
  53 # Most likely cleavage site between pos. 21 and 22: VQG-AP
  54
  55 SignalP-HMM result:
  56 >BC1G_00003.1
  57 Prediction: Signal peptide
  58 Signal peptide probability: 0.999
  59 Signal anchor probability: 0.000
  60 Max cleavage site probability: 0.973 between pos. 21 and 22
  61
  62 ----------------------------------------------------------------------
  63 >BC1G_00004.1 hypothetical protein (translation)
  64
  65 SignalP-NN result:
  66 >BC1G_00004.1          length = 361
  67 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
  68   max. C    30       0.078   0.32   NO
  69   max. Y    17       0.101   0.33   NO
  70   max. S     1       0.425   0.87   NO
  71   mean S     1-16    0.221   0.48   NO
  72        D     1-16    0.161   0.43   NO
  73
  74 SignalP-HMM result:
  75 >BC1G_00004.1
  76 Prediction: Non-secretory protein
  77 Signal peptide probability: 0.003
  78 Signal anchor probability: 0.000
  79 Max cleavage site probability: 0.001 between pos. 18 and 19
  80
  81 ----------------------------------------------------------------------
  82 >BC1G_00005.1 predicted protein (translation)
  83
  84 SignalP-NN result:
  85 >BC1G_00005.1          length = 244
  86 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
  87   max. C    18       0.085   0.32   NO
  88   max. Y    18       0.078   0.33   NO
  89   max. S     3       0.683   0.87   NO
  90   mean S     1-17    0.188   0.48   NO
  91        D     1-17    0.133   0.43   NO
  92
  93 SignalP-HMM result:
  94 >BC1G_00005.1
  95 Prediction: Non-secretory protein
  96 Signal peptide probability: 0.008
  97 Signal anchor probability: 0.000
  98 Max cleavage site probability: 0.007 between pos. 21 and 22
  99
 100 ----------------------------------------------------------------------
 101 >BC1G_00006.1 hypothetical protein (translation)
 102
 103 SignalP-NN result:
 104 >BC1G_00006.1          length = 35
 105 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
 106   max. C    27       0.244   0.32   NO
 107   max. Y    27       0.035   0.33   NO
 108   max. S     2       0.161   0.87   NO
 109   mean S     1-26    0.053   0.48   NO
 110        D     1-26    0.044   0.43   NO
 111
 112 SignalP-HMM result:
 113 >BC1G_00006.1
 114 Prediction: Non-secretory protein
 115 Signal peptide probability: 0.000
 116 Signal anchor probability: 0.000
 117 Max cleavage site probability: 0.000 between pos. 22 and 23
 118
 119 ----------------------------------------------------------------------
 120 >BC1G_00007.1 predicted protein (translation)
 121
 122 SignalP-NN result:
 123 >BC1G_00007.1          length = 73
 124 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
 125   max. C    22       0.257   0.32   NO
 126   max. Y    22       0.176   0.33   NO
 127   max. S     2       0.620   0.87   NO
 128   mean S     1-21    0.258   0.48   NO
 129        D     1-21    0.217   0.43   NO
 130
 131 SignalP-HMM result:
 132 >BC1G_00007.1
 133 Prediction: Non-secretory protein
 134 Signal peptide probability: 0.240
 135 Signal anchor probability: 0.000
 136 Max cleavage site probability: 0.228 between pos. 21 and 22
 137
 138 ----------------------------------------------------------------------
 139 >BC1G_00008.1 Homologue of M.grisea pathogenicity protein (translation)
 140
 141 SignalP-NN result:
 142 >BC1G_00008.1          length = 349
 143 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
 144   max. C    83       0.576   0.32   YES
 145   max. Y    83       0.383   0.33   YES
 146   max. S    45       0.952   0.87   YES
 147   mean S     1-82    0.489   0.48   YES
 148        D     1-82    0.436   0.43   YES
 149 # Most likely cleavage site between pos. 82 and 83: TQG-AR
 150
 151 SignalP-HMM result:
 152 >BC1G_00008.1
 153 Prediction: Non-secretory protein
 154 Signal peptide probability: 0.222
 155 Signal anchor probability: 0.067
 156 Max cleavage site probability: 0.061 between pos. 21 and 22
 157
 158 ----------------------------------------------------------------------
 159 >BC1G_00009.1 hypothetical protein (translation)
 160
 161 SignalP-NN result:
 162 >BC1G_00009.1          length = 514
 163 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
 164   max. C    28       0.425   0.32   YES
 165   max. Y    28       0.153   0.33   NO
 166   max. S     4       0.448   0.87   NO
 167   mean S     1-27    0.140   0.48   NO
 168        D     1-27    0.147   0.43   NO
 169
 170 SignalP-HMM result:
 171 >BC1G_00009.1
 172 Prediction: Non-secretory protein
 173 Signal peptide probability: 0.000
 174 Signal anchor probability: 0.000
 175 Max cleavage site probability: 0.000 between pos. 19 and 20
 176
 177 ----------------------------------------------------------------------
 178 >BC1G_00010.1 hypothetical protein (translation)
 179
 180 SignalP-NN result:
 181 >BC1G_00010.1          length = 440
 182 # Measure  Position  Value  Cutoff  signal peptide?
 183   max. C   421       0.380   0.32   YES
 184   max. Y    15       0.057   0.33   NO
 185   max. S     4       0.362   0.87   NO
 186   mean S     1-14    0.146   0.48   NO
 187        D     1-14    0.102   0.43   NO
 188
 189 SignalP-HMM result:
 190 >BC1G_00010.1
 191 Prediction: Non-secretory protein
 192 Signal peptide probability: 0.000
 193 Signal anchor probability: 0.000
 194 Max cleavage site probability: 0.000 between pos. -1 and  0
 195