Bring base classes from BioPerl-run back to BioPerl.
[bioperl-live.git] / t / data / singlescore.gbk
blob14aeeedb8bbc737fc30e1ade620b12e13ba3ef11
1 LOCUS       test0001                1500 bp    dna     linear   UNK 
2 DEFINITION  [organism=Test test] [strain=test0001] [gcode=11] [date=8-24-2011]
3 ACCESSION   test0001
4 KEYWORDS    .
5 FEATURES             Location/Qualifiers
6      fasta_record    1..1200
7                      /name="contig00002"
8                      /note="untiled"
9      CDS             16..1215
10                      /locus_tag="test0001_10"
11                      /inference="similar to AA sequence:BLASTX:2.2.18"
12                      /score="463"
13                      /product="tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl
14                      modification enzyme MnmG n=70 Tax=Proteobacteria
15                      RepID=MNMG_ALTMD"
16                      /note="score=463"
17                      /note="similar to tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl
18                      modification enzyme GidA PRK05192"
19      gene            16..1215
20                      /locus_tag="test0001_10"
21                      /inference="ab initio prediction:glimmer3:3.0.2"
22 ORIGIN      
23         1 ctaacacaaa gtaatatgag tttttattct agatcagttg tattatcaac aggtaccttt
24        61 ctaggtggaa aaatacacat aggtttagaa agttattctg ctggaagaaa aggagaaaaa
25       121 gcatctatag atttagctct tcgtttaaga gatttgcctt ttcgtgtgga tagattaaaa
26       181 actggaacac cacctcgaat tgatattaat acaattaatt ttgaaaattt atttgtccag
27       241 catggtgatg ttcctactcc tgttttttct tttatggggg atatttctaa tcatcctctt
28       301 caaataccgt gttttcttac acacactaat gaaaaaacgc atgaaataat acgtaaaaat
29       361 ttacataaga gtcctctata tacaggtatt attaaaggtg tgggacctcg atattgtcct
30       421 tctattgaag ataaaattgt acgtttccct gataggaaat cacatcaaat ttttttagag
31       481 ccagaaggat taactagtat tgaaatatat ccaaatggta tctcaactag tttaccctta
32       541 gatgttcaaa aagaaatagt aagttctgta aaaggtttag aaaagtctaa aattattact
33       601 cctggttatg ctgtagaata tgattttttt gatcctaagg atttaaatct tactttagag
34       661 agtaaatgga ttaaaggtct ttttttagct ggtcaaatta atggtactac tggttatgaa
35       721 gaagctgcgt ctcaaggact tttagcaggt ttaaatgcag ctttaagtgc aaaagattgc
36       781 aaacaatggt ttcctagacg tgatcaagct tatttaggtg ttcttattga tgatttaact
37       841 actcaaggtg cgaatgaacc ttatcgaatg tttacttcaa gatctgaata tcggttaact
38       901 ttaagagaag ataatgctga tttacgttta actgaaatag cttataaatt gggattagta
39       961 gataatccaa gatggattcg ttataatgaa aaagtactaa atatcagtaa tgaaaaaaat
40      1021 cgtttaaaaa aaataaaaat atatcctaaa tcctctgata gtactatttt aaatcagtta
41      1081 tttaatattg ttttaactaa agaaattaat attttaaatt tattaaaacg tccagaaatt
42      1141 acatatgaaa atttaaagta tttaaaaaat tttaaagtag gtatttctga tttagaagca
43      1201 nnnttaatta attaannngg tgagtttact tctagtgatt tattaaaacg tattttttct
44      1261 accttttgca taggaaaata agaatataat ttttgcccgg aggcggaatt gaaccaccga
45      1321 cacggggatt ttcagtcccc tgctctaccg actgagctat ccgggcaatt tttacattaa
46      1381 atcatcaaag ataaaacttt gtcaatcttt ttttgtagaa gttaatttga aattttgatt
47      1441 taactaatat cttttctatt ttgaaaatat aaaataaaaa taaaaaaata attttttccc