Bring base classes from BioPerl-run back to BioPerl.
[bioperl-live.git] / t / data / test.swiss
blobf93a6258514233bbecd4a9a93cb64af979689feb
1 ID   GCDH_CAEEL     STANDARD;      PRT;   409 AA.
2 AC   Q20772;
3 DT   01-NOV-1997 (Rel. 35, Created)
4 DT   01-NOV-1997 (Rel. 35, Last sequence update)
5 DT   16-OCT-2001 (Rel. 40, Last annotation update)
6 DE   PROBABLE GLUTARYL-COA DEHYDROGENASE, MITOCHONDRIAL PRECURSOR
7 DE   (EC 1.3.99.7) (GCD).
8 GN   F54D5.7.
9 OS   Caenorhabditis elegans.
10 OC   Eukaryota; Metazoa; Nematoda; Chromadorea; Rhabditida; Rhabditoidea;
11 OC   Rhabditidae; Peloderinae; Caenorhabditis.
12 OX   NCBI_TaxID=6239;
13 RN   [1]
14 RP   SEQUENCE FROM N.A.
15 RC   STRAIN=BRISTOL N2;
16 RA   Coles L.;
17 RL   Submitted (OCT-1995) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
18 CC   -!- CATALYTIC ACTIVITY: GLUTARYL-COA + ACCEPTOR = CROTONOYL-COA +
19 CC       CO(2) + REDUCED ACCEPTOR.
20 CC   -!- COFACTOR: FAD (BY SIMILARITY).
21 CC   -!- PATHWAY: DEGRADATIVE PATHWAY OF L-LYSINE, L-HYDROXYLYSINE,
22 CC       AND L-TRYPTOPHAN METABOLISM.
23 CC   -!- SUBCELLULAR LOCATION: MITOCHONDRIAL MATRIX (POTENTIAL).
24 CC   -!- SIMILARITY: BELONGS TO THE ACYL-COA DEHYDROGENASES FAMILY.
25 CC   --------------------------------------------------------------------------
26 CC   This SWISS-PROT entry is copyright. It is produced through a collaboration
27 CC   between  the Swiss Institute of Bioinformatics  and the  EMBL outstation -
28 CC   the European Bioinformatics Institute.  There are no  restrictions on  its
29 CC   use  by  non-profit  institutions as long  as its content  is  in  no  way
30 CC   modified and this statement is not removed.  Usage  by  and for commercial
31 CC   entities requires a license agreement (See http://www.isb-sib.ch/announce/
32 CC   or send an email to license@isb-sib.ch).
33 CC   --------------------------------------------------------------------------
34 DR   EMBL; Z66513; CAA91333.1; -.
35 DR   HSSP; Q06319; 1BUC.
36 DR   WormPep; F54D5.7; CE03411.
37 DR   InterPro; IPR001552; Acyl-CoA_dh.
38 DR   Pfam; PF00441; Acyl-CoA_dh; 1.
39 DR   Pfam; PF02770; Acyl-CoA_dh_M; 1.
40 DR   Pfam; PF02771; Acyl-CoA_dh_N; 1.
41 DR   PROSITE; PS00072; ACYL_COA_DH_1; FALSE_NEG.
42 DR   PROSITE; PS00073; ACYL_COA_DH_2; 1.
43 KW   Hypothetical protein; Oxidoreductase; Flavoprotein; FAD;
44 KW   Mitochondrion; Transit peptide.
45 FT   TRANSIT       1      ?       MITOCHONDRION (POTENTIAL).
46 FT   CHAIN         ?    409       PROBABLE GLUTARYL-COA DEHYDROGENASE.
47 FT   ACT_SITE    388    388       BASE (POTENTIAL).
48 SQ   SEQUENCE   409 AA;  44964 MW;  4D06241FB6768069 CRC64;
49      MLTRGFTSIG KIASRGLSST FYQDAFQLSD QLTEDERSLM LSAREYCQER LLPRVTEAYR
50      TEKFDPSLIP EMGSMGLLGA PYQGYGCAGT STVGYGLIAR EVERVDSGYR STMSVQTSLV
51      IGPIYNYGSE DQKQKYIPDL ASGKKIGCFG LTEPNHGSNP GGMETKATWD ETTKTYKLNG
52      SKTWISNSPV SDVMVVWARS ARHNNKIKGF ILERGMKGLT TPKIEGKLSL RASITGQIAM
53      DDVPVPEENL LPNAEGLQGP FGCLNNARLG IAWGALGAAE ECFHLARQYT LDRQQFGRPL
54      AQNQLMQLKM ADMLTEISLG LQGCLRVSRL KDEGKVQSEQ ISIIKRNSCG KALEVARKAR
55      DMLGGNGIVD EYHIMRHMVN LETVNTYEGT HDVHALILGR AITGLNGFC