t/data/testaln.prodom

   1 ID   1184 p2000.1                           57 seq.
   2 AC   PD001000
   3 KW   CB21(6) CB22(5) CB23(3)  // CHLOROPHYLL PROTEIN PRECURSOR BINDING PHOTOSYSTEM II TRANSIT PEPTIDE I TYPE
   4 LA   36
   5 AL P04777|CB21_ARATH       1    33 0.59 MAASTMALSSPA-FAGKAVNLS--PAASEVLGSGRV
   6 AL P04778|CB22_ARATH       1    33 0.59 MAASTMALSSPA-FAGKAVKLS--PAASEVLGSGRV
   7 AL P13851|CB21_SINAL       1    33 0.77 MAASTMALSSPA-FAGKAVKLS--PGASEVFGTGRV
   8 AL Q39142|Q39142_ARATH     1    33 0.77 MAASTMALSSPA-LTGKAVKLS--PAASEVFGTGRI
   9 AL O22669|O22669_PANGI     1    33 0.91 MAASTMALSSPS-FAGMAVKVA--PSSSELFGSGRI
  10 AL P92919|P92919_APIGR     1    33 0.91 MAASTMALSSPA-LAGKAVKVA--PSSSELFGNGRV
  11 AL P04780|CB22_PETSP       1    32 0.70 MAAATMALSSST-FAGKVVKLS--PSSSEITGNGK.
  12 AL Q41447|Q41447_SOLTU     1    32 0.70 MAAATMALSSST-FAGKAVKLS--PSSSEITGNGR.
  13 AL P12469|CB23_NICPL       1    33 0.31 MAASTMALSSSS-FAGKAVKLS--PSSSEITGNGKV
  14 AL O64446|O64446_NICSY     1    33 0.31 MAASTMALSSSS-FAGKAVKLS--PSSSEITGNGKV
  15 AL P27496|CB25_TOBAC       1    33 0.38 MAAATMALSSSS-FAGKAVKLS--PSSSEITGNGKV
  16 AL O64450|O64450_NICSY     1    33 0.45 MAASTMALSSSS-FVGKAVKLS--PSSSEITGNGKV
  17 AL P27495|CB24_TOBAC       1    33 0.49 MAASTMALSSPS-FAGKAVKLS--PSSSEITGNGKV
  18 AL P04781|CB23_PETSP       1    33 0.63 MAATTMALSSSS-FAGKAVKLS--SSSSEITGNGKV
  19 AL P07369|CB2G_LYCES       1    33 0.66 MATSTMALSSST-FAGKAVKLS--PSSSEITGNGRV
  20 AL P04783|CB25_PETSP       1    32 0.80 MAAATMALSSPS-FAGKAVKFS--PSSSEITGNGK.
  21 AL P27493|CB22_TOBAC       1    33 0.24 MAAATMALSSPS-FAGQAVKLS--PSAPEITGNGRV
  22 AL O64444|O64444_NICSY     1    33 0.24 MAASTMALSSPS-FAGQAVKLS--PSAPEITGNGRV
  23 AL O64442|O64442_NICSY     1    33 0.21 MAAATMALSSPS-FAGQAVKLS--PSASEITGNGRV
  24 AL O64443|O64443_NICSY     1    33 0.21 MAAATMALSSPS-FAGQAVKLS--PSASEITGNGRV
  25 AL Q41423|Q41423_SOLTU     1    33 0.21 MAAATMALSSPS-FAGQAVKLS--PSASEITGNGRI
  26 AL O64445|O64445_NICSY     1    33 0.28 MAASTMALSSPS-FAGQAVKLS--PSASEITGNGRV
  27 AL P07370|CB2B_LYCES       1    33 0.24 MAAATMALSSPS-FAGQAVKLS--PSASEISGNGRI
  28 AL Q41421|Q41421_SOLTU     1    33 0.24 MAAATMALSSPS-FAGQAVKLS--PSASEISGNGRI
  29 AL Q41422|Q41422_SOLTU     1    33 0.24 MAAATMALSSPS-FAGQAVKLS--PSASEISGNGRI
  30 AL Q41425|Q41425_SOLTU     1    33 0.35 MAASTMALSSPS-FAGQAVKLS--PSASEISGNGRI
  31 AL Q41424|Q41424_SOLTU     1    33 0.45 MAASTMALSSPS-FAGQAVKLS--PSTSEITGNGRI
  32 AL P27491|CB27_TOBAC       1    32 0.59 MTASTMALSSPS-FAGNAVKLS--PSSSEITGNGK.
  33 AL O64449|O64449_NICSY     1    32 0.59 MTASTMALSSPS-FAGNAVKLS--PSSSEITGNGK.
  34 AL O64448|O64448_NICSY     1    33 0.98 MAAATMSLSSPS-FAGKAVKLS--PSSYEIIGNGKV
  35 AL Q32291|Q32291_GOSHI     1    33 1.29 MASTTMALSSPS-FAGKAVKFS--PSTPEIQGTGRV
  36 AL P12333|CB21_SPIOL       1    33 0.77 MASSTMALSSPS-LAGKAVKLG--PTASEIIGEGRI
  37 AL O04686|O04686_MESCR     1    33 0.77 MASSTMALSSPS-LAGKMVKLA--PTASEILGEGRI
  38 AL O04685|O04685_MESCR     1    33 0.84 MASSTMALSSPS-FAGKAVKLS--PTASETLGEGRI
  39 AL O04687|O04687_MESCR     1    33 0.94 MASSAMALSSPS-LAGKAVKLN--PTTSQILGEGRI
  40 AL Q40961|Q40961_PRUPE     1    33 1.29 MASSTMALSSPS-LAGQAVKLG--SSVSNIVGEGRI
  41 AL P27492|CB21_TOBAC       1    32 0.80 MAASTTALSSP--FAGKAVKLS--PSSSEVTGNGKV
  42 AL P12470|CB25_NICPL       1    32 0.80 MAASTTALSSP--FAGKAVKLS--PSSSEVTGNGKV
  43 AL O64447|O64447_NICSY     1    32 1.11 MASSTMALSSS--FAGKAVKLS--PSSSEITGNGKV
  44 AL Q40247|Q40247_LACSA     1    32 1.32 MAASTMALSSP--FAGQAVKTS--PSSSELFGNGRV
  45 AL Q40185|Q40185_LEMGI     1    32 1.95 .MAASMALSSPS-LVGKAVKLA--PAASEVFGEGRV
  46 AL P08963|CB22_HORVU       1    33 2.02 MAAATMALSSST-FAGKAVKNL--SSSSEVQGDARV
  47 AL P04779|CB21_PETSP       1    32 1.57 MAAATMALSSSS-FAGKAVNV---PSSSEITRNGKV
  48 AL P04782|CB24_PETSP       1    31 1.57 MAAATMAISSSS-FAGKAVNV---PSSSQITGNGK.
  49 AL Q39141|Q39141_ARATH     1    31 2.19 MASSTMALSSPA-FAGKAVK----PAASDVLGSGRV
  50 AL P09755|CB22_SOYBN       1    32 1.18 MAASTMALSSSS-LAGQAMKLA--PSTPEL-GVGRV
  51 AL Q43437|Q43437_SOYBN     1    32 1.18 MAASTMALSSSS-LAGQAIKLA--PSTPEL-GVGRV
  52 AL O48657|O48657_FAGCR     1    32 1.43 MAASTMALSSPS-LAGKAVKLA--PSTPEL-NVGRV
  53 AL O81391|O81391_MEDSA     1    31 1.53 MAASSMALSSPT-LAGKPVKLT--PSSQEL-GAAR.
  54 AL Q9ZP08|Q9ZP08_CICAR     1    31 1.53 MAASSMALSSPT-LAGKPVKLS--PSSQEL-GASR.
  55 AL P09756|CB23_SOYBN       3    31 1.81 .AASSMALSSPS-LAGKAVKLG--PSAPEV-GRV..
  56 AL Q39831|Q39831_SOYBN     3    31 1.81 .AASSMALSSPS-LAGKAVKLG--PSAPEV-GRV..
  57 AL P04784|CB21_WHEAT       1    32 1.74 MAATTMSLSSSS-FAGKAVKNL--PSSA-LIGDARV
  58 AL O24401|O24401_WHEAT     1    32 1.74 MAAATMSLSSST-FAGKAVKNV--PSLA-LLGEARV
  59 AL Q40065|Q40065_HORVU     1    32 1.78 MAATTMYLSSST-FAGKAVKNV--PLSA-LFGEARV
  60 AL P27490|CB28_PEA         1    31 3.34 MAASSMALSSPT-LTGKPVETSANPSSQELGG....
  61 AL O24226|O24226_ORYSA     1    30 3.62 MAASTMALSSPAALAGKAV------ANAKVFGEGRV
  62 CO                                      MAASTMALSSPS-FAGKAVKLS--PSSSEITGNGRV
  63 //