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   5 // The Computer Language Shootout
   6 // http://shootout.alioth.debian.org/
   7 //
   8 // contributed by Jesse Millikan
   9 // Base on the Ruby version by jose fco. gonzalez
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 242 CAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCT\n\
 243 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGA\n\
 244 CCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCG\n\
 245 TGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAA\n\
 246 CCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGAC\n\
 247 AGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAC\n\
 248 TTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAA\n\
 249 CATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGC\n\
 250 CTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGA\n\
 251 GGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCC\n\
 252 GTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGA\n\
 253 GGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCC\n\
 254 CGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGC\n\
 255 TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGC\n\
 256 CGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGC\n\
 257 CGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCA\n\
 258 CCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAA\n\
 259 AATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCT\n\
 260 GAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCA\n\
 261 CTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGC\n\
 262 TCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGA\n\
 263 GTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTA\n\
 264 GCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT\n\
 265 CGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCC\n\
 266 TGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAAT\n\
 267 CCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGC\n\
 268 CTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTG\n\
 269 GCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGG\n\
 270 GAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGC\n\
 271 GAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG\n\
 272 GAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGG\n\
 273 TGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTA\n\
 274 ATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTG\n\
 275 CAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTC\n\
 276 AAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGG\n\
 277 GCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCT\n\
 278 CTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTC\n\
 279 GGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGA\n\
 280 TCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGC\n\
 281 GCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGA\n\
 282 GGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATAC\n\
 283 AAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGC\n\
 284 AGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCA\n\
 285 CTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACG\n\
 286 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCG\n\
 287 AGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGG\n\
 288 GCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTT\n\
 289 GAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGC\n\
 290 GACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAG\n\
 291 CACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGC\n\
 292 CAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCG\n\
 293 CGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGC\n\
 294 GGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGAC\n\
 295 TCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGC\n\
 296 CGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAA\n\
 297 CCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCC\n\
 298 AGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTG\n\
 299 AGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAA\n\
 300 GGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGA\n\
 301 TCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACT\n\
 302 AAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAG\n\
 303 GCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCG\n\
 304 CCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGT\n\
 305 GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCA\n\
 306 GGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAA\n\
 307 TTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAG\n\
 308 AATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCA\n\
 309 GCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGT\n\
 310 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACC\n\
 311 AGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTG\n\
 312 GTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACC\n\
 313 CGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAG\n\
 314 AGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT\n\
 315 TGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACA\n\
 316 TGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCT\n\
 317 GTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGG\n\
 318 TTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGT\n\
 319 CTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG\n\
 320 CGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCG\n\
 321 TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTA\n\
 322 CTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCG\n\
 323 AGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCG\n\
 324 GGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACC\n\
 325 TGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAA\n\
 326 TACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGA\n\
 327 GGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACT\n\
 328 GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTC\n\
 329 ACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGT\n\
 330 TCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC\n\
 331 CGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCG\n\
 332 CTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTG\n\
 333 GGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCC\n\
 334 CAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCT\n\
 335 GGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGC\n\
 336 GCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGA\n\
 337 GGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGA\n\
 338 GACTCCGTCTCAAAAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA\n\
 339 GGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTG\n\
 340 AAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAAT\n\
 341 CCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCA\n\
 342 GTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAA\n\
 343 AAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGC\n\
 344 GGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCT\n\
 345 ACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGG\n\
 346 GAGGCTGAGGCAGGAGAATC\n\
 347 >TWO IUB ambiguity codes\n\
 348 cttBtatcatatgctaKggNcataaaSatgtaaaDcDRtBggDtctttataattcBgtcg\n\
 349 tactDtDagcctatttSVHtHttKtgtHMaSattgWaHKHttttagacatWatgtRgaaa\n\
 350 NtactMcSMtYtcMgRtacttctWBacgaaatatagScDtttgaagacacatagtVgYgt\n\
 351 cattHWtMMWcStgttaggKtSgaYaaccWStcgBttgcgaMttBYatcWtgacaYcaga\n\
 352 gtaBDtRacttttcWatMttDBcatWtatcttactaBgaYtcttgttttttttYaaScYa\n\
 353 HgtgttNtSatcMtcVaaaStccRcctDaataataStcYtRDSaMtDttgttSagtRRca\n\
 354 tttHatSttMtWgtcgtatSSagactYaaattcaMtWatttaSgYttaRgKaRtccactt\n\
 355 tattRggaMcDaWaWagttttgacatgttctacaaaRaatataataaMttcgDacgaSSt\n\
 356 acaStYRctVaNMtMgtaggcKatcttttattaaaaagVWaHKYagtttttatttaacct\n\
 357 tacgtVtcVaattVMBcttaMtttaStgacttagattWWacVtgWYagWVRctDattBYt\n\
 358 gtttaagaagattattgacVatMaacattVctgtBSgaVtgWWggaKHaatKWcBScSWa\n\
 359 accRVacacaaactaccScattRatatKVtactatatttHttaagtttSKtRtacaaagt\n\
 360 RDttcaaaaWgcacatWaDgtDKacgaacaattacaRNWaatHtttStgttattaaMtgt\n\
 361 tgDcgtMgcatBtgcttcgcgaDWgagctgcgaggggVtaaScNatttacttaatgacag\n\
 362 cccccacatYScaMgtaggtYaNgttctgaMaacNaMRaacaaacaKctacatagYWctg\n\
 363 ttWaaataaaataRattagHacacaagcgKatacBttRttaagtatttccgatctHSaat\n\
 364 actcNttMaagtattMtgRtgaMgcataatHcMtaBSaRattagttgatHtMttaaKagg\n\
 365 YtaaBataSaVatactWtataVWgKgttaaaacagtgcgRatatacatVtHRtVYataSa\n\
 366 KtWaStVcNKHKttactatccctcatgWHatWaRcttactaggatctataDtDHBttata\n\
 367 aaaHgtacVtagaYttYaKcctattcttcttaataNDaaggaaaDYgcggctaaWSctBa\n\
 368 aNtgctggMBaKctaMVKagBaactaWaDaMaccYVtNtaHtVWtKgRtcaaNtYaNacg\n\
 369 gtttNattgVtttctgtBaWgtaattcaagtcaVWtactNggattctttaYtaaagccgc\n\
 370 tcttagHVggaYtgtNcDaVagctctctKgacgtatagYcctRYHDtgBattDaaDgccK\n\
 371 tcHaaStttMcctagtattgcRgWBaVatHaaaataYtgtttagMDMRtaataaggatMt\n\
 372 ttctWgtNtgtgaaaaMaatatRtttMtDgHHtgtcattttcWattRSHcVagaagtacg\n\
 373 ggtaKVattKYagactNaatgtttgKMMgYNtcccgSKttctaStatatNVataYHgtNa\n\
 374 BKRgNacaactgatttcctttaNcgatttctctataScaHtataRagtcRVttacDSDtt\n\
 375 aRtSatacHgtSKacYagttMHtWataggatgactNtatSaNctataVtttRNKtgRacc\n\
 376 tttYtatgttactttttcctttaaacatacaHactMacacggtWataMtBVacRaSaatc\n\
 377 cgtaBVttccagccBcttaRKtgtgcctttttRtgtcagcRttKtaaacKtaaatctcac\n\
 378 aattgcaNtSBaaccgggttattaaBcKatDagttactcttcattVtttHaaggctKKga\n\
 379 tacatcBggScagtVcacattttgaHaDSgHatRMaHWggtatatRgccDttcgtatcga\n\
 380 aacaHtaagttaRatgaVacttagattVKtaaYttaaatcaNatccRttRRaMScNaaaD\n\
 381 gttVHWgtcHaaHgacVaWtgttScactaagSgttatcttagggDtaccagWattWtRtg\n\
 382 ttHWHacgattBtgVcaYatcggttgagKcWtKKcaVtgaYgWctgYggVctgtHgaNcV\n\
 383 taBtWaaYatcDRaaRtSctgaHaYRttagatMatgcatttNattaDttaattgttctaa\n\
 384 ccctcccctagaWBtttHtBccttagaVaatMcBHagaVcWcagBVttcBtaYMccagat\n\
 385 gaaaaHctctaacgttagNWRtcggattNatcRaNHttcagtKttttgWatWttcSaNgg\n\
 386 gaWtactKKMaacatKatacNattgctWtatctaVgagctatgtRaHtYcWcttagccaa\n\
 387 tYttWttaWSSttaHcaaaaagVacVgtaVaRMgattaVcDactttcHHggHRtgNcctt\n\
 388 tYatcatKgctcctctatVcaaaaKaaaagtatatctgMtWtaaaacaStttMtcgactt\n\
 389 taSatcgDataaactaaacaagtaaVctaggaSccaatMVtaaSKNVattttgHccatca\n\
 390 cBVctgcaVatVttRtactgtVcaattHgtaaattaaattttYtatattaaRSgYtgBag\n\
 391 aHSBDgtagcacRHtYcBgtcacttacactaYcgctWtattgSHtSatcataaatataHt\n\
 392 cgtYaaMNgBaatttaRgaMaatatttBtttaaaHHKaatctgatWatYaacttMctctt\n\
 393 ttVctagctDaaagtaVaKaKRtaacBgtatccaaccactHHaagaagaaggaNaaatBW\n\
 394 attccgStaMSaMatBttgcatgRSacgttVVtaaDMtcSgVatWcaSatcttttVatag\n\
 395 ttactttacgatcaccNtaDVgSRcgVcgtgaacgaNtaNatatagtHtMgtHcMtagaa\n\
 396 attBgtataRaaaacaYKgtRccYtatgaagtaataKgtaaMttgaaRVatgcagaKStc\n\
 397 tHNaaatctBBtcttaYaBWHgtVtgacagcaRcataWctcaBcYacYgatDgtDHccta\n\
 398 aagacYRcaggattHaYgtKtaatgcVcaataMYacccatatcacgWDBtgaatcBaata\n\
 399 cKcttRaRtgatgaBDacggtaattaaYtataStgVHDtDctgactcaaatKtacaatgc\n\
 400 gYatBtRaDatHaactgtttatatDttttaaaKVccYcaaccNcBcgHaaVcattHctcg\n\
 401 attaaatBtatgcaaaaatYMctSactHatacgaWacattacMBgHttcgaatVaaaaca\n\
 402 BatatVtctgaaaaWtctRacgBMaatSgRgtgtcgactatcRtattaScctaStagKga\n\
 403 DcWgtYtDDWKRgRtHatRtggtcgaHgggcgtattaMgtcagccaBggWVcWctVaaat\n\
 404 tcgNaatcKWagcNaHtgaaaSaaagctcYctttRVtaaaatNtataaccKtaRgtttaM\n\
 405 tgtKaBtRtNaggaSattHatatWactcagtgtactaKctatttgRYYatKatgtccgtR\n\
 406 tttttatttaatatVgKtttgtatgtNtataRatWYNgtRtHggtaaKaYtKSDcatcKg\n\
 407 taaYatcSRctaVtSMWtVtRWHatttagataDtVggacagVcgKWagBgatBtaaagNc\n\
 408 aRtagcataBggactaacacRctKgttaatcctHgDgttKHHagttgttaatgHBtatHc\n\
 409 DaagtVaBaRccctVgtgDtacRHSctaagagcggWYaBtSaKtHBtaaactYacgNKBa\n\
 410 VYgtaacttagtVttcttaatgtBtatMtMtttaattaatBWccatRtttcatagVgMMt\n\
 411 agctStKctaMactacDNYgKYHgaWcgaHgagattacVgtttgtRaSttaWaVgataat\n\
 412 gtgtYtaStattattMtNgWtgttKaccaatagNYttattcgtatHcWtctaaaNVYKKt\n\
 413 tWtggcDtcgaagtNcagatacgcattaagaccWctgcagcttggNSgaNcHggatgtVt\n\
 414 catNtRaaBNcHVagagaaBtaaSggDaatWaatRccaVgggStctDaacataKttKatt\n\
 415 tggacYtattcSatcttagcaatgaVBMcttDattctYaaRgatgcattttNgVHtKcYR\n\
 416 aatRKctgtaaacRatVSagctgtWacBtKVatctgttttKcgtctaaDcaagtatcSat\n\
 417 aWVgcKKataWaYttcccSaatgaaaacccWgcRctWatNcWtBRttYaattataaNgac\n\
 418 acaatagtttVNtataNaYtaatRaVWKtBatKagtaatataDaNaaaaataMtaagaaS\n\
 419 tccBcaatNgaataWtHaNactgtcDtRcYaaVaaaaaDgtttRatctatgHtgttKtga\n\
 420 aNSgatactttcgagWaaatctKaaDaRttgtggKKagcDgataaattgSaacWaVtaNM\n\
 421 acKtcaDaaatttctRaaVcagNacaScRBatatctRatcctaNatWgRtcDcSaWSgtt\n\
 422 RtKaRtMtKaatgttBHcYaaBtgatSgaSWaScMgatNtctcctatttctYtatMatMt\n\
 423 RRtSaattaMtagaaaaStcgVgRttSVaScagtgDtttatcatcatacRcatatDctta\n\
 424 tcatVRtttataaHtattcYtcaaaatactttgVctagtaaYttagatagtSYacKaaac\n\
 425 gaaKtaaatagataatSatatgaaatSgKtaatVtttatcctgKHaatHattagaaccgt\n\
 426 YaaHactRcggSBNgtgctaaBagBttgtRttaaattYtVRaaaattgtaatVatttctc\n\
 427 ttcatgBcVgtgKgaHaaatattYatagWacNctgaaMcgaattStagWaSgtaaKagtt\n\
 428 ttaagaDgatKcctgtaHtcatggKttVDatcaaggtYcgccagNgtgcVttttagagat\n\
 429 gctaccacggggtNttttaSHaNtatNcctcatSaaVgtactgBHtagcaYggYVKNgta\n\
 430 KBcRttgaWatgaatVtagtcgattYgatgtaatttacDacSctgctaaaStttaWMagD\n\
 431 aaatcaVYctccgggcgaVtaaWtStaKMgDtttcaaMtVgBaatccagNaaatcYRMBg\n\
 432 gttWtaaScKttMWtYataRaDBMaDataatHBcacDaaKDactaMgagttDattaHatH\n\
 433 taYatDtattDcRNStgaatattSDttggtattaaNSYacttcDMgYgBatWtaMagact\n\
 434 VWttctttgYMaYaacRgHWaattgRtaagcattctMKVStatactacHVtatgatcBtV\n\
 435 NataaBttYtSttacKgggWgYDtgaVtYgatDaacattYgatggtRDaVDttNactaSa\n\
 436 MtgNttaacaaSaBStcDctaccacagacgcaHatMataWKYtaYattMcaMtgSttDag\n\
 437 cHacgatcaHttYaKHggagttccgatYcaatgatRaVRcaagatcagtatggScctata\n\
 438 ttaNtagcgacgtgKaaWaactSgagtMYtcttccaKtStaacggMtaagNttattatcg\n\
 439 tctaRcactctctDtaacWYtgaYaSaagaWtNtatttRacatgNaatgttattgWDDcN\n\
 440 aHcctgaaHacSgaataaRaataMHttatMtgaSDSKatatHHaNtacagtccaYatWtc\n\
 441 actaactatKDacSaStcggataHgYatagKtaatKagStaNgtatactatggRHacttg\n\
 442 tattatgtDVagDVaRctacMYattDgtttYgtctatggtKaRSttRccRtaaccttaga\n\
 443 gRatagSaaMaacgcaNtatgaaatcaRaagataatagatactcHaaYKBctccaagaRa\n\
 444 BaStNagataggcgaatgaMtagaatgtcaKttaaatgtaWcaBttaatRcggtgNcaca\n\
 445 aKtttScRtWtgcatagtttWYaagBttDKgcctttatMggNttattBtctagVtacata\n\
 446 aaYttacacaaRttcYtWttgHcaYYtaMgBaBatctNgcDtNttacgacDcgataaSat\n\
 447 YaSttWtcctatKaatgcagHaVaacgctgcatDtgttaSataaaaYSNttatagtaNYt\n\
 448 aDaaaNtggggacttaBggcHgcgtNtaaMcctggtVtaKcgNacNtatVaSWctWtgaW\n\
 449 cggNaBagctctgaYataMgaagatBSttctatacttgtgtKtaattttRagtDtacata\n\
 450 tatatgatNHVgBMtKtaKaNttDHaagatactHaccHtcatttaaagttVaMcNgHata\n\
 451 tKtaNtgYMccttatcaaNagctggacStttcNtggcaVtattactHaSttatgNMVatt\n\
 452 MMDtMactattattgWMSgtHBttStStgatatRaDaagattttctatMtaaaaaggtac\n\
 453 taaVttaSacNaatactgMttgacHaHRttgMacaaaatagttaatatWKRgacDgaRta\n\
 454 tatttattatcYttaWtgtBRtWatgHaaattHataagtVaDtWaVaWtgStcgtMSgaS\n\
 455 RgMKtaaataVacataatgtaSaatttagtcgaaHtaKaatgcacatcggRaggSKctDc\n\
 456 agtcSttcccStYtccRtctctYtcaaKcgagtaMttttcRaYDttgttatctaatcata\n\
 457 NctctgctatcaMatactataggDaHaaSttMtaDtcNatataattctMcStaaBYtaNa\n\
 458 gatgtaatHagagSttgWHVcttatKaYgDctcttggtgttMcRaVgSgggtagacaata\n\
 459 aDtaattSaDaNaHaBctattgNtaccaaRgaVtKNtaaYggHtaKKgHcatctWtctDt\n\
 460 ttctttggSDtNtaStagttataaacaattgcaBaBWggHgcaaaBtYgctaatgaaatW\n\
 461 cDcttHtcMtWWattBHatcatcaaatctKMagtDNatttWaBtHaaaNgMttaaStagt\n\
 462 tctctaatDtcRVaYttgttMtRtgtcaSaaYVgSWDRtaatagctcagDgcWWaaaBaa\n\
 463 RaBctgVgggNgDWStNaNBKcBctaaKtttDcttBaaggBttgaccatgaaaNgttttt\n\
 464 tttatctatgttataccaaDRaaSagtaVtDtcaWatBtacattaWacttaSgtattggD\n\
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 823 HaaatatDNaggctgaNcaaggagttBttMgRagVatBcRtaWgatgBtSgaKtcgHttt\n\
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 848 >THREE Homo sapiens frequency\n\
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1596 acttttgtctattcaaaagattgaatagttttttatacaaaagccgcatacttatgacgg\n\
1597 ctagtatacagtttcatcccctagcatcaatgctatggacagtattgaacttataggaaa\n\
1598 ttcttctaatagggcaaatccgtcgtgatgcctattttttttcagtcacatcctcaaatg\n\
1599 gcactagtattgtcgggatcccattaacaggctcaaccacgagctcacgcgaggacatgt\n\
1600 agtccgtatctttaacgaagcgacagcgacagaactcccatggataaccaattataaggc\n\
1601 ccgtaatcctctagacatcgtttaccaataaatccgctttctccgtaatcatgttgaata\n\
1602 ccccagagtagtccagatgataaccgatgaaacacaagtctttctcaatgcacttacggt\n\
1603 gaacttattaccgccaacgtagctcatcaaggttgcgacatctagttgtgtgtttgcgac\n\
1604 gagcccagcgaacttcatcaactttcgtatattcaacgccttgtaattttactttaagac\n\
1605 gcctggtgatgtagattcttagataatcagtttgttatcggctgtactttaccataattt\n\
1606 cacaggtttcaggtcaagaagattatagctgtatatacagttccatgctcggtgcacaga\n\
1607 aacgtgatcggataataatcaatcgcttatgtcgtctttaggcgtatccaatacatgccc\n\
1608 cgataccgcagtgtatttcgacatgtaggtataccgtcgcatttgagctcgagtcaggac\n\
1609 gtcagctagattagattccttaatagaatataccgacctctagtccgaactaaactatag\n\
1610 ataacgccaacttcaggttaattgtctagtcgtctgtttgcagatgggattcttagatga\n\
1611 gtgagtatcggccatattggttcgagcactttagtttttgatgcataggatatgcaatgt\n\
1612 atagctgaaagtactttatctgtttcaaactcacattgattaaaccggtaaacctttaaa\n\
1613 gactacaagaaaatattcagtgagggcaattttgtcaatcacaatcttccagctagagat\n\
1614 acttcacaatttgtcttgaggctacgcaacattagacggattttcgcgttttattgaaat\n\
1615 aatcgaggggcccaagagtatccatagttcattttgtaagatttctttacaggcttatta\n\
1616 cagcttcttcagactcctacatgcttacgagttatatgctagcatgtgaacaatagatta\n\
1617 atatacaggaaaacgtacattgagagagatgaccctacacagcgcaaccgttgagtactt\n\
1618 tcattaaagggtaacgctctcgagacagcatccttaagatggccttattgtcaaatcatt\n\
1619 tgcagaagtacgcaagatccctaaccaacgtagaagaatccctacaaacacatgagacgc\n\
1620 ggtgaaaatagacagggtgttagtattcaatcttcggagtatcaatttcgccaatcttgg\n\
1621 tgagaaagcataccctttcttcagagaaagaagatcaatcataacactatctttaacgag\n\
1622 gtacgcacgcgcatcattacctgcctccatggatctttaggatagcggaaagtattggca\n\
1623 gcgtattgtgatttcgttcctactttatcaatttcacattcatatacatgtcttttatca\n\
1624 aaatcgccaataagataggatgagctatattagatgctagtagagttcgcgccaacatca\n\
1625 tcgataggaatactcaggacagcgtgataggacttttcaatccctaatactctctataat\n\
1626 tataactctctcttaagtttggaggcagtaacgcgctctatataatcagtttgctgcacc\n\
1627 attcttcagcctctgatacatacaaataaattccacagcagtaagagggtttaattgaga\n\
1628 catcttgggaacttaggattttactctaacatcaccgaaacgattattggataccgtacc\n\
1629 taaacgaactttctcaaggcagtaatataggacatccgcaataacacaaatgctgcctcc\n\
1630 ccaggagttatgtcttcctggaggctatatcttacacccactcactataggcaaactaaa\n\
1631 gtttaaatgttgattgtctaaaaaaaagatagataagagttggccggcgtagcacatgcg\n\
1632 aaagtgaatcgtaagctataattctctggacttgaagttctgtcctgttcctctgcaaga\n\
1633 aacaaacttcctttaaagctatttacgacgcacatctcagcaagttataaacatgttgga\n\
1634 agtttctagtcggaattcccaaagaacggatctatctaatgcattcctacatttttcctg\n\
1635 tctgccgatggtgccatcctattcaaagaatttcttaaaagtagattaaatgggactttt\n\
1636 aacaatgagtaaccttacgcctctaagggttcctcgagtgccatacaccagtcaggtccg\n\
1637 agccacatacacggagaacattctaacatagcattctcaactcgatcatttgcaggttac\n\
1638 ttctttcctatcctagtgctaaaaatcatacttgcaatcccatagcacggattaagaacc\n\
1639 taagaaacaattcagtaaaacatgttcgaattcttggtatgggaacatcattgcagctat\n\
1640 ggtctaacgcattaatgtttgggtacatcttccatcatataaacaggaagagtctgacga\n\
1641 cagggagtgcttgcgatcatgtctatcattgtgaaatcaaattgtagctcacatgtcgtc\n\
1642 tatgagagcgtgtatccgataagatttagaaaaatagaagtcgtataagatctcactgaa\n\
1643 cttttgaatgaatgtgaagcatatatgatctgctttaataaaactttatccataggatac\n\
1644 gtttccaaatcaattcaataattattagtcaaaatagataaggatgaacaacctgaaggc\n\
1645 cgatcggacgtagaaagtggtcccatcactttgagttgatattgttgaaccacacgttat\n\
1646 tatggttttcaaacagtctcaggatattgtatatacagataatccgataccagttgtctg\n\
1647 acgcccctcttacgtaccccaccctttgtgacgtttaaagcagttgttcagtattttaaa\n\
1648 ctaggcggcaactaatttggaaagaagcacagtggatatgtctaaattcttgttattcag\n\
1649 gcctgaatttaatacaccgcatagttaacttcgcggtagagttgttcatcatgcctcctc\n\
1650 taagctaccacttctatgatacaccaatagttgttctacggaatctgataattggccaag\n\
1651 tcataaacttccgctgcgttcaacccccttgctcgaatatccaactcgaaaagacagcct\n\
1652 tttggtgtccggaacaaatcagttacttcttttctgatgttaattctctgtggtcagata\n\
1653 cagaccaaaaactccgcggatttaccatcctccaagaacaaatttgcatcaacatagcat\n\
1654 tttggctacatattctaagtctcaatagtttaggttttcaactacattatcccaacatta\n\
1655 ggattggaggaataatagctgggtaagtccccttgcgtctacaatcgactattttttatg\n\
1656 aatatgcttctgccgcacctatggttattaaaaaagtcatgactttgaagaaccctgaaa\n\
1657 agatagatgaatcaggtgtaatggcagcagccaaagagcatataattagcaacactctaa\n\
1658 gaacattatagatatgatgatagcgatcgtcatgatgttatccggtcacaatagtagctt\n\
1659 catcagctaattcgttttgccagtggtgacttgcgctggaagaatcgttatacggtccct\n\
1660 tccctcttgatacggtgggggcttattcaaccgcgtggattgggttgtcatacttgcatt\n\
1661 aaacgatgtaaaccatctagtagtcaactatactaaatcacaaaatagtgatcaatacat\n\
1662 acccgcttcatggttttaaccatttaattgattaaagatattccgctaagaaccattatc\n\
1663 tacctaaactgatcgccgtatcctagtagtttgaaatttgatgtaccgtaatgatcaacg\n\
1664 aagtaaaacgttatattgtatgtagaataataggtcttggagctaaatgatgtgattggt\n\
1665 agtgaagacttacccttacaactttaccggtttctcggaagaatatactagagaatcaat\n\
1666 gcatgggctacataagcactttagtctaatgagataaaaaatacacgagtcttccatcat\n\
1667 gaattttttgtcgaaaaactcgaacctggtaatttaaaccatatatctttatgtcgtcaa\n\
1668 taactctcatatgttttatataacttcccaatcacgacttgtaactgcttgttcgactga\n\
1669 gctgtttgagctatgaggccgggatccggttgagctacatctatttgctacaagaaaaat\n\
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1671 tgcggcctgcctccatattcaagtgtatcttaaaccaagtggttccaacgctcgcgctaa\n\
1672 agaattaaagcctttatttcctccacggagtagcccgtaatccggttcgaaagagaccat\n\
1673 tgaagttaattttcatatccagtgaagtttaggcacaagcatgtgttctgccacatgcct\n\
1674 caaagcgctcttcaaccaagatatgattcatcctaacttcgatgaatgcgtctgtaacat\n\
1675 aaatatagaaggaatgattcggcgagttaattttcgccttctccaacatggcatccctac\n\
1676 gttcgttataaggaccatacatgtaggttttaaaggtttgcggttaatcgatatttacat\n\
1677 catagaaattctatagtcaaatttacaagactctagatactcactcgttgcagccggcta\n\
1678 ggaagcgctttgtaccttacttcccttttcgttgcgtaatatgaatttcatatagtaagt\n\
1679 tcaaggcactcatacctccgtgaagagggtagatagactattaaagttgtttaatagtac\n\
1680 gtattgatggaaatgacccgtaggagatttaccactcaatccacaagattcgctgctgtg\n\
1681 cattatcaaaacagtgcatgtcgaaacatgggttgggtccttcaaacacgaatccaggta\n\
1682 gagatacctttgcaattttt\n";
1683
1684 dnaInput = dnaInput + dnaInput + dnaInput;
1685
1686 var ilen, clen,
1687  seqs = [
1688   /agggtaaa|tttaccct/ig,
1689   /[cgt]gggtaaa|tttaccc[acg]/ig,
1690   /a[act]ggtaaa|tttacc[agt]t/ig],
1691  seqs2 = [/ag[act]gtaaa|tttac[agt]ct/ig,
1692   /agg[act]taaa|ttta[agt]cct/ig,
1693   /aggg[acg]aaa|ttt[cgt]ccct/ig],
1694   seqs3 = [/agggt[cgt]aa|tt[acg]accct/ig,
1695   /agggta[cgt]a|t[acg]taccct/ig,
1696   /agggtaa[cgt]|[acg]ttaccct/ig],
1697  subs = {
1698   B: '(c|g|t)', D: '(a|g|t)', H: '(a|c|t)', K: '(g|t)',
1699   M: '(a|c)', N: '(a|c|g|t)', R: '(a|g)', S: '(c|t)',
1700   V: '(a|c|g)', W: '(a|t)', Y: '(c|t)' }
1701
1702 ilen = dnaInput.length;
1703
1704 // There is no in-place substitution
1705 dnaInput = dnaInput.replace(/>.*\n|\n/g,"")
1706 clen = dnaInput.length
1707
1708 var dnaOutputString;
1709
1710 window.onload = function(){ startTest("sunspider-regexp-dna", '4a9a13f2');
1711
1712 test("DNA Match (1)", function(){
1713         for(i in seqs)
1714                 dnaOutputString += seqs[i].source + " " + (dnaInput.match(seqs[i]) || []).length + "\n";
1715                 // match returns null if no matches, so replace with empty
1716 });
1717
1718 test("DNA Match (2)", function(){
1719         for(i in seqs2)
1720                 dnaOutputString += seqs2[i].source + " " + (dnaInput.match(seqs2[i]) || []).length + "\n";
1721                 // match returns null if no matches, so replace with empty
1722 });
1723
1724 test("DNA Match (3)", function(){
1725         for(i in seqs3)
1726                 dnaOutputString += seqs3[i].source + " " + (dnaInput.match(seqs3[i]) || []).length + "\n";
1727                 // match returns null if no matches, so replace with empty
1728 });
1729
1730 test("DNA Replace", function(){
1731         for(k in subs)
1732                 dnaInput = dnaInput.replace(k, subs[k]) // FIXME: Would like this to be a global substitution in a future version of SunSpider.
1733                 // search string, replacement string, flags
1734 });
1735
1736 endTest(); };
1737 </script>
1738 </head>
1739 <body></body>
1740 </html>