thesis.log

   1 This is pdfTeXk, Version 3.1415926-1.40.9 (Web2C 7.5.7) (format=pdflatex 2008.12.28)  8 FEB 2010 11:27
   2 entering extended mode
   3 \write18 enabled.
   4  %&-line parsing enabled.
   5 **thesis.tex
   6 (./thesis.tex
   7 LaTeX2e <2005/12/01>
   8 Babel <v3.8l> and hyphenation patterns for english, usenglishmax, dumylang, noh
   9 yphenation, german-x-2008-06-18, ngerman-x-2008-06-18, ancientgreek, ibycus, ar
  10 abic, basque, bulgarian, catalan, pinyin, coptic, croatian, czech, danish, dutc
  11 h, esperanto, estonian, farsi, finnish, french, galician, german, ngerman, mono
  12 greek, greek, hungarian, icelandic, indonesian, interlingua, irish, italian, la
  13 tin, lithuanian, mongolian, mongolian2a, bokmal, nynorsk, polish, portuguese, r
  14 omanian, russian, sanskrit, serbian, slovak, slovenian, spanish, swedish, turki
  15 sh, ukenglish, ukrainian, uppersorbian, welsh, loaded.
  16 (./phdthesis.cls
  17 Document Class: phdthesis 2001/07/18 PhD Dissertation Style
  18 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/base/book.cls
  19 Document Class: book 2005/09/16 v1.4f Standard LaTeX document class
  20 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/base/bk10.clo
  21 File: bk10.clo 2005/09/16 v1.4f Standard LaTeX file (size option)
  22 )
  23 \c@part=\count79
  24 \c@chapter=\count80
  25 \c@section=\count81
  26 \c@subsection=\count82
  27 \c@subsubsection=\count83
  28 \c@paragraph=\count84
  29 \c@subparagraph=\count85
  30 \c@figure=\count86
  31 \c@table=\count87
  32 \abovecaptionskip=\skip41
  33 \belowcaptionskip=\skip42
  34 \bibindent=\dimen102
  35 )
  36 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/graphics/epsfig.sty
  37 Package: epsfig 1999/02/16 v1.7a (e)psfig emulation (SPQR)
  38
  39 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/graphics/graphicx.sty
  40 Package: graphicx 1999/02/16 v1.0f Enhanced LaTeX Graphics (DPC,SPQR)
  41
  42 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/graphics/keyval.sty
  43 Package: keyval 1999/03/16 v1.13 key=value parser (DPC)
  44 \KV@toks@=\toks14
  45 )
  46 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/graphics/graphics.sty
  47 Package: graphics 2006/02/20 v1.0o Standard LaTeX Graphics (DPC,SPQR)
  48
  49 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/graphics/trig.sty
  50 Package: trig 1999/03/16 v1.09 sin cos tan (DPC)
  51 )
  52 (/usr/local/texlive/2008/texmf/tex/latex/config/graphics.cfg
  53 File: graphics.cfg 2007/01/18 v1.5 graphics configuration of teTeX/TeXLive
  54 )
  55 Package graphics Info: Driver file: pdftex.def on input line 90.
  56
  57 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/pdftex-def/pdftex.def
  58 File: pdftex.def 2008/09/08 v0.04l Graphics/color for pdfTeX
  59 \Gread@gobject=\count88
  60 ))
  61 \Gin@req@height=\dimen103
  62 \Gin@req@width=\dimen104
  63 )
  64 \epsfxsize=\dimen105
  65 \epsfysize=\dimen106
  66 )
  67 \@spacebeforechapterhead=\skip43
  68 \@spaceinchapterhead=\skip44
  69 \@spaceafterchapterhead=\skip45
  70 )
  71 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/fouriernc/fouriernc.sty
  72 Package: fouriernc 2005/12/20 1.0 fouriernc package
  73
  74 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/fourier/fourier.sty
  75 Package: fourier 2005/01/01 1.4 fourier-GUTenberg package
  76
  77 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/base/fontenc.sty
  78 Package: fontenc 2005/09/27 v1.99g Standard LaTeX package
  79
  80 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/base/t1enc.def
  81 File: t1enc.def 2005/09/27 v1.99g Standard LaTeX file
  82 LaTeX Font Info:    Redeclaring font encoding T1 on input line 43.
  83 ))
  84 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/base/textcomp.sty
  85 Package: textcomp 2005/09/27 v1.99g Standard LaTeX package
  86 Package textcomp Info: Sub-encoding information:
  87 (textcomp)               5 = only ISO-Adobe without \textcurrency
  88 (textcomp)               4 = 5 + \texteuro
  89 (textcomp)               3 = 4 + \textohm
  90 (textcomp)               2 = 3 + \textestimated + \textcurrency
  91 (textcomp)               1 = TS1 - \textcircled - \t
  92 (textcomp)               0 = TS1 (full)
  93 (textcomp)             Font families with sub-encoding setting implement
  94 (textcomp)             only a restricted character set as indicated.
  95 (textcomp)             Family '?' is the default used for unknown fonts.
  96 (textcomp)             See the documentation for details.
  97 Package textcomp Info: Setting ? sub-encoding to TS1/1 on input line 71.
  98
  99 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/base/ts1enc.def
 100 File: ts1enc.def 2001/06/05 v3.0e (jk/car/fm) Standard LaTeX file
 101 )
 102 LaTeX Info: Redefining \oldstylenums on input line 266.
 103 Package textcomp Info: Setting cmr sub-encoding to TS1/0 on input line 281.
 104 Package textcomp Info: Setting cmss sub-encoding to TS1/0 on input line 282.
 105 Package textcomp Info: Setting cmtt sub-encoding to TS1/0 on input line 283.
 106 Package textcomp Info: Setting cmvtt sub-encoding to TS1/0 on input line 284.
 107 Package textcomp Info: Setting cmbr sub-encoding to TS1/0 on input line 285.
 108 Package textcomp Info: Setting cmtl sub-encoding to TS1/0 on input line 286.
 109 Package textcomp Info: Setting ccr sub-encoding to TS1/0 on input line 287.
 110 Package textcomp Info: Setting ptm sub-encoding to TS1/4 on input line 288.
 111 Package textcomp Info: Setting pcr sub-encoding to TS1/4 on input line 289.
 112 Package textcomp Info: Setting phv sub-encoding to TS1/4 on input line 290.
 113 Package textcomp Info: Setting ppl sub-encoding to TS1/3 on input line 291.
 114 Package textcomp Info: Setting pag sub-encoding to TS1/4 on input line 292.
 115 Package textcomp Info: Setting pbk sub-encoding to TS1/4 on input line 293.
 116 Package textcomp Info: Setting pnc sub-encoding to TS1/4 on input line 294.
 117 Package textcomp Info: Setting pzc sub-encoding to TS1/4 on input line 295.
 118 Package textcomp Info: Setting bch sub-encoding to TS1/4 on input line 296.
 119 Package textcomp Info: Setting put sub-encoding to TS1/5 on input line 297.
 120 Package textcomp Info: Setting uag sub-encoding to TS1/5 on input line 298.
 121 Package textcomp Info: Setting ugq sub-encoding to TS1/5 on input line 299.
 122 Package textcomp Info: Setting ul8 sub-encoding to TS1/4 on input line 300.
 123 Package textcomp Info: Setting ul9 sub-encoding to TS1/4 on input line 301.
 124 Package textcomp Info: Setting augie sub-encoding to TS1/5 on input line 302.
 125 Package textcomp Info: Setting dayrom sub-encoding to TS1/3 on input line 303.
 126 Package textcomp Info: Setting dayroms sub-encoding to TS1/3 on input line 304.
 127
 128 Package textcomp Info: Setting pxr sub-encoding to TS1/0 on input line 305.
 129 Package textcomp Info: Setting pxss sub-encoding to TS1/0 on input line 306.
 130 Package textcomp Info: Setting pxtt sub-encoding to TS1/0 on input line 307.
 131 Package textcomp Info: Setting txr sub-encoding to TS1/0 on input line 308.
 132 Package textcomp Info: Setting txss sub-encoding to TS1/0 on input line 309.
 133 Package textcomp Info: Setting txtt sub-encoding to TS1/0 on input line 310.
 134 Package textcomp Info: Setting futs sub-encoding to TS1/4 on input line 311.
 135 Package textcomp Info: Setting futx sub-encoding to TS1/4 on input line 312.
 136 Package textcomp Info: Setting futj sub-encoding to TS1/4 on input line 313.
 137 Package textcomp Info: Setting hlh sub-encoding to TS1/3 on input line 314.
 138 Package textcomp Info: Setting hls sub-encoding to TS1/3 on input line 315.
 139 Package textcomp Info: Setting hlst sub-encoding to TS1/3 on input line 316.
 140 Package textcomp Info: Setting hlct sub-encoding to TS1/5 on input line 317.
 141 Package textcomp Info: Setting hlx sub-encoding to TS1/5 on input line 318.
 142 Package textcomp Info: Setting hlce sub-encoding to TS1/5 on input line 319.
 143 Package textcomp Info: Setting hlcn sub-encoding to TS1/5 on input line 320.
 144 Package textcomp Info: Setting hlcw sub-encoding to TS1/5 on input line 321.
 145 Package textcomp Info: Setting hlcf sub-encoding to TS1/5 on input line 322.
 146 Package textcomp Info: Setting pplx sub-encoding to TS1/3 on input line 323.
 147 Package textcomp Info: Setting pplj sub-encoding to TS1/3 on input line 324.
 148 Package textcomp Info: Setting ptmx sub-encoding to TS1/4 on input line 325.
 149 Package textcomp Info: Setting ptmj sub-encoding to TS1/4 on input line 326.
 150 )
 151 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/fourier/fourier-orns.sty
 152 Package: fourier-orns 2004/01/30 1.1 fourier-ornaments package
 153 )
 154 LaTeX Font Info:    Redeclaring symbol font `operators' on input line 50.
 155
 156
 157 LaTeX Font Warning: Encoding `OT1' has changed to `T1' for symbol font
 158 (Font)              `operators' in the math version `normal' on input line 50.
 159
 160 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `operators' in version `normal'
 161 (Font)                  OT1/cmr/m/n --> T1/futs/m/n on input line 50.
 162
 163 LaTeX Font Warning: Encoding `OT1' has changed to `T1' for symbol font
 164 (Font)              `operators' in the math version `bold' on input line 50.
 165
 166 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `operators' in version `bold'
 167 (Font)                  OT1/cmr/bx/n --> T1/futs/m/n on input line 50.
 168 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `operators' in version `bold'
 169 (Font)                  T1/futs/m/n --> T1/futs/b/n on input line 51.
 170 LaTeX Font Info:    Redeclaring symbol font `letters' on input line 59.
 171
 172 LaTeX Font Warning: Encoding `OML' has changed to `FML' for symbol font
 173 (Font)              `letters' in the math version `normal' on input line 59.
 174
 175 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `letters' in version `normal'
 176 (Font)                  OML/cmm/m/it --> FML/futmi/m/it on input line 59.
 177
 178 LaTeX Font Warning: Encoding `OML' has changed to `FML' for symbol font
 179 (Font)              `letters' in the math version `bold' on input line 59.
 180
 181 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `letters' in version `bold'
 182 (Font)                  OML/cmm/b/it --> FML/futmi/m/it on input line 59.
 183 \symotherletters=\mathgroup4
 184 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `letters' in version `bold'
 185 (Font)                  FML/futmi/m/it --> FML/futmi/b/it on input line 61.
 186 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `otherletters' in version `bold'
 187 (Font)                  FML/futm/m/it --> FML/futm/b/it on input line 62.
 188 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \Gamma on input line 63.
 189 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \Delta on input line 64.
 190 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \Theta on input line 65.
 191 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \Lambda on input line 66.
 192 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \Xi on input line 67.
 193 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \Pi on input line 68.
 194 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \Sigma on input line 69.
 195 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \Upsilon on input line 70.
 196 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \Phi on input line 71.
 197 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \Psi on input line 72.
 198 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \Omega on input line 73.
 199 LaTeX Font Info:    Redeclaring symbol font `symbols' on input line 113.
 200
 201 LaTeX Font Warning: Encoding `OMS' has changed to `FMS' for symbol font
 202 (Font)              `symbols' in the math version `normal' on input line 113.
 203
 204 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `symbols' in version `normal'
 205 (Font)                  OMS/cmsy/m/n --> FMS/futm/m/n on input line 113.
 206
 207 LaTeX Font Warning: Encoding `OMS' has changed to `FMS' for symbol font
 208 (Font)              `symbols' in the math version `bold' on input line 113.
 209
 210 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `symbols' in version `bold'
 211 (Font)                  OMS/cmsy/b/n --> FMS/futm/m/n on input line 113.
 212 LaTeX Font Info:    Redeclaring symbol font `largesymbols' on input line 114.
 213
 214 LaTeX Font Warning: Encoding `OMX' has changed to `FMX' for symbol font
 215 (Font)              `largesymbols' in the math version `normal' on input line 1
 216 14.
 217
 218 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `largesymbols' in version `normal'
 219 (Font)                  OMX/cmex/m/n --> FMX/futm/m/n on input line 114.
 220
 221 LaTeX Font Warning: Encoding `OMX' has changed to `FMX' for symbol font
 222 (Font)              `largesymbols' in the math version `bold' on input line 114
 223 .
 224
 225 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `largesymbols' in version `bold'
 226 (Font)                  OMX/cmex/m/n --> FMX/futm/m/n on input line 114.
 227 LaTeX Font Info:    Redeclaring math alphabet \mathbf on input line 115.
 228 LaTeX Font Info:    Overwriting math alphabet `\mathbf' in version `normal'
 229 (Font)                  OT1/cmr/bx/n --> T1/futs/bx/n on input line 115.
 230 LaTeX Font Info:    Overwriting math alphabet `\mathbf' in version `bold'
 231 (Font)                  OT1/cmr/bx/n --> T1/futs/bx/n on input line 115.
 232 LaTeX Font Info:    Redeclaring math alphabet \mathrm on input line 116.
 233 LaTeX Font Info:    Redeclaring math alphabet \mathit on input line 117.
 234 LaTeX Font Info:    Overwriting math alphabet `\mathit' in version `normal'
 235 (Font)                  OT1/cmr/m/it --> T1/futs/m/it on input line 117.
 236 LaTeX Font Info:    Overwriting math alphabet `\mathit' in version `bold'
 237 (Font)                  OT1/cmr/bx/it --> T1/futs/m/it on input line 117.
 238 LaTeX Font Info:    Redeclaring math alphabet \mathcal on input line 118.
 239 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \parallel on input line 134.
 240 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \hbar on input line 148.
 241 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \varkappa on input line 186.
 242 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \varvarrho on input line 187.
 243 LaTeX Font Info:    Redeclaring math delimiter \Vert on input line 210.
 244 LaTeX Font Info:    Redeclaring math delimiter \vert on input line 215.
 245 LaTeX Font Info:    Redeclaring math delimiter \Downarrow on input line 225.
 246 LaTeX Font Info:    Redeclaring math delimiter \backslash on input line 227.
 247 LaTeX Font Info:    Redeclaring math delimiter \rangle on input line 229.
 248 LaTeX Font Info:    Redeclaring math delimiter \langle on input line 231.
 249 LaTeX Font Info:    Redeclaring math delimiter \rbrace on input line 233.
 250 LaTeX Font Info:    Redeclaring math delimiter \lbrace on input line 235.
 251 LaTeX Font Info:    Redeclaring math delimiter \rceil on input line 237.
 252 LaTeX Font Info:    Redeclaring math delimiter \lceil on input line 239.
 253 LaTeX Font Info:    Redeclaring math delimiter \rfloor on input line 241.
 254 LaTeX Font Info:    Redeclaring math delimiter \lfloor on input line 243.
 255 LaTeX Font Info:    Redeclaring math accent \acute on input line 247.
 256 LaTeX Font Info:    Redeclaring math accent \grave on input line 248.
 257 LaTeX Font Info:    Redeclaring math accent \ddot on input line 249.
 258 LaTeX Font Info:    Redeclaring math accent \tilde on input line 250.
 259 LaTeX Font Info:    Redeclaring math accent \bar on input line 251.
 260 LaTeX Font Info:    Redeclaring math accent \breve on input line 252.
 261 LaTeX Font Info:    Redeclaring math accent \check on input line 253.
 262 LaTeX Font Info:    Redeclaring math accent \hat on input line 254.
 263 LaTeX Font Info:    Redeclaring math accent \dot on input line 255.
 264 LaTeX Font Info:    Redeclaring math accent \mathring on input line 256.
 265 \symUfutm=\mathgroup5
 266 )
 267 LaTeX Font Info:    Redeclaring symbol font `letters' on input line 16.
 268 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `letters' in version `normal'
 269 (Font)                  FML/futmi/m/it --> FML/fncmi/m/it on input line 16.
 270 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `letters' in version `bold'
 271 (Font)                  FML/futmi/b/it --> FML/fncmi/m/it on input line 16.
 272 LaTeX Font Info:    Redeclaring symbol font `otherletters' on input line 17.
 273 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `otherletters' in version `normal'
 274 (Font)                  FML/futm/m/it --> FML/fncm/m/it on input line 17.
 275 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `otherletters' in version `bold'
 276 (Font)                  FML/futm/b/it --> FML/fncm/m/it on input line 17.
 277 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `letters' in version `bold'
 278 (Font)                  FML/fncmi/m/it --> FML/fncmi/b/it on input line 18.
 279 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `otherletters' in version `bold'
 280 (Font)                  FML/fncm/m/it --> FML/fncm/b/it on input line 19.
 281 LaTeX Font Info:    Redeclaring symbol font `operators' on input line 32.
 282 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `operators' in version `normal'
 283 (Font)                  T1/futs/m/n --> T1/fnc/m/n on input line 32.
 284 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `operators' in version `bold'
 285 (Font)                  T1/futs/b/n --> T1/fnc/m/n on input line 32.
 286 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `operators' in version `bold'
 287 (Font)                  T1/fnc/m/n --> T1/fnc/b/n on input line 33.
 288 LaTeX Font Info:    Redeclaring symbol font `symbols' on input line 34.
 289 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `symbols' in version `normal'
 290 (Font)                  FMS/futm/m/n --> FMS/fncm/m/n on input line 34.
 291 LaTeX Font Info:    Overwriting symbol font `symbols' in version `bold'
 292 (Font)                  FMS/futm/m/n --> FMS/fncm/m/n on input line 34.
 293 LaTeX Font Info:    Redeclaring math alphabet \mathbf on input line 35.
 294 LaTeX Font Info:    Overwriting math alphabet `\mathbf' in version `normal'
 295 (Font)                  T1/futs/bx/n --> T1/fnc/b/n on input line 35.
 296 LaTeX Font Info:    Overwriting math alphabet `\mathbf' in version `bold'
 297 (Font)                  T1/futs/bx/n --> T1/fnc/b/n on input line 35.
 298 LaTeX Font Info:    Redeclaring math alphabet \mathrm on input line 36.
 299 LaTeX Font Info:    Overwriting math alphabet `\mathrm' in version `normal'
 300 (Font)                  T1/futs/m/n --> T1/fnc/m/n on input line 36.
 301 LaTeX Font Info:    Overwriting math alphabet `\mathrm' in version `bold'
 302 (Font)                  T1/futs/m/n --> T1/fnc/m/n on input line 36.
 303 LaTeX Font Info:    Redeclaring math alphabet \mathit on input line 37.
 304 LaTeX Font Info:    Overwriting math alphabet `\mathit' in version `normal'
 305 (Font)                  T1/futs/m/it --> T1/fnc/m/it on input line 37.
 306 LaTeX Font Info:    Overwriting math alphabet `\mathit' in version `bold'
 307 (Font)                  T1/futs/m/it --> T1/fnc/m/it on input line 37.
 308 LaTeX Font Info:    Redeclaring math alphabet \mathcal on input line 38.
 309 LaTeX Font Info:    Overwriting math alphabet `\mathcal' in version `normal'
 310 (Font)                  FMS/futm/m/n --> FMS/fncm/m/n on input line 38.
 311 LaTeX Font Info:    Overwriting math alphabet `\mathcal' in version `bold'
 312 (Font)                  FMS/futm/m/n --> FMS/fncm/m/n on input line 38.
 313 ) (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/base/makeidx.sty
 314 Package: makeidx 2000/03/29 v1.0m Standard LaTeX package
 315 )
 316 \@indexfile=\write3
 317 \openout3 = `thesis.idx'.
 318
 319
 320 Writing index file thesis.idx
 321 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/fancyhdr/fancyheadings.sty
 322 Package: fancyheadings 2008/02/04 1.99 Dummy package to call fancyhdr
 323
 324
 325 Package fancyheadings Warning: Please stop using fancyheadings!
 326 (fancyheadings)                Use fancyhdr instead.
 327 (fancyheadings)                We will call fancyhdr with the very same
 328 (fancyheadings)                options you passed to fancyheadings.
 329 (fancyheadings)
 330 (fancyheadings)                fancyhdr is 99 percent compatible with
 331 (fancyheadings)                fancyheadings. The only incompatibility is
 332 (fancyheadings)                that \headrulewidth and \footrulewidth and
 333 (fancyheadings)                their \plain... versions are no longer length
 334 (fancyheadings)                parameters, but normal macros (to be changed
 335 (fancyheadings)                with \renewcommand rather than \setlength)..
 336
 337 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/fancyhdr/fancyhdr.sty
 338 \fancy@headwidth=\skip46
 339 \f@ncyO@elh=\skip47
 340 \f@ncyO@erh=\skip48
 341 \f@ncyO@olh=\skip49
 342 \f@ncyO@orh=\skip50
 343 \f@ncyO@elf=\skip51
 344 \f@ncyO@erf=\skip52
 345 \f@ncyO@olf=\skip53
 346 \f@ncyO@orf=\skip54
 347 ))
 348 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsmath/amsmath.sty
 349 Package: amsmath 2000/07/18 v2.13 AMS math features
 350 \@mathmargin=\skip55
 351
 352 For additional information on amsmath, use the `?' option.
 353 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsmath/amstext.sty
 354 Package: amstext 2000/06/29 v2.01
 355
 356 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsmath/amsgen.sty
 357 File: amsgen.sty 1999/11/30 v2.0
 358 \@emptytoks=\toks15
 359 \ex@=\dimen107
 360 ))
 361 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsmath/amsbsy.sty
 362 Package: amsbsy 1999/11/29 v1.2d
 363 \pmbraise@=\dimen108
 364 )
 365 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsmath/amsopn.sty
 366 Package: amsopn 1999/12/14 v2.01 operator names
 367 )
 368 \inf@bad=\count89
 369 LaTeX Info: Redefining \frac on input line 211.
 370 \uproot@=\count90
 371 \leftroot@=\count91
 372 LaTeX Info: Redefining \overline on input line 307.
 373 \classnum@=\count92
 374 \DOTSCASE@=\count93
 375 LaTeX Info: Redefining \ldots on input line 379.
 376 LaTeX Info: Redefining \dots on input line 382.
 377 LaTeX Info: Redefining \cdots on input line 467.
 378 \Mathstrutbox@=\box26
 379 \strutbox@=\box27
 380 \big@size=\dimen109
 381 LaTeX Font Info:    Redeclaring font encoding OML on input line 567.
 382 LaTeX Font Info:    Redeclaring font encoding OMS on input line 568.
 383 \macc@depth=\count94
 384 \c@MaxMatrixCols=\count95
 385 \dotsspace@=\muskip10
 386 \c@parentequation=\count96
 387 \dspbrk@lvl=\count97
 388 \tag@help=\toks16
 389 \row@=\count98
 390 \column@=\count99
 391 \maxfields@=\count100
 392 \andhelp@=\toks17
 393 \eqnshift@=\dimen110
 394 \alignsep@=\dimen111
 395 \tagshift@=\dimen112
 396 \tagwidth@=\dimen113
 397 \totwidth@=\dimen114
 398 \lineht@=\dimen115
 399 \@envbody=\toks18
 400 \multlinegap=\skip56
 401 \multlinetaggap=\skip57
 402 \mathdisplay@stack=\toks19
 403 LaTeX Info: Redefining \[ on input line 2666.
 404 LaTeX Info: Redefining \] on input line 2667.
 405 )
 406 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsfonts/amssymb.sty
 407 Package: amssymb 2002/01/22 v2.2d
 408
 409 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsfonts/amsfonts.sty
 410 Package: amsfonts 2001/10/25 v2.2f
 411 \symAMSa=\mathgroup6
 412 \symAMSb=\mathgroup7
 413 LaTeX Font Info:    Overwriting math alphabet `\mathfrak' in version `bold'
 414 (Font)                  U/euf/m/n --> U/euf/b/n on input line 132.
 415 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \square on input line 164.
 416 )
 417 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \blacksquare on input line 64.
 418 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \vDash on input line 76.
 419 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \leftleftarrows on input line 79.
 420 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \rightrightarrows on input line 80.
 421
 422 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \leqslant on input line 117.
 423 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \geqslant on input line 124.
 424 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \blacktriangleright on input line 1
 425 36.
 426 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \blacktriangleleft on input line 13
 427 7.
 428 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \complement on input line 181.
 429 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \intercal on input line 182.
 430 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \nleqslant on input line 197.
 431 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \ngeqslant on input line 198.
 432 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \varsubsetneq on input line 219.
 433 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \subsetneqq on input line 223.
 434 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \nparallel on input line 231.
 435 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \nvDash on input line 237.
 436 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \nexists on input line 251.
 437 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \smallsetminus on input line 267.
 438 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \curvearrowleft on input line 273.
 439 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \curvearrowright on input line 274.
 440
 441 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \varkappa on input line 276.
 442 LaTeX Font Info:    Redeclaring math symbol \hslash on input line 278.
 443 )
 444 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/subfigure/subfigure.sty
 445 Package: subfigure 2002/03/15 v2.1.5 subfigure package
 446 \subfigtopskip=\skip58
 447 \subfigcapskip=\skip59
 448 \subfigcaptopadj=\dimen116
 449 \subfigbottomskip=\skip60
 450 \subfigcapmargin=\dimen117
 451 \subfiglabelskip=\skip61
 452 \c@subfigure=\count101
 453 \c@lofdepth=\count102
 454 \c@subtable=\count103
 455 \c@lotdepth=\count104
 456
 457 ****************************************
 458 * Local config file subfigure.cfg used *
 459 ****************************************
 460 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/subfigure/subfigure.cfg)
 461 \subfig@top=\skip62
 462 \subfig@bottom=\skip63
 463 )
 464 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/float/float.sty
 465 Package: float 2001/11/08 v1.3d Float enhancements (AL)
 466 \c@float@type=\count105
 467 \float@exts=\toks20
 468 \float@box=\box28
 469 \@float@everytoks=\toks21
 470 \@floatcapt=\box29
 471 )
 472 (./Stylefiles/here.sty)
 473 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/harvard/harvard.sty
 474 Package: harvard
 475
 476 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/base/ifthen.sty
 477 Package: ifthen 2001/05/26 v1.1c Standard LaTeX ifthen package (DPC)
 478 ))
 479 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/rotating/rotating.sty
 480 Package: rotating 2008/10/05 v2.15c rotated objects in LaTeX
 481 \c@r@tfl@t=\count106
 482 \rotFPtop=\skip64
 483 \rotFPbot=\skip65
 484 \rot@float@box=\box30
 485 \rot@mess@toks=\toks22
 486 )
 487 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/multirow/multirow.sty
 488 \bigstrutjot=\dimen118
 489 )
 490 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/comment/comment.sty
 491 \CommentStream=\write4
 492
 493 Excluding comment 'comment') (./Stylefiles/captionhack.sty)
 494 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/epigraph/epigraph.sty
 495 Package: epigraph 2002/10/22 v1.5a typesetting epigraphs
 496 \beforeepigraphskip=\skip66
 497 \afterepigraphskip=\skip67
 498 \epigraphwidth=\skip68
 499 \epigraphrule=\skip69
 500 )
 501 Dissertation
 502
 503 LaTeX Warning: Unused global option(s):
 504     [makeidx].
 505
 506 (./thesis.aux (./Thesis.Cover/cover.aux) (./thesis_front.aux)
 507 (./thesis_dedication.aux) (./Acknowledgments/Thesis.Acknowledgements.aux)
 508 (./Ag.Cu-System/Introduction/Ag.Cu.Introduction.aux))
 509 \openout1 = `thesis.aux'.
 510
 511 LaTeX Font Info:    Checking defaults for OML/cmm/m/it on input line 70.
 512 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 70.
 513 LaTeX Font Info:    Checking defaults for T1/cmr/m/n on input line 70.
 514 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 70.
 515 LaTeX Font Info:    Checking defaults for OT1/cmr/m/n on input line 70.
 516 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 70.
 517 LaTeX Font Info:    Checking defaults for OMS/cmsy/m/n on input line 70.
 518 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 70.
 519 LaTeX Font Info:    Checking defaults for OMX/cmex/m/n on input line 70.
 520 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 70.
 521 LaTeX Font Info:    Checking defaults for U/cmr/m/n on input line 70.
 522 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 70.
 523 LaTeX Font Info:    Checking defaults for FML/fncmi/m/it on input line 70.
 524 LaTeX Font Info:    Try loading font information for FML+fncmi on input line 70
 525 .
 526
 527 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/fouriernc/fmlfncmi.fd
 528 File: fmlfncmi.fd 2005/12/20 Fontinst v1.928 font definitions for FML/fncmi.
 529 )
 530 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 70.
 531 LaTeX Font Info:    Checking defaults for FMS/fncm/m/n on input line 70.
 532 LaTeX Font Info:    Try loading font information for FMS+fncm on input line 70.
 533
 534
 535 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/fouriernc/fmsfncm.fd
 536 File: fmsfncm.fd 2005/12/20 Fontinst v1.928 font definitions for FMS/fncm.
 537 )
 538 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 70.
 539 LaTeX Font Info:    Checking defaults for FMX/futm/m/n on input line 70.
 540 LaTeX Font Info:    Try loading font information for FMX+futm on input line 70.
 541
 542
 543 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/fourier/fmxfutm.fd
 544 File: fmxfutm.fd futm-extension
 545 )
 546 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 70.
 547 LaTeX Font Info:    Checking defaults for TS1/cmr/m/n on input line 70.
 548 LaTeX Font Info:    Try loading font information for TS1+cmr on input line 70.
 549
 550 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/base/ts1cmr.fd
 551 File: ts1cmr.fd 1999/05/25 v2.5h Standard LaTeX font definitions
 552 )
 553 LaTeX Font Info:    ... okay on input line 70.
 554 LaTeX Font Info:    Try loading font information for T1+fnc on input line 70.
 555
 556 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/fouriernc/t1fnc.fd
 557 File: t1fnc.fd 2005/12/13 scaled font definitions for T1/fnc.
 558 )
 559 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/m/n' will be
 560 (Font)              scaled to size 9.29993pt on input line 70.
 561
 562 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/context/base/supp-pdf.tex
 563 [Loading MPS to PDF converter (version 2006.09.02).]
 564 \scratchcounter=\count107
 565 \scratchdimen=\dimen119
 566 \scratchbox=\box31
 567 \nofMPsegments=\count108
 568 \nofMParguments=\count109
 569 \everyMPshowfont=\toks23
 570 \MPscratchCnt=\count110
 571 \MPscratchDim=\dimen120
 572 \MPnumerator=\count111
 573 \everyMPtoPDFconversion=\toks24
 574 )
 575 \openout2 = `./Thesis.Cover/cover.aux'.
 576
 577  (./Thesis.Cover/cover.tex
 578 \centeroffset=\skip70
 579 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/m/n' will be
 580 (Font)              scaled to size 11.15991pt on input line 16.
 581 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/bx/n' in size <12> not available
 582 (Font)              Font shape `T1/fnc/b/n' tried instead on input line 17.
 583 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/b/n' will be
 584 (Font)              scaled to size 11.15991pt on input line 17.
 585 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/m/it' will be
 586 (Font)              scaled to size 11.15991pt on input line 21.
 587
 588 <./Thesis.Cover/logo.jpg, id=1, 298.86656pt x 361.35pt>
 589 File: ./Thesis.Cover/logo.jpg Graphic file (type jpg)
 590
 591 <use ./Thesis.Cover/logo.jpg>
 592 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/m/n' will be
 593 (Font)              scaled to size 19.28804pt on input line 43.
 594
 595 Underfull \hbox (badness 10000) in paragraph at lines 43--43
 596
 597  []
 598
 599 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/m/n' will be
 600 (Font)              scaled to size 7.06795pt on input line 43.
 601 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/m/n' will be
 602 (Font)              scaled to size 5.57996pt on input line 43.
 603 LaTeX Font Info:    Font shape `FMX/futm/m/n' will be
 604 (Font)              scaled to size 9.19998pt on input line 43.
 605 LaTeX Font Info:    Font shape `FMX/futm/m/n' will be
 606 (Font)              scaled to size 6.99199pt on input line 43.
 607 LaTeX Font Info:    Font shape `FMX/futm/m/n' will be
 608 (Font)              scaled to size 5.51999pt on input line 43.
 609 LaTeX Font Info:    Try loading font information for FML+fncm on input line 43.
 610
 611 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/fouriernc/fmlfncm.fd
 612 File: fmlfncm.fd 2005/12/20 Fontinst v1.928 font definitions for FML/fncm.
 613 )
 614 LaTeX Font Info:    Font shape `U/futm/m/n' will be
 615 (Font)              scaled to size 9.19998pt on input line 43.
 616 LaTeX Font Info:    Font shape `U/futm/m/n' will be
 617 (Font)              scaled to size 6.99199pt on input line 43.
 618 LaTeX Font Info:    Font shape `U/futm/m/n' will be
 619 (Font)              scaled to size 5.51999pt on input line 43.
 620 LaTeX Font Info:    Try loading font information for U+msa on input line 43.
 621
 622 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsfonts/umsa.fd
 623 File: umsa.fd 2002/01/19 v2.2g AMS font definitions
 624 )
 625 LaTeX Font Info:    Try loading font information for U+msb on input line 43.
 626
 627 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/amsfonts/umsb.fd
 628 File: umsb.fd 2002/01/19 v2.2g AMS font definitions
 629 )
 630 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/m/it' will be
 631 (Font)              scaled to size 9.29993pt on input line 71.
 632  [1
 633
 634
 635 {/usr/local/texlive/2008/texmf-var/fonts/map/pdftex/updmap/pdftex.map} <./Thesi
 636 s.Cover/logo.jpg>]) [2]
 637 \openout2 = `thesis_front.aux'.
 638
 639  (./thesis_front.tex
 640 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/bx/n' in size <10> not available
 641 (Font)              Font shape `T1/fnc/b/n' tried instead on input line 6.
 642 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/b/n' will be
 643 (Font)              scaled to size 9.29993pt on input line 6.
 644 LaTeX Font Info:    Try loading font information for T1+cmss on input line 6.
 645
 646 (/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/tex/latex/base/t1cmss.fd
 647 File: t1cmss.fd 1999/05/25 v2.5h Standard LaTeX font definitions
 648 )) [3
 649
 650
 651 ]
 652 \openout2 = `thesis_dedication.aux'.
 653
 654
 655 No file thesis_dedication.tex.
 656 [4
 657
 658
 659
 660
 661 ]
 662 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/m/n' will be
 663 (Font)              scaled to size 13.39188pt on input line 121.
 664 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/bx/n' in size <14.4> not available
 665 (Font)              Font shape `T1/fnc/b/n' tried instead on input line 121.
 666 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/b/n' will be
 667 (Font)              scaled to size 13.39188pt on input line 121.
 668 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/bx/n' in size <17.28> not available
 669 (Font)              Font shape `T1/fnc/b/n' tried instead on input line 121.
 670 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/b/n' will be
 671 (Font)              scaled to size 16.07027pt on input line 121.
 672  (./thesis.toc)
 673 \tf@toc=\write5
 674 \openout5 = `thesis.toc'.
 675
 676  [5
 677
 678 ] [6
 679
 680 ]
 681 \openout2 = `./Acknowledgments/Thesis.Acknowledgements.aux'.
 682
 683  (./Acknowledgments/Thesis.Acknowledgements.tex)
 684 [7
 685
 686
 687 ] [8
 688
 689
 690 ] [1]
 691 \openout2 = `./Ag.Cu-System/Introduction/Ag.Cu.Introduction.aux'.
 692
 693  (./Ag.Cu-System/Introduction/Ag.Cu.Introduction.tex [2
 694
 695
 696 ]
 697 Chapter 1.
 698 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/m/n' will be
 699 (Font)              scaled to size 8.36993pt on input line 17.
 700 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/m/it' will be
 701 (Font)              scaled to size 8.36993pt on input line 17.
 702 LaTeX Font Info:    Font shape `FMX/futm/m/n' will be
 703 (Font)              scaled to size 8.27998pt on input line 17.
 704 LaTeX Font Info:    Font shape `U/futm/m/n' will be
 705 (Font)              scaled to size 8.27998pt on input line 17.
 706
 707 LaTeX Warning: Citation 'Hubel62' on page 3 undefined on input line 42.
 708
 709
 710 LaTeX Warning: Citation 'Hubel74' on page 3 undefined on input line 42.
 711
 712 [3]
 713
 714 LaTeX Warning: Citation 'Daugman80' on page 4 undefined on input line 50.
 715
 716
 717 LaTeX Warning: Citation 'Daugman85' on page 4 undefined on input line 50.
 718
 719
 720 <./Ag.Cu-System/Introduction/png/tobin-blakemore.png, id=41, 125.5089pt x 115.3
 721 911pt>
 722 File: ./Ag.Cu-System/Introduction/png/tobin-blakemore.png Graphic file (type pn
 723 g)
 724  <use ./Ag.Cu-System/Introduction/png/tobin-blakemore.png>
 725 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/bx/n' in size <9> not available
 726 (Font)              Font shape `T1/fnc/b/n' tried instead on input line 61.
 727 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/b/n' will be
 728 (Font)              scaled to size 8.36993pt on input line 61.
 729 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/m/sl' will be
 730 (Font)              scaled to size 8.36993pt on input line 61.
 731 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/m/n' will be
 732 (Font)              scaled to size 7.43994pt on input line 70.
 733 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/m/n' will be
 734 (Font)              scaled to size 6.32394pt on input line 71.
 735 LaTeX Font Info:    Font shape `FMX/futm/m/n' will be
 736 (Font)              scaled to size 7.35999pt on input line 71.
 737 LaTeX Font Info:    Font shape `FMX/futm/m/n' will be
 738 (Font)              scaled to size 6.25598pt on input line 71.
 739 LaTeX Font Info:    Font shape `U/futm/m/n' will be
 740 (Font)              scaled to size 7.35999pt on input line 71.
 741 LaTeX Font Info:    Font shape `U/futm/m/n' will be
 742 (Font)              scaled to size 6.25598pt on input line 71.
 743 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/bx/n' in size <8> not available
 744 (Font)              Font shape `T1/fnc/b/n' tried instead on input line 73.
 745 LaTeX Font Info:    Font shape `T1/fnc/b/n' will be
 746 (Font)              scaled to size 7.43994pt on input line 73.
 747
 748
 749 LaTeX Warning: Reference `Fig:Images' on page 4 undefined on input line 95.
 750
 751 ) [4 <./Ag.Cu-System/Introduction/png/tobin-blakemore.png (PNG copy)>] [5]
 752 [6
 753
 754
 755 ]
 756 No file thesis.bbl.
 757 No file thesis.ind.
 758 (./thesis.aux (./Thesis.Cover/cover.aux) (./thesis_front.aux)
 759 (./thesis_dedication.aux) (./Acknowledgments/Thesis.Acknowledgements.aux)
 760 (./Ag.Cu-System/Introduction/Ag.Cu.Introduction.aux))
 761
 762 LaTeX Warning: There were undefined references.
 763
 764  )
 765 Here is how much of TeX's memory you used:
 766  3624 strings out of 493876
 767  47503 string characters out of 1150567
 768  96172 words of memory out of 3000000
 769  6742 multiletter control sequences out of 10000+50000
 770  58127 words of font info for 95 fonts, out of 3000000 for 5000
 771  714 hyphenation exceptions out of 8191
 772  39i,10n,45p,1304b,326s stack positions out of 5000i,500n,10000p,200000b,50000s
 773 {/usr/local/texlive/2008/texmf-dist/fonts/enc/dvips/base/8r.enc}{/usr/local/t
 774 exlive/2008/texmf-dist/fonts/enc/dvips/cm-super/cm-super-t1.enc}</usr/local/tex
 775 live/2008/texmf-dist/fonts/type1/public/cm-super/sfsx1440.pfb></usr/local/texli
 776 ve/2008/texmf-dist/fonts/type1/urw/ncntrsbk/uncb8a.pfb></usr/local/texlive/2008
 777 /texmf-dist/fonts/type1/urw/ncntrsbk/uncr8a.pfb></usr/local/texlive/2008/texmf-
 778 dist/fonts/type1/urw/ncntrsbk/uncr8a.pfb></usr/local/texlive/2008/texmf-dist/fo
 779 nts/type1/urw/ncntrsbk/uncri8a.pfb>
 780 Output written on thesis.pdf (14 pages, 130898 bytes).
 781 PDF statistics:
 782  72 PDF objects out of 1000 (max. 8388607)
 783  0 named destinations out of 1000 (max. 131072)
 784  11 words of extra memory for PDF output out of 10000 (max. 10000000)
 785