some files I forgot to add
[dmvccm.git] / src / io.py.~12~
blob7cbb25f07f7694be6c571e4bb952c41099496a48
1 ##################################################################
2 #                            Changes:                            #
3 ##################################################################
4 # 2008-05-24, KBU:
5 # - more elaborate pseudo-code in the io()-function
7 # 2008-05-25, KBU:
8 # - CNF_Rule has a function LHS() which returns head, in DMV_Rule this
9 #   returns the pair of (bars, head). 
11 # 2008-05-27
12 # - CNF_Rule has __eq__ and __ne__ defined, so that we can use == and 
13 #   != on two such rules
16 # import numpy # numpy provides Fast Arrays, for future optimization
17 # import pprint # for pretty-printing
19 DEBUG = 0
21 # some of dmv-module bleeding in here... todo: prettier (in inner())
22 NOBAR = 0
23 STOP = (NOBAR, -2) 
25 def debug(string):
26     '''Easily turn on/off inline debug printouts with this global. There's
27 a lot of cluttering debug statements here, todo: clean up'''
28     if DEBUG:
29         print string
31 class CNF_Rule():
32     '''A single CNF rule in the PCFG, of the form 
33     head -> L R
34     where these are just integers
35     (where do we save the connection between number and symbol?
36     symbols being 'vbd' etc.)'''
37     def __eq__(self, other):
38         return self.LHS() == other.LHS() and self.R == other.R and self.L == other.L
39     def __ne__(self, other):
40         return self.LHS() != other.LHS() or self.R != other.R or self.L != other.L
41     def __str__(self):
42         return "%s -> %s %s [%.2f]" % (self.head, self.L, self.R, self.prob)
43     def __init__(self, head, L, R, prob):
44         self.head = head
45         self.R = R
46         self.L = L
47         self.prob = prob
48     def p(self, *arg):
49         "Return a probability, doesn't care about attachment..."
50         return self.prob
51     def LHS(self):
52         return self.head
54 class Grammar():
55     '''The PCFG used in the I/O-algorithm.
57     Todo: as of now, this allows duplicate rules... should we check
58     for this?  (eg. g = Grammar([x,x],[]) where x.prob == 1 may give
59     inner probabilities of 2.)'''
60     def rules(self, head):
61         return [rule for rule in self.p_rules if rule.head == head]
62     
63     def __init__(self, p_rules, p_terminals):
64         '''rules and p_terminals should be arrays, where p_terminals are of
65         the form [preterminal, terminal], and rules are CNF_Rule's.'''        
66         self.p_rules = p_rules # could check for summing to 1 (+/- epsilon)
67         self.p_terminals = p_terminals
71 def inner(s, t, LHS, g, sent, chart):
72     ''' Give the inner probability of having the node LHS cover whatever's
73     between s and t in sentence sent, using grammar g.
75     Returns a pair of the inner probability and the chart
77     For DMV, LHS is a pair (bar, h), but this function ought to be
78     agnostic about that.
80     e() is an internal function, so the variable chart (a dictionary)
81     is available to all calls of e().
83     Since terminal probabilities are just simple lookups, they are not
84     put in the chart (although we could put them in there later to
85     optimize)
86     '''
87     
88     def O(s):
89         return sent[s]
90     
91     def e(s,t,LHS):
92         '''Chart has lists of probability and whether or not we've attached
93 yet to L and R, each entry is a list [p, Rattach, Lattach], where if
94 Rattach==True then the rule has a right-attachment or there is one
95 lower in the tree (meaning we're no longer adjacent).'''
96         if (s, t, LHS) in chart:
97             return chart[(s, t, LHS)]
98         else:
99             debug( "trying from %d to %d with %s" % (s,t,LHS) )
100             if s == t:
101                 if (LHS, O(s)) in g.p_terminals:
102                     prob = g.p_terminals[LHS, O(s)] # b[LHS, O(s)]
103                 else:
104                     prob = 0.0 # todo: is this the right way to deal with lacking rules?
105                     print "\t LACKING TERMINAL:"
106                 debug( "\t terminal: %s -> %s : %.1f" % (LHS, O(s), prob) )
107                 # terminals have no attachment
108                 return prob
109             else:
110                 if (s,t,LHS) not in chart:
111                     # by default, not attachment yet
112                     chart[(s,t,LHS)] = 0.0 #, False, False] 
113                 for rule in g.rules(LHS): # summing over j,k in a[LHS,j,k]
114                     debug( "\tsumming rule %s" % rule ) 
115                     L = rule.L
116                     R = rule.R
117                     for r in range(s, t): # summing over r = s to r = t-1
118                         p_L = e(s, r, L)
119                         p_R = e(r + 1, t, R)
120                         p = rule.p("todo","todo") 
121                         chart[(s, t, LHS)] += p * p_L * p_R
122                 debug( "\tchart[(%d,%d,%s)] = %.2f" % (s,t,LHS, chart[(s,t,LHS)]) )
123                 return chart[(s, t, LHS)]
124     # end of e-function
125     
126     inner_prob = e(s,t,LHS)
127     if DEBUG:
128         print "---CHART:---"
129         for k,v in chart.iteritems():
130             print "\t%s -> %s_%d ... %s_%d : %.1f" % (k[2], O(k[0]), k[0], O(k[1]), k[1], v)
131         print "---CHART:end---"
132     return [inner_prob, chart] # inner_prob == chart[(s,t,LHS)] 
141 if __name__ == "__main__":
142     print "IO-module tests:"
143     b = {}
144     s   = CNF_Rule(0,1,2, 1.0) # s->np vp
145     np  = CNF_Rule(1,3,4, 0.3) # np->n p
146     b[1, 'n'] = 0.7 # np->'n'
147     b[3, 'n'] = 1.0 # n->'n'
148     b[4, 'p'] = 1.0 # p->'p'
149     vp  = CNF_Rule(2,5,1, 0.1) # vp->v np (two parses use this rule)
150     vp2 = CNF_Rule(2,2,4, 0.9) # vp->vp p
151     b[5, 'v'] = 1.0 # v->'v'
152     
153     g = Grammar([s,np,vp,vp2], b)
154     
155     print "The rules:"
156     for i in range(0,5):
157         for r in g.rules(i):
158             print r
159     print ""
161     test1 = inner(0,0, 1, g, ['n'], {})
162     if test1[0] != 0.7:
163         print "should be 0.70 : %.2f" % test1[0]
164         print ""
165     
166     DEBUG = 1
167     test2 = inner(0,2, 2, g, ['v','n','p'], test1[1])
168     print "should be 0.?? (.09??) : %.2f" % test2[0]
169     print "------ trying the same again:----------"
170     test2 = inner(0,2, 2, g, ['v','n','p'], test2[1])
171     print "should be 0.?? (.09??) : %.2f" % test2[0]
173     
174 ##################################################################
175 #            just junk from here on down:                        #
176 ##################################################################
178 # def io(corpus):
179 #     "(pseudo-code / wishful thinking) "
180 #     g = initialize(corpus) # or corpus.tagset ?
181     
182 #     P = {('v','n','p'):0.09}
183 #     # P is used in v_q, w_q (expectation), so each sentence in the
184 #     # corpus needs some initial P.
185     
186 #     # --- Maximation: ---
187 #     #
188 #     # actually, this step (from Lari & Young) probably never happens
189 #     # with DMV, since instead of the a[i,j,k] and b[i,m] vectors, we
190 #     # have P_STOP and P_CHOOSE... or, in a sense it happens only we
191 #     # calculate P_STOP and P_CHOOSE..somehow.
192 #     for rule in g.p_rules:
193 #         rule.num = 0
194 #         rule.den = 0
195 #     for pre_term in range(len(g.p_terminals)): 
196 #         ptnum[pre_term] = 0
197 #         ptden[pre_term] = 0
199 #     # we could also flip this to make rules the outer loop, then we
200 #     # wouldn't have to initialize den/num in loops of their own
201 #     for sent in corpus:
202 #         for rule in g.p_rules # Equation 20
203 #             for s in range(len(sent)):
204 #                 for t in range(s, len(sent)):
205 #                     rule.num += w(s,t, rule.LHS(),rule.L,rule.R, g, sent, P[sent])
206 #                     rule.den += v(s,t, rule.LHS(), g, sent, P[sent])
207 #             # todo: do we need a "new-prob" vs "old-prob" distinction here?
208 #                     probably, since we use inner/outer which checks rule.prob()
209 #             # todo: also, this wouldn't work, since for each sentence, we'd
210 #             #       discard the old probability; should rules be the outer
211 #             #       loop then?
212 #             rule.prob = rule.num / rule.den
213 #         for pre_term in range(len(g.p_terminals)): # Equation 21
214 #             num = 0
215 #             den = 0
216 #             for s in range(len(sent)):
217 #                 for t in range(s, len(sent)):
218 #                     num += v(t,t,pre_term, g, sent, P[sent])
219 #                     den += v(s,t,pre_term, g, sent, P[sent])
221 #     for rule in g.rules:
222 #         rule.prob = rule.num / rule.den
223 #     for pre_term in range(len(g.p_terminals)): 
224 #         g.p_terminals[pre_term] = ptnum[pre_term] / ptden[pre_term]
227 #     # --- Expectation: ---
228 #     for sent in corpus: # Equation 11
229 #         inside = inner(0, len(sent), ROOT, g, sent)
230 #         P[sent] = inside[0]
231     
232 #     # todo: set inner.chart to {} again, how?
234 #     # todo: need a old-P new-P distinction to check if we're below
235 #     # threshold difference
236 #     return "todo"
238 # def w(s,t, LHS,L,R, g, sent, P_sent):
239 #     w = 0
240 #     rule = g.rule(LHS, L, R)
241 #     for r in range(s, t):
242 #         w += rule.prob() * inner(s,r, L, g, sent) * inner(r+1, t, R, g, sent) * outer(s,t,LHS,g,sent)
243 #     return w / P_sent
244         
245 # def v(s,t, LHS, g, sent, P_sent):
246 #     return ( inner(s,t, LHS, g, sent) * outer(s,t, LHS, g, sent) ) / P_sent
247