BUGFIX: Uninitialised member variables
[foam-extend-3.2.git] / applications / utilities / mesh / manipulation / stitchMesh / stitchMesh.C
blobbc3288f1d9f9a391958404f87c42405b6b4fbb6d
1 /*---------------------------------------------------------------------------*\
2   =========                 |
3   \\      /  F ield         | OpenFOAM: The Open Source CFD Toolbox
4    \\    /   O peration     |
5     \\  /    A nd           | Copyright held by original author
6      \\/     M anipulation  |
7 -------------------------------------------------------------------------------
8 License
9     This file is part of OpenFOAM.
11     OpenFOAM is free software; you can redistribute it and/or modify it
12     under the terms of the GNU General Public License as published by the
13     Free Software Foundation; either version 2 of the License, or (at your
14     option) any later version.
16     OpenFOAM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT
17     ANY WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or
18     FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License
19     for more details.
21     You should have received a copy of the GNU General Public License
22     along with OpenFOAM; if not, write to the Free Software Foundation,
23     Inc., 51 Franklin St, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301 USA
25 Description
26     'Stitches' a mesh.
28     Takes a mesh and two patches and merges the faces on the two patches
29     (if geometrically possible) so the faces become internal.
31     Can do
32     - 'perfect' match: faces and points on patches align exactly. Order might
33     be different though.
34     - 'integral' match: where the surfaces on both patches exactly
35     match but the individual faces not
36     - 'partial' match: where the non-overlapping part of the surface remains
37     in the respective patch.
39     Note : Is just a front-end to perfectInterface/slidingInterface.
41     Comparable to running a meshModifier of the form
42     (if masterPatch is called "M" and slavePatch "S"):
44     couple
45     {
46         type                    slidingInterface;
47         masterFaceZoneName      MSMasterZone
48         slaveFaceZoneName       MSSlaveZone
49         cutPointZoneName        MSCutPointZone
50         cutFaceZoneName         MSCutFaceZone
51         masterPatchName         M;
52         slavePatchName          S;
53         typeOfMatch             partial or integral
54     }
57 \*---------------------------------------------------------------------------*/
59 #include "fvCFD.H"
60 #include "polyTopoChanger.H"
61 #include "mapPolyMesh.H"
62 #include "ListOps.H"
63 #include "slidingInterface.H"
64 #include "perfectInterface.H"
65 #include "IOobjectList.H"
66 #include "ReadFields.H"
69 // * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * //
71 // Checks whether patch present
72 void checkPatch(const polyBoundaryMesh& bMesh, const word& name)
74     label patchI = bMesh.findPatchID(name);
76     if (patchI == -1)
77     {
78         FatalErrorIn("checkPatch(const polyBoundaryMesh&, const word&)")
79             << "Cannot find patch " << name << endl
80             << "It should be present and of non-zero size" << endl
81             << "Valid patches are " << bMesh.names()
82             << exit(FatalError);
83     }
85     if (bMesh[patchI].empty())
86     {
87         FatalErrorIn("checkPatch(const polyBoundaryMesh&, const word&)")
88             << "Patch " << name << " is present but zero size"
89             << exit(FatalError);
90     }
94 // Main program:
96 int main(int argc, char *argv[])
98     Foam::argList::noParallel();
99 #   include "addRegionOption.H"
100     Foam::argList::validArgs.append("masterPatch");
101     Foam::argList::validArgs.append("slavePatch");
103     Foam::argList::validOptions.insert("partial", "");
104     Foam::argList::validOptions.insert("perfect", "");
106     Foam::argList::validOptions.insert("overwrite", "");
108 #   include "setRootCase.H"
109 #   include "createTime.H"
110     runTime.functionObjects().off();
111 #   include "createNamedMesh.H"
112     const word oldInstance = mesh.pointsInstance();
115     word masterPatchName(args.additionalArgs()[0]);
116     word slavePatchName(args.additionalArgs()[1]);
118     bool partialCover = args.optionFound("partial");
119     bool perfectCover = args.optionFound("perfect");
120     bool overwrite = args.optionFound("overwrite");
122     if (partialCover && perfectCover)
123     {
124         FatalErrorIn(args.executable())
125             << "Cannot both supply partial and perfect." << endl
126             << "Use perfect match option if the patches perfectly align"
127             << " (both vertex positions and face centres)" << endl
128             << exit(FatalError);
129     }
132     const word mergePatchName(masterPatchName + slavePatchName);
133     const word cutZoneName(mergePatchName + "CutFaceZone");
135     slidingInterface::typeOfMatch tom = slidingInterface::INTEGRAL;
137     if (partialCover)
138     {
139         Info<< "Coupling partially overlapping patches "
140             << masterPatchName << " and " << slavePatchName << nl
141             << "Resulting internal faces will be in faceZone " << cutZoneName
142             << nl
143             << "Any uncovered faces will remain in their patch"
144             << endl;
146         tom = slidingInterface::PARTIAL;
147     }
148     else if (perfectCover)
149     {
150         Info<< "Coupling perfectly aligned patches "
151             << masterPatchName << " and " << slavePatchName << nl
152             << "Resulting (internal) faces will be in faceZone " << cutZoneName
153             << nl << nl
154             << "Note: both patches need to align perfectly." << nl
155             << "Both the vertex"
156             << " positions and the face centres need to align to within" << nl
157             << "a tolerance given by the minimum edge length on the patch"
158             << endl;
159     }
160     else
161     {
162         Info<< "Coupling patches " << masterPatchName << " and "
163             << slavePatchName << nl
164             << "Resulting (internal) faces will be in faceZone " << cutZoneName
165             << nl << nl
166             << "Note: the overall area covered by both patches should be"
167             << " identical (\"integral\" interface)." << endl
168             << "If this is not the case use the -partial option" << nl << endl;
169     }
171     // Check for non-empty master and slave patches
172     checkPatch(mesh.boundaryMesh(), masterPatchName);
173     checkPatch(mesh.boundaryMesh(), slavePatchName);
175     // Create and add face zones and mesh modifiers
177     // Master patch
178     const polyPatch& masterPatch =
179         mesh.boundaryMesh()
180         [
181             mesh.boundaryMesh().findPatchID(masterPatchName)
182         ];
184     // Make list of masterPatch faces
185     labelList isf(masterPatch.size());
187     forAll (isf, i)
188     {
189         isf[i] = masterPatch.start() + i;
190     }
192     polyTopoChanger stitcher(mesh);
193     stitcher.setSize(1);
195     DynamicList<pointZone*> pz;
196     DynamicList<faceZone*> fz;
197     DynamicList<cellZone*> cz;
199     if (perfectCover)
200     {
201         // Add empty zone for resulting internal faces
202         fz.append
203         (
204             new faceZone
205             (
206                 cutZoneName,
207                 isf,
208                 boolList(masterPatch.size(), false),
209                 0,
210                 mesh.faceZones()
211             )
212         );
214         // Note: make sure to add the zones BEFORE constructing polyMeshModifier
215         // (since looks up various zones at construction time)
216         Info << "Adding point and face zones" << endl;
217         mesh.addZones(pz.shrink(), fz.shrink(), cz.shrink());
219         // Add the perfect interface mesh modifier
220         stitcher.set
221         (
222             0,
223             new perfectInterface
224             (
225                 "couple",
226                 0,
227                 stitcher,
228                 cutZoneName,
229                 masterPatchName,
230                 slavePatchName
231             )
232         );
233     }
234     else
235     {
236         pz.append
237         (
238             new pointZone
239             (
240                 mergePatchName + "CutPointZone",
241                 labelList(0),
242                 0,
243                 mesh.pointZones()
244             )
245         );
247         fz.append
248         (
249             new faceZone
250             (
251                 mergePatchName + "MasterZone",
252                 isf,
253                 boolList(masterPatch.size(), false),
254                 0,
255                 mesh.faceZones()
256             )
257         );
259         // Slave patch
260         const polyPatch& slavePatch =
261             mesh.boundaryMesh()
262             [
263                 mesh.boundaryMesh().findPatchID(slavePatchName)
264             ];
266         labelList osf(slavePatch.size());
268         forAll (osf, i)
269         {
270             osf[i] = slavePatch.start() + i;
271         }
273         fz.append
274         (
275             new faceZone
276             (
277                 mergePatchName + "SlaveZone",
278                 osf,
279                 boolList(slavePatch.size(), false),
280                 1,
281                 mesh.faceZones()
282             )
283         );
285         // Add empty zone for cut faces
286         fz.append
287         (
288             new faceZone
289             (
290                 cutZoneName,
291                 labelList(0),
292                 boolList(0, false),
293                 2,
294                 mesh.faceZones()
295             )
296         );
299         // Note: make sure to add the zones BEFORE constructing
300         // polyMeshModifier (since looks up various zones at construction time)
301         Info << "Adding point and face zones" << endl;
302         mesh.addZones(pz.shrink(), fz.shrink(), cz.shrink());
304         // Add the sliding interface mesh modifier
305         stitcher.set
306         (
307             0,
308             new slidingInterface
309             (
310                 "couple",
311                 0,
312                 stitcher,
313                 mergePatchName + "MasterZone",
314                 mergePatchName + "SlaveZone",
315                 mergePatchName + "CutPointZone",
316                 cutZoneName,
317                 masterPatchName,
318                 slavePatchName,
319                 tom,                  // integral or partial
320                 false,                // Attach-detach action
321                 intersection::VISIBLE
322             )
323         );
324     }
327     // Search for list of objects for this time
328     IOobjectList objects(mesh, runTime.timeName());
330     // Read all current fvFields so they will get mapped
331     Info<< "Reading all current volfields" << endl;
332     PtrList<volScalarField> volScalarFields;
333     ReadFields(mesh, objects, volScalarFields);
335     PtrList<volVectorField> volVectorFields;
336     ReadFields(mesh, objects, volVectorFields);
338     PtrList<volSphericalTensorField> volSphericalTensorFields;
339     ReadFields(mesh, objects, volSphericalTensorFields);
341     PtrList<volSymmTensorField> volSymmTensorFields;
342     ReadFields(mesh, objects, volSymmTensorFields);
344     PtrList<volTensorField> volTensorFields;
345     ReadFields(mesh, objects, volTensorFields);
347     //- uncomment if you want to interpolate surface fields (usually bad idea)
348     //Info<< "Reading all current surfaceFields" << endl;
349     //PtrList<surfaceScalarField> surfaceScalarFields;
350     //ReadFields(mesh, objects, surfaceScalarFields);
351     //
352     //PtrList<surfaceVectorField> surfaceVectorFields;
353     //ReadFields(mesh, objects, surfaceVectorFields);
354     //
355     //PtrList<surfaceTensorField> surfaceTensorFields;
356     //ReadFields(mesh, objects, surfaceTensorFields);
358     if (!overwrite)
359     {
360         runTime++;
361     }
363     // Execute all polyMeshModifiers
364     autoPtr<mapPolyMesh> morphMap = stitcher.changeMesh();
366     mesh.movePoints(morphMap->preMotionPoints());
368     // Write mesh
369     if (overwrite)
370     {
371         mesh.setInstance(oldInstance);
372         stitcher.instance() = oldInstance;
373     }
374     Info << nl << "Writing polyMesh to time " << runTime.timeName() << endl;
376     IOstream::defaultPrecision(10);
378     // Bypass runTime write (since only writes at outputTime)
379     if
380     (
381        !runTime.objectRegistry::writeObject
382         (
383             runTime.writeFormat(),
384             IOstream::currentVersion,
385             runTime.writeCompression()
386         )
387     )
388     {
389         FatalErrorIn(args.executable())
390             << "Failed writing polyMesh."
391             << exit(FatalError);
392     }
394     mesh.faceZones().write();
395     mesh.pointZones().write();
396     mesh.cellZones().write();
398     // Write fields
399     runTime.write();
401     Info<< nl << "end" << endl;
403     return 0;
407 // ************************************************************************* //