docs/reference-manual/run-parameters.rst

   1 Run parameters and Programs
   2 ===========================
   3
   4 Online documentation
   5 --------------------
   6
   7 We install standard UNIX man pages for all the programs. If
   8 you have sourced the ``GMXRC`` script in the |Gromacs| binary directory for
   9 your host they should already be present in your ``MANPATH`` environment
  10 variable, and you should be able to type *e.g.* ``man gmx-grompp``. You can
  11 also use the ``-h`` flag on the command line (e.g. :ref:`gmx grompp <gmx grompp>` ``-h``) to see the
  12 same information, as well as ``gmx help grompp``. The list of all programs
  13 are available from :ref:`gmx help <gmx help>`.
  14
  15 File types
  16 ----------
  17
  18 Information about different file types can be found
  19 in :doc:`file-formats`.
  20
  21 |Gromacs| files written in XDR format can be read on any architecture with
  22 |Gromacs| version 1.6 or later if the configuration script found the XDR
  23 libraries on your system. They should always be present on UNIX since
  24 they are necessary for NFS support.
  25
  26 Run Parameters
  27 --------------
  28
  29 The descriptions of :ref:`mdp` parameters can be found at
  30 under the link above both in your local |Gromacs| installation,
  31 or :ref:`here <mdp-general>`.
  32
  33 .. raw:: latex
  34
  35     \clearpage
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  37
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