share/top/amber99.ff/gbsa.itp

   1 [ implicit_genborn_params ]
   2 ; atype      sar      st     pi       gbr       hct
   3 ;Br           0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
   4 C            0.172    1      1.554    0.17    0.72 ; C
   5 CA           0.18     1      1.037    0.17    0.72 ; C
   6 CB           0.172    0.012  1.554    0.17    0.72 ; C
   7 CC           0.172    1      1.554    0.17    0.72 ; C
   8 CN           0.172    0.012  1.554    0.17    0.72 ; C
   9 CR           0.18     1      1.073    0.17    0.72 ; C
  10 CT           0.18     1      1.276    0.17     0.72 ; C
  11 CV           0.18     1      1.073    0.17    0.72 ; C
  12 CW           0.18     1      1.073    0.17    0.72 ; C
  13 C*           0.172    0.012  1.554    0.17    0.72 ; C
  14 H            0.1      1      1        0.13     0.85 ; H
  15 HC           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
  16 H1           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
  17 HA           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
  18 H4           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
  19 H5           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
  20 HO           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
  21 HS           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
  22 HP           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
  23 N            0.155    1      1.028    0.155   0.79 ; N
  24 NA           0.155    1      1.028    0.155   0.79 ; N
  25 NB           0.155    1      1.215    0.155   0.79 ; N
  26 N2           0.16     1      1.215    0.155   0.79 ; N
  27 N3           0.16     1      1.215    0.155    0.79 ; N
  28 O            0.15     1      0.926    0.15     0.85 ; O
  29 OH           0.152    1      1.080    0.15    0.85 ; O
  30 O2           0.17     1      0.922    0.15     0.85 ; O
  31 S            0.18     1      1.121    0.18    0.96 ; S
  32 SH           0.18     1      1.121    0.18    0.96 ; S
  33 ; masscenters for vsites do not have gbsa parameters
  34 MNH3         0        0      0        0         0
  35 MCH3         0        0      0        0         0