Remove unused function generate_excls and make clean_excls static
[gromacs.git] / src / gromacs / gmxpreprocess / tests / fragment4.pdb
blob088f80d8911ff7e13f93afeaf7ab88da48373f41
1 TITLE     Protein (fourth fragment of regressiontests/complex/aminoacids.gro)
2 REMARK    THIS IS A SIMULATION BOX
3 CRYST1   80.562   56.371   74.450  90.00  90.00  90.00 P 1           1
4 MODEL        1
5 ATOM      1  N   LYS    50      66.050  23.760   0.860  1.00  0.00            
6 ATOM      2  H1  LYS    50      66.515  24.212   1.621  1.00  0.00            
7 ATOM      3  H2  LYS    50      66.554  22.935   0.603  1.00  0.00            
8 ATOM      4  H3  LYS    50      66.009  24.382   0.078  1.00  0.00            
9 ATOM      5  CA  LYS    50      64.710  23.400   1.260  1.00  0.00            
10 ATOM      6  HA  LYS    50      64.810  22.785   2.042  1.00  0.00            
11 ATOM      7  CB  LYS    50      63.840  24.640   1.720  1.00  0.00            
12 ATOM      8  HB1 LYS    50      63.834  25.321   0.987  1.00  0.00            
13 ATOM      9  HB2 LYS    50      62.905  24.332   1.897  1.00  0.00            
14 ATOM     10  CG  LYS    50      64.410  25.310   3.030  1.00  0.00            
15 ATOM     11  HG1 LYS    50      64.306  24.664   3.787  1.00  0.00            
16 ATOM     12  HG2 LYS    50      65.381  25.504   2.889  1.00  0.00            
17 ATOM     13  CD  LYS    50      63.770  26.610   3.480  1.00  0.00            
18 ATOM     14  HD1 LYS    50      64.471  27.075   4.021  1.00  0.00            
19 ATOM     15  HD2 LYS    50      63.601  27.125   2.640  1.00  0.00            
20 ATOM     16  CE  LYS    50      62.490  26.730   4.290  1.00  0.00            
21 ATOM     17  HE1 LYS    50      62.559  26.151   5.102  1.00  0.00            
22 ATOM     18  HE2 LYS    50      62.365  27.682   4.569  1.00  0.00            
23 ATOM     19  NZ  LYS    50      61.290  26.310   3.520  1.00  0.00            
24 ATOM     20  HZ1 LYS    50      60.476  26.406   4.093  1.00  0.00            
25 ATOM     21  HZ2 LYS    50      61.196  26.886   2.708  1.00  0.00            
26 ATOM     22  HZ3 LYS    50      61.390  25.355   3.241  1.00  0.00            
27 ATOM     23  C   LYS    50      64.090  22.720   0.030  1.00  0.00            
28 ATOM     24  O   LYS    50      64.600  22.870  -1.070  1.00  0.00            
29 ATOM     25  N   SER    51      62.910  22.080   0.070  1.00  0.00            
30 ATOM     26  H   SER    51      62.521  21.816   0.953  1.00  0.00            
31 ATOM     27  CA  SER    51      62.200  21.770  -1.140  1.00  0.00            
32 ATOM     28  HA  SER    51      62.982  21.443  -1.671  1.00  0.00            
33 ATOM     29  CB  SER    51      61.100  20.710  -0.980  1.00  0.00            
34 ATOM     30  HB1 SER    51      60.716  20.500  -1.879  1.00  0.00            
35 ATOM     31  HB2 SER    51      61.499  19.882  -0.586  1.00  0.00            
36 ATOM     32  OG  SER    51      59.980  21.090  -0.120  1.00  0.00            
37 ATOM     33  HG  SER    51      59.321  20.339  -0.080  1.00  0.00            
38 ATOM     34  C   SER    51      61.440  23.000  -1.730  1.00  0.00            
39 ATOM     35  O   SER    51      61.210  23.200  -2.920  1.00  0.00            
40 ATOM     36  N   GLY    52      61.090  23.920  -0.790  1.00  0.00            
41 ATOM     37  H   GLY    52      61.278  23.740   0.176  1.00  0.00            
42 ATOM     38  CA  GLY    52      60.430  25.190  -1.190  1.00  0.00            
43 ATOM     39  HA1 GLY    52      61.108  25.915  -1.311  1.00  0.00            
44 ATOM     40  HA2 GLY    52      59.917  25.067  -2.040  1.00  0.00            
45 ATOM     41  C   GLY    52      59.510  25.510  -0.060  1.00  0.00            
46 ATOM     42  O   GLY    52      60.020  25.570   1.060  1.00  0.00            
47 ATOM     43  N   TYR    53      58.220  25.580  -0.180  1.00  0.00            
48 ATOM     44  H   TYR    53      57.817  25.584  -1.095  1.00  0.00            
49 ATOM     45  CA  TYR    53      57.380  25.650   0.930  1.00  0.00            
50 ATOM     46  HA  TYR    53      57.899  26.245   1.543  1.00  0.00            
51 ATOM     47  CB  TYR    53      55.950  26.140   0.490  1.00  0.00            
52 ATOM     48  HB1 TYR    53      55.665  25.733  -0.378  1.00  0.00            
53 ATOM     49  HB2 TYR    53      55.259  25.955   1.188  1.00  0.00            
54 ATOM     50  CG  TYR    53      56.020  27.540   0.310  1.00  0.00            
55 ATOM     51  CD1 TYR    53      56.800  28.140  -0.670  1.00  0.00            
56 ATOM     52  HD1 TYR    53      57.337  27.572  -1.294  1.00  0.00            
57 ATOM     53  CD2 TYR    53      55.370  28.360   1.260  1.00  0.00            
58 ATOM     54  HD2 TYR    53      54.851  27.957   2.014  1.00  0.00            
59 ATOM     55  CE1 TYR    53      56.840  29.540  -0.790  1.00  0.00            
60 ATOM     56  HE1 TYR    53      57.322  29.951  -1.564  1.00  0.00            
61 ATOM     57  CE2 TYR    53      55.470  29.770   1.120  1.00  0.00            
62 ATOM     58  HE2 TYR    53      54.968  30.350   1.762  1.00  0.00            
63 ATOM     59  CZ  TYR    53      56.220  30.370   0.150  1.00  0.00            
64 ATOM     60  OH  TYR    53      56.360  31.760   0.090  1.00  0.00            
65 ATOM     61  HH  TYR    53      55.848  32.179   0.840  1.00  0.00            
66 ATOM     62  C   TYR    53      57.080  24.210   1.430  1.00  0.00            
67 ATOM     63  O   TYR    53      56.010  23.620   1.130  1.00  0.00            
68 ATOM     64  N   ASP    54      57.980  23.720   2.320  1.00  0.00            
69 ATOM     65  H   ASP    54      58.615  24.348   2.770  1.00  0.00            
70 ATOM     66  CA  ASP    54      58.040  22.320   2.630  1.00  0.00            
71 ATOM     67  HA  ASP    54      58.132  21.881   1.736  1.00  0.00            
72 ATOM     68  CB  ASP    54      59.260  22.090   3.530  1.00  0.00            
73 ATOM     69  HB1 ASP    54      59.097  22.437   4.454  1.00  0.00            
74 ATOM     70  HB2 ASP    54      59.497  21.120   3.575  1.00  0.00            
75 ATOM     71  CG  ASP    54      60.370  22.780   3.000  1.00  0.00            
76 ATOM     72  OD1 ASP    54      60.690  23.920   3.530  1.00  0.00            
77 ATOM     73  OD2 ASP    54      61.010  22.280   2.050  1.00  0.00            
78 ATOM     74  C   ASP    54      56.760  21.720   3.200  1.00  0.00            
79 ATOM     75  O   ASP    54      56.400  20.580   2.900  1.00  0.00            
80 ATOM     76  N   ALA    55      56.050  22.530   4.050  1.00  0.00            
81 ATOM     77  H   ALA    55      56.390  23.458   4.206  1.00  0.00            
82 ATOM     78  CA  ALA    55      54.850  22.130   4.730  1.00  0.00            
83 ATOM     79  HA  ALA    55      55.263  21.295   5.095  1.00  0.00            
84 ATOM     80  CB  ALA    55      54.420  23.020   5.930  1.00  0.00            
85 ATOM     81  HB1 ALA    55      53.579  22.657   6.330  1.00  0.00            
86 ATOM     82  HB2 ALA    55      55.144  23.021   6.620  1.00  0.00            
87 ATOM     83  HB3 ALA    55      54.261  23.955   5.612  1.00  0.00            
88 ATOM     84  C   ALA    55      53.650  21.710   3.830  1.00  0.00            
89 ATOM     85  O   ALA    55      53.130  22.590   3.090  1.00  0.00            
90 ATOM     86  N   PRO    56      53.100  20.480   3.740  1.00  0.00            
91 ATOM     87  CA  PRO    56      52.100  20.160   2.720  1.00  0.00            
92 ATOM     88  HA  PRO    56      52.444  20.566   1.873  1.00  0.00            
93 ATOM     89  CB  PRO    56      51.980  18.600   2.750  1.00  0.00            
94 ATOM     90  HB1 PRO    56      51.027  18.313   2.651  1.00  0.00            
95 ATOM     91  HB2 PRO    56      52.530  18.186   2.025  1.00  0.00            
96 ATOM     92  CG  PRO    56      52.550  18.240   4.190  1.00  0.00            
97 ATOM     93  HG1 PRO    56      51.825  18.261   4.879  1.00  0.00            
98 ATOM     94  HG2 PRO    56      52.984  17.339   4.190  1.00  0.00            
99 ATOM     95  CD  PRO    56      53.590  19.300   4.520  1.00  0.00            
100 ATOM     96  HD1 PRO    56      53.610  19.502   5.499  1.00  0.00            
101 ATOM     97  HD2 PRO    56      54.503  19.025   4.217  1.00  0.00            
102 ATOM     98  C   PRO    56      50.720  20.810   2.900  1.00  0.00            
103 ATOM     99  O   PRO    56      49.850  20.720   2.080  1.00  0.00            
104 ATOM    100  N   PHE    57      50.500  21.510   3.970  1.00  0.00            
105 ATOM    101  H   PHE    57      51.263  21.623   4.607  1.00  0.00            
106 ATOM    102  CA  PHE    57      49.250  22.140   4.320  1.00  0.00            
107 ATOM    103  HA  PHE    57      48.619  21.633   3.733  1.00  0.00            
108 ATOM    104  CB  PHE    57      48.870  21.910   5.730  1.00  0.00            
109 ATOM    105  HB1 PHE    57      49.507  22.401   6.325  1.00  0.00            
110 ATOM    106  HB2 PHE    57      47.943  22.253   5.879  1.00  0.00            
111 ATOM    107  CG  PHE    57      48.940  20.390   5.990  1.00  0.00            
112 ATOM    108  CD1 PHE    57      48.070  19.530   5.340  1.00  0.00            
113 ATOM    109  HD1 PHE    57      47.405  19.862   4.671  1.00  0.00            
114 ATOM    110  CD2 PHE    57      49.900  19.890   6.860  1.00  0.00            
115 ATOM    111  HD2 PHE    57      50.488  20.547   7.332  1.00  0.00            
116 ATOM    112  CE1 PHE    57      48.170  18.160   5.670  1.00  0.00            
117 ATOM    113  HE1 PHE    57      47.519  17.514   5.272  1.00  0.00            
118 ATOM    114  CE2 PHE    57      50.100  18.540   7.120  1.00  0.00            
119 ATOM    115  HE2 PHE    57      50.861  18.210   7.679  1.00  0.00            
120 ATOM    116  CZ  PHE    57      49.170  17.680   6.550  1.00  0.00            
121 ATOM    117  HZ  PHE    57      49.207  16.704   6.765  1.00  0.00            
122 ATOM    118  C   PHE    57      49.240  23.690   4.060  1.00  0.00            
123 ATOM    119  O   PHE    57      48.240  24.360   4.270  1.00  0.00            
124 ATOM    120  N   THR    58      50.310  24.210   3.440  1.00  0.00            
125 ATOM    121  H   THR    58      51.077  23.582   3.310  1.00  0.00            
126 ATOM    122  CA  THR    58      50.510  25.530   2.940  1.00  0.00            
127 ATOM    123  HA  THR    58      50.215  26.066   3.731  1.00  0.00            
128 ATOM    124  CB  THR    58      51.930  25.870   2.590  1.00  0.00            
129 ATOM    125  HB  THR    58      52.163  25.470   1.704  1.00  0.00            
130 ATOM    126  OG1 THR    58      52.860  25.280   3.420  1.00  0.00            
131 ATOM    127  HG1 THR    58      53.780  25.547   3.133  1.00  0.00            
132 ATOM    128  CG2 THR    58      52.070  27.400   2.740  1.00  0.00            
133 ATOM    129 1HG2 THR    58      53.006  27.673   2.515  1.00  0.00            
134 ATOM    130 2HG2 THR    58      51.432  27.856   2.119  1.00  0.00            
135 ATOM    131 3HG2 THR    58      51.863  27.663   3.682  1.00  0.00            
136 ATOM    132  C   THR    58      49.730  25.710   1.610  1.00  0.00            
137 ATOM    133  O   THR    58      50.090  25.020   0.640  1.00  0.00            
138 ATOM    134  N   ILE    59      48.710  26.610   1.510  1.00  0.00            
139 ATOM    135  H   ILE    59      48.401  27.085   2.334  1.00  0.00            
140 ATOM    136  CA  ILE    59      48.060  26.900   0.250  1.00  0.00            
141 ATOM    137  HA  ILE    59      47.980  25.943  -0.029  1.00  0.00            
142 ATOM    138  CB  ILE    59      46.730  27.790   0.410  1.00  0.00            
143 ATOM    139  HB  ILE    59      46.375  28.063  -0.484  1.00  0.00            
144 ATOM    140  CG1 ILE    59      46.990  29.180   1.200  1.00  0.00            
145 ATOM    141 1HG1 ILE    59      47.168  29.006   2.169  1.00  0.00            
146 ATOM    142 2HG1 ILE    59      47.765  29.671   0.802  1.00  0.00            
147 ATOM    143  CG2 ILE    59      45.660  26.890   1.090  1.00  0.00            
148 ATOM    144 1HG2 ILE    59      44.814  27.409   1.208  1.00  0.00            
149 ATOM    145 2HG2 ILE    59      45.483  26.091   0.516  1.00  0.00            
150 ATOM    146 3HG2 ILE    59      45.995  26.591   1.984  1.00  0.00            
151 ATOM    147  CD  ILE    59      45.780  30.080   1.110  1.00  0.00            
152 ATOM    148  HD1 ILE    59      45.960  30.931   1.603  1.00  0.00            
153 ATOM    149  HD2 ILE    59      45.588  30.285   0.150  1.00  0.00            
154 ATOM    150  HD3 ILE    59      44.991  29.620   1.517  1.00  0.00            
155 ATOM    151  C   ILE    59      48.840  27.500  -0.820  1.00  0.00            
156 ATOM    152  O   ILE    59      49.700  28.340  -0.500  1.00  0.00            
157 ATOM    153  N   HIS    60      48.560  27.040  -2.080  1.00  0.00            
158 ATOM    154  H   HIS    60      47.694  26.588  -2.292  1.00  0.00            
159 ATOM    155  CA  HIS    60      49.580  27.240  -3.090  1.00  0.00            
160 ATOM    156  HA  HIS    60      49.861  28.199  -3.071  1.00  0.00            
161 ATOM    157  CB  HIS    60      50.850  26.360  -2.870  1.00  0.00            
162 ATOM    158  HB1 HIS    60      51.051  26.346  -1.890  1.00  0.00            
163 ATOM    159  HB2 HIS    60      50.641  25.433  -3.181  1.00  0.00            
164 ATOM    160  CG  HIS    60      52.130  26.690  -3.510  1.00  0.00            
165 ATOM    161  ND1 HIS    60      52.200  26.390  -4.810  1.00  0.00            
166 ATOM    162  CD2 HIS    60      53.270  27.000  -2.940  1.00  0.00            
167 ATOM    163  HD2 HIS    60      53.419  27.288  -1.994  1.00  0.00            
168 ATOM    164  CE1 HIS    60      53.490  26.510  -5.060  1.00  0.00            
169 ATOM    165  HE1 HIS    60      53.886  26.375  -5.968  1.00  0.00            
170 ATOM    166  NE2 HIS    60      54.240  26.840  -3.950  1.00  0.00            
171 ATOM    167  HE2 HIS    60      55.232  26.941  -3.879  1.00  0.00            
172 ATOM    168  C   HIS    60      48.890  26.820  -4.350  1.00  0.00            
173 ATOM    169  O   HIS    60      47.740  27.310  -4.530  1.00  0.00            
174 ATOM    170  N   VAL    61      49.430  25.950  -5.240  1.00  0.00            
175 ATOM    171  H   VAL    61      50.424  25.976  -5.345  1.00  0.00            
176 ATOM    172  CA  VAL    61      48.710  24.980  -6.060  1.00  0.00            
177 ATOM    173  HA  VAL    61      48.023  25.578  -6.472  1.00  0.00            
178 ATOM    174  CB  VAL    61      49.640  24.320  -7.100  1.00  0.00            
179 ATOM    175  HB  VAL    61      50.273  23.776  -6.549  1.00  0.00            
180 ATOM    176  CG1 VAL    61      48.930  23.320  -8.080  1.00  0.00            
181 ATOM    177 1HG1 VAL    61      49.603  22.942  -8.716  1.00  0.00            
182 ATOM    178 2HG1 VAL    61      48.513  22.578  -7.555  1.00  0.00            
183 ATOM    179 3HG1 VAL    61      48.221  23.803  -8.594  1.00  0.00            
184 ATOM    180  CG2 VAL    61      50.430  25.390  -7.900  1.00  0.00            
185 ATOM    181 1HG2 VAL    61      51.024  24.938  -8.565  1.00  0.00            
186 ATOM    182 2HG2 VAL    61      49.788  25.989  -8.379  1.00  0.00            
187 ATOM    183 3HG2 VAL    61      50.987  25.933  -7.271  1.00  0.00            
188 ATOM    184  C   VAL    61      47.910  23.930  -5.330  1.00  0.00            
189 ATOM    185  O   VAL    61      46.710  23.730  -5.500  1.00  0.00            
190 ATOM    186  N   CYS    62      48.580  23.410  -4.270  1.00  0.00            
191 ATOM    187  H   CYS    62      49.557  23.607  -4.191  1.00  0.00            
192 ATOM    188  CA  CYS    62      47.970  22.590  -3.250  1.00  0.00            
193 ATOM    189  HA  CYS    62      47.345  22.093  -3.852  1.00  0.00            
194 ATOM    190  CB  CYS    62      48.910  21.600  -2.500  1.00  0.00            
195 ATOM    191  HB1 CYS    62      49.628  22.177  -2.110  1.00  0.00            
196 ATOM    192  HB2 CYS    62      48.348  21.224  -1.764  1.00  0.00            
197 ATOM    193  SG  CYS    62      49.610  20.300  -3.490  1.00  0.00            
198 ATOM    194  HG  CYS    62      50.194  19.723  -2.919  1.00  0.00            
199 ATOM    195  C   CYS    62      47.250  23.420  -2.180  1.00  0.00            
200 ATOM    196  O   CYS    62      47.280  24.640  -2.190  1.00  0.00            
201 ATOM    197  N   GLY    63      46.400  22.810  -1.270  1.00  0.00            
202 ATOM    198  H   GLY    63      46.446  21.819  -1.141  1.00  0.00            
203 ATOM    199  CA  GLY    63      45.430  23.600  -0.490  1.00  0.00            
204 ATOM    200  HA1 GLY    63      45.354  23.223   0.433  1.00  0.00            
205 ATOM    201  HA2 GLY    63      45.735  24.551  -0.438  1.00  0.00            
206 ATOM    202  C   GLY    63      44.130  23.560  -1.120  1.00  0.00            
207 ATOM    203  O   GLY    63      43.120  23.980  -0.550  1.00  0.00            
208 ATOM    204  N   ALA    64      44.090  22.990  -2.320  1.00  0.00            
209 ATOM    205  H   ALA    64      44.935  22.906  -2.849  1.00  0.00            
210 ATOM    206  CA  ALA    64      42.810  22.470  -2.900  1.00  0.00            
211 ATOM    207  HA  ALA    64      42.059  22.447  -2.240  1.00  0.00            
212 ATOM    208  CB  ALA    64      42.150  23.440  -3.870  1.00  0.00            
213 ATOM    209  HB1 ALA    64      41.305  23.037  -4.221  1.00  0.00            
214 ATOM    210  HB2 ALA    64      41.940  24.295  -3.395  1.00  0.00            
215 ATOM    211  HB3 ALA    64      42.772  23.625  -4.631  1.00  0.00            
216 ATOM    212  C   ALA    64      43.180  21.010  -3.380  1.00  0.00            
217 ATOM    213  O   ALA    64      42.630  20.030  -2.810  1.00  0.00            
218 ATOM    214  N   PRO    65      44.050  20.730  -4.290  1.00  0.00            
219 ATOM    215  CA  PRO    65      44.830  19.510  -4.260  1.00  0.00            
220 ATOM    216  HA  PRO    65      44.171  18.765  -4.367  1.00  0.00            
221 ATOM    217  CB  PRO    65      45.920  19.640  -5.430  1.00  0.00            
222 ATOM    218  HB1 PRO    65      46.796  19.971  -5.080  1.00  0.00            
223 ATOM    219  HB2 PRO    65      46.057  18.769  -5.902  1.00  0.00            
224 ATOM    220  CG  PRO    65      45.340  20.660  -6.400  1.00  0.00            
225 ATOM    221  HG1 PRO    65      46.068  21.197  -6.828  1.00  0.00            
226 ATOM    222  HG2 PRO    65      44.799  20.208  -7.109  1.00  0.00            
227 ATOM    223  CD  PRO    65      44.450  21.540  -5.480  1.00  0.00            
228 ATOM    224  HD1 PRO    65      44.956  22.345  -5.169  1.00  0.00            
229 ATOM    225  HD2 PRO    65      43.626  21.832  -5.966  1.00  0.00            
230 ATOM    226  C   PRO    65      45.440  19.200  -2.910  1.00  0.00            
231 ATOM    227  O1  PRO    65      45.560  18.020  -2.580  1.00  0.00            
232 ATOM    228  O2  PRO    65      45.700  20.190  -2.030  1.00  0.00            
234 ENDMDL