share/top/amber03.ff/gbsa.itp

   1 [ implicit_genborn_params ]
   2
   3 ; atype      sar      st     pi       gbr       hct
   4 C            0.172    1      1.554    0.1875    0.72 ; C
   5 CA           0.18     1      1.037    0.1875    0.72 ; C
   6 CB           0.172    0.012  1.554    0.1875    0.72 ; C
   7 CC           0.172    1      1.554    0.1875    0.72 ; C
   8 CN           0.172    0.012  1.554    0.1875    0.72 ; C
   9 CR           0.18     1      1.073    0.1875    0.72 ; C
  10 CT           0.18     1      1.276    0.190     0.72 ; C
  11 CV           0.18     1      1.073    0.1875    0.72 ; C
  12 CW           0.18     1      1.073    0.1875    0.72 ; C
  13 C*           0.172    0.012  1.554    0.1875    0.72 ; C
  14 H            0.1      1      1        0.115     0.85 ; H
  15 HC           0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
  16 H0           0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
  17 H1           0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
  18 HA           0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
  19 H4           0.1      1      1        0.115     0.85 ; H
  20 H5           0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
  21 HO           0.1      1      1        0.105     0.85 ; H
  22 HS           0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
  23 HP           0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
  24 N            0.155    1      1.028    0.17063   0.79 ; N
  25 NA           0.155    1      1.028    0.17063   0.79 ; N
  26 NB           0.155    1      1.215    0.17063   0.79 ; N
  27 N2           0.16     1      1.215    0.17063   0.79 ; N
  28 N3           0.16     1      1.215    0.1625    0.79 ; N
  29 O            0.15     1      0.926    0.148     0.85 ; O
  30 OH           0.152    1      1.080    0.1535    0.85 ; O
  31 O2           0.17     1      0.922    0.148     0.85 ; O
  32 S            0.18     1      1.121    0.1775    0.96 ; S
  33 SH           0.18     1      1.121    0.1775    0.96 ; S
  34
  35 ; masscenters for vsites do not have gbsa parameters
  36
  37 MNH3         0        0      0        0         0
  38 MCH3         0        0      0        0         0