Update instructions in containers.rst
[gromacs.git] / share / top / oplsaa.ff / aminoacids.hdb
blob5d2205fb3b58a694e7499fa005b2a96f19e99735
1 ACE     1       
2 3       4       HH3     CH3     C       O
3 AIB     3       
4 1       1       H       N       -C      CA
5 3       4       HB1     CB1     CA      N
6 3       4       HB2     CB2     CA      N
7 ALA     3       
8 1       1       H       N       -C      CA
9 1       5       HA      CA      N       C       CB
10 3       4       HB      CB      CA      N
11 ARG     8       
12 1       1       H       N       -C      CA
13 1       5       HA      CA      N       C       CB
14 2       6       HB      CB      CG      CA
15 2       6       HG      CG      CD      CB
16 2       6       HD      CD      NE      CG
17 1       1       HE      NE      CD      CZ
18 2       3       HH1     NH1     CZ      NE
19 2       3       HH2     NH2     CZ      NE
20 ARGN    8       
21 1       1       H       N       -C      CA
22 1       5       HA      CA      N       C       CB
23 2       6       HB      CB      CG      CA
24 2       6       HG      CG      CD      CB
25 2       6       HD      CD      NE      CG
26 1       1       HE      NE      CD      CZ
27 1       2       HH1     NH1     CZ      NE
28 2       3       HH2     NH2     CZ      NE
29 ASN     4       
30 1       1       H       N       -C      CA
31 1       5       HA      CA      N       C       CB
32 2       6       HB      CB      CG      CA
33 2       3       HD2     ND2     CG      CB
34 ASP     3       
35 1       1       H       N       -C      CA
36 1       5       HA      CA      N       C       CB
37 2       6       HB      CB      CG      CA
38 ASPH    4       
39 1       1       H       N       -C      CA
40 1       5       HA      CA      N       C       CB
41 2       6       HB      CB      CG      CA
42 1       2       HD2     OD2     CG      CB
43 CYS2    3       
44 1       1       H       N       -C      CA
45 1       5       HA      CA      N       C       CB
46 2       6       HB      CB      SG      CA
47 CYSH    4       
48 1       1       H       N       -C      CA
49 1       5       HA      CA      N       C       CB
50 2       6       HB      CB      SG      CA
51 1       2       HG      SG      CB      CA
52 GLN     5       
53 1       1       H       N       -C      CA
54 1       5       HA      CA      N       C       CB
55 2       6       HB      CB      CG      CA
56 2       6       HG      CG      CD      CB
57 2       3       HE2     NE2     CD      CG
58 QLN     6
59 1       1       H       N       -C      CA
60 1       5       HA      CA      N       C       CB
61 2       6       HB      CB      CG      CA
62 2       6       HG      CG      CD      CB
63 2       3       HE2     NE2     CD      CG
64 1       3       HE1     OE1     CD      CG
65 GLU     4       
66 1       1       H       N       -C      CA
67 1       5       HA      CA      N       C       CB
68 2       6       HB      CB      CG      CA
69 2       6       HG      CG      CD      CB
70 PGLU    4       
71 1       1       H       N       CD      CA
72 1       5       HA      CA      N       C       CB
73 2       6       HB      CB      CG      CA
74 2       6       HG      CG      CD      CB
75 GLUH    5       
76 1       1       H       N       -C      CA
77 1       5       HA      CA      N       C       CB
78 2       6       HB      CB      CG      CA
79 2       6       HG      CG      CD      CB
80 1       2       HE2     OE2     CD      CG
81 GLY     2       
82 1       1       H       N       -C      CA
83 2       6       HA      CA      C       N
84 HISD    6       
85 1       1       H       N       -C      CA
86 1       5       HA      CA      N       C       CB
87 2       6       HB      CB      CG      CA
88 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
89 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
90 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
91 HISE    6       
92 1       1       H       N       -C      CA
93 2       6       HB      CB      CG      CA
94 1       5       HA      CA      N       C       CB
95 1       1       HE2     NE2     CE1     CD2
96 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
97 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
98 HISH    7       
99 1       1       H       N       -C      CA
100 1       5       HA      CA      N       C       CB
101 2       6       HB      CB      CG      CA
102 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
103 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
104 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
105 1       1       HE2     NE2     CE1     CD2
106 HO4     1       
107 3       10      HW      OW
108 HO5     1       
109 4       11      HW      OW
110 HOH     1       
111 2       7       HW      OW
112 ILE     6       
113 1       1       H       N       -C      CA
114 1       5       HA      CA      N       C       CB
115 1       5       HB      CB      CA      CG1     CG2
116 2       6       HG1     CG1     CD      CB
117 3       4       HG2     CG2     CB      CA
118 3       4       HD      CD      CG1     CB
119 LEU     6       
120 1       1       H       N       -C      CA
121 1       5       HA      CA      N       C       CB
122 2       6       HB      CB      CG      CA
123 1       5       HG      CG      CB      CD1     CD2
124 3       4       HD1     CD1     CG      CB
125 3       4       HD2     CD2     CG      CB
126 LYS     7       
127 1       1       H       N       -C      CA
128 1       5       HA      CA      N       C       CB
129 2       6       HB      CB      CG      CA
130 2       6       HG      CG      CD      CB
131 2       6       HD      CD      CE      CG
132 2       6       HE      CE      NZ      CD
133 2       4       HZ      NZ      CE      CD
134 LYSH    7       
135 1       1       H       N       -C      CA
136 1       5       HA      CA      N       C       CB
137 2       6       HB      CB      CG      CA
138 2       6       HG      CG      CD      CB
139 2       6       HD      CD      CE      CG
140 2       6       HE      CE      NZ      CD
141 3       4       HZ      NZ      CE      CD
142 MET     5       
143 1       1       H       N       -C      CA
144 1       5       HA      CA      N       C       CB
145 2       6       HB      CB      CG      CA
146 2       6       HG      CG      SD      CB
147 3       4       HE      CE      SD      CG
148 NAC     2       
149 1       1       H       N       -C      CH3
150 3       4       HH3     CH3     N       -C
151 NH2     1       
152 2       3       H       N       -C      -CA
153 NHE     1       
154 2       3       H       N       -C      -CA
155 PHE     8       
156 1       1       H       N       -C      CA
157 1       5       HA      CA      N       C       CB
158 2       6       HB      CB      CG      CA
159 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
160 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
161 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
162 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
163 1       1       HZ      CZ      CE1     CE2
164 PRO     4       
165 1       5       HA      CA      N       C       CB
166 2       6       HB      CB      CG      CA
167 2       6       HG      CG      CD      CB
168 2       6       HD      CD      N       CG
169 SER     4       
170 1       1       H       N       -C      CA
171 1       5       HA      CA      N       C       CB
172 2       6       HB      CB      OG      CA
173 1       2       HG      OG      CB      CA
174 THR     5       
175 1       1       H       N       -C      CA
176 1       5       HA      CA      N       C       CB
177 1       5       HB      CB      CA      OG1     CG2
178 1       2       HG1     OG1     CB      CA
179 3       4       HG2     CG2     CB      CA
180 TRP     9       
181 1       1       H       N       -C      CA
182 1       5       HA      CA      N       C       CB
183 2       6       HB      CB      CG      CA
184 1       1       HD1     CD1     NE1     CG
185 1       1       HE1     NE1     CD1     CE2
186 1       1       HE3     CE3     CD2     CZ3
187 1       1       HZ3     CZ3     CE3     CH2
188 1       1       HH2     CH2     CZ3     CZ2
189 1       1       HZ2     CZ2     CE2     CH2
190 TYR     8       
191 1       1       H       N       -C      CA
192 1       5       HA      CA      N       C       CB
193 2       6       HB      CB      CG      CA
194 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
195 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
196 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
197 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
198 1       2       HH      OH      CZ      CE1
199 VAL     5       
200 1       1       H       N       -C      CA
201 1       5       HA      CA      N       C       CB
202 1       5       HB      CB      CA      CG1     CG2
203 3       4       HG1     CG1     CB      CA
204 3       4       HG2     CG2     CB      CA
205 DMSO    2
206 3       4       HD1     CD1     SD      OD
207 3       4       HD2     CD2     SD      OD