Added cool quote from Viveca's defense
[gromacs.git] / share / top / amber99sb.ff / gbsa.itp
blobad74dcde140bc88f978adf5241f30271f32baf7b
1 [ implicit_genborn_params ]
2 ; atype      sar      st     pi       gbr       hct
3 ;Br           0.1      1      1        0.125     0.85 ; H
4 C            0.172    1      1.554    0.17    0.72 ; C
5 CA           0.18     1      1.037    0.17    0.72 ; C
6 CB           0.172    0.012  1.554    0.17    0.72 ; C
7 CC           0.172    1      1.554    0.17    0.72 ; C
8 CN           0.172    0.012  1.554    0.17    0.72 ; C
9 CR           0.18     1      1.073    0.17    0.72 ; C
10 CT           0.18     1      1.276    0.17     0.72 ; C
11 CV           0.18     1      1.073    0.17    0.72 ; C
12 CW           0.18     1      1.073    0.17    0.72 ; C
13 C*           0.172    0.012  1.554    0.17    0.72 ; C
14 H            0.1      1      1        0.13     0.85 ; H
15 HC           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
16 H1           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
17 HA           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
18 H4           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
19 H5           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
20 HO           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
21 HS           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
22 HP           0.1      1      1        0.12     0.85 ; H
23 N            0.155    1      1.028    0.155   0.79 ; N
24 NA           0.155    1      1.028    0.155   0.79 ; N
25 NB           0.155    1      1.215    0.155   0.79 ; N
26 N2           0.16     1      1.215    0.155   0.79 ; N
27 N3           0.16     1      1.215    0.155    0.79 ; N
28 O            0.15     1      0.926    0.15     0.85 ; O
29 OH           0.152    1      1.080    0.15    0.85 ; O
30 O2           0.17     1      0.922    0.15     0.85 ; O
31 S            0.18     1      1.121    0.18    0.96 ; S
32 SH           0.18     1      1.121    0.18    0.96 ; S
33 ; masscenters for vsites do not have gbsa parameters
34 MNH3         0        0      0        0         0
35 MCH3         0        0      0        0         0