share/top/amber99sb.ff/urea.itp

   1 [ moleculetype ]
   2 ; molname       nrexcl
   3 URE             3
   4
   5 [ atoms ]
   6      1  C            1  URE      C      1     0.880229  12.01000       ; amber C  type
   7      2  O            1  URE      O      2    -0.613359  16.00000       ; amber O  type
   8      3  N            1  URE     N1      3    -0.923545  14.01000       ; amber N  type
   9      4  H            1  URE    H11      4     0.395055   1.00800       ; amber H  type
  10      5  H            1  URE    H12      5     0.395055   1.00800       ; amber H  type
  11      6  N            1  URE     N2      6    -0.923545  14.01000       ; amber N  type
  12      7  H            1  URE    H21      7     0.395055   1.00800       ; amber H  type
  13      8  H            1  URE    H22      8     0.395055   1.00800       ; amber H  type
  14
  15 [ bonds ]
  16     1   2
  17     1   3
  18     1   6
  19     3   4
  20     3   5
  21     6   7
  22     6   8
  23 [ dihedrals ]
  24 ;   ai    aj    ak    al funct  definition
  25      2     1     3     4   9
  26      2     1     3     5   9
  27      2     1     6     7   9
  28      2     1     6     8   9
  29      3     1     6     7   9
  30      3     1     6     8   9
  31      6     1     3     4   9
  32      6     1     3     5   9
  33 [ dihedrals ]
  34      3     6     1     2   4
  35      1     4     3     5   4
  36      1     7     6     8   4