Added cool quote from Viveca's defense
[gromacs.git] / share / top / charmm27.ff / aminoacids.hdb
blob4775ad7989216799e30e2559a51a73fe2a6801fc
1 ACE     1       
2 3       4       HH3     CH3     C       O
3 AIB     3       
4 1       1       HN      N       -C      CA
5 3       4       HB1     CB1     CA      N
6 3       4       HB2     CB2     CA      N
7 ALA     3       
8 1       1       HN      N       -C      CA
9 1       5       HA      CA      N       C       CB
10 3       4       HB      CB      CA      N
11 ARG     8       
12 1       1       HN      N       -C      CA
13 1       5       HA      CA      N       C       CB
14 2       6       HB      CB      CG      CA
15 2       6       HG      CG      CD      CB
16 2       6       HD      CD      NE      CG
17 1       1       HE      NE      CD      CZ
18 2       3       HH1     NH1     CZ      NE
19 2       3       HH2     NH2     CZ      NE
20 ARGN    8       
21 1       1       HN      N       -C      CA
22 1       5       HA      CA      N       C       CB
23 2       6       HB      CB      CG      CA
24 2       6       HG      CG      CD      CB
25 2       6       HD      CD      NE      CG
26 1       1       HE      NE      CD      CZ
27 1       2       HH1     NH1     CZ      NE
28 2       3       HH2     NH2     CZ      NE
29 ASN     4       
30 1       1       HN      N       -C      CA
31 1       5       HA      CA      N       C       CB
32 2       6       HB      CB      CG      CA
33 2       3       HD2     ND2     CG      CB
34 ASP     3       
35 1       1       HN      N       -C      CA
36 1       5       HA      CA      N       C       CB
37 2       6       HB      CB      CG      CA
38 ASPP    4       
39 1       1       HN      N       -C      CA
40 1       5       HA      CA      N       C       CB
41 2       6       HB      CB      CG      CA
42 1       2       HD2     OD2     CG      CB
43 CT3     2
44 1       1       HN      N       -C      CH3
45 3       4       HH3     CH3     N       HN
46 CYS2    3       
47 1       1       HN      N       -C      CA
48 1       5       HA      CA      N       C       CB
49 2       6       HB      CB      SG      CA
50 CYS     4       
51 1       1       HN      N       -C      CA
52 1       5       HA      CA      N       C       CB
53 2       6       HB      CB      SG      CA
54 1       2       HG1     SG      CB      CA
55 GLN     5       
56 1       1       HN      N       -C      CA
57 1       5       HA      CA      N       C       CB
58 2       6       HB      CB      CG      CA
59 2       6       HG      CG      CD      CB
60 2       3       HE2     NE2     CD      CG
61 GLU     4       
62 1       1       HN      N       -C      CA
63 1       5       HA      CA      N       C       CB
64 2       6       HB      CB      CG      CA
65 2       6       HG      CG      CD      CB
66 GLUP    5       
67 1       1       HN      N       -C      CA
68 1       5       HA      CA      N       C       CB
69 2       6       HB      CB      CG      CA
70 2       6       HG      CG      CD      CB
71 1       2       HE2     OE2     CD      CG
72 GLY     2       
73 1       1       HN      N       -C      CA
74 2       6       HA      CA      C       N
75 HSD     6       
76 1       1       HN      N       -C      CA
77 1       5       HA      CA      N       C       CB
78 2       6       HB      CB      CG      CA
79 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
80 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
81 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
82 HSE     6       
83 1       1       HN      N       -C      CA
84 2       6       HB      CB      CG      CA
85 1       5       HA      CA      N       C       CB
86 1       1       HE2     NE2     CE1     CD2
87 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
88 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
89 HSP     7       
90 1       1       HN      N       -C      CA
91 1       5       HA      CA      N       C       CB
92 2       6       HB      CB      CG      CA
93 1       1       HD2     CD2     CG      NE2
94 1       1       HE1     CE1     ND1     NE2
95 1       1       HD1     ND1     CG      CE1
96 1       1       HE2     NE2     CE1     CD2
97 HO4     1       
98 3       10      HW      OW
99 HO5     1       
100 4       11      HW      OW
101 HOH     1       
102 2       7       HW      OW
103 ILE     6       
104 1       1       HN      N       -C      CA
105 1       5       HA      CA      N       C       CB
106 1       5       HB      CB      CA      CG1     CG2
107 2       6       HG1     CG1     CD      CB
108 3       4       HG2     CG2     CB      CA
109 3       4       HD      CD      CG1     CB
110 LEU     6       
111 1       1       HN      N       -C      CA
112 1       5       HA      CA      N       C       CB
113 2       6       HB      CB      CG      CA
114 1       5       HG      CG      CB      CD1     CD2
115 3       4       HD1     CD1     CG      CB
116 3       4       HD2     CD2     CG      CB
117 LSN     7
118 1       1       HN      N       -C      CA
119 1       5       HA      CA      N       C       CB
120 2       6       HB      CB      CG      CA
121 2       6       HG      CG      CD      CB
122 2       6       HD      CD      CE      CG
123 2       6       HE      CE      NZ      CD
124 2       4       HZ      NZ      CE      CD
125 LYS     7       
126 1       1       HN      N       -C      CA
127 1       5       HA      CA      N       C       CB
128 2       6       HB      CB      CG      CA
129 2       6       HG      CG      CD      CB
130 2       6       HD      CD      CE      CG
131 2       6       HE      CE      NZ      CD
132 3       4       HZ      NZ      CE      CD
133 MET     5       
134 1       1       HN      N       -C      CA
135 1       5       HA      CA      N       C       CB
136 2       6       HB      CB      CG      CA
137 2       6       HG      CG      SD      CB
138 3       4       HE      CE      SD      CG
139 PHE     8       
140 1       1       HN      N       -C      CA
141 1       5       HA      CA      N       C       CB
142 2       6       HB      CB      CG      CA
143 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
144 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
145 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
146 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
147 1       1       HZ      CZ      CE1     CE2
148 PRO     4       
149 1       5       HA      CA      N       C       CB
150 2       6       HB      CB      CG      CA
151 2       6       HG      CG      CD      CB
152 2       6       HD      CD      N       CG
153 SER     4       
154 1       1       HN      N       -C      CA
155 1       5       HA      CA      N       C       CB
156 2       6       HB      CB      OG      CA
157 1       2       HG1     OG      CB      CA
158 THR     5       
159 1       1       HN      N       -C      CA
160 1       5       HA      CA      N       C       CB
161 1       5       HB      CB      CA      OG1     CG2
162 1       2       HG1     OG1     CB      CA
163 3       4       HG2     CG2     CB      CA
164 TRP     9       
165 1       1       HN      N       -C      CA
166 1       5       HA      CA      N       C       CB
167 2       6       HB      CB      CG      CA
168 1       1       HD1     CD1     NE1     CG
169 1       1       HE1     NE1     CD1     CE2
170 1       1       HE3     CE3     CD2     CZ3
171 1       1       HZ3     CZ3     CE3     CH2
172 1       1       HH2     CH2     CZ3     CZ2
173 1       1       HZ2     CZ2     CE2     CH2
174 TYR     8       
175 1       1       HN      N       -C      CA
176 1       5       HA      CA      N       C       CB
177 2       6       HB      CB      CG      CA
178 1       1       HD1     CD1     CG      CE1
179 1       1       HD2     CD2     CG      CE2
180 1       1       HE1     CE1     CD1     CZ
181 1       1       HE2     CE2     CD2     CZ
182 1       2       HH      OH      CZ      CE1
183 VAL     5       
184 1       1       HN      N       -C      CA
185 1       5       HA      CA      N       C       CB
186 1       5       HB      CB      CA      CG1     CG2
187 3       4       HG1     CG1     CB      CA
188 3       4       HG2     CG2     CB      CA