Refactor preprocessing atom types.
[gromacs.git] / src / gromacs / gmxpreprocess / 
tree4fb3eddf585a959cc618af59df770da9bcd50932
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 1849 CMakeLists.txt
-rw-r--r-- 8905 add_par.cpp
-rw-r--r-- 3151 add_par.h
-rw-r--r-- 9684 calch.cpp
-rw-r--r-- 2625 calch.h
-rw-r--r-- 22964 convparm.cpp
-rw-r--r-- 2488 convparm.h
-rw-r--r-- 45686 editconf.cpp
-rw-r--r-- 1816 editconf.h
-rw-r--r-- 5761 fflibutil.cpp
-rw-r--r-- 3300 fflibutil.h
-rw-r--r-- 37679 gen_ad.cpp
-rw-r--r-- 2721 gen_ad.h
-rw-r--r-- 6250 gen_maxwell_velocities.cpp
-rw-r--r-- 2678 gen_maxwell_velocities.h
-rw-r--r-- 86340 gen_vsite.cpp
-rw-r--r-- 2654 gen_vsite.h
-rw-r--r-- 11600 genconf.cpp
-rw-r--r-- 1818 genconf.h
-rw-r--r-- 22862 genhydro.cpp
-rw-r--r-- 3670 genhydro.h
-rw-r--r-- 18189 genion.cpp
-rw-r--r-- 1810 genion.h
-rw-r--r-- 10928 genrestr.cpp
-rw-r--r-- 1810 genrestr.h
-rw-r--r-- 21531 gmxcpp.cpp
-rw-r--r-- 3586 gmxcpp.h
-rw-r--r-- 12830 gpp_atomtype.cpp
-rw-r--r-- 8610 gpp_atomtype.h
-rw-r--r-- 3127 gpp_bond_atomtype.cpp
-rw-r--r-- 2625 gpp_bond_atomtype.h
-rw-r--r-- 12874 gpp_nextnb.cpp
-rw-r--r-- 3254 gpp_nextnb.h
-rw-r--r-- 83993 grompp.cpp
-rw-r--r-- 1815 grompp.h
-rw-r--r-- 6388 grompp_impl.h
-rw-r--r-- 7437 h_db.cpp
-rw-r--r-- 3071 h_db.h
-rw-r--r-- 9967 hackblock.cpp
-rw-r--r-- 9618 hackblock.h
-rw-r--r-- 9884 hizzie.cpp
-rw-r--r-- 2152 hizzie.h
-rw-r--r-- 24463 insert_molecules.cpp
-rw-r--r-- 2080 insert_molecules.h
-rw-r--r-- 4359 keyvaluetreemdpwriter.cpp
-rw-r--r-- 2578 keyvaluetreemdpwriter.h
-rw-r--r-- 2694 makeexclusiondistances.cpp
-rw-r--r-- 2366 makeexclusiondistances.h
-rw-r--r-- 11884 nm2type.cpp
-rw-r--r-- 2675 nm2type.h
-rw-r--r-- 1893 notset.h
-rw-r--r-- 91533 pdb2gmx.cpp
-rw-r--r-- 2048 pdb2gmx.h
-rw-r--r-- 57264 pdb2top.cpp
-rw-r--r-- 5723 pdb2top.h
-rw-r--r-- 5999 pgutil.cpp
-rw-r--r-- 2819 pgutil.h
-rw-r--r-- 177015 readir.cpp
-rw-r--r-- 6014 readir.h
-rw-r--r-- 25050 readpull.cpp
-rw-r--r-- 11962 readrot.cpp
-rw-r--r-- 20549 resall.cpp
-rw-r--r-- 4188 resall.h
-rw-r--r-- 40352 solvate.cpp
-rw-r--r-- 1818 solvate.h
-rw-r--r-- 13034 specbond.cpp
-rw-r--r-- 2475 specbond.h
-rw-r--r-- 17701 ter_db.cpp
-rw-r--r-- 3273 ter_db.h
drwxr-xr-x - tests
-rw-r--r-- 9427 tomorse.cpp
-rw-r--r-- 2115 tomorse.h
-rw-r--r-- 16116 topdirs.cpp
-rw-r--r-- 3196 topdirs.h
-rw-r--r-- 56760 topio.cpp
-rw-r--r-- 4026 topio.h
-rw-r--r-- 87305 toppush.cpp
-rw-r--r-- 5738 toppush.h
-rw-r--r-- 10095 topshake.cpp
-rw-r--r-- 2102 topshake.h
-rw-r--r-- 14179 toputil.cpp
-rw-r--r-- 3127 toputil.h
-rw-r--r-- 54626 vsite_parm.cpp
-rw-r--r-- 2625 vsite_parm.h
-rw-r--r-- 21864 x2top.cpp
-rw-r--r-- 1812 x2top.h
-rw-r--r-- 8843 xlate.cpp
-rw-r--r-- 2410 xlate.h